Neocallimastigomycota

Neocallimastigomycota
Научная классификация
Домен:	Эукариота
Королевство:	Грибы
Разделение:	Neocallimastigomycota ; MJ Powell 2007
Сорт:	Неокаллимастигомицеты ; MJ Powell 2007
Заказ:	Неокаллимастигал ; JL Li, IB Heath & L. Packer
Семья:	Neocallimastigaceae
Тип рода
	Neocallimastix ; (IB Heath 1983) Vavra & Joyon
Роды
	Aestipascuomyces ; Agriosomyces ; Aklioshbomyces ; Anaeromyces ; BUWCHFAWROMYCES ; Caecomyces ; Капелломик ; Cyllamyces ; Feramyces ; Ghazallomyces ; Liebetanzomyces ; Joblinomyces ; Khoyollomyces ; Neocallimastix ; Oontomyces ; Orpinomyces ; Paucimyces ; Pecoramyces ; Пиромис ; Tahromyces

Neocallimastigomycota - это тип, содержащий анаэробные грибы , которые являются симбионтами, обнаруженными в пищеварительных трактах более крупных травоядных . Анаэробные грибы были первоначально размещены в Phylum Chytridiomycota , в порядке неокаллимастигал, но позже подняты до уровня филома, ^{[ 3 ]} Решение поддержано более поздними филогенетическими реконструкциями. ^{[ 4 ]} Это охватывает только одну семью . ^{[ 3 ]}

Открытие

Грибы в неокаллимастигомикоте были впервые признаны грибами Орпином в 1975 году, ^{[ 5 ]} на основе подвижных клеток, присутствующих рубце овец в . Их зооспоры наблюдались гораздо раньше, но, как полагают, были жгутиковыми протистами , но Орпин продемонстрировал, что они обладали клеточной стенкой хитина. ^{[ 6 ]} С тех пор было показано, что это грибы, связанные с основными хитридами. До этого считалось, что микробная популяция рубца состояла только из бактерий и простейших . С момента их открытия они были изолированы из пищеварительных трактов более 50 травоядных , в том числе жвачных и неторонних (фарматических) млекопитающих и травоядных рептилий . ^{[ 7 ]}^{[ 8 ]}

Neocallimastigomycota также были обнаружены у людей. ^{[ 9 ]}

Ограничение

Размножение и рост

Эти грибы воспроизводятся в рубце жвачных животных посредством образования зооспоров , которые выпускаются из спорангии. Эти зооспоры несут кинетосому, но не хватает нефалированной центриолы, известной в большинстве хитридов, ^{[ 2 ]} и известно, что используют горизонтальный перенос генов при их развитии ксиланазы (из бактерий) и других глюканаз . ^{[ 10 ]}

Ядерные конверты их клеток примечательны оставшимися неповрежденными на протяжении всего митоза . ^{[ 2 ]} Сексуальное размножение не наблюдалось в анаэробных грибах. Тем не менее, они, как известно, могут выжить в течение многих месяцев в аэробной среде, ^{[ 11 ]} фактор, который важен в колонизации новых хозяев. В Anaeromyces наблюдалось наличие предполагаемых покоящихся споров ^{[ 12 ]} Но способ, которым они образуются и прорастают, остается неизвестным.

Метаболизм

В неокаллимастигомикоте не хватает митохондрий , но вместо этого содержат водородные водороды , в которых окисление NADH до NAD+ , что приводит к образованию H ₂ . ^{[ 10 ]}

Полисахаридная активность

Neocallimastigomycota играет важную роль в вырвании волокна у их видов-хозяев. Они присутствуют в большом количестве в пищеварительных трактах животных, которые питаются диетами с высоким содержанием клетчатки. ^{[ 13 ]} Полисахаридные деградирующие ферменты, продуцируемые анаэробными грибами, могут гидролизировать наиболее непокорные растительные полимеры и могут полностью ухудшить неподходящие клетки растительных клеток. ^{[ 14 ]}^{[ 15 ]} Orpinomyces sp. демонстрировала способность ксиланазы, CMCASE, лихеназы, амилазы, β-ксилозидазы, β-глюкозидазы, α-ларабинофуранозидазы и незначительных количеств продукции β-клеозидазы путем использования Avicel в качестве источника энергии Sole. ^{[ 16 ]} Полисахаридные деградирующие ферменты организованы в мультипротеиновый комплекс, аналогичный бактериальной целлюлосоме . ^{[ 17 ]}

Написание имени

Греческое прекращение, «-mastix», ссылаясь на «Кнуты», т.е. множество жгутиков на этих грибах, изменяется на «-мастиг-» в сочетании с дополнительными терминациями в латинизированных именах. ^{[ 18 ]} Фамилия Neocallimastigaceae изначально была неправильно опубликована как «Neocallimasticaceae» авторами издательства, которые привели к монету с ошибкой, следовательно, неверно «Neocallimacales», легко прощенная ошибка, учитывая, что другие «-иксельные» финалы, такие как Salix, отправляются в Salicaceae . Коррекция этих имен поручена Международным кодексом ботанической номенклатуры , ст. 60. Исправленное правописание используется индексным Fungorum. ^{[ 19 ]} Оба написания встречаются в литературе и на www в результате написания в первоначальной публикации.

Ссылки

^ Ли, JL; и др. (1993). «Филогенетические отношения анаэробных хитридиомицеточных грибов кишечника ( ) и читридиомикота . II . неокаллимастика Может. J. Bot . 71 (3): 393–407. doi : 10.1139/b93-044 . S2CID 83723423 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} Хиббетт, DS; и др. (Март 2007 г.). более высокого уровня «Филогенетическая классификация грибов ». Микологические исследования . 111 (5): 509–547. Citeseerx 10.1.1.626.9582 . doi : 10.1016/j.mycres.2007.03.004 . PMID 17572334 . S2CID 4686378 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Хиббетт, Дэвид С.; Связанный, Манфред; Бишофф, Джозеф Ф.; Блэквелл, Мередит; Кэннон, Пол Ф.; Eriksson, Ove E.; Huhndorf, Sabine; Джеймс, Тимоти; Кирк, Пол М. (май 2007). «Филогенетическая классификация грибов более высокого уровня». Микологические исследования . 111 (5): 509–547. Citeseerx 10.1.1.626.9582 . doi : 10.1016/j.mycres.2007.03.004 . ISSN 0953-7562 . PMID 17572334 . S2CID 4686378 .
^ Tedersoo, Leho; Санчес-Рамирес, Сантьяго; Kõljalg, Urmas; Бахрам, Мухаммед; Доринг, Маркус; Шигель, Дмитрий; Май, Том; Риберг, Мартин; Абаренков, Кесси (2018-05-16). «Классификация грибов высокого уровня и инструмент для эволюционного экологического анализа» . Грибковое разнообразие . 90 : 135–159. doi : 10.1007/s13225-018-0401-0 . ISSN 1560-2745 .
^ Орпин CG (декабрь 1975 г.). «Исследования на рубце жгутиковой neocallimastix frontalis» . J. Gen. Microbiol . 91 (2): 249–62. doi : 10.1099/00221287-91-2-249 . PMID 1462 .
^ Orpiin, CG (1977). «Возникновение хитина в клеточных стенках Ormen Organims Neocallimastix Frontalis, Promomos Communis и Sphaerommons Communis» (PDF ) Журнал общей микробиологии 99 (1): 215–2 Doi : 10.1099/ 00221287-99-1-2 864435PMID
^ Ljungdahl LG (март 2008 г.). «Система целлюлазы/гемицеллюлазы анаэробного гриба Orpinomyces PC-2 и аспекты его применяемого использования». Энн. Нью -Йорк Акад. Наука 1125 (1): 308–21. BIBCODE : 2008NASA1125..308L . doi : 10.1196/annals.1419.030 . PMID 18378601 . S2CID 20006974 .
^ Mackie Ri, Rycyk M, Ruemmler RL, Aminov Ri, Wikelski M (2004). «Биохимические и микробиологические доказательства ферментативного пищеварения в свободно живой земле игуанах (Conolophus pallidus) и морских игуанах (Amblyrhynchus cristatus) на архипелаге Галапагос». Физиол. Биохимия. Zool . 77 (1): 127–38. doi : 10.1086/383498 . PMID 15057723 . S2CID 25961316 .
^ Родригес М., Перес Д., козы "Ожирение, ты меняешь микобиоом человеческого кишечника " Научные отчеты 5 14600. Бибкод : : два : 10 1038/ srep1 4600977PMC 26455903PMID
^ Jump up to: ^а ^{беременный} CJ Alexopolous, Charles W. Mims, M. Blackwell, Вводная микология, 4 -е изд. (Джон Уайли и сыновья, Хобокен Нью -Джерси, 2004) ISBN 0-471-52229-5
^ McGranaghan, P.; Дэвис, JC; Гриффит, GW; Дэвис, доктор; Теодору, М.К. (1999-07-01). «Выживание анаэробных грибов в фекалиях крупного рогатого скота» . Микробиология FEMS Экология . 29 (3): 293–300. doi : 10.1111/j.1574-6941.1999.tb00620.x . ISSN 0168-6496 .
^ Брукман, Джейн Л.; Озкоз, Эмин; Роджерс, Син; Тринчи, Энтони П.Дж.; Теодору, Майкл К. (2000-03-01). «Идентификация споров в полицентрических грибах кишечника, которые повышают их способность выжить» . Микробиология FEMS Экология . 31 (3): 261–267. doi : 10.1111/j.1574-6941.2000.tb00692.x . ISSN 0168-6496 . PMID 10719208 .
^ Ho YW, Bar DJ (1995). «Классификация анаэробных кишечных грибов у травоядных с акцентом на грибы рубца из Малайзии». Микология . 87 (5): 655–77. doi : 10.2307/3760810 . JSTOR 3760810 .
^ Акин де, Борнман, WS (октябрь 1990). «Роль грибов рубца в деградации волокна» . J. Dairy Sci . 73 (10): 3023–32. doi : 10.3168/jds.s0022-0302 (90) 78989-8 . PMID 2178175 .
^ Selinger LB, Forsberg CW, Cheng KJ (октябрь 1996 г.). «Руман: уникальный источник ферментов для улучшения производства скота». Анаэроб . 2 (5): 263–84. doi : 10.1006/anae.1996.0036 . PMID 16887555 .
^ Comlekcioglu, U.; Ozkose, E.; Yazdic, F.; Akyol, я.; Экинци М. (2010-08-19). «Производство полисахаридазы и гликозидазы Avicel выращенного гриба Rumen Orpinomyces sp. Gmlf5» . Acta Biologica Hungarica . 61 (3): 333–343. doi : 10.1556/abiol.61.2010.3.9 . ISSN 0236-5383 . PMID 20724279 . S2CID 21167921 .
^ Уилсон К.А., Вуд Т.М. (1992). «Исследования целлюлазы анаэробного гриба рубца Neocallimastix Frontalis, со специальной ссылкой на способность фермента к ухудшению кристаллической целлюлозы». Фермент и микробные технологии . 14 (4): 258–64. doi : 10.1016/0141-0229 (92) 90148-H .
^ Combform3.qxd Archived 2007-03-15 на машине Wayback
^ «Супрафамилиальные имена» . Архивировано из оригинала 2007-02-22 . Получено 2007-03-26 .

Внешние ссылки

Neocallimastigomycota в Национальной медицинской библиотеке Медицинской библиотеки США (Mesh)
Анаэробная сеть грибов

[1] Ли, JL; и др. (1993). «Филогенетические отношения анаэробных хитридиомицеточных грибов кишечника ( ) и читридиомикота . II . неокаллимастика Может. J. Bot . 71 (3): 393–407. doi : 10.1139/b93-044 . S2CID 83723423 .

[Hibbett-2] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} Хиббетт, DS; и др. (Март 2007 г.). более высокого уровня «Филогенетическая классификация грибов ». Микологические исследования . 111 (5): 509–547. Citeseerx 10.1.1.626.9582 . doi : 10.1016/j.mycres.2007.03.004 . PMID 17572334 . S2CID 4686378 .

[:0-3] Jump up to: ^а ^{беременный} Хиббетт, Дэвид С.; Связанный, Манфред; Бишофф, Джозеф Ф.; Блэквелл, Мередит; Кэннон, Пол Ф.; Eriksson, Ove E.; Huhndorf, Sabine; Джеймс, Тимоти; Кирк, Пол М. (май 2007). «Филогенетическая классификация грибов более высокого уровня». Микологические исследования . 111 (5): 509–547. Citeseerx 10.1.1.626.9582 . doi : 10.1016/j.mycres.2007.03.004 . ISSN 0953-7562 . PMID 17572334 . S2CID 4686378 .

[4] Tedersoo, Leho; Санчес-Рамирес, Сантьяго; Kõljalg, Urmas; Бахрам, Мухаммед; Доринг, Маркус; Шигель, Дмитрий; Май, Том; Риберг, Мартин; Абаренков, Кесси (2018-05-16). «Классификация грибов высокого уровня и инструмент для эволюционного экологического анализа» . Грибковое разнообразие . 90 : 135–159. doi : 10.1007/s13225-018-0401-0 . ISSN 1560-2745 .

[5] Орпин CG (декабрь 1975 г.). «Исследования на рубце жгутиковой neocallimastix frontalis» . J. Gen. Microbiol . 91 (2): 249–62. doi : 10.1099/00221287-91-2-249 . PMID 1462 .

[6] Orpiin, CG (1977). «Возникновение хитина в клеточных стенках Ormen Organims Neocallimastix Frontalis, Promomos Communis и Sphaerommons Communis» (PDF ) Журнал общей микробиологии 99 (1): 215–2 Doi : 10.1099/ 00221287-99-1-2 864435PMID

[pmid18378601-7] Ljungdahl LG (март 2008 г.). «Система целлюлазы/гемицеллюлазы анаэробного гриба Orpinomyces PC-2 и аспекты его применяемого использования». Энн. Нью -Йорк Акад. Наука 1125 (1): 308–21. BIBCODE : 2008NASA1125..308L . doi : 10.1196/annals.1419.030 . PMID 18378601 . S2CID 20006974 .

[pmid15057723-8] Mackie Ri, Rycyk M, Ruemmler RL, Aminov Ri, Wikelski M (2004). «Биохимические и микробиологические доказательства ферментативного пищеварения в свободно живой земле игуанах (Conolophus pallidus) и морских игуанах (Amblyrhynchus cristatus) на архипелаге Галапагос». Физиол. Биохимия. Zool . 77 (1): 127–38. doi : 10.1086/383498 . PMID 15057723 . S2CID 25961316 .

[9] Родригес М., Перес Д., козы "Ожирение, ты меняешь микобиоом человеческого кишечника " Научные отчеты 5 14600. Бибкод : : два : 10 1038/ srep1 4600977PMC 26455903PMID

[Alex-10] Jump up to: ^а ^{беременный} CJ Alexopolous, Charles W. Mims, M. Blackwell, Вводная микология, 4 -е изд. (Джон Уайли и сыновья, Хобокен Нью -Джерси, 2004) ISBN 0-471-52229-5

[11] McGranaghan, P.; Дэвис, JC; Гриффит, GW; Дэвис, доктор; Теодору, М.К. (1999-07-01). «Выживание анаэробных грибов в фекалиях крупного рогатого скота» . Микробиология FEMS Экология . 29 (3): 293–300. doi : 10.1111/j.1574-6941.1999.tb00620.x . ISSN 0168-6496 .

[12] Брукман, Джейн Л.; Озкоз, Эмин; Роджерс, Син; Тринчи, Энтони П.Дж.; Теодору, Майкл К. (2000-03-01). «Идентификация споров в полицентрических грибах кишечника, которые повышают их способность выжить» . Микробиология FEMS Экология . 31 (3): 261–267. doi : 10.1111/j.1574-6941.2000.tb00692.x . ISSN 0168-6496 . PMID 10719208 .

[Ho1995-13] Ho YW, Bar DJ (1995). «Классификация анаэробных кишечных грибов у травоядных с акцентом на грибы рубца из Малайзии». Микология . 87 (5): 655–77. doi : 10.2307/3760810 . JSTOR 3760810 .

[pmid2178175-14] Акин де, Борнман, WS (октябрь 1990). «Роль грибов рубца в деградации волокна» . J. Dairy Sci . 73 (10): 3023–32. doi : 10.3168/jds.s0022-0302 (90) 78989-8 . PMID 2178175 .

[pmid16887555-15] Selinger LB, Forsberg CW, Cheng KJ (октябрь 1996 г.). «Руман: уникальный источник ферментов для улучшения производства скота». Анаэроб . 2 (5): 263–84. doi : 10.1006/anae.1996.0036 . PMID 16887555 .

[16] Comlekcioglu, U.; Ozkose, E.; Yazdic, F.; Akyol, я.; Экинци М. (2010-08-19). «Производство полисахаридазы и гликозидазы Avicel выращенного гриба Rumen Orpinomyces sp. Gmlf5» . Acta Biologica Hungarica . 61 (3): 333–343. doi : 10.1556/abiol.61.2010.3.9 . ISSN 0236-5383 . PMID 20724279 . S2CID 21167921 .

[Wilson1992-17] Уилсон К.А., Вуд Т.М. (1992). «Исследования целлюлазы анаэробного гриба рубца Neocallimastix Frontalis, со специальной ссылкой на способность фермента к ухудшению кристаллической целлюлозы». Фермент и микробные технологии . 14 (4): 258–64. doi : 10.1016/0141-0229 (92) 90148-H .

[18] Combform3.qxd Archived 2007-03-15 на машине Wayback

[19] «Супрафамилиальные имена» . Архивировано из оригинала 2007-02-22 . Получено 2007-03-26 .

[ 2 ]

[ 1 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]

[ 16 ]

[ 17 ]

[ 18 ]

[ 19 ]