SCP2

SCP2
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	1QND, 2C0L
Идентификаторы
Псевдонимы	SCP2 , NLTP, NSL-TP, SCP-2, SCP-CHI, SCP-X, SCPX, белок-переносчик стерина 2, SCOX
Внешние идентификаторы	Опустить : 184755 ; МГИ : 98254 ; Гомологен : 37717 ; Генные карты : SCP2 ; ОМА : SCP2 - ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 1 (human)
End	53,051,698 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 4 (mouse)
End	108,002,195 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	jejunal mucosa; ; right lobe of liver; ; palpebral conjunctiva; ; germinal epithelium; ; duodenum; ; rectum; ; epithelium of nasopharynx; ; mucosa of sigmoid colon; ; gallbladder; ; pylorus;
	Top expressed in
	proximal tubule; ; right kidney; ; white adipose tissue; ; hepatobiliary system; ; liver; ; jejunum; ; granulocyte; ; duodenum; ; human kidney; ; colon;
	More reference expression data
	n/a
showГенная онтология
Molecular function	transferase activity; phosphatidylinositol transfer activity; fatty-acyl-CoA binding; acyltransferase activity, transferring groups other than amino-acyl groups; sterol transporter activity; oleic acid binding; long-chain fatty acyl-CoA binding; cholesterol binding; protein binding; propanoyl-CoA C-acyltransferase activity; catalytic activity; signaling receptor binding; acyltransferase activity; lipid binding; propionyl-CoA C2-trimethyltridecanoyltransferase activity;
Cellular component	membrane; intracellular membrane-bounded organelle; peroxisome; nucleoplasm; peroxisomal matrix; mitochondrion; extracellular exosome; cytoplasm; cytosol; protein-containing complex;
Biological process	progesterone biosynthetic process; peroxisome organization; lipid transport; inositol trisphosphate biosynthetic process; alpha-linolenic acid metabolic process; positive regulation of steroid metabolic process; lipid hydroperoxide transport; positive regulation of intracellular cholesterol transport; fatty acid beta-oxidation using acyl-CoA oxidase; metabolism; protein localization to plasma membrane; bile acid biosynthetic process; sterol transport; steroid biosynthetic process; phospholipid transport; transport; protein targeting to peroxisome;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	6342
	20280
	ENSG00000116171
	ENSMUSG00000028603
	P22307
	P32020
showНМ_001007098 ; НМ_001007099 ; НМ_001007100 ; НМ_001007250 ; НМ_001193599 ;
	NM_001193600; NM_001193617; NM_002979; NM_001330587
	НМ_011327
showНП_001007099 ; НП_001007100 ; НП_001007101 ; НП_001007251 ; НП_001180528 ;
	NP_001180529; NP_001180546; NP_001317516; NP_002970
	НП_035457
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Неспецифический белок-переносчик липидов, также известный как белок-переносчик стерола 2 (SCP-2) или пропаноил-КоА C-ацилтрансфераза, представляет собой белок , который у людей кодируется SCP2 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Функция

Этот ген кодирует два белка: белок-носитель стерина X (SCPx) и белок-носитель стерина 2 (SCP2), в результате инициации транскрипции с двух независимо регулируемых промоторов. Транскрипт, инициируемый проксимальным промотором, кодирует более длинный белок SCPx, а транскрипт, инициируемый дистальным промотором, кодирует более короткий белок SCP2, при этом два белка имеют общий С-конец . Имеющиеся данные свидетельствуют о том, что белок SCPx представляет собой пероксисомой , связанную с тиолазу , которая участвует в окислении жирных кислот с разветвленной цепью , тогда как белок SCP2 считается белком-переносчиком внутриклеточных липидов. Альтернативный сплайсинг этого гена дает несколько вариантов транскрипта, некоторые из которых кодируют разные изоформы. Полноразмерная природа всех вариантов транскрипта не определена. ^{[ 7 ]}

Клиническое значение

Этот ген высоко экспрессируется в органах, участвующих в липидном обмене, и может играть роль в синдроме Зеллвегера , при котором в клетках наблюдается дефицит пероксисом и нарушен синтез желчных кислот . ^{[ 7 ]}

Взаимодействия

Было показано, что SCP2 взаимодействует с кавеолином 1. ^{[ 8 ]} и пероксисомальный рецептор PEX5 . ^{[ 9 ]}

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000116171 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000028603 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Ямамото Р., Каллен CB, Бабалола ГО, Реннерт Х, Биллхаймер Дж.Т., Штраус Дж.Ф. (январь 1991 г.). «Клонирование и экспрессия кДНК, кодирующей белок-носитель стерина человека 2» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 88 (2): 463–7. Бибкод : 1991PNAS...88..463Y . дои : 10.1073/pnas.88.2.463 . ПМК 50831 . ПМИД 1703300 .
^ Хе З., Ямамото Р., Фёрт Э.Э., Шанц Л.Дж., Нейлор С.Л., Джордж Х., Биллхаймер Дж.Т., Штраус Дж.Ф. (октябрь 1991 г.). «кДНК, кодирующие члены семейства белков, родственных белку-переносчику стерола человека 2, и присвоение гена человеческой хромосоме 1 p21----pter». ДНК Клеточная Биол . 10 (8): 559–69. дои : 10.1089/dna.1991.10.559 . ПМИД 1718316 .
^ Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтрез: белок-носитель стерола SCP2 2» .
^ Чжоу М., Парр Р.Д., Петреску А.Д., Пейн Х.Р., Атшавес Б.П., Кир А.Б., Болл Дж.М., Шредер Ф. (июнь 2004 г.). «Белок-переносчик стерола-2 напрямую взаимодействует с кавеолином-1 in vitro и in vivo» . Биохимия . 43 (23): 7288–306. дои : 10.1021/bi035914n . ПМИД 15182174 .
^ Стэнли В.А., Филипп Ф.В., Курсула П., Шуллер Н., Эрдманн Р., Шлибс В., Саттлер М., Вильманс М. (декабрь 2006 г.). «Распознавание функциональной мишени пероксисомы типа 1 рецептором динамического импорта pex5p» . Мол. Клетка . 24 (5): 653–63. doi : 10.1016/j.molcel.2006.10.024 . ПМК 5030714 . ПМИД 17157249 .

Дальнейшее чтение

Зеедорф У., Эллингхаус П., Рох Нофер Дж. (2000). «Белок-переносчик стеролов-2». Биохим. Биофиз. Акта . 1486 (1): 45–54. дои : 10.1016/s1388-1981(00)00047-0 . ПМИД 10856712 .
Гальегос А.М., Атшавес Б.П., Стори С.М. и др. (2001). «Структура гена, внутриклеточная локализация и функциональная роль белка-переносчика стерина-2». Прог. Липидный Рес . 40 (6): 498–563. дои : 10.1016/S0163-7827(01)00015-7 . ПМИД 11591437 .
Ямамото Р. (1993). «[Локализация гена человеческого белка-переносчика стерола 2 и экспрессия кДНК в клетках COS-7]». Хоккайдо Игаку Засси . 67 (6): 839–48. ПМИД 1483685 .
Бейкер М.Э., Биллхаймер Дж.Т., Штраус Дж.Ф. (1992). «Сходство между аминоконцевой частью белка-переносчика стерола млекопитающих массой 58 кДа (SCPx) и ацетил-КоА-ацилтрансферазой Escherichia coli: свидетельства слияния генов в SCPx». ДНК Клеточная Биол . 10 (9): 695–8. дои : 10.1089/dna.1991.10.695 . ПМИД 1755959 .
Шредер Ф., Бутко П., Немеч Г., Скаллен Т.Дж. (1990). «Взаимодействие флуоресцентного дельта-5,7,9(11),22-эргостатетраен-3 бета-ола с белком-носителем стерина-2» . Ж. Биол. Хим . 265 (1): 151–7. дои : 10.1016/S0021-9258(19)40208-1 . ПМИД 2294101 .
Оба Т., Холт Дж.А., Биллхаймер Дж.Т., Штраус Дж.Ф. (1995). «Ген человеческого белка-переносчика стеролов x/гена белка-носителя стеролов 2 имеет два промотора». Биохимия . 34 (33): 10660–8. дои : 10.1021/bi00033a042 . ПМИД 7654720 .
Охба Т., Реннерт Х., Пфайфер С.М. и др. (1995). «Структура человеческого белка-переносчика стерола X/гена белка-переносчика стерина 2 (SCP2)» . Геномика . 24 (2): 370–4. дои : 10.1006/geno.1994.1630 . ПМИД 7698762 .
Вудфорд Дж.К., Коллес С.М., Майерс-Пейн С. и др. (1995). «Белок-переносчик стерола-2 стимулирует межмембранный перенос стерола путем прямого взаимодействия с мембраной». хим. Физ. Липиды . 76 (1): 73–84. дои : 10.1016/0009-3084(95)02436-М . ПМИД 7788802 .
Веса Дж., Хеллстен Э., Барноски Б.Л. и др. (1994). «Отнесение белка-носителя стерола X / белка-носителя стерина 2 к 1p32 и его исключение в качестве причинного гена детского нейронального цероидного липофусциноза». Хм. Мол. Жене . 3 (2): 341–6. дои : 10.1093/hmg/3.2.341 . ПМИД 8004106 .
Зеедорф У., Бриш П., Энгель Т. и др. (1994). «Белок-переносчик стерола X представляет собой пероксисомальную 3-оксоацил-коэнзим А-тиолазу с собственным переносчиком стерола и активностью переноса липидов» . Ж. Биол. Хим . 269 (33): 21277–83. дои : 10.1016/S0021-9258(17)31960-9 . ПМИД 8063752 .
Шиперски Т., Шик С., Йоханссон Дж. и др. (1993). «ЯМР-определение вторичной структуры и трехмерной складки полипептидного остова человеческого белка-переносчика стерола 2» . ФЭБС Летт . 335 (1): 18–26. дои : 10.1016/0014-5793(93)80431-S . ПМИД 8243660 . S2CID 9969358 .
Зеедорф У., Шик С., Энгель Т. и др. (1994). «Исследование структуры и активности человеческого белка-переносчика стеринов 2» . Ж. Биол. Хим . 269 (4): 2613–8. дои : 10.1016/S0021-9258(17)41988-0 . ПМИД 8300590 .
Янасэ Т., Хара Т., Сакаи Ю. и др. (1996). «Экспрессия белка-переносчика стерола 2 (SCP2) в ткани надпочечников человека». Евро. Дж. Эндокринол . 134 (4): 501–7. дои : 10.1530/eje.0.1340501 . ПМИД 8640304 .
Столович Н.Дж., Фролов А., Атшавес Б. и др. (1997). «Участок связывания жирных кислот с белком-носителем стерина-2: определение ЯМР, круговой дихроичности и флуоресцентной спектроскопии». Биохимия . 36 (7): 1719–29. дои : 10.1021/bi962317a . ПМИД 9048555 .
Шалк Дж.А., Оффенберг Х.Х., Петерс Э. и др. (1999). «Выделение и характеристика кДНК SCP2 человека и хромосомная локализация гена». Мамм. Геном . 10 (6): 642–4. дои : 10.1007/s003359901062 . ПМИД 10341103 . S2CID 9107396 .
Яцке С., Хинц Х.Дж., Зеедорф У., Ассманн Г. (1999). «Стабильность и связывающие свойства дикого типа и белка-носителя стерола человека с мутацией c17s 2». Биохим. Биофиз. Акта . 1432 (2): 265–74. дои : 10.1016/S0167-4838(99)00114-4 . ПМИД 10407148 .
Кимура Х., Фуджи Х., Сузуки С. и др. (1999). «Липидсвязывающие белки в почках крысы и человека» . Почки Int. Доп . 71 : С159–62. дои : 10.1046/j.1523-1755.1999.07141.x . ПМИД 10412765 .
Хуан Х., Болл Дж.М., Биллхаймер Дж.Т., Шредер Ф. (1999). «Аминоконец белка-переносчика стерола-2: домен взаимодействия с мембраной». Биохимия . 38 (40): 13231–43. дои : 10.1021/bi990870x . ПМИД 10529196 .

статья о гене на хромосоме 1 человека незавершена Эта . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000116171 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000028603 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid1703300-5] Ямамото Р., Каллен CB, Бабалола ГО, Реннерт Х, Биллхаймер Дж.Т., Штраус Дж.Ф. (январь 1991 г.). «Клонирование и экспрессия кДНК, кодирующей белок-носитель стерина человека 2» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 88 (2): 463–7. Бибкод : 1991PNAS...88..463Y . дои : 10.1073/pnas.88.2.463 . ПМК 50831 . ПМИД 1703300 .

[pmid1718316-6] Хе З., Ямамото Р., Фёрт Э.Э., Шанц Л.Дж., Нейлор С.Л., Джордж Х., Биллхаймер Дж.Т., Штраус Дж.Ф. (октябрь 1991 г.). «кДНК, кодирующие члены семейства белков, родственных белку-переносчику стерола человека 2, и присвоение гена человеческой хромосоме 1 p21----pter». ДНК Клеточная Биол . 10 (8): 559–69. дои : 10.1089/dna.1991.10.559 . ПМИД 1718316 .

[entrez-7] Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтрез: белок-носитель стерола SCP2 2» .

[pmid15182174-8] Чжоу М., Парр Р.Д., Петреску А.Д., Пейн Х.Р., Атшавес Б.П., Кир А.Б., Болл Дж.М., Шредер Ф. (июнь 2004 г.). «Белок-переносчик стерола-2 напрямую взаимодействует с кавеолином-1 in vitro и in vivo» . Биохимия . 43 (23): 7288–306. дои : 10.1021/bi035914n . ПМИД 15182174 .

[pmid17157249-9] Стэнли В.А., Филипп Ф.В., Курсула П., Шуллер Н., Эрдманн Р., Шлибс В., Саттлер М., Вильманс М. (декабрь 2006 г.). «Распознавание функциональной мишени пероксисомы типа 1 рецептором динамического импорта pex5p» . Мол. Клетка . 24 (5): 653–63. doi : 10.1016/j.molcel.2006.10.024 . ПМК 5030714 . ПМИД 17157249 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

v т и Трансферазы : ацилтрансферазы ( EC 2.3)
2.3.1: other than amino-acyl groups	acetyltransferases: Acetyl-Coenzyme A acetyltransferase N-Acetylglutamate synthase Choline acetyltransferase Dihydrolipoyl transacetylase Acetyl-CoA C-acyltransferase Beta-galactoside transacetylase Chloramphenicol acetyltransferase N-acetyltransferase Serotonin N-acetyl transferase HGSNAT ARD1A Histone acetyltransferase P300/CBP NAT2 palmitoyltransferases: Carnitine O-palmitoyltransferase CPT1 CPT2 Serine C-palmitoyltransferase SPTLC1 SPTLC2 other: Acyltransferase like 2 Aminolevulinic acid synthase Beta-ketoacyl-ACP synthase Glyceronephosphate O-acyltransferase Lecithin—cholesterol acyltransferase Glycerol-3-phosphate O-acyltransferase 1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase 2-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase ABHD5
2.3.2: Aminoacyltransferases	Gamma-glutamyl transpeptidase Peptidyl transferase Transglutaminase Tissue transglutaminase Keratinocyte transglutaminase Factor XIII
2.3.3: converted into alkyl on transfer	Citrate synthase Decylcitrate synthase Citrate (Re)-synthase Decylhomocitrate synthase 2-methylcitrate synthase 2-ethylmalate synthase 3-ethylmalate synthase ATP citrate lyase Malate synthase HMG-CoA synthase HMGCS2 2-hydroxyglutarate synthase 3-propylmalate synthase 2-isopropylmalate synthase Homocitrate synthase Sulfoacetaldehyde acetyltransferase

v т и Ферменты
Activity	Active site Binding site Catalytic triad Oxyanion hole Enzyme promiscuity Diffusion-limited enzyme Cofactor Enzyme catalysis
Regulation	Allosteric regulation Cooperativity Enzyme inhibitor Enzyme activator
Classification	EC number Enzyme superfamily Enzyme family List of enzymes
Kinetics	Enzyme kinetics Eadie–Hofstee diagram Hanes–Woolf plot Lineweaver–Burk plot Michaelis–Menten kinetics
Types	EC1 Oxidoreductases (list) EC2 Transferases (list) EC3 Hydrolases (list) EC4 Lyases (list) EC5 Isomerases (list) EC6 Ligases (list) EC7 Translocases (list)