ДУСП13

ДУСП13
Доступные структуры ПДБ Поиск ортологов: PDBe RCSB showСписок идентификационных кодов PDB 2GWO, 2PQ5
Идентификаторы
Псевдонимы	DUSP13 , BEDP, DUSP13A, DUSP13B, MDSP, SKRP4, TMDP, фосфатаза двойной специфичности 13
Внешние идентификаторы	Опустить : 613191 ; МГИ : 1351599 ; Гомологен : 121602 ; Генные карты : DUSP13 ; ОМА : DUSP13 — ортологи
showМестоположение гена ( человек ) Chr. Chromosome 10 (human) Band 10q22.2 Start 75,094,432 bp End 75,109,221 bp
showМестоположение гена ( Мышь ) Chr. Chromosome 14 (mouse) Band 14|14 A3 Start 21,783,462 bp End 21,801,249 bp
show экспрессии РНК Характер Bgee Human Mouse (ortholog) Top expressed in muscle of thigh gastrocnemius muscle triceps brachii muscle glutes Skeletal muscle tissue of rectus abdominis biceps brachii vastus lateralis muscle Skeletal muscle tissue of biceps brachii thoracic diaphragm deltoid muscle Top expressed in spermatid muscle of thigh triceps brachii muscle seminiferous tubule temporal muscle skeletal muscle tissue extraocular muscle sternocleidomastoid muscle medial head of gastrocnemius muscle digastric muscle More reference expression data BioGPS More reference expression data
showГенная онтология Molecular function protein tyrosine phosphatase activity phosphoprotein phosphatase activity hydrolase activity protein tyrosine/serine/threonine phosphatase activity phosphatase activity protein binding Cellular component cytoplasm Biological process protein dephosphorylation peptidyl-tyrosine dephosphorylation dephosphorylation spermatogenesis meiosis Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи Разновидность Человек Мышь Входить 51207 27389 Вместе ENSG00000079393 ENSMUSG00000021768 ЮниПрот Q6B8I1 Q9UII6 Q6B8I0 Q9QYJ7 RefSeq (мРНК) showНМ_001007271 НМ_001007272 НМ_001007273 НМ_001007274 НМ_001007275 NM_016364 NM_001320842 NM_001320843 NM_001363514 showНМ_001007268 НМ_013849 НМ_001374075 НМ_001374077 НМ_001374078 NM_001374079 RefSeq (белок) showНП_001007272 НП_001007273 НП_001007274 НП_001307771 НП_001307772 NP_057448 NP_001350443 NP_057448.3 NP_001307772.1 showНП_001007269 НП_038877 НП_001361004 НП_001361006 НП_001361007 NP_001361008 NP_038877.2 Местоположение (UCSC) Чр 10: 75.09 – 75.11 Мб Чр 14: 21,78 – 21,8 Мб в PubMed Поиск
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

Фосфатаза 13 двойной специфичности — это фермент , который у человека кодируется DUSP13 геном .

Функция

Члены суперсемейства протеинтирозинфосфатаз взаимодействуют с протеинкиназами, регулируя пролиферацию и дифференцировку клеток . Это суперсемейство разделено на два семейства в зависимости от дефосфорилированного субстрата. Одно семейство, фосфатазы двойной специфичности (DSP), действует как на остатки фосфотирозина, так и на остатки фосфосерина/треонина. Этот ген кодирует разные, но родственные белки DSP за счет использования неперекрывающихся открытых рамок считывания, альтернативного сплайсинга и предположительно разных промоторов транскрипции. Было обнаружено, что экспрессия отдельных белков этого гена тканеспецифична, и эти белки могут участвовать в постнатальном развитии конкретных тканей. Белок, кодируемый вышележащей ORF, был обнаружен в скелетных мышцах, тогда как белок, кодируемый нижележащей ORF, был обнаружен только в семенниках. У мышей был обнаружен аналогичный образец экспрессии. Было описано множество альтернативно сплайсированных вариантов транскриптов, но полноразмерная последовательность была определена только для некоторых.

Дальнейшее чтение

• Накамура К., Шима Х., Ватанабэ М. и др. (2000). «Молекулярное клонирование и характеристика новой протеинфосфатазы двойной специфичности, возможно, участвующей в сперматогенезе» . Биохим. Дж . 344 Ч. 3 (Часть 3): 819–25. дои : 10.1042/0264-6021:3440819 . ПМК   1220704 . ПМИД   10585869 .
• Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК   139241 . ПМИД   12477932 .
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека» . Нат. Жене . 36 (1): 40–5. дои : 10.1038/ng1285 . ПМИД   14702039 .
• Делоукас П., Земляной М.Э., Графхэм Д.В. и др. (2004). «Последовательность ДНК и сравнительный анализ 10-й хромосомы человека» . Природа . 429 (6990): 375–81. Бибкод : 2004Natur.429..375D . дои : 10.1038/nature02462 . ПМИД   15164054 .
• Чен Х.Х., Луче Р., Вэй Б., Тонкс Н.К. (2004). «Характеристика двух различных фосфатаз с двойной специфичностью, закодированных в альтернативных открытых рамках считывания одного гена, расположенного на хромосоме человека 10q22.2» . Ж. Биол. Хим . 279 (40): 41404–13. дои : 10.1074/jbc.M405286200 . ПМИД   15252030 .
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Рез . 14 (10Б): 2121–7. дои : 10.1101/гр.2596504 . ПМК   528928 . ПМИД   15489334 .
• Барриос-Родилес М., Браун К.Р., Оздамар Б. и др. (2005). «Высокопроизводительное картирование динамической сигнальной сети в клетках млекопитающих». Наука . 307 (5715): 1621–5. Бибкод : 2005Sci...307.1621B . дои : 10.1126/science.1105776 . ПМИД   15761153 . S2CID   39457788 .
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте сети белок-белковых взаимодействий человека в масштабе протеома». Природа . 437 (7062): 1173–8. Бибкод : 2005Natur.437.1173R . дои : 10.1038/nature04209 . ПМИД   16189514 . S2CID   4427026 .
• Ким С.Дж., Чон Д.Г., Юн Т.С. и др. (2007). «Кристаллическая структура человеческого TMDP, специфичной для семенников протеинфосфатазы с двойной специфичностью: значение для субстратной специфичности» . Белки . 66 (1): 239–45. дои : 10.1002/prot.21197 . ПМИД   17044055 . S2CID   30555597 .