ГенЭксперт МТБ/РИФ
Эту статью необходимо обновить . ( май 2020 г. ) |
Эта статья содержит множество положительных утверждений без указания на то, что большинство из них применимо ко всем автоматизированным ПЦР-тестам в реальном времени , а не только к этой собственной торговой марке (см. Cepheid (компания) ). Разница между тестом GeneXpert MTB/RIF и тестом GeneXprt для чего-либо еще заключается в замене одного реагента, поэтому было бы повторяющимся созданием отдельной статьи для каждого из них (см. Cepheid (company)#System ). Отсутствие этого контекста означает, что он содержит контент, написанный как реклама . ( Май 2022 г. ) |
Xpert MTB/RIF — это картриджный тест амплификации нуклеиновых кислот (МАНК) для быстрой диагностики туберкулеза и экспресс- теста на чувствительность к антибиотикам . Это автоматизированный диагностический тест , который позволяет выявить ДНК микобактерий туберкулеза (MTB) и устойчивость к рифампицину (RIF). Он был разработан совместно лабораторией профессора Дэвида Алланда из Университета медицины и стоматологии Нью-Джерси (UMDNJ). [1] Cepheid Inc. и Фонд инновационных новых диагностических средств при дополнительной финансовой поддержке Национального института здравоохранения США (NIH). [2]
В декабре 2010 года Всемирная организация здравоохранения (ВОЗ) одобрила использование Xpert MTB/RIF в странах, эндемичных по туберкулезу (ТБ). [3] Это объявление последовало за 18 месяцами оценки ее эффективности на местах при туберкулезе, МЛУ-ТБ и ТБ/ ВИЧ . коинфекции [4] Этот тест может позволить диагностировать туберкулез у пациентов, которые могут быть пропущены традиционными тестами. [4] [5]
По данным Центров по контролю и профилактике заболеваний (CDC) в 2015 г. [6] тест Xpert MTB/RIF «совершил революцию в борьбе с туберкулезом, способствуя быстрой диагностике заболевания туберкулезом и лекарственной устойчивости. Тест одновременно выявляет комплекс микобактерий туберкулеза (MTBC) и устойчивость к рифампицину (RIF) менее чем за 2 часа. Для сравнения: стандартным культурам может потребоваться от 2 до 6 недель для роста MTBC, а обычные тесты на лекарственную устойчивость могут добавить еще 3 недели». [6]
Описание
[ редактировать ]Xpert MTB/RIF выявляет последовательности ДНК, специфичные для Mycobacterium Tuberculosis и устойчивости к рифампицину, с помощью полимеразной цепной реакции . [5] [7] Он основан на системе Cepheid GeneXpert — быстром и простом в использовании тесте амплификации нуклеиновых кислот (NAAT). Xpert® MTB/RIF очищает и концентрирует микобактерии туберкулеза из образцов мокроты, изолирует геномный материал из захваченных бактерий путем обработки ультразвуком и впоследствии амплифицирует геномную ДНК с помощью ПЦР. Этот процесс идентифицирует большинство клинически значимых мутаций, вызывающих устойчивость к рифампицину, в гене РНК-полимеразы бета (rpoB) в геноме Mycobacterium Tuberculosis в формате реального времени с использованием флуоресцентных зондов, называемых молекулярными маяками. Результаты получены на необработанных образцах мокроты за 90 минут при минимальной биологической опасности и минимальной технической подготовке, необходимой для работы. [8] Этот тест был разработан как технология, проводимая вблизи пациента, которую при необходимости можно было проводить даже в кабинете врача.
Обзор по оценке диагностической точности Xpert TB показал, что при использовании в качестве первоначального теста для замены микроскопии мазка его совокупная чувствительность составила 89%, а специфичность - 99%. Однако когда Xpert TB использовался в качестве дополнения для случаев микроскопии отрицательных мазков, чувствительность составляла только 67%, а специфичность - 99%. [9] В ходе клинического исследования чувствительность теста MTB/RIF всего лишь на 1 образце мокроты составила 92,2% для туберкулеза с положительным результатом посева; 98,2% для случаев с положительным мазком и культурой; и 72,5% для случаев с отрицательным мазком и положительным посевом со специфичностью 99,2%. Чувствительность и более высокая специфичность были немного выше при тестировании 3 образцов. [10]
Расходы
[ редактировать ]По поводу Xpert MTB/RIF были высказаны некоторые опасения, включая эксплуатационные вопросы и стоимость. Льготная цена системы GeneXpert в настоящее время составляет 32 000 долларов США за четырехмодульный прибор. По состоянию на 6 августа 2012 г. стоимость тестового картриджа в странах, имеющих право на льготные цены, составляет 9,98 долларов США. [11] [12] [13] По состоянию на 30 июня 2013 года 1402 системы GeneXpert (содержащие 7553 модуля) и >3 миллионов картриджей Xpert MTB/RIF были закуплены в 88 из 145 стран по льготным ценам. [14]
Использование для тестирования на COVID-19
[ редактировать ]В августе 2020 года Министерство здравоохранения Вьетнама одобрило использование GeneXpert, который используется во Вьетнамской сети профилактики туберкулеза с 2012 года, для тестирования на COVID-19 . По словам Нгуена Вьет Нхунга, директора Национальной больницы легких в Ханое, тест аналогичен RT-PCR, дает точные результаты в течение 35–45 минут как для COVID-19, так и для туберкулеза, и может работать автоматически. [15] Он также используется для тестирования на COVID-19 в шести центрах по всей Сомали . [16] GeneXpert работает как экспресс-тест на COVID-19 со временем обработки около 45 минут и с меньшими затратами. [17]
См. также
[ редактировать ]- Цефеид Инк. (производитель)
Ссылки
[ редактировать ]- ^ «Часто задаваемые вопросы по анализу Xpert MTB/RIF». Архивировано 20 августа 2020 г. на Wayback Machine. Проверено 12 июня 2012 г.
- ↑ Тэнси, Бернадетт (25 марта 2009 г.). Cepheid представляет быстрый и недорогой тест на туберкулез , San Francisco Chronicle (перечисляет создателей, а также заявляет: «Разработчик генных тестов Cepheid из Саннивейла заявил во вторник, что разработал быстрый и чувствительный диагностический тест на туберкулез и сделает его доступным по сниженной цене при разработке). странах, где широко распространено опасное для жизни заболевание».)
- ^ «ВОЗ одобряет новый быстрый тест на туберкулез» 8 декабря 2010 г. Проверено 12 июня 2012 г.
- ↑ Перейти обратно: Перейти обратно: а б Смолл, Питер М.; Пай, Мадукар (2010). «Диагноз туберкулеза — время изменить правила игры». Медицинский журнал Новой Англии . 363 (11): 1070–1071. дои : 10.1056/NEJMe1008496 . ПМИД 20825320 .
- ↑ Перейти обратно: Перейти обратно: а б Ри, Аннелис Ван; Пейдж-Шипп, Лизл; Скотт, Лесли; Санне, Ян; Стивенс, Венди (2010). "Эксперт ® MTB/RIF для диагностики туберкулеза на месте оказания медицинской помощи в странах с высоким бременем ВИЧ и ограниченными ресурсами: шумиха или надежда?». Expert Review of Molecular Diagnostics . 10 (7): 937–946. doi : 10.1586/erm. 10.67 . ПМИД 20964612 .
- ↑ Перейти обратно: Перейти обратно: а б Центры по контролю и профилактике заболеваний (2015 г.), «Новый инструмент для диагностики туберкулеза: анализ Xpert MTB/RIF» (PDF) , веб-сайт CDC , заархивировано из оригинала (PDF) 17 декабря 2017 г. , получено 5 мая 2018 г. -25 .
- ^ Хелб, Даника; Джонс, Мартин; История, Элизабет; Беме, Катарина; Уоллес, Эллен; Хо, Кен; Коп, Джоанн; Оуэнс, Мишель Р.; Роджерс, Ричард; Банада, Падмаприя; Сафи, Хасан; Блейкмор, Роберт; Лан, Северная Каролина, Нгок; Джонс-ЛоПес, Эдвард К.; Леви, Майкл; Бердей, Мишель; Аякака, Ирен; Мугерва, Рой Д.; Макмиллан, Билл; Винн-Дин, Эмили; Кристель, Ли; Дэйли, Питер; Перкинс, Марк Д.; Персинг, Дэвид Х.; Алланд, Дэвид (2010). «Быстрое обнаружение микобактерий туберкулеза и устойчивости к рифампицину с использованием технологии, выполняемой по требованию и рядом с пациентом» . Журнал клинической микробиологии . 48 (1): 229–237. дои : 10.1128/jcm.01463-09 . ПМЦ 2812290 . ПМИД 19864480 .
- ^ Беме, Катарина К.; Набета, Памела; Хиллеманн, Дорис; Никол, Марк П.; Шенай, Шубхада; Крапп, Фиорелла; Аллен, Дженни; Тахирли, Расим; Блейкмор, Роберт; Рустомджи, Роксана; Милович, Ана; Джонс, Мартин; О'Брайен, Шон М.; Персинг, Дэвид Х.; Рюш-Гердес, Сабина; Готуццо, Эдуардо; Родригес, Камилла; Алланд, Дэвид; Перкинс, Марк Д. (2010). «Быстрое молекулярное обнаружение туберкулеза и устойчивости к рифампицину» . Медицинский журнал Новой Англии . 363 (11): 1005–1015. doi : 10.1056/NEJMoa0907847 . ПМЦ 2947799 . ПМИД 20825313 .
- ^ Хорн, Дэвид Дж.; Кохли, Микашми; Зифодья, Джерри С.; Шиллер, Ян; Дендукури, Нандини; Толлефсон, Дина; Шумахер, Сэмюэл Г.; Очодо, Элеонора А.; Пай, Мадукар; Стейнгарт, Карен Р. (7 июня 2019 г.). «Xpert MTB/RIF и Xpert MTB/RIF Ultra для лечения туберкулеза легких и устойчивости к рифампицину у взрослых» . Кокрановская база данных систематических обзоров . 6 (6): CD009593. дои : 10.1002/14651858.CD009593.pub4 . ISSN 1469-493X . ПМК 6555588 . ПМИД 31173647 .
- ^ Беме CC , Набета П., Хиллеманн Д. и др. (2010). «Быстрое молекулярное обнаружение туберкулеза и устойчивости к рифампицину» . Медицинский журнал Новой Англии . 363 (11): 1005–1015. дои : 10.1056/nejmoa0907847 . ПМЦ 2947799 . ПМИД 20825313 .
- ^ «Договорные цены на Xpert® MTB/RIF и список стран FIND» . НАЙТИ Диагностику . НАХОДИТЬ. Октябрь 2013. Архивировано из оригинала 7 апреля 2014 года . Проверено 6 апреля 2014 г.
- ^ (6 августа 2012 г.). Государственно-частное партнерство объявляет о немедленном 40-процентном сокращении затрат на экспресс-тест на туберкулез , Фонд Гейтса , дата обращения 15 сентября 2023 г.
- ^ (8 августа 2012 г.). Cepheid подписывает сделки по продаже тестов на туберкулез в развивающихся странах , Reuters
- ^ «Мониторинг ВОЗ внедрения Xpert MTB/RIF» Всемирная организация здравоохранения. Проверено 1 сентября 2013 г.
- ^ «Вьетнам будет использовать тест на туберкулез для Covid-19» . ВнЭкспресс . 8 августа 2020 г. Архивировано из оригинала 21 сентября 2020 г. . Проверено 8 августа 2020 г.
- ^ Джервинг, Сара (13 августа 2020 г.). «Стигма и слабая система препятствуют реагированию Сомали на COVID-19» . Девекс . Архивировано из оригинала 24 января 2021 года . Проверено 26 января 2021 г.
- ^ Сингх, Х.; Дибар, ДП (2020). «Старый тест для диагностики новой коронавирусной инфекции: роль GeneXpert в тестировании на COVID-19» . Журнал семейной медицины и первичной медицинской помощи . 9 (11): 5822–5823. дои : 10.4103/jfmpc.jfmpc_1289_20 . ПМЦ 7842456 . ПМИД 33532451 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]- Часто задаваемые вопросы об анализе Xpert MTB/RIF
- ВИДЕО: CNN рассказывает об использовании Xpert MTB/RIF в Уганде. Архивировано 6 октября 2011 г. в Wayback Machine.
- Техническое и оперативное руководство ВОЗ Xpert [ постоянная мертвая ссылка ]
- Дорожная карта ВОЗ по внедрению Xpert MTB/RIF для быстрой диагностики туберкулеза и МЛУ-ТБ
- Веб-сайт Cepheid на Xpert. Архивировано 10 февраля 2011 г. в Wayback Machine.
- Cepheid объявляет о выпуске в Европе первого молекулярного теста по требованию для одновременного обнаружения микобактерий туберкулеза (ТБ) и устойчивости к рифампицину