НДУФС1
| НДУФС1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Псевдонимы | NDUFS1 , CI-75Kd, CI-75k, PRO1304, основная субъединица S1 НАДН:убихиноноксидоредуктазы, MC1DN5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Внешние идентификаторы | Опустить : 157655 ; МГИ : 2443241 ; Гомологен : 3670 ; GeneCards : NDUFS1 ; ОМА : NDUFS1 — ортологи | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Викиданные | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Субъединица НАДН-убихиноноксидоредуктазы 75 кДа, митохондриальная (NDUFS1) представляет собой фермент , который у человека кодируется NDUFS1 геном . [ 5 ] Кодируемый белок NDUFS1 является крупнейшей субъединицей комплекса I , расположенной на внутренней митохондриальной мембране и играет важную роль в митохондриальном окислительном фосфорилировании . Мутации в этом гене связаны с дефицитом комплекса I. [ 6 ]
Структура
[ редактировать ]NDUFS1 расположен на q-плече хромосомы 2 в положении 33,3 и имеет 20 экзонов . [ 7 ] Ген NDUFS1 производит белок массой 79,5 кДа, состоящий из 727 аминокислот . [ 8 ] [ 9 ] NDUFS1, белок, кодируемый этим геном, является членом семейства субъединиц комплекса I массой 75 кДа. Он содержит транзитный пептид , 10 витков, 19 бета-цепей , 27 альфа-спиралей и сайты связывания кофактора для [ 2Fe-2S ] и [ 4Fe-4S кластеров ]. Кластерные домены состоят из 79 аминокислот типа 2Fe-2S ферредоксина из положений 30–108, 4Fe-4S His(Cys)3-лигированного типа из положений 108–147 и 4Fe-4S типа 4Fe-147. 4S Mo/W бис-МГД-типа с позиций 245–301. [ 10 ] [ 11 ] несколько вариантов транскрипта, кодирующих разные изоформы . Для этого гена обнаружено [ 6 ]
Функция
[ редактировать ]Белок, кодируемый этим геном, принадлежит к семейству субъединиц комплекса I массой 75 кДа. Комплекс I млекопитающих состоит из 45 различных субъединиц. Он расположен на внутренней мембране митохондрий . Этот белок обладает НАДН-дегидрогеназной активностью и оксидоредуктазной активностью. Он переносит электроны от НАДН к дыхательной цепи . Считается, что непосредственным акцептором электронов фермента является убихинон . Этот белок является крупнейшей субъединицей комплекса I и входит в состав железосерного ( ИП) фрагмента фермента. Он может образовывать часть щели активного центра, где окисляется НАДН. [ 6 ]
Клиническое значение
[ редактировать ]Мутации в гене NDUFS1 связаны с дефицитом митохондриального комплекса I, который является аутосомно-рецессивным . Этот дефицит является наиболее распространенным ферментативным дефектом при нарушениях окислительного фосфорилирования. [ 12 ] [ 13 ] Дефицит митохондриального комплекса I демонстрирует крайнюю генетическую гетерогенность и может быть вызван мутацией в генах, кодируемых в ядре или в генах, кодируемых в митохондриях. не существует Очевидных корреляций между генотипом и фенотипом , а вывод об основной основе на основе клинической или биохимической картины затруднен, если не невозможен. [ 14 ] Однако большинство случаев вызвано мутациями в генах, кодируемых ядерным кодом. [ 15 ] [ 16 ] Он вызывает широкий спектр клинических нарушений, начиная от летальных неонатальных заболеваний и заканчивая нейродегенеративными расстройствами, возникающими во взрослом возрасте. Фенотипы включают макроцефалию с прогрессирующей лейкодистрофией , неспецифическую энцефалопатию , гипертрофическую кардиомиопатию , миопатию , заболевание печени , синдром Лея , наследственную оптическую нейропатию Лебера и некоторые формы болезни Паркинсона . [ 17 ]
Взаимодействия
[ редактировать ]Было показано, что NDUFS1 имеет 124 бинарных белок-белковых взаимодействия, включая 110 кокомплексных взаимодействий. NDUFS1, по-видимому, взаимодействует с SOAT1 , NDUFA9 , HLA-B , ECE2, C1QTNF9, GPAA1 , STOM , GDI1 , ACAP2 , EHBP1, MBOAT7 , PIGS . [ 18 ]
См. также
[ редактировать ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б с ENSG00000283447 GRCh38: выпуск Ensembl 89: ENSG00000023228, ENSG00000283447 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ Jump up to: а б с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000025968 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ Чоу В., Рэган I, Робинсон Б.Х. (ноябрь 1991 г.). «Определение последовательности кДНК человеческого митохондриального белка Fe-S массой 75 кДа НАДН-коэнзима Q-редуктазы» . Европейский журнал биохимии . 201 (3): 547–50. дои : 10.1111/j.1432-1033.1991.tb16313.x . ПМИД 1935949 .
- ^ Jump up to: а б с «Ген Энтрез: NDUFS1 НАДН-дегидрогеназа (убихинон), белок Fe-S 1, 75 кДа (НАДН-коэнзим Q-редуктаза)» .
В данную статью включен текст из этого источника, находящегося в свободном доступе .
- ^ «Ген Энтрез: фактор сборки цитохром-с-оксидазы 7 (предполагаемый)» . Проверено 8 августа 2018 г. В данную статью включен текст из этого источника, находящегося в свободном доступе .
- ^ Яо, Дэниел. «Атлас знаний сердечных органелларных белков (COPaKB) — информация о белках» . www.amino.heartproteome.org . Проверено 27 августа 2018 г.
- ^ Зонг Н.К., Ли Х., Ли Х., Лам М.П., Хименес Р.К., Ким К.С. и др. (октябрь 2013 г.). «Интеграция биологии и медицины сердечного протеома с помощью специализированной базы знаний» . Исследование кровообращения . 113 (9): 1043–53. дои : 10.1161/CIRCRESAHA.113.301151 . ПМК 4076475 . ПМИД 23965338 .
- ^ «NDUFS1 - субъединица НАДН-убихинон оксидоредуктазы 75 кДа, митохондриальный предшественник - Homo sapiens (человек) - ген и белок NDUFS1» . www.uniprot.org . Проверено 27 августа 2018 г.
В эту статью включен текст, доступный по лицензии CC BY 4.0 .
- ^ «UniProt: универсальная база знаний о белках» . Исследования нуклеиновых кислот . 45 (Д1): Д158–Д169. Январь 2017 г. doi : 10.1093/nar/gkw1099 . ПМК 5210571 . ПМИД 27899622 .
- ^ Кирби Д.М., Салеми Р., Сугиана С., Отаке А., Парри Л., Белл К.М., Кирк Э.П., Бонех А., Тейлор Р.В., Даль Х.Х., Райан М.Т., Торберн Д.Р. (сентябрь 2004 г.). «Мутации NDUFS6 являются новой причиной летального неонатального дефицита митохондриального комплекса I» . Журнал клинических исследований . 114 (6): 837–845. дои : 10.1172/JCI20683 . ПМК 516258 . ПМИД 15372108 .
- ^ МакФарланд Р., Кирби Д.М., Фаулер К.Дж., Отаке А., Райан М.Т., Амор Дж., Флетчер Дж.М., Диксон Дж.В., Коллинз Ф.А., Тернбулл Д.М., Тейлор Р.В., Торберн Д.Р. (январь 2004 г.). «Мутации de novo в митохондриальном гене ND3 как причина детской митохондриальной энцефалопатии и дефицита комплекса I». Анналы неврологии . 55 (1): 58–64. дои : 10.1002/ана.10787 . ПМИД 14705112 . S2CID 21076359 .
- ^ Хаак ТБ, Хабербергер Б, Фриш ЭМ, Виланд Т, Юсо А, Горза М, Стрекер В, Граф Е, Майр Дж.А., Херберг Ю, Хеннерманн Дж.Б., Клопшток Т., Кун К.А., Ахтинг Ю, Сперл В., Вилиховски Е, Хоффманн Г.Ф. , Тесарова М, Хансикова Х, Земан Дж, Плечко Б, Зевиани М, Виттиг И, Стром ТМ, Шуэльке М, Фрейзингер П, Мейтингер Т, Прокиш Х (апрель 2012 г.). «Молекулярная диагностика дефицита митохондриального комплекса I с использованием секвенирования экзома» (PDF) . Журнал медицинской генетики . 49 (4): 277–283. doi : 10.1136/jmedgenet-2012-100846 . ПМИД 22499348 . S2CID 3177674 .
- ^ Леффен Дж.Л., Смитинк Дж.А., Трийбелс Дж.М., Янссен А.Дж., Трипелс Р.Х., Сенгерс Р.К., ван ден Хеувел Л.П. (2000). «Изолированный дефицит комплекса I у детей: клинические, биохимические и генетические аспекты» . Человеческая мутация . 15 (2): 123–134. doi : 10.1002/(SICI)1098-1004(200002)15:2<123::AID-HUMU1>3.0.CO;2-P . ПМИД 10649489 . S2CID 35579133 .
- ^ Трипелс Р.Х., Ван Ден Хеувел Л.П., Трийбелс Дж.М., Смейтинк Дж.А. (2001). «Дефицит I комплекса дыхательной цепи». Американский журнал медицинской генетики . 106 (1): 37–45. дои : 10.1002/ajmg.1397 . ПМИД 11579423 .
- ^ Робинсон Б.Х. (май 1998 г.). «Недостаточность I комплекса человека: клинический спектр и участие свободных радикалов кислорода в патогенности порока» . Biochimica et Biophysica Acta (BBA) — Биоэнергетика . 1364 (2): 271–286. дои : 10.1016/s0005-2728(98)00033-4 . ПМИД 9593934 .
- ^ «По запросу NDUFS1 найдено 124 двоичных взаимодействия» . База данных молекулярных взаимодействий IntAct . ЭМБЛ-ЭБИ . Проверено 25 августа 2018 г.
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Бартлинг Ф., Шапер Дж., Маятепек Э., Дистельмайер Ф. (июль 2013 г.). «Обучение NeuroImages: быстропрогрессирующая лейкоэнцефалопатия при дефиците митохондриального комплекса I» . Неврология . 81 (2): е10-1. дои : 10.1212/WNL.0b013e31829a339b . ПМИД 23836946 .
- Дункан А.М., Чоу В., Робинсон Б.Х. (1992). «Локализация человеческого белка Fe-S массой 75 кДа гена НАДН-коэнзима Q-редуктазы (NDUFS1) в 2q33----q34». Цитогенетика и клеточная генетика . 60 (3–4): 212–213. дои : 10.1159/000133340 . ПМИД 1505218 .
- Сумеги Б., Срере, Пенсильвания (декабрь 1984 г.). «Комплекс I связывает несколько митохондриальных НАД-связанных дегидрогеназ» . Журнал биологической химии . 259 (24): 15040–15045. дои : 10.1016/S0021-9258(17)42511-7 . ПМИД 6439716 .
- Леффен Дж.Л., Трипельс Р.Х., ван ден Хеувел Л.П., Шуэльке М., Бушенс К.А., Смитс Р.Дж., Трийбелс Дж.М., Смейтинк Дж.А. (декабрь 1998 г.). «КДНК восьми ядерно-кодируемых субъединиц НАДН:убихиноноксидоредуктазы: завершена характеристика кДНК человеческого комплекса I». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 253 (2): 415–422. дои : 10.1006/bbrc.1998.9786 . ПМИД 9878551 .
- Бенит П., Кретьен Д., Кадом Н., де Лонле-Дебени П., Кормье-Дэр В., Кабрал А., Педенье С., Растин П., Мюнних А., Рётиг А. (июнь 2001 г.). «Крупномасштабные делеции и точечные мутации ядерных генов NDUFV1 и NDUFS1 при дефиците митохондриального комплекса I» . Американский журнал генетики человека . 68 (6): 1344–1352. дои : 10.1086/320603 . ПМК 1226121 . ПМИД 11349233 .
- Риччи Дж.Э., Муньос-Пинедо С., Фицджеральд П., Байи-Мэтр Б., Перкинс Г.А., Ядава Н., Шеффлер И.Е., Эллисман М.Х., Грин Д.Р. (июнь 2004 г.). «Нарушение функции митохондрий при апоптозе опосредовано расщеплением каспазой субъединицы р75 комплекса I цепи переноса электронов» . Ячейка 117 (6): 773–786. дои : 10.1016/j.cell.2004.05.008 . ПМИД 15186778 . S2CID 14016847 .
- Мартин М.А., Бласкес А., Гутьеррес-Солана Л.Г., Фернандес-Морейра Д., Брионес П., Андреу А.Л., Гаресс Р., Кампос Ю., Аренас Дж. (апрель 2005 г.). «Синдром Ли, связанный с дефицитом митохондриального комплекса I из-за новой мутации в гене NDUFS1». Архив неврологии . 62 (4): 659–661. дои : 10.1001/archneur.62.4.659 . ПМИД 15824269 .
- Руал Дж.Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кисикава Т., Дрико А., Ли Н., Берриз Г.Ф., Гиббонс Ф.Д., Дрез М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон С., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Ли С., Альбала Дж.С., Лим Дж., Фротон С, Лламосас Е, Чевик С, Бекс С, Ламеш П, Сикорски Р.С., Ванденхаут Дж, Зогби Х.И., Смоляр А, Босак С., Секерра Р., Дусетт-Стамм Л., Кьюсик М.Е., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видал М. ( октябрь 2005 г.). «К карте сети белок-белковых взаимодействий человека в масштабе протеома». Природа . 437 (7062): 1173–1178. Бибкод : 2005Natur.437.1173R . дои : 10.1038/nature04209 . ПМИД 16189514 . S2CID 4427026 .
- Юсо А., Скакко С., Пикколи С., Белломо Ф., Петрузцелла В., Трентадуэ Р., Минуто М., Риполи М., Капитанио Н., Зевиани М., Папа С. (апрель 2006 г.). «Нарушения клеточного окислительного метаболизма у больных с мутациями генов NDUFS1 и NDUFS4 комплекса I» . Журнал биологической химии . 281 (15): 10374–10380. дои : 10.1074/jbc.M513387200 . ПМИД 16478720 .
- Пикколи С, Скакко С, Белломо Ф, Синьорил А, Юзо А, Боффоли Д, Скрима Р, Капитанио Н, Папа С (август 2006 г.). «цАМФ контролирует метаболизм кислорода в клетках млекопитающих» . Письма ФЭБС . 580 (18): 4539–4543. Бибкод : 2006FEBSL.580.4539P . doi : 10.1016/j.febslet.2006.06.085 . ПМИД 16870178 . S2CID 29078999 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]- Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : P28331 (субъединица НАДН-убихинон оксидоредуктаза 75 кДа, митохондриальная) в PDBe-KB .
Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .