Тимидин
| |
| |
| Имена | |
|---|---|
| Название ИЮПАК
Тимидин
| |
| Систематическое название ИЮПАК
1-[(2R , 4S , 5R ) -4-Гидрокси-5-(гидроксиметил)оксолан-2-ил]-5-метилпиримидин-2,4(1H , 3H ) -дион | |
| Другие имена
Дезокситимидин, Td, dT, 1-[(2R , 4S , 5R ) -4-Гидрокси-5-(гидроксиметил)тетрагидрофур-2-ил]-5-метил-1,3-дигидропиримидин-2,4- Дион
| |
| Идентификаторы | |
3D model ( JSmol )
|
|
| ХЭМБЛ | |
| ХимическийПаук | |
| Лекарственный Банк | |
| Информационная карта ECHA | 100.000.065 |
| МеШ | Дезокситимидин |
ПабХим CID
|
|
| НЕКОТОРЫЙ | |
Панель управления CompTox ( EPA )
|
|
| Характеристики | |
| С 10 Н 14 Н 2 О 5 | |
| Молярная масса | 242.231 g·mol −1 |
| Температура плавления | 185 °С |
Если не указано иное, данные приведены для материалов в стандартном состоянии (при 25 °C [77 °F], 100 кПа).
| |
Тимидин ( символ dT или dThd ), также известный как дезокситимидин , дезоксирибозилтимин или дезоксирибозид тимина , представляет пиримидиндезоксинуклеозид собой . Деокситимидин представляет собой Т ДНК нуклеозид , который соединяется с дезоксиаденозином (А) в двухцепочечной ДНК. В клеточной биологии он используется для синхронизации клеток в фазе G1/ранней S. Приставка дезокси- часто опускается, поскольку предшественников тиминовых нуклеотидов, участвующих в синтезе РНК, нет.
До бума использования тимидина, вызванного потребностью в тимидине для производства антиретровирусного препарата азидотимидина (АЗТ), большая часть мирового производства тимидина производилась из сельди . спермы [ 1 ] Тимидин встречается почти исключительно в ДНК, но он также встречается в -петле тРНК Т .
Структура и свойства
[ редактировать ]По своему составу дезокситимидин представляет собой нуклеозид, состоящий из дезоксирибозы (пентозного сахара ), соединенного с пиримидиновым основанием тимином .
Дезокситимидин может фосфорилироваться одной, двумя или тремя группами фосфорной кислоты, образуя дезокси - гимидинмонофосфат ) , dTTP ( dTDP dTMP или трифосфатов ( для ди- и три - соответственно).
Он существует в твердой форме в виде маленьких белых кристаллов или белого кристаллического порошка . Он имеет молекулярную массу 242,229 ед. и температуру плавления 185 °C . Стабильность дезокситимидина при стандартной температуре и давлении (СТП) очень высока.
Дезокситимидин нетоксичен и входит в состав одного из четырех нуклеозидов ДНК. Это природное соединение, которое существует во всех живых организмах и ДНК-вирусах. Вместо тимидина в РНК содержится уридин ( урацил, присоединенный к рибозе ). Урацил химически очень похож на тимин, который также известен как 5-метилурацил. Поскольку тиминовые нуклеотиды являются предшественниками ДНК (но не РНК), приставку «дезокси» часто оставляют, т. е. дезокситимидин часто называют просто тимидином.
Тимидин внесен в список химических тератогенов . [ 2 ]
Модифицированные аналоги
[ редактировать ]Йододезоксиуридин является радиосенсибилизатором и увеличивает количество повреждений ДНК, полученных от ионизирующего излучения.
Азидотимидин (АЗТ) – применяется при лечении ВИЧ- инфекции. AZT ингибирует процесс обратной транскрипции , важнейший этап жизненного цикла вируса .
Радиомеченый тимидин (TdR), такой как тритированный тимидин ( 3 H-TdR), обычно используется в анализах пролиферации клеток. Тимидин включается в делящиеся клетки, и уровень этого включения, измеренный с помощью жидкостного сцинтилляционного счетчика , пропорционален степени пролиферации клеток. Например, лимфоцитов таким образом можно измерить пролиферацию при лимфопролиферативных заболеваниях .
Бромодезоксиуридин (BrdU) — еще один аналог тимидина, который часто используется для обнаружения пролиферирующих клеток в живых тканях.
5-Этинил-2'-дезоксиуридин (EdU) представляет собой аналог тимидина, который встраивается в ДНК делящихся клеток и используется для анализа синтеза ДНК в культуре клеток или живых тканях. Его можно визуализировать путем ковалентного связывания флуоресцентного азида с помощью клик-химии , которая менее жесткая, чем условия, используемые для воздействия на эпитоп антител к BrdU.
Эдоксудин – противовирусный препарат .
Телбивудин (β- L -2'-дезокситимидин, LdT) представляет собой немодифицированный «неприродный» L - энантиомер тимидина, который использовался при лечении хронического гепатита В. [ 3 ]
Дисбаланс тимидина вызывает мутации и рекомбинации.
[ редактировать ]Во время роста бактериофага Т4 избыток тимидина увеличивает мутацию . [ 4 ] [ 5 ] Дефицит тимидина во время роста также увеличивает мутацию. [ 4 ] Тимидилатный ауксотроф диплоидных дрожжей Saccharomyces cerevisiae выращивали в условиях, в которых уровни тимидиата варьировали от избытка до истощения. [ 6 ] Высокие уровни тимидилата оказались мутагенными и рекомбиногенными, тогда как голодание тимидилата было рекомбиногенным, но лишь слегка мутагенным.
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Макото Исии; Хидеюки Сираэ; Кензо Йокозеко, Ферментативное производство 5-метилуридина из пуриновых нуклеозидов и тимина Erwinia carotovora AJ-2992 , Сельскохозяйственная и биологическая химия
- ^ Следующий список химических веществ, известных или считающихся тератогенами, взят в основном из книги «Опасные свойства промышленных материалов», 7-е изд., Н. Ирвинга Сакса и Ричарда Дж. Льюиса.
- ^ Госслен, Жиль; Пьера, Клэр; Бензария-Прад, Самира; Духан, Дэвид; Креттон-Скотт, Эрика; Стэндринг, Дэвид; Соммадосси, Жан-Пьер (2008). «LdT (телбивудин) как мощный и специфический аналог нуклеозидов (Tyzeka™, Sebivo™) для лечения хронического гепатита B». Коллекция симпозиумов : 244–248. дои : 10.1135/css200810244 . ISBN 978-80-86241-29-6 .
- ^ Jump up to: а б Бернштейн С., Бернштейн Х., Муфтий С., Стром Б. Стимуляция мутации фага Т 4 повреждениями гена 32 и дисбалансом тимидина. Мутат Рес. Октябрь 1972 г.; 16 (2): 113-9. дои: 10.1016/0027-5107(72)90171-6. PMID: 4561494
- ^ ДеВрис Дж.К., Уоллес С.С. Реверсия мутантов бактериофага T4rII высокими уровнями пиримидиндезоксирибонуклеозидов. Мол Ген Генет. 1982;186(1):101-5. дои: 10.1007/BF00422919. PMID: 7050620
- ^ Эккардт Ф., Кунц Б.А., Хейнс Р.Х. Изменение частот мутаций и рекомбинаций в диапазоне концентраций тимидилата у диплоидного тимидилатного ауксотрофа. Карр Генет. Сентябрь 1983 г.; 7 (5): 399–402. дои: 10.1007/BF00445881. PMID: 24173422