APOBEC3C

APOBEC3C
Доступные структуры
ПДБ	Поиск Human UniProt: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	3VM8, 3VOW
Идентификаторы
Псевдонимы	APOBEC3C , A3C, APOBEC1L, ARDC2, ARDC4, ARP5, PBI, bK150C2.3, каталитическая субъединица 3C фермента редактирования мРНК аполипопротеина B
Внешние идентификаторы	Опустить : 607750 ; Гомологен : 129856 ; Генные карты : APOBEC3C ; OMA : APOBEC3C — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 22 (human)
End	39,020,352 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	white blood cell; ; granulocyte; ; monocyte; ; lymph node; ; right adrenal cortex; ; left adrenal gland; ; left adrenal cortex; ; rectum; ; stromal cell of endometrium; ; smooth muscle tissue;
	n/a
	More reference expression data
	n/a
showГенная онтология
Molecular function	protein binding; hydrolase activity, acting on carbon-nitrogen (but not peptide) bonds, in cyclic amidines; catalytic activity; zinc ion binding; hydrolase activity; metal ion binding; RNA binding; cytidine deaminase activity;
Cellular component	nucleus; cytoplasm; P-body;
Biological process	negative regulation of viral genome replication; immune system process; defense response to virus; cytidine deamination; innate immune response; viral process; negative regulation of transposition; DNA demethylation; cytidine to uridine editing; negative regulation of single stranded viral RNA replication via double stranded DNA intermediate; DNA cytosine deamination;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	27350
	н/д
	ENSG00000244509
	н/д
	Q9NRW3
	н/д
	НМ_014508
	н/д
	НП_055323
	н/д
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека

Фермент APOBEC-3C, редактирующий ДНК dC->dU, представляет собой белок , который у человека кодируется APOBEC3C геном . ^{[ 3 ]}^{[ 4 ]}

A3C принадлежит к семейству цитидиндезаминаз A3, которые действуют как факторы рестрикции против различных ретровирусов. Сообщалось, что A3C эффективно ингибирует вирус дефицита иммунодефицита обезьян, а не ВИЧ-1, в отсутствие фактора вирусной инфекционности Vif . ^{[ 5 ]} Повышение каталитической активности A3C оказало лишь незначительное влияние на репликацию ВИЧ-1 (в отсутствие Vif), механизм противодействия вирусу неясен. ^{[ 6 ]} Было также показано, что A3C ингибирует другие вирусы. ^{[ 7 ]}^{[ 8 ]}^{[ 9 ]}^{[ 10 ]}^{[ 11 ]}

Функция

Этот ген является членом цитидиндезаминазы семейства генов . Это один из семи родственных генов или псевдогенов, обнаруженных в кластере, который, как считается, возникает в результате дупликации генов на 22-й хромосоме . Члены кластера кодируют белки, которые структурно и функционально родственны цитидиндезаминазе APOBEC1, редактирующей C-U РНК . И наоборот, белки А3 ферментативно преобразуют цитидин в уридин, присутствующий в одноцепочечной ДНК. ^{[ 12 ]}^{[ 13 ]}^{[ 14 ]}^{[ 15 ]}^{[ 16 ]} Было продемонстрировано, что два остатка в петле 1 A3C определяют его противовирусную активность против ВИЧ-1. ^{[ 17 ]}

Структура

Кристаллическая структура A3C предполагает предполагаемую область связывания vif ВИЧ-1. ^{[ 18 ]}^{[ 19 ]} Было обнаружено, что A3C ингибирует элементы LINE-1 путем прямого взаимодействия с белками ORF1p независимым от деаминазы способом. ^{[ 20 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000244509 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Джармуз А., Честер А., Бэйлисс Дж., Гисборн Дж., Данэм И., Скотт Дж., Наваратнам Н. (март 2002 г.). «Специфический для антропоидов локус сиротских ферментов C-U, редактирующих РНК, на хромосоме 22». Геномика . 79 (3): 285–96. дои : 10.1006/geno.2002.6718 . ПМИД 11863358 .
^ «Ген Энтрез: фермент редактирования мРНК аполипопротеина B APOBEC3C, каталитический полипептидоподобный 3C» .
^ Ю К, Чен Д., Кениг Р., Мариани Р., Унутмаз Д., Ландау Н.Р. (декабрь 2004 г.). «APOBEC3B и APOBEC3C являются мощными ингибиторами репликации вируса иммунодефицита обезьян» . Журнал биологической химии . 279 (51): 53379–86. дои : 10.1074/jbc.M408802200 . PMID 15466872 .
^ Ягува Васудеван А.А., Хофманн Х., Уиллболд Д., Хойссингер Д., Кениг Б.В., Мунк С. (апрель 2017 г.). «Усиление каталитической дезаминирующей активности APOBEC3C недостаточно для ингибирования Vif-дефицитного ВИЧ-1». Журнал молекулярной биологии . 429 (8): 1171–1191. дои : 10.1016/j.jmb.2017.03.015 . ПМИД 28315663 .
^ Баумерт Т.Ф., Рёслер С., Малим М.Х., фон Вайцзеккер Ф. (сентябрь 2007 г.). «ДНК вируса гепатита В подвергается обширному редактированию с помощью деаминазы человека APOBEC3C» . Гепатология . 46 (3): 682–9. дои : 10.1002/hep.21733 . ПМИД 17625792 . S2CID 9029300 .
^ Сюспен Р., Айно М.М., Кох С., Пасделуп Д., Лабетуль М., Гертнер Б., Вартанян Дж.П., Мейерханс А., Уэйн-Хобсон С. (август 2011 г.). «Генетическое редактирование геномов вируса простого герпеса 1 и герпесвируса Эпштейна-Барра с помощью цитидиндезаминазы APOBEC3 человека в культуре и in vivo» . Журнал вирусологии . 85 (15): 7594–602. дои : 10.1128/JVI.00290-11 . ПМК 3147940 . ПМИД 21632763 .
^ Кёк Дж., Блюм Х.Э. (май 2008 г.). «Гипермутация геномов вируса гепатита B с помощью APOBEC3G, APOBEC3C и APOBEC3H» . Журнал общей вирусологии . 89 (Часть 5): 1184–91. дои : 10.1099/vir.0.83507-0 . ПМИД 18420796 .
^ Ли Д., Лю Дж., Кан Ф., Гуань В., Гао Х., Ван Ю., Сунь Д. (октябрь 2011 г.). «Химерный белок Core-APOBEC3C ингибирует репликацию вируса гепатита B». Журнал биохимии . 150 (4): 371–4. дои : 10.1093/jb/mvr086 . ПМИД 21746770 .
^ Ахасан М.М., Вакаэ К., Ван З., Китамура К., Лю Г., Коура М., Имаясу М., Сакамото Н., Ханаока К., Накамура М., Кё С., Кондо С., Фудзивара Х., Ёсидзаки Т., Мори С., Кукимото И., Мурамацу М. (февраль 2015 г.). «APOBEC3A и 3C снижают инфекционность псевдовириона вируса папилломы человека 16» . Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 457 (3): 295–9. дои : 10.1016/j.bbrc.2014.12.103 . hdl : 2297/44628 . ПМИД 25576866 .
^ Ю К, Кениг Р., Пиллаи С., Чайлз К., Кирни М., Палмер С., Ричман Д., Коффин Дж. М., Ландау Н. Р. (май 2004 г.). «Одноцепочечная специфичность APOBEC3G объясняет минус-цепочечное дезаминирование генома ВИЧ». Структурная и молекулярная биология природы . 11 (5): 435–42. дои : 10.1038/nsmb758 . ПМИД 15098018 . S2CID 24306371 .
^ Харрис Р.С., Петерсен-Март С.К., Нойбергер М.С. (ноябрь 2002 г.). «Фермент редактирования РНК APOBEC1 и некоторые его гомологи могут действовать как мутаторы ДНК» . Молекулярная клетка . 10 (5): 1247–53. дои : 10.1016/s1097-2765(02)00742-6 . ПМИД 12453430 .
^ Харрис Р.С., Шихи А.М., Крейг Х.М., Малим М.Х., Нойбергер М.С. (июль 2003 г.). «Дезаминирование ДНК: не только триггер диверсификации антител, но и механизм защиты от ретровирусов». Природная иммунология . 4 (7): 641–3. дои : 10.1038/ni0703-641 . ПМИД 12830140 . S2CID 5549252 .
^ Харрис Р.С., Бишоп К.Н., Шихи А.М., Крейг Х.М., Петерсен-Март С.К., Ватт И.Н., Нойбергер М.С., Малим М.Х. (июнь 2003 г.). «Дезаминирование ДНК обеспечивает врожденный иммунитет к ретровирусной инфекции» . Клетка . 113 (6): 803–9. дои : 10.1016/s0092-8674(03)00423-9 . ПМИД 12809610 .
^ Ю К, Чен Д., Кениг Р., Мариани Р., Унутмаз Д., Ландау Н.Р. (декабрь 2004 г.). «APOBEC3B и APOBEC3C являются мощными ингибиторами репликации вируса иммунодефицита обезьян» . Журнал биологической химии . 279 (51): 53379–86. дои : 10.1074/jbc.M408802200 . PMID 15466872 .
^ Айяппан Джагува Васудеван, Ананда; Балакришнан, Каннан; Г.В. Герцен, Кристофер; Борвето, Фан; Чжан, Зели; Сангвиман, Ануча; Держись, Ульрика; Кустерманн, Кэролайн; Банерджи, Шармиштха; Шуман, Джеральд Г.; Хойссингер, Диеты (октябрь 2020 г.). «Петля 1 APOBEC3C регулирует его противовирусную активность против ВИЧ-1» . Журнал молекулярной биологии . 432 (23): 6200–6227. дои : 10.1016/j.jmb.2020.10.014 . ПМИД 33068636 . S2CID 224318971 .
^ Китамура С., Оде Х., Накашима М., Имахаси М., Наганава Ю., Куросава Т., Ёкомаку Ю., Ямане Т., Ватанабе Н., Сузуки А., Сугиура В., Иватани Ю. (октябрь 2012 г.). «Кристаллическая структура APOBEC3C и интерфейс связывания Vif ВИЧ-1». Структурная и молекулярная биология природы . 19 (10): 1005–10. дои : 10.1038/nsmb.2378 . ПМИД 23001005 . S2CID 7871310 .
^ Чжан З, Гу Ц, Ягува Васудеван А.А., Джейарадж М, Шмидт С, Зелонка Дж, Перкович М, Хекель Дж.О., Цихутек К., Хойссингер Д., Смитс Ш., Мунк С. (ноябрь 2016 г.). «Белки Vif из различных линий вируса иммунодефицита человека / вируса иммунодефицита обезьян имеют различные сайты связывания в A3C» . Журнал вирусологии . 90 (22): 10193–10208. дои : 10.1128/JVI.01497-16 . ПМК 5105656 . ПМИД 27581978 .
^ Хорн А.В., Клавиттер С., Хелд У., Бергер А., Васудеван А.А., Бок А., Хофманн Х., Ханшманн К.М., Треземайер Дж.Х., Флори Э., Ябуловски Р.А., Хан Дж.С., Лёвер Дж., Лёвер Р., Мюнк С., Шуман Г.Г. (январь 2014 г.) ). «Ограничение LINE-1 человека с помощью APOBEC3C не зависит от деаминазы и опосредовано взаимодействием ORF1p, которое влияет на активность обратной транскриптазы LINE» . Исследования нуклеиновых кислот . 42 (1): 396–416. дои : 10.1093/nar/gkt898 . ПМЦ 3874205 . ПМИД 24101588 .

Дальнейшее чтение

Ведекинд Дж. Э., Дэнс Г. С., Соуден, член парламента, Смит Х. К. (апрель 2003 г.). «Редактирование информационной РНК у млекопитающих: новые члены семейства APOBEC, ищущие роль в семейном бизнесе». Тенденции в генетике . 19 (4): 207–16. дои : 10.1016/S0168-9525(03)00054-4 . ПМИД 12683974 .
Каллен БР (февраль 2006 г.). «Роль и механизм действия семейства факторов антиретровирусной резистентности APOBEC3» . Журнал вирусологии . 80 (3): 1067–76. doi : 10.1128/JVI.80.3.1067-1076.2006 . ПМК 1346961 . ПМИД 16414984 .
Васудеван А.А., Смитс Ш., Хёппнер А., Хойсингер Д., Кениг Б.В., Мунк С. (ноябрь 2013 г.). «Структурные особенности противовирусных ДНК-цитидиндезаминаз» (PDF) . Биологическая химия . 394 (11): 1357–70. дои : 10.1515/hsz-2013-0165 . ПМИД 23787464 . S2CID 4151961 .
Хаче Дж., Мански Л.М., Харрис Р.С. (2006). «Человеческие белки APOBEC3, ограничение ретровирусов и устойчивость к лекарствам ВИЧ». Обзоры по СПИДу . 8 (3): 148–57. ПМИД 17078485 .
Мэдсен П., Анант С., Расмуссен Х.Х., Громов П., Ворум Х., Думански Дж.П., Томмеруп Н., Коллинз Дж.Е., Райт К.Л., Данэм И., МакГиннити А.Дж., Дэвидсон Н.О., Селис Дж.Е. (август 1999 г.). «Форболин-1, активируемый при псориазе, имеет структурное, но не функциональное сходство с белком апобек-1, редактирующим мРНК» . Журнал исследовательской дерматологии . 113 (2): 162–9. дои : 10.1046/j.1523–1747.1999.00682.x . ПМИД 10469298 .
Данхэм И, Симидзу Н., Роу Б.А., Чиссо С., Хант А.Р., Коллинз Дж.Э., Брускевич Р., Беар Д.М., Клэмп М., Сминк Л.Дж., Эйнскоу Р., Алмейда Дж.П., Бэббидж А., Бэггули С., Бэйли Дж., Барлоу К., Бейтс К.Н. , Бизли О, Бёрд С.П., Блейки С., Бриджмен А.М., Бак Д., Берджесс Дж., Беррилл WD, О'Брайен КП (декабрь 1999 г.). «Последовательность ДНК 22 хромосомы человека» . Природа . 402 (6761): 489–95. Бибкод : 1999Natur.402..489D . дои : 10.1038/990031 . ПМИД 10591208 .
Мариани Р., Чен Д., Шрёфельбауэр Б., Наварро Ф., Кениг Р., Боллман Б., Мюнк С., Нюмарк-МакМахон Х., Ландау Н.Р. (июль 2003 г.). «Видоспецифическое исключение APOBEC3G из вирионов ВИЧ-1 с помощью Vif» . Клетка . 114 (1): 21–31. дои : 10.1016/S0092-8674(03)00515-4 . ПМИД 12859895 .
Коллинз Дж. Э., Райт К. Л., Эдвардс К. А., Дэвис М. П., Гринхэм Дж. А., Коул К. Г., Говард М. Е., Агуадо Б., Малля М., Мокраб Ю., Хакл Э. Дж., Беар Д. М., Данэм I (2005). «Подход к клонированию ORFeome человека на основе аннотаций генома» . Геномная биология . 5 (10): Р84. дои : 10.1186/gb-2004-5-10-r84 . ПМК 545604 . ПМИД 15461802 .
Ю К, Чен Д., Кениг Р., Мариани Р., Унутмаз Д., Ландау Н.Р. (декабрь 2004 г.). «APOBEC3B и APOBEC3C являются мощными ингибиторами репликации вируса иммунодефицита обезьян» . Журнал биологической химии . 279 (51): 53379–86. дои : 10.1074/jbc.M408802200 . PMID 15466872 .
Ланглуа М.А., Бил Р.К., Контичелло С.Г., Нойбергер М.С. (2005). «Мутационное сравнение однодоменных APOBEC3C и двухдоменных антиретровирусных цитидиндезаминаз APOBEC3C и двухдоменных APOBEC3F/G дает представление о специфичности их целевых участков ДНК» . Исследования нуклеиновых кислот . 33 (6): 1913–23. дои : 10.1093/nar/gki343 . ПМЦ 1074398 . ПМИД 15809227 .
Папа С.Н., Ли И.Р. (февраль 2005 г.). «Двугибридная идентификация дрожжевых белков простаты, взаимодействующих с глобулином, связывающим половые гормоны человека». Журнал биохимии стероидов и молекулярной биологии . 94 (1–3): 203–8. дои : 10.1016/j.jsbmb.2005.01.007 . ПМИД 15862967 . S2CID 9746088 .
Дёле Б.П., Шефер А., Виганд Х.Л., Богерд Х.П., Каллен Б.Р. (июль 2005 г.). «Дифференциальная чувствительность вируса мышиного лейкоза к ингибированию, опосредованному APOBEC3, регулируется исключением вирионов» . Журнал вирусологии . 79 (13): 8201–7. doi : 10.1128/JVI.79.13.8201-8207.2005 . ПМЦ 1143768 . ПМИД 15956565 .
Роуз К.М., Марин М., Козак С.Л., Кабат Д. (июль 2005 г.). «Регулируемое производство и активность цитидиндезаминаз APOBEC3B, 3F и 3G против ВИЧ 1 типа». Исследования СПИДа и ретровирусы человека . 21 (7): 611–9. дои : 10.1089/aid.2005.21.611 . ПМИД 16060832 .
Макенфусс Х., Хамдорф М., Хелд У., Перкович М., Лёвер Дж., Цихутек К., Флори Э., Шуман Г.Г., Мунк К. (август 2006 г.). «Белки APOBEC3 ингибируют ретротранспозицию LINE-1 человека» . Журнал биологической химии . 281 (31): 22161–72. дои : 10.1074/jbc.M601716200 . ПМИД 16735504 .
Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф., Ли Х., Тейлор П., Клими С., МакБрум-Серажевски Л., Робинсон М.Д., О'Коннор Л., Ли М., Тейлор Р., Дарси М., Хо Ю, Хейлбут А., Мур Л., Чжан С., Орнацкий О., Бухман Ю.В., Этьер М., Шэн Ю., Василеску Дж., Абу-Фарха М., Ламберт Дж.П., Дювел. Х.С., Стюарт II, Кюль Б., Хог К., Колвилл К., Гладвиш К., Маскат Б., Кинач Р., Адамс С.Л., Моран М.Ф., Морин ГБ, Топалоглу Т., Фигейс Д. (2007). «Крупномасштабное картирование белково-белковых взаимодействий человека методом масс-спектрометрии» . Молекулярная системная биология . 3 (1): 89. дои : 10.1038/msb4100134 . ПМЦ 1847948 . ПМИД 17353931 .
Киномото М, Канно Т, Шимура М, Ишизака Ю, Кодзима А, Курата Т, Сата Т, Токунага К (2007). «Все белки семейства APOBEC3 дифференциально ингибируют ретротранспозицию LINE-1» . Исследования нуклеиновых кислот . 35 (9): 2955–64. дои : 10.1093/нар/gkm181 . ПМК 1888823 . ПМИД 17439959 .

Внешние ссылки

человека APOBEC3C Расположение генома APOBEC3C и страница сведений о гене в браузере генома UCSC .
Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : Q9NRW3 (фермент, редактирующий ДНК dC->dU APOBEC-3C) на PDBe-KB .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000244509 – Ensembl , май 2017 г.

[2] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid11863358-3] Джармуз А., Честер А., Бэйлисс Дж., Гисборн Дж., Данэм И., Скотт Дж., Наваратнам Н. (март 2002 г.). «Специфический для антропоидов локус сиротских ферментов C-U, редактирующих РНК, на хромосоме 22». Геномика . 79 (3): 285–96. дои : 10.1006/geno.2002.6718 . ПМИД 11863358 .

[entrez-4] «Ген Энтрез: фермент редактирования мРНК аполипопротеина B APOBEC3C, каталитический полипептидоподобный 3C» .

[5] Ю К, Чен Д., Кениг Р., Мариани Р., Унутмаз Д., Ландау Н.Р. (декабрь 2004 г.). «APOBEC3B и APOBEC3C являются мощными ингибиторами репликации вируса иммунодефицита обезьян» . Журнал биологической химии . 279 (51): 53379–86. дои : 10.1074/jbc.M408802200 . PMID 15466872 .

[6] Ягува Васудеван А.А., Хофманн Х., Уиллболд Д., Хойссингер Д., Кениг Б.В., Мунк С. (апрель 2017 г.). «Усиление каталитической дезаминирующей активности APOBEC3C недостаточно для ингибирования Vif-дефицитного ВИЧ-1». Журнал молекулярной биологии . 429 (8): 1171–1191. дои : 10.1016/j.jmb.2017.03.015 . ПМИД 28315663 .

[7] Баумерт Т.Ф., Рёслер С., Малим М.Х., фон Вайцзеккер Ф. (сентябрь 2007 г.). «ДНК вируса гепатита В подвергается обширному редактированию с помощью деаминазы человека APOBEC3C» . Гепатология . 46 (3): 682–9. дои : 10.1002/hep.21733 . ПМИД 17625792 . S2CID 9029300 .

[8] Сюспен Р., Айно М.М., Кох С., Пасделуп Д., Лабетуль М., Гертнер Б., Вартанян Дж.П., Мейерханс А., Уэйн-Хобсон С. (август 2011 г.). «Генетическое редактирование геномов вируса простого герпеса 1 и герпесвируса Эпштейна-Барра с помощью цитидиндезаминазы APOBEC3 человека в культуре и in vivo» . Журнал вирусологии . 85 (15): 7594–602. дои : 10.1128/JVI.00290-11 . ПМК 3147940 . ПМИД 21632763 .

[9] Кёк Дж., Блюм Х.Э. (май 2008 г.). «Гипермутация геномов вируса гепатита B с помощью APOBEC3G, APOBEC3C и APOBEC3H» . Журнал общей вирусологии . 89 (Часть 5): 1184–91. дои : 10.1099/vir.0.83507-0 . ПМИД 18420796 .

[10] Ли Д., Лю Дж., Кан Ф., Гуань В., Гао Х., Ван Ю., Сунь Д. (октябрь 2011 г.). «Химерный белок Core-APOBEC3C ингибирует репликацию вируса гепатита B». Журнал биохимии . 150 (4): 371–4. дои : 10.1093/jb/mvr086 . ПМИД 21746770 .

[11] Ахасан М.М., Вакаэ К., Ван З., Китамура К., Лю Г., Коура М., Имаясу М., Сакамото Н., Ханаока К., Накамура М., Кё С., Кондо С., Фудзивара Х., Ёсидзаки Т., Мори С., Кукимото И., Мурамацу М. (февраль 2015 г.). «APOBEC3A и 3C снижают инфекционность псевдовириона вируса папилломы человека 16» . Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 457 (3): 295–9. дои : 10.1016/j.bbrc.2014.12.103 . hdl : 2297/44628 . ПМИД 25576866 .

[12] Ю К, Кениг Р., Пиллаи С., Чайлз К., Кирни М., Палмер С., Ричман Д., Коффин Дж. М., Ландау Н. Р. (май 2004 г.). «Одноцепочечная специфичность APOBEC3G объясняет минус-цепочечное дезаминирование генома ВИЧ». Структурная и молекулярная биология природы . 11 (5): 435–42. дои : 10.1038/nsmb758 . ПМИД 15098018 . S2CID 24306371 .

[13] Харрис Р.С., Петерсен-Март С.К., Нойбергер М.С. (ноябрь 2002 г.). «Фермент редактирования РНК APOBEC1 и некоторые его гомологи могут действовать как мутаторы ДНК» . Молекулярная клетка . 10 (5): 1247–53. дои : 10.1016/s1097-2765(02)00742-6 . ПМИД 12453430 .

[14] Харрис Р.С., Шихи А.М., Крейг Х.М., Малим М.Х., Нойбергер М.С. (июль 2003 г.). «Дезаминирование ДНК: не только триггер диверсификации антител, но и механизм защиты от ретровирусов». Природная иммунология . 4 (7): 641–3. дои : 10.1038/ni0703-641 . ПМИД 12830140 . S2CID 5549252 .

[15] Харрис Р.С., Бишоп К.Н., Шихи А.М., Крейг Х.М., Петерсен-Март С.К., Ватт И.Н., Нойбергер М.С., Малим М.Х. (июнь 2003 г.). «Дезаминирование ДНК обеспечивает врожденный иммунитет к ретровирусной инфекции» . Клетка . 113 (6): 803–9. дои : 10.1016/s0092-8674(03)00423-9 . ПМИД 12809610 .

[16] Ю К, Чен Д., Кениг Р., Мариани Р., Унутмаз Д., Ландау Н.Р. (декабрь 2004 г.). «APOBEC3B и APOBEC3C являются мощными ингибиторами репликации вируса иммунодефицита обезьян» . Журнал биологической химии . 279 (51): 53379–86. дои : 10.1074/jbc.M408802200 . PMID 15466872 .

[17] Айяппан Джагува Васудеван, Ананда; Балакришнан, Каннан; Г.В. Герцен, Кристофер; Борвето, Фан; Чжан, Зели; Сангвиман, Ануча; Держись, Ульрика; Кустерманн, Кэролайн; Банерджи, Шармиштха; Шуман, Джеральд Г.; Хойссингер, Диеты (октябрь 2020 г.). «Петля 1 APOBEC3C регулирует его противовирусную активность против ВИЧ-1» . Журнал молекулярной биологии . 432 (23): 6200–6227. дои : 10.1016/j.jmb.2020.10.014 . ПМИД 33068636 . S2CID 224318971 .

[18] Китамура С., Оде Х., Накашима М., Имахаси М., Наганава Ю., Куросава Т., Ёкомаку Ю., Ямане Т., Ватанабе Н., Сузуки А., Сугиура В., Иватани Ю. (октябрь 2012 г.). «Кристаллическая структура APOBEC3C и интерфейс связывания Vif ВИЧ-1». Структурная и молекулярная биология природы . 19 (10): 1005–10. дои : 10.1038/nsmb.2378 . ПМИД 23001005 . S2CID 7871310 .

[19] Чжан З, Гу Ц, Ягува Васудеван А.А., Джейарадж М, Шмидт С, Зелонка Дж, Перкович М, Хекель Дж.О., Цихутек К., Хойссингер Д., Смитс Ш., Мунк С. (ноябрь 2016 г.). «Белки Vif из различных линий вируса иммунодефицита человека / вируса иммунодефицита обезьян имеют различные сайты связывания в A3C» . Журнал вирусологии . 90 (22): 10193–10208. дои : 10.1128/JVI.01497-16 . ПМК 5105656 . ПМИД 27581978 .

[20] Хорн А.В., Клавиттер С., Хелд У., Бергер А., Васудеван А.А., Бок А., Хофманн Х., Ханшманн К.М., Треземайер Дж.Х., Флори Э., Ябуловски Р.А., Хан Дж.С., Лёвер Дж., Лёвер Р., Мюнк С., Шуман Г.Г. (январь 2014 г.) ). «Ограничение LINE-1 человека с помощью APOBEC3C не зависит от деаминазы и опосредовано взаимодействием ORF1p, которое влияет на активность обратной транскриптазы LINE» . Исследования нуклеиновых кислот . 42 (1): 396–416. дои : 10.1093/nar/gkt898 . ПМЦ 3874205 . ПМИД 24101588 .

[1]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]

[ 16 ]

[ 17 ]

[ 18 ]

[ 19 ]

[ 20 ]

v т и Гидролазы : углерод-азотные непептиды ( EC 3,5)
3.5.1: Linear amides / Amidohydrolases	Asparaginase Glutaminase Urease Biotinidase Aminoacylase ACY1 Aspartoacylase(ACY2) ACY3 Ceramidase Aspartylglucosaminidase Fatty acid amide hydrolase Histone deacetylase Sirtuin
3.5.2: Cyclic amides/ Amidohydrolases	Barbiturase Beta-lactamase Dihydroorotase
3.5.3: Linear amidines/ Ureohydrolases	Arginase Agmatinase Protein-arginine deiminase
3.5.4: Cyclic amidines/ Aminohydrolases	Guanine deaminase Adenosine deaminase AMP deaminase Inosine monophosphate synthase DCMP deaminase GTP cyclohydrolase I Cytidine deaminase AICDA Activation-induced cytidine deaminase
3.5.5: Nitriles/ Aminohydrolases	Nitrilase
3.5.99: Other	Riboflavinase Thiaminase II

v т и Ферменты
Activity	Active site Binding site Catalytic triad Oxyanion hole Enzyme promiscuity Diffusion-limited enzyme Cofactor Enzyme catalysis
Regulation	Allosteric regulation Cooperativity Enzyme inhibitor Enzyme activator
Classification	EC number Enzyme superfamily Enzyme family List of enzymes
Kinetics	Enzyme kinetics Eadie–Hofstee diagram Hanes–Woolf plot Lineweaver–Burk plot Michaelis–Menten kinetics
Types	EC1 Oxidoreductases (list) EC2 Transferases (list) EC3 Hydrolases (list) EC4 Lyases (list) EC5 Isomerases (list) EC6 Ligases (list) EC7 Translocases (list)