Пепд

Пепд
Доступные структуры
PDB	Поиск ортолога: PDBE RCSB
showСписок кодов идентификаторов PDB
	2IW2, 2OKN
Идентификаторы
Псевдонимы	PEPD , пролидаза, пептидаза D
Внешние идентификаторы	Омим : 613230 ; MGI : 97542 ; Гомологен : 239 ; GeneCards : PEPD ; OMA : PEPD - ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 19 (human)
End	33,521,791 bp
showМестоположение гена ( мышь )
Chr.	Chromosome 7 (mouse)
End	34,744,133 bp
showРНК -паттерн экспрессии
	Top expressed in
	mucosa of ileum; ; human kidney; ; right lobe of liver; ; jejunal mucosa; ; kidney tubule; ; duodenum; ; C1 segment; ; left adrenal cortex; ; stromal cell of endometrium; ; right adrenal cortex;
	Top expressed in
	right kidney; ; intestinal villus; ; jejunum; ; Ileal epithelium; ; proximal tubule; ; human kidney; ; vestibular membrane of cochlear duct; ; duodenum; ; Paneth cell; ; yolk sac;
	More reference expression data
	More reference expression data
showДжин Онтология
Molecular function	peptidase activity; aminopeptidase activity; protein binding; hydrolase activity; metallopeptidase activity; dipeptidase activity; manganese ion binding; metal ion binding; metallocarboxypeptidase activity; proline dipeptidase activity;
Cellular component	extracellular exosome; nucleus; nucleoplasm;
Biological process	collagen catabolic process; cellular amino acid metabolic process; proteolysis;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	5184
	18624
	ENSG00000124299
	Ensmusg00000063931
	P12955
	Q11136
	NM_001166057 ; NM_000285 ; NM_001166056
	NM_008820
	NP_000276 ; NP_001159528 ; NP_001159529
	NP_032846
	Викидид
Посмотреть/редактировать человека	Посмотреть/редактировать мышь

XAA-Pro Dipeptidase , также известная как пролидаза , представляет собой фермент , который у людей кодируется PEPD геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]} Пролидаза является ферментом у людей, который играет решающую роль в метаболизме белков и рециркуляции коллагена посредством катализа стадии ограничивающей скорости в этих химических реакциях. ^{[ 8 ]} Этот фермент кодируется геном PEPD (пептидаза D), расположенной на хромосоме 19. ^{[ 9 ]} Активность сывороточной пролидазы также в настоящее время изучается как биомаркер для заболеваний.

Функция

Dipeptidase XAA-Pro представляет собой цитозольную дипептидазу , которая гидролизует дипептиды пролином или гидроксипролином на карбокси-конце (но не Pro-Pro). Это важно в метаболизме коллагена из -за высоких уровней иминокислот . ^{[ 7 ]} Мутации в локусе PEPD вызывают дефицит пролидазы . Это характеризуется иминодипептидуреа, язв кожи , умственной отсталостью и рецидивирующими инфекциями.

Сывороточная пролидаза попадает в категорию протеаз, в частности, экзопептидазы. Эти числа ЕС варьируются от 3.4.11 до 3.4.19. ^{[ 10 ]}

Структура

Пролидазы подпадают под подклассы металлопептидаз , которые включают бинуклеарные активные участки металлических кластеров . ^{[ 11 ]} Этот металлический кластер облегчает катализ , служа в качестве субстрата сайта связывания , активируя нуклеофилы и стабилизируя переходное состояние . Кроме того, пролидазы классифицируются в меньшем семействе, называемых ферментами "пита-брета", которые расщепляют амидо- , имидо- и амидино- содержащие связи. ^{[ 12 ]} Складка "PITA-Bread", содержащая металлический центр, окруженный двумя четко определенными субстратными карманами, позволила пролидазе специфически дезиться между любой непролиновой аминокислотой и пролином.

PFPROL

Первая в истории решенная структура пролидазы была получена из гипертермофильного археонного пирококка Фуриоса (PFPROL). ^{[ 11 ]} Этот димер имеет кристаллическую структуру показывает два приблизительно симметричных мономеров , которые имеют N-концевой домен , состоящий из шестицепочечного смешанного β-листа, окруженного пятью α-спиралью , спиральным линкером и C-концевым доменом , состоящим из Смешанный шестицепочечный β-лист в окружении четырех α-спиралей. Изогнутый β-лист домена II имеет склад "пита-брелоку". Активный сайт лежит на внутренней поверхности β-листа домена II, с заметным кластером Dinuclear Co, закрепленным боковыми цепями двух аспартатных остатков (ASP209 и ASP220), два остатка глутамата (GLU313 и Glu327 и гистидин Остаток (HIS284). Карбоксилатные группы остатков аспартата и глютамина служат в качестве мостов между двумя атомами CO. В процессе кристаллизации атомы CO заменяются Zn , что препятствует ферментативной активности.

последовательности Гомология между человеком и PFPROL дает только 25% идентичности и 43% сходства. ^{[ 13 ]}

Человеческая сыворотка пролидаза

Две 493 аминокислотные цепи конструируют сывороточную пролидазу, удерживаемую вместе с симметрией C2. ^{[ 14 ]} Эта симметрия C2 относится к двумкранированной вращательной симметрии молекулы без зеркальной симметрии. ^{[ 15 ]} Проще говоря, если бы сывороточная пролидаза вращалась под углом 180º, она выглядела бы одинаково, однако она не выглядела одинаково в зеркальном изображении. Кроме того, эта структура имеет два домена: N-концевой домен и C-концевой домен, последний из которых несет активное место в аминокислотных остатках 185-493. ^{[ 14 ]} Активный сайт - это область на ферменте, с которой связывается субстрат и происходит катализ. Этот С-концевой домен обладает способностью ковалентно связываться с другими ферментами пролидазы, чтобы создать тетрамер через дисульфидные связи. ^{[ 14 ]} Этот домен выполняет сгибу «пита-брелота», состоящий из биметаллического активного центра, удерживаемого двумя атмосферами и одним антипараллельным β-листом. ^{[ 14 ]} Фермент пролидазы считается гомодимерным, что означает, что он образуется двумя идентичными полипептидными цепями. ^{[ 8 ]} В этом ферменте есть как гидрофильные, так и гидрофобные остатки, которые равномерно распределены.

Ионы марганца (мн ²⁺) используются сывороточной пролидазой в качестве ко-факторов. Исследование кристаллической структуры показало, что два Mn ²⁺ Ионы необходимы для каталитической активности этого фермента. ^{[ 8 ]} Это требование приводит к тому, что пролидаза считается активированной металлом пептидазой, термин, используемый для описания ферментов, которые катализируют изменяющие пептиды реакции гидролиза в аминокислоты, обладающие повышенной способностью благодаря существованию ионов металлов. Было указано, что один мн ²⁺ Ион тесно связан с HIS370, в то время как второй предназначен для ASP276. ^{[ 8 ]}

Человеческая пролидаза имеет четыре кристаллические структуры, HSPROL-MN, HSPROL-NA-GLYPRO, HSPROL-MG-LEUPRO и HSPROL-MN-PRO. ^{[ 14 ]} Первая из этих структур, HSProl-MN, относится к активности сывороточной пролидазы перед связыванием субстрата. ^{[ 14 ]} Кроме того, HSPROL-NA-GLYPRO является результатом деградации субстрата, вызванной обменом MN ²⁺ Ион с Na ⁺Полем Это вызвано связыванием субстрата GlyPro с ферментом. ^{[ 14 ]} Третья кристаллическая структура сывороточной пролидазы-HSProl-Mg-Leupro. Эта структура функционирует аналогично hsprol-na-glypro; Тем не менее, субстрат, используемый в этой структуре, является leupro. Кроме того, Mn ²⁺ заменяется MG ²⁺. ^{[ 14 ]} Эти различия приводят к тому, что структура будет более стабильной с более низкой скоростью оборота. ^{[ 14 ]} Окончательной кристаллической структурой сывороточной пролидазы является HSProl-Mn-Pro, которая использует Pro в качестве субстрата. ^{[ 14 ]} Этот профессионал происходит от реакции, катализируемой этим ферментом. ^{[ 14 ]} Кристаллическая структура пролидазы хорошо изучена и регистрируется в банке данных белка. ^{[ 16 ]}

Функция

Роль пролидазы в физиологии человека заключается в разрушении коллагена. Коллаген, наиболее распространенный белок в организме человека, необходим для поддержания сильных соединительных тканей, клеточной пролиферации и заживления ран, среди других функций. ^{[ 17 ]} Поскольку коллаген разлагается, дипептиды высвобождаются как побочный продукт. Сывороточная пролидаза поглощает и переваривает эти побочные продукты, чтобы их можно было повторно использовать при производстве коллагена. ^{[ 8 ]} Пролин необходим для выработки коллагена, что далее указывает на необходимость сывороточной пролидазы, поскольку пролин является продуктом реакции пролидазы. ^{[ 8 ]} Заживление ран является первостепенной функцией в поддержании хорошего здоровья человеческого тела. Коллаген использует свои жесткие свойства для структурной поддержки ранов и ускорения процесса заживления. ^{[ 8 ]} По мере заживления раны коллаген типа III производится фибробластами, который впоследствии заменяется коллагеном типа II, затем коллагеном типа I. ^{[ 8 ]} Эти изменения указывают на разные стадии процесса заживления раны.

Из -за циклической структуры пролина только несколько пептидаз могут расщеплять связь между пролином и другими аминокислотами. ^{[ 18 ]} Наряду с пролиназой , пролидаза являются единственными известными ферментами, которые могут разрушать дипептиды, чтобы получить свободный пролин. Пролидаза служит для гидролиза как диетических, так и эндогенных дипептидов XAA-Pro. Более конкретно, это необходимо для катализирования последней стадии деградации проколлагена, коллагена и других пролинсодержащих пептидов в свободные аминокислоты, которые будут использоваться для клеточного роста. ^{[ 19 ]} Кроме того, он также участвует в процессе переработки пролина из дипептидов XAA-Pro для ресинтеза коллагена. Пролин и гидроипролин составляют четверть аминокислотных остатков в коллагене, который является наиболее распространенным белком в организме массой и играет важную роль в поддержании соединительной ткани в организме. ^{[ 19 ]}^{[ 20 ]}

Механизм

Биохимический и структурный анализ аминопептидазы (AVS), метиониновой аминопептидазы (METAP) и пролидазы, все члены металлоферментов «PITA-Bread» , позволяют предположить, что они имеют общую схему механизма. ^{[ 12 ]} Основное различие возникает в месте атома карбонильного кислорода нос -пептидной связи .

Предлагаемая схема механизма для металла-зависимого фермента «пита-брелота» с нумерацией остатков emetap. ^{[ 12 ]}

Следующий механизм показывает предложенную схему для металла-зависимого фермента «пита-брета» с нумерующим остатком, соответствующим тем, которые обнаружены в метиониновой аминопептидазе из E. coli . ^{[ 12 ]} Как показано на промежуточном I на рисунке, три потенциальных кислотных аминокислотных остатков взаимодействуют с N-конце подложки таким образом, который еще предстоит определить. Карбонильные и амидные группы носкую пептидную связь взаимодействуют с первым ионом металла, M1, в дополнение к HIS178 и HIS79 соответственно. M1 и Glu204 активируют молекулу воды, чтобы придумать ее нуклеофильную атаку на карбонильный углерод ностной пептидной связи. Затем тетраэдрическое промежуточное соединение (промежуточное соединение II) стабилизируется от взаимодействия с M1 и HIS178. Наконец, Glu204 жертвует протон на амин уходящего пептида (P1 '). Это приводит к разрушению промежуточного (промежуточного III), который сохраняет свои взаимодействия с M1 и HIS178.

Путь реакции пролидазы является довольно сложным процессом со многими вовлеченными компонентами. После удаления протона с моста между двумя MN ²⁺ Ионы, субстрат GlyPro вызывает конформационные изменения, поскольку он связывается с активным сайтом. ^{[ 8 ]} Этот GlyPro удерживается на месте водородными связями, образованными множественными аминокислотами в этой структуре. ^{[ 8 ]} Атом Gly-N субстрата GlyPro и атом Gly-O пептидной связи каждый взаимодействует с MN ²⁺ Ионы, которые стабилизируются дополнительными аминокислотами, что приводит к поляризации. ^{[ 8 ]} Эта реакция вызывает атом карбонильного углерода, расположенный на пептидной связи для получения положительного заряда, который затем реагирует с гидроксидом ионом, образованным MN ²⁺ Ионы, создавая тетраэдрический промежуток. ^{[ 8 ]} Происходит конформационное изменение, высвобождающее начальный продукт глицина, в то время как белок все еще закрыт. Дополнительное изменение конформации от закрытого к открытую, когда выпускается пролин, конечный продукт этой реакции. ^{[ 8 ]}

Регулирование

Посттрансляционные модификации пролидазы регулируют его ферментативные способности. фосфорилирование Было показано, что пролидазы увеличивает свою активность, в то время как дефосфорилирование приводит к снижению активности фермента. ^{[ 21 ]} Анализ известной консенсусной последовательности, необходимой для фосфорилирования серина / треонина, показал, что пролидаза содержит по меньшей мере три потенциальных сайта для фосфорилирования серина / треонина. Было показано, что оксид азота, как экзогенно приобретенная, так и эндогенно , увеличивает активность пролидазы в зависимости от времени и дозы посредством фосфорилирования в этих сериновых и треониновых сайтах. ^{[ 22 ]} Кроме того, пролидаза также может регулироваться в сайтах фосфорилирования тирозина , которые опосредованы FAK и MAPK сигнальными путями . ^{[ 21 ]}

Актуальность заболевания

Присутствие сывороточной пролидазы в крови является хорошим показателем наличия и тяжести многих типов заболеваний. Например, пациенты с сахарным диабетом 2 типа имеют повышенные уровни сывороточной пролидазы. ^{[ 8 ]} Это ожидается, потому что высокая глюкоза в крови приводит к снижению выработки коллагена и образования воспалительных клеток, что обесценивает способность заживления ран. ^{[ 8 ]} Кроме того, ревматоидный артрит, анкилозирующий спондилит и доброкачественный синдром гипермобильности сустава соответствовали низким уровням пролидазы в сыворотке. ^{[ 8 ]} Пролидаза стала заметным маркером прогрессирования рака у пациентов с различными типами рака. В зависимости от повышенных уровней пролидазы сыворотки в крови врачи способны определять размер опухоли, стадию рака и прогноз, которые значительно помогают при лечении этих заболеваний. ^{[ 8 ]}

Анализ уровней пролидазы в сыворотке был использован для обнаружения тяжести заболевания печени в некоторых случаях. ^{[ 8 ]} Исследования показали корреляцию между хроническими заболеваниями печени и сывороточной пролидазой. Например, одно исследование показало увеличение уровней пролидазы в сыворотке на начальных стадиях цирротического фиброза печени, а затем снижение по мере прогрессирования заболевания. ^{[ 8 ]} Кроме того, анализ уровней пролидазы в сыворотке у пациентов с алкогольным гепатитом показал более высокие уровни по сравнению с пациентами с циррозом. ^{[ 8 ]}

Сывороточная пролидаза является очень необходимым ферментом в организме человека. Благодаря своим многочисленным функциям, в первую очередь утилизацию коллагена, пролидаза широко используется в общем метаболизме людей. Путь реакции этого фермента является ключом к регулированию синтеза и деградации коллагена, жизненно важного белка, необходимого для множества аспектов организма. Нерегулярные уровни сывороточной пролидазы в крови указывают на различные заболевания и состояния у людей.

Дефицит в пролидазе приводит к редкому тяжелому аутосомно -рецессивному расстройству ( дефицит пролидазы ), которое вызывает многие хронические, изнурительные состояния здоровья у людей. ^{[ 23 ]} Эти фенотипические симптомы варьируются и могут включать изъязвления кожи , умственную замедление , спленомегалию , рецидивирующие инфекции , фоточувствительность , гиперкератоз и необычное внешний вид лица. Кроме того, было обнаружено, что активность пролидазы является аномальной по сравнению со здоровыми уровнями в различных заболеваниях, включая, но ограниченную: биполярное расстройство , рак молочной железы , рак эндометрия , рубца келоида образование , эректильная дисфункция , заболевание печени , рак легких , гипертония , меланома и хроническая панкреатит . ^{[ 18 ]} При некоторых раковых заболеваниях с повышенными уровнями активности пролидазы, такими как меланома, дифференциальная экспрессия пролидазы и ее субстрата специфичности для дипептидов с пролином на карбоксильном конце предполагает потенциал пролидазы в становлении жизнеспособной, селективной эндогенной пролиновых ферментной мишенью для пролепов пролерок . ^{[ 24 ]} Активность фермента пролидазы сыворотки также в настоящее время изучается как возможный надежный маркер для заболеваний, включая хронический гепатит В и фиброз печени . ^{[ 25 ]}^{[ 26 ]}^{[ 27 ]}

Другие приложения

Дезактивация : пролидаза из гипертермофильного археонного пирококкового фариоса (PFProl) демонстрирует потенциал для применения при дезактивации органофосфорных нервных агентов в химических военных агентах . ^{[ 28 ]} Кроме того, пролидаза также может служить для обнаружения фтор -содержащих органофосфорных нейротоксинов , таких как агенты химических военных действий G -типа, и может противодействовать органофосфора интоксикации и защищать от воздействия диизопропилфлюрофосфата при инкапсулировании в липосомах . ^{[ 29 ]}^{[ 30 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000124299 - Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000063931 - Ensembl , май 2017 г.
^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ Endo F, Tanoue A, Nakai H, et al. (Март 1989 г.). «Первичная структура и гена локализация пролидазы человека» . Журнал биологической химии . 264 (8): 4476–81. doi : 10.1016/s0021-9258 (18) 83768-1 . PMID 2925654 .
^ Tanoue A, Endo F, Matsuda I (июль 1990 г.). «Структурная организация гена для пролидазы человека (пептидаза D) и демонстрация частичной делеции гена у пациента с дефицитом пролидазы» . Журнал биологической химии . 265 (19): 11306–11. doi : 10.1016/s0021-9258 (19) 38592-8 . PMID 1972707 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} «Ген Entrez: PEPD пептидаза D» .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и ^фон ^глин ^час ^я ^Дж ^k ^л ^м ^не ^а ^п ^Q. ^{ведущий} ^с ^Т Eni-Aganga I, Lanaghan ZM, Balasubramaniam M, et al. (2021-08-31). «Пролидаза: обзор от Discovery до его роли в здоровье и болезнях» . Границы в молекулярных биологических науках . 8 : 723003. DOI : 10.3389/fmolb.2021.723003 . PMC 8438212 . PMID 34532344 .
^ "PEPD Gene: MedlinePlus Genetics" . medlineplus.gov . Получено 2023-10-24 .
^ Ferreira GC (январь 2021 г.). «Кофакторы и коэнзименты | Синтез гема ☆» . В Jez J (ред.). Энциклопедия биологической химии III (третье изд.). Оксфорд: Elsevier. С. 356–362. doi : 10.1016/b978-0-12-809633-8.21267-3 . ISBN 978-0-12-822040-5 Полем S2CID 240746340 . Получено 2023-10-24 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Maher MJ, Ghosh M, Grunden AM, et al. (Март 2004 г.). «Структура пролидазы из пирококка Фуриоса». Биохимия . 43 (10): 2771–83. doi : 10.1021/bi0356451 . PMID 15005612 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} Лоутер WT, Matthews BW (декабрь 2002 г.). «Металлоаминопептидазы: общие функциональные темы в разрозненных структурных окружениях». Химические обзоры . 102 (12): 4581–608. doi : 10.1021/cr0101757 . PMID 12475202 .
^ Lupi A, Tenni R, Rossi A, et al. (Ноябрь 2008 г.). «Дефицит пролидазы человека и пролидазы: обзор характеристики фермента, участвующего в рециркуляции пролина и влияния его мутаций». Аминокислоты . 35 (4): 739–52. doi : 10.1007/s00726-008-0055-4 . PMID 18340504 . S2CID 925797 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и ^фон ^глин ^час ^я ^Дж ^k Wilk P, Uelein M, Kalms J, et al. (Сентябрь 2017). «Субстратная специфичность и механизм реакции человеческой пролидазы» . Журнал FEBS . 284 (17): 2870–2885. doi : 10.1111/febs.14158 . PMID 28677335 .
^ "C2 Point Group" . www.cup.uni-muenchen.de . Получено 2023-10-24 .
^ «Кристаллическая структура человеческой пролидазы: 3D View: 2okn» . RCSB Белковой банк данных .
^ «Коллаген: что это такое, типы, функция и преимущества» . Клиника Кливленда . Получено 2023-10-24 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Китченер Р.Л., Грунден А.М. (август 2012 г.). «Функция пролидазы в метаболизме пролина и ее медицинское и биотехнологическое применение». Журнал прикладной микробиологии . 113 (2): 233–47. doi : 10.1111/j.1365-2672.2012.05310.x . PMID 22512465 . S2CID 22164798 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Surazynski A, Miltyk W, Palka J, et al. (Ноябрь 2008 г.). «Пролидаза-зависимая регуляция биосинтеза коллагена». Аминокислоты . 35 (4): 731–8. doi : 10.1007/s00726-008-0051-8 . PMID 18320291 . S2CID 13025572 .
^ Phang JM, Donald SP, Pandhare J, et al. (Ноябрь 2008 г.). «Метаболизм пролина, стрессового субстрата, модулирует канцерогенные пути» . Аминокислоты . 35 (4): 681–90. doi : 10.1007/s00726-008-0063-4 . PMID 18401543 . S2CID 26081769 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Surazyński A, Pałka J, Wołczyński S (апрель 2001 г.). «Фосфорилирование пролидазы увеличивает ферментную активность». Молекулярная и клеточная биохимия . 220 (1–2): 95–101. doi : 10.1023/a: 1010849100540 . PMID 11451388 . S2CID 25456347 .
^ Surazynski A, Liu Y, Miltyk W, et al. (Декабрь 2005 г.). «Оксид азота регулирует активность пролидазы с помощью серинового/треонинового фосфорилирования» . Журнал сотовой биохимии . 96 (5): 1086–1094. doi : 10.1002/jcb.20631 . PMID 16167338 . S2CID 33258991 .
^ Viglio S, Annovazzi L, Conti B, et al. (Февраль 2006 г.). «Роль новых методов в исследовании дефицита пролидазы: от диагностики до развития возможного терапевтического подхода». Журнал хроматографии б . 832 (1): 1–8. doi : 10.1016/j.jchromb.2005.12.049 . PMID 16434239 .
^ Mittal S, Song X, Vig BS, et al. (2005). «Пролидаза, потенциальная ферментативная мишень для меланомы: конструкция пролиносодержащих дипептид-подобных пролекарств». Молекулярная фармацевтика . 2 (1): 37–46. doi : 10.1021/mp049922p . PMID 15804176 .
^ Şen V, Uluca ü, ECE A, et al. (Ноябрь 2014). «Активность пролидазы сыворотки и статус окислителя-антиоксиданта у детей с хронической инфекцией вируса гепатита В» . Итальянский журнал педиатрии . 40 (1): 95. doi : 10.1186/s13052-014-0095-1 . PMC 4247636 . PMID 25425101 .
^ Duygu F, Aksoy N, Cicek AC, et al. (Сентябрь 2013 г.). «Пролидаза указывает на ухудшение инфекции гепатита В?» Полем Журнал клинического лабораторного анализа . 27 (5): 398–401. doi : 10.1002/jcla.21617 . PMC 6807447 . PMID 24038226 .
^ Stanfliet JC, Locketz M, Berman P, et al. (Май 2015). «Оценка полезности сывороточной пролидазы в качестве маркера фиброза печени» . Журнал клинического лабораторного анализа . 29 (3): 208–13. doi : 10.1002/jcla.21752 . PMC 6807100 . PMID 24798655 .
^ Theriot CM, Du X, Tove Sr, et al. (Август 2010 г.). «Улучшение каталитической активности гипертермофильного пирококка пролидаз для детоксикации органофосфорных нервных агентов на широком диапазоне температур». Прикладная микробиология и биотехнология . 87 (5): 1715–26. doi : 10.1007/s00253-010-2614-3 . PMID 20422176 . S2CID 1363629 .
^ Саймонян А.Л., Гримсли Дж.К., Камбалы AW, et al. (2001). «Биосенсор на основе ферментов для прямого обнаружения фториносодержащих органофосфатов». Analytica Chimica Acta . 442 (1): 15–23. Bibcode : 2001acac..442 ... 15S . doi : 10.1016/s0003-2670 (01) 01131-x .
^ Petrikovics I, Cheng TC, Papahadjopoulos D, et al. (Сентябрь 2000). «Длинные циркулирующие липосомы, инкапсулирующие ормофосфоровую кислоту ангидролазу в дизопропилфлюрофосфатном антагонизме» . Токсикологические науки . 57 (1): 16–21. doi : 10.1093/toxsci/57.1.16 . PMID 10966507 .

Дальнейшее чтение

Tanoue A, Endo F, Kitano A, et al. (Июль 1990). «Единое изменение нуклеотида в гене пролидазы в фибробластах у двух пациентов с дефицитом полипептид -положительной пролидазы. Экспрессия мутантного фермента в клетках NIH 3T3» . Журнал клинических исследований . 86 (1): 351–5. doi : 10.1172/jci114708 . PMC 296729 . PMID 2365824 .
Boright AP, Scriver CR, Lancaster GA, et al. (Май 1989). «Дефицит пролидазы: биохимическая классификация аллелей» . Американский журнал человеческой генетики . 44 (5): 731–40. PMC 1715628 . PMID 2705457 .
Friedrich U, Brunner H, Smets D, et al. (Март 1987 г.). «Анализ трехточечных сцеплений с использованием маркеров C3 и 19CEN назначает ген миотонической дистрофии на 19Q». Человеческая генетика . 75 (3): 291–3. doi : 10.1007/bf00281077 . PMID 2881880 . S2CID 24376519 .
Maruyama K, Sugano S (январь 1994 г.). «Олиго-капитализация: простой метод замены структуры крышки эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген . 138 (1–2): 171–4. doi : 10.1016/0378-1119 (94) 90802-8 . PMID 8125298 .
Ledoux P, Scriver C, Hechtman P (июнь 1994 г.). «Четыре новых аллеля PEPD, вызывающие дефицит пролидазы» . Американский журнал человеческой генетики . 54 (6): 1014–21. PMC 1918181 . PMID 8198124 .
Ledoux P, Scriver CR, Hechtman P (ноябрь 1996 г.). «Экспрессия и молекулярный анализ мутаций при дефиците пролидазы» . Американский журнал человеческой генетики . 59 (5): 1035–9. PMC 1914827 . PMID 8900231 .
Pałka JA (1997). «Роль пролидазы как фермента, участвующего в метаболизме коллагена». Анналы Медицинского университета Биалистока . 41 (2): 149–60. PMID 9020526 .
Palka JA, Phang JM (ноябрь 1997 г.). «Активность пролидазы в фибробластах регулируется взаимодействием внеклеточного матрикса с рецепторами интегрина клеточной поверхности» . Журнал сотовой биохимии . 67 (2): 166–75. doi : 10.1002/(SICI) 1097-4644 (19971101) 67: 2 <166 :: AID-JCB2> 3.0.CO; 2-V . PMID 9328822 . S2CID 30974724 .
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, et al. (Октябрь 1997). «Строительство и характеристика обогащенной полной длиной и библиотекой кДНК с 5'-эндом». Ген . 200 (1–2): 149–56. doi : 10.1016/s0378-1119 (97) 00411-3 . PMID 9373149 .
Muszyńska A, Pałka J, Gorodkiewicz E (май 2000). «Механизм индуцированного даунорубином ингибирования активности пролидазы в фибробластах кожи человека и его значение для нарушения биосинтеза коллагена». Экспериментальная и токсикологическая патология . 52 (2): 149–55. doi : 10.1016/s0940-2993 (00) 80108-6 . PMID 10965990 .
Surazyński A, Pałka J (2002). «FAK-независимая регуляция активности пролидазы и биосинтеза коллагена в клетках MCF-7». Folia histochemica et cytobiologica . 39 (Suppl 2): 212–3. PMID 11820613 .
Харрис Р.А., Ян А., Стейн Р.К. и др. (Февраль 2002 г.). «Кластерный анализ обширной базы данных экспрессии белка рака молочной железы человека». Протеомика . 2 (2): 212–23. doi : 10.1002/1615-9861 (200202) 2: 2 <212 :: AID-Prot212> 3.0.co; 2-H . PMID 11840567 . S2CID 44946014 .
Forlino A, Lupi A, Vaghi P, et al. (Октябрь 2002). «Мутационный анализ пяти новых пациентов, страдающих дефицитом пролидазы: отсутствие ферментной активности вызывает некроз-подобную гибель клеток в культивируемых фибробластах». Человеческая генетика . 111 (4–5): 314–22. doi : 10.1007/s00439-002-0792-5 . PMID 12384772 . S2CID 40260709 .
Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D, et al. (Август 2004 г.). «Крупномасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 101 (33): 12130–5. Bibcode : 2004pnas..10112130B . doi : 10.1073/pnas.0404720101 . PMC 514446 . PMID 15302935 .
Lupi A, De Riso A, Della Torre S, et al. (2004). «Характеристика нового аллеля PEPD, вызывающего дефицит пролидазы у двух неродственных пациентов: мутации естественного тока в качестве инструмента для исследования взаимосвязи структурной функции» . Журнал человеческой генетики . 49 (9): 500–6. doi : 10.1007/s10038-004-0180-1 . PMID 15309682 .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000124299 - Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000063931 - Ensembl , май 2017 г.

[3] «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[4] «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[pmid2925654-5] Endo F, Tanoue A, Nakai H, et al. (Март 1989 г.). «Первичная структура и гена локализация пролидазы человека» . Журнал биологической химии . 264 (8): 4476–81. doi : 10.1016/s0021-9258 (18) 83768-1 . PMID 2925654 .

[pmid1972707-6] Tanoue A, Endo F, Matsuda I (июль 1990 г.). «Структурная организация гена для пролидазы человека (пептидаза D) и демонстрация частичной делеции гена у пациента с дефицитом пролидазы» . Журнал биологической химии . 265 (19): 11306–11. doi : 10.1016/s0021-9258 (19) 38592-8 . PMID 1972707 .

[entrez-7] Jump up to: ^а ^{беременный} «Ген Entrez: PEPD пептидаза D» .

[ireti-8] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и ^фон ^глин ^час ^я ^Дж ^k ^л ^м ^не ^а ^п ^Q. ^{ведущий} ^с ^Т Eni-Aganga I, Lanaghan ZM, Balasubramaniam M, et al. (2021-08-31). «Пролидаза: обзор от Discovery до его роли в здоровье и болезнях» . Границы в молекулярных биологических науках . 8 : 723003. DOI : 10.3389/fmolb.2021.723003 . PMC 8438212 . PMID 34532344 .

[medlineplus-9] "PEPD Gene: MedlinePlus Genetics" . medlineplus.gov . Получено 2023-10-24 .

[10] Ferreira GC (январь 2021 г.). «Кофакторы и коэнзименты | Синтез гема ☆» . В Jez J (ред.). Энциклопедия биологической химии III (третье изд.). Оксфорд: Elsevier. С. 356–362. doi : 10.1016/b978-0-12-809633-8.21267-3 . ISBN 978-0-12-822040-5 Полем S2CID 240746340 . Получено 2023-10-24 .

[Guss_2004-11] Jump up to: ^а ^{беременный} Maher MJ, Ghosh M, Grunden AM, et al. (Март 2004 г.). «Структура пролидазы из пирококка Фуриоса». Биохимия . 43 (10): 2771–83. doi : 10.1021/bi0356451 . PMID 15005612 .

[Matthews_2002-12] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} Лоутер WT, Matthews BW (декабрь 2002 г.). «Металлоаминопептидазы: общие функциональные темы в разрозненных структурных окружениях». Химические обзоры . 102 (12): 4581–608. doi : 10.1021/cr0101757 . PMID 12475202 .

[Forlino_2008-13] Lupi A, Tenni R, Rossi A, et al. (Ноябрь 2008 г.). «Дефицит пролидазы человека и пролидазы: обзор характеристики фермента, участвующего в рециркуляции пролина и влияния его мутаций». Аминокислоты . 35 (4): 739–52. doi : 10.1007/s00726-008-0055-4 . PMID 18340504 . S2CID 925797 .

[wilk-14] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и ^фон ^глин ^час ^я ^Дж ^k Wilk P, Uelein M, Kalms J, et al. (Сентябрь 2017). «Субстратная специфичность и механизм реакции человеческой пролидазы» . Журнал FEBS . 284 (17): 2870–2885. doi : 10.1111/febs.14158 . PMID 28677335 .

[15] "C2 Point Group" . www.cup.uni-muenchen.de . Получено 2023-10-24 .

[16] «Кристаллическая структура человеческой пролидазы: 3D View: 2okn» . RCSB Белковой банк данных .

[17] «Коллаген: что это такое, типы, функция и преимущества» . Клиника Кливленда . Получено 2023-10-24 .

[Grunden_2012-18] Jump up to: ^а ^{беременный} Китченер Р.Л., Грунден А.М. (август 2012 г.). «Функция пролидазы в метаболизме пролина и ее медицинское и биотехнологическое применение». Журнал прикладной микробиологии . 113 (2): 233–47. doi : 10.1111/j.1365-2672.2012.05310.x . PMID 22512465 . S2CID 22164798 .

[Phang_2008-19] Jump up to: ^а ^{беременный} Surazynski A, Miltyk W, Palka J, et al. (Ноябрь 2008 г.). «Пролидаза-зависимая регуляция биосинтеза коллагена». Аминокислоты . 35 (4): 731–8. doi : 10.1007/s00726-008-0051-8 . PMID 18320291 . S2CID 13025572 .

[Liu_2008-20] Phang JM, Donald SP, Pandhare J, et al. (Ноябрь 2008 г.). «Метаболизм пролина, стрессового субстрата, модулирует канцерогенные пути» . Аминокислоты . 35 (4): 681–90. doi : 10.1007/s00726-008-0063-4 . PMID 18401543 . S2CID 26081769 .

[Wolczynski_2001-21] Jump up to: ^а ^{беременный} Surazyński A, Pałka J, Wołczyński S (апрель 2001 г.). «Фосфорилирование пролидазы увеличивает ферментную активность». Молекулярная и клеточная биохимия . 220 (1–2): 95–101. doi : 10.1023/a: 1010849100540 . PMID 11451388 . S2CID 25456347 .

[Phang_2005-22] Surazynski A, Liu Y, Miltyk W, et al. (Декабрь 2005 г.). «Оксид азота регулирует активность пролидазы с помощью серинового/треонинового фосфорилирования» . Журнал сотовой биохимии . 96 (5): 1086–1094. doi : 10.1002/jcb.20631 . PMID 16167338 . S2CID 33258991 .

[Iadarola_2006-23] Viglio S, Annovazzi L, Conti B, et al. (Февраль 2006 г.). «Роль новых методов в исследовании дефицита пролидазы: от диагностики до развития возможного терапевтического подхода». Журнал хроматографии б . 832 (1): 1–8. doi : 10.1016/j.jchromb.2005.12.049 . PMID 16434239 .

[Amidon_2005-24] Mittal S, Song X, Vig BS, et al. (2005). «Пролидаза, потенциальная ферментативная мишень для меланомы: конструкция пролиносодержащих дипептид-подобных пролекарств». Молекулярная фармацевтика . 2 (1): 37–46. doi : 10.1021/mp049922p . PMID 15804176 .

[Tekin_2014-25] Şen V, Uluca ü, ECE A, et al. (Ноябрь 2014). «Активность пролидазы сыворотки и статус окислителя-антиоксиданта у детей с хронической инфекцией вируса гепатита В» . Итальянский журнал педиатрии . 40 (1): 95. doi : 10.1186/s13052-014-0095-1 . PMC 4247636 . PMID 25425101 .

[Unlu_2013-26] Duygu F, Aksoy N, Cicek AC, et al. (Сентябрь 2013 г.). «Пролидаза указывает на ухудшение инфекции гепатита В?» Полем Журнал клинического лабораторного анализа . 27 (5): 398–401. doi : 10.1002/jcla.21617 . PMC 6807447 . PMID 24038226 .

[Pillay_2014-27] Stanfliet JC, Locketz M, Berman P, et al. (Май 2015). «Оценка полезности сывороточной пролидазы в качестве маркера фиброза печени» . Журнал клинического лабораторного анализа . 29 (3): 208–13. doi : 10.1002/jcla.21752 . PMC 6807100 . PMID 24798655 .

[Grunden_2010-28] Theriot CM, Du X, Tove Sr, et al. (Август 2010 г.). «Улучшение каталитической активности гипертермофильного пирококка пролидаз для детоксикации органофосфорных нервных агентов на широком диапазоне температур». Прикладная микробиология и биотехнология . 87 (5): 1715–26. doi : 10.1007/s00253-010-2614-3 . PMID 20422176 . S2CID 1363629 .

[Wild_2001-29] Саймонян А.Л., Гримсли Дж.К., Камбалы AW, et al. (2001). «Биосенсор на основе ферментов для прямого обнаружения фториносодержащих органофосфатов». Analytica Chimica Acta . 442 (1): 15–23. Bibcode : 2001acac..442 ... 15S . doi : 10.1016/s0003-2670 (01) 01131-x .

[Way_2000-30] Petrikovics I, Cheng TC, Papahadjopoulos D, et al. (Сентябрь 2000). «Длинные циркулирующие липосомы, инкапсулирующие ормофосфоровую кислоту ангидролазу в дизопропилфлюрофосфатном антагонизме» . Токсикологические науки . 57 (1): 16–21. doi : 10.1093/toxsci/57.1.16 . PMID 10966507 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]

[ 16 ]

[ 17 ]

[ 18 ]

[ 19 ]

[ 20 ]

[ 21 ]

[ 22 ]

[ 23 ]

[ 24 ]

[ 25 ]

[ 26 ]

[ 27 ]

[ 28 ]

[ 29 ]

[ 30 ]