Марцин Хоффманн
Марцин Хоффманн | |
---|---|
![]() | |
Рожденный | 2 октября 1972 г. Годзеше Вельке , Польша | ( 51 год)
Альма-матер | Университет Адама Мицкевича в Познани |
Научная карьера | |
Поля | |
Диссертация | Эффекты замещения гидроксильной группы атомом фтора - исследования ab initio и DFT (2000) |
Марцин Мацей Хоффманн (родился 2 октября 1972 г.) — польский учёный и предприниматель . Он является профессором химии химического факультета Университета Адама Мицкевича в Познани .
Ранние годы
[ редактировать ]Хоффманн родился в 1972 году в Годзеше-Вельке , небольшом городке недалеко от Калиша . Он посещал начальную школу № 30 в Познани и среднюю школу имени Кароля Марцинковского в Познани ; в то время он стал лауреатом Польской олимпиады по физике и дважды лауреатом Польской олимпиады по химии. В 1996 году ему было присвоено звание магистра химии на химическом факультете Университета Адама Мицкевича в Познани ; его диссертация « Теоретический анализ избранных (R,R)-винной кислоты» производных , которую курировал Яцек Рыхлевский , была удостоена первой премии факультетского конкурса на лучшую магистерскую диссертацию того года. В 1997 году он получил степень магистра биотехнологии на биологическом факультете АМУ за диссертацию «Свойства гликопротеинов, выделенных из Chelidonium majus» млечного сока , под руководством Анны Годзицкой-Юзефиак. Во время учебы в магистратуре он выиграл ряд различных стипендий , в том числе предоставленных министром национального образования . [ 1 ] и Фонда Стефана Батория , он также был президентом студенческого совета АМУ . химического факультета [ 2 ] В 2000 году защитил кандидатскую диссертацию по химии « Эффекты замещения гидроксильной группы атомом фтора - ab initio и DFT исследования». [ 3 ] (под руководством Рыхлевского), награжден первой премией ежегодного факультетского конкурса на лучшую кандидатскую диссертацию. Он также получил степень MBA , организованную совместно Познанской экономической академией и Государственным университетом Джорджии в Атланте в 2000 году (под руководством Хенрика Мрука в качестве преподавателя его управленческого проекта), а также аспирантуру по информатике на AMU факультете математики и информатики в 2004. [ 2 ]
Академическая карьера
[ редактировать ]Уже во время учебы в магистратуре Хоффманн прошел академическую стажировку в Оксфордском университете под руководством доктора Джона М. Брауна. [ 2 ] После получения степени доктора философии он работал доцентом АМУ ; химического факультета в 2001–2002 годах работал постдокторантом в Университете Эмори в Атланте , где проводил исследования под руководством Кейджи Морокумы , [ 2 ] всемирно признанный эксперт в области квантовой химии . [ 4 ] Будучи молодым ученым, он был удостоен ряда стипендий различных учреждений, таких как Фонд польской науки и Центр прикладной волновой механики ( Centre de Mécanique Ondulatoire Appliquée ). [ 2 ] Защитил кандидатскую диссертацию « Квантово-химические расчеты в молекулярном моделировании отдельных систем, важных в химии , биохимии и медицине» . [ 5 ] в 2009 году и стал доцентом два года спустя . 8 марта 2017 года в возрасте 44 лет ему было присвоено звание профессора Президентом Анджеем Дудой Республики Польша . [ 6 ]
Научная деятельность
[ редактировать ]Исследования Хоффмана сосредоточены на применении вычислительных методов квантовой химии при исследовании структуры молекул и взаимодействий между ними , а также на моделировании ферментативных реакций , а также на разработке новых лекарств и химических соединений желаемой активности с использованием вычислительных моделей. построен для этой цели. К результатам его научных исследований относятся:
- Определение влияния замещения гидроксильной группы на атом фтора в ряде соединений, в том числе (R,R)-винной кислоты производных и D-глюкозе , на их конформационную свободу . [ 7 ] [ 8 ] [ 9 ]
- Детальный конформационный анализ множественных (R,R)-винной кислоты производных . [ 10 ] [ 11 ] [ 12 ] [ 13 ]
- Подробное объяснение механизма ингибирования тербинафином скваленэпоксидазы выяснение и полностью атомной трехмерной модели этого белка . [ 14 ]
- Исследование двойного переноса протона в люмихрома. димере [ 15 ] и в люмихром / уксусная кислота . системе [ 16 ]
- Детальное исследование влияния широкого круга заместителей на геометрическое и электронное строение фтор- и трифторметилбензолов производных . [ 17 ]
- Объяснение механизма азатиоприна биоактивации молекулами цистеина и глутатиона . [ 18 ]
- Характеристика гомо- и гетеробиядерных комплексов Zn (II) и Ln(III) ионов с тридентатным лигандом на основе Шиффа . [ 19 ]
- Исследование мембранного транспорта некоторых производных пурина ( антиметаболитов ). [ 20 ]
- Определение белковых эффектов О 2 молекулы с активным центром метанмонооксигеназы . связывания [ 21 ]
- Открытие частого встречаемости палиндромных последовательностей в белковых молекулах. [ 22 ]
- Оценка эффективности Fe(0) комплексов с мультивинилсиликоновыми лигандами при гидросилилировании и дегидрогенативном силилировании стирола тризамещенными . силанами и гидросилоксанами [ 23 ]
- Открытие общей палиндромной последовательности (TCTCGCGAGA) в промоторах генов человека . [ 24 ]
- Конформационный флувастатина анализ [ 25 ] и аторвастатин [ 26 ] а также выяснение механизма взаимного превращения их лактона в оксикарбоновую кислоту в кислой и щелочной среде.
- Объяснение механизма взаимодействия коронавируса SARS хеликазы / АТФазы и АТФ и разработка потенциальных ингибиторов этого фермента. [ 27 ]
- Разработка новых лейцил-тРНК-синтетазы ингибиторов [ 28 ] самодельных аминоацил-тРНК-синтазы ингибиторов на основе базы данных . [ 29 ]
- Идентификация новых прегнановых X-рецепторов активаторов . [ 30 ]
- Разработка самодельной компьютерной программы MM2QM, объединяющей докинг , молекулярную динамику , молекулярную механику и квантовую механику . [ 31 ]
- Исследование механизма теломеразы ингибирования алкалоидами Chelidonium majus изохинолиновыми квадруплекса путем стабилизации теломерных последовательностей G- . [ 32 ]
- Выяснение геометрии UO 4 − ион , образующийся при диссоциации некоторых сложных анионов уранила . [ 33 ]
В результате этих и других исследований были установлены авторство и соавторство ок. 100 публикаций (101 по данным Google Scholar ), включая высокопрестижные научные журналы , такие как Journal of the American Chemical Society и Cancer Research . Его статьи цитируются из года в год все чаще (всего 960 — Google Scholar ), что дает 9,50 цитирований на публикацию и индекс Хирша 18. [ 34 ]
Образовательная деятельность
[ редактировать ]С 1996 года Хоффманн активно преподает на АМУ химическом факультете , частично на английском языке. Эти занятия включают лекции, семинары, семинары и лабораторные занятия по широкому спектру курсов: от фундаментальных предметов, а именно физической химии , квантовой химии и теоретической химии , до более конкретных, таких как применение вычислительных методов , молекулярное моделирование и онлайн-базы данных. в других областях химии . Он также работал учителем в X средней школе в Познани в течение двух лет (1999–2001). [ 2 ] За свою карьеру он руководил несколькими десятками бакалаврских и магистерских диссертаций , а также четырьмя докторскими диссертациями : [ 35 ]
- Доктор Якуб Пашь (2013), название диссертации: Применение и реализация вероятностных методов сравнения профилей для распознавания складки белков .
- Доктор Марцин Новосельски (2015), название диссертации: Квантовые и классические механические вычислительные методы в компьютерном дизайне лекарств .
- Доктор Войцех Янковский (2017), название диссертации: Квантово-химические исследования комплексов избранных алкалоидов с цинка (II) и меди (II) ионами .
- Доктор Мартина Кута-Сейковска (2018), название диссертации: Исследования взаимодействия протоонкогенных G-квадруплексов с лигандами .
Он также рассмотрел несколько десятков бакалаврских и магистерских диссертаций, семь докторских диссертаций, два процесса абилитации и две заявки на звание профессора (доктор хаб. Мариуш Маковски, UG и доктор хаб. Роберт Вечорек, UWr ).
Организационная деятельность
[ редактировать ]На протяжении многих лет Хоффманн активно работал над расширением научных и образовательных возможностей Университета Адама Мицкевича , например, инициируя и соавторами AMU – наднациональных и междисциплинарных решений 21 века ( мн. UAM – ponadnarodowe i interdyscyplinarne rozwiązania XXI wieku ). – проект, софинансируемый Национальным центром исследований и разработок , осуществляемый совместно с университетом Массачусетс Лоуэлл , а также соавтор программ курсов бакалавриата , магистратуры и доктора философии на химическом факультете. Он активно участвует в организации мероприятий по популяризации науки на факультете, таких как Познаньский фестиваль науки и искусства или Ночь европейских исследователей . С 2012 года — заместитель декана по научной работе (переизбран в 2016 году). [ 36 ] Он является инициатором и секретарем жюри или присуждения Яцека Рыхлевского премии Польского химического общества за лучшую магистерскую диссертацию по квантовой химии за использование методов квантовой химии в других областях науки . Он рассматривал и давал заключения по реализации исследовательских проектов, финансируемых Национальным научным центром , заявок на гранты для молодых ученых и заявок на проекты, подаваемых в Польскую грид-инфраструктуру PLGrid . В 2013 году совместно с Институтом «БиоИнфоБанк» и Междисциплинарным центром математического и вычислительного моделирования Хоффманн организовал международную конференцию «Достижения молекулярного моделирования» . С 2014 года является членом Научного комитета Всепольского семинара аспирантов «Между химией и биологией» ( пл. Ogólnopolskie Seminarium Doktorantów «Na pograniczu chemii i biologii» ). [ 37 ] Он также возглавлял работу секции теоретической и вычислительной химии на 59-м научном конгрессе Польского химического общества в 2016 году. [ 38 ]
Другие достижения
[ редактировать ]широко сотрудничает с высокотехнологичными предприятиями , реализующими идею экономики, основанной на знаниях Помимо академической работы, Хоффманн уже почти двадцать лет . В 2002–2003 годах работал консультантом McKinsey & Company , управляя телекоммуникациями и энергоносителями ; В 2004 году стал директором по инвестициям и развитию Института «БиоИнфоБанк» . В 2007 году вместе с Лешеком Рыхлевским он основал BIB Seed Capital — фонд начального капитала , ориентированный на поддержку польской научной и инженерной мысли в таких областях, как биоинформатика , молекулярная биология , химия и информатика , а также содействие ее передаче в малый и средний бизнес. крупные предприятия . [ 39 ] Целенаправленные инвестиции компании, возглавляемой Хоффманном и по сей день, позволили ей приумножить свои финансовые ресурсы , а некоторые из стартапов профинансированных ею стали глобальными игроками, такие как:
- Medicalgorithmics SA – польская высокотехнологичная компания, эксперт и поставщик системных и алгоритмических решений в области кардиодиагностики ; компания котируется на Варшавской фондовой бирже . [ 40 ]
- Proteon Pharmaceuticals SA – польская фармацевтическая компания , которая проводит исследования бактериофагов и использует их в качестве основы для разработки новых препаратов – успешных заменителей антибиотиков. [ 41 ]
С 2010 года работал свидетелем-экспертом Окружного суда Познани по точным наукам , экономическим наукам и предпринимательству ; он также давал экспертные заключения для судов в других городах, включая Варшаву , Мыслибуж и Лович . [ 42 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ В то время отвечал за высшее образование в Польше.
- ^ Jump up to: а б с д и ж Хоффманн 2014 .
- ^ «Марцин Хоффманн» . Центра обработки информации База данных (на польском языке).
- ^ Цуи, Кью; Ирле, С.; Мусаев Дж. (февраль 2018 г.). «Кейджи Морокума (1934-2017)» . Angewandte Chemie, международное издание . 57 (9): 2288–2289. дои : 10.1002/anie.201800390 . ПМИД 29392802 .
- ^ «Марцин Хоффманн» . Центра обработки информации База данных (на польском языке).
- ^ «Президент присвоил профессорские звания» . President.pl (на польском языке). 08.03.2017 . Проверено 29 октября 2018 г.
- ^ Хоффманн, М.; Рыхлевски Дж.; Рыхлевска, У. (февраль 1999 г.). «Эффекты замещения ОН-группы атомом F на конформационные предпочтения фторзамещенных аналогов (R, R)-винной кислоты, ее диметилового диэфира, диамида и N, N, N ', N'-тетраметилдиамида. Ab Initio Конформационный анализ». Журнал Американского химического общества . 121 (9): 1912–1921. дои : 10.1021/ja982935+ .
- ^ Хоффманн, М.; Рыхлевски, Дж. (март 2001 г.). «Эффекты замены группы OH атомом F в D-глюкозе. Ab initio и DFT-анализ». Журнал Американского химического общества . 123 (10): 2308–16. дои : 10.1021/ja003198w . ПМИД 11456879 .
- ^ Хоффманн, М.; Рыхлевски, Дж. (июль 2002 г.). «Когда в контексте разработки лекарств атом фтора может успешно заменить гидроксильную группу?». Международный журнал квантовой химии . 89 (4): 419–427. дои : 10.1002/qua.10277 .
- ^ Шарецка, А.; Хоффманн, М.; Рыхлевски, Дж; Рыхлевская, У. (январь 1996 г.). «Рентгеноструктурные и теоретические исследования метилового эфира моноамида (R,R)-винной кислоты: полуэмпирические и ab initio расчеты некоторых модельных соединений». Журнал молекулярной структуры . 374 (1–3): 363–372. Бибкод : 1996JMoSt.374..363S . дои : 10.1016/0022-2860(95)08928-4 .
- ^ Гавронский, Ю.; Гавроньска, К.; Сковронек, П.; Рыхлевска, У.; и др. (апрель 1997 г.). «Факторы, влияющие на конформацию эфира (R, R)-винной кислоты, производных амида и нитрила. Рентгеновская дифракция, круговой дихроизм, ядерный магнитный резонанс и исследования ab initio». Тетраэдр . 53 (17): 6113–6144. дои : 10.1016/S0040-4020(97)00271-8 .
- ^ Рыхлевска, У.; Варжайтис, Б.; Хоффманн, М.; Рыхлевски, Дж. (июль 1997 г.). «Диметиловый диэфир (R, R)-винной кислоты по данным рентгеновских исследований и ab initio исследований: факторы, влияющие на его конформацию и упаковку» . Молекулы . 2 (7): 106–113. дои : 10.3390/20700106 .
- ^ Хоффманн, М.; Шарецка, А.; Рыхлевски, Дж. (1998). Газофазный конформационный анализ (R, R)-винной кислоты, ее диамида, N, N, N', N'-тетраметилдиамида и модельных соединений . Достижения квантовой химии. Том. 32. С. 109–125. дои : 10.1016/S0065-3276(08)60409-8 . ISBN 9780120348336 .
- ^ Новосельский, М.; Хоффманн, М.; Вирвич, Л.С.; Степняк, П.; и др. (февраль 2011 г.). «Детальный механизм ингибирования скваленэпоксидазы тербинафином». Журнал химической информации и моделирования . 51 (2): 455–62. дои : 10.1021/ci100403b . ПМИД 21229992 .
- ^ Сикорска, Э.; Хмелинский И.; Кубицкий, М.; Прукала, В.; и др. (апрель 2006 г.). «В поисках переноса протона в возбужденном состоянии в димере люмихрома в твердом состоянии: теоретический и экспериментальный подход». Журнал физической химии А. 110 (14): 4638–48. Бибкод : 2006JPCA..110.4638S . дои : 10.1021/jp060072y . ПМИД 16599430 .
- ^ Сикорска, Э.; Хмелинский И.; Хоффманн, М.; Мачадо, ИФ; и др. (декабрь 2005 г.). «Двойной перенос протона в основном и возбужденном состоянии в системе люмихром/уксусная кислота: теоретический и экспериментальный подход». Журнал физической химии А. 109 (51): 11707–14. Бибкод : 2005JPCA..10911707S . дои : 10.1021/jp053951d . ПМИД 16366620 .
- ^ Сиодла, Т.; Озиминский, В.П.; Хоффманн, М.; Короняк, Х.; Крыговский, Т.М. (август 2014 г.). «К физической интерпретации эффектов заместителей: случай фтора и трифторметильных групп». Журнал органической химии . 79 (16): 7321–31. дои : 10.1021/jo501013p . ПМИД 25046196 .
- ^ Хоффманн, М.; Рыхлевски Дж.; Хшановска, М.; Германн, Т. (июль 2001 г.). «Механизм активации иммунодепрессанта: азатиоприна. Квантово-химическое исследование реакции азатиоприна с цистеином». Журнал Американского химического общества . 123 (26): 6404–9. дои : 10.1021/ja010378c . ПМИД 11427067 .
- ^ Патроняк, В.; Стефанкевич А.; Лен, Дж.; Кубицкий, М.; Хоффманн, М. (январь 2006 г.). «Самосборка и характеристика гомо- и гетеродинадерных комплексов ионов цинка (II) и лантанида (III) с трехдентатным лигандом на основании Шиффа». Европейский журнал неорганической химии . 2006 (1): 144–149. дои : 10.1002/ejic.200500699 .
- ^ Хоффманн, М.; Хшановска, М.; Германн, Т.; Рыхлевски, Дж. (июнь 2005 г.). «Моделирование транспорта производных пурина через клеточные мембраны на основе определения их коэффициента распределения и квантово-химических расчетов» . Журнал медицинской химии . 48 (13): 4482–6. дои : 10.1021/jm0495273 . ПМИД 15974600 .
- ^ Хоффманн, М.; Хавруцкий, ИВ; Мусаев, Д.Г.; Морокума, К. (июнь 2004 г.). «Влияние белка на связывание O2 с активным центром метанмонооксигеназы: исследования ONIOM» . Международный журнал квантовой химии . 99 (6): 972–980. дои : 10.1002/qua.20141 .
- ^ Гиль-Петрасук, М.; Хоффманн, М.; Долецка, С.; Рыхлевски Дж.; Барчишевски, Дж. (февраль 2003 г.). «Палиндромы в белках». Журнал белковой химии . 22 (2): 109–13. дои : 10.1023/а:1023454111924 . ПМИД 12760415 . S2CID 28294669 .
- ^ Марцинец, Б.; Ковначка, А.; Ковнацкий И.; Хоффманн, М.; Тейлор, Р. (август 2015 г.). «Гидросилирование против дегидрогенативного силилирования стирола, катализируемого карбонильными комплексами железа (0) с поливинилкремниевыми лигандами - Механистические последствия». Журнал металлоорганической химии . 791 : 58–65. doi : 10.1016/j.jorganchem.2015.04.051 .
- ^ Вирвич, Л.С.; Гай, П.; Хоффманн, М.; Рыхлевски, Л.; Островский, Дж. (2007). «Общий цис-элемент в промоторах синтеза белка и генах клеточного цикла» . Польский биохимический акт . 54 (1): 89–98. дои : 10.18388/abp.2007_3273 . ПМИД 17351670 .
- ^ Грабаркевич, Т.; Гробельный, П.; Хоффманн, М.; Милкарек, Дж. (декабрь 2006 г.). «Исследование методом DFT взаимного превращения гидроксикислоты и лактона статинов: случай флувастатина». Орг. Биомол. Хим . 4 (23): 4299–306. дои : 10.1039/b612999b . ПМИД 17102875 .
- ^ Хоффманн, М.; Новосельский, М. (октябрь 2008 г.). «Исследование методом DFT взаимного превращения гидроксикислоты и лактона статинов: случай аторвастатина». Органическая и биомолекулярная химия . 6 (19): 3527–31. дои : 10.1039/b803342k . ПМИД 19082153 .
- ^ Плевчинский, Д.; Хоффманн, М.; фон Гротгусс, М.; Гинальский, К.; Рычевский, Л. (апрель 2007 г.). «Прогнозирование in silico ингибиторов протеазы SARS с помощью виртуального высокопроизводительного скрининга» . Химическая биология и дизайн лекарств . 69 (4): 269–79. дои : 10.1111/j.1747-0285.2007.00475.x . ПМЦ 7188353 . ПМИД 17461975 .
- ^ Хоффманн, М.; Торчала, М. (июнь 2009 г.). «Поиск ингибиторов аминоацил-тРНК-синтазы с помощью химии виртуального клика». Журнал молекулярного моделирования . 15 (6): 665–72. дои : 10.1007/s00894-008-0421-x . ПМИД 19048310 . S2CID 207035662 .
- ^ Торчала, М.; Хоффманн, М. (сентябрь 2007 г.). «IA, база данных известных лигандов аминоацил-тРНК-синтетаз». Журнал компьютерного молекулярного дизайна . 21 (9): 523–5. Бибкод : 2007JCAMD..21..523T . дои : 10.1007/s10822-007-9135-x . ПМИД 17882381 . S2CID 27897915 .
- ^ Ратаевски, М.; Гржелак И.; Вишневска, К.; Рыба, К.; и др. (январь 2015 г.). «Проверка химической библиотеки выявила новые фармакологические соединения, активирующие PXR». Письма по токсикологии . 232 (1): 193–202. дои : 10.1016/j.toxlet.2014.10.009 . ПМИД 25455453 .
- ^ Новосельский, М.; Хоффманн, М.; Курон, А.; Корицка-Мачала, М.; Дзядек, Дж. (апрель 2013 г.). «Инструмент MM2QM для объединения стыковки, молекулярной динамики, молекулярной механики и квантовой механики». Журнал вычислительной химии . 34 (9): 750–6. дои : 10.1002/jcc.23192 . ПМИД 23233437 . S2CID 659117 .
- ^ Нурейни, Словакия; Эсмаили, Х.; Абачи, Ф.; Хиали, С.; и др. (август 2017 г.). «Селективность основных изохинолиновых алкалоидов Chelidonium majus по отношению к теломерному G-квадруплексу: исследование с использованием анализа переходного FRET (t-FRET)» . Biochimica et Biophysical Acta (BBA) – Общие предметы . 1861 (8): 2020–2030 гг. дои : 10.1016/j.bbagen.2017.05.002 . ПМИД 28479277 .
- ^ Сокальска, М.; Прусаковска, М.; Хоффманн, М.; Герчик, Б.; Франьски, Р. (октябрь 2010 г.). «Необычный ион UO(4)(-) образовался при диссоциации, вызванной столкновением [UO(2)(NO(3))(3)](-), [UO(2)(ClO(4))(3)] (-), ионы [UO(2)(CH(3)COO)(3)](-)» . Журнал Американского общества масс-спектрометрии . 21 (10): 1789–94. дои : 10.1016/j.jasms.2010.06.018 . ПМИД 20678945 .
- ^ Публикации Марцина Хоффмана, индексируемые Google Scholar.
- ^ «Марцин Хоффманн» . Центра обработки информации База данных (на польском языке).
- ^ «Химический факультет Университета Адама Мицкевича в Познани - Марцин Хоффманн» (на польском языке) . Проверено 29 октября 2018 г.
- ^ «XVI На границе химии и биологии 2018 – Организаторы» [XVI Между химией и биологией – Организаторы] . Проверено 29 октября 2018 г.
- ^ «59-й научный конгресс Польского химического общества – Секции» . Проверено 29 октября 2018 г.
- ^ «BIB Seed Capital» . Проверено 29 октября 2018 г.
- ^ «Медицинскаягоритмика» . Проверено 29 октября 2018 г.
- ^ «Протеон Фармасьютикалс» . Проверено 29 октября 2018 г.
- ^ « Реестр свидетелей-экспертов Окружного суда в Познани » (PDF) (на польском языке) . Проверено 29 октября 2018 г.
Источники
[ редактировать ]- Хоффманн, Марцин (2014). «Биографическая справка» (PDF) . medicalgorithmics.com (на польском языке) . Проверено 29 октября 2018 г.
- «Марцин Хоффманн» . Центра обработки информации База данных (на польском языке).
Внешние ссылки
[ редактировать ]- Публикации Марцина Хоффмана , индексируемые Google Scholar
- BIB Seed Capital (официальный сайт)