Циклаза монометилового эфира магния-протопорфирина IX (окислительная)
| Циклаза монометилового эфира магния-протопорфирина IX (окислительная) | |||
|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||
| Номер ЕС. | 1.14.13.81 | ||
| Номер CAS. | 92353-62-3 | ||
| Базы данных | |||
| ИнтЭнк | вид IntEnz | ||
| БРЕНДА | БРЕНДА запись | ||
| Экспаси | Просмотр NiceZyme | ||
| КЕГГ | КЕГГ запись | ||
| МетаЦик | метаболический путь | ||
| ПРЯМОЙ | профиль | ||
| PDB Структуры | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||
| |||
Циклаза монометилового эфира магния-протопорфирина IX (окислительная) ( EC 1.14.13.81 ) представляет собой фермент с систематическим названием 13-монометиловый эфир магния-протопорфирина-IX, ферредоксин:оксидоредуктаза кислорода (гидроксилирование) . [ 1 ] В растениях этот фермент катализирует следующую общую химическую реакцию:
- магний-протопорфирин IX 13-монометиловый эфир + 3 НАДФН + 3 H + + 3 О 2 дивинилпротохлорофиллид + 3 НАДФ + + 5 H 2 O (общая реакция)
Недавние доказательства [ 2 ] показывает, что необходимые электроны, которые переводят фермент из окисленной формы в восстановленную, поступают от ферредоксина . В зеленой ткани ферредоксин может получать эти электроны непосредственно из фотосистемы I , поэтому НАДФН не требуется. Однако в темноте ферредоксин также может быть восстановлен с помощью ферредоксина-НАДФ(+) редуктазы , что позволяет в этом случае протекать реакции. Поэтому точнее будет показать отдельные этапы следующим образом:
- (1a) магний-протопорфирин IX 13-монометиловый эфир + 2 восстановленный ферредоксин + O 2 13 1 -гидрокси-магний-протопорфирин IX 13-монометиловый эфир + H 2 O
- (1б) 13 1 -гидрокси-магний-протопорфирин IX 13-монометиловый эфир + 2 восстановленный ферредоксин + O 2 13 1 -оксо-магний-протопорфирин IX 13-монометиловый эфир + 2 H 2 O
- (1в) 13 1 -оксо-магний-протопорфирин IX 13-монометиловый эфир + 2 восстановленный ферредоксин + O 2 дивинилпротохлорофиллид + 2 H 2 O
Для активности этого фермента требуется Fe(II). В ячмене белок циклаза называется XanL и кодируется геном Xantha-1 . Связанный с ним белок Ycf54, по-видимому, необходим для правильного созревания фермента XanL. [ 2 ] является частью пути биосинтеза хлорофиллов который . [ 3 ] [ 4 ] [ 5 ] В анаэробных организмах, таких как Rhodobacter sphaeroides, происходит такая же общая трансформация, но кислород, включенный в 13-монометиловый эфир магния-протопорфирина IX, поступает из воды в реакции EC 1.21.98.3 . [ 6 ]
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Болливар Д.В., Бил С.И. (сентябрь 1996 г.). «Фермент биосинтеза хлорофилла Mg-протопорфирин IX монометиловый эфир (окислительная) циклаза (характеристика и частичная очистка от Chlamydomonas reinhardtii и Synechocystis sp. PCC 6803)» . Физиология растений . 112 (1): 105–114. дои : 10.1104/стр.112.1.105 . ПМК 157929 . ПМИД 12226378 .
- ^ Перейти обратно: а б Стюарт Д., Сандстрем М., Юсеф Х.М., Захрабекова С., Йенсен П.Е., Болливар Д.В., Ханссон М. (08.09.2020). «Аэробный ячменный магний-протопорфирин IX монометилэфирциклаза питается электронами ферредоксина» . Растения . 9 (9): 1157. doi : 10.3390/plants9091157 . ПМК 7570240 . ПМИД 32911631 .
- ^ Уиллоуз Р.Д. (июнь 2003 г.). «Биосинтез хлорофиллов из протопорфирина IX». Отчеты о натуральных продуктах . 20 (3): 327–41. дои : 10.1039/B110549N . ПМИД 12828371 .
- ^ Болливар Д.В. (ноябрь 2006 г.). «Последние достижения в биосинтезе хлорофилла». Исследования фотосинтеза . 90 (2): 173–94. дои : 10.1007/s11120-006-9076-6 . ПМИД 17370354 . S2CID 23808539 .
- ^ Танака, Рёичи; Танака, Аюми (2007). «Биосинтез тетрапиррола у высших растений». Ежегодный обзор биологии растений . 58 : 321–346. doi : 10.1146/annurev.arplant.57.032905.105448 . ПМИД 17227226 .
- ^ Порра, Роберт Дж.; Шафер, Вольфрам; Гад'Он, Наср; Катедер, Ингрид; Дрюс, Герхарт; Шеер, Хьюго (1996). «Происхождение двух карбонильных кислородов бактериохлорофилла а. Демонстрация двух различных путей образования кольца е у Rhodobacter sphaeroides и Roseobacter denitrificans, а также общего гидратазного механизма образования 3-ацетильной группы» . Европейский журнал биохимии . 239 (1): 85–92. doi : 10.1111/j.1432-1033.1996.0085u.x . ПМИД 8706723 .
