Jump to content

ЭХМТ1

(Перенаправлено с G9a-подобного белка )
ЭХМТ1
Доступные структуры
ПДБ Поиск ортологов: PDBe RCSB
Идентификаторы
Псевдонимы EHMT1 , EUHMTASE1, Eu-HMTase1, FP13812, GLP, GLP1, KMT1D, bA188C12.1, эухроматическая гистон-лизинметилтрансфераза 1, EHMT1-IT1, KLEFS1
Внешние идентификаторы ОМИМ : 607001 ; МГИ : 1924933 ; Гомологен : 11698 ; GeneCards : EHMT1 ; ОМА : EHMT1 — ортологи
Ортологи
Разновидность Человек Мышь
Входить
Вместе
ЮниПрот
RefSeq (мРНК)

НМ_001012518
НМ_001109686
НМ_001109687
НМ_172545

RefSeq (белок)

НП_001012536
НП_001103156
НП_001103157
НП_766133

Местоположение (UCSC) Chr 9: 137,62 – 137,87 Мб Chr 2: 24,79 – 24,92 Мб
в PubMed Поиск [3] [4]
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

Эухроматическая гистон-лизин-N-метилтрансфераза 1 , также известная как G9a-подобный белок ( GLP ), представляет собой белок , который у человека кодируется геном EHMT1 . [5]

Структура

[ редактировать ]

Информационная РНК EHMT1 подвергается альтернативному сплайсингу с образованием трех предсказанных изоформ белка . начиная с N-конца Каноническая изоформа, , имеет восемь анкириновых повторов pre-SET и , домены SET . Вторая и третья изоформы имеют отсутствующие или неполные С-концевые домены SET соответственно. [6]

G9A-подобный белок (GLP) разделяет эволюционно консервативный домен SET с G9A , ответственным за метилтрансферазы . активность [7] Домен SET в первую очередь функционирует для установления и поддержания моно- и диметилирования H3K9, маркера факультативного гетерохроматина . [7] [8] При временной сверхэкспрессии G9A и GLP образуют гомо- и гетеродимеры через свой домен SET. [9] Однако эндогенно оба фермента функционируют исключительно как гетеромерный комплекс. [9] Хотя G9A и GLP могут независимо проявлять свою метилтрансферазную активность in vitro , если G9a или Glp нокаутированы in vivo , глобальные уровни H3K9me2 сильно снижаются и эквивалентны уровням H3K9me2 у мышей с двойным нокаутом G9a и Glp. [7] Поэтому считается, что G9A не может компенсировать потерю активности GLP-метилтрансферазы in vivo , и наоборот. [7] Другим важным функциональным доменом, общим для G9A и GLP, является область, содержащая повторы анкриина , который участвует в белок-белковых взаимодействиях. Домен анкиринового повтора также содержит сайты связывания H3K9me1 и H3K9me2. [7] Следовательно, комплекс G9A/GLP может как метилировать хвосты гистонов, так и связываться с моно- и диметилированными H3K9, рекрутируя молекулы, такие как ДНК-метилтрансферазы , в хроматин. [10] [7] H3K9me2 представляет собой обратимую модификацию и может быть удален с помощью широкого спектра лизиндеметилаз гистонов (KDM), включая членов семейства KDM1, KDM3, KDM4 и KDM7. [7] [11] [12]

В дополнение к их роли гистон-лизин-метилтрансфераз (HMT), несколько исследований показали, что G9A/GLP также способны метилировать широкий спектр негистоновых белков. [13] Однако, поскольку большинство известных сайтов метилирования были получены в результате масс-спектрометрического анализа, функция многих из этих модификаций остается неизвестной. Тем не менее, появляется все больше данных, свидетельствующих о том, что метилирование негистоновых белков может влиять на стабильность белков, межбелковые взаимодействия и регулировать клеточные сигнальные пути. [14] [13] [15] [16] Например, G9A/GLP могут метилировать ряд факторов транскрипции, чтобы регулировать их транскрипционную активность, включая MyoD, [17] К/ЕВР, [16] Рептин, [15] р53, [18] МЕФ2Д, [19] МЕФ2С [20] и МТА1. [21] Более того, G9A/GLP способны метилировать негистоновые белки для регулирования комплексов, которые рекрутируют ДНК-метилтрансферазы на промоторы генов для подавления транскрипции посредством метилирования CpG-островков . [22] [23] Таким образом, G9A и/или GLP играют широкую роль в развитии. [20] [17] установление и поддержание идентичности клеток, [17] [24] регуляция клеточного цикла, [18] и клеточные реакции на раздражители окружающей среды, [15] которые зависят от их негистоновой белково-метилтрансферазной активности.

Клиническое значение

[ редактировать ]

Дефекты этого гена являются причиной синдрома субтеломерной делеции хромосомы 9q (синдрома 9q или синдрома Клифстры-1). [5]

Нарушение регуляции EHMT1 связано с воспалительными и сердечно-сосудистыми заболеваниями. [25] [26] [27] [28]

  1. ^ Перейти обратно: а б с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000181090 Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ Перейти обратно: а б с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000036893 Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Перейти обратно: а б «Ген Энтреза: эухроматическая гистон-лизин-N-метилтрансфераза 1» . Проверено 4 марта 2012 г.
  6. ^ Клифстра Т., Бруннер Х.Г., Амиэль Дж., Оудаккер А.Р., Нилсен В.М., Маги А. и др. (август 2006 г.). «Мутации потери функции в гистон-метилтрансферазе 1 эухроматина (EHMT1) вызывают синдром субтеломерной делеции 9q34» . Американский журнал генетики человека . 79 (2): 370–7. дои : 10.1086/505693 . ПМЦ   1559478 . ПМИД   16826528 .
  7. ^ Перейти обратно: а б с д и ж г Синкай Ю., Татибана М. (апрель 2011 г.). «Метилтрансфераза H3K9 G9a и родственная молекула GLP» . Гены и развитие . 25 (8): 781–8. дои : 10.1101/gad.2027411 . ПМК   3078703 . ПМИД   21498567 .
  8. ^ Сюн Ю, Ли Ф, Бабо Н, Донг А, Цзэн Х, Ву Х и др. (март 2017 г.). «Открытие мощных и селективных ингибиторов G9a-подобного белка (GLP) лизинметилтрансферазы» . Журнал медицинской химии . 60 (5): 1876–1891. doi : 10.1021/acs.jmedchem.6b01645 . ПМК   5352984 . ПМИД   28135087 .
  9. ^ Перейти обратно: а б Тачибана М., Уэда Дж., Фукуда М., Такеда Н., Охта Т., Иванари Х. и др. (апрель 2005 г.). «Гистон-метилтрансферазы G9a и GLP образуют гетеромерные комплексы и обе имеют решающее значение для метилирования эухроматина по H3-K9» . Гены и развитие . 19 (7): 815–26. дои : 10.1101/gad.1284005 . ПМЦ   1074319 . ПМИД   15774718 .
  10. ^ Чжан Т., Терманис А., Озкан Б., Бао XX, Калли Дж., де Лима Алвес Ф. и др. (апрель 2016 г.). «Комплекс G9a/GLP поддерживает импринтированное метилирование ДНК в эмбриональных стволовых клетках» . Отчеты по ячейкам . 15 (1): 77–85. дои : 10.1016/j.celrep.2016.03.007 . ПМЦ   4826439 . ПМИД   27052169 .
  11. ^ Делькув GP, Растегар М, Дэви-младший (май 2009 г.). «Эпигенетический контроль». Журнал клеточной физиологии . 219 (2): 243–50. дои : 10.1002/jcp.21678 . ПМИД   19127539 . S2CID   39355478 .
  12. ^ Клоос П.А., Кристенсен Дж., Аггер К., Хелин К. (май 2008 г.). «Стирание метильной метки: деметилазы гистонов в центре клеточной дифференциации и болезней» . Гены и развитие . 22 (9): 1115–40. дои : 10.1101/gad.1652908 . ПМК   2732404 . ПМИД   18451103 .
  13. ^ Перейти обратно: а б Биггар К.К., Ли СС (январь 2015 г.). «Метилирование негистоновых белков как регулятор клеточной передачи сигналов и функций» . Обзоры природы. Молекулярно-клеточная биология . 16 (1): 5–17. дои : 10.1038/nrm3915 . ПМИД   25491103 . S2CID   12558106 .
  14. ^ Lee JY, Lee SH, Heo SH, Kim KS, Kim C, Kim DK и др. (22 октября 2015 г.). «Новая функция лизинметилтрансферазы G9a в регуляции стабильности белка Sox2» . ПЛОС ОДИН . 10 (10): e0141118. Бибкод : 2015PLoSO..1041118L . дои : 10.1371/journal.pone.0141118 . ПМК   4619656 . ПМИД   26492085 .
  15. ^ Перейти обратно: а б с Ли Дж.С., Ким Ю., Ким И.С., Ким Б., Чой Х.Дж., Ли Дж.М. и др. (июль 2010 г.). «Негативная регуляция гипоксических реакций посредством индуцированного метилирования рептина» . Молекулярная клетка . 39 (1): 71–85. doi : 10.1016/j.molcel.2010.06.008 . ПМК   4651011 . ПМИД   20603076 .
  16. ^ Перейти обратно: а б Плесс О, Ковенц-Лейц Э, Кноблих М, Лаузен Дж, Бейерманн М, Уолш МДж, Лейц А (сентябрь 2008 г.). «G9a-опосредованное метилирование лизина изменяет функцию CCAAT/белка-бета, связывающего энхансер» . Журнал биологической химии . 283 (39): 26357–63. дои : 10.1074/jbc.M802132200 . ПМЦ   3258912 . ПМИД   18647749 .
  17. ^ Перейти обратно: а б с Линг Б.М., Бхарати Н., Чунг Т.К., Кок В.К., Ли С., Тан Ю.Х. и др. (январь 2012 г.). «Лизинметилтрансфераза G9a метилирует фактор транскрипции MyoD и регулирует дифференцировку скелетных мышц» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 109 (3): 841–6. Бибкод : 2012PNAS..109..841L . дои : 10.1073/pnas.1111628109 . ПМК   3271886 . ПМИД   22215600 .
  18. ^ Перейти обратно: а б Хуан Дж., Дорси Дж., Чуйков С., Перес-Бургос Л., Чжан Х., Дженувейн Т. и др. (март 2010 г.). «G9a и Glp метилируют лизин 373 в супрессоре опухоли p53» . Журнал биологической химии . 285 (13): 9636–41. дои : 10.1074/jbc.M109.062588 . ПМЦ   2843213 . ПМИД   20118233 .
  19. ^ Чой Дж., Чан Х., Ким Х., Ли Дж.Х., Ким С.Т., Чо Э.Дж., Юн Х.Д. (январь 2014 г.). «Модуляция метилирования лизина в факторе-энхансере 2 миоцитов во время дифференцировки клеток скелетных мышц» . Исследования нуклеиновых кислот . 42 (1): 224–34. дои : 10.1093/нар/gkt873 . ПМЦ   3874188 . ПМИД   24078251 .
  20. ^ Перейти обратно: а б Оу Дж.Р., Паланичами Кала М., Рао В.К., Чой М.Х., Бхарати Н., Танеджа Р. (сентябрь 2016 г.). «G9a ингибирует активность MEF2C, контролируя сборку саркомера» . Научные отчеты . 6 (1): 34163. Бибкод : 2016NatSR...634163O . дои : 10.1038/srep34163 . ПМК   5036183 . ПМИД   27667720 .
  21. ^ Наир С.С., Ли ДК, Кумар Р. (февраль 2013 г.). «Основной фактор ремоделирования хроматина управляет глобальной передачей сигналов хроматина посредством многовалентного чтения нуклеосомных кодов» . Молекулярная клетка . 49 (4): 704–18. дои : 10.1016/j.molcel.2012.12.016 . ПМЦ   3582764 . ПМИД   23352453 .
  22. ^ Чанг И., Сунь Л., Кокура К., Хортон Дж.Р., Фукуда М., Эспехо А. и др. (ноябрь 2011 г.). «MPP8 опосредует взаимодействие между ДНК-метилтрансферазой Dnmt3a и метилтрансферазой H3K9 GLP/G9a» . Природные коммуникации . 2 : 533. Бибкод : 2011NatCo...2..533C . дои : 10.1038/ncomms1549 . ПМЦ   3286832 . ПМИД   22086334 .
  23. ^ Люнг Д.С., Донг К.Б., Максакова И.А., Гоял П., Аппана Р., Ли С. и др. (апрель 2011 г.). «Лизинметилтрансфераза G9a необходима для метилирования ДНК de novo и установления, но не поддержания, подавления провирусов» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 108 (14): 5718–23. Бибкод : 2011PNAS..108.5718L . дои : 10.1073/pnas.1014660108 . ПМК   3078371 . ПМИД   21427230 .
  24. ^ Перселл DJ, Халид О, Оу С.И., Литтл Г.Х., Френкель Б., Банивал С.К., Столлкап М.Р. (июль 2012 г.). «Привлечение корегулятора G9a с помощью Runx2 для избирательного усиления или подавления транскрипции» . Журнал клеточной биохимии . 113 (7): 2406–14. дои : 10.1002/jcb.24114 . ПМК   3350606 . ПМИД   22389001 .
  25. ^ Тьенпонт Б., Аронсен Дж.М., Робинсон Э.Л., Оккенхауг Х., Лош Э., Феррини А. и др. (январь 2017 г.). «Диметилтрансферазы H3K9 EHMT1/2 защищают от патологической гипертрофии сердца» . Журнал клинических исследований . 127 (1): 335–348. дои : 10.1172/JCI88353 . ПМК   5199699 . ПМИД   27893464 .
  26. ^ Харман Дж.Л., Добникар Л., Чаппелл Дж., Стокелл Б.Г., Долби А., Фут К. и др. (ноябрь 2019 г.). «Эпигенетическая регуляция сосудистых гладкомышечных клеток с помощью диметилирования гистона H3 лизина 9 ослабляет индукцию целевого гена посредством передачи воспалительных сигналов» . Атеросклероз, тромбоз и сосудистая биология . 39 (11): 2289–2302. дои : 10.1161/ATVBAHA.119.312765 . ПМК   6818986 . ПМИД   31434493 .
  27. ^ Леви Д., Куо А.Дж., Чанг Й., Шефер У., Китсон С., Чунг П. и др. (январь 2011 г.). «Метилирование лизина субъединицы RelA NF-κB с помощью SETD6 связывает активность гистон-метилтрансферазы GLP в хроматине с тонической репрессией передачи сигналов NF-κB» . Природная иммунология . 12 (1): 29–36. дои : 10.1038/н.1968 . ПМК   3074206 . ПМИД   21131967 .
  28. ^ Харман Дж.Л., Йоргенсен ХФ (октябрь 2019 г.). «Роль гладкомышечных клеток в стабильности бляшек: потенциал терапевтического нацеливания» . Британский журнал фармакологии . 176 (19): 3741–3753. дои : 10.1111/bph.14779 . ПМК   6780045 . PMID   31254285 .
[ редактировать ]
  • Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : Q9H9B1 (гистон-лизин N-метилтрансфераза EHMT1) на PDBe-KB .
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: 5f1d9f332040a443d6a5a1a09daa81a3__1708516020
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/5f/a3/5f1d9f332040a443d6a5a1a09daa81a3.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
EHMT1 - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)