Геномный проект-Написание

The Genome Project — Write (также известный как GP-Write ) — масштабный совместный исследовательский проект (расширение Genome Projects , направленное на чтение геномов с 1984 года), направленный на разработку технологий синтеза и тестирования геномов множество различных видов микробов, растений и животных, включая геном человека в подпроекте, известном как «Проект генома человека» ( HGP-Write ). ^{[ 1 ]}^{[ 2 ]}^{[ 3 ]}^{[ 4 ]}^{[ 5 ]}^{[ 6 ]} Официально объявленный 2 июня 2016 года, проект объединяет двадцатилетнюю работу в области синтетической биологии и искусственного синтеза генов .

Недавно созданный проект GP-Write будет управляться Центром передового опыта инженерной биологии. ^{[ 7 ]} американская некоммерческая организация. Исследователи ожидают, что способность искусственно синтезировать большие части многих геномов приведет ко многим научным и медицинским достижениям. ^{[ 1 ]}^{[ 2 ]}^{[ 3 ]}^{[ 4 ]}^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Наука и развитие

В мае 2021 года GP-write и Twist Bioscience запустили новую платформу САПР для полногеномного дизайна. САПР GP-write автоматизирует рабочие процессы, обеспечивая совместную работу, необходимую для масштабирования от проектирования плазмид до мегабаз по всем геномам. ^{[ 8 ]}

Проекты микробного генома - Написать

Технологии конструирования и тестирования искусственных хромосом дрожжей (YAC), синтетических геномов дрожжей (Sc2.0), ^{[ 9 ]} а устойчивые к вирусам и фагам бактериальные геномы находят промышленное, сельскохозяйственное и медицинское применение. ^{[ 2 ]}

Написание проекта «Геном человека»

Полная гаплоидная копия генома человека состоит как минимум из трех миллиардов ДНК нуклеотидов пар оснований , которые были описаны в программе Human Genome Project — Read (95% завершено по состоянию на 2004 год). Среди многих целей GP-Write — создание клеточных линий, устойчивых ко всем вирусам, и сборочных линий синтеза для тестирования вариантов неизвестной значимости , возникающих в ходе исследований и диагностического секвенирования геномов человека (которое экспоненциально улучшается по стоимости, качеству и интерпретация). ^{[ 2 ]}

См. также

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б Поллак, Эндрю (2 июня 2016 г.). «Ученые объявляют о проекте HGP-Write по синтезу генома человека» . Нью-Йорк Таймс . Проверено 2 июня 2016 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д Буке, Джей Ди, Чёрч Дж., Хессель А., Келли Нью-Джерси, Аркин А., Кай Ю., Карлсон Р., Чакраварти А., Корниш В.В., Холт Л., Исаакс Ф.Дж., Куикен Т., Ладжуа М., Лессор Т., Луншоф Дж., Маурано М.Т., Митчелл. Л.А., Райн Дж., Россер С., Санджана Н.Е., Сильвер П.А., Вэлли Д., Ван Х., Уэй Дж.К., Ян Л.; и др. (2 июня 2016 г.). «Проект «Геном – Напиши»» . Наука 353 (6295): 126–127. Бибкод : 2016Sci...353..126B . doi : 10.1126/science.aaf6850 . ПМИД 27256881 . S2CID 206649424 . Получено 2 июня. {{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )
^ Jump up to: ^а ^б Каллауэй, Юэн (2 июня 2016 г.). «План по синтезу генома человека вызывает неоднозначную реакцию» . Научный американец . Проверено 2 июня 2016 г.
^ Jump up to: ^а ^б Регаладо, Антонио (2 июня 2016 г.). «План по созданию генома вызывает вопросы о людях-дизайнерах» . Обзор технологий Массачусетского технологического института . Проверено 2 июня 2016 г.
^ Jump up to: ^а ^б Акст, Джеф (2 июня 2016 г.). « Разоблачен проект «Геном человека» . Ученый . Проверено 2 июня 2016 г.
^ Jump up to: ^а ^б Опал, Пунит; Кини, Амит (3 июня 2016 г.). «О дивный новый мир синтетического генома человека» . Время . Проверено 12 июня 2016 г.
^ «Центр передового опыта инженерной биологии» . Проверено 2 марта 2017 г.
^ «Платформа САПР, разработанная GP-Write and Twist для запуска проектов с большим геномом» . Новости генной инженерии и технологий . 12 мая 2021 г.
^ «Синтетические геномы дрожжей (Sc2.0)» . Проверено 2 марта 2017 г.

Дальнейшее чтение

МакЭлхени, Виктор К. (2010). Рисование карты жизни: проект «Геном человека изнутри» . Основные книги . ISBN 978-0-465-03260-0 . 361 страница. Исследует интеллектуальное происхождение, историю и мотивацию проекта по картированию генома человека; основан на интервью с ключевыми фигурами.
Черч, Дж., Реджис Э. (2014). Регенезис . Основные книги . ISBN 978-0465075706 . {{cite book}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )
Жозефина Лильерум, Эрик Галлберг, Энтони С. Форстер (2014). Синтетическая биология. Лабораторное руководство . Мировое научное издательство. ISBN 978-9814579544 . {{cite book}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )
Genome Project-Write: официальная информационная страница консорциума

Национальный институт исследования генома человека (NHGRI) . NHGRI возглавил вклад Национальных институтов здравоохранения в Международный проект генома человека. Этот проект, основной целью которого было секвенирование трех миллиардов пар оснований, составляющих геном человека, был завершен на 95% в апреле 2004 года.

[NYT-20160602-1] Jump up to: ^а ^б Поллак, Эндрю (2 июня 2016 г.). «Ученые объявляют о проекте HGP-Write по синтезу генома человека» . Нью-Йорк Таймс . Проверено 2 июня 2016 г.

[SCI-20160602-2] Jump up to: ^а ^б ^с ^д Буке, Джей Ди, Чёрч Дж., Хессель А., Келли Нью-Джерси, Аркин А., Кай Ю., Карлсон Р., Чакраварти А., Корниш В.В., Холт Л., Исаакс Ф.Дж., Куикен Т., Ладжуа М., Лессор Т., Луншоф Дж., Маурано М.Т., Митчелл. Л.А., Райн Дж., Россер С., Санджана Н.Е., Сильвер П.А., Вэлли Д., Ван Х., Уэй Дж.К., Ян Л.; и др. (2 июня 2016 г.). «Проект «Геном – Напиши»» . Наука 353 (6295): 126–127. Бибкод : 2016Sci...353..126B . doi : 10.1126/science.aaf6850 . ПМИД 27256881 . S2CID 206649424 . Получено 2 июня. {{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )

[SA-20160602-3] Jump up to: ^а ^б Каллауэй, Юэн (2 июня 2016 г.). «План по синтезу генома человека вызывает неоднозначную реакцию» . Научный американец . Проверено 2 июня 2016 г.

[MIT-20160602-4] Jump up to: ^а ^б Регаладо, Антонио (2 июня 2016 г.). «План по созданию генома вызывает вопросы о людях-дизайнерах» . Обзор технологий Массачусетского технологического института . Проверено 2 июня 2016 г.

[TS-20160602-5] Jump up to: ^а ^б Акст, Джеф (2 июня 2016 г.). « Разоблачен проект «Геном человека» . Ученый . Проверено 2 июня 2016 г.

[TIME-20160612-6] Jump up to: ^а ^б Опал, Пунит; Кини, Амит (3 июня 2016 г.). «О дивный новый мир синтетического генома человека» . Время . Проверено 12 июня 2016 г.

[7] «Центр передового опыта инженерной биологии» . Проверено 2 марта 2017 г.

[8] «Платформа САПР, разработанная GP-Write and Twist для запуска проектов с большим геномом» . Новости генной инженерии и технологий . 12 мая 2021 г.

[9] «Синтетические геномы дрожжей (Sc2.0)» . Проверено 2 марта 2017 г.

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

v т и Геномика
Fields	Cognitive genomics Computational genomics Comparative genomics Functional genomics Genome project Human Genome Project Metagenomics Human Microbiome Project Pangenomics Personal genomics Population genomics Sociogenomics Structural genomics
Bioinformatics	Biochip Cheminformatics Chemogenomics Connectomics Human Connectome Project Epigenomics Human Epigenome Project Glycomics Immunomics Lipidomics Metabolomics Microbiomics Nutrigenomics Paleopolyploidy Pharmacogenetics Pharmacogenomics Systems biology Toxicogenomics Transcriptomics
Structural biology	Proteomics Human proteome project Call-map proteomics Structure-based drug design Expression proteomics
Research tools	2-D electrophoresis Mass spectrometer Electrospray ionization Matrix-assisted laser desorption ionization Matrix-assisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometer Microfluidic-based tools Isotope affinity tags Chromosome conformation capture
Organizations	DNA Data Bank of Japan (JP) European Molecular Biology Laboratory (EU) National Institutes of Health (USA) Wellcome Sanger Institute (UK)
List Category

v т и Персональная геномика
Data collection	Biobank Biological database
Field concepts	Biological specimen De-identification Human genetic variation Genetic linkage Single-nucleotide polymorphisms Identity by descent Genetic disorder
Applications	Personalized medicine Predictive medicine Genetic epidemiology Pharmacogenomics
Analysis techniques	Whole genome sequencing Genome-wide association study SNP array Genetic testing
Major projects	Human Genome Project International HapMap Project 1000 Genomes Project Human Genome Diversity Project

v т и Обезьяны
Extant ape species	Homo Human (H. sapiens) Pan Bonobo (P. paniscus) Chimpanzee (P. troglodytes) Gorilla Eastern gorilla (G. beringei) Western gorilla (G. gorilla) Orangutan Sumatran orangutan (P. abelii) Bornean orangutan (P. pygmaeus) Tapanuli orangutan (P. tapanuliensis) Gibbon (family: Hylobatidae)
Study of apes	Great ape language Dian Fossey Birutė Galdikas Jane Goodall Chimpanzee genome project Human Genome Project Gladys Kalema-Zikusoka Neanderthal genome project Willie Smits Lone Drøscher Nielsen Ian Redmond Elgin Center Iowa Primate Learning Sanctuary Borneo Orangutan Survival Primate archaeology
Legal and social status	Personhood Research ban Kinshasa Declaration on Great Apes Great Ape Project Great Apes Survival Partnership International Primate Day Nonhuman Rights Project
Related	Primate List of individual apes (non-human) Apes in space (non-human) Bigfoot Bushmeat Chimpanzee–human last common ancestor Gorilla–human last common ancestor Orangutan–human last common ancestor Gibbon–human last common ancestor List of fictional primates (non-human) Great apes Human evolution Monkey Day Mythic humanoids Yeren Yeti Yowie
Category