C-тип лектин
(Перенаправлен из домена лектина C-типа )
| Лектин C-тип домен | |||
|---|---|---|---|
 | |||
| Идентификаторы | |||
| Символ | Lectin_c | ||
| Pfam | PF00059 | ||
| InterPro | IPR001304 | ||
| УМНЫЙ | Клеме | ||
| PROSITE | PS50041 | ||
| Краткое содержание | 2msb / scope / supfam | ||
| CDD | CD00037 | ||
| |||
Лектин C-типа ( CLEC )-это тип углеводного связывающего белка, известного как лектин . [ 3 ] Обозначение C-типа связано с их требованием к кальция для связывания. [ 4 ] Белки, содержащие домены лектина С-типа, имеют разнообразный диапазон функций, включая клеточную адгезию, иммунный ответ на патогены и апоптоз . [ 5 ] [ 6 ]
Классификация
[ редактировать ]Drickamer et al. классифицированные лектины C-типа на 7 подгрупп (I до VII) на основе порядка различных белковых доменов в каждом белке. [ 7 ] Эта классификация была впоследствии обновлена в 2002 году, что привело к семи дополнительным группам (VIII до XIV). [ 8 ] Совсем недавно были добавлены еще три подгруппы (XV до XVII). [ 3 ]
| Группа | Имя | Связанные домены |
|---|---|---|
| я | Лектики | EGF , Sushi , Ig и Link Domains |
| II | асиалогликопротеина и постоянного тока Рецепторы | Никто |
| Iii | Коллекционирование | Никто |
| IV | Selectins | суши и EGF Домены |
| V | NK - клеточные рецепторы | Никто |
| МЫ | Многоцелевые эндоцитарные рецепторы | Домены fnii и riCin |
| VII | Рег Группа | Никто |
| VIII | Хондролектин , Layilin | Никто |
| IX | Тетранектин | Никто |
| Х | Полицистин | WSC, REJ, PKD -домены |
| Xi | Привлечение ( ATRN ) | PSI, EGF и CUB DOMENS |
| Xii | Эозинофил основной базовый белок (эмпп) | Никто |
| Xiii | DGCR2 | Никто |
| XIV | Тромбомодулин , CD93 , CD248 , CLEC14A | EGF -области [ 9 ] |
| XV | Bimlec | Никто |
| XVI | Домик | SCP и EGF Домены |
| XVII | CBCP / FREM1 / Qbrick | CSPG повторяется и Calx-бета домены |
CLEC включают:
- Clec1a , clec1b
- CLEC2A , CLEC2B , CD69 (CLEC2C), CLEC2D , CLEC2L
- Clec3a , clec3b
- Clec4a , clec4c , clec4d , clec4e , clec4f , clec4g , asgr1 (clec4h1), asgr2 (clec4j), (clec4h2), fcer2 cd207 (clec4k), cd209 (clec4l), clec4mm, cd207 (clec4k), cd209 , (clec4l), clec4m
- Clec5a
- Clec6a
- Clec7a
- Olr1 (clec8a)
- Clec9a
- Clec10a
- Clece11a
- CLEC12A , CLEC12B
- CD302 (CLEC13A), LY75 (CLEC13B), PLA2R1 (CLEC13C), MRC1 (CLEC13D), MRC2 (CLEC13E)
- Clec14a
- CLEC16A
- Clec17a
«НК-клеточные лектиноподобные рецепторы» являются очень тесно связанной группой: [ 10 ]
- KLRA1
- Klrb1 (clec5b)
- KLRC1 , KLRC2 , KLRC3 , KLRC4
- Klrd1
- Klrf1 (clec5c)
- Klrg1 (clec15a), klrg2 (clec15b)
- Klrk1
Дополнительные белки, содержащие этот домен, включают:
- Agc1 ; Atrnl1
- BCAN
- CD248 ; CD72 ; CD93 ; Чодл ; CL-K1-IA ; CL-K1-IB ; CL-K1-IC ; Clecsf5 ; Colec10 ; Colec11 ; Colec12 ; CSPG3
- Fcer2 ; Fram1 ; HBXBP ;
- Летать ; LOC348174 ; LOC728276
- Мафа ; MBL2 ; MGC34761 ; Микл ; MRC1L1
- Olr1
- Пап ; PKD1 ; PKD1L2 ; PLA2R1 ; PRG2 ; PRG3
- Reg1a ; Reg1b ; Reg3a ; Reg3g ; Рег4
- Селе ; ПРОДАВАТЬ ; Selp ; SFTPA1 ; SFTPA2 ; SFTPA2B ; SFTPD ; Srcl
- THBD
- Vcan
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Уокер -младший, Нагар Б., Янг Н.М., Хирама Т., Рини Дж. М. (апрель 2004 г.). «Рентгеновская кристаллическая структура лектина C-типа, обладающего галактозой, обладающий новой декамерной четвертичной структурой». Биохимия . 43 (13): 3783–92. doi : 10.1021/bi035871a . PMID 15049685 .
- ^ Махла Р.С., Редди М.К., Прасад Д.В., Кумар Х (сентябрь 2013 г.). «Подслащивают Pamps: роль сахарных комплексных PAMPS в врожденном иммунитете и биологии вакцины» . Границы в иммунологии . 4 : 248. DOI : 10.3389/fimmu.2013.00248 . PMC 3759294 . PMID 24032031 .
- ^ Jump up to: а беременный Зеленский А.Н., Гриди -Дж. (Декабрь 2005 г.). «Суперсемейство с лектином C-типа». Февраль J. 272 (24): 6179–217. doi : 10.1111/j.1742-4658.2005.05031.x . PMID 16336259 . S2CID 7084402 .
- ^ C-тип+лектин в Национальной медицинской библиотеке Медицинской библиотеки США (Mesh)
- ^ Drickamer K (октябрь 1999). "C-типа, похожие на лектин домены". Карт Мнение Структура Биол . 9 (5): 585–90. doi : 10.1016/s0959-440x (99) 00009-3 . PMID 10508765 .
- ^ Камби А., Фигур С (май 2009 г.). «Некроз: лектины C-типа чувствую гибель клеток» . Карт Биол . 19 (9): R375–8. Bibcode : 2009cbio ... 19.r375c . doi : 10.1016/j.cub.2009.03.032 . PMID 19439262 . S2CID 17409821 .
- ^ Drickamer K (1993). «Эволюция Ca (2+)-зависимых животных лектинов» . Прогик Нуклеиновая кислота Res. Мол Биол . Прогресс в исследованиях нуклеиновых кислот и молекулярной биологии. 45 : 207–32. doi : 10.1016/s0079-6603 (08) 60870-3 . ISBN 978-0-12-540045-9 Полем PMID 8341801 .
- ^ Drickamer K, Fadden AJ (2002). «Геномный анализ лектинов C-типа». Биохимия. Соц Симптат 69 (69): 59–72. doi : 10.1042/bss0690059 . PMID 12655774 .
- ^ Хан, Ка; McMurray, JL; Мухаммед, Ф.; Бикнелл Р. (2019). «Белки 14 белков доменного домена C-типа в сосудистой биологии, раке и воспалении» . Febs Journal . 286 (17): 3299–3332. doi : 10.1111/febs.14985 . PMC 6852297 . PMID 31287944 .
- ^ NK+Cell+Lectin-подобные+рецепторы в Национальной библиотеке Медицинской библиотеки Медицинской библиотеки Медицинские заголовки (Mesh)
Внешние ссылки
[ редактировать ]- Функциональный гликомический шлюз , сотрудничество между консорциумом для функциональной гликомики и издательской группы природы