✖


Jump to content

Аптамер

(Перенаправлено с Аптамеров )
Слева: несвязанный аптамер. Справа: аптамер, связанный со своим белком-мишенью. Белок окрашен в желтый цвет. Части аптамера, которые меняют форму при связывании с мишенью, отмечены синим цветом, а неизмененные части — оранжевым. Части аптамера, контактирующие с белком, выделены красным.
Клетки рака молочной железы инкубируют с аптамерами, которые избирательно связываются с биомаркерами раковых клеток, но не со здоровыми клетками. Аптамеры связаны с Alexa Fluor 594 , молекулой, которая светится красным под УФ- светом. Этот тип теста позволяет врачу или исследователю идентифицировать раковые клетки в образце ткани пациента .

Аптамеры — это олигомеры искусственных оцДНК , РНК , XNA или пептидов , которые связываются с конкретной целевой молекулой или семейством целевых молекул. Они демонстрируют диапазон сродства ( K D в диапазоне от пМ до мкМ), [1] [2] с переменным уровнем нецелевого связывания [3] и иногда классифицируются как химические антитела . Аптамеры и антитела могут использоваться во многих одних и тех же приложениях, но нуклеиновых кислот структура аптамеров на основе , которые в основном представляют собой олигонуклеотиды , сильно отличается от аминокислот структуры антител на основе , которые являются белками . Эта разница может сделать аптамеры лучшим выбором для некоторых целей, чем антитела (см. Замена антител ).

Аптамеры используются в биологических лабораторных исследованиях и медицинских тестах . Если несколько аптамеров объединить в один анализ , они смогут измерить большое количество различных белков в образце . Они могут использоваться для идентификации молекулярных маркеров заболеваний или могут функционировать как лекарства , системы доставки лекарств и системы контролируемого высвобождения лекарств . Они также находят применение в других молекулярной инженерии задачах .

Большинство аптамеров происходят из SELEX , серии экспериментов в пробирках для поиска полезных аптамеров в огромном пуле различных последовательностей ДНК. Этот процесс во многом похож на естественный отбор , направленную эволюцию или искусственный отбор. В SELEX исследователь неоднократно отбирает лучшие аптамеры из исходной библиотеки ДНК, состоящей примерно из квадриллиона различных случайно сгенерированных фрагментов ДНК или РНК . После SELEX исследователь может мутировать или изменить химический состав аптамеров и сделать другой отбор или может использовать рациональные процессы проектирования для разработки улучшений. Существуют также не-SELEX-методы обнаружения аптамеров.

Исследователи оптимизируют аптамеры для достижения множества полезных свойств. Наиболее важной особенностью является специфическая и чувствительная привязка к выбранной цели. Когда аптамеры подвергаются воздействию жидкостей организма, как, например, при тестировании сыворотки крови или при терапии аптамерами, для них часто важно противостоять перевариванию белками , разрушающими ДНК и РНК . Терапевтические аптамеры часто необходимо модифицировать, чтобы они медленно выводились из организма . Аптамеры, которые резко меняют свою форму , когда связываются со своей мишенью, полезны в качестве молекулярных переключателей для включения и выключения сенсора. Некоторые аптамеры созданы для использования в биосенсорах или при тестировании биологических образцов . В некоторых случаях аптамеру может быть полезно достичь заранее определенного уровня или скорости связывания. Поскольку выход синтеза, используемого для производства известных аптамеров, быстро снижается для более длинных последовательностей, [4] исследователи часто усекают аптамеры до минимальной связывающей последовательности, чтобы снизить стоимость производства.

Этимология

[ редактировать ]

Слово «аптамер» — это неологизм, придуманный Эндрю Эллингтоном и Джеком Шостаком в их первой публикации по этой теме. Они не дали точного определения, заявив: «Мы назвали эти отдельные последовательности РНК «аптамерами», от латинского « aptus », чтобы соответствовать». [5]

Однако само слово происходит от греческого слова ἅπτω , означающего «соединить» или «приспособиться» (как это использовал Гомер (ок. 8 век до н.э.). [6] [7] ) и часть, составная часть чего-то большего. [8]

Классификация

[ редактировать ]

Типичный аптамер представляет собой синтетически созданный лиганд, использующий комбинаторное разнообразие ДНК, РНК, XNA или пептида для достижения сильного специфического связывания с конкретной целевой молекулой или семейством целевых молекул. Аптамеры иногда классифицируют как «химические антитела» или «имитаторы антител» . [9] Однако большинство аптамеров имеют небольшие размеры, с молекулярной массой 6–30 кДа, в отличие от антител с размером 150 кДа, и содержат один сайт связывания, а не два совпадающих антигенсвязывающих участка типичного антитела.

История

[ редактировать ]
Джек Шостак, лауреат Нобелевской премии и один из изобретателей SELEX и аптамеров.

С момента своего первого применения в 1967 г. [10] Методологии направленной эволюции использовались для разработки биомолекул с новыми свойствами и функциями. Ранние примеры включают модификацию системы репликации бактериофага Qbeta и создание рибозимов с измененной активностью расщепления . [11]

В 1990 году две группы независимо друг от друга разработали и опубликовали методы SELEX ( систематическая эволюция лигандов путем экспоненциального обогащения ) и создали РНК-аптамеры: лаборатория Ларри Голда использовала термин SELEX для своего процесса отбора РНК- лигандов Т4 . против ДНК-полимеразы [12] и лаборатория Джека Шостака , отбирающая РНК-лиганды против различных органических красителей . [5] [13] Два года спустя лаборатория Шостака и Gilead Sciences , действуя независимо друг от друга, использовали in vitro для создания аптамеров ДНК для органических красителей. схемы селекции [14] и человеческий тромбин , [15] соответственно. В 2001 году Дж. Колин Кокс автоматизировал SELEX в лаборатории Эллингтона, сократив продолжительность недельного селекционного эксперимента всего до трех дней. [16] [17] [18]

В 2002 году две группы под руководством Рональда Брейкера и Евгения Нудлера опубликовали первые убедительные доказательства существования рибопереключателя на основе нуклеиновой кислоты , генетического регуляторного элемента , существование которого ранее подозревалось. Рибопереключатели обладают свойствами молекулярного распознавания, аналогичными аптамерам. Это открытие добавило поддержки гипотезе мира РНК , постулируемому этапу во времени зарождения жизни на Земле . [19]

Характеристики

[ редактировать ]

Структура

[ редактировать ]
Сложная и разнообразная вторичная и третичная структура аптамеров, как показано на этой схеме вторичной структуры аптамера, позволяет им прочно и специфично связывать свою мишень. Комплементарное спаривание оснований видно по черным линиям, соединяющим некоторые основания GC и AT. Это особенность нуклеиновых кислот, которой нет у аминокислот антител. Это помогает аптамерам формировать эти уникальные структуры. Области шпильки (красные), которые основаны на этой паре оснований, повышают стабильность аптамера при различных температурах. На этом изображении также показаны примеры химических модификаций базового аптамера. Две искусственные основы желтого цвета, повышающие стойкость. Молекула биотина чрезвычайно прочно связывается со стрептавидином , позволяя аптамеру закрепляться на других молекулах или на поверхности в сенсорах и анализах.

Большинство аптамеров основаны на определенной олигомерной последовательности длиной 20–100 оснований и массой 3–20 кДа . Некоторые из них имеют химические модификации для улучшения функциональности или совместимости с более крупными молекулярными системами. Химия ДНК, РНК, XNA и пептидных аптамеров может иметь различные профили с точки зрения стабильности при хранении, долговечности в сыворотке или in vivo , специфичности и чувствительности, стоимости, простоты генерации, амплификации и характеристики, а также осведомленности пользователей. Как правило, аптамеры на основе ДНК и РНК проявляют низкую иммуногенность , поддаются амплификации с помощью полимеразной цепной реакции (ПЦР) и имеют сложную вторичную и третичную структуру . [20] [21] [22] [23] Аптамеры на основе ДНК и XNA демонстрируют превосходную стабильность при хранении. Аптамеры на основе XNA могут привнести дополнительное химическое разнообразие для повышения аффинности связывания или большей устойчивости в сыворотке или in vivo .

Поскольку существуют 22 генетически закодированные и более 500 встречающихся в природе аминокислот , пептидные аптамеры , а также антитела обладают гораздо большим потенциальным комбинаторным разнообразием на единицу длины по сравнению с 4 нуклеиновыми кислотами в ДНК или РНК. [24] Химические модификации оснований нуклеиновых кислот или остовов увеличивают химическое разнообразие стандартных оснований нуклеиновых кислот. [25]

Сплит-аптамеры состоят из двух или более нитей ДНК, которые представляют собой части более крупного родительского аптамера, разделенного на две части молекулярным разрывом . [26] Способность каждой составляющей цепи связывать мишени будет зависеть от местоположения разрыва, а также от вторичных структур дочерних цепей. [27] Наличие целевой молекулы поддерживает соединение фрагментов ДНК. Это может быть использовано в качестве основы для биосенсоров. [28] После сборки две отдельные цепи ДНК можно связать в одну цепь.

Немодифицированные аптамеры быстро выводятся из кровотока , период полураспада составляет от нескольких секунд до нескольких часов. В основном это происходит из-за деградации нуклеазы , которая физически разрушает аптамеры, а также выведения их почками из аптамера -за низкой молекулярной массы и размера . Некоторые модификации, такие как 2'-фторзамещенные пиримидины и связь полиэтиленгликоля (ПЭГ), обеспечивают период полувыведения из сыворотки от нескольких дней до недель. ПЭГилирование может добавить достаточную массу и размер, чтобы предотвратить клиренс почками in vivo . Немодифицированные аптамеры могут лечить нарушения свертываемости крови . Проблема клиренса и переваривания нуклеаз уменьшается, когда их наносят на глаза , где концентрация нуклеазы ниже и скорость клиренса ниже. [29] Быстрое выведение из сыворотки также может быть полезно в некоторых случаях, например, in vivo при диагностической визуализации . [30]

В исследовании аптамеров [31] Разработанный для связывания с белками, связанными с инфекцией Эбола, было проведено сравнение трех выделенных аптамеров на предмет их способности связывать целевой белок EBOV sGP. Хотя эти аптамеры различаются как по последовательности, так и по структуре, они проявляют удивительно схожее относительное сродство к sGP из EBOV и SUDV, а также к EBOV GP1.2. Примечательно, что эти аптамеры продемонстрировали высокую степень специфичности к продуктам гена GP. Один аптамер, в частности, оказался эффективным в качестве элемента распознавания в электрохимическом сенсоре, позволяя обнаруживать sGP и GP1.2 в растворе, а также GP1.2 в мембранном контексте. Результаты этого исследования указывают на интригующую возможность что определенные области на поверхности белков могут обладать аптатропными свойствами. Идентификация ключевых особенностей таких сайтов в сочетании с улучшенными трехмерными структурными прогнозами аптамеров потенциально может повысить точность прогнозирования сайтов взаимодействия аптамеров на белках. Это, в свою очередь, может помочь идентифицировать аптамеры с повышенной вероятностью связывания белков с высоким сродством, а также пролить свет на белковые мутации, которые могут существенно повлиять на связывание аптамеров. Такое всестороннее понимание структурных взаимодействий между аптамерами и белками имеет жизненно важное значение. для уточнения вычислительной предсказуемости связывания аптамера с белком. Более того, он потенциально может в конечном итоге устранить необходимость в экспериментальном протоколе SELEX.

Цели

[ редактировать ]

Мишенью аптамера могут быть небольшие молекулы и ионы тяжелых металлов , более крупные лиганды, такие как белки, и даже целые клетки. [32] [33] Эти мишени включают лизоцим , [34] тромбин , [35] [36] вируса иммунодефицита человека транс-действующий чувствительный элемент ( HIV TAR), [37] гемин , [38] интерферон γ , [39] фактор роста эндотелия сосудов (VEGF), [40] [41] простатический специфический антиген (ПСА), [42] [43] дофамин , [44] и неклассический онкоген , фактор теплового шока 1 (HSF1). [45]

Аптамеры были созданы против раковых клеток, [46] прионы , [47] бактерии, [48] и вирусы. Вирусные мишени аптамеров включают вирусы гриппа А и В , [49] Респираторно-синцитиальный вирус (РСВ), [49] Коронавирус SARS (SARS-CoV) [49] и SARS-CoV-2 . [50]

Аптамеры могут быть особенно полезны для протеомики наук об окружающей среде . [51] Антитела, как и другие белки, сложнее секвенировать, чем нуклеиновые кислоты. Их содержание и производство также являются дорогостоящими, и они подвергаются постоянному риску загрязнения, поскольку производятся с помощью клеточной культуры или собираются из сыворотки животных. По этой причине исследователи, интересующиеся малоизученными белками и видами, могут обнаружить, что компании не будут производить, поддерживать или адекватно проверять качество антител против интересующей их цели. [52] Напротив, аптамеры легко секвенировать и ничего не стоит поддерживать, поскольку их точную структуру можно хранить в цифровом виде и синтезировать по требованию. Это может сделать их более экономически целесообразными в качестве исследовательских инструментов для недостаточно финансируемых субъектов биологических исследований. Аптамеры существуют для растительных соединений, таких как теофиллин (содержится в чае ). [53] и абсцизовая кислота (иммунный гормон растений). [54] Был разработан аптамер против аманитина (токсина, вызывающего летальное отравление мухомором ), что является примером аптамера против грибной мишени. [55]

Приложения аптамеров можно условно разделить на сенсорные, терапевтические, производство реагентов и инженерные категории. Сенсорные приложения важны в экологических, биомедицинских, эпидемиологических , биобезопасных и фундаментальных исследованиях, где аптамеры действуют как зонды в анализах, методах визуализации, диагностических анализах и биосенсорах. [32] [56] [57] [58] [59] [60] В терапевтических целях и точной медицине аптамеры могут действовать как лекарства. [61] в качестве средства адресной доставки лекарств , [62] в качестве механизмов контролируемого высвобождения и в качестве реагентов для открытия лекарств посредством высокопроизводительного скрининга малых молекул. [63] и белки. [64] [65] Аптамеры находят применение для мониторинга производства белка, контроля качества и очистки. [66] [67] [68] Они могут использоваться в приложениях молекулярной инженерии как способ модификации белков, например, для усиления ДНК-полимеразы, чтобы сделать ПЦР более надежным. [69] [70] [71] [72]

Поскольку сродство аптамера также влияет на его динамический диапазон и предел обнаружения, аптамеры с более низким сродством могут быть желательны при анализе высоких концентраций целевой молекулы. [73] Аффинная хроматография также зависит от способности аффинного реагента, такого как аптамер, связывать и высвобождать свою мишень, а более низкое сродство может способствовать высвобождению целевой молекулы. [74] Следовательно, конкретные применения определяют полезный диапазон сродства к аптамерам.

Замена антител

[ редактировать ]

Аптамеры могут заменить антитела во многих биотехнологических приложениях. [75] [52] В лабораторных исследованиях и клинической диагностике их можно использовать в аптамерных вариантах иммуноанализа, включая иммуноферментный анализ (ИФА) , [76] вестерн-блоттинг , [77] иммуногистохимия (ИГХ) , [78] и проточная цитометрия . [79] В качестве терапевтических средств они могут действовать как агонисты или антагонисты своего лиганда. [80] Хотя антитела — это знакомая технология с хорошо развитым рынком, аптамеры — относительно новая технология для большинства исследователей, и аптамеры были созданы лишь для части важных исследовательских целей. [81] В отличие от антител, немодифицированные аптамеры более восприимчивы к расщеплению нуклеазой в сыворотке и почечному клиренсу in vivo . Аптамеры намного меньше по размеру и массе, чем антитела, что может быть важным фактором при выборе того, что лучше всего подходит для конкретного применения. Когда аптамеры доступны для конкретного применения, их преимущества перед антителами включают потенциально более низкую иммуногенность, большую воспроизводимость и меньшую стоимость, более высокий уровень контроля благодаря условиям отбора in vitro и возможность эффективной разработки для обеспечения долговечности, специфичности и чувствительности. . [82]

Кроме того, аптамеры способствуют сокращению использования исследовательских животных . [83] Хотя при первоначальном открытии антител, а также при их производстве в случае поликлональных антител часто используются животные , как селекция, так и производство аптамеров обычно осуществляются без участия животных. Однако методы фагового дисплея позволяют проводить отбор антител in vitro с последующим производством из моноклональной клеточной линии, полностью избегая использования животных. [84]

Контролируемое высвобождение терапевтических средств

[ редактировать ]

Способность аптамеров обратимо связывать молекулы, такие как белки, вызвала растущий интерес к их использованию для облегчения контролируемого высвобождения терапевтических биомолекул, таких как факторы роста . Этого можно достичь, настроив силу связывания на пассивное высвобождение факторов роста. [85] наряду с активным высвобождением посредством таких механизмов, как гибридизация аптамера с комплементарными олигонуклеотидами. [86] или разворачивание аптамера за счет клеточных сил тяги. [87]

АптаБиД

[ редактировать ]

AptaBiD (обнаружение биомаркеров с помощью аптамеров) — это основанный на аптамерах метод обнаружения биомаркеров . [88]

Пептидные аптамеры

[ редактировать ]

Хотя большинство аптамеров основаны на ДНК, РНК или XNA, пептидные аптамеры [89] представляют собой искусственные белки, выбранные или сконструированные для связывания конкретных молекул-мишеней.

Структура

[ редактировать ]

Пептидные аптамеры состоят из одной или нескольких пептидных петель вариабельной последовательности, представленных белковым каркасом. Производные, известные как головастики, в которых «головки» пептидных аптамеров ковалентно связаны с уникальной последовательностью двухцепочечных «хвостов» ДНК, позволяют количественно определять дефицитные молекулы-мишени в смесях с помощью ПЦР (с использованием, например, количественной полимеразной цепной реакции в реальном времени). ) их хвостов ДНК. [90] Пептиды, образующие вариабельные области аптамера, синтезируются как часть той же полипептидной цепи, что и каркас, и ограничиваются на своих N- и C-концах за счет связывания с ним. Это двойное структурное ограничение уменьшает разнообразие трехмерных структур, которые могут принять переменные регионы. [91] и это уменьшение структурного разнообразия снижает энтропийную стоимость молекулярного связывания , когда взаимодействие с мишенью заставляет вариабельные области принимать однородную структуру.

Выбор

[ редактировать ]

Наиболее распространенной системой селекции пептидных аптамеров является дрожжевая двухгибридная система . Пептидные аптамеры также могут быть выбраны из комбинаторных пептидных библиотек, созданных с помощью фагового дисплея и других технологий поверхностного дисплея, таких как дисплей мРНК , рибосомный дисплей , бактериальный дисплей и дрожжевой дисплей . Эти экспериментальные процедуры также известны как биопэннинг . Все пептиды, полученные из комбинаторных пептидных библиотек, были сохранены в базе данных MimoDB . [92] [93]

Приложения

[ редактировать ]

Библиотеки пептидных аптамеров использовались в качестве «мутагенов» в исследованиях, в которых исследователь вводит библиотеку, которая экспрессирует различные пептидные аптамеры в популяцию клеток, выбирает желаемый фенотип и идентифицирует те аптамеры, которые вызывают фенотип. Затем исследователь использует эти аптамеры в качестве приманки, например, при скрининге двухгибридных дрожжей, чтобы идентифицировать клеточные белки, на которые нацелены эти аптамеры. Такие эксперименты идентифицируют определенные белки, связанные аптамерами, и белковые взаимодействия, которые аптамеры нарушают, вызывая фенотип. [94] [95] Кроме того, пептидные аптамеры, производные соответствующих функциональных фрагментов, могут вызывать специфическую посттрансляционную модификацию своих белков-мишеней или изменять субклеточную локализацию мишеней. [96]

Этот анализ проверяет способность двух разных типов аптамеров (V и I) обнаруживать соответствующие им белковые мишени (VEGF и IFN-y). Метки Apt1, Apt2, Apt3 и Apt4 расположены в порядке убывания силы связывания (т.е. Apt1 является самым сильным аптамером). Буквы DD, AD, DA и AA означают, что они имеют разные комбинации неестественных пар оснований. Это обуславливает их разницу в прочности связывания. В столбцах «-» белок отсутствует, а в столбцах «+» белок есть. Аптамер с белком (+) и без белка (-) загружается в лунки геля и перемещается по дорожкам колонки. Если мишень присутствует, они связываются и перемещаются медленнее из-за заряда аптамера и массы белка. В противном случае несвязанный аптамер быстро перемещается в конец дорожки. Разница в положении полос «+» и «-» и есть «сдвиг подвижности». Это позволяет исследователю обнаружить наличие или отсутствие белка. Более темная полоса на крайних левых полосах V и I показывает, что более сильное связывание аптамера с мишенью облегчает обнаружение мишени при заданном количестве целевого белка в образце. Нижнее изображение включает в себя денатурация мочевины в геле, которая нарушает связывание аптамера с мишенью в более слабых I аптамерах, показывая, что связывание аптамера с белком действительно является причиной изменения подвижности.

Промышленное и исследовательское сообщество

[ редактировать ]

Коммерческие продукты и компании на основе аптамеров включают препарат Макуген (пегаптаниб). [97] и клинико-диагностическая компания SomaLogic. [98] Международное общество аптамеров (INSOAP), профессиональное общество исследовательского сообщества аптамеров, издает журнал, посвященный этой теме, Aptamers . Apta-индекс [99] — это текущая база данных, каталогизирующая и упрощающая процесс заказа более 700 аптамеров.

См. также

[ редактировать ]

Ссылки

[ редактировать ]
  1. ^ Роудс, Эндрю; Смитерс, Ник; Чепмен, Тревор; Парсонс, Сара; Рис, Стивен (5 октября 2001 г.). «Получение и характеристика аптамеров РНК-антагонистов MCP-1» . Письма ФЭБС . 506 (2): 85–90. дои : 10.1016/S0014-5793(01)02895-2 . ISSN   0014-5793 . ПМИД   11591377 . S2CID   36797240 .
  2. ^ Столтенбург, Регина; Николаус, Надя; Стрелиц, Беате (30 декабря 2012 г.). «Capture-SELEX: Отбор ДНК-аптамеров для аминогликозидных антибиотиков» . Журнал аналитических методов в химии . 2012 : e415697. дои : 10.1155/2012/415697 . ISSN   2090-8865 . ПМЦ   3544269 . ПМИД   23326761 .
  3. ^ Кривиану-Гайта В., Томпсон М. (ноябрь 2016 г.). «Аптамеры, антитела scFv и фрагменты антитела Fab: обзор и сравнение трех наиболее универсальных биосенсорных элементов биораспознавания». Биосенсоры и биоэлектроника . 85 : 32–45. дои : 10.1016/j.bios.2016.04.091 . ПМИД   27155114 .
  4. ^ «Синтез ДНК-олигонуклеотидов» . Миллипор Сигма . Проверено 4 июля 2022 г.
  5. ^ Перейти обратно: а б Эллингтон А.Д., Шостак Дж.В. (август 1990 г.). «Отбор in vitro молекул РНК, связывающих специфические лиганды». Природа . 346 (6287): 818–822. Бибкод : 1990Natur.346..818E . дои : 10.1038/346818a0 . ПМИД   1697402 . S2CID   4273647 .
  6. ^ "ἅπτω" , Βικιλεξικό (на греческом языке), 12 марта 2023 г. , получено 21 марта 2024 г.
  7. ^ «Одиссея/ф — Wikisource» . el.wikisource.org (на греческом языке) . Проверено 21 марта 2024 г.
  8. ^ «μέρος» , Викисловарь, бесплатный словарь , 31 мая 2023 г. , получено 21 марта 2024 г.
  9. ^ Чжоу Дж., Уилсон Дж., Хеббард Л., Дуань В., Лиддл С., Джордж Дж., Цяо Л. (март 2016 г.). «Аптамеры: многообещающие химические антитела для терапии рака» . Онкотаргет . 7 (12): 13446–13463. дои : 10.18632/oncotarget.7178 . ПМЦ   4924653 . ПМИД   26863567 . S2CID   16618423 .
  10. ^ Миллс Д.Р., Петерсон Р.Л., Шпигельман С. (июль 1967 г.). «Внеклеточный дарвиновский эксперимент с самодублирующейся молекулой нуклеиновой кислоты» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 58 (1): 217–224. Бибкод : 1967ПНАС...58..217М . дои : 10.1073/pnas.58.1.217 . ПМК   335620 . ПМИД   5231602 .
  11. ^ Джойс Г.Ф. (октябрь 1989 г.). «Амплификация, мутация и селекция каталитической РНК». Джин . 82 (1): 83–87. дои : 10.1016/0378-1119(89)90033-4 . ПМИД   2684778 .
  12. ^ Туерк C, Золото L (август 1990 г.). «Систематическая эволюция лигандов путем экспоненциального обогащения: лиганды РНК к ДНК-полимеразе бактериофага Т4». Наука . 249 (4968): 505–510. Бибкод : 1990Sci...249..505T . дои : 10.1126/science.2200121 . ПМИД   2200121 .
  13. ^ Столтенбург Р., Райнеманн С., Стрелиц Б. (октябрь 2007 г.). «SELEX - (р) эволюционный метод получения высокоаффинных нуклеиновых кислот-лигандов». Биомолекулярная инженерия . 24 (4): 381–403. doi : 10.1016/j.bioeng.2007.06.001 . ПМИД   17627883 .
  14. ^ Эллингтон А.Д., Шостак Дж.В. (февраль 1992 г.). «Отбор in vitro одноцепочечных молекул ДНК, которые складываются в специфические лиганд-связывающие структуры». Природа . 355 (6363): 850–852. Бибкод : 1992Natur.355..850E . дои : 10.1038/355850a0 . ПМИД   1538766 . S2CID   4332485 .
  15. ^ Бок LC, Гриффин LC, Лэтэм Дж.А., Вермаас Э.Х., Тул Дж.Дж. (февраль 1992 г.). «Выбор одноцепочечных молекул ДНК, которые связывают и ингибируют тромбин человека». Природа . 355 (6360): 564–566. Бибкод : 1992Natur.355..564B . дои : 10.1038/355564a0 . ПМИД   1741036 . S2CID   4349607 .
  16. ^ Кокс Дж.К., Эллингтон AD (октябрь 2001 г.). «Автоматизированный отбор антибелковых аптамеров». Биоорганическая и медицинская химия . 9 (10): 2525–2531. дои : 10.1016/s0968-0896(01)00028-1 . ПМИД   11557339 .
  17. ^ Кокс Дж.К., Раджендран М., Ридель Т., Дэвидсон Э.А., Сутер Л.Дж., Байер Т.С. и др. (июнь 2002 г.). «Автоматическое получение последовательностей аптамеров». Комбинаторная химия и высокопроизводительный скрининг . 5 (4): 289–299. дои : 10.2174/1386207023330291 . ПМИД   12052180 .
  18. ^ Кокс Дж.К., Хейхерст А., Хессельберт Дж., Байер Т.С., Джорджиу Дж., Эллингтон А.Д. (октябрь 2002 г.). «Автоматизированный отбор аптамеров против белков-мишеней, транслируемых in vitro: от гена к аптамеру» . Исследования нуклеиновых кислот . 30 (20): 108д–108. дои : 10.1093/нар/gnf107 . ПМК   137152 . ПМИД   12384610 .
  19. ^ Breaker RR (февраль 2012 г.). «Рибопереключатели и мир РНК» . Перспективы Колд-Спринг-Харбор в биологии . 4 (2): а003566. doi : 10.1101/cshperspect.a003566 . ПМК   3281570 . ПМИД   21106649 .
  20. ^ Свигель Р., Досси Н., Тониоло Р., Миранда-Кастро Р., де-Лос-Сантос-Альварес Н., Лобо-Кастаньон М.Дж. (сентябрь 2018 г.). «Выбор антиглютеновых ДНК-аптамеров в глубоком эвтектическом растворителе». Ангеванде Хеми . 57 (39): 12850–12854. Бибкод : 2018АнгЧ.13013032С . дои : 10.1002/ange.201804860 . hdl : 10651/49996 . ПМИД   30070419 . S2CID   240281828 .
  21. ^ Невес М.А., Райнштейн О., Саад М., Джонсон П.Е. (декабрь 2010 г.). «Определение вторичных структурных требований аптамера, связывающего кокаин, с помощью термодинамического и мутационного исследования». Биофизическая химия . 153 (1): 9–16. дои : 10.1016/j.bpc.2010.09.009 . ПМИД   21035241 .
  22. ^ Боуг С., Грейт Д., Уилсон С. (август 2000 г.). «2.8 Кристаллическая структура аптамера малахитового зеленого». Журнал молекулярной биологии . 301 (1): 117–128. дои : 10.1006/jmbi.2000.3951 . ПМИД   10926496 .
  23. ^ Дикманн Т., Фудзикава Э., Ксао Х, Шостак Дж., Фейгон Дж. (1995). «Структурные исследования аптамеров РНК и ДНК в растворе». Журнал клеточной биохимии . 59 : 13–81. дои : 10.1002/jcb.240590703 . S2CID   221833821 .
  24. ^ Масчини М., Палчетти И., Томбелли С. (февраль 2012 г.). «Нуклеиновые кислоты и пептидные аптамеры: основы и биоаналитические аспекты». Ангеванде Хеми . 51 (6): 1316–1332. дои : 10.1002/anie.201006630 . ПМИД   22213382 .
  25. ^ Липи Ф., Чен С., Чакраварти М., Ракеш С., Виду Р.Н. (декабрь 2016 г.). «Эволюция химически модифицированных аптамеров нуклеиновых кислот in vitro: плюсы и минусы, а также комплексные стратегии отбора» . Биология РНК . 13 (12): 1232–1245. дои : 10.1080/15476286.2016.1236173 . ПМК   5207382 . ПМИД   27715478 .
  26. ^ Чен А, Ян М, Ян С (2016). «Сплит-аптамеры и их применение в сэндвич-аптасенсорах» . TrAC Тенденции в аналитической химии . 80 : 581–593. дои : 10.1016/j.trac.2016.04.006 .
  27. ^ Кент А.Д., Спиропулос Н.Г., Хемстра Дж.М. (октябрь 2013 г.). «Общий подход к разработке расщепленных аптамеров ДНК, связывающихся с малыми молекулами». Аналитическая химия . 85 (20): 9916–9923. дои : 10.1021/ac402500n . ПМИД   24033257 .
  28. ^ Дебиа М., Лелиевр А., Смитана М., Мюллер С. (апрель 2020 г.). «Расщепление аптамеров и ферментов нуклеиновых кислот для разработки современных биосенсоров» . Исследования нуклеиновых кислот . 48 (7): 3400–3422. дои : 10.1093/nar/gkaa132 . ПМЦ   7144939 . ПМИД   32112111 .
  29. ^ Дроле Д.В., Грин Л.С., Голд Л., Янич Н. (июнь 2016 г.). «Пригодно для глаз: аптамеры при заболеваниях глаз» . Нуклеиновая кислотная терапия . 26 (3): 127–146. дои : 10.1089/нат.2015.0573 . ПМЦ   4900223 . ПМИД   26757406 .
  30. ^ Ван А.З., Фарохзад О.К. (март 2014 г.). «Современный прогресс молекулярной визуализации на основе аптамеров» . Журнал ядерной медицины . 55 (3): 353–356. дои : 10.2967/jnumed.113.126144 . ПМК   4110511 . ПМИД   24525205 .
  31. ^ Банерджи, С.; Хеммат, Массачусетс; Шубхам, С.; Госай, А.; Девараконда, С.; Цзян, Н.; Гикиянаге, К.; Диллард, Дж.А.; Мори, В.; Шротрия, П.; и др. Структурно разные, но функционально схожие: аптамеры, специфичные для растворимого гликопротеина вируса Эбола и GP1,2, и их применение в электрохимическом зондировании. Межд. Дж. Мол. наук. 2023, 24, 4627. https://doi.org/10.3390/ijms24054627.
  32. ^ Перейти обратно: а б Каур Х., Шори М. (июнь 2019 г.). «Аптасенсоры на основе наноматериалов для клинической и экологической диагностики» . Наномасштабные достижения . 1 (6): 2123–2138. Бибкод : 2019NanoA...1.2123K . дои : 10.1039/C9NA00153K . ПМЦ   9418768 . ПМИД   36131986 .
  33. ^ Малликаратчи П. (январь 2017 г.). «Эволюция комплексного целевого SELEX для идентификации аптамеров против антигенов поверхности клеток млекопитающих» . Молекулы . 22 (2): 215. doi : 10,3390/molecules22020215 . ПМЦ   5572134 . ПМИД   28146093 .
  34. ^ Потти А.С., Куренци К., Фанг Х., Джексон Г.В., Чжан Х, Легге ГБ, Уилсон Р.К. (февраль 2009 г.). «Биофизическая характеристика взаимодействия ДНК-аптамеров с фактором роста эндотелия сосудов». Биополимеры . 91 (2): 145–156. дои : 10.1002/bip.21097 . ПМИД   19025993 . S2CID   23670 .
  35. ^ Лонг SB, Лонг MB, Уайт RR, Салленджер BA (декабрь 2008 г.). «Кристаллическая структура аптамера РНК, связанного с тромбином» . РНК . 14 (12): 2504–2512. дои : 10.1261/rna.1239308 . ПМК   2590953 . ПМИД   18971322 .
  36. ^ Кон, Эрик М.; Коновалов Кирилл; Гомес, Кристиан А.; Гувер, Джиллиан Н.; Йик, Эндрю Кай-хей; Хуан, Сюйхуэй; Мартелл, Джеффри Д. (2 августа 2023 г.). «Терминальные алкин-модифицированные ДНК-аптамеры с повышенным сродством к связыванию с белками» . АКС Химическая биология . 18 (9): 1976–1984. doi : 10.1021/acschembio.3c00183 . ISSN   1554-8929 . ПМИД   37531184 .
  37. ^ Дарфей Ф., Рейгадас С., Хансен Дж.Б., Орум Х., Ди Примо К., Тулме Ж.Дж. (октябрь 2006 г.). «Аптамеры, нацеленные на шпильку РНК, демонстрируют улучшенную специфичность по сравнению со специфичностью комплементарных олигонуклеотидов». Биохимия . 45 (39): 12076–12082. дои : 10.1021/bi0606344 . ПМИД   17002307 .
  38. ^ Лю М., Кагахара Т., Абэ Х., Ито Ю. (2009). «Прямой отбор in vitro геминсвязывающего ДНК-аптамера с пероксидазной активностью». Бюллетень Химического общества Японии . 82 : 99–104. дои : 10.1246/bcsj.82.99 .
  39. ^ Мин К., Чо М., Хан С.Ю., Шим Ю.Б., Ку Дж., Бан С. (июль 2008 г.). «Простое и прямое электрохимическое обнаружение гамма-интерферона с использованием его аптамеров РНК и ДНК». Биосенсоры и биоэлектроника . 23 (12): 1819–1824. дои : 10.1016/j.bios.2008.02.021 . ПМИД   18406597 .
  40. ^ Нг Э.В., Шима Д.Т., Калиас П., Каннингем Э.Т., Гайер Д.Р., Адамис А.П. (февраль 2006 г.). «Пегаптаниб, целевой аптамер против VEGF при заболеваниях глазных сосудов». Обзоры природы. Открытие наркотиков . 5 (2): 123–132. дои : 10.1038/nrd1955 . ПМИД   16518379 . S2CID   8833436 .
  41. ^ Могадам, Фатеме Мортазави; Рахайе, Махди (май 2019 г.). «Нанобиосенсор с сигналом для обнаружения VEGF165 на основе супрачастичных нанокластеров меди, образованных на двухвалентном аптамере» . Биосенсоры и биоэлектроника . 132 : 186–195. дои : 10.1016/j.bios.2019.02.046 . ПМИД   30875630 . S2CID   80613434 .
  42. ^ Сэвори Н., Абэ К., Соде К., Икебукуро К. (декабрь 2010 г.). «Выбор ДНК-аптамера против специфического антигена простаты с использованием генетического алгоритма и применения к зондированию». Биосенсоры и биоэлектроника . 26 (4): 1386–1391. дои : 10.1016/j.bios.2010.07.057 . ПМИД   20692149 .
  43. ^ Чон С., Хан С.Р., Ли Ю.Дж., Ли С.В. (март 2010 г.). «Отбор РНК-аптамеров, специфичных к активному простатспецифическому антигену». Биотехнологические письма . 32 (3): 379–385. дои : 10.1007/s10529-009-0168-1 . ПМИД   19943183 . S2CID   22201181 .
  44. ^ Уолш Р., ДеРоса MC (октябрь 2009 г.). «Сохранение функции в гомологе ДНК аптамера дофамина РНК». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 388 (4): 732–735. дои : 10.1016/j.bbrc.2009.08.084 . ПМИД   19699181 .
  45. ^ Саламанка Х.Х., Антоньяк М.А., Серионе Р.А., Ши Х., Лис Дж.Т. (2014). «Ингибирование фактора теплового шока 1 в раковых клетках человека с помощью мощного РНК-аптамера» . ПЛОС ОДИН . 9 (5): е96330. Бибкод : 2014PLoSO...996330S . дои : 10.1371/journal.pone.0096330 . ПМК   4011729 . ПМИД   24800749 .
  46. ^ Фарохзад О.К., Карп Дж.М., Лангер Р. (май 2006 г.). «Биоконъюгаты наночастиц-аптамеров для борьбы с раком». Экспертное мнение о доставке лекарств . 3 (3): 311–324. дои : 10.1517/17425247.3.3.311 . ПМИД   16640493 . S2CID   37058942 .
  47. ^ Проске Д., Гилч С., Вопфнер Ф., Шетцль Х.М., Виннакер Э.Л., Фамулок М. (август 2002 г.). «Аптамер, специфичный для прионного белка, снижает образование PrPSc». ХимБиоХим . 3 (8): 717–725. doi : 10.1002/1439-7633(20020802)3:8<717::AID-CBIC717>3.0.CO;2-C . ПМИД   12203970 . S2CID   36801266 .
  48. ^ Каур Х., Шори М., Шарма М., Гангули А.К., Сабхервал П. (декабрь 2017 г.). «Аптасенсор с функционализированным графеном мостовым стержнем для обнаружения патогенной E. coli O78: K80: H11». Биосенсоры и биоэлектроника . 98 : 486–493. дои : 10.1016/j.bios.2017.07.004 . ПМИД   28728009 .
  49. ^ Перейти обратно: а б с Аша К., Кумар П., Саникас М., Месеко К.А., Ханна М., Кумар Б. (декабрь 2018 г.). «Достижения в области терапии на основе нуклеиновых кислот против респираторных вирусных инфекций» . Журнал клинической медицины . 8 (1): 6. дои : 10.3390/jcm8010006 . ПМК   6351902 . ПМИД   30577479 .
  50. ^ Шмитц А., Вебер А., Байин М., Брейерс С., Фиберг В., Фамулок М., Майер Г. (апрель 2021 г.). «Аптамер ДНК, связывающий спайки SARS-CoV-2, который ингибирует псевдовирусную инфекцию с помощью RBD-независимого механизма*» . Ангеванде Хеми . 60 (18): 10279–10285. дои : 10.1002/anie.202100316 . ПМЦ   8251191 . PMID   33683787 .
  51. ^ Дхар П., Самарасингхе Р.М., Шигдар С. (апрель 2020 г.). «Антитела, нанотела или аптамеры – что лучше всего подходит для расшифровки протеомов немодельных видов?» . Международный журнал молекулярных наук . 21 (7): 2485. doi : 10.3390/ijms21072485 . ПМЦ   7177290 . ПМИД   32260091 .
  52. ^ Перейти обратно: а б Бауэр М., Стром М., Хаммонд Д.С., Шигдар С. (ноябрь 2019 г.). «Все, что вы можете сделать, я могу сделать лучше: могут ли аптамеры заменить антитела в клинической диагностике?» . Молекулы . 24 (23): 4377. doi : 10,3390/molecules24234377 . ПМК   6930532 . ПМИД   31801185 .
  53. ^ Фэн С., Чен С., Ван В., Цюй Л. (май 2018 г.). «Микросенсор с нанопорами аптамера для обнаружения теофиллина» . Биосенсоры и биоэлектроника . 105 : 36–41. дои : 10.1016/j.bios.2018.01.016 . ПМИД   29351868 .
  54. ^ Песня С (2017). «Обнаружение растительного гормона абсцизовой кислоты (АБК) с использованием оптического сенсора на основе аптамера с капиллярным микрофлюидным интерфейсом» . 2017 30-я Международная конференция IEEE по микроэлектромеханическим системам (MEMS) . стр. 370–373. дои : 10.1109/MEMSYS.2017.7863418 . ISBN  978-1-5090-5078-9 . S2CID   20781208 .
  55. ^ Мушиньска К., Островска Д., Бартницки Ф., Ковальска Е., Бодашевска-Любас М., Германович П. и др. (2017). «Выбор и анализ ДНК-аптамера, связывающего α-аманитин из Amanita phalloides» . Акта Биохимика Полоника . 64 (3): 401–406. дои : 10.18388/abp.2017_1615 . ПМИД   28787470 . S2CID   3638299 .
  56. ^ Пеннер Дж. (июль 2012 г.). «Коммерциализация диагностического теста на основе аптамеров» (PDF) . НеоВенчурс .
  57. ^ Вэй Х, Ли Б, Ли Дж, Ван Э, Донг С (сентябрь 2007 г.). «Простое и чувствительное колориметрическое определение белка на основе аптамеров с использованием немодифицированных зондов из наночастиц золота». Химические коммуникации (36): 3735–3737. дои : 10.1039/B707642H . ПМИД   17851611 .
  58. ^ Ченг Х, Цю X, Чжао X, Мэн В, Хо Д, Вэй Х (март 2016 г.). «Функциональный зонд нуклеиновой кислоты для параллельного мониторинга K (+) и протопорфирина IX в живых организмах». Аналитическая химия . 88 (5): 2937–2943. дои : 10.1021/acs.analchem.5b04936 . ПМИД   26866998 .
  59. ^ Сян Ю, Лу Ю (июль 2011 г.). «Использование персональных глюкометров и функциональных ДНК-сенсоров для количественного определения различных аналитических целей» . Природная химия . 3 (9): 697–703. Бибкод : 2011НатЧ...3..697Х . дои : 10.1038/nchem.1092 . ПМК   3299819 . ПМИД   21860458 .
  60. ^ Агниво Госай, Брендан Шин Хау Да, Марит Нильсен-Гамильтон, Пранав Шротрия, «Обнаружение свободного тромбина по меткам в присутствии высокой концентрации альбумина с использованием нанопористой мембраны, функционализированной аптамером», Biosensors and Bioelectronics , Volume 126, 2019, стр. 88 –95, ISSN   0956-5663 , два : 10.1016/j.bios.2018.10.010 .
  61. ^ Амеро П., Хатуа С., Родригес-Агуайо С., Лопес-Берестейн Г. (октябрь 2020 г.). «Аптамеры: новые методы лечения и потенциальная роль в нейроонкологии» . Раки . 12 (10): 2889. doi : 10.3390/cancers12102889 . ПМК   7600320 . ПМИД   33050158 .
  62. ^ Фаттал Э., Хиллеро Х., Исмаил С.И. (сентябрь 2018 г.). «Аптамеры в терапии и доставке лекарств». Обзоры расширенной доставки лекарств . 134 : 1–2. дои : 10.1016/j.addr.2018.11.001 . ПМИД   30442313 . S2CID   53562925 .
  63. ^ Хафнер М., Вианини Э., Альбертони Б., Маркетти Л., Грюне И., Глекнер С., Фамулок М. (2008). «Замещение связанных с белками аптамеров небольшими молекулами, проверенными с помощью поляризации флуоресценции». Протоколы природы . 3 (4): 579–587. дои : 10.1038/nprot.2008.15 . ПМИД   18388939 . S2CID   4997899 .
  64. ^ Хуан Цзы, Цю Л, Чжан Т, Тан В (03 февраля 2021 г.). «Интеграция ДНК-нанотехнологии с аптамерами для биологических и биомедицинских приложений» . Иметь значение . 4 (2): 461–489. дои : 10.1016/j.matt.2020.11.002 . ISSN   2590-2385 . S2CID   234061584 .
  65. ^ Рейно Л., Буше-Спинелли А., Райлон С., Бюхо А. (август 2020 г.). «Зондирование с помощью нанопор и аптамеров: путь вперед» . Датчики . 20 (16): 4495. Бибкод : 2020Senso..20.4495R . дои : 10.3390/s20164495 . ПМЦ   7472324 . ПМИД   32796729 .
  66. ^ Ян Ю, Инь С, Ли Ю, Лу Д, Чжан Дж, Сунь С (2017). «Применение аптамеров для обнаружения и хроматографической очистки антибиотиков в различных матрицах» . TrAC Тенденции в аналитической химии . 95 : 1–22. дои : 10.1016/j.trac.2017.07.023 . Проверено 4 июля 2022 г.
  67. ^ Мерфи М.Б., Фуллер С.Т., Ричардсон П.М., Дойл С.А. (сентябрь 2003 г.). «Улучшенный метод эволюции аптамеров in vitro и его применение в обнаружении и очистке белков» . Исследования нуклеиновых кислот . 31 (18): 110д–110. дои : 10.1093/нар/gng110 . ПМК   203336 . ПМИД   12954786 .
  68. ^ Чен К., Чжоу Дж., Шао З., Лю Дж., Сун Дж., Ван Р. и др. (июль 2020 г.). «Аптамеры как универсальные молекулярные инструменты для мониторинга производства антител и контроля качества». Журнал Американского химического общества . 142 (28): 12079–12086. дои : 10.1021/jacs.9b13370 . ПМИД   32516525 . S2CID   219564070 .
  69. ^ Кейзер Дж. Ф., Альбада Б (март 2022 г.). «Сайт-селективная модификация белка с помощью ДНК» . Биополимеры . 113 (3): e23483. дои : 10.1002/bip.23483 . ПМЦ   9285461 . ПМИД   34878181 . S2CID   244954278 .
  70. ^ Смит Д., Коллинз Б.Д., Хайл Дж., Кох Т.Х. (январь 2003 г.). «Чувствительность и специфичность фотоаптамерных зондов» . Молекулярная и клеточная протеомика . 2 (1): 11–18. дои : 10.1074/mcp.m200059-mcp200 . ПМИД   12601078 . S2CID   13406870 .
  71. ^ Винкенборг Дж. Л., Майер Г., Фамулок М. (сентябрь 2012 г.). «Аффинное мечение белков на основе аптамеров» . Ангеванде Хеми . 51 (36): 9176–9180. дои : 10.1002/anie.201204174 . ПМИД   22865679 .
  72. ^ Кейзер Дж. Ф., Фирет Дж., Альбада Б. (декабрь 2021 г.). «Сайт-селективное и индуцируемое ацилирование тромбина с использованием конъюгатов аптамер-катализатор» . Химические коммуникации . 57 (96): 12960–12963. дои : 10.1039/d1cc05446e . ПМИД   34792071 . S2CID   243998479 .
  73. ^ Уилсон, Брэндон Д.; Со, Х. Том (01 августа 2020 г.). «Переоценка общепринятых представлений об анализах связывания» . Тенденции биохимических наук . 45 (8): 639–649. дои : 10.1016/j.tibs.2020.04.005 . ISSN   0968-0004 . ПМЦ   7368832 . ПМИД   32402748 .
  74. ^ Янсон, Ян-Кристер (3 января 2012 г.). Очистка белков: принципы, методы высокого разрешения и приложения . Джон Уайли и сыновья. ISBN  978-1-118-00219-3 .
  75. ^ Чен А., Ян С. (сентябрь 2015 г.). «Замена антител аптамерами в иммуноанализе в латеральном потоке». Биосенсоры и биоэлектроника . 71 : 230–242. дои : 10.1016/j.bios.2015.04.041 . ПМИД   25912679 .
  76. ^ Тох С.Ю., Цитартан М., Гопинатх С.С., Тан Т.Х. (февраль 2015 г.). «Аптамеры как замена антител в иммуноферментном анализе». Биосенсоры и биоэлектроника . 64 : 392–403. дои : 10.1016/j.bios.2014.09.026 . ПМИД   25278480 .
  77. ^ Бруно Дж.Г., Сивилс Дж.К. (2016). «Аптамер «Вестерн»-блоттинг белков внешней мембраны E. coli и ключевых факторов вирулентности патогенных серотипов E. coli» . Аптамеры и синтетические антитела .
  78. ^ Бауэр М., Макдональд Дж., Анри Дж., Дуан В., Шигдар С. (июнь 2016 г.). «Применение аптамеров для иммуногистохимии». Нуклеиновая кислотная терапия . 26 (3): 120–126. дои : 10.1089/нат.2015.0569 . ПМИД   26862683 .
  79. ^ Мейер М., Шепер Т., Уолтер Дж.Г. (август 2013 г.). «Аптамеры: универсальные зонды для проточной цитометрии». Прикладная микробиология и биотехнология . 97 (16): 7097–7109. дои : 10.1007/s00253-013-5070-z . ПМИД   23838792 . S2CID   13996688 .
  80. ^ Чжоу Дж., Росси Дж. (март 2017 г.). «Аптамеры как средства таргетной терапии: текущий потенциал и проблемы» . Обзоры природы. Открытие наркотиков . 16 (3): 181–202. дои : 10.1038/nrd.2016.199 . ПМК   5700751 . ПМИД   27807347 .
  81. ^ Бруно Дж.Г. (апрель 2015 г.). «Прогнозирование неопределенного будущего диагностики и терапии на основе аптамеров» . Молекулы . 20 (4): 6866–6887. дои : 10.3390/molecules20046866 . ПМК   6272696 . ПМИД   25913927 .
  82. ^ Ван Т., Чен С., Ларчер Л.М., Барреро Р.А., Виду Р.Н. (2019). «Три десятилетия технологий аптамеров нуклеиновых кислот: извлеченные уроки, прогресс и возможности в разработке аптамеров» . Достижения биотехнологии . 37 (1): 28–50. doi : 10.1016/j.biotechadv.2018.11.001 . ПМИД   30408510 . S2CID   53242220 .
  83. ^ Мельбурн Дж., Бишоп П., Браун Дж., Стоддарт Дж. (октябрь 2016 г.). «Многогранный подход к достижению глобального признания методов исследования без использования животных» . Альтернативы лабораторным животным . 44 (5): 495–498. дои : 10.1177/026119291604400511 . ПМИД   27805832 . S2CID   1002312 .
  84. ^ Альфале М.А., Альсааб Х.О., Махмуд А.Б., Алкайял А.А., Джонс М.Л., Малер С.М., Хашем А.М. (2020). «Моноклональные антитела, полученные из фагового дисплея: от скамьи до постели» . Границы в иммунологии . 11 : 1986. doi : 10.3389/fimmu.2020.01986 . ПМЦ   7485114 . ПМИД   32983137 .
  85. ^ Сунторнвораджит Б., Чжоу Дж., Шоу М.Т., Фань Т.Х., Ван Ю. (март 2010 г.). «Функционализация гидрогеля с помощью ДНК-аптамеров для устойчивого высвобождения PDGF-BB». Химические коммуникации . 46 (11): 1857–1859. дои : 10.1039/B924909E . ПМИД   20198232 .
  86. ^ Баттиг М.Р., Сунторнвораджит Б., Ван Ю (август 2012 г.). «Программируемое высвобождение нескольких белковых препаратов из гидрогелей, функционализированных аптамерами, посредством гибридизации нуклеиновых кислот». Журнал Американского химического общества . 134 (30): 12410–12413. дои : 10.1021/ja305238a . ПМИД   22816442 .
  87. ^ Стейскалова А., Олива Н., Англия Ф.Д., Алмквист Б.Д. (февраль 2019 г.). «Биологически обусловленное клеточно-селективное высвобождение захваченных аптамерами факторов роста с помощью тяговых сил» . Продвинутые материалы . 31 (7): e1806380. Бибкод : 2019AdM....3106380S . дои : 10.1002/adma.201806380 . ПМК   6375388 . ПМИД   30614086 .
  88. ^ Березовский М.В., Лехманн М., Мушеев М.Ю., Мак Т.В., Крылов С.Н. (июль 2008 г.). «Открытие биомаркеров с помощью аптамеров (AptaBiD)». Журнал Американского химического общества . 130 (28): 9137–9143. дои : 10.1021/ja801951p . ПМИД   18558676 .
  89. ^ Колас П., Коэн Б., Джессен Т., Гришина И., Маккой Дж., Брент Р. (апрель 1996 г.). «Генетический отбор пептидных аптамеров, которые распознают и ингибируют циклин-зависимую киназу 2». Природа . 380 (6574): 548–550. Бибкод : 1996Natur.380..548C . дои : 10.1038/380548a0 . ПМИД   8606778 . S2CID   4327303 .
  90. ^ Нолан GP (январь 2005 г.). «Головастики за хвост». Природные методы . 2 (1): 11–12. дои : 10.1038/nmeth0105-11 . ПМИД   15782163 . S2CID   1423778 .
  91. ^ Споляр РС, Рекорд МТ (февраль 1994 г.). «Сочетание локальной складки с сайт-специфическим связыванием белков с ДНК». Наука . 263 (5148): 777–784. Бибкод : 1994Sci...263..777S . дои : 10.1126/science.8303294 . ПМИД   8303294 .
  92. ^ Хуан Дж., Ру Б., Чжу П., Не Ф., Ян Дж., Ван Х. и др. (январь 2012 г.). «MimoDB 2.0: база данных мимотопов и не только» . Исследования нуклеиновых кислот . 40 (Проблема с базой данных): D271–D277. дои : 10.1093/nar/gkr922 . ПМК   3245166 . ПМИД   22053087 .
  93. ^ «MimoDB: база данных мимотопов и не только» . immunt.cn . Архивировано из оригинала 16 ноября 2012 г. Проверено 3 февраля 2016 г.
  94. ^ Гейер Ч.Р., Колман-Лернер А., Брент Р. (июль 1999 г.). « Мутагенез с помощью пептидных аптамеров идентифицирует членов генетической сети и связи путей» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 96 (15): 8567–8572. Бибкод : 1999PNAS...96.8567G . дои : 10.1073/pnas.96.15.8567 . ЧВК   17557 . ПМИД   10411916 .
  95. ^ Дибенедетто С., Клюэ Д., Стебе П.Н., Баумле В., Лео Дж., Терре Р. и др. (июль 2013 г.). «Кальцинеурин А по сравнению с доменом NS5A-TP2/HD, содержащим 2: тематическое исследование направленного низкочастотного случайного мутагенеза для определения целевой специфичности пептидных аптамеров» . Молекулярная и клеточная протеомика . 12 (7): 1939–1952. дои : 10.1074/mcp.M112.024612 . ПМК   3708177 . ПМИД   23579184 .
  96. ^ Колас П., Коэн Б., Ко Ферриньо П., Сильвер П.А., Брент Р. (декабрь 2000 г.). «Направленная модификация и транспортировка клеточных белков» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 97 (25): 13720–13725. Бибкод : 2000PNAS...9713720C . дои : 10.1073/pnas.97.25.13720 . ЧВК   17642 . ПМИД   11106396 .
  97. ^ «FDA одобряет препарат Macugen компании Eyetech/Pfizer» . Обзор офтальмологии . Проверено 30 июня 2022 г.
  98. ^ Датт С. «SomaLogic и Illumina объединяют сильные стороны для продвижения инноваций в протеомике» . Биокосмос . Проверено 30 июня 2022 г.
  99. ^ «Apta-Index™ (база данных аптамеров) — библиотека из более чем 500 аптамеров» . АПТАГЕН, ООО . Проверено 16 декабря 2022 г.

Дальнейшее чтение

[ редактировать ]
Retrieved from "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Aptamer&oldid=1229933341"
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: ed0c7eab45ad879f41b7217d92c04ca6__1718797080
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/ed/a6/ed0c7eab45ad879f41b7217d92c04ca6.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
Aptamer - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)