КСИЛТ1

КСИЛТ1
Идентификаторы
Псевдонимы	XYLT1 , DBQD2, PXT-I, XT1, XTI, XYLTI, ксилТ-I, ксилозилтрансфераза 1
Внешние идентификаторы	Опустить : 608124 ; МГИ : 2451073 ; Гомологен : 32534 ; Генные карты : XYLT1 ; OMA : XYLT1 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 16 (human)
End	17,470,960 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 7 (mouse)
End	117,272,803 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	tibia; ; cartilage tissue; ; hair follicle; ; Region I of hippocampus proper; ; Epithelium of choroid plexus; ; synovial joint; ; gingival epithelium; ; retinal pigment epithelium; ; entorhinal cortex; ; Brodmann area 23;
	Top expressed in
	subiculum; ; anterior amygdaloid area; ; primary motor cortex; ; deep cerebellar nuclei; ; retinal pigment epithelium; ; ventromedial nucleus; ; cingulate gyrus; ; paraventricular nucleus of hypothalamus; ; granulocyte; ; mammillary body;
	More reference expression data
	n/a
showГенная онтология
Molecular function	protein xylosyltransferase activity; transferase activity; acetylglucosaminyltransferase activity; glycosyltransferase activity; metal ion binding;
Cellular component	integral component of membrane; extracellular region; Golgi apparatus; endoplasmic reticulum membrane; endoplasmic reticulum; membrane; Golgi membrane; Golgi cis cisterna; extracellular space;
Biological process	chondroitin sulfate biosynthetic process; heparan sulfate proteoglycan biosynthetic process; glycosaminoglycan biosynthetic process; glycosaminoglycan metabolic process; proteoglycan biosynthetic process; ossification involved in bone maturation; embryonic skeletal system development; chondroitin sulfate proteoglycan biosynthetic process;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	64131
	233781
	ENSG00000103489 ; ENSG00000285395
	ENSMUSG00000030657
	Q86Y38
	Q811B1
	НМ_022166
	НМ_175645
	НП_071449
	НП_783576
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Ксилозилтрансфераза 1 — это фермент , который у человека кодируется XYLT1 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Ксилозилтрансфераза (XT; EC 2.4.2.26) катализирует перенос UDP-ксилозы на остатки серина в последовательностях распознавания XT белков-мишеней. Добавление этой ксилозы к основному белку необходимо для биосинтеза гликозаминогликановых цепей , характерных для протеогликанов . [поставляется OMIM] ^{[ 6 ]}

Клиническая значимость

Синдром Баратела-Скотта

В 2012 году у человека был выявлен синдром Баратела-Скотта. ^{[ 7 ]} Расширение повтора GGC и метилирование экзона 1 XYLT1 являются распространенным патогенным вариантом синдрома Баратела-Скотта. ^{[ 8 ]}

пациентов с синдромом Бартарлла-Скотта наблюдаются аномальное развитие скелета У , характерные черты лица и задержка когнитивного развития. коленной чашечки Проблемы скелета включают неправильное положение , короткие длинные кости с легкими изменениями в узкой части , короткие кости ладоней с короткими большими пальцами, короткие шейки бедер , неглубокие впадины бедер и пороки развития позвоночника. Характерные черты лица включают уплощенную среднюю часть лица с широкой переносицей , расщелину неба и монобровь . Синдром также вызывает задержку когнитивного развития в дошкольном возрасте с сокращением концентрации внимания. Некоторая часть когнитивной задержки маскируется теплым и обаятельным характером.

Расширение аксона

Нейроны используют присутствие молекул внеклеточного матрикса как подсказку, следует ли стимулировать или подавлять расширение аксонов. Хондроитинсульфат-протеогликаны подавляют распространение аксонов через глиальный рубец - барьер, который развивается после поражения спинного мозга. Протеогликаны состоят из одного относительно небольшого белкового ядра и прикрепленных к ним крупных боковых цепей гликозаминогликанов. Блокировать само образование этих боковых цепей ксилозилтрансфераза (XYLT1), которая присоединяет ксилозу к серину ядра белка, что инициирует удлинение цепи гликозаминогликанов, была целью класса разработанных молекул ДНК. Эти молекулы называются ДНК-ферментами, которые были разработаны для специфического расщепления мРНК XYLT1 внутри клеток. ДНК-ферменты легко усваиваются клетками млекопитающих, но они более стабильны и требуют гораздо меньших концентраций, чем миРНК. ДНК-фермент XTYL1 в совместных культурах нейронов с клетками, секретирующими нейрокан, продемонстрировал заметное увеличение роста аксонов. Крысы с определенными поражениями спинного мозга, в том числе клинически значимой контузией, получавшие лечение ДНК-ферментом XTYL1, вводимым с помощью микроинфузионных насосов, или системно достигавшие улучшения в выполнении задачи по горизонтальной лестнице, повышение пластичности аксонов, рост кортикоспинального тракта, отсутствие влияния на нейропатические боль при использовании механических и термических тестов на аллодинию и отсутствие токсикологических или патологических побочных эффектов по сравнению с контрольными животными. {{Oudega M, Chao OY, Avison DL, Бронсон RT, Buchser WJ, Hurtado A, Grimpe B. (2012)Системное введение дезоксирибозима в мРНК ксилозилтрансферазы-1 способствует восстановлению после травмы спинного мозга Exp Neurol. Сентябрь;237(1):170-9. doi: 10.1016/j.expneurol.2012.06.006. PMID: 22721770}}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с ENSG00000285395 GRCh38: выпуск Ensembl 89: ENSG00000103489, ENSG00000285395 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000030657 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Геттинг К., Кун Дж., Зан Р., Бринкманн Т., Клесик К. (январь 2001 г.). «Молекулярное клонирование и экспрессия человеческого UDP-d-ксилозы: корового белка протеогликана бета-d-ксилозилтрансферазы и ее первой изоформы XT-II». Дж Мол Биол . 304 (4): 517–28. дои : 10.1006/jmbi.2000.4261 . ПМИД 11099377 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: ксилозилтрансфераза I XYLT1» .
^ Баратела, Вагнер А.Р.; Бобер, Майкл Б.; Тиллер, Джордж Э.; Окенфусс, Эрика; Дитро, Коллин; Дукер, Анджела; Краков, Дебора; Стейбли, Дебора Л.; Сол-Церковь, Катя; Маккензи, Уильям; Лахман, Ральф; Скотт, Чарльз I. (август 2012 г.). «Недавно выявленный синдром с характерными чертами лица, скелетной дисплазией и задержкой развития» . Американский журнал медицинской генетики, часть A. 158А (8): 1815–1822 гг. дои : 10.1002/ajmg.a.35445 . ПМК 4164294 . ПМИД 22711505 .
^ Лакруа, Эми Дж.; Стейбли, Дебора; Сахрауи, Ребекка; Адам, Маргарет П.; Мехаффи, Мишель; Кернан, Келли; Майерс, Кэндис Т.; Фагерстром, Кэрри; Анадиотис, Джордж; Аккари, Яссмин М.; Роббинс, Кэтрин М.; Грипп, Карен В.; Баратела, Вагнер А.Р.; Бобер, Майкл Б.; Дукер, Анджела Л.; Доэрти, Дэн; Демпси, Дженнифер С.; Миллер, Дэниел Г.; Кирхер, Мартин; Бамшад, Майкл Дж.; Никерсон, Дебора А.; Меффорд, Хизер С.; Сол-Церковь, Катя (январь 2019). «Расширение повторов GGC и метилирование экзона 1 XYLT1 являются распространенным патогенным вариантом синдрома Баратела-Скотта» . Американский журнал генетики человека . 104 (1): 35–44. дои : 10.1016/j.ajhg.2018.11.005 . ПМК 6323552 . ПМИД 30554721 .

Дальнейшее чтение

Геттинг С., Соллберг С., Кун Дж. и др. (1999). «Сывороточная ксилозилтрансфераза: новый биохимический маркер склеротического процесса при системной склеродермии» . Дж. Инвест. Дерматол . 112 (6): 919–24. дои : 10.1046/j.1523-1747.1999.00590.x . ПМИД 10383739 .
Кун Дж., Геттинг С., Шнольцер М. и др. (2001). «Первое выделение человеческой UDP-D-ксилозы: корового белка протеогликана бета-D-ксилозилтрансферазы, секретируемого из культивируемых клеток хориокарциномы JAR» . Ж. Биол. Хим . 276 (7): 4940–7. дои : 10.1074/jbc.M005111200 . ПМИД 11087729 .
Геттинг С., Кун Дж., Бринкманн Т., Клесик К. (2002). «Активность ксилозилтрансферазы в семенной плазме бесплодных мужчин». Клин. Хим. Акта . 317 (1–2): 199–202. дои : 10.1016/S0009-8981(01)00793-8 . ПМИД 11814476 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Гёттинг С., Мюллер С., Шёттлер М. и др. (2004). «Анализ мотивов DXD в ксилозилтрансферазе I человека, необходимых для активности фермента» . Ж. Биол. Хим . 279 (41): 42566–73. дои : 10.1074/jbc.M401340200 . ПМИД 15294915 .
Мюллер С., Шёттлер М., Шён С. и др. (2005). «Человеческая ксилозилтрансфераза I: функциональная и биохимическая характеристика остатков цистеина, необходимых для ферментативной активности» . Биохим. Дж . 386 (Часть 2): 227–36. дои : 10.1042/BJ20041206 . ПМК 1134786 . ПМИД 15461586 .
Геттинг С., Хендиг Д., Адам А. и др. (2006). «Повышенная активность ксилозилтрансферазы I у пациентов с эластической псевдоксантомой (PXE) как маркер стимулированного биосинтеза протеогликана». Дж. Мол. Мед . 83 (12): 984–92. дои : 10.1007/s00109-005-0693-x . ПМИД 16133423 . S2CID 9907867 .
Шон С., Пранте С., Мюллер С. и др. (2005). «Влияние полиморфизмов генов, кодирующих ксилозилтрансферазу I и ее гомолог, у пациентов с диабетом 1 типа с нефропатией и без нее» . Почки Int . 68 (4): 1483–90. дои : 10.1111/j.1523-1755.2005.00561.x . ПМИД 16164625 .
Мюллер С., Дисс Дж., Шёттлер М. и др. (2006). «Человеческая ксилозилтрансфераза I и N-концевые усеченные формы: функциональная характеристика основного фермента» . Биохим. Дж . 394 (Часть 1): 163–71. дои : 10.1042/BJ20051606 . ПМК 1386014 . ПМИД 16225459 .
Шон С., Пранте С., Бахр С. и др. (2006). «Клонирование и рекомбинантная экспрессия активной полноразмерной ксилозилтрансферазы I (XT-I) и характеристика субклеточной локализации XT-I и XT-II» . Ж. Биол. Хим . 281 (20): 14224–31. дои : 10.1074/jbc.M510690200 . ПМИД 16569644 .
Шён С., Шульц В., Пранте С. и др. (2007). «Полиморфизмы в генах ксилозилтрансферазы вызывают более высокую активность XT-I в сыворотке крови у пациентов с эластической псевдоксантомой (PXE) и способствуют тяжелому течению заболевания» . Дж. Мед. Жене . 43 (9): 745–9. дои : 10.1136/jmg.2006.040972 . ПМК 2593031 . ПМИД 16571645 .
Пранте С., Бибек К., Функе С. и др. (2006). «Формирование внеклеточного матрикса во время хондрогенной дифференцировки мезенхимальных стволовых клеток коррелирует с повышенным уровнем ксилозилтрансферазы I». Стволовые клетки . 24 (10): 2252–61. doi : 10.1634/stemcells.2005-0508 . ПМИД 16778156 . S2CID 40255873 .
Шон С., Пранте С., Бахр С. и др. (2007). «Полиморфизм гена ксилозилтрансферазы I c.343G>T (p.A125S) является фактором риска диабетической нефропатии при диабете 1 типа» . Уход при диабете . 29 (10): 2295–9. дои : 10.2337/dc06-0344 . ПМИД 17003309 .
Куэльяр К., Чуонг Х., Хаббелл С.М., Хинсдейл М.Э. (2007). «Биосинтез хондроитина и гепарансульфата в клетках яичника китайского хомячка зависит от ксилозилтрансферазы II» . Ж. Биол. Хим . 282 (8): 5195–200. дои : 10.1074/jbc.M611048200 . ПМИД 17189266 .
Пранте С., Милтинг Х., Касснер А. и др. (2007). «Активность ксилозилтрансферазы I, регулируемая трансформирующим фактором роста бета1, в сердечных фибробластах человека и ее влияние на ремоделирование миокарда» . Ж. Биол. Хим . 282 (36): 26441–9. дои : 10.1074/jbc.M702299200 . ПМИД 17635914 .
Гримпе Б., Прессман Ю., Лупа М.Д., Хорн К.П., Бунге М.Б., Сильвер Дж. (2005). «Роль протеогликанов во взаимодействиях шванновских клеток и астроцитов и в нарушении регенерации на границах ПНС/ЦНС». Молекулярная и клеточная нейронаука . 28 (1): 18–29. дои : 10.1016/j.mcn.2004.06.010 . ПМИД 15607938 . S2CID 38001196 .
Уртадо А., Подини Х., Удега М., Гримпе Б. (2008). «Опосредованный дезоксирибозимом нокдаун мРНК ксилозилтрансферазы-1 способствует росту аксонов в спинном мозге взрослой крысы». Мозг . 131 (10): 2596–605. дои : 10.1093/brain/awn206 . ПМИД 18765417 .
Кениг Б., Папе Д., Чао О., Бауэр Дж., Гримпе Б. (2016). «Долгосрочное исследование введения дезоксирибозима в мРНК XT-1 способствует регенерации кортиоспинального тракта и улучшает поведенческие результаты после травмы спинного мозга». Экспериментальная неврология . 276 : 51–58. дои : 10.1016/j.expneurol.2015.09.015 . ПМИД 26428904 . S2CID 10575072 .
Удега М., Чао О.Ю., Ависон Д.Л., Бронсон Р.Т., Бухсер В.Дж., Уртадо А., Гримпе Б. (2012). «Системное введение дезоксирибозима в мРНК ксилозилтрансферазы-1 способствует восстановлению после ушиба спинного мозга». Экспериментальная неврология . 237 (1): 170–179. doi : 10.1016/j.expneurol.2012.06.006 . ПМИД 22721770 . S2CID 34942901 .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с ENSG00000285395 GRCh38: выпуск Ensembl 89: ENSG00000103489, ENSG00000285395 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000030657 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid11099377-5] Геттинг К., Кун Дж., Зан Р., Бринкманн Т., Клесик К. (январь 2001 г.). «Молекулярное клонирование и экспрессия человеческого UDP-d-ксилозы: корового белка протеогликана бета-d-ксилозилтрансферазы и ее первой изоформы XT-II». Дж Мол Биол . 304 (4): 517–28. дои : 10.1006/jmbi.2000.4261 . ПМИД 11099377 .

[entrez-6] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: ксилозилтрансфераза I XYLT1» .

[Baratela-Scott-7] Баратела, Вагнер А.Р.; Бобер, Майкл Б.; Тиллер, Джордж Э.; Окенфусс, Эрика; Дитро, Коллин; Дукер, Анджела; Краков, Дебора; Стейбли, Дебора Л.; Сол-Церковь, Катя; Маккензи, Уильям; Лахман, Ральф; Скотт, Чарльз I. (август 2012 г.). «Недавно выявленный синдром с характерными чертами лица, скелетной дисплазией и задержкой развития» . Американский журнал медицинской генетики, часть A. 158А (8): 1815–1822 гг. дои : 10.1002/ajmg.a.35445 . ПМК 4164294 . ПМИД 22711505 .

[GCC_Repeat-8] Лакруа, Эми Дж.; Стейбли, Дебора; Сахрауи, Ребекка; Адам, Маргарет П.; Мехаффи, Мишель; Кернан, Келли; Майерс, Кэндис Т.; Фагерстром, Кэрри; Анадиотис, Джордж; Аккари, Яссмин М.; Роббинс, Кэтрин М.; Грипп, Карен В.; Баратела, Вагнер А.Р.; Бобер, Майкл Б.; Дукер, Анджела Л.; Доэрти, Дэн; Демпси, Дженнифер С.; Миллер, Дэниел Г.; Кирхер, Мартин; Бамшад, Майкл Дж.; Никерсон, Дебора А.; Меффорд, Хизер С.; Сол-Церковь, Катя (январь 2019). «Расширение повторов GGC и метилирование экзона 1 XYLT1 являются распространенным патогенным вариантом синдрома Баратела-Скотта» . Американский журнал генетики человека . 104 (1): 35–44. дои : 10.1016/j.ajhg.2018.11.005 . ПМК 6323552 . ПМИД 30554721 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]