✖


Jump to content

Энхансер (генетика)

(Перенаправлено из эпизода Enhancer )

Здесь представлена ​​четырехэтапная диаграмма, показывающая использование усилителя. Внутри этой последовательности ДНК белок(ы), известный как фактор(ы) транскрипции, связывается с энхансером и увеличивает активность промотора.
  1. ДНК
  2. Усилитель
  3. Промоутер
  4. Ген
  5. Белок-активатор транскрипции
  6. Медиаторный белок
  7. РНК-полимераза

В генетике энхансер — это короткий (50–1500 пар оснований ) участок ДНК , который может быть связан белками ( активаторами ), чтобы увеличить вероятность транскрипции определенного гена . возникновения [ 1 ] [ 2 ] Эти белки обычно называют факторами транскрипции . Усилители цис -действия . Они могут располагаться на расстоянии до 1 Мбит (1 000 000 пар оснований) от гена, выше или ниже стартового сайта. [ 2 ] [ 3 ] В геноме человека существуют сотни тысяч энхансеров. [ 2 ] Они встречаются как у прокариот, так и у эукариот. [ 4 ] Активные энхансеры обычно транскрибируются как энхансерные или регуляторные некодирующие РНК, уровни экспрессии которых коррелируют с уровнями мРНК генов-мишеней. [ 5 ]

Первое открытие эукариотического энхансера было сделано в гене тяжелой цепи иммуноглобулина в 1983 году. [ 6 ] [ 7 ] [ 8 ] Этот энхансер, расположенный в большом интроне , объясняет активацию транскрипции реаранжированных промоторов гена Vh, в то время как нереаранжированные промоторы Vh остаются неактивными. [ 9 ] Недавно было показано, что энхансеры участвуют в некоторых заболеваниях, например, при миелосупрессии . [ 10 ] С 2022 года ученые использовали искусственный интеллект для разработки синтетических усилителей и применяли их в системах животных, сначала в клеточной линии, [ 11 ] а год спустя также и in vivo. [ 12 ] [ 13 ]

Локации

[ редактировать ]

В эукариотических клетках структура хроматинового комплекса ДНК свернута таким образом, что функционально имитирует сверхспиральное состояние, характерное для прокариотической ДНК, поэтому, хотя энхансерная ДНК может быть линейно далекой от гена, она пространственно близка к промотору. и ген. Это позволяет ему взаимодействовать с общими факторами транскрипции и РНК-полимеразой II . [ 14 ] Тот же механизм справедлив и для сайленсеров в геноме эукариот. Сайленсеры — это антагонисты энхансеров, которые, будучи связаны с собственными факторами транскрипции, называемыми репрессорами , подавляют транскрипцию гена. Сайленсеры и энхансеры могут находиться в непосредственной близости друг от друга или даже могут находиться в одной и той же области, отличаясь только транскрипционным фактором, с которым эта область связывается.

Энхансер может располагаться выше или ниже гена, который он регулирует. Более того, энхансер не обязательно должен располагаться рядом с сайтом инициации транскрипции , чтобы влиять на транскрипцию, поскольку некоторые из них, как было обнаружено, расположены на несколько сотен тысяч пар оснований выше или ниже сайта инициации. [ 15 ] Энхансеры не действуют на саму область промотора, но связываются белками-активаторами, как впервые показали эксперименты по конкуренции in vivo. [ 16 ] [ 17 ] Впоследствии молекулярные исследования показали прямое взаимодействие с факторами транскрипции и кофакторами, включая медиаторный комплекс , который рекрутирует полимеразу II, и общие факторы транскрипции, которые затем начинают транскрипцию генов. [ 18 ] [ 19 ] Энхансеры также можно найти в интронах. Ориентацию энхансера можно даже изменить, не влияя на его функцию; кроме того, энхансер может быть вырезан и вставлен в другое место хромосомы, и при этом он все равно будет влиять на транскрипцию гена. [ 8 ] Это одна из причин того, что полиморфизмы интронов могут иметь последствия, хотя они и не транслируются . [ нужна ссылка ] Энхансеры также можно обнаружить в экзонной области несвязанного гена. [ 20 ] [ 21 ] [ 22 ] и они могут действовать на гены на другой хромосоме . [ 23 ]

Энхансеры связываются p300-CBP , и их местоположение можно предсказать с помощью ChIP-seq против этого семейства коактиваторов. [ 24 ] [ 25 ] [ 26 ] [ 27 ]

Роль в экспрессии генов

[ редактировать ]
Регуляция транскрипции у млекопитающих . Активная энхансерная регуляторная область ДНК может взаимодействовать с промоторной областью ДНК своего целевого гена путем образования хромосомной петли. Это может инициировать синтез информационной РНК (мРНК) с помощью РНК-полимеразы II (РНКП II), связанной с промотором в сайте начала транскрипции гена. Петля стабилизируется одним архитектурным белком, прикрепленным к энхансеру, и другим белком, прикрепленным к промотору, и эти белки соединяются, образуя димер (красные зигзаги). Специфические регуляторные факторы транскрипции связываются с мотивами последовательности ДНК на энхансере. Общие факторы транскрипции связываются с промотором. Когда фактор транскрипции активируется сигналом (здесь обозначено как фосфорилирование, показанное маленькой красной звездочкой на факторе транскрипции на энхансере), энхансер активируется и теперь может активировать свой целевой промотор. Активный энхансер транскрибируется на каждой цепи ДНК в противоположных направлениях с помощью связанных РНКП II. Медиатор (комплекс, состоящий примерно из 26 белков во взаимодействующей структуре) передает регуляторные сигналы от энхансера, связанного с ДНК-связанными факторами транскрипции, к промотору.

Экспрессия генов у млекопитающих регулируется многими цис-регуляторными элементами , включая коровые промоторы и проксимальные промоторные элементы , которые расположены вблизи сайтов начала транскрипции генов. Core-промоторов достаточно для управления транскрипцией. инициации, но обычно имеют низкую базальную активность. [ 28 ] Другие важные цис-регуляторные модули локализованы в участках ДНК, удаленных от сайтов начала транскрипции. К ним относятся усилители, глушители , изоляторы и привязывающие элементы. [ 29 ] Среди этого созвездия элементов энхансеры и связанные с ними факторы транскрипции играют ведущую роль в регуляции экспрессии генов. [ 30 ] Энхансер, локализованный в участке ДНК, удаленном от промотора гена, может оказывать очень большое влияние на экспрессию гена, при этом экспрессия некоторых генов увеличивается до 100 раз из-за активированного энхансера. [ 31 ]

Энхансеры — это участки генома, которые являются основными генно-регуляторными элементами. Энхансеры контролируют программы экспрессии генов, специфичные для определенного типа клеток, чаще всего путем прохождения больших расстояний, чтобы оказаться в физической близости с промоторами своих генов-мишеней. [ 32 ] Хотя существуют сотни тысяч участков ДНК-энхансеров, [ 2 ] для определенного типа ткани только определенные энхансеры приближаются к промоторам, которые они регулируют. При исследовании нейронов коры головного мозга было обнаружено 24 937 петель, приводящих энхансеры к целевым промоторам. [ 31 ] Множественные энхансеры, каждый из которых часто находится на десятках или сотнях тысяч нуклеотидов, удаленных от генов-мишеней, соединяются с промоторами гена-мишени и могут координироваться друг с другом, чтобы контролировать экспрессию общего гена-мишени. [ 32 ]

Схематическая иллюстрация в этом разделе показывает, как энхансер движется по кругу, чтобы вступить в тесную физическую близость к промотору целевого гена. Петля стабилизируется димером соединительного белка (например, димером CTCF или YY1 ), причем один член димера прикреплен к своему связывающему мотиву на энхансере, а другой член прикреплен к своему связывающему мотиву на промоторе (представленному красные зигзаги на иллюстрации). [ 33 ] Несколько факторов транскрипции, специфичных для клеточных функций (в клетке человека насчитывается около 1600 факторов транскрипции). [ 34 ] ) обычно связываются с конкретными мотивами энхансера [ 35 ] и небольшая комбинация этих связанных с энхансером факторов транскрипции, когда они приближаются к промотору с помощью петли ДНК, регулируют уровень транскрипции целевого гена. Медиатор (комплекс, обычно состоящий примерно из 26 белков во взаимодействующей структуре) передает регуляторные сигналы от энхансерных ДНК-связанных факторов транскрипции непосредственно ферменту РНК-полимеразы II (pol II), связанному с промотором. [ 36 ]

Энхансеры, когда они активны, обычно транскрибируются с обеих цепей ДНК с помощью РНК-полимераз, действующих в двух разных направлениях, образуя две энхансерные РНК (еРНК), как показано на рисунке. [ 37 ] Подобно мРНК , эти эРНК обычно защищены 5'-кэпом . [ 38 ] Неактивный энхансер может быть связан с неактивным фактором транскрипции. Фосфорилирование транскрипционного фактора может активировать его, и этот активированный транскрипционный фактор может затем активировать энхансер, с которым он связан (см. маленькую красную звездочку, обозначающую фосфорилирование транскрипционного фактора, связанного с энхансером, на иллюстрации). [ 39 ] Активированный энхансер начинает транскрипцию своей РНК до активации транскрипции информационной РНК из своего гена-мишени. [ 40 ]

Теории

[ редактировать ]

По состоянию на 2005 год Существует две разные теории обработки информации, происходящей в энхансерах: [ 41 ]

  • Энхансосомы – основаны на тесном сотрудничестве, скоординированных действиях и могут быть отключены с помощью единичных точечных мутаций , которые перемещают или удаляют сайты связывания отдельных белков.
  • Гибкие рекламные щиты – менее интегративные, несколько белков независимо регулируют экспрессию генов, и их сумма считывается базальным механизмом транскрипции.

Примеры в геноме человека

[ редактировать ]

HACNS1

[ редактировать ]

HACNS1 (также известный как CENTG2 и расположенный в ускоренной области 2 человека ) представляет собой усилитель гена, «который, возможно, способствовал эволюции уникального противостоящего человека большого пальца и, возможно, также модификациям лодыжки или стопы , которые позволяют людям ходить на двух ноги». Имеющиеся на сегодняшний день данные показывают, что из 110 000 последовательностей генов-энхансеров, идентифицированных в геноме человека , HACNS1 претерпел наибольшие изменения в ходе эволюции человека после разделения с предками шимпанзе . [ нужна ссылка ]

ГАДД45G

[ редактировать ]

Был описан энхансер рядом с геном GADD45g, который может регулировать рост мозга у шимпанзе и других млекопитающих, но не у человека. [ 42 ] Регулятор GADD45G у мышей и шимпанзе активен в областях мозга, где расположены клетки, образующие кору, вентральную часть переднего мозга и таламус, и может подавлять дальнейший нейрогенез. Потеря энхансера GADD45G у людей может способствовать увеличению определенных популяций нейронов и расширению переднего мозга у людей. [ нужна ссылка ]

В биологии развития

[ редактировать ]

Развитие, дифференциация и рост клеток и тканей требуют точно регулируемых паттернов экспрессии генов . Энхансеры действуют как цис-регуляторные элементы, обеспечивая как пространственный, так и временной контроль развития, включая транскрипцию в определенных клетках и/или подавляя ее в других клетках. Таким образом, определенная комбинация факторов транскрипции и других ДНК-связывающих белков в развивающейся ткани контролирует, какие гены будут экспрессироваться в этой ткани. Энхансеры позволяют использовать один и тот же ген в различных процессах в пространстве и времени. [ нужна ссылка ] [ 43 ]

Идентификация и характеристика

[ редактировать ]

Традиционно энхансеры идентифицировали с помощью методов ловушки энхансера с использованием репортерного гена или с помощью сравнительного анализа последовательностей и компьютерной геномики. В генетически поддающихся модели, таких как плодовая мушка Drosophila melanogaster , например, репортерная конструкция, такая как lacZ, ген может быть случайным образом интегрирована в геном с использованием P-элемента транспозона . Если репортерный ген интегрируется рядом с энхансером, его экспрессия будет отражать паттерн экспрессии, обусловленный этим энхансером. Таким образом, окрашивание мух на экспрессию или активность LacZ и клонирование последовательности, окружающей сайт интеграции, позволяет идентифицировать последовательность энхансера. [ 44 ]

Однако развитие геномных и эпигеномных технологий резко изменило перспективы открытия цис-регуляторных модулей (CRM). Методы секвенирования следующего поколения (NGS) теперь позволяют проводить высокопроизводительные функциональные анализы обнаружения CRM и значительно увеличивать объемы доступных данных, включая крупномасштабные библиотеки мотивов сайта связывания транскрипционных факторов (TFBS) , коллекции аннотированных, проверенных CRM, и обширные эпигенетические данные по многим типам клеток делают точное вычислительное открытие CRM достижимой целью. Пример подхода, основанного на NGS, под названием DNase-seq, позволил идентифицировать истощенные нуклеосомами или открытые области хроматина, которые могут содержать CRM. такие методы, как ATAC-seq Совсем недавно были разработаны , которые требуют меньше исходного материала. Области, обедненные нуцелосомами, можно идентифицировать in vivo посредством экспрессии Dam-метилазы , что позволяет лучше контролировать идентификацию специфичных для типа клеток энхансеров. [ 45 ] Вычислительные методы включают сравнительную геномику , кластеризацию известных или прогнозируемых сайтов связывания TF, а также контролируемые подходы машинного обучения, обученные на известных CRM. Все эти методы доказали свою эффективность для обнаружения CRM, но каждый из них имеет свои особенности и ограничения, и каждый подвержен большему или меньшему количеству ложноположительных идентификаций. [ 46 ] В сравнительной геномики подходе консервативность последовательностей некодирующих областей может указывать на наличие энхансеров. Последовательности нескольких видов выравниваются, а консервативные области идентифицируются вычислительным путем. [ 47 ] Идентифицированные последовательности затем можно присоединить к репортерному гену, такому как зеленый флуоресцентный белок или lacZ, чтобы определить характер экспрессии гена in vivo, продуцируемый энхансером при инъекции в эмбрион. Экспрессию мРНК репортера можно визуализировать с помощью in situ гибридизации , которая обеспечивает более прямое измерение активности энхансера, поскольку она не подвергается сложностям трансляции и сворачивания белка . Хотя многие данные указывают на консервацию последовательностей критически важных энхансеров развития, др. работы показали, что функция энхансеров может быть консервативной с незначительной консервацией или вообще без консервации первичной последовательности. Например, энхансеры RET у людей имеют очень мало консервативных последовательностей по сравнению с таковыми у рыбок данио , однако последовательности обоих видов производят почти идентичные паттерны экспрессии репортерного гена у рыбок данио. [ 47 ] Аналогичным образом, у насекомых, сильно разошедшихся (разделенных примерно на 350 миллионов лет), было обнаружено, что сходные паттерны экспрессии нескольких ключевых генов регулируются посредством сходно устроенных CRM, хотя эти CRM не демонстрируют какой-либо заметной консервации последовательностей, обнаруживаемой стандартными методами выравнивания последовательностей, такими как ВЗРЫВ . [ 48 ]

В сегментации насекомых

[ редактировать ]

Энхансеры, определяющие раннюю сегментацию у эмбрионов Drosophila melanogaster, являются одними из наиболее изученных энхансеров развития. У ранних эмбрионов мух факторы транскрипции гена разрыва ответственны за активацию и репрессию ряда генов сегментации, таких как гены правила пары . Гены разрыва экспрессируются блоками вдоль передне-задней оси мухи вместе с другими факторами транскрипции материнского эффекта , создавая таким образом зоны, внутри которых экспрессируются различные комбинации факторов транскрипции. Гены парного правила отделены друг от друга неэкспрессирующими клетками. Более того, полосы экспрессии различных генов парного правила смещены друг от друга на несколько диаметров клеток. Таким образом, уникальные комбинации экспрессии генов по парному правилу создают пространственные домены вдоль передне-задней оси для формирования каждого из 14 отдельных сегментов. второй острой полосы гена правила пар Энхансер размером 480 п.н., ответственный за пропуск четности ( eve ), хорошо охарактеризован. Энхансер содержит 12 различных сайтов связывания транскрипционных факторов материнского гена и гена Gap. Активирующие и репрессирующие сайты последовательно перекрываются. Eve экспрессируется только в узкой полосе клеток, которые содержат высокие концентрации активаторов и низкую концентрацию репрессоров для этой энхансерной последовательности. Другие энхансерные области управляют экспрессией eve в 6 других полосах эмбриона. [ 49 ]

В формировании паттерна позвоночных

[ редактировать ]

Установление осей тела является важным шагом в развитии животных. Во время эмбрионального развития мышей Nodal , лиганд суперсемейства трансформирующего фактора роста бета , является ключевым геном, участвующим в формировании паттерна как передне-задней оси, так и оси лево-право раннего эмбриона. Ген Nodal содержит два энхансера: энхансер проксимального эпибласта (PEE) и асимметричный энхансер (ASE). PEE находится выше гена Nodal и управляет экспрессией Nodal в той части примитивной полоски , которая дифференцируется в узел (также называемый примитивным узлом ). [ 50 ] PEE включает экспрессию Nodal в ответ на комбинацию передачи сигналов Wnt плюс второй, неизвестный сигнал; таким образом, член семейства транскрипционных факторов LEF/TCF, вероятно, связывается с сайтом связывания TCF в клетках узла. Диффузия Nodal от узла образует градиент, который затем моделирует простирающуюся передне-заднюю ось эмбриона. [ 51 ] ASE представляет собой интронный энхансер, связанный транскрипционным фактором Fox1 домена вилочной головки . На ранних стадиях развития Fox1-управляемая экспрессия Nodal устанавливает висцеральную энтодерму. Позже в развитии связывание Fox1 с ASE управляет экспрессией Nodal на левой стороне мезодермы латеральной пластинки , тем самым устанавливая лево-правую асимметрию, необходимую для асимметричного развития органов в мезодерме. [ 52 ]

Создание трех зародышевых листков во время гаструляции является еще одним важным шагом в развитии животных. Каждый из трех зародышевых листков имеет уникальные закономерности экспрессии генов, которые способствуют их дифференцировке и развитию. Энтодерма , а Gata4 специфицируется на ранних стадиях развития посредством экспрессии Gata4 позже направляет морфогенез кишечника. Экспрессия Gata4 контролируется у ранних эмбрионов с помощью интронного энхансера, который связывает другой фактор транскрипции домена forkhead, FoxA2. Первоначально энхансер управляет широкой экспрессией генов по всему эмбриону, но экспрессия быстро ограничивается энтодермой, указывая тем самым, что в ее ограничении могут участвовать и другие репрессоры. На поздних стадиях развития тот же энхансер ограничивает экспрессию тканями, которые впоследствии станут желудком и поджелудочной железой. Дополнительный энхансер отвечает за поддержание экспрессии Gata4 в энтодерме на промежуточных стадиях развития кишечника. [ 53 ]

Множественные усилители способствуют устойчивости развития

[ редактировать ]

Некоторые гены, участвующие в важнейших процессах развития, содержат множественные усилители перекрывающихся функций. Вторичные энхансеры, или «теневые энхансеры», могут находиться на расстоянии многих тысяч оснований от первичного энхансера («первичный» обычно относится к первому обнаруженному энхансеру, который часто находится ближе к гену, который он регулирует). Каждый энхансер сам по себе управляет почти идентичными паттернами экспрессии генов. Действительно ли эти два усилителя избыточны? Недавние исследования показали, что множественные усилители позволяют плодовым мушкам выживать при воздействии окружающей среды, например, при повышении температуры. При повышении температуры один энхансер иногда не может обеспечить полную картину экспрессии, тогда как присутствие обоих энхансеров обеспечивает нормальную экспрессию генов. [ 54 ]

Эволюция механизмов развития

[ редактировать ]

Одной из тем исследований в области эволюционной биологии развития («эво-дево») является изучение роли энхансеров и других цис-регуляторных элементов в возникновении морфологических изменений посредством различий в развитии между видами. [ нужна ссылка ]

Колюшка Pitx1

[ редактировать ]

Недавняя работа исследовала роль энхансеров в морфологических изменениях у трехиглой колюшки . Колюшки существуют как в морской, так и в пресноводной среде, но во многих пресноводных популяциях колюшки полностью утратили брюшные плавники (придатки, гомологичные задней конечности четвероногих).
Pitx1 — это гомеобоксный ген, участвующий в развитии задних конечностей у позвоночных. Предварительный генетический анализ показал, что изменения в экспрессии этого гена ответственны за уменьшение размеров таза колюшек. Рыбы, экспрессирующие только пресноводный аллель Pitx1 , не имеют тазовых шипов, тогда как рыбы, экспрессирующие морской аллель, сохраняют тазовые шипы. Более тщательная характеристика показала, что энхансерная последовательность из 500 пар оснований отвечает за включение экспрессии Pitx1 в зачатке заднего плавника. Этот энхансер расположен рядом с хрупким участком хромосомы — последовательностью ДНК, которая, скорее всего, будет повреждена и, следовательно, с большей вероятностью мутирует в результате неточной репарации ДНК . Этот хрупкий участок вызывает повторные, независимые потери энхансера, ответственного за управление экспрессией Pitx1 в тазовых шипах в изолированной пресноводной популяции, и без этого энхансера у пресноводных рыб не могут развиться тазовые шипы. [ 55 ]

дрозофилы Эволюция рисунка крыльев

[ редактировать ]

Паттерны пигментации представляют собой одно из самых ярких и легко определяемых различий между разными видами животных. Пигментация крыла дрозофилы оказалась особенно подходящей системой для изучения развития сложных фенотипов пигментации. На крыле Drosophila guttifera имеется 12 темных пигментных пятен и 4 более светлых серых межжилковых пятна. Пигментные пятна возникают в результате экспрессии гена желтого цвета , продукт которого производит черный меланин . Недавняя работа показала, что два энхансера в гене желтого вызывают экспрессию генов именно по такому образцу: энхансер пятен вен управляет экспрессией репортерного гена в 12 пятнах, а энхансер цвета между жилками управляет экспрессией репортера в 4 отдельных участках. Эти два энхансера чувствительны к сигнальному пути Wnt , который активируется экспрессией wingless во всех пигментированных местах. Таким образом, в ходе эволюции сложного фенотипа пигментации ген желтого пигмента развил энхансеры, реагирующие на бескрылый сигнал и Бескрылое выражение эволюционировало в новых местах, создавая новые модели крыльев. [ 56 ]

При воспалении и раке

[ редактировать ]

Каждая клетка обычно содержит несколько сотен энхансеров особого класса, которые простираются на последовательности ДНК длиной в несколько тысяч оснований, называемых « суперэнхансерами ». [ 57 ] Эти энхансеры содержат большое количество сайтов связывания для специфичных для последовательности индуцируемых факторов транскрипции и регулируют экспрессию генов, участвующих в дифференцировке клеток. [ 58 ] Во время воспаления транскрипционный фактор NF-κB способствует ремоделированию хроматина таким образом, что избирательно перераспределяет кофакторы из энхансеров с высокой занятостью, тем самым подавляя гены, участвующие в поддержании клеточной идентификации, чью экспрессию они усиливают; в то же время это ремоделирование и перераспределение, управляемое F-κB, активирует другие усилители, которые направляют изменения клеточной функции посредством воспаления. [ 59 ] [ 60 ] В результате воспаление перепрограммирует клетки, изменяя их взаимодействие с остальными тканями и иммунной системой. [ 61 ] [ 62 ] При раке белки, которые контролируют активность NF-κB, нарушаются, что позволяет злокачественным клеткам уменьшить свою зависимость от взаимодействия с местной тканью и препятствует надзору за ними со стороны иммунной системы . [ 63 ] [ 64 ]

Разработка усилителей в синтетической биологии

[ редактировать ]

Синтетические регуляторные элементы, такие как энхансеры, обещают стать мощным инструментом для направления генных продуктов к определенным типам клеток с целью лечения заболеваний путем активации полезных генов или остановки аберрантных состояний клеток.

С 2022 года стратегии искусственного интеллекта и трансферного обучения привели к лучшему пониманию особенностей регуляторных последовательностей ДНК, прогнозированию и разработке синтетических энхансеров. [ 65 ] [ 66 ]

Опираясь на работы в области клеточных культур, [ 65 ] синтетические энхансеры были успешно применены ко всем живым организмам в 2023 году. Используя глубокие нейронные сети , ученые смоделировали эволюцию последовательностей ДНК, чтобы проанализировать появление особенностей, лежащих в основе функционирования энхансеров. Это позволило разработать и произвести ряд функциональных синтетических усилителей для различных типов клеток мозга плодовых мух. [ 13 ] Второй подход обучил модели искусственного интеллекта данным о доступности одноклеточной ДНК и перенес изученные модели на прогнозирование энхансеров для выбранных тканей эмбриона плодовой мухи. Эти модели прогнозирования энхансеров использовались для разработки синтетических энхансеров для нервной системы, мозга, мышц, эпидермиса и кишечника. [ 12 ]

См. также

[ редактировать ]

Ссылки

[ редактировать ]
  1. ^ Блэквуд Э.М., Кадонага Дж.Т. (июль 1998 г.). «Идти дальше: современный взгляд на действие усилителя». Наука . 281 (5373): 60–63. Бибкод : 1998Sci...281...60. . дои : 10.1126/science.281.5373.60 . ПМИД   9679020 . S2CID   11666739 .
  2. ^ Перейти обратно: а б с д Пеннаккио Л.А., Бикмор В., Дин А., Нобрега М.А., Беджерано Дж. (апрель 2013 г.). «Усилители: пять основных вопросов» . Обзоры природы. Генетика . 14 (4): 288–295. дои : 10.1038/nrg3458 . ПМЦ   4445073 . ПМИД   23503198 .
  3. ^ Мастон Г.А., Эванс С.К., Грин М.Р. (2006). «Транскрипционные регуляторные элементы в геноме человека» . Ежегодный обзор геномики и генетики человека . 7 : 29–59. дои : 10.1146/annurev.genom.7.080505.115623 . ПМИД   16719718 . S2CID   12346247 .
  4. ^ Кулаева О.И., Низовцева Е.В., Поликанов Ю.С., Ульянов С.В., Студицкий В.М. (декабрь 2012 г.). «Дистанционная активация транскрипции: механизмы действия энхансера» . Молекулярная и клеточная биология . 32 (24): 4892–4897. дои : 10.1128/MCB.01127-12 . ПМЦ   3510544 . ПМИД   23045397 .
  5. ^ Беррен О.С., Рубио Гарсиа А., Хавьер Б.М., Рэйнбоу Д.Б., Кэрнс Дж., Купер Н.Дж. и др. (4 сентября 2017 г.). «Хромосомные контакты в активированных Т-клетках идентифицируют гены-кандидаты аутоиммунных заболеваний» . Геномная биология . 18 (1): 165. дои : 10.1186/s13059-017-1285-0 . ISSN   1474-760X . ПМК   5584004 . ПМИД   28870212 .
  6. ^ Меркола М., Ван XF, Олсен Дж., Калам К. (август 1983 г.). «Элементы-энхансеры транскрипции в локусе тяжелой цепи иммуноглобулина мыши». Наука . 221 (4611): 663–665. Бибкод : 1983Sci...221..663M . дои : 10.1126/science.6306772 . ПМИД   6306772 .
  7. ^ Банерджи Дж., Олсон Л., Шаффнер В. (июль 1983 г.). «Лимфоцит-специфичный клеточный энхансер расположен ниже соединительной области в генах тяжелой цепи иммуноглобулина». Клетка . 33 (3): 729–740. дои : 10.1016/0092-8674(83)90015-6 . ПМИД   6409418 . S2CID   23981549 .
  8. ^ Перейти обратно: а б Гиллис С.Д., Моррисон С.Л., Ои В.Т., Тонегава С. (июль 1983 г.). «Тканеспецифичный элемент-усилитель транскрипции расположен в главном интроне реаранжированного гена тяжелой цепи иммуноглобулина». Клетка . 33 (3): 717–728. дои : 10.1016/0092-8674(83)90014-4 . ПМИД   6409417 . S2CID   40313833 .
  9. ^ Гауптман Дж., Райхерт М.К., Абдал Рида М.А., Эванс Т.А. (декабрь 2022 г.). «Характеристика фрагментов энхансера у Drosophila robo2 » . Летать . 16 (1): 312–346. bioRxiv   10.1101/2022.08.01.502399 . дои : 10.1080/19336934.2022.2126259 . ПМЦ   9559326 . ПМИД   36217698 .
  10. ^ Жигулев А., Норберг З., Кордье Дж., Спалинскас Р., Бассерех Х., Бьёрн Н. и др. (март 2024 г.). «Мутации-энхансеры модулируют тяжесть миелосупрессии, вызванной химиотерапией» . Альянс наук о жизни . 7 (3): e202302244. дои : 10.26508/lsa.202302244 . ПМЦ   10796589 . ПМИД   38228368 .
  11. ^ де Алмейда Б.П., Райтер Ф., Пагани М., Старк А. (май 2022 г.). «DeepSTARR предсказывает активность энхансера по последовательности ДНК и позволяет создавать синтетические энхансеры de novo». Природная генетика . 54 (5): 613–624. дои : 10.1038/s41588-022-01048-5 . ПМИД   35551305 .
  12. ^ Перейти обратно: а б де Алмейда Б.П., Шауб С., Пагани М., Секкиа С., Ферлонг Э.Э., Старк А. (февраль 2024 г.). «Целевой дизайн синтетических усилителей для избранных тканей эмбриона дрозофилы» . Природа . 626 (7997): 207–211. Бибкод : 2024Natur.626..207D . дои : 10.1038/s41586-023-06905-9 . ПМЦ   10830412 . ПМИД   38086418 .
  13. ^ Перейти обратно: а б Таскиран II, Спаньер К.И., Дикманкен Х., Кемпинк Н., Панчикова А., Экши ЕС и др. (февраль 2024 г.). «Дизайн синтетических усилителей, ориентированный на клеточный тип» . Природа . 626 (7997): 212–220. Бибкод : 2024Natur.626..212T . дои : 10.1038/s41586-023-06936-2 . ПМК   10830415 . ПМИД   38086419 .
  14. ^ Мастон Г.А., Эванс С.К., Грин М.Р. (1 января 2006 г.). «Транскрипционные регуляторные элементы в геноме человека» . Ежегодный обзор геномики и генетики человека . 7 (1): 29–59. дои : 10.1146/annurev.genom.7.080505.115623 . ПМИД   16719718 . S2CID   12346247 .
  15. ^ Смемо С., Тена Дж.Дж., Ким К.Х., Гамазон Э.Р., Сакабе Н.Дж., Гомес-Марин С. и др. (март 2014 г.). «Связанные с ожирением варианты внутри FTO образуют долгосрочные функциональные связи с IRX3» . Природа . 507 (7492): 371–375. Бибкод : 2014Natur.507..371S . дои : 10.1038/nature13138 . ПМЦ   4113484 . ПМИД   24646999 .
  16. ^ Меркола М., Говерман Дж., Мирелл С., Калам К. (январь 1985 г.). «Усилитель тяжелой цепи иммуноглобулина требует одного или нескольких тканеспецифичных факторов». Наука . 227 (4684): 266–270. Бибкод : 1985Sci...227..266M . дои : 10.1126/science.3917575 . ПМИД   3917575 .
  17. ^ Шолер Х., Хаслингер А., Хеги А., Холтгрив Х., Карин М. (апрель 1986 г.). «Конкуренция in vivo между регуляторным элементом металлотионеина и усилителем SV40». Наука . 232 (4746): 76–80. Бибкод : 1986Sci...232...76S . дои : 10.1126/science.3006253 . ПМИД   3006253 .
  18. ^ Курас Л., Борггрефе Т., Корнберг Р.Д. (ноябрь 2003 г.). «Ассоциация Медиаторного комплекса с энхансерами активных генов» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 100 (24): 13887–13891. Бибкод : 2003PNAS..10013887K . дои : 10.1073/pnas.2036346100 . ПМК   283516 . ПМИД   14623974 .
  19. ^ Рамасами С., Альджахани А., Карпинска М.А., Као Т.Б., Величко Т., Круз Дж.Н. и др. (июль 2023 г.). «Медиаторный комплекс регулирует взаимодействие энхансер-промотор» . Структурная и молекулярная биология природы . 30 (7): 991–1000. дои : 10.1038/s41594-023-01027-2 . ПМЦ   10352134 . ПМИД   37430065 .
  20. ^ Донг X, Навратилова П., Фредман Д., Драйнес О., Беккер Т.С., Ленхард Б. (март 2010 г.). «Экзонные остатки дупликации всего генома обнаруживают цис-регуляторную функцию кодирующих экзонов» . Исследования нуклеиновых кислот . 38 (4): 1071–1085. дои : 10.1093/нар/gkp1124 . ПМЦ   2831330 . ПМИД   19969543 .
  21. ^ Бирнбаум Р.Ю., Клоуни Э.Дж., Агами О., Ким М.Дж., Чжао Дж., Яманака Т. и др. (июнь 2012 г.). «Кодирующие экзоны действуют как тканеспецифичные усилители близлежащих генов» . Геномные исследования . 22 (6): 1059–1068. дои : 10.1101/гр.133546.111 . ПМК   3371700 . ПМИД   22442009 .
  22. ^ Член парламента Эйхенлауба, Л. Эттуиллер (ноябрь 2011 г.). «Генезис de novo энхансеров у позвоночных» . ПЛОС Биология . 9 (11): e1001188. дои : 10.1371/journal.pbio.1001188 . ПМК   3206014 . ПМИД   22069375 .
  23. ^ Спилианакис К.Г., Лалиоти, доктор медицинских наук, Таун Т., Ли Г.Р., Флавелл Р.А. (июнь 2005 г.). «Межхромосомные ассоциации между альтернативно экспрессируемыми локусами». Природа . 435 (7042): 637–645. Бибкод : 2005Natur.435..637S . дои : 10.1038/nature03574 . ПМИД   15880101 . S2CID   1755326 .
  24. ^ Ван З., Занг С., Цуй К., Шонес Д.Э., Барски А., Пэн В. и др. (сентябрь 2009 г.). «Полногеномное картирование HAT и HDAC выявляет различные функции активных и неактивных генов» . Клетка . 138 (5): 1019–1031. дои : 10.1016/j.cell.2009.06.049 . ПМЦ   2750862 . ПМИД   19698979 .
  25. ^ Хайнцман Н.Д., Хон Г.К., Хокинс Р.Д., Херадпур П., Старк А., Харп Л.Ф. и др. (май 2009 г.). «Модификации гистонов в энхансерах человека отражают глобальную экспрессию генов, специфичных для конкретного типа клеток» . Природа . 459 (7243): 108–112. Бибкод : 2009Natur.459..108H . дои : 10.1038/nature07829 . ПМК   2910248 . ПМИД   19295514 .
  26. ^ Висел А., Блоу М.Дж., Ли З., Чжан Т., Акияма Дж.А., Холт А. и др. (февраль 2009 г.). «ChIP-seq точно предсказывает тканеспецифическую активность энхансеров» . Природа . 457 (7231): 854–858. Бибкод : 2009Natur.457..854V . дои : 10.1038/nature07730 . ПМЦ   2745234 . ПМИД   19212405 .
  27. ^ Блоу MJ, Маккалли DJ, Ли Зи, Чжан Т, Акияма Дж.А., Холт А. и др. (сентябрь 2010 г.). «ChIP-Seq идентификация слабоконсервативных усилителей сердца» . Природная генетика . 42 (9): 806–810. дои : 10.1038/ng.650 . ПМК   3138496 . ПМИД   20729851 .
  28. ^ Хаберле В., Старк А. (октябрь 2018 г.). «Коровые промоторы эукариот и функциональная основа инициации транскрипции» . Обзоры природы. Молекулярно-клеточная биология . 19 (10): 621–637. дои : 10.1038/s41580-018-0028-8 . ПМК   6205604 . ПМИД   29946135 .
  29. ^ Верхёль Т.С., ван Хейфте Л., Перенталер Э., Баракат Т.С. (2020). «Почему YY1: механизмы регуляции транскрипции Инь Ян 1» . Границы клеточной биологии и биологии развития . 8 : 592164. дои : 10.3389/fcell.2020.592164 . ПМЦ   7554316 . ПМИД   33102493 .
  30. ^ Шпиц Ф, Ферлонг Э.Э. (сентябрь 2012 г.). «Факторы транскрипции: от связывания энхансера к контролю развития». Обзоры природы. Генетика . 13 (9): 613–626. дои : 10.1038/nrg3207 . ПМИД   22868264 . S2CID   205485256 .
  31. ^ Перейти обратно: а б Биган Дж.А., Пастузин Э.Д., Фернандес Л.Р., Го М.Х., Фэн К., Титус КР и др. (июнь 2020 г.). «Трехмерная реструктуризация генома во временных рамках экспрессии генов нейронов, индуцированной активностью» . Природная неврология . 23 (6): 707–717. дои : 10.1038/s41593-020-0634-6 . ПМЦ   7558717 . ПМИД   32451484 .
  32. ^ Перейти обратно: а б Шенфельдер С., Фрейзер П. (август 2019 г.). «Дальние контакты энхансер-промотор в контроле экспрессии генов». Обзоры природы. Генетика . 20 (8): 437–455. дои : 10.1038/s41576-019-0128-0 . ПМИД   31086298 . S2CID   152283312 .
  33. ^ Вайнтрауб А.С., Ли CH, Замудио А.В., Сигова А.А., Ханнетт Н.М., Дэй Д.С. и др. (декабрь 2017 г.). «YY1 является структурным регулятором петель энхансер-промотор» . Клетка . 171 (7): 1573–1588.e28. дои : 10.1016/j.cell.2017.11.008 . ПМЦ   5785279 . ПМИД   29224777 .
  34. ^ Ламберт С.А., Джолма А., Кампителли Л.Ф., Дас П.К., Инь Ю., Альбу М. и др. (февраль 2018 г.). «Факторы транскрипции человека» . Клетка . 172 (4): 650–665. дои : 10.1016/j.cell.2018.01.029 . ПМИД   29425488 .
  35. ^ Гроссман С.Р., Энгрейтц Дж., Рэй Дж.П., Нгуен Т.Х., Хакоэн Н., Ландер Э.С. (июль 2018 г.). «Позиционная специфичность различных классов транскрипционных факторов в энхансерах» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 115 (30): Е7222–Е7230. Бибкод : 2018PNAS..115E7222G . дои : 10.1073/pnas.1804663115 . ПМК   6065035 . ПМИД   29987030 .
  36. ^ Аллен Б.Л., Taatjes DJ (март 2015 г.). «Медиаторный комплекс: центральный интегратор транскрипции» . Обзоры природы. Молекулярно-клеточная биология . 16 (3): 155–166. дои : 10.1038/nrm3951 . ПМЦ   4963239 . ПМИД   25693131 .
  37. ^ Михайличенко О., Бондаренко В., Харнетт Д., Шор И.Е., Малес М., Виалес Р.Р. и др. (январь 2018 г.). «Степень активности энхансера или промотора отражается уровнями и направленностью транскрипции эРНК» . Гены и развитие . 32 (1): 42–57. дои : 10.1101/gad.308619.117 . ПМЦ   5828394 . ПМИД   29378788 .
  38. ^ Яо Л., Лян Дж., Озер А., Люн А.К., Лис Дж.Т., Ю Х. (июль 2022 г.). «Сравнение экспериментальных анализов и аналитических методов полногеномной идентификации активных энхансеров» . Природная биотехнология . 40 (7): 1056–1065. дои : 10.1038/s41587-022-01211-7 . ПМЦ   9288987 . ПМИД   35177836 .
  39. ^ Ли QJ, Ян Ш., Маэда Ю., Сладек Ф.М., Шаррокс А.Д., Мартинс-Грин М. (январь 2003 г.). «Зависимая от фосфорилирования MAP-киназы активация Elk-1 приводит к активации коактиватора p300» . Журнал ЭМБО . 22 (2): 281–291. дои : 10.1093/emboj/cdg028 . ПМК   140103 . ПМИД   12514134 .
  40. ^ Карулло Н.В., Филлипс III Р.А., Саймон Р.К., Сото С.А., Хиндс Дж.Э., Солсбери А.Дж. и др. (сентябрь 2020 г.). «Энхансерные РНК предсказывают регуляторные связи энхансер-ген и имеют решающее значение для функции энхансера в нейрональных системах» . Исследования нуклеиновых кислот . 48 (17): 9550–9570. дои : 10.1093/nar/gkaa671 . ПМЦ   7515708 . ПМИД   32810208 .
  41. ^ Арности Д.Н., Кулкарни М.М. (апрель 2005 г.). «Усилители транскрипции: интеллектуальные энхансосомы или гибкие рекламные щиты?» (PDF) . Журнал клеточной биохимии . 94 (5): 890–898. дои : 10.1002/jcb.20352 . ПМИД   15696541 . S2CID   32405464 . Архивировано из оригинала (PDF) 21 июля 2006 года . Проверено 8 августа 2019 г.
  42. ^ Маклин С.И., Рено П.Л., Поллен А.А., Бассан А.И., Капеллини Т.Д., Гюнтер С. и др. (март 2011 г.). «Специфическая для человека потеря регуляторной ДНК и эволюция специфичных для человека черт» . Природа . 471 (7337): 216–219. Бибкод : 2011Natur.471..216M . дои : 10.1038/nature09774 . ПМК   3071156 . ПМИД   21390129 .
  43. ^ Барретт Л.В., Флетчер С., Уилтон С.Д. (ноябрь 2012 г.). «Регуляция экспрессии генов эукариот с помощью нетранслируемых областей генов и других некодирующих элементов» . Клеточные и молекулярные науки о жизни . 69 (21): 3613–3634. дои : 10.1007/s00018-012-0990-9 . ПМЦ   3474909 . ПМИД   22538991 .
  44. ^ Хартенштейн В., Ян Ю.Н. (июнь 1992 г.). «Изучение эмбриогенеза дрозофилы с помощью линий-ловушек с энхансером P-lacZ». Архив биологии развития Ру . 201 (4): 194–220. дои : 10.1007/BF00188752 . ПМИД   28305845 . S2CID   25759655 .
  45. ^ Оги Дж.Н., Эстасио Гомес А., Томсон Дж., Инь Х., Саутхолл Т.Д. (февраль 2018 г.). «CATaDa обнаруживает глобальное ремоделирование доступности хроматина во время дифференцировки стволовых клеток in vivo» . электронная жизнь . 7 . doi : 10.7554/eLife.32341 . ПМК   5826290 . ПМИД   29481322 .
  46. ^ Сурьямохан К., Халфон М.С. (2014). «Идентификация транскрипционных цис-регуляторных модулей в геномах животных» . Междисциплинарные обзоры Wiley. Биология развития . 4 (2): 59–84. дои : 10.1002/wdev.168 . ПМЦ   4339228 . ПМИД   25704908 .
  47. ^ Перейти обратно: а б Висел А., Бристоу Дж., Пеннаккио Л.А. (февраль 2007 г.). «Идентификация энхансеров посредством сравнительной геномики» . Семинары по клеточной биологии и биологии развития . 18 (1): 140–152. дои : 10.1016/j.semcdb.2006.12.014 . ПМЦ   1855162 . ПМИД   17276707 .
  48. ^ «Доказательства глубокого регуляторного сходства в программах раннего развития сильно различающихся насекомых» . Геномная биология и эволюция. Архивировано из оригинала 10 июля 2015 года.
  49. ^ Борок М.Дж., Тран Д.А., Хо MC, Древэлл Р.А. (январь 2010 г.). «Анализ регуляторных переключателей развития: уроки эволюции энхансеров у дрозофилы» . Разработка . 137 (1): 5–13. дои : 10.1242/dev.036160 . ПМК   2796927 . ПМИД   20023155 .
  50. ^ Норрис Д.П., Робертсон Э.Дж. (июнь 1999 г.). «Асимметричные и специфичные для узлов паттерны экспрессии узлов контролируются двумя различными цис-действующими регуляторными элементами» . Гены и развитие . 13 (12): 1575–1588. дои : 10.1101/gad.13.12.1575 . ПМК   316799 . ПМИД   10385626 .
  51. ^ Гранье С., Гурченков В., Переа-Гомез А., Камю А., Отт С., Папанайоту С. и др. (январь 2011 г.). «Узловые цис-регуляторные элементы выявляют гетерогенность эпибласта и примитивной энтодермы в периимплантационном эмбрионе мыши» . Биология развития . 349 (2): 350–362. дои : 10.1016/j.ydbio.2010.10.036 . ПМИД   21047506 .
  52. ^ Норрис Д.П., Бреннан Дж., Бикофф Е.К., Робертсон Э.Дж. (июль 2002 г.). «Foxh1-зависимый энхансер ауторегуляции контролирует уровень сигналов Nodal в эмбрионе мыши». Разработка . 129 (14): 3455–3468. дои : 10.1242/dev.129.14.3455 . ПМИД   12091315 . S2CID   24426844 .
  53. ^ Рохас А., Шахтерле В., Сюй С.М., Мартин Ф., Блэк Б.Л. (октябрь 2010 г.). «Прямая регуляция транскрипции Gata4 во время ранней спецификации эндодермы контролируется связыванием FoxA2 с интронным энхансером» . Биология развития . 346 (2): 346–355. дои : 10.1016/j.ydbio.2010.07.032 . ПМЦ   2945415 . ПМИД   20692247 .
  54. ^ Перри М.В., Беттигер А.Н., Ботма Дж.П., Левин М. (сентябрь 2010 г.). «Теневые усилители способствуют устойчивости гаструляции дрозофилы» . Современная биология . 20 (17): 1562–1567. Бибкод : 2010CBio...20.1562P . дои : 10.1016/j.cub.2010.07.043 . ПМЦ   4257487 . ПМИД   20797865 .
  55. ^ Чан Ю.Ф., Маркс М.Э., Джонс ФК, Вильярреал Дж., Шапиро М.Д., Брэйди С.Д. и др. (январь 2010 г.). «Адаптивная эволюция уменьшения таза у колюшек за счет повторяющейся делеции энхансера Pitx1» . Наука . 327 (5963): 302–305. Бибкод : 2010Sci...327..302C . дои : 10.1126/science.1182213 . ПМК   3109066 . ПМИД   20007865 .
  56. ^ Вернер Т., Косикава С., Уильямс Т.М., Кэрролл С.Б. (апрель 2010 г.). «Создание нового рисунка цвета крыльев с помощью Wingless морфогена». Природа . 464 (7292): 1143–1148. Бибкод : 2010Natur.464.1143W . дои : 10.1038/nature08896 . ПМИД   20376004 . S2CID   4407744 .
  57. ^ Уайт В.А., Орландо Д.А., Хниш Д., Абрахам Б.Дж., Лин С.И., Кейги М.Х. и др. (апрель 2013 г.). «Главные факторы транскрипции и медиатор создают суперэнхансеры ключевых генов идентичности клеток» . Клетка . 153 (2): 307–319. дои : 10.1016/j.cell.2013.03.035 . ПМЦ   3653129 . ПМИД   23582322 .
  58. ^ Паркер С.К., Ститцель М.Л., Тейлор Д.Л., Ороско Дж.М., Эрдос М.Р., Акияма Дж.А. и др. (октябрь 2013 г.). «Состояния, усиливающие растяжение хроматина, управляют клеточно-специфической регуляцией генов и содержат варианты риска заболеваний человека» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 110 (44): 17921–17926. Бибкод : 2013PNAS..11017921P . дои : 10.1073/pnas.1317023110 . ПМЦ   3816444 . ПМИД   24127591 .
  59. ^ Браун Дж.Д., Лин С.И., Дуан К., Гриффин Дж., Федерация А, Паранал Р.М. и др. (октябрь 2014 г.). «NF-κB управляет динамическим образованием суперэнхансера при воспалении и атерогенезе» . Молекулярная клетка . 56 (2): 219–231. doi : 10.1016/j.molcel.2014.08.024 . ПМЦ   4224636 . ПМИД   25263595 .
  60. ^ Шмидт С.Ф., Ларсен Б.Д., Лофт А., Нильсен Р., Мэдсен Дж.Г., Мандруп С. (сентябрь 2015 г.). «Острая репрессия генов клеточной идентичности, индуцированная TNF, опосредуется NFκB-направленным перераспределением кофакторов из суперэнхансеров» . Геномные исследования . 25 (9): 1281–1294. дои : 10.1101/гр.188300.114 . ПМЦ   4561488 . ПМИД   26113076 .
  61. ^ Чаттерджи Б., Банот Б., Мукерджи Т., Тайе Н., Виджаярагаван Б., Чаттопадхьяй С. и др. (декабрь 2016 г.). «Поздняя фаза синтеза IκBα изолирует TLR4-активируемый канонический путь NF-κB от неканонической передачи сигналов NF-κB в макрофагах» . Научная сигнализация . 9 (457): ра120. дои : 10.1126/scisignal.aaf1129 . ПМК   5260935 . ПМИД   27923915 .
  62. ^ Вахеди Г., Канно Ю., Фурумото Ю., Цзян К., Паркер С.С., Эрдос М.Р. и др. (апрель 2015 г.). «Суперэнхансеры определяют связанные с заболеванием регуляторные узлы в Т-клетках» . Природа . 520 (7548): 558–562. Бибкод : 2015Natur.520..558V . дои : 10.1038/nature14154 . ПМК   4409450 . ПМИД   25686607 .
  63. ^ Влахопулос С.А., Сен О, Хенген Н., Аган Дж., Мошови М., Крицелис Е. и др. (август 2015 г.). «Динамический аберрантный NF-κB стимулирует онкогенез: новая модель, охватывающая микроокружение» . Обзоры цитокинов и факторов роста . 26 (4): 389–403. doi : 10.1016/j.cytogfr.2015.06.001 . ПМЦ   4526340 . ПМИД   26119834 .
  64. ^ Цзоу З, Хуан Б, Ву Х, Чжан Х, Ци Дж, Брэднер Дж и др. (май 2014 г.). «Brd4 поддерживает конститутивно активный NF-κB в раковых клетках путем связывания с ацетилированным RelA» . Онкоген . 33 (18): 2395–2404. дои : 10.1038/onc.2013.179 . ПМЦ   3913736 . ПМИД   23686307 .
  65. ^ Перейти обратно: а б де Алмейда Б.П., Райтер Ф., Пагани М., Старк А. (май 2022 г.). «DeepSTARR предсказывает активность энхансера по последовательности ДНК и позволяет создавать синтетические энхансеры de novo». Природная генетика . 54 (5): 613–624. дои : 10.1038/s41588-022-01048-5 . ПМИД   35551305 .
  66. ^ Авсек Ж., Вейлерт М., Шрикумар А., Крюгер С., Александари А., Далал К. и др. (март 2021 г.). «Модели связывания факторов транскрипции с базовым разрешением выявляют синтаксис мягких мотивов» . Природная генетика . 53 (3): 354–366. дои : 10.1038/s41588-021-00782-6 . ПМЦ   8812996 . ПМИД   33603233 .
[ редактировать ]
Retrieved from "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Enhancer_(genetics)&oldid=1238698946"
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: 0ae63629948287810b85f2c83000ac93__1722830640
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/0a/93/0ae63629948287810b85f2c83000ac93.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
Enhancer (genetics) - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)