Хлорофлексота
| Хлорофлексота | |
|---|---|
Научная классификация 
| |
| Домен: | Бактерии |
| Клэйд : | Террабактерии |
| Тип: | Хлорофлексота Гаррити и Холт 2021 [1] |
| Классы | |
| Синонимы | |
| |
Chloroflexota , — это тип бактерий аэробными содержащий изоляты с разнообразными фенотипами, включая представителей, которые являются термофилами , которые используют кислород и хорошо растут при высоких температурах; аноксигенные фототрофы , использующие свет для фотосинтеза ( зеленые несерные бактерии ); и анаэробные галореспиреры , которые используют галогенированные органические вещества (такие как токсичные хлорированные этины и полихлорированные дифенилы ) в качестве акцепторов электронов.
Представители филума Chloroflexota являются монодермами (то есть имеют одну клеточную мембрану без внешней оболочки), но окрашиваются преимущественно грамотрицательно. [2] Многие хорошо изученные типы бактерий представляют собой дидермы и окрашивают грамотрицательные бактерии , тогда как хорошо известные монодермы, окрашивающие грамположительные бактерии, включают Firmicutes (или Bacillota ) ( с низким содержанием G+C грамположительные микроорганизмы ), Actinomycetota (грамположительные бактерии с высоким содержанием G+C). положительные) и Deinococta (грамположительные дидермы с толстым слоем пептидогликана).
История
[ редактировать ]Название таксона было создано в издании 2001 года Тома 1 « Руководства Берджи по систематической бактериологии» и представляет собой латинское множественное число от названия Chloroflexus , названия типового рода этого типа, общепринятой практики . [3]
В 1987 году Карл Вёзе , считающийся одним из предшественников революции в молекулярной филогении, разделил эубактерии на 11 подразделений на основе последовательностей 16S рибосомальной РНК (SSU) и сгруппировал роды Chloroflexus , Herpetosiphon и Thermomicrobium в «зеленые несерные бактерии и родственники", [4] [5] который был временно переименован в «Хлорофлекси» в первом томе «Руководства по систематической бактериологии» Берджи. [6]
Хлорофлексота, являющаяся глубоко разветвленным типом (см. Типы бактерий ), в первом томе Руководства по систематической бактериологии Берги считала, что она включает один класс с тем же названием. [6] Однако с 2001 года благодаря вновь открытым видам были созданы новые классы, и теперь тип Chloroflexi разделен на несколько классов.
« Dehalococcoidetes » — это имя-заполнитель, данное Hugenholtz & Stackebrandt, 2004 г., [7] после Dehalococcoides ethenogenes , вида, частично описанного в 1997 году. [8] Первым полностью описанным видом был Dehalogenimonas lykanthroporepellens Moe et al. 2009, [9] но в описании этого вида класс не был официально оформлен, а также не были указаны семейства или отряды, поскольку эти два вида имеют только 90% идентичности 16S рибосомальной РНК , а это означает, что они могут относиться к разным семействам или даже отрядам. [9]
Недавний филогенетический анализ Chloroflexota обнаружил очень слабую поддержку группировки различных классов, которые в настоящее время являются частью этого типа. [10] Шесть классов, составляющих тип, не образуют последовательно хорошо поддерживаемую кладу в филогенетических деревьях, основанных на конкатенированных последовательностях для больших наборов данных белков, и не было идентифицировано никаких консервативных сигнатурных инделей , которые были бы уникально общими для всего типа. [10] Однако было обнаружено, что классы Chloroflexi и Thermomicrobia последовательно группируются вместе как обычными филогенетическими методами, так и с помощью идентификации общих консервативных сигнатурных инделей в 50S рибосомальном белке L19 и ферменте UDP-глюкозо-4-эпимеразе. [10] Было высказано предположение, что тип Chloroflexi sensu stricto должен включать только классы Chloroflexi и Thermomicrobia, а остальные четыре класса («Dehalococcoidetes», Anaerolineae, Caldilineae и Ktedonobacteria) могут представлять собой один или несколько независимых типов, разветвляющихся по соседству с Chloroflexi. [10]
Филогения
[ редактировать ]Принятая в настоящее время таксономия основана на Списке названий прокариот, имеющих номенклатуру (LPSN). [11] и Национальный центр биотехнологической информации (NCBI). [12]
| на основе 16S рРНК ДП _08_2023 [13] [14] [15] | 120 маркерных белков на основе GTDB 08-RS214 (28 апреля 2023 г.). [16] [17] [18] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|
Таксономия
[ редактировать ]Род Candidatus Caldibacter корриг . Шпик и др. 2020 год
Род Candidatus Chlorotrichoides правильный . Орен и др. 2020 [" Candidatus Chlorothrix " Клаппенбах и Пирсон 2004 г., не Дьяр 1921 г., не Бергер-Перро 1982 г. [22] ]
Род « Candidatus Nitrocaldera » Spieck et al. 2020 год
Род « Candidatus Nitrotheca » Spieck et al. 2020 год
Род « Candida Poriflexus » Kogawa et al. 2022 год
Класс « Limnocylindria » Mehrshad et al. 2018 год
- Отряд « Limnocylindrales » Mehrshad et al. 2018 год
- Семейство « Limnocylindraaceae » Mehrshad et al. 2018 (СЛ56)
- Род Candidus Aquidulcis корриг . Родригес-Р и др. 2020 год
- Род « Candidatus Limnocylindrus » Mehrshad et al. 2018 год
- Семейство « Limnocylindraaceae » Mehrshad et al. 2018 (СЛ56)
Класс Ktedonobacteria Cavaletti et al. Покупка 2007 года. Ябе и др. 2010 год
- Отряд Thermogemmatisporales Yabe et al. 2011 год
- Семейство Thermogemmatisporaceae Yabe et al. 2011 год
- Род Thermogemmatispora Yabe et al. 2011 год [23]
- Семейство Thermogemmatisporaceae Yabe et al. 2011 год
- Отряд Ktedonobacterales Cavaletti et al. 2007 год
- Семейство Dictyobacteraceae Wang et al. 2019 год
- Род Dictyobacter Yabe et al. 2017 год
- Род Tengunoibacter Wang et al. 2019 год
- Семейство Ktedonobacteriaceae Cavaletti et al. 2007 год
- Род Ktedonobacter corrig. Кавалетти и др. 2007 год
- Род Ktedonospora Yabe et al. 2021 год
- Семейство Ktedonosporobacteraceae Yan et al. 2020 год
- Род Ktedonosporobacter Yan et al. 2020 год
- Семейство Reticulibacteraceae Yabe et al. 2021 год
- Род Reticulibacter Yabe et al. 2021 год
- Семейство Thermosporotrichaceae Yabe et al. 2010 год
- Род Thermosporothrix Yabe et al. 2010 год [24]
- Семейство Dictyobacteraceae Wang et al. 2019 год
Класс « Умбрициклопия » Mehrshad et al. 2018 год
- Отряд « Umbricyclpales » Mehrshad et al. 2018 год
- Семейство « Umbricyclopaceae » Mehrshad et al. 2018 год
- Род « Candidatus Umbricyclops » Mehrshad et al. 2018 (ТК10)
- Семейство « Umbricyclopaceae » Mehrshad et al. 2018 год
Класс « Bathosphaeria » Mehrshad et al. 2018 год
- Орден « Bathosphaerales » Mehrshad et al. 2018 год
- Семейство « Bathosphaeraceae » Mehrshad et al. 2018 год
- Род Candidatus Bathosphaera Mehrshad et al. 2018 (ДЖГ30-КФ-СМ66)
- Семейство « Bathosphaeraceae » Mehrshad et al. 2018 год
Класс Tepidiformia Кочеткова и др. 2020 год
- Отряд Tepidiformales Кочеткова и др. 2020 год
- Family Tepidiformaceae Kochetkova et al. 2020
- Род « Тепидиформа Кочеткова и др. 2020».
- Family Tepidiformaceae Kochetkova et al. 2020
Класс Dehalococcoidia Löffler et al. 2013 год
- Отряд Dehalococcoidales Löffler et al. 2013 год
- Семейство Dehalococcoidaceae Löffler et al. 2013 год
- Род Dehalococcoides Löffler et al. 2013 год
- Род Dehalogenimonas Moe et al. 2009 год
- Семейство Dehalococcoidaceae Löffler et al. 2013 год
Класс « Термофонтия » испр. Уорд и др. 2018 год
- Отряд « Фототрофические » Чжэн и др. 2022 год
- Семейство « Фототрофные » Zheng et al. 2022 год
- Род « Phototropicus » Zheng et al. 2022 год
- Семейство « Фототрофные » Zheng et al. 2022 год
Класс Ardenticatenia Kawaichi et al. 2013 год
- Отряд Ardenticatenales Kawaichi et al. 2013 год
- Семейство Ardenticatenaceae Kawaichi et al. 2013 год
- Род Ardenticatena Kawaichi et al. 2013 год
- Семейство Ardenticatenaceae Kawaichi et al. 2013 год
Класс " Caldilineia " Орен, Парте и Гаррити 2016 г. от Cavalier-Smith 2020 г.
- Отряд Caldilineales Yamada et al. 2006 г.
- Род Candidatus Defluviiphilum Nierychlo et al . 2019 год
- Семейство « Amarolineaceae » Andersen et al. 2019 год
- Род « Кандидат Amarolinea » Andersen et al. 2019 год
- Семейство Caldilineaceae Yamada et al. 2006 г.
- Род Caldilinea Sekiguchi et al. 2003 г.
- Род Litorilinea Kale et al. 2013 год
Класс Thermoflexia Dodsworth et al. 2014 год
- Заказ Thermoflexales Dodsworth et al. 2014 год
- Семейство Thermoflexaceae Dodsworth et al. 2014 год
- Род « Candida Roseilinea » Thiel et al. 2016 год
- Род Thermoflexus Dodsworth et al. 2014 год
- Семейство Thermoflexaceae Dodsworth et al. 2014 год
Класс " Анаэролиния " Орен, Парте и Гаррити 2016г.
- Семейство « Profundisolitariaceae » Mehrshad et al. 2018 год
- Род Candidatus Profundisolitarius Mehrshad et al. 2018 (CL500-11)
- Орден « Проминифилалес ».
- Семейство Проминифиловые .
- Род Candidatus Promineifilum исправлен . Макилрой и др. 2016 год
- Семейство Проминифиловые .
- Порядок Aggregatilineales Nakahara et al. 2019 год
- Семейство Aggregatilineaceae Nakahara et al. 2019 год
- Род Aggregatilinea Nakahara et al. 2019 год
- Семейство Aggregatilineaceae Nakahara et al. 2019 год
- Отряд Anaerolineales Yamada et al. 2006 г.
- Семейство Anaerolineaceae Yamada et al. 2006 г.
- Род Anaerolinea Sekiguchi et al. Покупка 2003 года. Ямада и др. 2006 г.
- Род Bellilinea Yamada et al. 2007 год [21]
- Род « Brevefilum » McIlroy et al. 2017 год
- Род « Кандидат Denitrolinea » Okubo et al. 2021 год
- Род « Desulfolinea » Van Vliet et al. 2020 год
- Род Flexilinea Sun et al. 2015 год
- Род Levilinea Yamada et al. 2006 г. [19]
- Род Leptolinea Yamada et al. 2006 г. [19]
- Род Longilinea Yamada et al. 2007 год [21]
- Род Ornatilinea Podosokorsky et al. 2013 год
- Род Pelolinea Imachi et al. 2014 год
- Род Thermomarinilinea Nunoura et al. 2013 год
- Род « Thermanaerothrix » Gregoire et al. 2011 год [25]
- Род « Кандидат » Villigracilis Nierychlo et al. 2019 год
- Семейство Anaerolineaceae Yamada et al. 2006 г.
Класс Thermomicrobiia Oren, Parte & Garrity 2016
- Порядок Sphaerobacterales Стакебрандт, Рейни и Уорд-Рейни, 1997 г.
- Семейство Sphaerobacteraceae Стакебрандт, Рейни и Уорд-Рейни, 1997 г.
- Род Nitrolancea Сорокин и др. 2014 [ « Нитроланцетус » Сорокин и др. 2012 ]
- Род Sphaerobacter Demharter et al. 1989 год
- Семейство Sphaerobacteraceae Стакебрандт, Рейни и Уорд-Рейни, 1997 г.
- Заказать Thermomicrobiales Garrity & Holt 2002 г.
- Семейство Thermomicrobiaceae Гаррити и Холт, 2002 г.
- Род Thermalbibacter Zhao et al. 2023 год
- Род Thermomicrobium Jackson, Ramaley & Meinschein 1973.
- Род Thermorudis King & King 2014 г.
- Семейство Thermomicrobiaceae Гаррити и Холт, 2002 г.
Класс « Спирибактерии » Williams et al. 2024 год
- Отряд « Spiritibacterales » Williams et al. 2024 год
- Семейство « Spiritibacteraceae » Williams et al. 2024 год
- Род « Candidatus Spiritibacter » Williams et al. 2024 год
- Род « Candidatus Aglaurobacter » Williams et al. 2024 год
- Род « Candida Otrerea » Williams et al. 2024 год
- Семейство « Spiritibacteraceae » Williams et al. 2024 год
Класс « Мартимикробия » Williams et al. 2024 год
- Отряд « Martimicrobiales » Williams et al. 2024 год
- Семейство « Martimicrobiaceae » Williams et al. 2024 год
- Род « Кандидат Martimicrobium » Williams et al. 2024 год
- Род « Candida Laranimicrobium » Williams et al. 2024 год
- Семейство « Martimicrobiaceae » Williams et al. 2024 год
Класс « Tarhunnaeia » Williams et al. 2024 год
- Орден « Tarhunnaeales » Williams et al. 2024 год
- Семейство Tarhunnaeaceae . Williams et al. 2024 год
- Род « Candidatum Tarhunnaea » Williams et al. 2024 год
- Род « Кандидат Сутехии » Williams et al. 2024 год
- Семейство Tarhunnaeaceae . Williams et al. 2024 год
Класс « Уликсимикробии » Williams et al. 2024 год
- Отряд « Uliximicrobiales » Williams et al. 2024 год
- Семейство « Uliximicrobiaceae » Williams et al. 2024 год
- Род « Кандидат Uliximicrobium » Williams et al. 2024 год
- Семейство « Uliximicrobiaceae » Williams et al. 2024 год
Класс Chloroflexia Gupta et al. 2013 год
- Род « Dehalobium » Wu et al. 2002 г. [26]
- Род « Candida Lithoflexus » Saghai et al. 2020 год
- Род Candidatus Sarcinithrix Nierychlo et al . 2019 год
- Отряд « Термобакулалес ».
- Семейство Термобакуловые .
- Род « Thermobaculum » Botero et al. 2004 г.
- Семейство Термобакуловые .
- Отряд Kallotenuales Cole et al. 2013 год
- Семейство Kallotenuaceae Cole et al. 2013 год
- Род Kallotenue Cole et al. 2013 год
- Семейство Kallotenuaceae Cole et al. 2013 год
- Отряд Herpetosiphonales Gupta et al. 2013 год
- Семейство Herpetosiphonaceae Gupta et al. 2013 год
- Род Candidatus Anthektikosiphon г. Уорд, Фишер и МакГлинн, 2020
- Род Herpetosiphon Holt & Lewin 1968 [ Flavilitoribacter García-López et al. 2020 ]
- Семейство Herpetosiphonaceae Gupta et al. 2013 год
- Отряд Chloroflexales Gupta et al. 2013 год
- Подотряд Roseiflexineae Gupta et al. 2013 год
- Семейство Roseiflexaceae Gupta et al. 2013 ["Kouleotrichaceae" Mehrshad et al. 2018 ]
- Род « Kuleothrix » Kohno et al. 2002 г.
- Род Heliothrix Pierson et al. 1986 год
- Род Roseiflexus Hanada et al. 2002 г.
- Семейство Roseiflexaceae Gupta et al. 2013 ["Kouleotrichaceae" Mehrshad et al. 2018 ]
- Подотряд Chloroflexineae Gupta et al. 2013 год
- Семейство Chloroflexaceae Gupta et al. 2013 год
- Род Candida Chloranaerophilus Thiel et al. 2016 год
- Род Chloroflexus Pierson & Castenholz 1974 [" Chlorocrinis "]
- Семейство Oscilloloridaceae Gupta et al. 2013 год
- Род Candidatus Chloroploca Горленко и др. 2014 год
- Род Chloronema ♪ Дубинина и Горленко 1975.
- Род Oscilloloris Горленко и Пивоварова 1989.
- Род Candida Viridilinea Grouzdev et al. 2018 год
- Семейство Chloroflexaceae Gupta et al. 2013 год
- Подотряд Roseiflexineae Gupta et al. 2013 год
Этимология
[ редактировать ]Название Chloroflexi представляет собой неолатинский именительный падеж мужского рода множественного числа от Chloroflexus , названия первого описанного рода. Существительное представляет собой сочетание греческого прилагательного хлорос, -а, на (χλωρός, -ά, -όν) , [27] что означает «зеленовато-желтый», и латинское пассивное совершенное причастие мужского рода flexus (от flecto ), [28] означает «согнутый». [6] Этимология не связана с хлором , элементом, который был открыт в 1810 году сэром Хамфри Дэви и назван в честь его бледно-зеленого цвета. Другой тип с тем же корнем — Chlorobiota , тогда как « цианобактерии » имеют корень cyanos ( κύανος ), что означает «сине-зеленый». [29]
В отличие от некоторых других типов, в названии родов Chloroflexota нет тематического корня, и фактически многие роды, начинающиеся с « Chloro- » или заканчивающиеся на «-хлорис», являются либо цианобактериями, либо хлороби.
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Орен А., генеральный менеджер Гаррити (2021 г.). «Действительная публикация названий сорока двух типов прокариот» . Int J Syst Evol Microbiol . 71 (10): 5056. doi : 10.1099/ijsem.0.005056 . ПМИД 34694987 . S2CID 239887308 .
- ^ Сатклифф, IC (2010). «Взгляд на архитектуру оболочки бактериальных клеток на уровне типа». Тенденции в микробиологии . 18 (10): 464–470. дои : 10.1016/j.tim.2010.06.005 . ПМИД 20637628 .
- ^ Дон Дж. Бреннер; Ноэль Р. Криг; Джеймс Т. Стейли (26 июля 2005 г.) [1984 (Williams & Wilkins)]. Джордж М. Гаррити (ред.). Вводные эссе . Руководство Берджи по систематической бактериологии. Том. 2А (2-е изд.). Нью-Йорк: Спрингер. п. 304. ИСБН 978-0-387-24143-2 . Британская библиотека №. GBA561951.
- ^ Холланд Л. (22 мая 1990 г.). «Возе, Карл в авангарде революции в области бактериальной эволюции». Ученый . 4 (10).
- ^ Вёзе, ЧР (1987). «Бактериальная эволюция» . Микробиологические обзоры . 51 (2): 221–271. дои : 10.1128/MMBR.51.2.221-271.1987 . ПМК 373105 . ПМИД 2439888 .
- ^ Перейти обратно: а б с Дон Дж. Бреннер; Ноэль Р. Криг; Джеймс Т. Стейли (26 июля 2005 г.) [1984 (Williams & Wilkins)]. Джордж М. Гаррити (ред.). Вводные эссе . Руководство Берджи по систематической бактериологии. Том. 2А (2-е изд.). Нью-Йорк: Спрингер. п. 304. ИСБН 978-0-387-24143-2 . Британская библиотека №. GBA561951.
- ^ Гугенгольц, П.; Стакебрандт, Э. (2004). «Реклассификация Sphaerobacter thermophilus из подкласса Sphaerobacteridae типа Actinobacteria в класс Thermomicrobia (исправленное описание) в типе Chloroflexi (исправленное описание)» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 54 (6): 2049–2051. дои : 10.1099/ijs.0.03028-0 . ПМИД 15545432 .
- ^ Маймо-Гателл, X.; Чиен, Ю.; Госсетт, Дж. М.; Зиндер, С.Х. (1997). «Выделение бактерии, которая восстановительно дехлорирует тетрахлорэтен до этилена». Наука . 276 (5318): 1568–1571. дои : 10.1126/science.276.5318.1568 . ПМИД 9171062 .
- ^ Перейти обратно: а б Мо, ВМ; Ян, Дж.; Нобре, МФ; Да Коста, MS; Рейни, ФА (2009). «Dehalogenimonas lykanthroporepellens gen. Nov., sp. Nov., восстановительно дегалогенирующая бактерия, выделенная из грунтовых вод, загрязненных хлорированными растворителями» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 59 (11): 2692–2697. дои : 10.1099/ijs.0.011502-0 . ПМИД 19625421 .
- ^ Перейти обратно: а б с д Гупта, РС; Чандер, П.; Джордж, С. (2012). «Филогенетическая основа и молекулярные признаки класса Chloroflexi и его различных клад; предложение о разделении класса Chloroflexi class. nov. на подотряд Chloroflexineae subord. nov., состоящий из исправленного семейства Oscilloloridaceae и семейства Chloroflexaceae семейства nov., и подотряд Roseiflexineae subord., содержащий семейство Roseiflexaceae fam nov. Антони ван Левенгук . 103 (1): 99–119. дои : 10.1007/s10482-012-9790-3 . ПМИД 22903492 . S2CID 17656551 .
- ^ Ж. П. Эзеби. «Хлорофлекси» . Список названий прокариот, имеющих номенклатуру (LPSN) . Проверено 20 июля 2018 г.
- ^ Сэйерс; и др. «Хлорофлекси» . База данных таксономии Национального центра биотехнологической информации (NCBI) . Проверено 20 марта 2014 г.
- ^ «ЛТП» . Проверено 20 ноября 2023 г.
- ^ «Дерево LTP_all в формате Ньюика» . Проверено 20 ноября 2023 г.
- ^ «Примечания к выпуску LTP_08_2023» (PDF) . Проверено 20 ноября 2023 г.
- ^ «Выпуск GTDB 08-RS214» . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.
- ^ "bac120_r214.sp_label" . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.
- ^ «История таксонов» . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.
- ^ Перейти обратно: а б с д и Ямада, Т.; Секигути, Ю.; Ханада, С.; Имачи, Х.; Охаси, А.; Харада, Х.; Камагата, Ю. (2006). " Anaerolinea thermolimosa sp. nov., Levilinea saccharolytica gen. nov., sp. nov. и Leptolinea tardivitalis gen. nov., sp. nov., новые нитчатые анаэробы и описание новых классов Anaerolineae classis nov. и Caldilineae classis nov. в бактериальном типе Chloroflexi» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 56 (6): 1331–1340. дои : 10.1099/ ijs.0.64169-0 ПМИД 16738111 .
- ^ Секигути, Ю.; Ямада, Т.; Ханада, С.; Охаси, А.; Харада, Х.; Камагата, Ю. (2003). « Anaerolinea thermophila gen. nov., sp. nov. и Caldilinea aerophila gen. nov., sp. nov., новые нитчатые термофилы, которые представляют ранее некультивируемую линию доменных бактерий на уровне подтипа» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 53 (6): 1843–1851. дои : 10.1099/ijs.0.02699-0 . ПМИД 14657113 .
- ^ Перейти обратно: а б с Ямада, Т.; Имачи, Х.; Охаси, А.; Харада, Х.; Ханада, С.; Камагата, Ю.; Секигути, Ю. (2007). « Bellilinea Caldifistulae gen. nov., sp. nov. и Longilinea arvoryzae gen. nov., sp. nov., строго анаэробные нитчатые бактерии типа Chloroflexi, выделенные из метаногенных консорциумов, разлагающих пропионат» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 57 (10): 2299–2306. дои : 10.1099/ ijs.0.65098-0 ПМИД 17911301 .
- ^ Клаппенбах, JA; Пирсон, БК (2004). «Филогенетическая и физиологическая характеристика нитчатой аноксигенной фотоавтотрофной бактерии Candidatus Chlorothrix halophila Gen. Nov., sp. Nov., выделенной из гиперсоленых микробных матов». Архив микробиологии . 181 (1): 17–25. дои : 10.1007/s00203-003-0615-7 . ПМИД 14655000 . S2CID 23854988 .
- ^ Ябе, С.; Айба, Ю.; Сакаи, Ю.; Хазака, М.; Ёкота, А. (2010). « Thermogemmatispora onikobensis gen. nov., sp. nov. и Thermogemmatispora foliorum sp. nov., выделенных из опавших листьев на геотермальных почвах, и описание Thermogemmatisporaceae fam. Nov. и Thermogemmatisporales ord. Nov. В пределах класса Ktedonobacteria» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 61 (4): 903–910. дои : 10.1099/ijs.0.024877-0 . ПМИД 20495028 .
- ^ Ябе, С.; Айба, Ю.; Сакаи, Ю.; Хазака, М.; Ёкота, А. (2009). « Thermosporothrix hazakensis gen. nov., sp. nov., выделенный из компоста, описание семейства Thermosporotrichaceae. Nov. В классе Ktedonobacteria Cavaletti et al. 2007 и исправленное описание класса Ktedonobacteria» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 60 (8): 1794–1801. дои : 10.1099/ijs.0.018069-0 . ПМИД 19767365 .
- ^ Грегуар, П.; Фардо, ML; Джозеф, М.; Гуаско, С.; Хамаиде, Ф.; Биасутти, С.; Мичоти, ВР; Бонин, П.; Оливье, Б. (2011). «Выделение и характеристика Thermanaerothrix daxensis gen. nov., sp. nov., термофильной анаэробной бактерии, относящейся к типу «Chloroflexi», выделенной из глубокого горячего водоносного горизонта в бассейне Аквитании». Систематическая и прикладная микробиология . 34 (7): 494–497. дои : 10.1016/j.syapm.2011.02.004 . ПМИД 21621938 .
- ^ Ву, К.; Уоттс, ДЖЕМ; Сауэрс, КР; Мэй, HD (2002). «Идентификация бактерии, которая специфически катализирует восстановительное дехлорирование полихлорированных дифенилов двусторонними хлорами» . Прикладная и экологическая микробиология . 68 (2): 807–812. Бибкод : 2002ApEnM..68..807W . дои : 10.1128/АЕМ.68.2.807-812.2002 . ПМК 126686 . ПМИД 11823222 .
- ^ χλωρός . Лидделл, Генри Джордж ; Скотт, Роберт ; Греко-английский лексикон в проекте «Персей»
- ^ Льюис и Шорт...
- ^ κύανος . Лидделл, Генри Джордж ; Скотт, Роберт ; Греко-английский лексикон в проекте «Персей»