ГРИН1

ГРИН1
Доступные структуры ПДБ Поиск ортологов: PDBe RCSB showСписок идентификационных кодов PDB 2HQW, 2NR1, 3BYA, 5H8N, 5H8H, 5H8Q, 5H8F, 5I2N, 5I2K, 5KCJ, 5KDT
Идентификаторы
Псевдонимы	GRIN1 , GluN1, MRD8, NMDA1, NMDAR1, NR1, NMD-R1, субъединица 1 типа NMDA ионотропного рецептора глутамата, NDHMSR, NDHMSD, DEE101
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 138249 ; МГИ : 95819 ; Гомологен : 7187 ; Генные карты : GRIN1 ; ОМА : GRIN1 — ортологи
showМестоположение гена ( человек ) Chr. Chromosome 9 (human) Band 9q34.3 Start 137,139,154 bp End 137,168,756 bp
showМестоположение гена ( Мышь ) Chr. Chromosome 2 (mouse) Band 2 A3|2 17.14 cM Start 25,181,193 bp End 25,209,199 bp
show экспрессии РНК Характер Bgee Human Mouse (ortholog) Top expressed in right hemisphere of cerebellum right frontal lobe anterior cingulate cortex nucleus accumbens prefrontal cortex Brodmann area 9 putamen amygdala caudate nucleus Brodmann area 10 Top expressed in perirhinal cortex entorhinal cortex primary visual cortex superior frontal gyrus CA3 field dentate gyrus of hippocampal formation granule cell cerebellar cortex superior colliculus molecular layer of cerebellar cortex primary motor cortex More reference expression data BioGPS More reference expression data
showГенная онтология Molecular function calcium ion binding signaling receptor binding glycine binding calmodulin binding protein binding cation channel activity extracellularly glutamate-gated ion channel activity glutamate binding calcium channel activity NMDA glutamate receptor activity ion channel activity ionotropic glutamate receptor activity neurotransmitter binding transmitter-gated ion channel activity involved in regulation of postsynaptic membrane potential amyloid-beta binding glutamate-gated calcium ion channel activity signaling receptor activity protein-containing complex binding Cellular component cytoplasm postsynaptic membrane membrane synapse NMDA selective glutamate receptor complex neuron projection synaptic vesicle dendritic spine cell surface endoplasmic reticulum integral component of membrane plasma membrane postsynaptic density integral component of plasma membrane excitatory synapse cell junction dendrite synaptic cleft terminal bouton postsynaptic density membrane synaptic membrane glutamatergic synapse integral component of postsynaptic density membrane Biological process negative regulation of neuron apoptotic process pons maturation synaptic transmission, glutamatergic regulation of respiratory gaseous exchange response to amphetamine regulation of membrane potential regulation of synapse assembly learning positive regulation of excitatory postsynaptic potential response to ethanol calcium ion transport suckling behavior prepulse inhibition male mating behavior regulation of long-term neuronal synaptic plasticity adult locomotory behavior regulation of neuron apoptotic process ion transport memory regulation of axonogenesis neuromuscular process ionotropic glutamate receptor signaling pathway excitatory postsynaptic potential learning or memory social behavior regulation of neuronal synaptic plasticity associative learning startle response calcium ion homeostasis cation transport cellular calcium ion homeostasis cation transmembrane transport respiratory gaseous exchange by respiratory system regulation of synaptic plasticity response to morphine propylene metabolic process conditioned taste aversion cerebral cortex development transport sensory perception of pain olfactory learning regulation of cell communication visual learning ephrin receptor signaling pathway MAPK cascade regulation of dendrite morphogenesis ion transmembrane transport long-term memory positive regulation of apoptotic process positive regulation of transcription by RNA polymerase II positive regulation of GTPase activity calcium ion transmembrane transport regulation of ion transmembrane transport brain development positive regulation of calcium ion transport into cytosol calcium-mediated signaling protein heterotetramerization calcium ion transmembrane import into cytosol excitatory chemical synaptic transmission positive regulation of reactive oxygen species biosynthetic process protein localization to postsynaptic membrane cellular response to amyloid-beta response to glycine positive regulation of cysteine-type endopeptidase activity regulation of NMDA receptor activity Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи Разновидность Человек Мышь Входить 2902 14810 Вместе ENSG00000176884 ENSMUSG00000026959 ЮниПрот Q05586 P35438 RefSeq (мРНК) НМ_000832 НМ_001185090 НМ_001185091 НМ_007327 НМ_021569 showНМ_001177656 НМ_001177657 НМ_008169 НМ_001372558 НМ_001372559 NM_001372560 NM_001372561 NM_001372562 RefSeq (белок) НП_000823 НП_001172019 НП_001172020 НП_015566 НП_067544 showНП_001171127 НП_001171128 НП_032195 НП_001359487 НП_001359488 NP_001359489 NP_001359490 NP_001359491 Местоположение (UCSC) Чр 9: 137,14 – 137,17 Мб Чр 2: 25.18 – 25.21 Мб в PubMed Поиск
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

Субъединица дзета-1 глутаматного [NMDA] рецептора представляет собой белок , который у человека кодируется GRIN1 геном .

Белок, кодируемый этим геном, является важной субъединицей N-метил-D-аспартатных рецепторов , членов суперсемейства глутаматных рецепторных каналов, которые представляют собой гетеромерные белковые комплексы с множеством субъединиц, организованных с образованием лиганд-управляемого ионного канала . Эти субъединицы играют ключевую роль в пластичности синапсов . , которая, как полагают, лежит в основе памяти и обучения Ген состоит из 21 экзона и подвергается альтернативному сплайсингу, в результате чего образуются варианты транскриптов, различающиеся по С-концу. Последовательность экзона 5 идентична у позвоночных, при этом сплайсинг экзона 5 продемонстрирован у человека, мыши и крысы. Считается, что клеточно-специфические факторы контролируют экспрессию различных изоформ , что, возможно, способствует функциональному разнообразию субъединиц.

См. также

• NMDA-рецептор

Дальнейшее чтение

• Лин Дж.В., Вышински М., Мадхаван Р., Силок Р., Ким Джу, Шэн М. (март 1998 г.). «Йотяо, новый белок нервно-мышечных соединений и головного мозга, который взаимодействует со специфическими вариантами сплайсинга субъединицы NR1 рецептора NMDA» . Журнал неврологии . 18 (6): 2017–2027. doi : 10.1523/JNEUROSCI.18-06-02017.1998 . ПМК   6792910 . ПМИД   9482789 .
• Шредер Х.К., Перович С., Кавсан В., Ушиджима Х., Мюллер В.Е. (1998). «Механизмы прионSc- и ВИЧ-1 gp120, индуцирующих гибель нейрональных клеток». Нейротоксикология . 19 (4–5): 683–688. ПМИД   9745929 .
• Адриани В., Феличи А., Сарголини Ф., Рулле П., Усиелло А., Оливерио А., Меле А. (ноябрь 1998 г.). «Участие N-метил-D-аспартата и дофаминовых рецепторов в модуляции двигательной активности и процессов памяти». Экспериментальное исследование мозга . 123 (1–2): 52–59. дои : 10.1007/s002210050544 . ПМИД   9835392 . S2CID   8388670 .
• Дингледин Р., Борхес К., Боуи Д., Трайнелис С.Ф. (март 1999 г.). «Ионные каналы глутаматных рецепторов». Фармакологические обзоры . 51 (1): 7–61. ПМИД   10049997 .
• Кинг Дж. Э., Евгенин Е. А., Бакнер С. М., Берман Дж. В. (апрель 2006 г.). «ВИЧ-Тат и нейротоксичность» . Микробы и инфекции . 8 (5): 1347–1357. дои : 10.1016/j.micinf.2005.11.014 . ПМИД   16697675 .
• Циммер М., Финк Т.М., Франке Ю., Лихтер П., Шписс Дж. (июль 1995 г.). «Клонирование и структура гена, кодирующего человеческий рецептор N-метил-D-аспартата (NMDAR1)». Джин . 159 (2): 219–223. дои : 10.1016/0378-1119(95)00044-7 . ПМИД   7622053 .
• Карп С.Дж., Масу М., Эки Т., Одзава К., Наканиси С. (февраль 1993 г.). «Молекулярное клонирование и хромосомная локализация ключевой субъединицы человеческого N-метил-D-аспартатного рецептора» . Журнал биологической химии . 268 (5): 3728–3733. дои : 10.1016/S0021-9258(18)53754-6 . ПМИД   7679115 .
• Юнкин Д.П., Тан СМ, Харди М., Редди УР, Ши QY, Pleasure SJ и др. (март 1993 г.). «Индуцируемая экспрессия нейрональных каналов рецепторов глутамата в клеточной линии человека NT2» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 90 (6): 2174–2178. Бибкод : 1993PNAS...90.2174Y . дои : 10.1073/pnas.90.6.2174 . ПМК   46048 . ПМИД   7681588 .
• Планеллс-Кейс Р., Сан В., Феррер-Монтьель А.В., Монталь М. (июнь 1993 г.). «Молекулярное клонирование, функциональная экспрессия и фармакологическая характеристика субъединицы рецептора N-метил-D-аспартата из мозга человека» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 90 (11): 5057–5061. Бибкод : 1993PNAS...90.5057P . дои : 10.1073/pnas.90.11.5057 . ПМК   46653 . ПМИД   7685113 .
• Магнусон Д.С., Кнудсен Б.Е., Гейгер Дж.Д., Браунстоун Р.М., Нат А. (март 1995 г.). «Вирус иммунодефицита человека типа 1 активирует не-N-метил-D-аспартатные возбуждающие аминокислотные рецепторы и вызывает нейротоксичность». Анналы неврологии . 37 (3): 373–380. дои : 10.1002/ana.410370314 . ПМИД   7695237 . S2CID   24405132 .
• Фолдес Р.Л., Рамперсад В., Камбой Р.К. (сентябрь 1994 г.). «Клонирование и анализ последовательности дополнительных вариантов сплайсинга, кодирующих субъединицы человеческого рецептора N-метил-D-аспартата (hNR1)». Джин . 147 (2): 303–304. дои : 10.1016/0378-1119(94)90089-2 . ПМИД   7926821 .
• Шэн М., Каммингс Дж., Ролдан Л.А., Ян Ю.Н., Ян Л.И. (март 1994 г.). «Изменение субъединичного состава гетеромерных NMDA-рецепторов в процессе развития коры головного мозга крыс». Природа . 368 (6467): 144–147. Бибкод : 1994Natur.368..144S . дои : 10.1038/368144a0 . ПМИД   8139656 . S2CID   4332025 .
• Тингли В.Г., Рош К.В., Томпсон А.К., Хуганир Р.Л. (июль 1993 г.). «Регуляция фосфорилирования рецептора NMDA путем альтернативного сплайсинга С-концевого домена». Природа . 364 (6432): 70–73. Бибкод : 1993Natur.364...70T . дои : 10.1038/364070a0 . ПМИД   8316301 . S2CID   4322831 .
• Фолдес Р.Л., Рамперсад В., Камбой Р.К. (сентябрь 1993 г.). «Клонирование и анализ последовательности кДНК, кодирующих субъединицы рецептора N-метил-D-аспартата гиппокампа человека: доказательства альтернативного сплайсинга РНК». Джин . 131 (2): 293–298. дои : 10.1016/0378-1119(93)90309-Q . ПМИД   8406025 .
• Коллинз С., Дафф С., Дункан А.М., Планеллс-Кейс Р., Сан В., Норремолл А. и др. (июль 1993 г.). «Картирование субъединицы рецептора NMDA человека (NMDAR1) и предлагаемой субъединицы, связывающей глутамат рецептора NMDA (NMDARA1), с хромосомами 9q34.3 и хромосомой 8 соответственно». Геномика . 17 (1): 237–239. дои : 10.1006/geno.1993.1311 . ПМИД   8406459 .
• Ланнузель А., Лледо П.М., Ламгитния Х.О., Винсент Дж.Д., Тардье М. (ноябрь 1995 г.). «Белки оболочки ВИЧ-1 gp120 и gp160 потенцируют NMDA-индуцированное увеличение [Ca2+]i, изменяют гомеостаз [Ca2+]i и вызывают нейротоксичность в эмбриональных нейронах человека». Европейский журнал неврологии . 7 (11): 2285–2293. дои : 10.1111/j.1460-9568.1995.tb00649.x . ПМИД   8563977 . S2CID   27201873 .
• Корасанити М.Т., Мелино Дж., Наварра М., Гарачи Е., Финацци-Агро А., Нистико Г. (сентябрь 1995 г.). «Гибель культивируемых клеток нейробластомы человека, индуцированная gp120 ВИЧ-1, предотвращается антагонистами рецепторов NMDA и ингибиторами оксида азота и циклооксигеназы». Нейродегенерация . 4 (3): 315–321. дои : 10.1016/1055-8330(95)90021-7 . ПМИД   8581564 .
• Элерс, доктор медицинских наук, Чжан С., Бернхадт Дж.П., Хуганир Р.Л. (март 1996 г.). «Инактивация рецепторов NMDA путем прямого взаимодействия кальмодулина с субъединицей NR1» . Клетка . 84 (5): 745–755. дои : 10.1016/S0092-8674(00)81052-1 . ПМИД   8625412 . S2CID   1376853 .
• Питталуга А., Паттарини Р., Севери П., Райтери М. (май 1996 г.). «Рецепторы N-метил-D-аспартата головного мозга человека, регулирующие высвобождение норадреналина, положительно модулируются белком оболочки gp120 ВИЧ-1». СПИД . 10 (5): 463–468. дои : 10.1097/00002030-199605000-00003 . ПМИД   8724036 . S2CID   1669986 .