ГРИК1

ГРИК1
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	2ZNS, 2ZNT, 2ZNU, 3FUZ, 3FV1, 3FV2, 3FVG, 3FVK, 3FVN, 3FVO, 4MF3
Идентификаторы
Псевдонимы	GRIK1 , EAA3, EEA3, GLR5, GLUR5, GluK1, gluR-5, субъединица 1 каинатного типа глутаматного ионотропного рецептора
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 138245 ; МГИ : 95814 ; Гомологен : 68992 ; Генные карты : ГРИК1 ; ОМА : ГРИК1 – ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 21 (human)
End	29,940,033 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 16 (mouse)
End	88,087,153 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	testicle; ; cingulate gyrus; ; anterior cingulate cortex; ; amygdala; ; prefrontal cortex; ; dorsolateral prefrontal cortex; ; frontal pole; ; paraflocculus of cerebellum; ; hypothalamus; ; right frontal lobe;
	Top expressed in
	lumbar spinal ganglion; ; neural layer of retina; ; lateral hypothalamus; ; medial geniculate nucleus; ; suprachiasmatic nucleus; ; pontine nuclei; ; retinal pigment epithelium; ; anterior amygdaloid area; ; barrel cortex; ; lateral geniculate nucleus;
	More reference expression data
	; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	ion channel activity; kainate selective glutamate receptor activity; extracellularly glutamate-gated ion channel activity; ionotropic glutamate receptor activity; ligand-gated ion channel activity; signaling receptor activity; glutamate receptor activity; transmitter-gated ion channel activity involved in regulation of postsynaptic membrane potential;
Cellular component	integral component of membrane; cell junction; plasma membrane; postsynaptic membrane; integral component of plasma membrane; synapse; membrane; kainate selective glutamate receptor complex; presynaptic membrane;
Biological process	glutamate receptor signaling pathway; central nervous system development; ion transmembrane transport; regulation of synaptic transmission, glutamatergic; ion transport; nervous system development; chemical synaptic transmission; ionotropic glutamate receptor signaling pathway; excitatory postsynaptic potential; synaptic transmission, glutamatergic; modulation of chemical synaptic transmission; regulation of postsynaptic membrane potential;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	2897
	14805
	ENSG00000171189
	ENSMUSG00000022935
	P39086
	Q60934
showНМ_000830 ; НМ_175611 ; НМ_001320616 ; НМ_001320618 ; НМ_001320621 ;
	NM_001320630; NM_001330993; NM_001330994; NM_001393424; NM_001393425; NM_001393426
	НМ_010348 ; НМ_146072 ; НМ_001346964
showНП_000821 ; НП_001307545 ; НП_001307547 ; НП_001307550 ; НП_001307559 ;
	NP_001317922; NP_001317923; NP_783300
	н/д
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Рецептор глутамата, ионотропный, каинат 1 , также известный как GRIK1 , представляет собой белок , который у человека кодируется GRIK1 геном . ^[5]

Функция

Этот ген кодирует одну из многих субъединиц ионотропного глутаматного рецептора (GluR), которые функционируют как лиганд-управляемый ионный канал . Специфическая субъединица GluR, кодируемая этим геном, относится к подтипу каинатного рецептора . Сборка рецепторов и внутриклеточный транспорт ионотропных рецепторов глутамата регулируются путем редактирования РНК и альтернативного сплайсинга . Эти рецепторы опосредуют возбуждающую нейротрансмиссию и имеют решающее значение для нормальной синаптической функции . Описаны два альтернативно сплайсированных варианта транскрипта, кодирующие разные изоформы. Экзоны этого гена перемежаются экзонами гена C21orf41, который транскрибируется в той же ориентации, что и этот ген, но, по-видимому, не кодирует белок. ^[5]

Взаимодействия

Было показано, что GRIK1 взаимодействует с DLG4 . ^[6] ВЫБРАТЬ1 ^[6] и СДКБП . ^[6]

Редактирование РНК

Тип

Редактирование РНК от A до I катализируется семейством аденозиндезаминаз, действующих на РНК ( ADAR ), которые специфически распознают аденозины в двухцепочечных областях пре-мРНК и дезаминируют их до инозина. Инозины распознаются механизмом трансляции клеток как гуанозин. Существует три члена семейства ADAR (ADAR 1–3), причем ADAR1 и ADAR2 являются единственными ферментативно активными членами. Считается, что ADAR3 играет регулирующую роль в мозге. ADAR1 и ADAR2 широко экспрессируются в тканях, тогда как ADAR3 ограничен мозгом. Двухцепочечные области РНК образуются путем спаривания оснований между остатками в области, близкой к месту редактирования, с остатками обычно в соседнем интроне, но могут быть экзонной последовательностью. Область, которая соединяется с областью редактирования, известна как дополнительная редактируемая последовательность (ECS).Связывание ADAR напрямую взаимодействует с субстратом дцРНК через свои двухцепочечные РНК-связывающие домены. Если сайт редактирования встречается в кодирующей последовательности, результатом может быть изменение кодона. Это может привести к трансляции изоформы белка из-за изменения ее первичной белковой структуры. Следовательно, редактирование также может изменить функцию белка. Редактирование от A до I происходит в некодирующих последовательностях РНК, таких как интроны, нетранслируемые области (UTR), LINE, SINE (особенно повторы Alu). Считается, что функция редактирования A в I в этих регионах включает, среди прочего, создание сайтов сплайсинга и удержание РНК в ядре.

Расположение

Пре-мРНК GluR-5 редактируется в одном положении в сайте Q/R, расположенном в области мембраны 2 (M2). В результате редактирования происходит изменение кодона. Замена кодона: (CAG) глутамин (Q) на (CGG) и аргинин (R). ^[7]Как и GluR-6, ECS расположен примерно на 2000 нуклеотидов ниже сайта редактирования. ^[8]

Регулирование

Редактирование сайта Q/R регулируется развитием и тканями. Редактирование в спинном мозге, мозолистом теле, мозжечке составляет 50%, а редактирование в таламусе, миндалевидном теле, гиппокампе - около 70%.

Последствия

Структура

Редактирование приводит к изменению аминокислоты во втором мембранном домене рецептора.

Функция

Сайт редактирования находится во втором внутриклеточном домене. Считается, что редактирование влияет на проницаемость рецептора для CA2+. Считается, что редактирование сайта Q/R снижает проницаемость канала для Ca2+. ^[7]

Редактирование РНК сайта Q/R может привести к ингибированию канала мембранными жирными кислотами, такими как арахидоновая кислота и докозагексаеновая кислота. ^[9] Каинатные рецепторы, содержащие только отредактированные изоформы, сильно ингибируются этими жирными кислотами. Однако включения всего лишь одной нередактируемой субъединицы достаточно, чтобы остановить это торможение(. ^[9]

См. также

Каинатный рецептор
Редактирование РНК GRIK1

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000171189 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000022935 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: глутаматный рецептор GRIK1, ионотропный, каинат 1» .
^ Jump up to: ^а ^б ^с Хирбек, Элен; Фрэнсис, Джоанна С.; Лаури, Сари Э.; Брейтуэйт, Стивен П.; Куссен, Франсуаза; Мулле, Кристоф; Дев, Кумлеш К.; Коутиньо, Виктория; Мейер, Гвидо; Исаак, Джон Т.Р.; Коллингридж, Грэм Л.; Хенли, Джереми М.; Кутино, Виктория (февраль 2003 г.). «Быстрая и дифференциальная регуляция АМРА и каинатных рецепторов в синапсах мшистых волокон гиппокампа с помощью PICK1 и GRIP» . Нейрон . 37 (4). США: 625–38. дои : 10.1016/S0896-6273(02)01191-1 . ISSN 0896-6273 . ПМК 3314502 . ПМИД 12597860 .
^ Jump up to: ^а ^б Сибург PH, Single F, Кунер Т, Хигучи М, Шпренгель Р (июль 2001 г.). «Генетические манипуляции с ключевыми детерминантами потока ионов в каналах рецепторов глутамата у мышей». Мозговой Рес. 907 (1–2): 233–43. дои : 10.1016/S0006-8993(01)02445-3 . ПМИД 11430906 . S2CID 11969068 .
^ Херб А., Хигучи М., Шпренгель Р., Зеебург П.Х. (март 1996 г.). «Редактирование сайта Q/R в пре-мРНК каинатных рецепторов GluR5 и GluR6 требует удаленных интронных последовательностей» . Учеб. Натл. акад. наук. США 93 (5): 1875–80. Бибкод : 1996PNAS...93.1875H . дои : 10.1073/pnas.93.5.1875 . ПМК 39875 . ПМИД 8700852 .
^ Jump up to: ^а ^б Уайлдинг Т.Дж., Фуллинг Э., Чжоу Ю., Хюттнер Дж.Э. (июль 2008 г.). «Аминокислотные замены в спирали пор, контролирующие ингибирование GluR6 мембранными жирными кислотами» . Дж. Генерал Физиол. 132 (1): 85–99. дои : 10.1085/jgp.200810009 . ПМК 2442176 . ПМИД 18562501 .

Дальнейшее чтение

Натт С.Л., Камбой Р.К. (1995). «Редактирование РНК субъединиц каинатного рецептора человека». НейроОтчет . 5 (18): 2625–9. дои : 10.1097/00001756-199412000-00055 . ПМИД 7696618 .
Рош К.В., Раймонд Л.А., Блэкстоун С., Хуганир Р.Л. (1994). «Трансмембранная топология субъединицы глутаматного рецептора GluR6» . Ж. Биол. Хим . 269 (16): 11679–82. дои : 10.1016/S0021-9258(17)32623-6 . ПМИД 8163463 .
Грегор П., О'Хара Б.Ф., Ян Х, Уль Г.Р. (1994). «Экспрессия и новые изоформы субъединиц генов глутаматных рецепторов GluR5 и GluR6». НейроОтчет . 4 (12): 1343–6. дои : 10.1097/00001756-199309150-00014 . ПМИД 8260617 .
Юбэнкс Дж.Х., Пуранам Р.С., Клекнер Н.В. и др. (1993). «Ген, кодирующий субъединицу GluR5 рецептора глутамата, расположен на хромосоме человека 21q21.1-22.1 рядом с геном семейного бокового амиотрофического склероза» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 90 (1): 178–82. Бибкод : 1993PNAS...90..178E . дои : 10.1073/pnas.90.1.178 . ПМК 45623 . ПМИД 8419920 .
Потье М.С., Дютрио А., Ламболез Б. и др. (1993). «Присвоение гена GLUR5 человеческого рецептора глутамата 21q22 путем скрининга библиотеки YAC хромосомы 21». Геномика . 15 (3): 696–7. дои : 10.1006/geno.1993.1131 . ПМИД 8468067 .
Корчак Б., Натт С.Л., Флетчер Э.Дж. и др. (1996). «Клонирование кДНК и функциональные свойства человеческого глутаматного рецептора EAA3 (GluR5) в гомомерной и гетеромерной конфигурации». Прием. Каналы . 3 (1): 41–9. ПМИД 8589992 .
Брейкман П.Р., Ланахан А.А., О'Брайен Р. и др. (1997). «Гомер: белок, который избирательно связывает метаботропные рецепторы глутамата». Природа . 386 (6622): 284–8. Бибкод : 1997Natur.386..284B . дои : 10.1038/386284a0 . ПМИД 9069287 . S2CID 4346579 .
Сандер Т., Хильдманн Т., Крец Р. и др. (1997). «Аллельная ассоциация юношеской абсансной эпилепсии с полиморфизмом гена каинатного рецептора GluR5 (GRIK1)». Являюсь. Дж. Мед. Жене . 74 (4): 416–21. doi : 10.1002/(SICI)1096-8628(19970725)74:4<416::AID-AJMG13>3.0.CO;2-L . ПМИД 9259378 .
Кларк В.Р., Баллик Б.А., Ху К.Х. и др. (1997). «Каинатный рецептор GluR5 гиппокампа, регулирующий ингибирующую синаптическую передачу». Природа . 389 (6651): 599–603. Бибкод : 1997Natur.389..599C . дои : 10.1038/39315 . ПМИД 9335499 . S2CID 4426839 .
Сяо Б., Ту Дж.К., Петралия Р.С. и др. (1998). «Гомер регулирует ассоциацию метаботропных рецепторов глутамата группы 1 с поливалентными комплексами родственных Гомеру синаптических белков» . Нейрон . 21 (4): 707–16. дои : 10.1016/S0896-6273(00)80588-7 . ПМИД 9808458 . S2CID 16431031 .
Монтегю А.А., Грир Калифорния (1999). «Дифференциальное распределение субъединиц ионотропных рецепторов глутамата в обонятельной луковице крысы». Дж. Комп. Нейрол . 405 (2): 233–46. doi : 10.1002/(SICI)1096-9861(19990308)405:2<233::AID-CNE7>3.0.CO;2-A . ПМИД 10023812 . S2CID 1317987 .
Бортолотто З.А., Кларк В.Р., Делани СМ и др. (1999). «Каинатные рецепторы участвуют в синаптической пластичности». Природа . 402 (6759): 297–301. Бибкод : 1999Natur.402..297B . дои : 10.1038/46290 . ПМИД 10580501 . S2CID 205051834 .
Барбон А., Барлати С. (2000). «Геномная организация, предлагаемые альтернативные механизмы сплайсинга и структура редактирования РНК GRIK1». Цитогенет. Клеточная генетика . 88 (3–4): 236–9. дои : 10.1159/000015558 . ПМИД 10828597 . S2CID 5850944 .
Хаттори М., Фудзияма А., Тейлор Т.Д. и др. (2000). «Последовательность ДНК 21 хромосомы человека» . Природа . 405 (6784): 311–9. Бибкод : 2000Natur.405..311H . дои : 10.1038/35012518 . ПМИД 10830953 .
Анго Ф., Презо Л., Мюллер Т. и др. (2001). «Агонист-независимая активация метаботропных рецепторов глутамата внутриклеточным белком Гомер». Природа . 411 (6840): 962–5. Бибкод : 2001Natur.411..962A . дои : 10.1038/35082096 . ПМИД 11418862 . S2CID 4417727 .
Шибата Х., Джу А., Фуджи Ю. и др. (2002). «Исследование ассоциации полиморфизмов гена каинатного рецептора GluR5 (GRIK1) с шизофренией». Психиатр. Жене . 11 (3): 139–44. дои : 10.1097/00041444-200109000-00005 . ПМИД 11702055 . S2CID 38356907 .
Хирбек Х., Перестенко О., Нишимунэ А. и др. (2002). «Белки PDZ PICK1, GRIP и синтенин связывают несколько подтипов рецепторов глутамата. Анализ мотивов связывания PDZ» (PDF) . Ж. Биол. Хим . 277 (18): 15221–4. дои : 10.1074/jbc.C200112200 . ПМИД 11891216 . S2CID 13732968 .
Энц Р. (2002). «Актин-связывающий белок филамин-А взаимодействует с метаботропным глутаматным рецептором типа 7» . ФЭБС Летт . 514 (2–3): 184–8. дои : 10.1016/S0014-5793(02)02361-X . ПМИД 11943148 . S2CID 44474808 .
Хирбек Х., Фрэнсис Дж.К., Лаури С.Е. и др. (2003). «Быстрая и дифференциальная регуляция АМРА и каинатных рецепторов в синапсах мшистых волокон гиппокампа с помощью PICK1 и GRIP» . Нейрон . 37 (4): 625–38. дои : 10.1016/S0896-6273(02)01191-1 . ПМЦ 3314502 . ПМИД 12597860 .
Рен З., Райли, Нью-Джерси, Нидлман Л.А. и др. (2004). «Экспрессия каинатных рецепторов GluR5 на клеточной поверхности регулируется сигналом удержания эндоплазматического ретикулума» . Ж. Биол. Хим . 278 (52): 52700–9. дои : 10.1074/jbc.M309585200 . ПМИД 14527949 .