АДАР

АДАР
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
показывать Список идентификационных кодов PDB
	1QBJ, 1QGP, 1XMK, 2ACJ, 2GXB, 2L54, 2MDR, 3F21, 3F22, 3F23, 3IRQ, 3IRR
Идентификаторы
Псевдонимы	ADAR , ADAR1, ADAR2, ADAR3, ADARB1, ADARB2, ADAR1p150, ADAR1p110, IFI-4, DSH, P136, РНК-специфическая аденозиндезаминаза, DRADA, IFI4, AGS6, G1P1, K88DSRBP, DSRAD
Внешние идентификаторы	Опустить : 146920 ; МГИ : 1889575 ; Гомологен : 9281 ; GeneCards : АДАР ; ОМА : АДАР – ортологи
показывать Местоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 1 (human)
End	154,628,013 bp
показывать Местоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 3 (mouse)
End	89,660,753 bp
показывать экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	endothelial cell; ; middle temporal gyrus; ; middle frontal gyrus; ; visceral pleura; ; parietal pleura; ; palpebral conjunctiva; ; thymus; ; paraflocculus of cerebellum; ; internal globus pallidus; ; Brodmann area 23;
	Top expressed in
	dorsal tegmental nucleus; ; paraventricular nucleus of hypothalamus; ; dorsomedial hypothalamic nucleus; ; ventral tegmental area; ; lateral hypothalamus; ; ventromedial nucleus; ; subiculum; ; anterior amygdaloid area; ; mammillary body; ; arcuate nucleus;
	More reference expression data
	More reference expression data
показывать Генная онтология
Molecular function	DNA binding; metal ion binding; double-stranded RNA adenosine deaminase activity; adenosine deaminase activity; protein binding; hydrolase activity; RNA binding; double-stranded RNA binding; tRNA-specific adenosine deaminase activity;
Cellular component	cytoplasm; membrane; supraspliceosomal complex; nucleoplasm; nucleolus; nucleus;
Biological process	hematopoietic stem cell homeostasis; cellular response to virus; RNA processing; protein import into nucleus; immune system process; negative regulation of type I interferon-mediated signaling pathway; mRNA processing; response to virus; base conversion or substitution editing; negative regulation of apoptotic process; in utero embryonic development; pre-miRNA processing; negative regulation of viral genome replication; defense response to virus; type I interferon signaling pathway; osteoblast differentiation; hematopoietic progenitor cell differentiation; protein export from nucleus; response to interferon-alpha; negative regulation of protein kinase activity by regulation of protein phosphorylation; erythrocyte differentiation; somatic diversification of immune receptors via somatic mutation; definitive hemopoiesis; positive regulation of viral genome replication; negative regulation of RNA interference; gene silencing; innate immune response; adenosine to inosine editing; production of miRNAs involved in gene silencing by miRNA;
	Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи
	103
	56417
	ENSG00000160710
	ENSMUSG00000027951
	P55265
	Q99MU3
показывать НМ_001025107 ; НМ_001111 ; НМ_001193495 ; НМ_015840 ; НМ_015841 ;
	NM_001365045; NM_001365046; NM_001365047; NM_001365048; NM_001365049
	НМ_001038587 ; НМ_001146296 ; НМ_019655 ; НМ_001357958
	НП_001020278 ; НП_001102 ; НП_001180424 ; НП_056655 ; НП_056656
	НП_001033676 ; НП_001139768 ; НП_062629 ; НП_001344887
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Семейство аденозиндезаминазы, специфичных для двухцепочечной РНК, ферментов кодируется ADAR семейства генами . ^{[ 5 ]} ADAR означает аденозиндезаминазу, действующую на РНК . ^{[ 6 ]}^{[ 7 ]} Эта статья посвящена белкам ADAR; В этой статье подробно описана история эволюции, структура, функции, механизмы и важность всех белков этого семейства. ^{[ 5 ]}

Ферменты ADAR связываются с двухцепочечной РНК (дцРНК) и превращают аденозин в инозин ( гипоксантин ) путем дезаминирования . ^{[ 8 ]} Белки ADAR действуют посттранскрипционно, изменяя нуклеотидный состав РНК. ^{[ 9 ]} Преобразование аденозина в инозин (от A до I) в РНК нарушает нормальное спаривание A:U, дестабилизируя РНК. Инозин структурно похож на гуанин (G), что приводит к связыванию инозина с цитозином (I:C). ^{[ 10 ]} Инозин обычно имитирует гуанозин во время трансляции, но также может связываться с урацилом, цитозином и аденозином, хотя это не является предпочтительным.

Изменения кодонов могут возникнуть в результате редактирования РНК, что приводит к изменениям в кодирующих последовательностях белков и их функциях. ^{[ 11 ]} Большинство сайтов редактирования находятся в некодирующих областях РНК, таких как нетранслируемые области (UTR), элементы Alu и длинные вкрапленные ядерные элементы (LINE). ^{[ 12 ]} Изменения кодонов могут привести к появлению альтернативных вариантов транскрипционного сплайсинга. ADAR влияет на транскриптом независимым от редактирования способом, вероятно, вмешиваясь в работу других РНК-связывающих белков. ^{[ 9 ]}

Мутации в этом гене связаны с рядом заболеваний, включая ВИЧ, корь и меланому. Недавние исследования подтверждают связь между редактированием РНК и расстройствами нервной системы, такими как боковой амиотрофический склероз (БАС). Атипичное редактирование РНК, связанное с ADAR, может также коррелировать с психическими расстройствами, такими как шизофрения, эпилепсия и суицидальная депрессия. ^{[ 13 ]}

Открытие

Фермент ADAR и связанный с ним ген были обнаружены случайно в 1987 году в результате исследований Бренды Басс и Гарольда Вайнтрауба . ^{[ 14 ]} Эти исследователи использовали ингибирование антисмысловой РНК , чтобы определить, какие гены играют ключевую роль в развитии Xenopus laevis эмбрионов . Предыдущие исследования Xenopus ооцитов оказались успешными. Однако, когда Басс и Вайнтрауб применили идентичные протоколы к эмбрионам Xenopus , они не смогли определить гены развития эмбриона. Чтобы понять, почему метод оказался безуспешным, они начали сравнивать дуплексные РНК как в ооцитах, так и в эмбрионах. Это привело их к открытию регулируемой в процессе развития активности, которая денатурирует гибриды РНК:РНК в эмбрионах.

В 1988 году Рихард Вагнер и др. дополнительно изучили активность эмбрионов Xenopus . ^{[ 15 ]} Они определили, что белок отвечает за раскручивание РНК из-за отсутствия активности после обработки протеиназой . Этот белок специфичен для дсРНК и не требует АТФ . Стало очевидным, что активность этого белка в отношении дцРНК модифицирует ее за пределами точки регибридизации, но не полностью денатурирует. Наконец, исследователи определили, что это раскручивание происходит из-за дезаминирования остатков аденозина в инозин . Эта модификация приводит к несовпадению пар оснований между инозином и уридином , что приводит к дестабилизации и раскручиванию дцРНК.

Эволюция и функции

ADAR являются одной из наиболее распространенных форм редактирования РНК и обладают как селективной, так и неселективной активностью. ^{[ 16 ]} ADAR способен модифицировать и регулировать выработку генного продукта, поскольку инозин интерпретируется клеткой как гуанозин . ADAR может изменить функциональность небольших молекул РНК. Недавно ADARs также были обнаружены в качестве регулятора сплайсинга и биогенеза циркРНК благодаря их способности редактирования или функции связывания РНК. ^{[ 17 ]}^{[ 18 ]}^{[ 19 ]} Считается, что ADAR произошел от ADAT (аденозиндезаминазы, действующей на тРНК), критического белка, присутствующего у всех эукариот , в начале многоклеточного периода путем добавления домена, связывающего дцРНК . Вероятно, это произошло в линии, ведущей к короне Metazoa. Когда дубликат гена ADAT был соединен с другим геном, который кодировал по крайней мере одно связывание двухцепочечной РНК. Семейство генов ADAR в значительной степени сохранилось на протяжении всей истории своего существования. Это, наряду с его присутствием у большинства современных типов , указывает на то, что редактирование РНК имеет важное значение для регуляции генов многоклеточных организмов. ADAR не был обнаружен у различных неметазойных эукариот, таких как растения , грибы и хоанофлагелляты .

Предполагается, что ADAR выполняют две функции: увеличивать разнообразие протеома, стимулируя создание безвредных негеномно кодируемых белков, и защищать важные сайты трансляции. Традиционно считается, что их основная роль заключается в увеличении разнообразия транскриптов и расширении вариаций белков, способствуя эволюции белков. ^{[ 5 ]}

Формы ферментов ADAR

У млекопитающих существует три типа ферментов ADAR: ADAR (ADAR1), ADARB1 (ADAR2) и ADARB2 (ADAR3). ^{[ 5 ]}

АДАР (ADAR1) и АДАР2 (ADARB1)

ADAR один и два обнаружены в различных тканях организма. Эти две формы ADAR также оказались каталитически активными, то есть их можно использовать в качестве катализатора в реакции. Обе формы также имеют сходные структуры экспрессии белков и требуют субстратных структур двухцепочечной РНК. ^{[ 11 ]} Однако они различаются по своей активности редактирования тем, что и ADAR one, и два могут редактировать пре-мРНК GluR-B в сайте R/G, и только ADAR2 может изменять сайт Q/R. ^{[ 20 ]} Было обнаружено, что ADAR1 имеет две изоформы: ADAR1p150 и ADARp110. ADAR1p110 обычно обнаруживается в ядре, тогда как ADAR1p150 перемещается между ядром и цитоплазмой, в основном присутствуя в цитоплазме.

АДАР3 (АДАРБ2)

ADAR 3 отличается от двух других форм ADAR тем, что обнаруживается только в тканях мозга. Он также считается неактивным с точки зрения каталитической активности. ^{[ 11 ]} Было обнаружено, что ADAR3 связан с памятью и обучением у мышей, показывая, что он играет решающую роль в нервной системе. Исследования in vitro также показали, что ADAR3 может играть роль в регуляции ADAR один и два. ^{[ 21 ]}

Каталитическая активность

Биохимическая реакция

ADAR катализируют реакцию гидролитического дезаминирования аденозина в инозин. ^{[ 8 ]} Молекула активированной воды будет реагировать с аденозином в реакции нуклеофильного замещения аминогруппой углерода-6. Гидратированный интермедиат будет существовать в течение короткого периода времени, затем аминогруппа уйдет в виде иона аммиака.

Преобразование аденозина в инозин через ADAR

Активный сайт

У людей ферменты ADAR имеют два-три аминоконцевых домена связывания дсРНК (dsRBD) и один карбокси-концевой каталитический домен деаминазы. ^{[ 22 ]} В dsRBD существует консервативная конфигурация α-β-β-β-α. ^{[ 11 ]} ADAR1 содержит две области связывания Z-ДНК, известные как Zα и Zβ. ^{[ 23 ]}^{[ 24 ]} ADAR2 и ADAR3 имеют богатый аргинином домен, связывающий одноцепочечную РНК (оцРНК). Кристаллическая структура ADAR2 была решена. ^{[ 22 ]} В активном центре фермента имеется остаток глутаминовой кислоты (E396), который связывается водородом с водой. Гистидин ( H394 ) и два остатка цистеина (C451 и C516) координируются с ионом цинка . Цинк активирует молекулу воды для нуклеофильного гидролитического дезаминирования. Внутри каталитического ядра находится инозитолгексакисфосфат (IP6), который стабилизирует аргинина и лизина остатки .

Димеризация

У млекопитающих превращение A в I требует гомодимеризации ADAR1 и ADAR2, но не ADAR3. ^{[ 11 ]} Исследования in vivo не дали окончательных результатов, требуется ли связывание РНК для димеризации. Исследование мутантов семейства ADAR показало, что мутанты не способны связываться с дцРНК, но все же способны димеризоваться , что позволяет предположить, что они могут связываться на основе белок-белковых взаимодействий. ^{[ 11 ]}^{[ 25 ]}

Роль в болезни

Синдром Айкарди-Гутьера и двусторонний стриарный некроз/дистония.

ADAR1 — один из множества генов, которых часто способствует развитию синдрома Айкарди-Гутьера . мутация ^{[ 26 ]} Синдром Айкарди-Гутьера — генетическое воспалительное заболевание, поражающее преимущественно кожу и головной мозг и характеризующееся высоким уровнем IFN-α в спинномозговой жидкости. ^{[ 27 ]} Воспаление вызвано неправильной активацией генов, индуцируемых интерфероном, например тех, которые активируются для борьбы с вирусными инфекциями. Мутация и потеря функции ADAR1 предотвращает дестабилизацию двухцепочечной РНК (дцРНК). ^{[ 28 ]} Такое накопление дцРНК стимулирует выработку интерферона без вирусной инфекции, вызывая воспалительную реакцию и аутоиммунный ответ. ^{[ 29 ]} Фенотип у нокаутных мышей восстанавливается за счет формы ADAR1 p150, содержащей домен Zα, который специфически связывается с левосторонней двухцепочечной конформацией, обнаруженной в Z-ДНК и Z-РНК, но не за счет изоформы p110, лишенной этого домена. домен. ^{[ 30 ]} У людей мутация P193A в домене Zα является причиной синдрома Айкарди-Гутьера. ^{[ 26 ]} и для более тяжелого фенотипа, обнаруженного при двустороннем полосатом некрозе/дистонии. ^{[ 31 ]} Результаты устанавливают биологическую роль левосторонней конформации Z-ДНК. ^{[ 32 ]}

Боковой амиотрофический склероз (АЛС)

В мотонейронах наиболее обоснованным маркером бокового амиотрофического склероза (БАС) является ДНК-связывающий белок TAR (TDP-43) . Когда редактирование РНК не удается из-за снижения регуляции TDP-43, мотонейроны, лишенные фермента ADAR2, экспрессируют нерегулируемую экспрессию, что приводит к аномально проницаемому Са. ²⁺ каналы. Мыши с нокаутом ADAR2 демонстрируют признаки сходства фенотипов БАС. Современные исследователи разрабатывают молекулярную таргетную терапию, нормализующую экспрессию ADAR2. ^{[ 33 ]}

Рак

(ADAR)-индуцированное редактирование РНК A-to-I может вызывать опасные аминокислотные мутации. Редактирование мРНК обычно приводит к миссенс-мутациям, приводящим к изменениям в начальных и конечных областях трансляции. Однако могут произойти важные аминокислотные изменения, приводящие к изменению функций некоторых клеточных процессов. Изменения аминокислот могут привести к структурным изменениям вторичной, третичной и четвертичной структуры белка. Исследователи наблюдали высокие уровни онкогенетического редактирования A-to-I в предшественниках кольцевых РНК, что напрямую подтверждает связь ADAR с раком. Список сайтов редактирования РНК, связанных с опухолями, можно найти здесь . ^{[ 34 ]}

Гепатоцеллюлярная карцинома

Исследования пациентов с гепатоцеллюлярной карциномой (ГЦК) показали тенденцию к повышению уровня ADAR1 и снижению уровня ADAR2. Результаты показывают, что нерегулярная регуляция ответственна за нарушение паттерна редактирования A к I, наблюдаемого при ГЦК, и что ADAR1 действует в этом контексте как онкоген, в то время как ADAR2 обладает супрессорной активностью в отношении опухолей. ^{[ 35 ]} Дисбаланс в экспрессии ADAR может изменить частоту переходов от A к I в кодирующей белок области генов, что приведет к мутированию белков, которые приводят к заболеванию. Нарушение регуляции ADAR1 и ADAR2 может быть использовано в качестве возможного прогностического маркера.

Меланома

Исследования показали, что потеря ADAR1 способствует росту и метастазированию меланомы. Ферменты ADAR могут действовать на микроРНК и влиять на ее биогенез, стабильность и/или мишень связывания. ^{[ 36 ]} ADAR1 может подавляться белком, связывающим элемент ответа цАМФ (CREB), что ограничивает его способность действовать на микроРНК. ^{[ 37 ]} Одним из таких примеров является miR-455-5p, которую редактирует ADAR1. Когда ADAR подавляется CREB, неотредактированная миР-455-5p подавляет белок-супрессор опухоли, называемый CPEB1, способствуя прогрессированию меланомы в модели in vivo.

Наследственный симметричный дисхроматоз (DSH1)

Мутация Gly1007Arg в ADAR1, а также другие усеченные версии считаются причиной некоторых случаев DSH1. ^{[ 38 ]} Это заболевание, характеризующееся гиперпигментацией кистей и стоп, может встречаться в японских и китайских семьях.

ВИЧ

Было показано, что уровни экспрессии белка ADAR1 повышаются во время ВИЧ- инфекции, и было высказано предположение, что он отвечает за мутации от A до G в геноме ВИЧ, ингибируя репликацию. ^{[ 39 ]} Мутация генома ВИЧ с помощью ADAR1 может в некоторых случаях приводить к полезным вирусным мутациям, которые могут способствовать устойчивости к лекарствам.

^{[ 37 ]}

Вирусная активность

Противовирусное средство

ADAR1 представляет собой белок, индуцируемый интерфероном ( IFN ) (высвобождаемый клеткой в ответ на патоген или вирус), способный способствовать иммунному пути клетки. Данные свидетельствуют об элиминации репликона HCV , лимфоцитарного хориоменингита LCMV и полиомавируса . ^{[ 40 ]}^{[ 41 ]}

Провирусный

ADAR1 является провирусным и при других обстоятельствах. Редактирование ADAR1 от А до I обнаружено во многих вирусах, включая вирус кори, ^{[ 42 ]}^{[ 41 ]}^{[ 43 ]} вирус гриппа, ^{[ 44 ]} вирус лимфоцитарного хориоменингита, ^{[ 45 ]} полиомавирус, ^{[ 46 ]} вирус гепатита дельта ^{[ 47 ]} и вирус гепатита С. ^{[ 48 ]} Хотя ADAR1 был обнаружен и у других вирусов, лишь у некоторых из них он был тщательно изучен. Исследования вируса кори показывают, что ADAR1 усиливает репликацию вируса посредством двух различных механизмов: редактирования РНК и ингибирования дцРНК-активируемой протеинкиназы ( PKR ). ^{[ 40 ]}^{[ 41 ]} В частности, считается, что вирусы используют ADAR1 в качестве положительного фактора репликации путем избирательного подавления дцРНК-зависимых и противовирусных путей. ^{[ 49 ]}

См. также

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000160710 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000027951 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д Савва Ю.А., Ридер Л.Е., Ринан Р.А. (декабрь 2012 г.). «Семейство белков ADAR» . Геномная биология . 13 (12): 252. doi : 10.1186/gb-2012-13-12-252 . ПМК 3580408 . ПМИД 23273215 .
^ «Ген Энтрез: аденозиндезаминаза ADAR, действующая на РНК» .
^ Ким Ю, Ван Ю, Сэнфорд Т, Цзэн Ю, Нисикура К (ноябрь 1994 г.). «Молекулярное клонирование кДНК для аденозиндезаминазы двухцепочечной РНК, фермента-кандидата для редактирования ядерной РНК» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 91 (24): 11457–11461. Бибкод : 1994PNAS...9111457K . дои : 10.1073/pnas.91.24.11457 . ПМК 45250 . ПМИД 7972084 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Сэмюэл CE (2012). Аденозиндезаминазы, действующие на РНК (ADAR), и редактирование A-to-I . Гейдельберг: Спрингер. ISBN 978-3-642-22800-1 .
^ Перейти обратно: ^а ^б «АДАР» . НКБИ . Национальная медицинская библиотека США.
^ Лихт К., Хартл М., Амман Ф., Анратер Д., Янисив М.П., Янч М.Ф. (январь 2019 г.). «Инозин вызывает контекстно-зависимое перекодирование и остановку трансляции» . Исследования нуклеиновых кислот . 47 (1): 3–14. дои : 10.1093/nar/gky1163 . ПМК 6326813 . ПМИД 30462291 .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж Нисикура К. (7 июня 2010 г.). «Функции и регуляция редактирования РНК деаминазами ADAR» . Ежегодный обзор биохимии . 79 (1): 321–349. doi : 10.1146/annurev-biochem-060208-105251 . ПМЦ 2953425 . ПМИД 20192758 .
^ Таджаддод М., Янч М.Ф., Лихт К. (март 2016 г.). «Динамический эпитранскриптом: редактирование от А до I модулирует генетическую информацию» . Хромосома . 125 (1): 51–63. дои : 10.1007/s00412-015-0526-9 . ПМК 4761006 . ПМИД 26148686 .
^ Савва Ю.А., Ридер Л.Е., Ринан Р.А. (декабрь 2012 г.). «Семейство белков ADAR» . Геномная биология . 13 (12): 252. doi : 10.1186/gb-2012-13-12-252 . ПМК 3580408 . ПМИД 23273215 .
^ Сэмюэл CE (март 2011 г.). «Аденозиндезаминазы, действующие на РНК (ADAR), обладают как противовирусным, так и провирусным действием» . Вирусология . 411 (2): 180–193. дои : 10.1016/j.virol.2010.12.004 . ПМК 3057271 . ПМИД 21211811 .
^ Вагнер Р.В., Смит Дж.Э., Куперман Б.С., Нисикура К. (апрель 1989 г.). «Активность по раскручиванию двухцепочечной РНК приводит к структурным изменениям посредством превращений аденозина в инозин в клетках млекопитающих и яйцах Xenopus» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 86 (8): 2647–2651. Бибкод : 1989PNAS...86.2647W . дои : 10.1073/pnas.86.8.2647 . ПМК 286974 . ПМИД 2704740 .
^ Грайс Л.Ф., Дегнан Б.М. (январь 2015 г.). «Происхождение семейства генов ADAR и редактирование РНК животных» . Эволюционная биология BMC . 15 (1): 4. Бибкод : 2015BMCEE..15....4G . дои : 10.1186/s12862-015-0279-3 . ПМК 4323055 . ПМИД 25630791 .
^ Тан С.Дж., Шен Х., Ан О, Хун Х., Ли Дж., Сонг Ю и др. (февраль 2020 г.). «Цис- и транс-регуляция сплайсинга пре-мРНК ферментами редактирования РНК влияют на развитие рака» . Природные коммуникации . 11 (1): 799. Бибкод : 2020NatCo..11..799T . дои : 10.1038/s41467-020-14621-5 . ПМЦ 7005744 . ПМИД 32034135 .
^ Сяо Ю.Е., Бан Дж.Х., Ян Ю., Линь Х., Тран С., Ян Э.В. и др. (июнь 2018 г.). «Редактирование РНК в зарождающейся РНК влияет на сплайсинг пре-мРНК» . Геномные исследования . 28 (6): 812–823. дои : 10.1101/гр.231209.117 . ПМЦ 5991522 . ПМИД 29724793 .
^ Шен Х., Ан О, Рен Х, Сонг Ю, Тан С.Дж., Ке XY и др. (март 2022 г.). «ADARs действуют как мощные регуляторы кольцевого транскриптома при раке» . Природные коммуникации . 13 (1): 1508. Бибкод : 2022NatCo..13.1508S . дои : 10.1038/s41467-022-29138-2 . ПМЦ 8938519 . ПМИД 35314703 .
^ Келлман А.М., Сахлин М., Оман М. (15 августа 2003 г.). «ADAR2 A -> I редактирование: избирательность сайта и эффективность редактирования — это отдельные события» . Исследования нуклеиновых кислот . 31 (16): 4874–4881. дои : 10.1093/нар/gkg681 . ISSN 1362-4962 . ПМК 169957 . ПМИД 12907730 .
^ Ван Ю, Чунг Д.Х., Монтелеоне ЛР, Ли Дж, Чан Ю, Тони, доктор медицинских наук, Бил, Пенсильвания (18 ноября 2019 г.). «Кандидаты на связывание РНК для человеческого ADAR3 из субстратов мутанта с усилением функции, экспрессируемого в нейрональных клетках» . Исследования нуклеиновых кислот . 47 (20): 10801–10814. дои : 10.1093/nar/gkz815 . ISSN 1362-4962 . ПМК 6846710 . ПМИД 31552420 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Савва Ю.А., Ридер Л.Е., Ринан Р.А. (декабрь 2012 г.). «Семейство белков ADAR» . Геномная биология . 13 (12): 252. doi : 10.1186/gb-2012-13-12-252 . ПМК 3580408 . ПМИД 23273215 .
^ Шринивасан Б., Кусь К., Атанасиадис А. (август 2022 г.). «Термодинамический анализ взаимодействий домена Zα с нуклеиновой кислотой» . Биохимический журнал . 479 (16): 1727–1741. дои : 10.1042/BCJ20220200 . ПМИД 35969150 .
^ Габриэль Л., Шринивасан Б., Куш К., Мата Дж.Ф., Жоао Аморим М., Янсен Л.Е., Атанасиадис А. (май 2021 г.). «Обогащение доменов Zα в цитоплазматических стрессовых гранулах обусловлено их врожденной способностью связываться с нуклеиновыми кислотами» . Журнал клеточной науки . 134 (10): jcs258446. дои : 10.1242/jcs.258446 . ПМИД 34037233 . S2CID 235202242 .
^ Чо Д.С., Ян В., Ли Дж.Т., Шихаттар Р., Мюррей Дж.М., Нисикура К. (май 2003 г.). «Необходимость димеризации для активности редактирования РНК аденозиндезаминаз, действующих на РНК» . Журнал биологической химии . 278 (19): 17093–17102. дои : 10.1074/jbc.M213127200 . ПМИД 12618436 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Райс Г.И., Кашер П.Р., Форте Г.М., Маннион Н.М., Гринвуд С.М., Шинкевич М. и др. (ноябрь 2012 г.). «Мутации в ADAR1 вызывают синдром Айкарди-Гутьера, связанный с сигнатурой интерферона I типа» . Природная генетика . 44 (11): 1243–1248. дои : 10.1038/ng.2414 . ПМК 4154508 . ПМИД 23001123 .
^ Ян С., Дэн П., Чжу З, Чжу Дж., Ван Г., Чжан Л. и др. (октябрь 2014 г.). «Аденозинддезаминаза, действующая на РНК 1, ограничивает обнаружение РНК RIG-I и подавляет выработку IFN в ответ на вирусные и эндогенные РНК» . Журнал иммунологии . 193 (7): 3436–3445. doi : 10.4049/jimmunol.1401136 . ПМК 4169998 . ПМИД 25172485 .
^ Галло А., Вукич Д., Михалик Д., О'Коннелл М.А., Киган Л.П. (сентябрь 2017 г.). «Редактирование РНК ADAR при заболеваниях человека: это нечто большее, чем просто I». Генетика человека . 136 (9): 1265–1278. дои : 10.1007/s00439-017-1837-0 . ПМИД 28913566 . S2CID 3754471 .
^ Лиддикоат Б.Дж., Пискол Р., Чок А.М., Рамасвами Г., Хигучи М., Хартнер Дж.К. и др. (сентябрь 2015 г.). «Редактирование РНК с помощью ADAR1 предотвращает восприятие MDA5 эндогенной дцРНК как чужой» . Наука . 349 (6252): 1115–1120. Бибкод : 2015Sci...349.1115L . дои : 10.1126/science.aac7049 . ПМК 5444807 . ПМИД 26275108 .
^ Уорд С.В., Джордж С.Х., Уэлч М.Дж., Лиу Л.И., Хам Б., Левицки Х. и др. (январь 2011 г.). «Фермент редактирования РНК аденозиндезаминаза является фактором рестрикции для контроля репликации вируса кори, который также необходим для эмбриогенеза» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 108 (1): 331–336. Бибкод : 2011PNAS..108..331W . дои : 10.1073/pnas.1017241108 . ПМК 3017198 . ПМИД 21173229 .
^ Ливингстон Дж.Х., Лин Дж.П., Дейл Р.К., Гилл Д., Броган П., Мюнних А. и др. (февраль 2014 г.). «Сигнатура интерферона I типа идентифицирует двусторонний некроз полосатого тела из-за мутации ADAR1». Журнал медицинской генетики . 51 (2): 76–82. doi : 10.1136/jmedgenet-2013-102038 . ПМИД 24262145 . S2CID 8716360 .
^ Герберт А. (январь 2020 г.). «Менделевская болезнь, вызванная вариантами, влияющими на распознавание Z-ДНК и Z-РНК доменом Zα фермента редактирования двухцепочечной РНК ADAR» . Европейский журнал генетики человека . 28 (1): 114–117. дои : 10.1038/s41431-019-0458-6 . ПМК 6906422 . ПМИД 31320745 .
^ Ямасита Т., Квак С. (июль 2019 г.). «Каскад гибели клеток и молекулярная терапия в ADAR2-дефицитных мотонейронах БАС». Неврологические исследования . 144 : 4–13. doi : 10.1016/j.neures.2018.06.004 . ПМИД 29944911 . S2CID 49433496 .
^ Ван Х, Чен С, Вэй Дж, Сун Г, Чжао Ю (2021). «Редактирование РНК A-to-I при раке: от оценки уровня редактирования к изучению эффектов редактирования» . Границы онкологии . 10 : 632187. doi : 10.3389/fonc.2020.632187 . ПМК 7905090 . ПМИД 33643923 .
^ Чан Т.Х., Линь Ч., Ци Л, Фей Дж., Ли Ю., Юн К.Дж. и др. (май 2014 г.). «Нарушение баланса редактирования РНК, опосредованное ADAR (аденозиндеаминазами, действующими на РНК) при гепатоцеллюлярной карциноме человека» . Гут . 63 (5): 832–843. дои : 10.1136/gutjnl-2012-304037 . ПМЦ 3995272 . ПМИД 23766440 .
^ Хил Б.С., Киган Л.П., МакГерк Л., Михлевски Г., Бриндл Дж., Стэнтон К.М. и др. (октябрь 2009 г.). «Редактирование независимых эффектов ADAR на пути микроРНК/миРНК» . Журнал ЭМБО . 28 (20): 3145–3156. дои : 10.1038/emboj.2009.244 . ПМЦ 2735678 . ПМИД 19713932 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Шошан Э., Мобли А.К., Бройер Р.Р., Камия Т., Хуанг Л., Васкес М.Е. и др. (март 2015 г.). «Пониженное редактирование миР-455-5p из аденозина в инозин способствует росту и метастазированию меланомы» . Природная клеточная биология . 17 (3): 311–321. дои : 10.1038/ncb3110 . ПМЦ 4344852 . ПМИД 25686251 .
^ Тодзё К., Секиджима Й., Сузуки Т., Сузуки Н., Томита Й., Ёсида К. и др. (сентябрь 2006 г.). «Дистония, ухудшение умственного развития и наследственный симметричный дисхроматоз в семье с мутацией ADAR1». Двигательные расстройства . 21 (9): 1510–1513. дои : 10.1002/mds.21011 . ПМИД 16817193 . S2CID 38374943 .
^ Вейден М.Д., Хосино С., Леви Д.Н., Ли Ю., Кумар Р., Берк С.А. и др. (2014). «Аденозиндезаминаза, действующая на РНК-1 (ADAR1), ингибирует репликацию ВИЧ-1 в альвеолярных макрофагах человека» . ПЛОС ОДИН . 9 (10): e108476. Бибкод : 2014PLoSO...9j8476W . дои : 10.1371/journal.pone.0108476 . ПМЦ 4182706 . ПМИД 25272020 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Желинас Дж. Ф., Клерзиус Дж., Шоу Э., Гатиньоль А. (сентябрь 2011 г.). «Усиление репликации РНК-вирусов с помощью ADAR1 посредством редактирования РНК и ингибирования РНК-активируемой протеинкиназы» . Журнал вирусологии . 85 (17): 8460–8466. дои : 10.1128/JVI.00240-11 . ПМК 3165853 . ПМИД 21490091 .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с Пфаллер С.К., Джордж С.Х., Сэмюэл С.Э. (сентябрь 2021 г.). «Аденозиндезаминазы, действующие на РНК (ADAR) и вирусные инфекции» . Ежегодный обзор вирусологии . 8 (1): 239–264. doi : 10.1146/annurev-virology-091919-065320 . ПМИД 33882257 .
^ Бачко К., Лампе Дж., Либерт У.Г., Бринкманн У., Тер Мейлен В., Пардовиц И. и др. (ноябрь 1993 г.). «Клональная экспансия гипермутированного вируса кори в мозге SSPE». Вирусология . 197 (1): 188–195. дои : 10.1006/виро.1993.1579 . ПМИД 8212553 .
^ Каттанео Р., Шмид А., Эшле Д., Бачко К., Тер Меулен В., Биллетер М.А. (октябрь 1988 г.). «Смещенная гипермутация и другие генетические изменения дефектных вирусов кори при инфекциях головного мозга человека» . Клетка . 55 (2): 255–265. дои : 10.1016/0092-8674(88)90048-7 . ПМК 7126660 . ПМИД 3167982 .
^ Теноевер Б.Р., Нг С.Л., Чуа М.А., МакВиртер С.М., Гарсиа-Састре А., Маниатис Т. (март 2007 г.). «Множественные функции IKK-родственной киназы IKKepsilon в интерферон-опосредованном противовирусном иммунитете». Наука . 315 (5816): 1274–1278. дои : 10.1126/science.1136567 . ПМИД 17332413 . S2CID 86636484 .
^ Зан Р.К., Шелп И., Утермёлен О., фон Лаер Д. (январь 2007 г.). «Гипермутация A-to-G в геноме вируса лимфоцитарного хориоменингита» . Журнал вирусологии . 81 (2): 457–464. дои : 10.1128/jvi.00067-06 . ПМК 1797460 . ПМИД 17020943 .
^ Кумар М., Кармайкл Г.Г. (апрель 1997 г.). «Ядерная антисмысловая РНК индуцирует обширные модификации аденозина и удержание ядерных транскриптов-мишеней» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 94 (8): 3542–3547. Бибкод : 1997PNAS...94.3542K . дои : 10.1073/pnas.94.8.3542 . ПМК 20475 . ПМИД 9108012 .
^ Луо Дж.С., Чао М., Се С.Ю., Сюро С., Нисикура К., Тейлор Дж. (март 1990 г.). «При репликации РНК вируса гепатита дельта происходит специфический переход оснований» . Журнал вирусологии . 64 (3): 1021–1027. doi : 10.1128/JVI.64.3.1021-1027.1990 . ПМК 249212 . ПМИД 2304136 .
^ Тейлор Д.Р., Пуиг М., Дарнелл М.Е., Михалик К., Фейнстон С.М. (май 2005 г.). «Новый противовирусный путь, который опосредует чувствительность репликона вируса гепатита С к интерферону через ADAR1» . Журнал вирусологии . 79 (10): 6291–6298. doi : 10.1128/JVI.79.10.6291-6298.2005 . ПМЦ 1091666 . ПМИД 15858013 .
^ Тот А.М., Ли З., Каттанео Р., Сэмюэл С.Э. (октябрь 2009 г.). «РНК-специфическая аденозиндезаминаза ADAR1 подавляет индуцированный вирусом кори апоптоз и активацию протеинкиназы PKR» . Журнал биологической химии . 284 (43): 29350–29356. дои : 10.1074/jbc.M109.045146 . ПМЦ 2785566 . ПМИД 19710021 .

Дальнейшее чтение

Валенсуэла А., Бланко Дж., Каллебо С., Жакото Э., Луис С., Ованесян А.Г., Франко Р. (1997). «Оболочка ВИЧ-1 gp120 и вирусные частицы блокируют связывание аденозиндезаминазы с CD26 человека». Клеточные пептидазы в иммунных функциях и заболеваниях . Достижения экспериментальной медицины и биологии. Том. 421. стр. 185–92. дои : 10.1007/978-1-4757-9613-1_24 . ISBN 978-1-4757-9615-5 . ПМИД 9330696 .
Уотелет М.Г., Шпирер Дж., Нолс С.Б., Клаусс И.М., Де Вит Л., Ислам М.К. и др. (сентябрь 1988 г.). «Клонирование и хромосомное расположение генов человека, индуцируемых интерфероном I типа». Соматическая клетка и молекулярная генетика . 14 (5): 415–426. дои : 10.1007/BF01534709 . ПМИД 3175763 . S2CID 42406993 .
Ван Ю, Цзэн Ю, Мюррей Дж. М., Нисикура К. (ноябрь 1995 г.). «Геномная организация и хромосомное расположение гена аденозиндезаминазы дцРНК человека: фермента для редактирования РНК ионного канала, активируемого глутаматом» . Журнал молекулярной биологии . 254 (2): 184–195. дои : 10.1006/jmbi.1995.0610 . ПМИД 7490742 .
Паттерсон Дж. Б., Сэмюэл CE (октябрь 1995 г.). «Экспрессия и регуляция интерфероном специфичной для двухцепочечной РНК аденозиндезаминазы из клеток человека: данные о двух формах деаминазы» . Молекулярная и клеточная биология . 15 (10): 5376–5388. дои : 10.1128/mcb.15.10.5376 . ПМК 230787 . ПМИД 7565688 .
Паттерсон Дж.Б., Томис Д.К., Ханс С.Л., Сэмюэл К.Э. (июль 1995 г.). «Механизм действия интерферона: двухцепочечная РНК-специфичная аденозиндезаминаза из клеток человека индуцируется альфа- и гамма-интерферонами» . Вирусология . 210 (2): 508–511. дои : 10.1006/виро.1995.1370 . ПМИД 7618288 .
О'Коннелл М.А., Краузе С., Хигучи М., Сюань Дж.Дж., Тотти Н.Ф., Дженни А., Келлер В. (март 1995 г.). «Клонирование кДНК, кодирующей двухцепочечную РНК-специфическую аденозиндезаминазу млекопитающих» . Молекулярная и клеточная биология . 15 (3): 1389–1397. дои : 10.1128/mcb.15.3.1389 . ПМК 230363 . ПМИД 7862132 .
Вейер Х.У., Джордж С.Х., Грейлих К.М., Сэмюэл К.Э. (ноябрь 1995 г.). «Индуцируемый интерфероном ген аденозиндезаминазы, специфичной для двухцепочечной РНК (DSRAD), картируется на хромосоме человека 1q21.1-21.2». Геномика . 30 (2): 372–375. дои : 10.1006/geno.1995.0034 . PMID 8586444 .
Лю Ю, Джордж С.Х., Паттерсон Дж.Б., Сэмюэл С.Э. (февраль 1997 г.). «Функционально различные двухцепочечные РНК-связывающие домены, связанные с альтернативными вариантами сайтов сплайсинга интерферон-индуцируемой двухцепочечной РНК-специфичной аденозиндезаминазы» . Журнал биологической химии . 272 (7): 4419–4428. дои : 10.1074/jbc.272.7.4419 . ПМИД 9020165 .
Валенсуэла А., Бланко Х., Каллебо К., Жакото Э., Луис К., Ованесян А.Г., Франко Р. (апрель 1997 г.). «Связывание аденозиндезаминазы с CD26 человека ингибируется гликопротеином оболочки gp120 ВИЧ-1 и вирусными частицами» . Журнал иммунологии . 158 (8): 3721–3729. дои : 10.4049/jimmunol.158.8.3721 . ПМИД 9103436 . S2CID 22609553 .
Герберт А., Альфкен Дж., Ким Ю.Г., Миан И.С., Нисикура К., Рич А. (август 1997 г.). «Домен, связывающий Z-ДНК, присутствует в редактирующем ферменте человека, аденозиндезаминазе двухцепочечной РНК» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 94 (16): 8421–8426. Бибкод : 1997PNAS...94.8421H . дои : 10.1073/pnas.94.16.8421 . ПМК 22942 . ПМИД 9237992 .
Лю Ю, Герберт А, Рич А, Сэмюэл CE (июль 1998 г.). «Двухцепочечная РНК-специфическая аденозиндезаминаза: свойства связывания нуклеиновых кислот». Методы . 15 (3): 199–205. дои : 10.1006/meth.1998.0624 . ПМИД 9735305 .
Джордж CX, Сэмюэл CE (апрель 1999 г.). «Транскрипты аденозиндезаминазы ADAR1 человека, специфичные для РНК, обладают альтернативными структурами экзона 1, которые инициируются разными промоторами, один из которых конститутивно активен, а другой индуцируется интерфероном» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 96 (8): 4621–4626. Бибкод : 1999PNAS...96.4621G . дои : 10.1073/pnas.96.8.4621 . ПМК 16382 . ПМИД 10200312 .
Шварц Т., Рулд М.А., Ловенхаупт К., Герберт А., Рич А. (июнь 1999 г.). «Кристаллическая структура Zalpha-домена человеческого фермента редактирования ADAR1, связанного с левосторонней Z-ДНК». Наука . 284 (5421): 1841–1845. дои : 10.1126/science.284.5421.1841 . ПМИД 10364558 .
Шаде М., Тернер С.Дж., Кюне Р., Шмидер П., Ловенхаупт К., Герберт А. и др. (октябрь 1999 г.). «Структура раствора Zalpha-домена человеческого фермента редактирования РНК ADAR1 обнаруживает предварительно расположенную поверхность связывания для Z-ДНК» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 96 (22): 12465–12470. Бибкод : 1999PNAS...9612465S . дои : 10.1073/pnas.96.22.12465 . ПМК 22950 . ПМИД 10535945 .
Бланко Х., Валенсуэла А., Эррера К., Луис К., Ованесян А.Г., Франко Р. (июль 2000 г.). «Gp120 ВИЧ-1 ингибирует связывание аденозиндезаминазы с CD26 с помощью механизма, модулируемого экспрессией CD4 и CXCR4». Письма ФЭБС . 477 (1–2): 123–128. дои : 10.1016/S0014-5793(00)01751-8 . ПМИД 10899322 . S2CID 22229481 .
Эррера С, Моримото С, Бланко Дж, Маллол Дж, Арензана Ф, Луис С, Франко Р (июнь 2001 г.). «Комодуляция CXCR4 и CD26 в лимфоцитах человека» . Журнал биологической химии . 276 (22): 19532–19539. дои : 10.1074/jbc.M004586200 . ПМИД 11278278 .
Вонг С.К., Сато С., Лазински Д.В. (июнь 2001 г.). «Распознавание субстрата ADAR1 и ADAR2» . РНК . 7 (6): 846–858. дои : 10.1017/S135583820101007X . ПМК 1370134 . ПМИД 11421361 .
Экманн Ч.Р., Нойнтойфль А., Пфаффстеттер Л., Янч М.Ф. (июль 2001 г.). «Человеческий, но не фермент ADAR1, редактирующий РНК Xenopus, имеет атипичный сигнал ядерной локализации и проявляет характеристики челночного белка» . Молекулярная биология клетки . 12 (7): 1911–1924. дои : 10.1091/mbc.12.7.1911 . ПМЦ 55639 . ПМИД 11451992 .

Ян С., Дэн П., Чжу З, Чжу Дж., Ван Г., Чжан Л. и др. (октябрь 2014 г.). «Аденозинддезаминаза, действующая на РНК 1, ограничивает обнаружение РНК RIG-I и подавляет выработку IFN в ответ на вирусные и эндогенные РНК» . Журнал иммунологии . 193 (7): 3436–3445. doi : 10.4049/jimmunol.1401136 . ПМК 4169998 . ПМИД 25172485 .

Внешние ссылки

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000160710 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000027951 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[:0-5] Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д Савва Ю.А., Ридер Л.Е., Ринан Р.А. (декабрь 2012 г.). «Семейство белков ADAR» . Геномная биология . 13 (12): 252. doi : 10.1186/gb-2012-13-12-252 . ПМК 3580408 . ПМИД 23273215 .

[entrez-6] «Ген Энтрез: аденозиндезаминаза ADAR, действующая на РНК» .

[pmid7972084-7] Ким Ю, Ван Ю, Сэнфорд Т, Цзэн Ю, Нисикура К (ноябрь 1994 г.). «Молекулярное клонирование кДНК для аденозиндезаминазы двухцепочечной РНК, фермента-кандидата для редактирования ядерной РНК» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 91 (24): 11457–11461. Бибкод : 1994PNAS...9111457K . дои : 10.1073/pnas.91.24.11457 . ПМК 45250 . ПМИД 7972084 .

[Samuel-8] Перейти обратно: ^а ^б Сэмюэл CE (2012). Аденозиндезаминазы, действующие на РНК (ADAR), и редактирование A-to-I . Гейдельберг: Спрингер. ISBN 978-3-642-22800-1 .

[NCBI-9] Перейти обратно: ^а ^б «АДАР» . НКБИ . Национальная медицинская библиотека США.

[10] Лихт К., Хартл М., Амман Ф., Анратер Д., Янисив М.П., Янч М.Ф. (январь 2019 г.). «Инозин вызывает контекстно-зависимое перекодирование и остановку трансляции» . Исследования нуклеиновых кислот . 47 (1): 3–14. дои : 10.1093/nar/gky1163 . ПМК 6326813 . ПМИД 30462291 .

[Nishikura-11] Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж Нисикура К. (7 июня 2010 г.). «Функции и регуляция редактирования РНК деаминазами ADAR» . Ежегодный обзор биохимии . 79 (1): 321–349. doi : 10.1146/annurev-biochem-060208-105251 . ПМЦ 2953425 . ПМИД 20192758 .

[12] Таджаддод М., Янч М.Ф., Лихт К. (март 2016 г.). «Динамический эпитранскриптом: редактирование от А до I модулирует генетическую информацию» . Хромосома . 125 (1): 51–63. дои : 10.1007/s00412-015-0526-9 . ПМК 4761006 . ПМИД 26148686 .

[13] Савва Ю.А., Ридер Л.Е., Ринан Р.А. (декабрь 2012 г.). «Семейство белков ADAR» . Геномная биология . 13 (12): 252. doi : 10.1186/gb-2012-13-12-252 . ПМК 3580408 . ПМИД 23273215 .

[14] Сэмюэл CE (март 2011 г.). «Аденозиндезаминазы, действующие на РНК (ADAR), обладают как противовирусным, так и провирусным действием» . Вирусология . 411 (2): 180–193. дои : 10.1016/j.virol.2010.12.004 . ПМК 3057271 . ПМИД 21211811 .

[pmid2704740-15] Вагнер Р.В., Смит Дж.Э., Куперман Б.С., Нисикура К. (апрель 1989 г.). «Активность по раскручиванию двухцепочечной РНК приводит к структурным изменениям посредством превращений аденозина в инозин в клетках млекопитающих и яйцах Xenopus» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 86 (8): 2647–2651. Бибкод : 1989PNAS...86.2647W . дои : 10.1073/pnas.86.8.2647 . ПМК 286974 . ПМИД 2704740 .

[16] Грайс Л.Ф., Дегнан Б.М. (январь 2015 г.). «Происхождение семейства генов ADAR и редактирование РНК животных» . Эволюционная биология BMC . 15 (1): 4. Бибкод : 2015BMCEE..15....4G . дои : 10.1186/s12862-015-0279-3 . ПМК 4323055 . ПМИД 25630791 .

[17] Тан С.Дж., Шен Х., Ан О, Хун Х., Ли Дж., Сонг Ю и др. (февраль 2020 г.). «Цис- и транс-регуляция сплайсинга пре-мРНК ферментами редактирования РНК влияют на развитие рака» . Природные коммуникации . 11 (1): 799. Бибкод : 2020NatCo..11..799T . дои : 10.1038/s41467-020-14621-5 . ПМЦ 7005744 . ПМИД 32034135 .

[18] Сяо Ю.Е., Бан Дж.Х., Ян Ю., Линь Х., Тран С., Ян Э.В. и др. (июнь 2018 г.). «Редактирование РНК в зарождающейся РНК влияет на сплайсинг пре-мРНК» . Геномные исследования . 28 (6): 812–823. дои : 10.1101/гр.231209.117 . ПМЦ 5991522 . ПМИД 29724793 .

[19] Шен Х., Ан О, Рен Х, Сонг Ю, Тан С.Дж., Ке XY и др. (март 2022 г.). «ADARs действуют как мощные регуляторы кольцевого транскриптома при раке» . Природные коммуникации . 13 (1): 1508. Бибкод : 2022NatCo..13.1508S . дои : 10.1038/s41467-022-29138-2 . ПМЦ 8938519 . ПМИД 35314703 .

[20] Келлман А.М., Сахлин М., Оман М. (15 августа 2003 г.). «ADAR2 A -> I редактирование: избирательность сайта и эффективность редактирования — это отдельные события» . Исследования нуклеиновых кислот . 31 (16): 4874–4881. дои : 10.1093/нар/gkg681 . ISSN 1362-4962 . ПМК 169957 . ПМИД 12907730 .

[21] Ван Ю, Чунг Д.Х., Монтелеоне ЛР, Ли Дж, Чан Ю, Тони, доктор медицинских наук, Бил, Пенсильвания (18 ноября 2019 г.). «Кандидаты на связывание РНК для человеческого ADAR3 из субстратов мутанта с усилением функции, экспрессируемого в нейрональных клетках» . Исследования нуклеиновых кислот . 47 (20): 10801–10814. дои : 10.1093/nar/gkz815 . ISSN 1362-4962 . ПМК 6846710 . ПМИД 31552420 .

[Savva-22] Перейти обратно: ^а ^б Савва Ю.А., Ридер Л.Е., Ринан Р.А. (декабрь 2012 г.). «Семейство белков ADAR» . Геномная биология . 13 (12): 252. doi : 10.1186/gb-2012-13-12-252 . ПМК 3580408 . ПМИД 23273215 .

[23] Шринивасан Б., Кусь К., Атанасиадис А. (август 2022 г.). «Термодинамический анализ взаимодействий домена Zα с нуклеиновой кислотой» . Биохимический журнал . 479 (16): 1727–1741. дои : 10.1042/BCJ20220200 . ПМИД 35969150 .

[24] Габриэль Л., Шринивасан Б., Куш К., Мата Дж.Ф., Жоао Аморим М., Янсен Л.Е., Атанасиадис А. (май 2021 г.). «Обогащение доменов Zα в цитоплазматических стрессовых гранулах обусловлено их врожденной способностью связываться с нуклеиновыми кислотами» . Журнал клеточной науки . 134 (10): jcs258446. дои : 10.1242/jcs.258446 . ПМИД 34037233 . S2CID 235202242 .

[Cho-25] Чо Д.С., Ян В., Ли Дж.Т., Шихаттар Р., Мюррей Дж.М., Нисикура К. (май 2003 г.). «Необходимость димеризации для активности редактирования РНК аденозиндезаминаз, действующих на РНК» . Журнал биологической химии . 278 (19): 17093–17102. дои : 10.1074/jbc.M213127200 . ПМИД 12618436 .

[Rice_2012-26] Перейти обратно: ^а ^б Райс Г.И., Кашер П.Р., Форте Г.М., Маннион Н.М., Гринвуд С.М., Шинкевич М. и др. (ноябрь 2012 г.). «Мутации в ADAR1 вызывают синдром Айкарди-Гутьера, связанный с сигнатурой интерферона I типа» . Природная генетика . 44 (11): 1243–1248. дои : 10.1038/ng.2414 . ПМК 4154508 . ПМИД 23001123 .

[27] Ян С., Дэн П., Чжу З, Чжу Дж., Ван Г., Чжан Л. и др. (октябрь 2014 г.). «Аденозинддезаминаза, действующая на РНК 1, ограничивает обнаружение РНК RIG-I и подавляет выработку IFN в ответ на вирусные и эндогенные РНК» . Журнал иммунологии . 193 (7): 3436–3445. doi : 10.4049/jimmunol.1401136 . ПМК 4169998 . ПМИД 25172485 .

[28] Галло А., Вукич Д., Михалик Д., О'Коннелл М.А., Киган Л.П. (сентябрь 2017 г.). «Редактирование РНК ADAR при заболеваниях человека: это нечто большее, чем просто I». Генетика человека . 136 (9): 1265–1278. дои : 10.1007/s00439-017-1837-0 . ПМИД 28913566 . S2CID 3754471 .

[29] Лиддикоат Б.Дж., Пискол Р., Чок А.М., Рамасвами Г., Хигучи М., Хартнер Дж.К. и др. (сентябрь 2015 г.). «Редактирование РНК с помощью ADAR1 предотвращает восприятие MDA5 эндогенной дцРНК как чужой» . Наука . 349 (6252): 1115–1120. Бибкод : 2015Sci...349.1115L . дои : 10.1126/science.aac7049 . ПМК 5444807 . ПМИД 26275108 .

[30] Уорд С.В., Джордж С.Х., Уэлч М.Дж., Лиу Л.И., Хам Б., Левицки Х. и др. (январь 2011 г.). «Фермент редактирования РНК аденозиндезаминаза является фактором рестрикции для контроля репликации вируса кори, который также необходим для эмбриогенеза» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 108 (1): 331–336. Бибкод : 2011PNAS..108..331W . дои : 10.1073/pnas.1017241108 . ПМК 3017198 . ПМИД 21173229 .

[31] Ливингстон Дж.Х., Лин Дж.П., Дейл Р.К., Гилл Д., Броган П., Мюнних А. и др. (февраль 2014 г.). «Сигнатура интерферона I типа идентифицирует двусторонний некроз полосатого тела из-за мутации ADAR1». Журнал медицинской генетики . 51 (2): 76–82. doi : 10.1136/jmedgenet-2013-102038 . ПМИД 24262145 . S2CID 8716360 .

[32] Герберт А. (январь 2020 г.). «Менделевская болезнь, вызванная вариантами, влияющими на распознавание Z-ДНК и Z-РНК доменом Zα фермента редактирования двухцепочечной РНК ADAR» . Европейский журнал генетики человека . 28 (1): 114–117. дои : 10.1038/s41431-019-0458-6 . ПМК 6906422 . ПМИД 31320745 .

[33] Ямасита Т., Квак С. (июль 2019 г.). «Каскад гибели клеток и молекулярная терапия в ADAR2-дефицитных мотонейронах БАС». Неврологические исследования . 144 : 4–13. doi : 10.1016/j.neures.2018.06.004 . ПМИД 29944911 . S2CID 49433496 .

[34] Ван Х, Чен С, Вэй Дж, Сун Г, Чжао Ю (2021). «Редактирование РНК A-to-I при раке: от оценки уровня редактирования к изучению эффектов редактирования» . Границы онкологии . 10 : 632187. doi : 10.3389/fonc.2020.632187 . ПМК 7905090 . ПМИД 33643923 .

[35] Чан Т.Х., Линь Ч., Ци Л, Фей Дж., Ли Ю., Юн К.Дж. и др. (май 2014 г.). «Нарушение баланса редактирования РНК, опосредованное ADAR (аденозиндеаминазами, действующими на РНК) при гепатоцеллюлярной карциноме человека» . Гут . 63 (5): 832–843. дои : 10.1136/gutjnl-2012-304037 . ПМЦ 3995272 . ПМИД 23766440 .

[36] Хил Б.С., Киган Л.П., МакГерк Л., Михлевски Г., Бриндл Дж., Стэнтон К.М. и др. (октябрь 2009 г.). «Редактирование независимых эффектов ADAR на пути микроРНК/миРНК» . Журнал ЭМБО . 28 (20): 3145–3156. дои : 10.1038/emboj.2009.244 . ПМЦ 2735678 . ПМИД 19713932 .

[Melanoma_Ref-37] Перейти обратно: ^а ^б Шошан Э., Мобли А.К., Бройер Р.Р., Камия Т., Хуанг Л., Васкес М.Е. и др. (март 2015 г.). «Пониженное редактирование миР-455-5p из аденозина в инозин способствует росту и метастазированию меланомы» . Природная клеточная биология . 17 (3): 311–321. дои : 10.1038/ncb3110 . ПМЦ 4344852 . ПМИД 25686251 .

[38] Тодзё К., Секиджима Й., Сузуки Т., Сузуки Н., Томита Й., Ёсида К. и др. (сентябрь 2006 г.). «Дистония, ухудшение умственного развития и наследственный симметричный дисхроматоз в семье с мутацией ADAR1». Двигательные расстройства . 21 (9): 1510–1513. дои : 10.1002/mds.21011 . ПМИД 16817193 . S2CID 38374943 .

[39] Вейден М.Д., Хосино С., Леви Д.Н., Ли Ю., Кумар Р., Берк С.А. и др. (2014). «Аденозиндезаминаза, действующая на РНК-1 (ADAR1), ингибирует репликацию ВИЧ-1 в альвеолярных макрофагах человека» . ПЛОС ОДИН . 9 (10): e108476. Бибкод : 2014PLoSO...9j8476W . дои : 10.1371/journal.pone.0108476 . ПМЦ 4182706 . ПМИД 25272020 .

[Enhancement-40] Перейти обратно: ^а ^б Желинас Дж. Ф., Клерзиус Дж., Шоу Э., Гатиньоль А. (сентябрь 2011 г.). «Усиление репликации РНК-вирусов с помощью ADAR1 посредством редактирования РНК и ингибирования РНК-активируемой протеинкиназы» . Журнал вирусологии . 85 (17): 8460–8466. дои : 10.1128/JVI.00240-11 . ПМК 3165853 . ПМИД 21490091 .

[Pfaller-41] Перейти обратно: ^а ^б ^с Пфаллер С.К., Джордж С.Х., Сэмюэл С.Э. (сентябрь 2021 г.). «Аденозиндезаминазы, действующие на РНК (ADAR) и вирусные инфекции» . Ежегодный обзор вирусологии . 8 (1): 239–264. doi : 10.1146/annurev-virology-091919-065320 . ПМИД 33882257 .

[42] Бачко К., Лампе Дж., Либерт У.Г., Бринкманн У., Тер Мейлен В., Пардовиц И. и др. (ноябрь 1993 г.). «Клональная экспансия гипермутированного вируса кори в мозге SSPE». Вирусология . 197 (1): 188–195. дои : 10.1006/виро.1993.1579 . ПМИД 8212553 .

[43] Каттанео Р., Шмид А., Эшле Д., Бачко К., Тер Меулен В., Биллетер М.А. (октябрь 1988 г.). «Смещенная гипермутация и другие генетические изменения дефектных вирусов кори при инфекциях головного мозга человека» . Клетка . 55 (2): 255–265. дои : 10.1016/0092-8674(88)90048-7 . ПМК 7126660 . ПМИД 3167982 .

[44] Теноевер Б.Р., Нг С.Л., Чуа М.А., МакВиртер С.М., Гарсиа-Састре А., Маниатис Т. (март 2007 г.). «Множественные функции IKK-родственной киназы IKKepsilon в интерферон-опосредованном противовирусном иммунитете». Наука . 315 (5816): 1274–1278. дои : 10.1126/science.1136567 . ПМИД 17332413 . S2CID 86636484 .

[45] Зан Р.К., Шелп И., Утермёлен О., фон Лаер Д. (январь 2007 г.). «Гипермутация A-to-G в геноме вируса лимфоцитарного хориоменингита» . Журнал вирусологии . 81 (2): 457–464. дои : 10.1128/jvi.00067-06 . ПМК 1797460 . ПМИД 17020943 .

[46] Кумар М., Кармайкл Г.Г. (апрель 1997 г.). «Ядерная антисмысловая РНК индуцирует обширные модификации аденозина и удержание ядерных транскриптов-мишеней» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 94 (8): 3542–3547. Бибкод : 1997PNAS...94.3542K . дои : 10.1073/pnas.94.8.3542 . ПМК 20475 . ПМИД 9108012 .

[pmid2304136-47] Луо Дж.С., Чао М., Се С.Ю., Сюро С., Нисикура К., Тейлор Дж. (март 1990 г.). «При репликации РНК вируса гепатита дельта происходит специфический переход оснований» . Журнал вирусологии . 64 (3): 1021–1027. doi : 10.1128/JVI.64.3.1021-1027.1990 . ПМК 249212 . ПМИД 2304136 .

[pmid15858013-48] Тейлор Д.Р., Пуиг М., Дарнелл М.Е., Михалик К., Фейнстон С.М. (май 2005 г.). «Новый противовирусный путь, который опосредует чувствительность репликона вируса гепатита С к интерферону через ADAR1» . Журнал вирусологии . 79 (10): 6291–6298. doi : 10.1128/JVI.79.10.6291-6298.2005 . ПМЦ 1091666 . ПМИД 15858013 .

[49] Тот А.М., Ли З., Каттанео Р., Сэмюэл С.Э. (октябрь 2009 г.). «РНК-специфическая аденозиндезаминаза ADAR1 подавляет индуцированный вирусом кори апоптоз и активацию протеинкиназы PKR» . Журнал биологической химии . 284 (43): 29350–29356. дои : 10.1074/jbc.M109.045146 . ПМЦ 2785566 . ПМИД 19710021 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]

[ 16 ]

[ 17 ]

[ 18 ]

[ 19 ]

[ 20 ]

[ 21 ]

[ 22 ]

[ 23 ]

[ 24 ]

[ 25 ]

[ 26 ]

[ 27 ]

[ 28 ]

[ 29 ]

[ 30 ]

[ 31 ]

[ 32 ]

[ 33 ]

[ 34 ]

[ 35 ]

[ 36 ]

[ 37 ]

[ 38 ]

[ 39 ]

[ 40 ]

[ 41 ]

[ 42 ]

[ 43 ]

[ 44 ]

[ 45 ]

[ 46 ]

[ 47 ]

[ 48 ]

[ 49 ]

v т и Гидролазы : углерод-азотные непептиды ( EC 3,5)
3.5.1: Linear amides / Amidohydrolases	Asparaginase Glutaminase Urease Biotinidase Aminoacylase ACY1 Aspartoacylase(ACY2) ACY3 Ceramidase Aspartylglucosaminidase Fatty acid amide hydrolase Histone deacetylase Sirtuin
3.5.2: Cyclic amides/ Amidohydrolases	Barbiturase Beta-lactamase Dihydroorotase
3.5.3: Linear amidines/ Ureohydrolases	Arginase Agmatinase Protein-arginine deiminase
3.5.4: Cyclic amidines/ Aminohydrolases	Guanine deaminase Adenosine deaminase AMP deaminase Inosine monophosphate synthase DCMP deaminase GTP cyclohydrolase I Cytidine deaminase AICDA Activation-induced cytidine deaminase
3.5.5: Nitriles/ Aminohydrolases	Nitrilase
3.5.99: Other	Riboflavinase Thiaminase II

v т и Ферменты
Activity	Active site Binding site Catalytic triad Oxyanion hole Enzyme promiscuity Diffusion-limited enzyme Cofactor Enzyme catalysis
Regulation	Allosteric regulation Cooperativity Enzyme inhibitor Enzyme activator
Classification	EC number Enzyme superfamily Enzyme family List of enzymes
Kinetics	Enzyme kinetics Eadie–Hofstee diagram Hanes–Woolf plot Lineweaver–Burk plot Michaelis–Menten kinetics
Types	EC1 Oxidoreductases (list) EC2 Transferases (list) EC3 Hydrolases (list) EC4 Lyases (list) EC5 Isomerases (list) EC6 Ligases (list) EC7 Translocases (list)