PDIA3

PDIA3
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	2ALB, 2DMM, 2H8L, 3F8U
Идентификаторы
Псевдонимы	PDIA3 , семейство протеиндисульфидизомераз A, член 3, ER60, ERp57, ERp60, ERp61, GRP57, GRP58, HEL-S-269, HEL-S-93n, HsT17083, P58, PI-PLC, семейство протеиндисульфидизомеразы A, член 3
Внешние идентификаторы	Опустить : 602046 ; МГИ : 95834 ; Гомологен : 68454 ; Генные карты : PDIA3 ; OMA : PDIA3 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 15 (human)
End	43,773,279 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 2 (mouse)
End	121,269,168 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	corpus epididymis; ; stromal cell of endometrium; ; caput epididymis; ; beta cell; ; left lobe of thyroid gland; ; right lobe of thyroid gland; ; anterior pituitary; ; smooth muscle tissue; ; mucosa of sigmoid colon; ; rectum;
	Top expressed in
	seminal vesicula; ; decidua; ; molar; ; dermis; ; mandibular prominence; ; calvaria; ; maxillary prominence; ; stroma of bone marrow; ; abdominal wall; ; migratory enteric neural crest cell;
	More reference expression data
	n/a
showГенная онтология
Molecular function	disulfide oxidoreductase activity; isomerase activity; protein binding; phospholipase C activity; cysteine-type endopeptidase activity; RNA binding; protein disulfide isomerase activity; identical protein binding;
Cellular component	endoplasmic reticulum lumen; focal adhesion; melanosome; myelin sheath; cell surface; endoplasmic reticulum; extracellular exosome; nucleus; phagocytic vesicle; recycling endosome membrane; extracellular space; MHC class I peptide loading complex;
Biological process	protein import into nucleus; antigen processing and presentation of peptide antigen via MHC class I; protein folding in endoplasmic reticulum; cell redox homeostasis; response to endoplasmic reticulum stress; protein retention in ER lumen; protein folding; positive regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway; signal transduction; proteolysis; antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I, TAP-dependent; cellular response to interleukin-7;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	2923
	14827
	ENSG00000167004
	ENSMUSG00000027248
	P30101
	P27773
	НМ_005313
	НМ_007952
	НП_005304
	НП_031978
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Протеиндисульфид-изомераза А3 ( PDIA3 ), также известная как белок, регулируемый глюкозой, 58-кДа ( GRP58 ), представляет собой изомеразу, фермент- кодируемую аутосомным геном PDIA3 у человека. ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}^{[ 8 ]} Этот белок локализуется в эндоплазматическом ретикулуме (ER) и взаимодействует с лектиновыми шаперонами кальретикулином и кальнексином (CNX), модулируя сворачивание вновь синтезированных гликопротеинов. Считается, что комплексы лектинов и этого белка опосредуют сворачивание белков, способствуя образованию дисульфидных связей в их гликопротеиновых субстратах. ^{[ 9 ]}

Структура

Белок PDIA3 состоит из четырех тиоредоксин-подобных доменов: a, b, b' и a'. Домены a и a' имеют мотивы активного сайта Cys-Gly-His-Cys (C57-G58-H59-C60 и C406-G407-H408-C409) и являются каталитически активными. ^{[ 10 ]}^{[ 11 ]} Домены bb' содержат сайт связывания CNX, который состоит из положительно заряженных высококонсервативных остатков (K214, K274 и R282), которые взаимодействуют с отрицательно заряженными остатками домена CNX P. Домен b' содержит большую часть сайта связывания, но петля β4-β5 домена b обеспечивает дополнительный контакт (K214) для усиления взаимодействия. ^{[ 11 ]} образуется временная дисульфидная связь Между N-концевым цистеином в каталитическом мотиве и субстратом , но на этапе, называемом «путь ускользания», связь разрывается, поскольку С-концевой цистеин атакует N-концевой цистеин, высвобождая субстрат. ^{[ 10 ]}

Функция

Белок PDIA3 представляет собой , тиолоксидоредуктазу обладающую протеиндисульфидизомеразной активностью. ^{[ 8 ]}^{[ 10 ]} PDIA3 также является частью главного комплекса гистосовместимости (MHC) класса I комплекса загрузки пептидов , который необходим для формирования окончательной конформации антигена и экспорта из эндоплазматического ретикулума на поверхность клетки. ^{[ 10 ]}^{[ 12 ]} Этот белок эндоплазматического ретикулума взаимодействует с лектиновыми шаперонами, такими как кальретикулин и CNX, чтобы модулировать сворачивание вновь синтезируемых белков. Считается, что PDIA3 играет роль в сворачивании белка, способствуя образованию дисульфидных связей, и что CNX способствует позиционированию субстратов рядом с каталитическими цистеинами. ^{[ 9 ]}^{[ 10 ]} Эта функция позволяет ему служить окислительно-восстановительным сенсором, активируя mTORC1 , который затем опосредует сборку комплекса mTOR для адаптации клеток к окислительному повреждению. Таким образом, PDIA3 регулирует клеток рост и гибель в зависимости от концентрации кислорода, например, в гипоксическом микроокружении костей. Кроме того, PDIA3 активирует закрепление клеток в костях, связываясь с белками клеточного деления и цитоскелета , такими как бета -актин и виментин , с образованием комплекса, который контролирует сворачивание TUBB3 и правильное прикрепление микротрубочек к кинетохоре . PDIA3 также играет роль в цитокин -зависимой передаче сигналов , включая передачу сигналов STAT3 . ^{[ 13 ]}

PDIA3 может также участвовать в передаче сигналов витамина D (в частности, кальцитриола ) в качестве мембраносвязанного рецептора. ^{[ 14 ]}

Клиническое значение

Было продемонстрировано, что снижение экспрессии ERp57 коррелирует с плохим прогнозом при раке шейки матки на ранних стадиях . ^{[ 15 ]} Также было продемонстрировано, что ERp57/PDIA3 связывает специфические фрагменты ДНК в линии клеток меланомы. ^{[ 16 ]} PDIA3 также участвует в метастазировании в кости , которое является наиболее частым источником отдаленных рецидивов рака молочной железы . ^{[ 13 ]} Помимо рака, сверхэкспрессия PDIA3 связана с фиброзом почек , который характеризуется избыточным синтезом и секрецией ЕСМ, что приводит к стрессу ER. ^{[ 17 ]}

Взаимодействия

Было продемонстрировано, что PDIA3 взаимодействует с:

См. также

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000167004 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000027248 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Отчет по символам для PDIA3» . ХГНК . Комитет по генной номенклатуре Хьюго . Проверено 7 февраля 2024 г.
^ Бурди М., Демади Д., Мартин Дж.Л., Джаббур С.К., Мартин Б.М., Джордж Дж.В., Пол Л.Р. (ноябрь 1995 г.). «Клонирование кДНК и экспрессия бакуловируса эндоплазматической сети печени человека P58: характеристика как изоформы протеиндисульфидизомеразы, но не как протеазы или карнитинацилтрансферазы» . Архив биохимии и биофизики . 323 (2): 397–403. дои : 10.1006/abbi.1995.0060 . ПМИД 7487104 .
^ Хирано Н., Сибасаки Ф., Сакаи Р., Танака Т., Нисида Дж., Ядзаки Ю., Такенава Т., Хираи Х. (ноябрь 1995 г.). «Молекулярное клонирование человеческого глюкозо-регулируемого белка ERp57/GRP58, тиол-зависимой редуктазы. Идентификация его секреторной формы и индуцируемой экспрессии путем онкогенной трансформации». Европейский журнал биохимии . 234 (1): 336–42. дои : 10.1111/j.1432-1033.1995.336_c.x . ПМИД 8529662 .
^ Jump up to: ^а ^б Койвунен П., Хелаакоски Т., Аннунен П., Вейола Дж., Райсанен С., Пихлаяниеми Т., Кивирикко К.И. (июнь 1996 г.). «ERp60 не заменяет протеиндисульфидизомеразу в качестве бета-субъединицы пролил-4-гидроксилазы» . Биохимический журнал . 316. 316 (2): 599–605. дои : 10.1042/bj3160599 . ПМЦ 1217390 . ПМИД 8687406 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: семейство А протеиндисульфидизомераз PDIA3, член 3» .
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж Донг Г., Уирш П.А., Пипер Д.Р., Крессвелл П., Рейниш К.М. (январь 2009 г.). «Взгляд на нагрузку пептида MHC класса I на основе структуры гетеродимера тиолоксидоредуктазы тапасин-ERp57» . Иммунитет . 30 (1): 21–32. doi : 10.1016/j.immuni.2008.10.018 . ПМК 2650231 . ПМИД 19119025 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д Козлов Г., Мааттанен П., Шраг Дж.Д., Поллок С., Циглер М., Нагар Б., Томас Д.Ю., Геринг К. (август 2006 г.). «Кристаллическая структура доменов bb' протеиндисульфидизомеразы ERp57» . Структура . 14 (8): 1331–9. дои : 10.1016/j.str.2006.06.019 . ПМИД 16905107 .
^ Гарби Н., Танака С., Момбург Ф., Хеммерлинг Г.Дж. (январь 2006 г.). «Нарушение сборки комплекса пептид-нагрузка главного комплекса гистосовместимости класса I у мышей с дефицитом оксидоредуктазы ERp57». Природная иммунология . 7 (1): 93–102. дои : 10.1038/ni1288 . ПМИД 16311600 . S2CID 5857455 .
^ Jump up to: ^а ^б Сантана-Кодина Н, Карретеро Р, Санс-Памплона Р, Кабрера Т, Гюней Э, Олива Б, Клезардин П, Оларте ОЭ, Лоса-Альварес П, Мендес-Лукас А, Пералес ХК, Сьерра А (август 2013 г.). «Интегрированная сеть транскриптом-протеом идентифицирует тиолоксидоредуктазу эндоплазматического ретикулума (ERp57) как узел, который опосредует метастазирование в кости» . Молекулярная и клеточная протеомика . 12 (8): 2111–25. дои : 10.1074/mcp.M112.022772 . ПМЦ 3734573 . ПМИД 23625662 .
^ Гауччи Э., Раймондо Д., Грилло С., Червони Л., Алтьери Ф., Ниттари Г. и др. (ноябрь 2016 г.). «Анализ взаимодействия кальцитриола с дисульфид-изомеразой ERp57» . Научные отчеты . 6 : 37957. Бибкод : 2016NatSR...637957G . дои : 10.1038/srep37957 . ПМК 5126700 . ПМИД 27897272 .
^ Чунг Х, Чо Х, Перри С, Сонг Дж, Илайя К, Ли Х, Ким Дж. Х. (ноябрь 2013 г.). «Снижение экспрессии ERp57 связано с плохим прогнозом при раке шейки матки на ранней стадии» . Биомаркеры . 18 (7): 573–9. дои : 10.3109/1354750X.2013.827742 . ПМИД 23957851 . S2CID 23970844 .
^ Аурели С., Гауччи Е., Арканджели В., Грилло С., Эуфеми М., Чичиарелли С. (июль 2013 г.). «ERp57/PDIA3 связывает специфические фрагменты ДНК в линии клеток меланомы». Джин . 524 (2): 390–5. дои : 10.1016/j.gene.2013.04.004 . hdl : 11573/516861 . ПМИД 23587917 .
^ Дихази Х., Дихази Г.Х., Биби А., Эльтовейси М., Мюллер К.А., Асиф А.Р., Рубель Д., Васко Р., Мюллер Г.А. (август 2013 г.). «Секреция ERP57 важна для накопления внеклеточного матрикса и прогрессирования фиброза почек и является ранним признаком начала заболевания» . Журнал клеточной науки . 126 (Часть 16): 3649–63. дои : 10.1242/jcs.125088 . ПМИД 23781031 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д Лич М.Р., Коэн-Дойл М.Ф., Томас Д.Ю., Уильямс Д.Б. (август 2002 г.). «Локализация лектина, сайтов связывания ERp57 и полипептидов кальнексина и кальретикулина» . Журнал биологической химии . 277 (33): 29686–97. дои : 10.1074/jbc.M202405200 . ПМИД 12052826 .
^ Аланен Х.И., Уильямсон Р.А., Ховард М.Дж., Хатахет Ф.С., Сало К.Е., Кауппила А., Келлокумпу С., Раддок Л.В. (ноябрь 2006 г.). «ERp27, новый некаталитический член семейства белково-дисульфид-изомеразы человека, локализованный в эндоплазматическом ретикулуме, взаимодействует с ERp57» . Журнал биологической химии . 281 (44): 33727–38. дои : 10.1074/jbc.M604314200 . ПМИД 16940051 .

Внешние ссылки

PDIA3+белок+человек Национальной медицинской библиотеки США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000167004 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000027248 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[5] «Отчет по символам для PDIA3» . ХГНК . Комитет по генной номенклатуре Хьюго . Проверено 7 февраля 2024 г.

[pmid7487104-6] Бурди М., Демади Д., Мартин Дж.Л., Джаббур С.К., Мартин Б.М., Джордж Дж.В., Пол Л.Р. (ноябрь 1995 г.). «Клонирование кДНК и экспрессия бакуловируса эндоплазматической сети печени человека P58: характеристика как изоформы протеиндисульфидизомеразы, но не как протеазы или карнитинацилтрансферазы» . Архив биохимии и биофизики . 323 (2): 397–403. дои : 10.1006/abbi.1995.0060 . ПМИД 7487104 .

[pmid8529662-7] Хирано Н., Сибасаки Ф., Сакаи Р., Танака Т., Нисида Дж., Ядзаки Ю., Такенава Т., Хираи Х. (ноябрь 1995 г.). «Молекулярное клонирование человеческого глюкозо-регулируемого белка ERp57/GRP58, тиол-зависимой редуктазы. Идентификация его секреторной формы и индуцируемой экспрессии путем онкогенной трансформации». Европейский журнал биохимии . 234 (1): 336–42. дои : 10.1111/j.1432-1033.1995.336_c.x . ПМИД 8529662 .

[pmid8687406-8] Jump up to: ^а ^б Койвунен П., Хелаакоски Т., Аннунен П., Вейола Дж., Райсанен С., Пихлаяниеми Т., Кивирикко К.И. (июнь 1996 г.). «ERp60 не заменяет протеиндисульфидизомеразу в качестве бета-субъединицы пролил-4-гидроксилазы» . Биохимический журнал . 316. 316 (2): 599–605. дои : 10.1042/bj3160599 . ПМЦ 1217390 . ПМИД 8687406 .

[entrez-9] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: семейство А протеиндисульфидизомераз PDIA3, член 3» .

[pmid19119025-10] Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж Донг Г., Уирш П.А., Пипер Д.Р., Крессвелл П., Рейниш К.М. (январь 2009 г.). «Взгляд на нагрузку пептида MHC класса I на основе структуры гетеродимера тиолоксидоредуктазы тапасин-ERp57» . Иммунитет . 30 (1): 21–32. doi : 10.1016/j.immuni.2008.10.018 . ПМК 2650231 . ПМИД 19119025 .

[pmid16905107-11] Jump up to: ^а ^б ^с ^д Козлов Г., Мааттанен П., Шраг Дж.Д., Поллок С., Циглер М., Нагар Б., Томас Д.Ю., Геринг К. (август 2006 г.). «Кристаллическая структура доменов bb' протеиндисульфидизомеразы ERp57» . Структура . 14 (8): 1331–9. дои : 10.1016/j.str.2006.06.019 . ПМИД 16905107 .

[pmid16311600-12] Гарби Н., Танака С., Момбург Ф., Хеммерлинг Г.Дж. (январь 2006 г.). «Нарушение сборки комплекса пептид-нагрузка главного комплекса гистосовместимости класса I у мышей с дефицитом оксидоредуктазы ERp57». Природная иммунология . 7 (1): 93–102. дои : 10.1038/ni1288 . ПМИД 16311600 . S2CID 5857455 .

[pmid23625662-13] Jump up to: ^а ^б Сантана-Кодина Н, Карретеро Р, Санс-Памплона Р, Кабрера Т, Гюней Э, Олива Б, Клезардин П, Оларте ОЭ, Лоса-Альварес П, Мендес-Лукас А, Пералес ХК, Сьерра А (август 2013 г.). «Интегрированная сеть транскриптом-протеом идентифицирует тиолоксидоредуктазу эндоплазматического ретикулума (ERp57) как узел, который опосредует метастазирование в кости» . Молекулярная и клеточная протеомика . 12 (8): 2111–25. дои : 10.1074/mcp.M112.022772 . ПМЦ 3734573 . ПМИД 23625662 .

[pmid27897272-14] Гауччи Э., Раймондо Д., Грилло С., Червони Л., Алтьери Ф., Ниттари Г. и др. (ноябрь 2016 г.). «Анализ взаимодействия кальцитриола с дисульфид-изомеразой ERp57» . Научные отчеты . 6 : 37957. Бибкод : 2016NatSR...637957G . дои : 10.1038/srep37957 . ПМК 5126700 . ПМИД 27897272 .

[15] Чунг Х, Чо Х, Перри С, Сонг Дж, Илайя К, Ли Х, Ким Дж. Х. (ноябрь 2013 г.). «Снижение экспрессии ERp57 связано с плохим прогнозом при раке шейки матки на ранней стадии» . Биомаркеры . 18 (7): 573–9. дои : 10.3109/1354750X.2013.827742 . ПМИД 23957851 . S2CID 23970844 .

[16] Аурели С., Гауччи Е., Арканджели В., Грилло С., Эуфеми М., Чичиарелли С. (июль 2013 г.). «ERp57/PDIA3 связывает специфические фрагменты ДНК в линии клеток меланомы». Джин . 524 (2): 390–5. дои : 10.1016/j.gene.2013.04.004 . hdl : 11573/516861 . ПМИД 23587917 .

[17] Дихази Х., Дихази Г.Х., Биби А., Эльтовейси М., Мюллер К.А., Асиф А.Р., Рубель Д., Васко Р., Мюллер Г.А. (август 2013 г.). «Секреция ERP57 важна для накопления внеклеточного матрикса и прогрессирования фиброза почек и является ранним признаком начала заболевания» . Журнал клеточной науки . 126 (Часть 16): 3649–63. дои : 10.1242/jcs.125088 . ПМИД 23781031 .

[pmid12052826-18] Jump up to: ^а ^б ^с ^д Лич М.Р., Коэн-Дойл М.Ф., Томас Д.Ю., Уильямс Д.Б. (август 2002 г.). «Локализация лектина, сайтов связывания ERp57 и полипептидов кальнексина и кальретикулина» . Журнал биологической химии . 277 (33): 29686–97. дои : 10.1074/jbc.M202405200 . ПМИД 12052826 .

[19] Аланен Х.И., Уильямсон Р.А., Ховард М.Дж., Хатахет Ф.С., Сало К.Е., Кауппила А., Келлокумпу С., Раддок Л.В. (ноябрь 2006 г.). «ERp27, новый некаталитический член семейства белково-дисульфид-изомеразы человека, локализованный в эндоплазматическом ретикулуме, взаимодействует с ERp57» . Журнал биологической химии . 281 (44): 33727–38. дои : 10.1074/jbc.M604314200 . ПМИД 16940051 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]

[ 16 ]

[ 17 ]

[ 18 ]

[ 19 ]

v т и Изомеразы : внутримолекулярные оксидоредуктазы ( EC 5.3)
5.3.1: Aldoses/Ketoses	Triosephosphate isomerase Ribose-5-phosphate isomerase Mannose phosphate isomerase Glucose isomerase
5.3.2: Keto/Enol	Phenylpyruvate tautomerase Oxaloacetate tautomerase 4-Oxalocrotonate tautomerase
5.3.3: C = C	Steroid D-isomerase Isopentenyl-diphosphate delta isomerase Vinylacetyl-CoA D-isomerase Muconolactone D-isomerase Cholestenol Delta-isomerase (EBP) Methylitaconate D-isomerase Aconitate Delta-isomerase Enoyl CoA isomerase Prostaglandin-A1 Delta-isomerase 5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate D-isomerase Isopiperitenone D-isomerase L-dopachrome isomerase Polyenoic fatty acid isomerase
5.3.4: S-S	Protein disulfide-isomerase (PDIA3)
5.3.99: other	Prostaglandin D2 synthase/Prostaglandin-D synthase Prostaglandin E synthase Prostacyclin synthase Thromboxane-A synthase

v т и Ферменты
Activity	Active site Binding site Catalytic triad Oxyanion hole Enzyme promiscuity Diffusion-limited enzyme Cofactor Enzyme catalysis
Regulation	Allosteric regulation Cooperativity Enzyme inhibitor Enzyme activator
Classification	EC number Enzyme superfamily Enzyme family List of enzymes
Kinetics	Enzyme kinetics Eadie–Hofstee diagram Hanes–Woolf plot Lineweaver–Burk plot Michaelis–Menten kinetics
Types	EC1 Oxidoreductases (list) EC2 Transferases (list) EC3 Hydrolases (list) EC4 Lyases (list) EC5 Isomerases (list) EC6 Ligases (list) EC7 Translocases (list)