Трехфункциональный пуриновый биосинтетический белок аденозин-3.

GART
Доступные структуры ПДБ Поиск ортологов: PDBe RCSB showСписок идентификационных кодов PDB 1MEJ, 1MEN, 1MEO, 1NJS, 1RBM, 1RBQ, 1RBY, 1RBZ, 1RC0, 1RC1, 1ZLX, 1ZLY, 2QK4, 2V9Y, 4EW1, 4EW2, 4EW3, 4ZZ2, 4ZZ3, 4ZZ1, 4ZYV, 4ZZ0, 4ZYY, 4ZYX, 4ZYZ, 4ZYT, 4ZYU, 4ZYW
Идентификаторы
Псевдонимы	GART , AIRS, GARS, GARTF, PAIS, PGFT, PRGS, фосфорибозилглицинамидформилтрансфераза, фосфорибозилглицинамидсинтетаза, фосфорибозиламиноимидазолсинтетаза
Внешние идентификаторы	Опустить : 138440 ; МГИ : 95654 ; Гомологен : 637 ; Генные карты : GART ; ОМА : ГАРТ - ортологи
showМестоположение гена ( человек ) Chr. Chromosome 21 (human) Band 21q22.11 Start 33,503,931 bp End 33,543,491 bp
showМестоположение гена ( Мышь ) Chr. Chromosome 16 (mouse) Band 16 C3.3|16 53.18 cM Start 91,418,074 bp End 91,443,840 bp
show экспрессии РНК Характер Bgee Human Mouse (ortholog) Top expressed in ventricular zone ganglionic eminence rectum smooth muscle tissue epithelium of colon body of pancreas gastric mucosa trabecular bone islet of Langerhans tonsil Top expressed in Ileal epithelium epiblast primitive streak yolk sac embryo somite extraocular muscle ventricular zone embryo morula More reference expression data BioGPS n/a
showГенная онтология Molecular function transferase activity nucleotide binding phosphoribosylglycinamide formyltransferase activity metal ion binding ligase activity catalytic activity hydroxymethyl-, formyl- and related transferase activity ATP binding phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase activity phosphoribosylamine-glycine ligase activity Cellular component cytoplasm cytosol extracellular exosome Biological process purine nucleotide biosynthetic process glycine metabolic process 'de novo' IMP biosynthetic process brainstem development biosynthesis response to organic substance cerebellum development ribonucleoside monophosphate biosynthetic process tetrahydrofolate biosynthetic process response to inorganic substance purine ribonucleoside monophosphate biosynthetic process cerebral cortex development metabolism purine nucleobase biosynthetic process adenine biosynthetic process Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи Разновидность Человек Мышь Входить 2618 14450 Вместе ENSG00000262473 ENSG00000159131 ENSMUSG00000022962 ЮниПрот P22102 Q64737 RefSeq (мРНК) НМ_000819 НМ_001136005 НМ_001136006 НМ_175085 НМ_010256 НМ_001357351 RefSeq (белок) НП_000810 НП_001129477 НП_001129478 НП_780294 НП_034386 НП_001344280 Местоположение (UCSC) Чр 21: 33,5 – 33,54 Мб Чр 16: 91,42 – 91,44 Мб в PubMed Поиск
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

Трехфункциональный пуриновый биосинтетический белок аденозин-3 представляет собой фермент , который у человека кодируется GART геном .

Этот белок представляет собой трехфункциональный полипептид. Он обладает активностью фосфорибозиламин-глицинлигазы (EC 6.3.4.13), фосфорибозилглицинамидформилтрансферазы (EC 2.1.2.2), AIR-синтетазы (FGAM-циклазы) (EC 6.3.3.1), которая необходима для de novo биосинтеза пуринов .

Дальнейшее чтение

• Хаттори М., Фудзияма А., Тейлор Т.Д. и др. (2000). «Последовательность ДНК 21 хромосомы человека» . Природа . 405 (6784): 311–9. Бибкод : 2000Natur.405..311H . дои : 10.1038/35012518 . ПМИД   10830953 .
• Банерджи Д., Нандагопал К. (2007). «Потенциальное взаимодействие между геном GARS-AIRS-GART и фактором транскрипции CP2/LBP-1c/LSF при болезни Альцгеймера, связанной с синдромом Дауна». Клетка. Мол. Нейробиол . 27 (8): 1117–26. дои : 10.1007/s10571-007-9217-2 . ПМИД   17902044 . S2CID   5102914 .
• Дамс Т.Э., Сайнс Г., Жиру Э.Л. и др. (2005). «Апо и тройные комплексные структуры химиотерапевтической мишени: глицинамидрибонуклеотидтрансформилаза человека». Биохимия . 44 (29): 9841–50. дои : 10.1021/bi050307g . ПМИД   16026156 .
• Кимура К., Вакамацу А., Судзуки Ю. и др. (2006). «Диверсификация модуляции транскрипции: крупномасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека» . Геном Рез . 16 (1): 55–65. дои : 10.1101/гр.4039406 . ПМК   1356129 . ПМИД   16344560 .
• Дагл Дж.М., Лепп Н.Т., Купер М.Е. и др. (2009). «Определение генетической предрасположенности к открытому артериальному протоку у недоношенных детей» . Педиатрия . 123 (4): 1116–23. дои : 10.1542/пед.2008-0313 . ПМК   2734952 . ПМИД   19336370 .
• Франке Б., Вермюлен Ш., Стигерс-Теуниссен Р.П. и др. (2009). «Исследование ассоциации 45 генов, связанных с фолиевой кислотой, при расщелине позвоночника: участие кубилина (CUBN) и тРНК метилтрансферазы 1 аспарагиновой кислоты (TRDMT1)» . Исследование врожденных дефектов. Часть A: Клиническая и молекулярная тератология . 85 (3): 216–26. дои : 10.1002/bdra.20556 . ПМИД   19161160 .
• Барбе Л., Лундберг Э., Оксволд П. и др. (2008). «К конфокальному субклеточному атласу протеома человека» . Мол. Клетка. Протеомика . 7 (3): 499–508. дои : 10.1074/mcp.M700325-MCP200 . ПМИД   18029348 .
• Чжан Ю., Дешарне Дж., Марсилье Т.Х. и др. (2003). «Рациональный дизайн, синтез, оценка и кристаллическая структура мощного ингибитора человеческой GAR-Тфазы: 10-(трифторацетил)-5,10-дидеазаациклическая-5,6,7,8-тетрагидрофолиевая кислота». Биохимия . 42 (20): 6043–56. дои : 10.1021/bi034219c . ПМИД   12755606 .
• Бродский Г., Барнс Т., Блескан Дж. и др. (1997). «Ген человека GARS-AIRS-GART кодирует два белка, которые дифференциально экспрессируются во время развития мозга человека и временно сверхэкспрессируются в мозжечке у людей с синдромом Дауна» . Хм. Мол. Жене . 6 (12): 2043–50. дои : 10.1093/hmg/6.12.2043 . ПМИД   9328467 .
• Кан Дж.Л., Моран Р.Г. (1997). «Интронное полиаденилирование в гене глицинамидрибонуклеотидформилтрансферазы человека» . Нуклеиновые кислоты Рез . 25 (15): 3118–23. дои : 10.1093/нар/25.15.3118 . ПМЦ   146841 . ПМИД   9224613 .
• Гомес Х.Л., Сантильяна С.Л., Вальехос К.С. и др. (2006). «Исследование фазы II пеметрекседа при распространенном раке молочной железы: клинический ответ и связь с экспрессией молекулярных мишеней» . Клин. Рак Рез . 12 (3, часть 1): 832–8. дои : 10.1158/1078-0432.CCR-05-0295 . ПМИД   16467096 .
• Чжан Ю., Дешарне Дж., Грисли С.Э. и др. (2002). «Кристаллические структуры человеческой GAR-Тфазы при низком и высоком pH и с субстратом бета-GAR». Биохимия . 41 (48): 14206–15. дои : 10.1021/bi020522m . ПМИД   12450384 .
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Рез . 14 (10Б): 2121–7. дои : 10.1101/гр.2596504 . ПМК   528928 . ПМИД   15489334 .
• Маньери В., Мур М.Э., Зёлльнер М.Б. и др. (2007). «Человеческая глицинамидрибонуклеотидтрансформилаза: мутанты активного центра как механистические зонды» . Биохимия . 46 (1): 156–63. дои : 10.1021/bi0619270 . ПМК   2518408 . ПМИД   17198385 .
• Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2002). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК   139241 . ПМИД   12477932 .
• Раш Дж., Мориц А., Ли К.А. и др. (2005). «Иммуноаффинное профилирование фосфорилирования тирозина в раковых клетках». Нат. Биотехнология . 23 (1): 94–101. дои : 10.1038/nbt1046 . ПМИД   15592455 . S2CID   7200157 .
• Залкин Х., Диксон Дж.Э. (1992). «Биосинтез пуриновых нуклеотидов de novo». Прог. Нуклеиновая кислота Рез. Мол. Биол . Прогресс в исследованиях нуклеиновых кислот и молекулярной биологии. 42 : 259–87. дои : 10.1016/s0079-6603(08)60578-4 . ISBN  9780125400428 . ПМИД   1574589 .
• Виейра А.Р., МакГенри Т.Г., Даак-Хирш С. и др. (2008). «Исследование генов-кандидатов/локусов при расщелинах губы/неба и зубных аномалиях выявило новые гены предрасположенности к расщелинам» . Жене. Мед . 10 (9): 668–74. дои : 10.1097/GIM.0b013e3181833793 . ПМК   2734954 . ПМИД   18978678 .
• Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф. и др. (2007). «Крупномасштабное картирование белково-белковых взаимодействий человека методом масс-спектрометрии» . Мол. Сист. Биол . 3 (1): 89. дои : 10.1038/msb4100134 . ПМЦ   1847948 . ПМИД   17353931 .
• Банерджи Д., Нандагопал К. (2009). «Филогенетический анализ и характеристика in silico гена GARS-AIRS-GART, который кодирует трехфункциональный ферментный белок, участвующий в биосинтезе пуринов de novo». Мол. Биотехнология . 42 (3): 306–19. дои : 10.1007/s12033-009-9160-1 . ПМИД   19301155 . S2CID   34759623 .

Внешние ссылки

• Фосфорибозилглицинамид + формилтрансфераза в Национальной медицинской библиотеке США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)