Порядок ветвления бактериальных типов (Гупта, 2001)

Существует несколько моделей порядка ветвления бактериальных типов , одна из них была предложена в 2001 году Гуптой на основе консервативных инделей или белков, называемых «белковыми сигнатурами», альтернативного подхода к молекулярной филогении. ^{[ 1 ]} В этих консервативных инделях присутствуют некоторые проблематичные исключения и конфликты, однако они согласуются с несколькими группами классов и типов. ^{[ 1 ]} Одной из особенностей кладограммы, полученной этим методом, является кластеризация морфологии клеточных стенок (за некоторыми исключениями) от монодерм к переходным дидермам и традиционным дидермам. ^{[ 2 ]}

На кладограмме ниже желтый = монодермы псевдопептидогликана (вариабельная по Грамму), красный = монодермы с толстым пептидогликаном (грамположительный), синий = дидермы с тонкими пептидогликанами (грамотрицательный), зеленый = атипичный, см. примечание в скобках).

Архея

Фирмикуты

Актинобактерии

Фузобактерии

Термотоги

Группа Deinococcus-Thermus (толстые пепт. дидермы)

Chloroflexi (тонкий пепт. монодермы)

Цианобактерии

Спирохеты

Группа ФКБ

Фибробактерии

	Бактероидеты

	Хлороби

Группа ПВХ

Планктомицеты (нуклеоид, закрытый пиреллусомой)

	Хламидии

	Веррукомикробия (компартментализация)

Водный

Протеобактерии

Дельтапротеобактерии

Эпсилонпротеобактерии

Альфапротеобактерии

	Бетапротеобактерии

	Гаммапротеобактерии

См. также

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б Гупта, Р. (2001). «Порядок ветвления и филогенетическое размещение видов из завершенных бактериальных геномов на основе консервативных инделей, обнаруженных в различных белках» . Международная микробиология . 4 (4): 187–202. дои : 10.1007/s10123-001-0037-9 . ПМИД 12051562 . S2CID 14017883 .
^ Гупта, Р.С. (2011). «Происхождение дидермальных (грамотрицательных) бактерий: давление отбора антибиотиков, а не эндосимбиоз, вероятно, привело к эволюции бактериальных клеток с двумя мембранами» . Антони ван Левенгук . 100 (2): 171–182. дои : 10.1007/s10482-011-9616-8 . ПМК 3133647 . ПМИД 21717204 .

[Gupta-1] Jump up to: ^а ^б Гупта, Р. (2001). «Порядок ветвления и филогенетическое размещение видов из завершенных бактериальных геномов на основе консервативных инделей, обнаруженных в различных белках» . Международная микробиология . 4 (4): 187–202. дои : 10.1007/s10123-001-0037-9 . ПМИД 12051562 . S2CID 14017883 .

[2] Гупта, Р.С. (2011). «Происхождение дидермальных (грамотрицательных) бактерий: давление отбора антибиотиков, а не эндосимбиоз, вероятно, привело к эволюции бактериальных клеток с двумя мембранами» . Антони ван Левенгук . 100 (2): 171–182. дои : 10.1007/s10482-011-9616-8 . ПМК 3133647 . ПМИД 21717204 .

[ 1 ]

[ 2 ]