Порядок ветвления бактериальных типов (Ciccarelli et al., 2006)
Существует несколько моделей порядка ветвления бактериальных типов , одна из них была предложена в 2006 году Ciccarelli et al. для своего проекта iTOL. [ 1 ]
Это дерево основано на объединенном наборе консервативных белков, а не на 16S рРНК (см. Порядок ветвления бактериальных типов (Woese, 1987) ).
| "Неомура" |
| ||||||
| Доменные бактерии | |||||||
Расположение различных типов отличается от расположения 16S, но может быть связано с притяжением длинных ветвей и ограниченностью выборки (многие типы имеют единственного секвенированного представителя, тогда как Firmicutes и Proteobacteria чрезмерно представлены). В этой филограмме протеобактерии не являются монофилетическими, но это может быть ошибочным, учитывая большое количество литературы в пользу базальных ацидобактерий. В отличие от деревьев 16S, самая глубокая ветвящаяся клада — Firmicutes . Тем не менее, последний общий предок был между бактериями и археями+эукариями.
См. также
[ редактировать ]- Порядок ветвления бактериальных типов (Woese, 1987)
- Порядок ветвления бактериальных типов (Раппе и Джованони, 2003).
- Порядок ветвления типов бактерий после живого дерева ARB Silva
- Порядок ветвления бактериальных типов (Ciccarelli et al., 2006)
- Порядок ветвления бактериальных типов (Battistuzzi et al.,2004)
- Порядок ветвления бактериальных типов (Гупта, 2001)
- Порядок ветвления бактериальных типов (Кавальер-Смит, 2002)
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Сиссарелли, Флорида; Доркс, Т; Фон Меринг, К; Криви, CJ; Снел, Б; Борк, П. (2006). «На пути к автоматической реконструкции древа жизни с высоким разрешением». Наука . 311 (5765): 1283–1287. Бибкод : 2006Sci...311.1283C . CiteSeerX 10.1.1.381.9514 . дои : 10.1126/science.1123061 . ПМИД 16513982 .
