Парагруппа
Парагруппа — это термин, используемый в популяционной генетике для описания линий внутри гаплогруппы , которые не определяются какими-либо дополнительными уникальными маркерами .
В гаплогруппах ДНК Y-хромосомы человека парагруппы обычно обозначаются звездочкой ( * ) , расположенной после основной гаплогруппы. [1]
Термин «парагруппа» представляет собой комбинацию терминов «парафилетическая гаплогруппа» , указывающую на то, что парагруппы образуют парафилетические субклады. [1] Помимо мутаций, определяющих родительскую гаплогруппу, парагруппы могут не обладать какими-либо дополнительными уникальными маркерами. Альтернативно, парагруппы могут обладать уникальными маркерами, которые еще не были обнаружены. Если внутри парагруппы обнаруживается уникальный маркер, конкретной линии присваивается уникальное имя, и она перемещается из парагруппы, образуя независимый субклад.
Например, парагруппой гаплогруппы DE Y-ДНК человека является DE*. Член DE* имеет маркер, который определяет DE, но не имеет маркеров, которые определяют единственные известные непосредственные субклады DE, D и E. гаплогруппы [2] Аналогичным образом, гаплогруппа E1b1b1g (также известная как E-M293) является примером относительно нового субклада, обнаруженного внутри ранее обозначенной парагруппы и получившего новое имя. До тех пор, пока в 2008 году не был обнаружен маркер SNP/UEP M293, члены субклада были неотличимы от других компонентов парагруппы E1b1b1* (также известной как E3b* и E-M35*). [3]
Другой пример: член Y-ДНК гаплогруппы R (определяемой маркером M207) может принадлежать к субгаплогруппе R1 (определяемой маркером M173) или R2 (определяемой маркером M124). Лица, не имеющие ни одной из этих мутаций, будут отнесены к гаплогруппе R*.
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б Консорциум Y-хромосомы, TYC (2002). «Система номенклатуры дерева бинарных гаплогрупп Y-хромосомы человека» (PDF) . Геномные исследования . 12 (2). Лабораторное издательство Колд-Спринг-Харбор: 339–48. дои : 10.1101/гр.217602 . ПМК 155271 . ПМИД 11827954 .
- ^ Уил, Майкл Э.; и др. (2003). «Редкие глубоко укоренившиеся линии Y-хромосомы у человека: уроки филогеографии» . Генетика . 165 (1): 229–34. дои : 10.1093/генетика/165.1.229 . ПМЦ 1462739 . ПМИД 14504230 .
- ^ Хенн, Б.М.; и др. (2008). «Y-хромосомное свидетельство миграции скотоводов через Танзанию в южную Африку» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 105 (31). ПНАС: 10693–8. Бибкод : 2008PNAS..10510693H . дои : 10.1073/pnas.0801184105 . ПМК 2504844 . ПМИД 18678889 .
Филогенетическое древо гаплогрупп митохондриальной ДНК (мтДНК) человека | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Митохондриальная Ева ( L ) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Л0 | Л1–6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Л1 | Л2 | Л3 | Л4 | Л5 | Л6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
М | Н | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Чехия | Д | И | Г | вопрос | ТО | А | С | Р | я | В | Х | И | |||||||||||||||||||||||||||
С | С | Б | Ф | Р0 | до JT | П | В | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Х.В. | Джей Ти | К | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ЧАС | V | Дж | Т |