Гаплогруппа R1
| Гаплогруппа R1 | |
|---|---|
 | |
| Возможное место происхождения | Сибирь , Средняя Азия , Южная Азия или Юго-Западная Азия. [1] [2] [3] |
| Предок | Р (Р-М207) |
| Потомки | Р1а (М420), Р1б (М343) |
| Определение мутаций | M173/P241/Page29, CTS916/M611/PF5859, CTS997/M612/PF6111, CTS1913/M654, CTS2565/M663, CTS2680, CTS2908/M666/PF6123, CTS3123/M670, CTS3321/M673, C ТС4075/М682, CTS5611/М694, CTS7085/M716/Y481, CTS8116/M730, F93/M621/PF6114, F102/M625/PF6116, F132/M632, F211/Y290, F245/M659/Y477, FGC189/Y305, L875/M706/PF6131/Y SC0000288, L1352/ M785/YSC0000230, M306/PF6147/S1, M640/PF6118, M643, M689, M691/CTS4862/PF6042/YSC0001281, M710/PF6132/YSC0000192, M748/YSC0000207, M781, P225 , П231, П233, П234, П236, П238/ ПФ6115, П242/ПФ6113, П245/ПФ6117, П286/ПФ6136, П294/ПФ6112, ПФ6120 [4] |
Гаплогруппа R1 , или R-M173 , представляет собой гаплогруппу ДНК Y-хромосомы . Первичный субклад гаплогруппы R (R-M207), он определяется SNP M173 . Другим основным субкладом гаплогруппы R является гаплогруппа R2 (R-M479).
Самцы-носители R-M173 в современных популяциях, по-видимому, включают два субклада: R1a и R1b , которые встречаются в основном в популяциях, обитающих в Евразии (за исключением Восточной и Юго-Восточной Азии ). R-M173 содержит большинство представителей гаплогруппы R в виде ее субкладов R1a и R1b ( Rosser 2000 , Semino 2000 ).
Структура
[ редактировать ]| Гаплогруппа R1 | ||||||||||||||||||||||||
|
Происхождение
[ редактировать ]R1 и его родственная клада R2 (R-M79) являются единственными непосредственными потомками гаплогруппы R (R-M207). R является прямым потомком гаплогруппы P1 (P-M45) и, следовательно, родственной кладой гаплогруппы Q (Q-M242). Происхождение гаплогруппы R1 в настоящее время невозможно доказать. По данным SNP-Tracker (по состоянию на май 2023 г.), он возник около 25 000 лет назад/23 000 лет до нашей эры в Западной Сибири между южным Уралом и озером Балхаш . [5]
Никаких примеров базального субклада R1* пока не обнаружено у живых людей или древних останков. Однако родительская клада R* присутствовала у особей эпохи верхнего палеолита (24 000 лет назад ) из мальта-буретской культуры в Сибири. [6] Аутосомная ДНК народа Мальта-Буреть входит в группу, известную учёным-популяционной генетике как Древние Северные Евразийцы (АНЭ). Первые крупные гаплогруппы-потомки появились впоследствии у охотников-собирателей из Восточной Европы ( R1a , 13 тыс. лет назад). [7] и Западная Европа ( R1b , 14 тыс. лет назад), [8] с генотипами, полученными в той или иной степени от ANE. [9]
Общее распространение
[ редактировать ]Евразия
[ редактировать ]Гаплогруппа R1 очень распространена на всей территории Евразии, кроме Восточной и Юго-Восточной Азии . Считается, что его распространение связано с переселением Евразии после последнего ледникового максимума . Его основные подгруппы — R1a и R1b . Один субклад гаплогруппы R1b (особенно R1b1a2) является наиболее распространенной гаплогруппой в Западной Европе и Башкортостане ( Лобов 2009 ), тогда как субклад гаплогруппы R1a (особенно гаплогруппа R1a1 ) является наиболее распространенной гаплогруппой на значительной территории Южной Азии и Восточной Европы. , Средняя Азия , Западный Китай и Южная Сибирь . [10]
Лица, чьи Y-хромосомы обладают всеми мутациями во внутренних узлах дерева Y-ДНК вплоть до M207 включительно (который определяет гаплогруппу R ), но у которых нет ни мутации M173, которая определяет гаплогруппу R1, ни мутации M479, которая определяет гаплогруппу R2, относятся к категории как принадлежащие к группе R * (R-M207). R* был обнаружен у 10,3% (10/97) образца Бурушо и 6,8% (3/44) образца Калаша из северного Пакистана ( Firasat 2007 ).
Америка
[ редактировать ]Присутствие гаплогруппы R1 среди коренных американцев является предметом споров. В настоящее время это самая распространенная гаплогруппа после различных Q-M242 , особенно в Северной Америке у оджибве - 79%, чипевьян - 62%, семинолов - 50%, чероки - 47%, догриб - 40% и тохоно о'одхам - 38%.
Некоторые авторитетные источники указывают на большее сходство между субкладами гаплогруппы R1, обнаруженными в Северной Америке, и субкладами, обнаруженными в Сибири (например, Лелль [11] и Рагхаван [12] ), что предполагает доисторическую иммиграцию из Азии и/или Берингии .
Африка
[ редактировать ]Один субклад, теперь известный как R1b1a2 (R-V88), встречается только с высокой частотой среди коренных народов Западной Африки , таких как фулани , и, как полагают, отражает доисторическую обратную миграцию из Евразии в Африку. [ нужна ссылка ]
Распределение субкладов
[ редактировать ]Р1а (Р-М420)
[ редактировать ]Раскол R1a (M420) рассчитан примерно на 25 000 лет назад (95% ДИ: 21 300–29 000 лет назад) или примерно до последнего ледникового максимума . Крупное исследование, проведенное в 2014 году (Underhill et al., 2015), в котором приняли участие 16 244 человека из более чем 126 популяций со всей Евразии, пришло к выводу, что существуют убедительные доказательства того, что «начальные эпизоды диверсификации гаплогруппы R1a, вероятно, произошли в окрестностях современного Ирана». ." [13] Субклад M417 (R1a1a1) разнообразен ок. 5800 лет назад. [14] Распространение М417-субкладов R1-Z282 (включая R1-Z280) [15] в Центральной и Восточной Европе и R1-Z93 в Азии [15] [16] предполагает, что R1a1a диверсифицировался в пределах Евразийских степей или региона Ближнего Востока и Кавказа . [15] Место происхождения этих субкладов играет роль в споре о происхождении индоевропейцев .Высокие частоты гаплогруппы R1a встречаются среди Западной Бенгалии брахманов (72%), брахманов Уттар-Прадеша (67%), ишкашими (68%), таджикского населения Пенджикента (64%), кыргызского населения Центрального Кыргызстана ( 63,5%), сорбы (63,39%), бихарские брамины (60,53%), шорцы (58,8%), [17] поляки (56,4%), телеуты (55,3%), [17] Южные Алтайцы (58,1%), [18] Украинцы (50%) и русские (50%) ( Семино 2000 , Уэллс 2001 , Бехар 2003 и Шарма 2007 ).
Р1б (Р-М343)
[ редактировать ]Гаплогруппа R1b , вероятно, возникла в Евразии до или во время последнего оледенения. Это наиболее распространенная гаплогруппа в Западной Европе и Башкортостане . ( Лобов 2009 ). Возможно, она пережила последний ледниковый максимум , [19] в рефугиумах вблизи Южного Урала и Эгейского моря . ( Лобов 2009 ).
Он также присутствует с более низкой частотой по всей Восточной Европе, с более высоким разнообразием, чем в Западной Европе, что позволяет предположить древнюю миграцию гаплогруппы R1b с востока. [20] Гаплогруппа R1b также встречается с различной частотой во многих популяциях вблизи Уральских гор и Центральной Азии , вероятного региона ее происхождения.
Может существовать корреляция между этой гаплогруппой и распространением Centum ветви индоевропейских языков в южной и западной Европе. Например, современная заболеваемость R1b достигает от 60% до 90% мужского населения в большинстве частей Испании , Португалии , Франции , Великобритании и Ирландии . [21] Клада также встречается с частотой до 90% в бассейне Чада , а также присутствует в Северной Африке , где ее частота превышает 10% в некоторых частях Алжира .
это редкость Хотя в Южной Азии , в некоторых группах населения наблюдается относительно высокий процент R1b. В их число входит Ламбади , показавший 37% ( Кивисилд, 2003 ). Хазарейцы 32% ( Сенгупта 2005 ) и Агария (в Восточной Индии ) 30% ( Сенгупта 2005 ). Помимо этого, R1b появился у белуджей (8%), бенгальцев (6,5%), ченчу (2%), макрани (5%), неваров (10,6%), палланов (3,5%) и пенджабцев (7,6%) ( Кивисилд). 2003 , Сенгупта 2005 и Гайден 2007 ). В Юго-Восточной Азии он присутствует на Филиппинах из-за испанской и американской колонизации, где в разных исследованиях его частота различается; от 3,6% мужского населения в исследовании 2001 года, проведенном Стэнфордского университета, Азиатско-Тихоокеанским исследовательским центром имели европейскую Y-ДНК R1b до 13% в публичной библиотеке Y-ДНК. [22] [23] [24]
R-M343 (ранее называвшийся Hg1 [ нужна ссылка ] и ЕС18 [ нужна ссылка ] ) — наиболее распространенная гаплогруппа Y-хромосомы в Европе . Это ответвление R-M173, характеризующееся маркером M343 . [25] Подавляющее большинство членов R-M343 классифицируются как R-P25 (определяется маркером P25), остальные — как R-M343* . Его частота наиболее высока в Западной Европе (а из-за современной европейской иммиграции - в некоторых частях Америки ). Большинство носителей R-M343 европейского происхождения принадлежат к потомственной линии R-M269 (R1b1a2).
См. также
[ редактировать ]
Генетика
[ редактировать ]- Генетическая история Ближнего Востока
- Таблица перевода гаплогрупп Y-хромосомы
- Генетическая генеалогия
- Гаплогруппа
- Гаплотип
- Гаплогруппа ДНК Y-хромосомы человека
- Молекулярная филогения
- Парагруппа
- Субклад
- Y-хромосома Аарон
- Гаплогруппы Y-хромосомы в популяциях мира
- Гаплогруппы Y-ДНК по этническим группам
- Гаплогруппы Y-ДНК у населения Южной Азии
- Гаплогруппы Y-ДНК в популяциях Восточной и Юго-Восточной Азии
- Гаплогруппы Y-ДНК у населения Ближнего Востока
- Гаплогруппы Y-ДНК у населения Северной Африки
- Гаплогруппы Y-ДНК у населения Кавказа
Субклады Y-ДНК R-M207
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Кивисилд 2003
- ^ Соареш 2010
- ^ ( Уэллс 2001 ) [ мертвая ссылка ]
- ^ Гаплогруппа R Y-ДНК и ее субклады - 2008 г. от ISOGG.
- ^ «СНП Трекер» .
- ^ Хаак, Вольфганг; Лазаридис, Иосиф; Паттерсон, Ник; Роланд, Надин; Маллик, Свапан; Пламя, Бастьен; Брандт, Гвидо; Норденфилд, Сюзанна; Харни, Эдаоин; Стюардсон, Кристина; Фу, Цяомэй (10 февраля 2015 г.). «Массовая миграция из степей в индоевропейские языки в Европе » bioRxiv : 013433. arXiv : 1502.02783 . дои : 10.1101/013433 . S2CID 196643946 .
- ^ Сааг, Лехти; Васильев Сергей Владимирович; Варул, Лийви; Косорукова Наталья Владимировна; Герасимов Дмитрий В.; Ошибкина Светлана Владимировна; Гриффит, Сэмюэл Дж.; Сольник, Ану; Сааг, Лаури; Д'Атанасио, Евгения; Мецпалу, Эне (январь 2021 г.). «Изменения генетического происхождения при переходе от каменного века к бронзовому веку на восточноевропейской равнине» . Достижения науки . 7 (4): eabd6535. Бибкод : 2021SciA....7.6535S . дои : 10.1126/sciadv.abd6535 . ПМЦ 7817100 . ПМИД 33523926 .
- ^ Фу К., Пост С., Хайдиняк М., Петр М., Маллик С., Фернандес Д. и др. (июнь 2016 г.). «Генетическая история Европы ледникового периода» . Природа . 534 (7606): 200–5. Бибкод : 2016Natur.534..200F . дои : 10.1038/nature17993 . hdl : 10211.3/198594 . ПМЦ 4943878 . ПМИД 27135931 .
- ^ Хаак, Вольфганг; Лазаридис, Иосиф; Паттерсон, Ник; Роланд, Надин; Маллик, Свапан; Ламас, Бастьен; Брандт, Гвидо; Норденфельт, Сюзанна; Харни, Эдаоин; Стюардсон, Кристин; Фу, Цяомэй (июнь 2015 г.). «Массовая миграция из степи явилась источником индоевропейских языков в Европе» . Природа . 522 (7555): 207–211. arXiv : 1502.02783 . Бибкод : 2015Natur.522..207H . дои : 10.1038/nature14317 . ISSN 1476-4687 . ПМК 5048219 . ПМИД 25731166 .
- ^ «Результаты для членов R1b1» . Архивировано из оригинала 13 марта 2009 года . Проверено 27 декабря 2019 г.
- ^ Лелл Джеффри Т.; Сукерник Рем И.; Стариковская Елена Борисовна; Су Бин; Цзинь Ли; Шурр Теодор Г.; Андерхилл Питер А.; Уоллес Дуглас К. (2002). «Двойное происхождение и сибирское сходство коренных американцев» . Американский журнал генетики человека . 70 (1): 192–206. дои : 10.1086/338457 . ПМЦ 384887 . ПМИД 11731934 .
- ^ Рагхаван Маанаса; Скоглунд Понтус; Эрл Келли Э.; Мецпалу Мейт; Альбрехцен Андерс; Мольтке Ида; Расмуссен Саймон; Томас В. Стаффорд младший; Орландо Людовик; Мецпалу Эне; Кармин Моника; Кристина Тамбец; Рутси Сири; Волшебный Ридик; Кампос Паула Ф.; Елена Балановская; Олег Балановский; Хуснутдинова Эльза; Литвинов Сергей; Осипова Людмила П.; Федорова Сардана А.; Воевода Михаил Иванович; ДеДжорджио Майкл; Зихеритц-Понтен Томас; Брунак Сорен; и др. (2013). "(2 января 2014 г.). "Геном верхнепалеолита Сибири обнаруживает двойное происхождение коренных американцев" " . Природа . 505 (7481): 87–91. Бибкод : 2014Natur.505...87R . дои : 10.1038/nature12736 . ПМК 4105016 . ПМИД 24256729 .
- ^ Андерхилл, Питер А. (2015), «Филогенетическая и географическая структура гаплогруппы R1a Y-хромосомы», European Journal of Human Genetics , 23 (1): 124–131, doi : 10.1038/ejhg.2014.50 , PMC 4266736 , PMID 24667786
- ^ Андерхилл 2014 , с. 130.
- ^ Перейти обратно: а б с Памджав 2012 .
- ^ Андерхилл 2014 .
- ^ Перейти обратно: а б Мирослава Деренко и др. 2005, Контрастные закономерности вариаций Y-хромосомы в южно-сибирских популяциях из Байкальского и Алтае-Саянского регионов. Архивировано 30 марта 2022 года в Wayback Machine.
- ^ Харьков В.Н. (2007), «Различия генофонда северных и южных Алтайцев, выведенные на основе данных о гаплогруппах Y-хромосомы», Генетика , 43 (5): 675–87, doi : 10.1134/S1022795407050110 , PMID 17633562 , S2CID 566825
- ^ Робино С., Кробу Ф., Ди Гаэтано С. и др. (май 2008 г.). «Анализ гаплогрупп SNP Y-хромосомы и гаплотипов STR в выборке населения Алжира». Межд. Дж. Юридическая Мед . 122 (3): 251–5. дои : 10.1007/s00414-007-0203-5 . ПМИД 17909833 . S2CID 11556974 .
- ^ «Вариации R1b Ydna в Европе: распространение и происхождение | WorldFamilies.net» . www.worldfamilies.net . Архивировано из оригинала 9 октября 2018 года . Проверено 27 декабря 2019 г.
- ^ Большинство европейских мужчин связаны с Тутанхамом: анализ ДНК выявил странную генетическую связь между европейцами; Как ни странно, большинство египтян не являются членами семьи , Метро Нью-Йорк, 2 августа 2011 г., заархивировано из оригинала 23 марта 2012 г. , получено 14 сентября 2011 г.
{{citation}}: Неизвестный параметр|agency=игнорируется ( помогите ) - ^ «На примере выборки из 105 филиппинцев компания Applied Biosystems проанализировала Y-ДНК среднего филиппинца и обнаружила, что около 0,95% образцов имеют гаплотип Y-ДНК «H1a», который наиболее распространен на юге страны. В Азии и распространились на Филиппины через доколониальных индийских миссионеров, которые распространяли индуизм и основали индийские раджанаты, такие как Себу и Бутуан. 13%-ная частота R1b также указывает на испанскую примесь» . Архивировано из оригинала 25 мая 2017 года . Проверено 20 октября 2021 г.
- ^ «Ручная сортировка» . Архивировано из оригинала 26 октября 2022 года . Проверено 26 октября 2022 г.
- ^ Филиппинский проект ДНК. Архивировано 4 февраля 2023 г. в Wayback Machine - Классическая диаграмма Y-ДНК.
- ^ Обратите внимание, что в более ранней литературе для определения гаплогруппы «R1b» использовался маркер M269, а не M343. Затем какое-то время (с 2003 по 2005 год) то, что сейчас называется R1b1c, называлось R1b3.
Цитируемые работы
[ редактировать ]- Гайден, Т; Каденас, AM; Регейро, М; Сингх, Северная Каролина; Животовский, Л.А.; Андерхилл, Пенсильвания; Кавалли-Сфорца, LL; Эррера, Р.Дж. (2007), «Гималаи как направленный барьер для потока генов», Американский журнал генетики человека , 80 (5): 884–94, doi : 10.1086/516757 , PMC 1852741 , PMID 17436243
- Бехар; Томас, Миннесота; Скорецкий, К; Хаммер, МФ; Булыгина Е; Розенгартен, Д; Джонс, Алабама; Хелд, К; Моисей, В. (2003), «Множественное происхождение ашкеназских левитов: свидетельства Y-хромосомы как ближневосточного, так и европейского происхождения» (PDF) , Am. Дж. Хум. Жене. , том. 73, нет. 4, стр. 768–779, номер документа : 10.1086/378506 , PMC 1180600 , PMID 13680527.
- Луиджи Лука Кавалли-Сфорца (1994), История и география человеческих генов , Princeton University Press, ISBN 978-0-691-08750-4
- Чинниоглу, К; и др. (2004), «Раскопки слоев гаплотипов Y-хромосомы в Анатолии», Hum Genet , 114 (2): 127–48, doi : 10.1007/s00439-003-1031-4 , PMID 14586639 , S2CID 10763736
- Фирасат, С.; Халик, С.; Мохьюддин, А.; Папайоанну, М.; Тайлер-Смит, К.; Андерхилл, Пенсильвания; Аюб, К. (2007). «Y-хромосомные доказательства ограниченного вклада греков в патанское население Пакистана» . Европейский журнал генетики человека . 15 (1): 121–26. дои : 10.1038/sj.ejhg.5201726 . ПМЦ 2588664 . ПМИД 17047675 .
- Кивисилд, Т.; Роотси, С.; Метспалу, М.; Мастана, С.; Калдма, К.; Парик, Дж.; Метспалу, Э.; Адоджаан, М.; Толк, Х.-В.; Степанов В.; Гёльге, М.; Усанга, Э.; Папиха, СС; Чинниоглу, К.; Кинг, Р.; Кавалли-Сфорца, Л.; Андерхилл, Пенсильвания; Виллемс, Р. (2003). «Генетическое наследие первых поселенцев сохраняется как в индийских племенных, так и в кастовых популяциях» . Американский журнал генетики человека . 72 (2): 313–332. дои : 10.1086/346068 . ISSN 0002-9297 . ПМК 379225 . ПМИД 12536373 .
- Лобов А.С. и др. (2009). «Структура генофонда башкирских субпопуляций» (PDF) (на русском языке). Архивировано из оригинала (PDF) 16 августа 2011 года.
- Памджав (декабрь 2012 г.), «Краткое сообщение: Новые бинарные маркеры Y-хромосомы улучшают филогенетическое разрешение в гаплогруппе R1a1», Американский журнал физической антропологии , 149 (4): 611–615, doi : 10.1002/ajpa.22167 , PMID 23115110
- Пассарино; и др. (2002), «Различные генетические компоненты норвежской популяции, выявленные с помощью анализа полиморфизмов мтДНК и Y-хромосомы», Eur. Дж. Хум. Жене. , том. 10, нет. 9, стр. 521–9, doi : 10.1038/sj.ejhg.5200834 , PMID 12173029
- Саха; и др. (2005), «Генетическая близость между пятью различными группами населения в Индии, отражающая поток генов Y-хромосомы», J. Hum. Жене. , том. 50, нет. 1, стр. 49–51, номер документа : 10.1007/s10038-004-0219-3 , PMID 15611834.
- Семино; и др. (2000), «Генетическое наследие палеолитического Homo sapiens sapiens у современных европейцев» (PDF) , Science , vol. 290, нет. 5494, стр. 1155–9, Bibcode : 2000Sci...290.1155S , doi : 10.1126/science.290.5494.1155 , PMID 11073453 , заархивировано из оригинала (PDF) 25 ноября 2003 г.
- Сенгупта; и др. (2005), «Полярность и временность распределения Y-хромосомы с высоким разрешением в Индии определяют как местное, так и экзогенное распространение и выявляют незначительное генетическое влияние скотоводов Центральной Азии», Am. Дж. Хум. Жене. , том. 78, нет. 2, стр. 202–21, doi : 10.1086/499411 , PMC 1380230 , PMID 16400607.
- Шарма, Сваркар; Рай, Экта; Бхат, Аудеш К; Бханвер, Амарджит С; Бамезай, Рамешвар Н.К. (2007). «Новая подгруппа Q5 гаплогруппы Q Y-хромосомы человека в Индии» . Эволюционная биология BMC . 7 (1): 232. Бибкод : 2007BMCEE...7..232S . дои : 10.1186/1471-2148-7-232 . ПМК 2258157 . ПМИД 18021436 .
- Соарес; и др. (2010), «Археогенетика Европы», Current Biology , 20 (4): R174–83, Bibcode : 2010CBio...20.R174S , doi : 10.1016/j.cub.2009.11.054 , PMID 20178764 , S2CID 7679921
- Уэллс; и др. (2001), «Евразийский центр: континентальный взгляд на разнообразие Y-хромосомы», Proc. Натл. акад. наук. США , том. 98, нет. 18, стр. 10244–9, Bibcode : 2001PNAS...9810244W , doi : 10.1073/pnas.171305098 , PMC 56946 , PMID 11526236 . Также [1]
- Россер Ж.Х., Зержал Т., Хёрлес М.Е., Адохаан М., Алавантик Д., Аморим А., Амос В., Арментерос М. и др. (2000). «Разнообразие Y-хромосомы в Европе является клинальным и зависит в первую очередь от географии, а не от языка» . Американский журнал генетики человека . 67 (6): 1526–1543. дои : 10.1086/316890 . ПМЦ 1287948 . ПМИД 11078479 .
