Соматическая эволюция при раке
Соматическая эволюция — это накопление мутаций и эпимутаций в соматических клетках (клетках организма, в отличие от зародышевой плазмы и стволовых клеток ) в течение жизни, а также влияние этих мутаций и эпимутаций на приспособленность этих клеток. Этот эволюционный процесс впервые был показан в исследованиях Берта Фогельштейна при раке толстой кишки. Соматическая эволюция важна в процессе старения, а также в развитии некоторых заболеваний, включая рак.
Естественный отбор при раке
[ редактировать ]Клетки предзлокачественных и злокачественных новообразований ( опухолей ) эволюционируют путем естественного отбора . [1] [2] Это объясняет, как рак развивается из нормальной ткани и почему его трудно вылечить. Существуют три необходимых и достаточных условия естественного отбора, все из которых выполняются в новообразовании:
- Должно быть разнообразие в популяции. Новообразования представляют собой мозаику различных мутантных клеток с генетическими и эпигенетическими изменениями, отличающими их от нормальных клеток.
- Переменные признаки должны быть наследуемыми. Когда раковая клетка делится, обе дочерние клетки наследуют генетические и эпигенетические аномалии родительской клетки, а также могут приобретать новые генетические и эпигенетические аномалии в процессе клеточного размножения.
- Это изменение должно влиять на выживание или воспроизводство ( приспособленность ). Хотя многие генетические и эпигенетические аномалии новообразований, вероятно, являются нейтральной эволюцией , было показано, что многие из них увеличивают пролиферацию мутантных клеток или снижают скорость их гибели ( апоптоз ). [3] (См. клейма ниже)
Клетки новообразований конкурируют за ресурсы, такие как кислород и глюкоза, а также за пространство. Таким образом, клетка, которая приобретает мутацию, повышающую ее приспособленность, будет генерировать больше дочерних клеток, чем клетки-конкуренты, у которых нет этой мутации. Таким образом, популяция мутантных клеток, называемая клоном, может размножаться в новообразовании. Клональная экспансия является признаком естественного отбора при раке.
Терапия рака действует как форма искусственного отбора, убивая чувствительные раковые клетки, но оставляя после себя резистентные клетки . Часто опухоль вырастает из этих резистентных клеток, у пациента происходит рецидив, и ранее использованная терапия больше не убивает раковые клетки. Этот отбор на устойчивость аналогичен многократному опрыскиванию культур пестицидом и отбору устойчивых вредителей до тех пор, пока пестицид не перестанет действовать.
Эволюция в сложных биологических системах
[ редактировать ]Современные описания биологической эволюции обычно подробно описывают основные факторы, способствующие эволюции, такие как формирование локальной микросреды, устойчивость к мутациям, молекулярная вырожденность и загадочные генетические вариации. [4] Многие из этих факторов, способствующих эволюции, были выделены и описаны для рака. [5]
Многоуровневый отбор
[ редактировать ]Рак является классическим примером того, что биологи-эволюционисты называют многоуровневым отбором : на уровне организма рак обычно приводит к летальному исходу, поэтому происходит отбор генов и организации тканей. [6] [7] которые подавляют рак. На уровне клетки происходит отбор на повышенную пролиферацию и выживаемость клеток, так что мутантная клетка приобретает один из признаков рака. [3] (см. ниже), будет иметь конкурентное преимущество перед клетками, не имеющими этого отличительного знака. Таким образом, на уровне клетки происходит отбор на рак.
История
[ редактировать ]Пре-Ноуэлл и Кэрнс
[ редактировать ]Самые ранние идеи об эволюции опухолей исходят от Бовери. [8] который предположил, что опухоли возникают в результате хромосомных аномалий, передающихся дочерним клеткам. В последующие десятилетия было признано, что рак имеет клональное происхождение, связанное с хромосомными аберрациями. [9] [10] [11] [12]
Раннее математическое моделирование рака, проведенное Армитиджем и Доллом , подготовило почву для будущего развития соматической эволюционной теории рака. Армитидж и Долл объяснили данные о заболеваемости раком в зависимости от возраста процессом последовательного накопления соматических мутаций (или других шагов, ограничивающих скорость). [13]
Достижения цитогенетики способствовали обнаружению хромосомных аномалий в новообразованиях, в том числе филадельфийской хромосомы при хроническом миелогенном лейкозе. [14] и транслокации при остром миелобластном лейкозе. [15] Наблюдали последовательности кариотипов, сменяющих друг друга в опухоли по мере ее прогрессирования. [16] [17] [18] Исследователи выдвинули гипотезу, что рак развивается в результате последовательности хромосомных мутаций и отбора. [6] [17] [19] [20] и что терапия может дополнительно отбирать клоны. [12]
Кнудсон, Кэрнс и Ноуэлл
[ редактировать ]В 1971 году Кнудсон опубликовал гипотезу двух совпадений мутации и рака, основанную на статистическом анализе наследственных и спорадических случаев ретинобластомы. [21] Он предположил, что ретинобластома развилась в результате двух мутаций; один из которых может быть наследственным или соматическим, за которым следует вторая соматическая мутация. Цитогенетические исследования локализовали эту область на длинном плече хромосомы 13, а молекулярно-генетические исследования показали, что онкогенез связан с хромосомными механизмами, такими как митотическая рекомбинация или нерасхождение, которые могут привести к гомозиготности мутации. [22] Ген ретинобластомы был первым геном-супрессором опухоли, клонированным в 1986 году.
В 1975 году Кэрнс выдвинул гипотезу о другом, но дополнительном механизме подавления опухоли, основанном на тканевой архитектуре для защиты от отбора вариантов соматических клеток с повышенной приспособленностью к пролиферирующим эпителиальным популяциям, таким как кишечник и другие эпителиальные органы. [6] Он предположил, что этого можно достичь, ограничив количество стволовых клеток, например, в основании кишечных крипт, и ограничив возможности конкуренции между клетками за счет выделения дифференцированных кишечных клеток в кишечник. Основные предсказания этой модели были подтверждены, хотя мутации в некоторых генах-супрессорах опухолей, включая CDKN2A (p16), предрасполагают к клональной экспансии, которая охватывает большое количество крипт при некоторых состояниях, таких как пищевод Барретта. Он также постулировал существование бессмертной цепи ДНК, которая обсуждается в гипотезе бессмертной цепи ДНК .
В 1976 году Ноуэлл синтезировал эволюционный взгляд на рак как на процесс генетической нестабильности и естественного отбора. [1] Большинство происходящих изменений вредны для клетки, и эти клоны имеют тенденцию вымирать, но время от времени возникают избирательно полезные мутации, которые приводят к клональной экспансии. Эта теория предсказывает уникальный генетический состав каждого новообразования из-за случайного процесса мутаций, генетического полиморфизма в человеческой популяции и различий в давлении отбора микроокружения новообразования. Прогнозируется, что вмешательства будут иметь разные результаты у разных пациентов. Что еще более важно, теория предсказывает появление устойчивых клонов под избирательным давлением терапии. С 1976 года исследователи выявили клональную экспансию. [23] [24] [25] [26] [27] [28] и генетическая гетерогенность [29] [30] [31] [32] [33] [34] во многих различных типах новообразований.
Соматическая эволюция в прогрессе
[ редактировать ]Генетическая гетерогенность в новообразованиях
[ редактировать ]Существует несколько уровней генетической гетерогенности, связанных с раком, включая однонуклеотидный полиморфизм (SNP), [35] мутации последовательности, [30] Микросателлитные сдвиги [29] и нестабильность, [36] потеря гетерозиготности (LOH), [34] Изменение числа копий (обнаруживается как с помощью сравнительной геномной гибридизации (CGH), так и с помощью сравнительной геномной гибридизации (CGH), [31] и массив CGH, [37] ) и кариотипические вариации, включая структурные аберрации хромосом и анеуплоидию. [32] [33] [38] [39] [40] Исследования этого вопроса были сосредоточены в основном на уровне генных мутаций, поскольку изменение числа копий, LOH и специфические хромосомные транслокации объясняются в контексте генной мутации. Таким образом, необходимо интегрировать несколько уровней генетической изменчивости в контексте сложной системы и многоуровневого отбора.
Нестабильность системы является основным фактором, способствующим генетической гетерогенности. [41] Для большинства видов рака нестабильность генома отражается в большой частоте мутаций во всей последовательности ДНК генома (а не только в областях, кодирующих белок, которые составляют всего 1,5% генома). [42] ). При полногеномном секвенировании различных типов рака было обнаружено большое количество мутаций в двух видах рака молочной железы (около 20 000 точечных мутаций). [43] ), 25 меланом (от 9000 до 333000 точковых мутаций) [44] ) и рак легких (50 000 точковых мутаций и 54 000 небольших добавлений и делеций). [45] ). Нестабильность генома также называют благоприятной характеристикой для достижения конечных точек эволюции рака. [3]
Многие соматические эволюционные исследования традиционно были сосредоточены на клональной экспансии, поскольку можно проследить повторяющиеся типы изменений, чтобы проиллюстрировать эволюционный путь на основе доступных методов. Недавние исследования, основанные на прямом секвенировании ДНК и анализе кариотипа, иллюстрируют важность высокого уровня гетерогенности в соматической эволюции. Для формирования солидных опухолей необходимо участие множественных циклов клональной и неклональной экспансии. [39] [46] Даже на типичной фазе клональной экспансии существуют значительные уровни гетерогенности внутри клеточной популяции, однако большинство из них не выявляется, когда смешанные популяции клеток используются для молекулярного анализа. В солидных опухолях большинство генных мутаций не являются рецидивирующими. [47] и кариотипы тоже. [39] [41] Эти анализы дают объяснение выводам о том, что не существует общих мутаций, свойственных большинству видов рака. [48]
Соматическая эволюция эпигенетикой
[ редактировать ]состояние клетки может меняться эпигенетически Помимо генетических изменений, . Наиболее изученными эпигенетическими изменениями в опухолях являются подавление или экспрессия генов за счет изменений метилирования пар CG нуклеотидов в промоторных областях генов. Эти закономерности метилирования копируются в новые хромосомы, когда клетки реплицируют свои геномы, поэтому изменения метилирования передаются по наследству и подлежат естественному отбору. Считается, что изменения метилирования происходят чаще, чем мутации в ДНК, и поэтому могут быть причиной многих изменений во время неопластической прогрессии (процесса, в результате которого нормальная ткань становится раковой), особенно на ранних стадиях. Например, когда потеря экспрессии белка репарации ДНК MGMT происходит при раке толстой кишки, она вызвана мутацией только примерно в 4% случаев, тогда как в большинстве случаев потеря связана с метилированием его промоторной области. [49] Аналогичным образом, когда потеря экспрессии белка репарации ДНК PMS2 происходит при раке толстой кишки, это вызвано мутацией примерно в 5% случаев, тогда как в большинстве случаев потеря экспрессии происходит из-за метилирования промотора его партнера по спариванию MLH1 ( PMS2 нестабильен в отсутствие MLH1). [50] Эпигенетические изменения в прогрессировании взаимодействуют с генетическими изменениями. Например, эпигенетическое молчание генов, ответственных за восстановление неправильных пар или повреждений в ДНК (например, MLH1 или MSH2), приводит к увеличению числа генетических мутаций.
Дефицит белков репарации ДНК PMS2 , MLH1 , MSH2 , MSH3 , MSH6 или BRCA2 может привести к увеличению частоты мутаций до 100 раз. [51] [52] [53] Эпигенетические нарушения экспрессии белков генов репарации ДНК были обнаружены при многих видах рака, хотя не все недостатки были оценены при всех видах рака. Эпигенетически дефицитные белки репарации ДНК включают BRCA1 , WRN , MGMT , MLH1 , MSH2 , ERCC1 , PMS2 , XPF, P53 , PCNA и OGG1 , и обнаружено, что их дефицит встречается с частотой от 13% до 100% при различных видах рака. [ нужна ссылка ] (Также см. Частоты эпимутаций в генах репарации ДНК .)
В дополнение к хорошо изученному метилированию эпигенетического промотора, совсем недавно были получены существенные данные об эпигенетических изменениях при раке из-за изменений в архитектуре гистонов и хроматина, а также изменений в экспрессии микроРНК (микроРНК либо вызывают деградацию информационных РНК , либо блокируют их трансляцию ). [54] Например, гипометилирование промотора . микроРНК миР-155 увеличивает экспрессию миР-155, и эта повышенная миР-155 нацелена на гены репарации ДНК MLH1, MSH2 и MSH6, вызывая снижение экспрессии каждого из них [55]
При раке потеря экспрессии генов происходит примерно в 10 раз чаще из-за подавления транскрипции (вызванного соматически наследуемым гиперметилированием промоторов CpG-островков), чем из-за мутаций. Как Фогельштейн и др. Обратите внимание, что при колоректальном раке обычно имеется от 3 до 6 мутаций водителя и от 33 до 66 мутаций автостопщика или пассажира. [56] Напротив, в опухолях толстой кишки по сравнению с прилегающей нормальной на вид слизистой оболочкой толстой кишки имеется от 600 до 800 соматически наследуемых сильно метилированных CpG-островков в промоторах генов в опухолях, в то время как эти CpG-островки не метилированы в прилегающей слизистой оболочке. [57] [58] [59]
Метилирование цитозина динуклеотидов CpG является соматически наследуемой и консервативной регуляторной меткой, которая обычно связана с репрессией транскрипции. Островки CpG сохраняют свое общее неметилированное состояние (или метилированное состояние) чрезвычайно стабильно на протяжении нескольких поколений клеток. [60]
Клональные расширения
[ редактировать ]Одной из общих черт неопластической прогрессии является распространение клона с генетическими или эпигенетическими изменениями. Это может быть делом случая, но более вероятно из-за того, что расширяющийся клон имеет конкурентное преимущество (либо репродуктивное, либо выживающее) над другими клетками в ткани. Поскольку клоны часто имеют множество генетических и эпигенетических изменений в своих геномах, часто неясно, какие из этих изменений обеспечивают репродуктивное преимущество или преимущество в выживании, а какие другие изменения являются просто мутациями автостопа или пассажирами (см. Глоссарий ниже) при клональной экспансии.
Клональная экспансия чаще всего связана с потерей генов-супрессоров опухоли p53 (TP53) или p16 (CDKN2A/INK4a). При раке легких клон с мутацией р53 распространился по поверхности одного легкого и проник в другое легкое. [27] При раке мочевого пузыря клоны с потерей р16 распространялись по всей поверхности мочевого пузыря. [61] [62] Аналогичным образом, в полости рта наблюдалось большое распространение клонов с потерей р16. [24] и в пищеводе Барретта . [25] В коже также наблюдались клональные экспансии, связанные с инактивацией р53. [23] [63] пищевод Барретта , [25] мозг, [64] и почки. [65] Дальнейшая клональная экспансия наблюдалась в желудке. [66] мочевой пузырь, [67] толстая кишка, [68] легкое, [69] кроветворные (кровяные) клетки, [70] и простата. [71]
Эти клональные экспансии важны как минимум по двум причинам. Во-первых, они создают большую целевую популяцию мутантных клеток и таким образом увеличивают вероятность того, что множественные мутации, необходимые для возникновения рака, будут приобретены внутри этого клона. Во-вторых, по крайней мере в одном случае размер клона с потерей р53 был связан с повышенным риском превращения предраковой опухоли в раковую. [72] Считается, что процесс развития рака включает последовательные волны клональной экспансии внутри опухоли. [73]
Полевые дефекты
[ редактировать ]
Термин «поле канцеризации» был впервые использован в 1953 году для описания области или «поля» эпителия, который был предварительно обусловлен (в то время) в значительной степени неизвестными процессами, предрасполагающими его к развитию рака. [74] С тех пор термины «полевая канцеризация» и «полевой дефект» используются для описания предраковой ткани, в которой вероятно возникновение нового рака. Дефекты поля, например, были идентифицированы в большинстве основных областей, подверженных онкогенезу в желудочно-кишечном тракте. [75] Рак желудочно-кишечного тракта, который, как показано, в некоторой степени обусловлен дефектами поля, включает плоскоклеточный рак головы и шеи (HNSCC) , рак ротоглотки/гортани , аденокарциному пищевода и плоскоклеточный рак пищевода , рак желудка , рак желчных протоков. , рак поджелудочной железы , рак тонкой кишки и рак толстой кишки .
В толстой кишке дефект поля , вероятно, возникает в результате естественного отбора мутантной измененной или эпигенетически клетки среди стволовых клеток в основании одного из кишечных крипт на внутренней поверхности толстой кишки. Мутантная или эпигенетически измененная стволовая клетка, если она имеет селективное преимущество, может заменить другие близлежащие стволовые клетки путем естественного отбора. Это может привести к появлению участка аномальной ткани или дефекта поля. Рисунок в этом разделе включает фотографию свежерезецированного и продольно открытого сегмента толстой кишки, который может представлять собой большой полевой дефект, в котором имеется рак толстой кишки и четыре полипа . Четыре полипа, помимо рака, могут представлять собой субклоны с пролиферативными преимуществами.
Последовательность событий, приводящих к возникновению этого возможного дефекта поля, указана под фотографией. На схематической диаграмме показана большая область желтого цвета, обозначающая большой участок мутантных или эпигенетически измененных клеток, образовавшихся в результате клональной экспансии исходной клетки на основе селективного преимущества. Внутри этого первого большого участка могла произойти вторая подобная мутация или эпигенетическое изменение, так что данная стволовая клетка приобрела дополнительное селективное преимущество по сравнению с другими стволовыми клетками в пределах участка, и эта измененная стволовая клетка клонально размножилась, образуя вторичный участок, или субклон в исходном патче. На схеме это обозначено четырьмя меньшими пятнами разного цвета внутри большой желтой исходной области. Внутри этих новых участков (субклонов) процесс мог повторяться несколько раз, на что указывают еще меньшие участки в четырех вторичных участках (с по-прежнему разными цветами на диаграмме), которые клонально расширялись, пока не возникла стволовая клетка, которая произвела либо небольшие полипы (которые могут быть доброкачественными) новообразования ) или же злокачественное новообразование (рак). Эти новообразования также обозначены на схеме под фотографией 4 маленькими коричневыми кружками (полипами) и более крупным красным участком (рак). Рак на фотографии возник в слепокишечной области толстой кишки, где толстая кишка соединяется с тонкой кишкой (помечено) и где находится аппендикс (помечено). Жир на фотографии находится снаружи внешней стенки толстой кишки. В показанном здесь сегменте толстой кишки толстая кишка была разрезана вдоль, чтобы обнажить внутреннюю поверхность толстой кишки и выявить рак и полипы, возникающие во внутренней эпителиальной выстилке толстой кишки.
Филогенетический анализ
[ редактировать ]Филогенетику можно применять к клеткам в опухолях, чтобы выявить эволюционные связи между клетками, точно так же, как она используется для выявления эволюционных связей между организмами и видами. Шибата, Таваре и коллеги использовали это, чтобы оценить время между возникновением опухоли и ее обнаружением в клинике. [29] Лоухелайнен и др. использовали экономию , чтобы реконструировать отношения между образцами биопсии на основе потери гетерозиготности. [76] Филогенетические деревья не следует путать с онкогенетическими деревьями. [77] которые представляют собой общие последовательности генетических событий во время неопластической прогрессии и не отражают отношения общего происхождения, которые важны для филогении. Актуальный обзор в этой области см. в Bast 2012. [78]
Адаптивные ландшафты
[ редактировать ]Адаптивный ландшафт — это гипотетический топологический ландшафт, на котором, как предполагается, происходит эволюция. Это похоже на фитнес-ландшафт Райта. [79] [80] в котором расположение каждой точки представляет генотип организма, а высота представляет приспособленность этого организма к текущей среде. Однако, в отличие от жесткого ландшафта Райта, адаптивный ландшафт податлив. Он легко меняет форму с изменениями плотности населения и стратегий выживания/воспроизведения, используемых внутри и среди различных видов.
Теория эволюции Райта смещающегося баланса сочетает в себе генетический дрейф (случайную ошибку выборки при передаче генов) и естественный отбор , чтобы объяснить, как могут быть заняты несколько пиков на ландшафте приспособленности или как популяция может достичь более высокого пика на этом ландшафте. Эта теория, основанная на предположении, что отбор, зависящий от плотности , является основной формой отбора, приводит к относительно жесткой ландшафту приспособленности. Жесткий ландшафт — это ландшафт, который не меняется в ответ даже на большие изменения в положении и составе стратегий на ландшафте.
В отличие от ландшафта приспособленности, адаптивный ландшафт строится на предположении, что задействован отбор, зависящий как от плотности, так и от частоты (отбор является частотно-зависимым, когда приспособленность вида зависит не только от стратегии этого вида, но и от стратегии всех других видов). разновидность). Таким образом, форма адаптивного ландшафта может радикально измениться в ответ даже на небольшие изменения в стратегиях и плотности населения. [81]
Гибкость адаптивных ландшафтов предоставляет естественному отбору несколько способов пересечь долины и занять несколько вершин без необходимости внесения серьезных изменений в свои стратегии. В контексте моделей дифференциальных уравнений или моделей разностных уравнений для динамики населения адаптивный ландшафт фактически может быть построен с использованием производящей функции приспособленности . [82] Если данный вид способен развиваться, он со временем «поднимется» по адаптивному ландшафту к пику приспособленности посредством постепенных изменений своего среднего фенотипа в соответствии со стратегической динамикой, которая включает наклон адаптивного ландшафта. Поскольку адаптивный ландшафт не является жестким и может менять форму в ходе эволюционного процесса, вполне возможно, что вид может быть доведен до максимальной, минимальной или седловой точки адаптивного ландшафта. Популяция на глобальном максимуме адаптивного ландшафта соответствует эволюционно стабильной стратегии (ESS) и станет доминирующей, подталкивая всех остальных к вымиранию. Популяции в минимуме или седловой точке не устойчивы к инвазии, так что введение немного другого мутантного штамма может продолжить эволюционный процесс к незанятым локальным максимумам.
Адаптивный ландшафт представляет собой полезный инструмент для изучения соматической эволюции, поскольку он может описать процесс эволюции мутантной клетки из небольшой опухоли в инвазивный рак. Понимание этого процесса с точки зрения адаптивного ландшафта может привести к борьбе с раком посредством внешнего манипулирования формой ландшафта. [83] [84]
Признаки рака как эволюционные адаптации новообразования
[ редактировать ]В своей знаковой статье «Признаки рака » [3] Ханахан и Вайнберг предполагают, что рак можно описать с помощью небольшого количества основных принципов, несмотря на сложность заболевания. Авторы описывают, как прогрессирование опухоли происходит посредством процесса, аналогичного дарвиновской эволюции, где каждое генетическое изменение дает клетке преимущество в росте. Эти генетические изменения можно сгруппировать в шесть «отличительных признаков», которые заставляют популяцию нормальных клеток превращаться в рак. Шесть отличительных черт:
- самодостаточность в сигналах роста
- нечувствительность к сигналам, препятствующим росту
- уклонение от апоптоза
- безграничный репликативный потенциал
- устойчивый ангиогенез и
- инвазия тканей и метастазирование.
Генетическая нестабильность определяется как «благоприятная характеристика», которая облегчает приобретение других мутаций из-за дефектов репарации ДНК.
Отличительная черта «самодостаточность сигналов роста» описывает наблюдение, что опухолевые клетки производят множество собственных сигналов роста и, таким образом, больше не полагаются на сигналы пролиферации из микроокружения. Нормальные клетки поддерживаются в неделящемся состоянии с помощью сигналов, препятствующих росту, от которых раковые клетки учатся уклоняться посредством генетических изменений, вызывающих «нечувствительность к сигналам, препятствующим росту». Нормальная клетка инициирует запрограммированную клеточную смерть (апоптоз) в ответ на такие сигналы, как повреждение ДНК, сверхэкспрессия онкогенов и недостаточность факторов выживания, но раковая клетка учится «уклоняться от апоптоза», что приводит к накоплению аберрантных клеток. Большинство клеток млекопитающих могут реплицироваться ограниченное количество раз из-за прогрессирующего укорочения теломер; практически все злокачественные раковые клетки обретают способность сохранять свои теломеры, что обеспечивает «безграничный репликативный потенциал». Поскольку клетки не могут выжить на расстоянии более 100 мкм от источника крови, раковые клетки должны инициировать образование новых кровеносных сосудов, чтобы поддерживать свой рост посредством процесса «устойчивого ангиогенеза». Во время развития большинства видов рака первичные опухолевые клетки приобретают способность подвергаться «инвазии и метастазам», в результате чего они мигрируют в окружающие ткани и перемещаются в отдаленные участки тела, образуя вторичные опухоли.
Пути, по которым клетки превращаются в злокачественные опухоли, различны, и порядок приобретения признаков может варьироваться от опухоли к опухоли. Ранние генетические события онкогенеза трудно измерить клинически, но их можно смоделировать в соответствии с известными биологическими данными. [85] В настоящее время макроскопические опухоли начинают описывать с точки зрения лежащих в их основе генетических изменений, предоставляя дополнительные данные для уточнения концепции, описанной в книге «Признаки рака».
Клональная эволюция и раковые стволовые клетки
[ редактировать ]Моноклональная теория происхождения рака
[ редактировать ]Теория о моноклональном происхождении рака утверждает, что, как правило, новообразования возникают из одной клетки происхождения. [1] Хотя возможно, что некоторые канцерогены могут мутировать более чем в одной клетке одновременно, опухолевая масса обычно представляет собой потомство одной клетки или очень небольшого количества клеток. [1] В процессе канцерогенеза необходима серия мутаций, чтобы клетка превратилась из нормальной в предзлокачественную, а затем в раковую клетку. [86] Мутировавшие гены обычно относятся к классам смотрителя, привратника, ландшафтного дизайнера или нескольким другим генам. Мутация в конечном итоге приводит к приобретению десяти признаков рака.
Раковые стволовые клетки
[ редактировать ]Первую злокачественную клетку, дающую начало опухоли, часто называют раковой стволовой клеткой. [87]
что многие опухоли гетерогенны Гипотеза раковых стволовых клеток основана на том факте , – клетки в опухоли различаются по фенотипу и функциям. [87] [88] [89] Текущие исследования показывают, что при многих видах рака существует очевидная иерархия клеток. [87] [88] [89] в целом популяция клеток в опухоли небольшая – около 0,2–1% [88] – который обладает свойствами, подобными стволовым клеткам. Эти клетки обладают способностью давать начало различным клеткам опухолевой ткани, неограниченно самообновляться и при переносе могут образовывать новые опухоли. Согласно гипотезе, раковые стволовые клетки — единственные клетки, способные к онкогенезу — инициации новой опухоли. [87] Гипотеза раковых стволовых клеток могла бы объяснить такие явления, как метастазы и ремиссия .
Моноклональная модель рака и модель раковых стволовых клеток не исключают друг друга. [87] Раковые стволовые клетки возникают в результате клональной эволюции в результате отбора клеток с наибольшей приспособленностью в новообразовании . Таким образом, гетерогенную природу новообразования можно объяснить двумя процессами – клональной эволюцией, или иерархической дифференцировкой клеток, регулируемой раковыми стволовыми клетками. [87] Все виды рака возникают в результате соматической эволюции, но только некоторые из них соответствуют гипотезе раковых стволовых клеток. [87] Эволюционные процессы не прекращаются, когда в опухоли возникает популяция раковых стволовых клеток. Лекарства для лечения рака оказывают сильное избирательное воздействие на все типы клеток опухолей, включая раковые стволовые клетки, которые будут вынуждены вырабатывать устойчивость к лечению. Раковые стволовые клетки не всегда должны обладать самой высокой устойчивостью среди клеток опухоли, чтобы пережить химиотерапию и вновь появиться после нее. Выжившие клетки могут находиться в особом микроокружении , защищающем их от неблагоприятных последствий лечения. [87]
В настоящее время неясно, возникают ли раковые стволовые клетки в результате трансформации взрослых стволовых клеток, остановки созревания клеток-предшественников или в результате дедифференцировки зрелых клеток. [88]
Соматическая эволюция терапевтической резистентности
[ редактировать ]Терапевтическая резистентность наблюдалась практически при каждой форме терапии с самого начала лечения рака. [90] В большинстве случаев терапия, по-видимому, выбирает мутации в генах или путях, на которые воздействует препарат.
Резистентность к метотрексату
[ редактировать ]Некоторые из первых доказательств генетической основы приобретенной терапевтической резистентности были получены в ходе исследований метотрексата. Метотрексат ингибирует ген дигидрофолатредуктазы (DHFR). Однако терапия метотрексатом, по-видимому, отбирает клетки с дополнительными копиями (амплификацией) DHFR, которые устойчивы к метотрексату. Это наблюдалось как в клеточных культурах, так и в культурах клеток. [91] и образцы опухолей у пациентов, получавших метотрексат. [92] [93] [94] [95]
Устойчивость к 5-фторурацилу
[ редактировать ]Обычная цитотоксическая химиотерапия, используемая при различных видах рака, 5-фторурацил (5-ФУ), нацелена на путь TYMS, и резистентность может развиваться за счет эволюции дополнительных копий TYMS, тем самым ослабляя эффект препарата. [96]
Устойчивость к препаратам, нацеленным на BCR-ABL
[ редактировать ]В случае с Гливеком (иматинибом), который нацелен на слитый ген BCR-ABL при хроническом миелолейкозе , резистентность часто развивается вследствие мутации, которая изменяет форму сайта связывания препарата. [97] [98] Последовательное применение лекарств может привести к последовательной эволюции мутаций устойчивости к каждому лекарству поочередно. [99]
Гливек не так избирательен, как первоначально предполагалось. Оказывается, он нацелен на другие гены тирозинкиназы и может использоваться для контроля желудочно-кишечных стромальных опухолей (ГИСО) , вызванных мутациями в c-KIT. Однако у пациентов с GIST иногда возникает рецидив с дополнительными мутациями в c-KIT, которые делают раковые клетки устойчивыми к Гливеку. [100] [101]
Устойчивость к препаратам, нацеленным на EGFR
[ редактировать ]Гефитиниб (Иресса) и Эрлотиниб (Тарцева) представляют собой ингибиторы тирозинкиназы рецептора эпидермального фактора роста (EGFR), используемые для лечения пациентов с немелкоклеточным раком легких, опухоли которых имеют соматические мутации в EGFR. Однако опухоли большинства пациентов со временем становятся устойчивыми к этим препаратам. У пациентов, у которых развилась клиническая устойчивость к гефитинибу или эрлотинибу, были обнаружены два основных механизма приобретенной резистентности: [102] точечные мутации в гене EGFR, на которые воздействуют препараты, [103] и амплификация MET, другого рецептора тирозинкиназы, который может обходить EGFR и активировать нижестоящую передачу сигналов в клетке. В первоначальном исследовании 22% опухолей с приобретенной устойчивостью к гефитинибу или эрлотинибу имели амплификацию MET. [104] Для решения этих проблем в настоящее время проводятся клинические испытания необратимых ингибиторов EGFR (которые подавляют рост даже в клеточных линиях с мутациями в EGFR), комбинации ингибиторов EGFR и киназы MET, а также ингибиторов Hsp90 (оба EGFR и MET требуют, чтобы белки Hsp90 правильно сворачивались). ). Кроме того, повторные биопсии опухолей у пациентов по мере развития у них устойчивости к этим препаратам помогут понять динамику опухоли.
Резистентность к селективным модуляторам эстрогеновых рецепторов.
[ редактировать ]Селективные модуляторы рецепторов эстрогена (SERM) являются широко используемой адъювантной терапией при эстроген-рецептор-положительном (ERα+) раке молочной железы и профилактическим лечением для женщин с высоким риском заболевания. Существует несколько возможных механизмов резистентности СЭРМ, хотя относительная клиническая значимость каждого из них обсуждается. К ним относятся: [105] [106]
- Потеря рецептора альфа эстрогена (ERα) [107]
- Хотя это может быть механизмом резистентности у меньшинства женщин, большинство ERα+ опухолей, которые становятся устойчивыми к SERMS, остаются ERα+. [108]
- Повышенная относительная экспрессия ERβ по сравнению с ERα.
- Вмешательство/перекрестные помехи в сигнальных путях факторов роста, таких как EGFR/HER2.
- Мутации рецепторов эстрогена
- Изменения в корегуляторных белках
- Взаимодействие между SERM, ER и корегуляторными белками может влиять на то, действует ли SERM как антагонист эстрогена или как агонист эстрогена.
- Снижение метаболической активации тамоксифена. [109]
- Полиморфизмы CYP2D6 демонстрируют различную скорость превращения тамоксифена в его активированную антиэстрогенную форму. [110]
Резистентность к антиандрогенной терапии
[ редактировать ]Большинство случаев рака простаты происходят из клеток, пролиферация которых стимулируется андрогенами. Таким образом, большинство методов лечения рака простаты основаны на удалении или блокировании андрогенов. Мутации в андрогенном рецепторе (АР) наблюдались при антиандроген-резистентном раке предстательной железы, что делает АР гиперчувствительным к низким уровням андрогенов, которые остаются после терапии. [111] Аналогичным образом, дополнительные копии гена AR (амплификация) наблюдались при раке простаты, устойчивом к антиандрогенам. [112] Считается, что эти дополнительные копии гена делают клетки сверхчувствительными к низким уровням андрогенов и, таким образом, позволяют им размножаться при антиандрогенной терапии.
Устойчивость к лучевой терапии
[ редактировать ]Также часто наблюдается устойчивость к лучевой терапии. Однако на сегодняшний день сравнения злокачественных тканей до и после лучевой терапии для выявления генетических и эпигенетических изменений, вызванных воздействием радиации, не проводились. При глиомах , форме рака головного мозга, лучевая терапия, по-видимому, отбирает стволовые клетки. [113] [114] хотя неясно, возвращается ли опухоль к дотерапевтической доле раковых стволовых клеток после терапии или лучевая терапия выбирает изменение, которое сохраняет клетки глиомы в состоянии стволовых клеток.
Использование эволюции в терапии
[ редактировать ]Лекарства и методы лечения рака, обычно используемые сегодня, эволюционно инертны и представляют собой сильную силу отбора, которая приводит к лекарственной устойчивости. [115] Возможный способ избежать этого — использовать лечебный агент, который будет эволюционировать вместе с раковыми клетками.
Аноксические бактерии
[ редактировать ]Аноксические бактерии могут использоваться в качестве конкурентов или хищников в гипоксической среде внутри опухолей. [115] Учёные интересовались идеей использования бескислородных бактерий уже более 150 лет, но до недавнего времени прогресс в этой области был незначительным. По мнению Джайна и Форбса, клетки должны соответствовать нескольким требованиям, чтобы считаться эффективными противораковыми бактериями: [116]
- Бактерия не может быть токсичной для хозяина.
- Его популяция должна быть ограничена опухолевой массой.
- Он должен иметь возможность равномерно распределиться по всему новообразованию.
- В конце лечения бактерия должна быть легко удалена из организма хозяина.
- Оно не должно вызывать серьезную иммунную реакцию.
- Он должен быть способен вызывать гибель опухолевых клеток за счет конкуренции за питательные вещества.
В процессе лечения раковые клетки, скорее всего, разовьют ту или иную форму устойчивости к бактериальному лечению. Однако, будучи живым организмом, бактерии будут эволюционировать совместно с опухолевыми клетками, что потенциально исключает возможность резистентности. [116]
Возможные ограничения
[ редактировать ]Поскольку бактерии предпочитают бескислородную среду, они неэффективны при уничтожении клеток на периферии опухоли, где подача кислорода эффективна. Сочетание бактериального лечения с химическими препаратами увеличит шансы на уничтожение опухоли. [116]
Онколитические вирусы
[ редактировать ]Онколитические вирусы созданы для заражения раковых клеток. Ограничения этого метода включают иммунный ответ на вирус и возможность превращения вируса в патоген . [115]
Естественный отбор
[ редактировать ]Манипулируя средой опухоли, можно создать благоприятные условия для того, чтобы клетки с наименьшей устойчивостью к химиотерапевтическим препаратам стали более приспособленными и вытеснили остальную популяцию. Химиотерапия, проводимая сразу после этого, должна уничтожить преобладающие опухолевые клетки. [115]
Глоссарий
[ редактировать ]Сопоставление общих терминов из биологии рака и эволюционной биологии:
- Драйверная мутация — мутация, которая дает селективное преимущество клону в его микроокружении либо за счет увеличения его выживаемости, либо за счет увеличения воспроизводства. Мутации драйверов имеют тенденцию вызывать клональную экспансию.
- Пассажирская мутация — мутация, которая не влияет на приспособленность клона, но может быть связана с клональной экспансией, поскольку возникает в том же геноме, что и драйверная мутация. это известно как « автостоп» . В эволюционной биологии
- Клон — набор клеток, происходящих от общей предковой клетки. Клон обычно выделяется путем наследования характерного генетического повреждения (мутации), произошедшего в предковой клетке.
- Неопластическая прогрессия — соматический эволюционный процесс, в результате которого нормальная ткань превращается в злокачественную (раковую) ткань.
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б с д Nowell PC (октябрь 1976 г.). «Клональная эволюция популяций опухолевых клеток». Наука . 194 (4260): 23–28. Бибкод : 1976Sci...194...23N . дои : 10.1126/science.959840 . ПМИД 959840 .
- ^ Мерло Л.М., Пеппер Дж.В., Рид Б.Дж., Мэйли CC (декабрь 2006 г.). «Рак как эволюционный и экологический процесс» . Обзоры природы. Рак . 6 (12): 924–935. дои : 10.1038/nrc2013 . ПМИД 17109012 . S2CID 8040576 .
- ^ Jump up to: а б с д Ханахан Д., Вайнберг Р.А. (январь 2000 г.). «Признаки рака» . Клетка . 100 (1): 57–70. дои : 10.1016/S0092-8674(00)81683-9 . ПМИД 10647931 . S2CID 1478778 .
- ^ Уитакр Дж. М. (2011). «Генетические и обусловленные окружающей средой пути к инновациям: о возможности универсальной связи между устойчивостью и адаптацией в сложных биологических системах» . Эволюционная экология . 25 (5): 965–975. Бибкод : 2011EvEco..25..965W . дои : 10.1007/s10682-011-9464-z .
- ^ Тиан Т., Олсон С., Уитакр Дж. М., Хардинг А. (январь 2011 г.). «Истоки устойчивости и эволюционности рака» (PDF) . Интегративная биология . 3 (1): 17–30. дои : 10.1039/c0ib00046a . ПМИД 20944865 .
- ^ Jump up to: а б с Кэрнс Дж. (май 1975 г.). «Мутационный отбор и естественное течение рака». Природа . 255 (5505): 197–200. Бибкод : 1975Natur.255..197C . дои : 10.1038/255197a0 . ПМИД 1143315 . S2CID 4216433 .
- ^ Пеппер Дж.В., Спроуффске К., Мэйли CC (декабрь 2007 г.). «Модели дифференцировки клеток животных подавляют соматическую эволюцию» . PLOS Вычислительная биология . 3 (12): е250. Бибкод : 2007PLSCB...3..250P . дои : 10.1371/journal.pcbi.0030250 . ПМК 2134960 . ПМИД 18085819 . Также смотрите комментарий
- ^ Манчестер, КЛ (октябрь 1995 г.). «Теодор Бовери и происхождение злокачественных опухолей». Тенденции в клеточной биологии . 5 (10): 384–387. дои : 10.1016/S0962-8924(00)89080-7 . ПМИД 14732055 .
- ^ Макино С. (март 1956 г.). «Дополнительные доказательства в пользу концепции стволовых клеток при асцитных опухолях крыс». Анналы Нью-Йоркской академии наук . 63 (5): 818–830. Бибкод : 1956NYASA..63..818M . дои : 10.1111/j.1749-6632.1956.tb50894.x . ПМИД 13314436 . S2CID 28319058 .
- ^ Хаушка Т.С. (сентябрь 1961 г.). «Хромосомы в онтогенезе и онкогении». Исследования рака . 21 : 957–974. ПМИД 13712320 .
- ^ Леван А., Бизель Дж. Дж. (сентябрь 1958 г.). «Роль хромосом в канцерогенезе, изученная в серийной культуре тканей клеток млекопитающих» . Анналы Нью-Йоркской академии наук . 71 (6): 1022–1053. Бибкод : 1958NYASA..71.1022L . doi : 10.1111/j.1749-6632.1958.tb46820.x (неактивен 12 июля 2024 г.). ПМИД 13583868 . Архивировано из оригинала 5 января 2013 г.
{{cite journal}}
: CS1 maint: DOI неактивен по состоянию на июль 2024 г. ( ссылка ) - ^ Jump up to: а б де Груши Дж., де Нава С. (август 1968 г.). «Хромосомная теория канцерогенеза». Анналы внутренней медицины . 69 (2): 381–391. дои : 10.7326/0003-4819-69-2-381 . ПМИД 5243847 .
- ^ Армитидж П., Долл Р. (март 1954 г.). «Возрастное распределение рака и многостадийная теория канцерогенеза» . Британский журнал рака . 8 (1): 1–12. дои : 10.1038/bjc.1954.1 . ПМК 2007940 . ПМИД 13172380 .
- ^ Nowell PC, Хангерфорд, Д.А. (июль 1960 г.). «Хромосомные исследования нормальных и лейкемических лейкоцитов человека». Журнал Национального института рака . 25 : 85–109. дои : 10.1093/jnci/25.1.85 . ПМИД 14427847 .
- ^ Роули JD (июнь 1973 г.). «Идентификация транслокации с хинакринной флуоресценцией у больного острым лейкозом». Анналы Генетики . 16 (2): 109–112. ПМИД 4125056 .
- ^ Форд CE, Кларк CM (1963). «Цитогенетические доказательства клональной пролиферации при первичных ретикулярных новообразованиях». Слушания. Канадская конференция по раку . 5 : 129–146. ПМИД 14278854 .
- ^ Jump up to: а б Йосида Т.Х. (1966). «Связь между хромосомными изменениями и развитием опухолей» . Японский журнал генетики . 41 (6): 439–51. дои : 10.1266/jjg.41.439 .
- ^ де Груши Дж., де Нава С., Канту Ж.М., Бильски-Паскье Дж., Буссер Дж. (сентябрь 1966 г.). «Модели клональной эволюции: исследование хронического миелогенного лейкоза» . Американский журнал генетики человека . 18 (5): 485–503. ПМК 1706184 . ПМИД 5224748 .
- ^ де Груши Дж. (январь 1973 г.). «Рак и эволюция видов: выкуп». Биомедицина . 18 (1): 6–8. ПМИД 4197290 .
- ^ Райсер HJ (сентябрь 1971 г.). «Химический канцерогенез». Медицинский журнал Новой Англии . 285 (13): 721–734. дои : 10.1056/NEJM197109232851305 . ПМИД 4942982 .
- ^ Кнудсон А.Г. (апрель 1971 г.). «Мутация и рак: статистическое исследование ретинобластомы» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 68 (4): 820–823. Бибкод : 1971ПНАС...68..820К . дои : 10.1073/pnas.68.4.820 . ПМК 389051 . ПМИД 5279523 .
- ^ Кавени В.К., Дриджа Т.П., Филлипс Р.А., Бенедикт В.Ф., Годбаут Р., Галли Б.Л. и др. (1983). «Экспрессия рецессивных аллелей хромосомными механизмами при ретинобластоме». Природа . 305 (5937): 779–784. Бибкод : 1983Natur.305..779C . дои : 10.1038/305779a0 . ПМИД 6633649 . S2CID 4248936 .
- ^ Jump up to: а б Браш Д.Е., Чжан В., Гроссман Д., Такеучи С. (апрель 2005 г.). «Колонизация соседних отсеков стволовых клеток мутантными кератиноцитами». Семинары по биологии рака . 15 (2): 97–102. doi : 10.1016/j.semcancer.2004.08.006 . ПМИД 15652454 .
- ^ Jump up to: а б Браахейс Б.Дж., Лиманс Ч.Р., Бракенхофф Р.Х. (апрель 2005 г.). «Расширение полей генетически измененных клеток при плоскоклеточном канцерогенезе головы и шеи». Семинары по биологии рака . 15 (2): 113–120. doi : 10.1016/j.semcancer.2004.08.004 . ПМИД 15652456 .
- ^ Jump up to: а б с Мэйли CC, Галипо ПК, Ли Икс, Санчес К.А., Полсон Т.Г., Рид Б.Дж. (май 2004 г.). «Селективно выгодные мутации и автостопщики при новообразованиях: поражения р16 выбираются в пищеводе Барретта» . Исследования рака . 64 (10): 3414–3427. дои : 10.1158/0008-5472.CAN-03-3249 . ПМИД 15150093 .
- ^ Хабути Т. (август 2005 г.). «Происхождение мультифокальных карцином мочевого пузыря и верхних мочевых путей: молекулярный анализ и клиническое значение» . Международный журнал урологии . 12 (8): 709–716. дои : 10.1111/j.1442-2042.2005.01155.x . ПМИД 16174043 . S2CID 30176505 .
- ^ Jump up to: а б Франклин В.А., Газдар А.Ф., Хейни Дж., Вистуба II, Ла Роза Ф.Г., Кеннеди Т. и др. (октябрь 1997 г.). «Широко распространенная мутация р53 в респираторном эпителии. Новый механизм полевого канцерогенеза» . Журнал клинических исследований . 100 (8): 2133–2137. дои : 10.1172/JCI119748 . ПМК 508406 . ПМИД 9329980 .
- ^ Брентналл Т.А., Криспин Д.А., Рабинович П.С., Хаггитт Р.К., Рубин С.Э., Стивенс А.К., Бермер Г.К. (август 1994 г.). «Мутации в гене p53: ранний маркер неопластического прогрессирования при язвенном колите». Гастроэнтерология . 107 (2): 369–378. дои : 10.1016/0016-5085(94)90161-9 . ПМИД 8039614 .
- ^ Jump up to: а б с Цао Дж.Л., Ятабе Ю., Саловаара Р., Ярвинен Х.Дж., Меклин Дж.П., Аалтонен Л.А. и др. (февраль 2000 г.). «Генетическая реконструкция историй отдельных колоректальных опухолей» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 97 (3): 1236–1241. Бибкод : 2000PNAS...97.1236T . дои : 10.1073/pnas.97.3.1236 . ПМК 15581 . ПМИД 10655514 .
- ^ Jump up to: а б Гонсалес-Гарсия I, Соле Р.В., Коста Х (октябрь 2002 г.). «Метапопуляционная динамика и пространственная гетерогенность при раке» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 99 (20): 13085–13089. Бибкод : 2002PNAS...9913085G . дои : 10.1073/pnas.202139299 . ПМК 130590 . ПМИД 12351679 .
- ^ Jump up to: а б Харада Т., Окита К., Сираиси К., Кусано Н., Кондо С., Сасаки К. (февраль 2002 г.). «Межжелезистая цитогенетическая гетерогенность, обнаруженная методом сравнительной геномной гибридизации при раке поджелудочной железы» . Исследования рака . 62 (3): 835–839. ПМИД 11830540 .
- ^ Jump up to: а б Мерфи Д.С., Хоар С.Ф., Гоинг Дж.Дж., Мэллон Э.Э., Джордж В.Д., Кэй С.Б. и др. (ноябрь 1995 г.). «Характеристика обширных генетических изменений при протоковой карциноме in situ с помощью флуоресцентной гибридизации in situ и молекулярного анализа». Журнал Национального института рака . 87 (22): 1694–1704. дои : 10.1093/jnci/87.22.1694 . ПМИД 7473818 .
- ^ Jump up to: а б Кастро М.А., Онстен Т.Т., де Алмейда Р.М., Морейра Х.К. (июнь 2005 г.). «Профилирование цитогенетического разнообразия с помощью энтропийного кариотипического анализа». Журнал теоретической биологии . 234 (4): 487–495. Бибкод : 2005JThBi.234..487C . дои : 10.1016/j.jtbi.2004.12.006 . PMID 15808870 .
- ^ Jump up to: а б Барретт М.Т., Санчес К.А., Прево Л.Дж., Вонг Д.Д., Галипо ПК, Полсон Т.Г. и др. (май 1999 г.). «Эволюция неопластических клеточных линий пищевода Барретта» . Природная генетика . 22 (1): 106–109. дои : 10.1038/8816 . ПМК 1559997 . ПМИД 10319873 .
- ^ Ху В., Фэн З., Ма Л., Вагнер Дж., Райс Дж.Дж., Столовицкий Г., Левин А.Дж. (март 2007 г.). «Однонуклеотидный полиморфизм в гене MDM2 нарушает колебания уровней p53 и MDM2 в клетках» . Исследования рака . 67 (6): 2757–2765. дои : 10.1158/0008-5472.CAN-06-2656 . ПМИД 17363597 .
- ^ Гоэл А., Арнольд К.Н., Недзвецки Д., Каретерс Дж.М., Доуэлл Дж.М., Вассерман Л. и др. (май 2004 г.). «Частая инактивация PTEN путем гиперметилирования промотора при спорадическом колоректальном раке с высокой нестабильностью микросателлитов» . Исследования рака . 64 (9): 3014–3021. дои : 10.1158/0008-5472.CAN-2401-2 . ПМИД 15126336 .
- ^ Каллиониеми А (февраль 2008 г.). «Микрочипы CGH и рак». Современное мнение в области биотехнологии . 19 (1): 36–40. дои : 10.1016/j.copbio.2007.11.004 . ПМИД 18162393 .
- ^ Дюсберг П., Рауш С., Расник Д., Хельманн Р. (ноябрь 1998 г.). «Генетическая нестабильность раковых клеток пропорциональна степени их анеуплоидии» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 95 (23): 13692–13697. Бибкод : 1998PNAS...9513692D . дои : 10.1073/pnas.95.23.13692 . ПМК 24881 . ПМИД 9811862 .
- ^ Jump up to: а б с Хэн Х.Х., Стивенс Дж.Б., Лю Дж., Бремер С.В., Йе К.Дж., Редди П.В. и др. (август 2006 г.). «Стохастическое прогрессирование рака, вызванное неклональными хромосомными аберрациями». Журнал клеточной физиологии . 208 (2): 461–472. дои : 10.1002/jcp.20685 . ПМИД 16688757 . S2CID 33441988 .
- ^ Хэн Х.Х., Бремер С.В., Стивенс Дж., Йе К.Дж., Миллер Ф., Лю Дж., Йе. CJ (август 2006 г.). «Прогрессирование рака за счет неклональных хромосомных аберраций». Журнал клеточной биохимии . 98 (6): 1424–1435. дои : 10.1002/jcb.20964 . ПМИД 16676347 . S2CID 23123441 .
- ^ Jump up to: а б Е CJ, Лю Дж., Бремер С.В., Хэн Х.Х. (2007). «Динамика раковых хромосом и геномов». Цитогенетические и геномные исследования . 118 (2–4): 237–246. дои : 10.1159/000108306 . ПМИД 18000376 . S2CID 22867025 .
- ^ Ландер Э.С., Линтон Л.М., Биррен Б., Нусбаум С., Зоди М.С., Болдуин Дж. и др. (февраль 2001 г.). «Первичное секвенирование и анализ генома человека» . Природа . 409 (6822): 860–921. Бибкод : 2001Natur.409..860L . дои : 10.1038/35057062 . hdl : 2027.42/62798 . ПМИД 11237011 .
- ^ Йост С.Е., Смит Э.Н., Шваб Р.Б., Бао Л., Юнг Х., Ван Х и др. (август 2012 г.). «Идентификация соматических мутаций с высокой степенью достоверности в полногеномной последовательности фиксированных формалином образцов рака молочной железы» . Исследования нуклеиновых кислот . 40 (14): е107. дои : 10.1093/nar/gks299 . ПМЦ 3413110 . ПМИД 22492626 .
- ^ Бергер М.Ф., Ходис Э., Хеффернан Т.П., Дерибе Ю.Л., Лоуренс М.С., Протопопов А. и др. (май 2012 г.). «Секвенирование генома меланомы выявило частые мутации PREX2» . Природа . 485 (7399): 502–506. Бибкод : 2012Natur.485..502B . дои : 10.1038/nature11071 . ПМЦ 3367798 . ПМИД 22622578 .
- ^ Ли В., Цзян З., Лю Дж., Хаверти П.М., Гуань Ю., Стинсон Дж. и др. (май 2010 г.). «Спектр мутаций, выявленный парными последовательностями генома больного раком легких». Природа . 465 (7297): 473–477. Бибкод : 2010Natur.465..473L . дои : 10.1038/nature09004 . ПМИД 20505728 . S2CID 4354035 .
- ^ Хэн Х.Х. (август 2007 г.). «Секвенирование генома рака: предстоящие задачи». Биоэссе . 29 (8): 783–794. doi : 10.1002/bies.20610 . ПМИД 17621658 .
- ^ Биелас Дж.Х., Леб К.Р., Рубин Б.П., Тру Л.Д., Леб Л.А. (ноябрь 2006 г.). «Рак человека выражает мутаторный фенотип» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 103 (48): 18238–18242. дои : 10.1073/pnas.0607057103 . ПМЦ 1636340 . ПМИД 17108085 .
- ^ Вуд Л.Д., Парсонс Д.В., Джонс С., Лин Дж., Сьёблом Т., Лири Р.Дж. и др. (ноябрь 2007 г.). «Геномный ландшафт рака молочной железы и колоректального рака человека». Наука . 318 (5853): 1108–1113. Бибкод : 2007Sci...318.1108W . CiteSeerX 10.1.1.218.5477 . дои : 10.1126/science.1145720 . ПМИД 17932254 . S2CID 7586573 .
- ^ Хэлфорд С., Роуэн А., Сойер Э., Талбот I, Томлинсон I (июнь 2005 г.). «О (6)-метилгуанин метилтрансфераза при колоректальном раке: обнаружение мутаций, потеря экспрессии и слабая связь с переходами G: C> A: T» . Гут . 54 (6): 797–802. дои : 10.1136/gut.2004.059535 . ПМК 1774551 . ПМИД 15888787 .
- ^ Трунингер К., Менигатти М., Луз Дж., Рассел А., Хайдер Р., Гебберс Дж.О. и др. (май 2005 г.). «Иммуногистохимический анализ выявляет высокую частоту дефектов PMS2 при колоректальном раке» . Гастроэнтерология . 128 (5): 1160–1171. дои : 10.1053/j.gastro.2005.01.056 . ПМИД 15887099 .
- ^ Нарайанан Л., Фритцелл Дж.А., Бейкер С.М., Лискай Р.М., Глейзер П.М. (апрель 1997 г.). «Повышенные уровни мутаций во многих тканях мышей с дефицитом гена репарации несоответствия ДНК Pms2» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 94 (7): 3122–3127. Бибкод : 1997PNAS...94.3122N . дои : 10.1073/pnas.94.7.3122 . ЧВК 20332 . ПМИД 9096356 .
- ^ Хеган Д.С., Нараянан Л., Жирик Ф.Р., Эдельманн В., Лискай Р.М., Глейзер П.М. (декабрь 2006 г.). «Различные модели генетической нестабильности у мышей с дефицитом генов репарации ошибочного спаривания Pms2, Mlh1, Msh2, Msh3 и Msh6» . Канцерогенез . 27 (12): 2402–2408. doi : 10.1093/carcin/bgl079 . ПМК 2612936 . ПМИД 16728433 .
- ^ Тутт А.Н., ван Остром КТ, Росс ГМ, ван Стиг Х., Эшворт А. (март 2002 г.). «Нарушение Brca2 увеличивает частоту спонтанных мутаций in vivo: синергизм с ионизирующим излучением» . Отчеты ЭМБО . 3 (3): 255–260. дои : 10.1093/embo-reports/kvf037 . ПМК 1084010 . ПМИД 11850397 .
- ^ Гоэл А., Боланд Ч.Р. (декабрь 2012 г.). «Эпигенетика колоректального рака» . Гастроэнтерология . 143 (6): 1442–1460.e1. дои : 10.1053/j.gastro.2012.09.032 . ПМЦ 3611241 . ПМИД 23000599 .
- ^ Шнекенбургер М., Дидерих М. (март 2012 г.). «Эпигенетика открывает новые горизонты в профилактике колоректального рака» . Текущие отчеты о колоректальном раке . 8 (1): 66–81. дои : 10.1007/s11888-011-0116-z . ПМК 3277709 . ПМИД 22389639 .
- ^ Фогельштейн Б., Пападопулос Н., Велкулеску В.Е., Чжоу С., Диас Л.А., Кинцлер К.В. (март 2013 г.). «Пейзажи генома рака» . Наука . 339 (6127): 1546–1558. Бибкод : 2013Sci...339.1546V . дои : 10.1126/science.1235122 . ПМК 3749880 . ПМИД 23539594 .
- ^ Иллингворт Р.С., Грюневальд-Шнайдер У., Уэбб С., Керр А.Р., Джеймс К.Д., Тернер Д.Д. и др. (сентябрь 2010 г.). «Островки-сироты CpG идентифицируют многочисленные консервативные промоторы в геноме млекопитающих» . ПЛОС Генетика . 6 (9): e1001134. дои : 10.1371/journal.pgen.1001134 . ПМЦ 2944787 . ПМИД 20885785 .
- ^ Вэй Дж, Ли Г, Данг С, Чжоу Ю, Цзэн К, Лю М (2016). «Открытие и проверка гиперметилированных маркеров колоректального рака» . Маркеры заболеваний . 2016 : 2192853. дои : 10.1155/2016/2192853 . ПМЦ 4963574 . ПМИД 27493446 .
- ^ Беггс А.Д., Джонс А., Эль-Бахрави М., Эль-Бахвари М., Абулафи М., Ходжсон С.В., Томлинсон И.П. (апрель 2013 г.). «Полногеномный анализ метилирования доброкачественных и злокачественных колоректальных опухолей» . Журнал патологии . 229 (5): 697–704. дои : 10.1002/путь.4132 . ПМЦ 3619233 . ПМИД 23096130 .
- ^ Птица А (январь 2002 г.). «Схемы метилирования ДНК и эпигенетическая память» . Гены и развитие . 16 (1): 6–21. дои : 10.1101/gad.947102 . ПМИД 11782440 .
- ^ Черняк Б., Чатурведи В., Ли Л., Ходжес С., Джонстон Д., Рой Дж.Ю. и др. (февраль 1999 г.). «Наложенное гистологическое и генетическое картирование хромосомы 9 при прогрессировании неоплазии мочевого пузыря человека: значение для генетической модели многоэтапного уротелиального канцерогенеза и раннего выявления рака мочевого пузыря» . Онкоген . 18 (5): 1185–1196. дои : 10.1038/sj.onc.1202385 . ПМИД 10022124 .
- ^ Маевски Т., Ли С., Чон Дж., Юн Д.С., Крам А., Ким М.С. и др. (июль 2008 г.). «Понимание развития рака мочевого пузыря человека с помощью стратегии геномного картирования всего органа» . Лабораторные исследования; Журнал технических методов и патологии . 88 (7): 694–721. дои : 10.1038/labinvest.2008.27 . ПМЦ 2849658 . ПМИД 18458673 .
- ^ Чжан В., Хэнкс А.Н., Баучер К., Флорелл С.Р., Аллен С.М., Александр А. и др. (январь 2005 г.). «УФ-индуцированный апоптоз стимулирует клональную экспансию во время развития опухоли кожи» . Канцерогенез . 26 (1): 249–257. дои : 10.1093/carcin/bgh300 . ПМК 2292404 . ПМИД 15498793 .
- ^ Сидранский Д., Миккельсен Т., Швеххаймер К., Розенблюм М.Л., Кавани В., Фогельштейн Б. (февраль 1992 г.). «Клональная экспансия мутантных клеток p53 связана с прогрессированием опухоли головного мозга». Природа . 355 (6363): 846–847. Бибкод : 1992Natur.355..846S . дои : 10.1038/355846a0 . ПМИД 1311419 . S2CID 4318673 .
- ^ Барди Н., Беквит Дж. Б., Пеллетье Дж. (январь 1995 г.). «Клональная экспансия и ослабленный апоптоз в опухолях Вильмса связаны с мутациями гена р53» . Исследования рака . 55 (2): 215–219. ПМИД 7812946 .
- ^ Макдональд С.А., Гривз Л.С., Гутьеррес-Гонсалес Л., Родригес-Хусто М., Дехерагода М., Лидхэм С.Дж. и др. (февраль 2008 г.). «Механизмы полевого канцерообразования в желудке человека: экспансия и распространение мутировавших желудочных стволовых клеток». Гастроэнтерология . 134 (2): 500–510. дои : 10.1053/j.gastro.2007.11.035 . ПМИД 18242216 .
- ^ Ли С., Джонг Дж., Маевски Т., Шерер С.Е., Ким М.С., Тузиак Т. и др. (август 2007 г.). «Гены-предшественники, прилегающие к RB1, способствуют развитию неоплазии in situ» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 104 (34): 13732–13737. Бибкод : 2007PNAS..10413732L . дои : 10.1073/pnas.0701771104 . ЧВК 1949496 . ПМИД 17702869 .
- ^ Макдональд С.А., Престон С.Л., Гривз Л.С., Лидхэм С.Дж., Ловелл М.А., Янковски Дж.А. и др. (апрель 2006 г.). «Клональная экспансия в кишечнике человека: мутации митохондриальной ДНК указывают нам путь» . Клеточный цикл . 5 (8): 808–811. дои : 10.4161/cc.5.8.2641 . ПМИД 16628008 .
- ^ Парк И.В., Вистуба II, Майтра А., Милчгруб С., Вирмани А.К., Минна Дж.Д., Газдар А.Ф. (ноябрь 1999 г.). «Множественные клональные аномалии бронхиального эпителия больных раком легких» . Журнал Национального института рака . 91 (21): 1863–1868. дои : 10.1093/jnci/91.21.1863 . ПМИД 10547393 .
- ^ Тиу Р., Гондек Л., О'Киф С., Мациевски Дж. П. (август 2007 г.). «Клональность компартмента стволовых клеток во время развития миелодиспластических синдромов и других синдромов недостаточности костного мозга» . Лейкемия . 21 (8): 1648–1657. дои : 10.1038/sj.leu.2404757 . ПМИД 17554386 .
- ^ Мехра Р., Томлинс С.А., Ю Дж., Цао X, Ван Л., Менон А. и др. (май 2008 г.). «Характеристика аберраций гена TMPRSS2-ETS при андроген-независимом метастатическом раке простаты» . Исследования рака . 68 (10): 3584–3590. дои : 10.1158/0008-5472.CAN-07-6154 . ПМК 2677168 . ПМИД 18483239 .
- ^ Мали CC, Галипо ПК, Ли Икс, Санчес К.А., Полсон Т.Г., Блаунт П.Л., Рид Б.Дж. (октябрь 2004 г.). «Сочетание генетической нестабильности и клональной экспансии предсказывает прогрессирование аденокарциномы пищевода» . Исследования рака . 64 (20): 7629–7633. дои : 10.1158/0008-5472.CAN-04-1738 . ПМИД 15492292 .
- ^ Беренвинкель Н., Антал Т., Дингли Д., Траулсен А., Кинцлер К.В., Велкулеску В.Е. и др. (ноябрь 2007 г.). «Генетическая прогрессия и время ожидания рака» . PLOS Вычислительная биология . 3 (11): е225. arXiv : 0707.3770 . Бибкод : 2007PLSCB...3..225B . дои : 10.1371/journal.pcbi.0030225 . ПМК 2065895 . ПМИД 17997597 .
- ^ Слотер ДП, Саутвик HW, Смейкал В (сентябрь 1953 г.). «Полевая канцеризация многослойного плоского эпителия полости рта; клинические последствия мультицентрического происхождения» . Рак . 6 (5): 963–968. doi : 10.1002/1097-0142(195309)6:5<963::AID-CNCR2820060515>3.0.CO;2-Q . ПМИД 13094644 . S2CID 6736946 .
- ^ Бернштейн С., Бернштейн Х., Пейн С.М., Дворжак К., Гаревал Х. (февраль 2008 г.). «Полевые дефекты при прогрессировании рака желудочно-кишечного тракта» . Письма о раке . 260 (1–2): 1–10. дои : 10.1016/j.canlet.2007.11.027 . ПМЦ 2744582 . ПМИД 18164807 .
- ^ Лоухелайнен Дж., Вейкстрем Х., Хемминки К. (июль 2000 г.). «Моделирование инициации-развития аллельных потерь на хромосоме 9 при мультифокальном раке мочевого пузыря». Европейский журнал рака . 36 (11): 1441–1451. дои : 10.1016/S0959-8049(00)00127-1 . ПМИД 10899659 .
- ^ Деспер Р., Цзян Ф., Каллиониеми О.П., Мох Х., Пападимитриу Ч., Шеффер А.А. (1999). «Вывод древовидных моделей онкогенеза на основе сравнительных данных гибридизации генома». Журнал вычислительной биологии . 6 (1): 37–51. CiteSeerX 10.1.1.53.9617 . дои : 10.1089/cmb.1999.6.37 . ПМИД 10223663 .
- ^ Баст, Ф. 2012. Филогенетика рака: компьютерное моделирование эволюции опухоли. В Р. Тутея (ред.), Биоинформатика: геномная биоинформатика и вычислительная биология (стр. 211-230). Nova Publishers, Нью-Йорк. 211-230
- ^ Райт С. (март 1931 г.). «Эволюция менделевских популяций» . Генетика . 16 (2): 97–159. дои : 10.1093/генетика/16.2.97 . ПМК 1201091 . ПМИД 17246615 .
- ^ Райт С. Эволюция и генетика популяций. Том. 2, Издательство Чикагского университета (1969)
- ^ Новак М.А., Зигмунд К. (февраль 2004 г.). «Эволюционная динамика биологических игр» (PDF) . Наука . 303 (5659): 793–799. Бибкод : 2004Sci...303..793N . дои : 10.1126/science.1093411 . ПМИД 14764867 . S2CID 2966169 .
- ^ Винсент Т.Л. и Браун Дж.С. Эволюционная теория игр, естественный отбор и дарвиновская динамика. Издательство Кембриджского университета, 2005 г.
- ^ Винсент Т.Л., Гейтенби РА (апрель 2008 г.). «Эволюционная модель инициации, продвижения и прогрессирования канцерогенеза» . Международный журнал онкологии . 32 (4): 729–737. дои : 10.3892/ijo.32.4.729 . ПМИД 18360700 .
- ^ Мэйли CC, Рид Б.Дж., Форрест С. (август 2004 г.). «Стратегии профилактики рака, учитывающие эволюционную динамику неопластических клеток: моделирование усилителей доброкачественных клеток и отбор на химиочувствительность» . Эпидемиология рака, биомаркеры и профилактика . 13 (8): 1375–1384. дои : 10.1158/1055-9965.1375.13.8 . ПМИД 15298961 . S2CID 1143689 .
- ^ Спенсер С.Л., Герети Р.А., Пиента К.Дж., Форрест С. (август 2006 г.). «Моделирование соматической эволюции при онкогенезе» . PLOS Вычислительная биология . 2 (8): е108. Бибкод : 2006PLSCB...2..108S . дои : 10.1371/journal.pcbi.0020108 . ПМК 1550273 . ПМИД 16933983 .
- ^ Аксельрод Р., Аксельрод Д.Е., Пиента К.Дж. (сентябрь 2006 г.). «Эволюция сотрудничества опухолевых клеток» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 103 (36): 13474–13479. дои : 10.1073/pnas.0606053103 . ПМЦ 1557388 . ПМИД 16938860 .
- ^ Jump up to: а б с д и ж г час Шеклтон М., Кинтана Э., Фирон Э.Р., Моррисон С.Дж. (сентябрь 2009 г.). «Гетерогенность рака: раковые стволовые клетки против клональной эволюции» . Клетка . 138 (5): 822–829. дои : 10.1016/j.cell.2009.08.017 . ПМИД 19737509 . S2CID 2615068 .
- ^ Jump up to: а б с д Бапат С.А. (июнь 2007 г.). «Эволюция раковых стволовых клеток». Семинары по биологии рака . 17 (3): 204–213. doi : 10.1016/j.semcancer.2006.05.001 . ПМИД 16787749 .
- ^ Jump up to: а б Далерба П., Чо Р.В., Кларк М.Ф. (2007). «Раковые стволовые клетки: модели и концепции». Ежегодный обзор медицины . 58 : 267–284. дои : 10.1146/annurev.med.58.062105.204854 . ПМИД 17002552 .
- ^ Чабнер Б.А., Робертс Т.Г. (январь 2005 г.). «Хронология: химиотерапия и война с раком». Обзоры природы. Рак . 5 (1): 65–72. дои : 10.1038/nrc1529 . ПМИД 15630416 . S2CID 205467419 .
- ^ Шимке РТ (май 1984 г.). «Амплификация генов, устойчивость к лекарствам и рак» . Исследования рака . 44 (5): 1735–1742. ПМИД 6713376 .
- ^ Курт Г.А., Карни Д.Н., Коуэн К.Х., Джоливет Дж., Бейли Б.Д., Дрейк Дж.К. и др. (январь 1983 г.). «Нестабильная резистентность к метотрексату при мелкоклеточной карциноме человека, связанной с двухминутными хромосомами». Медицинский журнал Новой Англии . 308 (4): 199–202. дои : 10.1056/NEJM198301273080406 . ПМИД 6294518 . S2CID 44868799 .
- ^ Карман, доктор медицинских наук, Шорнагель Дж. Х., Ривест Р. С., Шриматкандада С., Портлок К. С., Даффи Т., Бертино Дж. Р. (январь 1984 г.). «Резистентность к метотрексату вследствие амплификации гена у пациента с острым лейкозом». Журнал клинической онкологии . 2 (1): 16–20. дои : 10.1200/JCO.1984.2.1.16 . ПМИД 6583326 .
- ^ Хорнс Р.К., Дауэр В.Дж., Шимке Р.Т. (январь 1984 г.). «Амплификация гена у пациента с лейкемией, получавшего метотрексат». Журнал клинической онкологии . 2 (1): 2–7. дои : 10.1200/JCO.1984.2.1.2 . ПМИД 6583327 .
- ^ Трент Дж. М., Бьюик Р. Н., Олсон С., Хорнс Р. К., Шимке Р. Т. (январь 1984 г.). «Цитологические доказательства амплификации генов в клетках, устойчивых к метотрексату, полученных от пациентки с аденокарциномой яичника». Журнал клинической онкологии . 2 (1): 8–15. дои : 10.1200/JCO.1984.2.1.8 . ПМИД 6699660 .
- ^ Ван Т.Л., Диас Л.А., Романс К., Барделли А. , Саха С. , Галиция Г. и др. (март 2004 г.). «Цифровое кариотипирование идентифицирует амплификацию тимидилатсинтазы как механизм устойчивости к 5-фторурацилу у пациентов с метастатическим колоректальным раком» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 101 (9): 3089–3094. Бибкод : 2004PNAS..101.3089W . дои : 10.1073/pnas.0308716101 . ПМК 420348 . ПМИД 14970324 .
- ^ Горр М.Э., Сойерс К.Л. (июль 2002 г.). «Молекулярные механизмы устойчивости к STI571 при хроническом миелолейкозе». Современное мнение в гематологии . 9 (4): 303–307. дои : 10.1097/00062752-200207000-00007 . ПМИД 12042704 . S2CID 34233816 .
- ^ Рош-Лестьен С, Преудом С (апрель 2003 г.). «Мутации в киназном домене ABL существуют до начала лечения иматинибом». Семинары по гематологии . 40 (2 Приложение 2): 80–82. дои : 10.1053/shem.2003.50046 . ПМИД 12783380 .
- ^ Шах Н.П., Скэггс Б.Дж., Брэнфорд С., Хьюз Т.П., Николл Дж.М., Пакетт Р.Л., Сойерс К.Л. (сентябрь 2007 г.). «Последовательная терапия ингибиторами киназы ABL позволяет выбрать сложные лекарственно-устойчивые мутации BCR-ABL с измененной онкогенной активностью» . Журнал клинических исследований . 117 (9): 2562–2569. дои : 10.1172/JCI30890 . ПМЦ 1940237 . ПМИД 17710227 .
- ^ Тамборини Э., Бонадиман Л., Греко А., Альбертини В., Негри Т., Гронки А. и др. (июль 2004 г.). «Новая мутация в кармане KIT ATP вызывает приобретенную устойчивость к иматинибу у пациента со стромальной опухолью желудочно-кишечного тракта» . Гастроэнтерология . 127 (1): 294–299. дои : 10.1053/j.gastro.2004.02.021 . ПМИД 15236194 .
- ^ Чен Л.Л., Трент Дж.К., Ву Э.Ф., Фуллер Г.Н., Рамдас Л., Чжан В. и др. (сентябрь 2004 г.). «Миссенс-мутация в домене 1 киназы KIT коррелирует с резистентностью к иматинибу в желудочно-кишечных стромальных опухолях» . Исследования рака . 64 (17): 5913–5919. дои : 10.1158/0008-5472.CAN-04-0085 . ПМИД 15342366 .
- ^ Энгельман Ю.А., Янне П.А. (май 2008 г.). «Механизмы приобретенной устойчивости к ингибиторам тирозинкиназы рецептора эпидермального фактора роста при немелкоклеточном раке легкого» . Клинические исследования рака . 14 (10): 2895–2899. дои : 10.1158/1078-0432.CCR-07-2248 . ПМИД 18483355 .
- ^ Кобаяши С., Боггон Т.Дж., Даярам Т., Янне П.А., Кохер О., Мейерсон М. и др. (февраль 2005 г.). «Мутация EGFR и устойчивость немелкоклеточного рака легких к гефитинибу» . Медицинский журнал Новой Англии . 352 (8): 786–792. doi : 10.1056/NEJMoa044238 . ПМИД 15728811 .
- ^ Энгельман Дж.А., Зейнуллаху К., Мицудоми Т., Сонг Ю., Хайланд С., Пак Дж.О. и др. (май 2007 г.). «Амплификация MET приводит к устойчивости к гефитинибу при раке легких за счет активации передачи сигналов ERBB3» . Наука . 316 (5827): 1039–1043. Бибкод : 2007Sci...316.1039E . дои : 10.1126/science.1141478 . ПМИД 17463250 . S2CID 23254145 .
- ^ Кольцо А, Доусетт М. (декабрь 2004 г.). «Механизмы резистентности к тамоксифену» . Эндокринный рак . 11 (4): 643–658. дои : 10.1677/erc.1.00776 . ПМИД 15613444 .
- ^ Осборн СК (ноябрь 1998 г.). «Тамоксифен в лечении рака молочной железы». Медицинский журнал Новой Англии . 339 (22): 1609–1618. дои : 10.1056/NEJM199811263392207 . ПМИД 9828250 .
- ^ Энкарнасьон Калифорния, Чокка Д.Р., МакГуайр В.Л., Кларк Г.М., Фукуа С.А., Осборн К.К. (1993). «Измерение рецепторов стероидных гормонов у больных раком молочной железы, принимающих тамоксифен». Исследование и лечение рака молочной железы . 26 (3): 237–246. дои : 10.1007/BF00665801 . ПМИД 8251648 . S2CID 9716966 .
- ^ Джонстон С.Р., Саккани-Джотти Дж., Смит И.Е., Солтер Дж., Ньюби Дж., Коппен М. и др. (август 1995 г.). «Изменения в экспрессии эстрогеновых рецепторов, рецепторов прогестерона и pS2 при устойчивом к тамоксифену раке молочной железы человека» . Исследования рака . 55 (15): 3331–3338. ПМИД 7614468 .
- ^ Джордан ВК, О'Мэлли BW (декабрь 2007 г.). «Селективные модуляторы рецепторов эстрогена и антигормональная резистентность при раке молочной железы». Журнал клинической онкологии . 25 (36): 5815–5824. дои : 10.1200/JCO.2007.11.3886 . ПМИД 17893378 .
- ^ Беверидж Дж.Н., Сиссунг ТМ, Сион А.М., Данези Р., Фигг В.Д. (сентябрь 2007 г.). «Полиморфизмы CYP2D6 и влияние на терапию тамоксифеном». Журнал фармацевтических наук . 96 (9): 2224–2231. дои : 10.1002/jps.20892 . ПМИД 17518364 .
- ^ Таплин М.Е., Бабли Г.Дж., Ко Ю.Дж., Смолл Э.Дж., Аптон М., Раджешкумар Б., Балк С.П. (июнь 1999 г.). «Отбор мутаций андрогенных рецепторов при раке предстательной железы, обработанном антагонистами андрогенов» . Исследования рака . 59 (11): 2511–2515. ПМИД 10363963 .
- ^ Вискорпи Т., Хютинен Э., Койвисто П., Таннер М., Кейнянен Р., Палмберг С. и др. (апрель 1995 г.). «Усиление in vivo гена рецептора андрогенов и прогрессирование рака простаты человека». Природная генетика . 9 (4): 401–406. дои : 10.1038/ng0495-401 . ПМИД 7795646 . S2CID 20120114 .
- ^ Бао С., Ву К., МакЛендон Р.Э., Хао Ю., Ши К., Хьелмеланд А.Б. и др. (декабрь 2006 г.). «Стволовые клетки глиомы способствуют радиорезистентности за счет преимущественной активации реакции на повреждение ДНК». Природа . 444 (7120): 756–760. Бибкод : 2006Natur.444..756B . дои : 10.1038/nature05236 . ПМИД 17051156 . S2CID 4340708 .
- ^ Ким Ю, Ким К. Х., Ли Дж., Ли Ю. А., Ким М., Ли С. Дж. и др. (март 2012 г.). «Активация Wnt участвует в радиорезистентности глиобластомы» . Лабораторные исследования; Журнал технических методов и патологии . 92 (3): 466–473. дои : 10.1038/labinvest.2011.161 . ПМИД 22083670 .
- ^ Jump up to: а б с д Пеппер Дж.В., Скотт Финдли С., Кассен Р., Спенсер С.Л., Мэйли CC (февраль 2009 г.). «Исследование рака встречается с эволюционной биологией» . Эволюционные приложения . 2 (1): 62–70. дои : 10.1111/j.1752-4571.2008.00063.x . ПМЦ 3352411 . ПМИД 25567847 .
- ^ Jump up to: а б с Джайн Р.К., Forbes NS (декабрь 2001 г.). «Могут ли искусственно созданные бактерии помочь контролировать рак?» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 98 (26): 14748–14750. Бибкод : 2001PNAS...9814748J . дои : 10.1073/pnas.261606598 . ПМК 64926 . ПМИД 11752416 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]- Рабочая группа Института Санта-Фе по эволюции рака
- Лаборатория Дэррила Шибаты, специализирующаяся на исследованиях эволюции рака и соматической эволюции.
- Лаборатория Карло Мали, специализирующаяся на исследованиях эволюции рака.
- Исследования Джона Пеппера в области соматической эволюции
- Программа исследования пищевода Сиэтла Барретта