Генетическая история Южной Африки
Генетическая история Южной Африки в себя генетическую историю народов Южной Африки включает . Сахара . служила трансрегиональным проходом и местом проживания людей в Африке во время различных влажных периодов [1] [2] [3] и периоды на протяжении всей истории Африки . [4] [5]
Архаичная человеческая ДНК
[ редактировать ]В то время как денисовское и неандертальское происхождение у неафриканцев за пределами Африки более достоверно, архаическое человеческое происхождение у африканцев менее достоверно, и его слишком рано устанавливать с уверенностью. [6]
Древняя ДНК
[ редактировать ]Три позднего каменного века охотника-собирателя несли древнюю ДНК, похожую на ДНК охотников-собирателей, говорящих на койсанском языке . [7] До миграции банту в этот регион, о чем свидетельствует древняя ДНК из Ботсваны , из Восточной Африки пастухи мигрировали в Южную Африку. [7] Из четырех века банту земледельцев- западноафриканского происхождения железного двое более ранних земледельцев несли древнюю ДНК, похожую на ДНК народов тсонга и венда , а два более поздних земледельца несли древнюю ДНК, похожую на ДНК людей нгуни ; это указывает на то, что в общей миграции банту происходили различные перемещения народов, что привело к усилению взаимодействия и смешения между народами , говорящими на банту , и народами, говорящими на койсанском языке. [7]
Ботсвана
[ редактировать ]В Нкоме, в Ботсване , человек, живший в раннем железном веке (900 лет назад), нес гаплогруппу L2a1f . [8] [9]
В Таукоме, в Ботсване, человек, датируемый ранним железным веком (1100 лет назад), нес гаплогруппы E1b1a1 (E-M2, E-Z1123) и L0d3b1 . [8] [9]
В Ксаро, в Ботсване, обитали два человека, датированные ранним железным веком (1400 г. до н.э.); один нес гаплогруппы E1b1a1a1c1a и L3e1a2 , а другой нес гаплогруппы E1b1b1b2b (E-M293, E-CTS10880) и L0k1a2 . [8] [9]
Малави
[ редактировать ]Притворяться
[ редактировать ]В каменном убежище Фингира в Малави человек, датируемый периодом между 6179 и 2341 годами до нашей эры, нес гаплогруппы B2 и L0d1 . [10]
В Фингире, в Малави, человек, возраст которого, по оценкам, на сегодняшний день составляет от 6175 до 5913 лет назад, нес гаплогруппы BT и L0d1b2b . [11]
В Фингире, в Малави, человек, возраст которого, по оценкам, на сегодняшний день составляет от 6177 до 5923 лет назад, нес гаплогруппы BT и L0d1c . [11]
В Фингире, в Малави, человек, живший на сегодняшний день между 2676 и 2330 годами назад, нес гаплогруппу L0f . [11]
Ченчерер
[ редактировать ]В Ченчерере, в Малави , человек, возраст которого, по оценкам, составляет от 5400 до 4800 лет назад, нес гаплогруппу L0k2 . [11]
В Ченчерере, в Малави, человек, возраст которого, по оценкам, составляет от 5293 до 4979 лет назад, нес гаплогруппу L0k1 . [11]
Время
[ редактировать ]В каменном убежище Хора 1 в Малави человек, датируемый периодом от 16 897 до 15 827 лет назад, нес гаплогруппы B2b и L5b . [10]
В каменном убежище Хора 1 в Малави человек, датируемый периодом от 16 424 до 14 029 лет назад, нес гаплогруппы B2b1a2~ и L0d3/L0d3b . [10]
В Хоре, в Малави, человек, возраст которого, по оценкам, составляет от 10 000 до 5 000 лет назад, нес гаплогруппы BT и L0k2 . [11]
В Хоре, в Малави, человек, возраст которого, по оценкам, составляет от 8173 до 7957 лет назад, нес гаплогруппу L0a2 . [11]
ЮАР
[ редактировать ]В Дунсайде , в Южной Африке , человек, живший на сегодняшний день между 2296 и 1910 годами до нашей эры, был носителем гаплогруппы L0d2 . [12] [13]
В замке Шампань в Южной Африке человек, возраст которого, по оценкам, составляет от 448 до 282 лет назад, нес гаплогруппу L0d2a1a . [12] [13]
В пещере Эланд в Южной Африке человек, возраст которого, по оценкам, на сегодняшний день составляет от 533 до 453 лет назад, нес гаплогруппу L3e3b1 . [12] [13]
В Мфонгоси, в Южной Африке, человек, возраст которого, по оценкам, составляет от 448 до 308 лет назад, нес гаплогруппу L3e1b2 . [12] [13]
В Ньюкасле , в Южной Африке, человек, возраст которого, по оценкам, на сегодняшний день составляет от 508 до 327 лет назад, нес гаплогруппу L3e2b1a2 . [12] [13]
На острове Св. Елены , в Южной Африке, человек, живший, по оценкам, между 2241 и 1965 годами до нашей эры, нес гаплогруппы A1b1b2a и L0d2c1 . [11]
В приюте Фараоскоп-Рок в Южной Африке человек, живший, по оценкам, между 2017 и 1748 годами до нашей эры, нес гаплогруппы A1b1b2a и L0d1b2b1b . [11]
В Кастельберге, в Южной Африке, человек, возраст которого, по оценкам, составляет от 1282 до 1069 лет назад, нес гаплогруппу L0d1a1a . [11]
В приюте Ваалкранс в Южной Африке человек, возраст которого, по оценкам, составляет 200 лет назад, преимущественно связан с носителями койсанского языка , частично (15–32%) связан с выходцами из Восточной Африки и несет гаплогруппы L0d3b1 . [14]
Баллито Бэй
[ редактировать ]В Баллито заливе , Южная Африка , человек, живший, по оценкам, между 2149 и 1932 годами до нашей эры, нес гаплогруппы A1b1b2 и L0d2a1 . [12] [13]
В заливе Баллито , Южная Африка, человек, живший, по оценкам, между 1986 и 1831 годами до нашей эры, нес гаплогруппы A1b1b2 и L0d2c1 . [12] [13]
В заливе Баллито , Южная Африка, у Ballito Boy, возраст которого, по оценкам, составляет 1980 ± 20 кал. лет назад, была обнаружена Rickettsia felis . [15] [16]
Замбия
[ редактировать ]В каменном убежище Калемба в Замбии человек, датируемый между 5285 и 4975 годами до нашей эры, нес гаплогруппу L0d1b2b . [10]
Y-хромосомная ДНК
[ редактировать ]Различные исследования Y-хромосомы показывают, что сан несут некоторые из наиболее расходящихся (старейших) гаплогрупп Y-хромосомы человека . Эти гаплогруппы представляют собой особые подгруппы гаплогрупп A и B , двух самых ранних ветвей дерева Y-хромосомы человека . [17] [18] [19]
Митохондриальная ДНК
[ редактировать ]За 200 000 лет назад африканцы (например, койсаны из Южной Африки), несущие гаплогруппу L0, отделились от других африканцев, несущих гаплогруппу L1'6 , которые, как правило, проживали к северу от Южной Африки . [20] Между 130 000 и 75 000 лет назад среди жителей Южной Африки возникла поведенческая современность долгосрочные взаимодействия между регионами Южной Африки и Восточной Африки . и установились [20]
Исследования митохондриальной ДНК также свидетельствуют о том, что сан несут высокие частоты самых ранних ветвей гаплогрупп в дереве митохондриальной ДНК человека. Эта ДНК наследуется только от матери. Самая дивергентная (самая старая) митохондриальная гаплогруппа, L0d , была идентифицирована с самой высокой частотой в южноафриканских группах сан. [17] [21] [22] [23]
Аутосомная ДНК
[ редактировать ]От региона Кении и Танзании до Южной Африки восточные африканцы, говорящие на языке банту, составляют генетическую линию с севера на юг ; кроме того, от восточной Африки до южной Африки свидетельства генетической однородности указывают на последовательный эффект основателя и события примеси , произошедшие между африканцами, говорящими на банту, и другими африканскими популяциями к тому времени, когда миграция банту распространилась на Южную Африку. [24]
Хенн и др. (2011) обнаружили, что хомани сан, а также народы сандаве и хадза в Танзании были наиболее генетически разнообразными из всех изученных живых людей. Такая высокая степень генетического разнообразия намекает на происхождение анатомически современного человека . [25] [26]
Медицинская ДНК
[ редактировать ]Среди древней ДНК трех охотников-собирателей, имеющих генетическое сходство с людьми сан , и четырех земледельцев железного века , их SNP показали, что они несли варианты устойчивости к сонной болезни и Plasmodium vivax . [27] В частности, двое из четырех земледельцев железного века имели варианты устойчивости к сонной болезни, а трое из четырех земледельцев железного века имели отрицательные по Даффи варианты устойчивости к малярии . [27] В отличие от земледельцев железного века, из числа охотников-собирателей, родственных сану, шестилетний мальчик мог умереть от шистосомоза . [27] В Ботсване мужчина, датируемый 1400 годом до нашей эры, возможно, также был носителем отрицательного варианта Даффи по устойчивости к малярии. [27]
Геномы африканцев, обычно подвергающихся адаптации, представляют собой регуляторную ДНК , и многие случаи адаптации, обнаруженные среди африканцев, связаны с диетой , физиологией и эволюционным давлением со стороны патогенов. [24] По всей Африке к югу от Сахары генетическая адаптация (например, мутация rs334, группа крови Даффи , повышенный уровень дефицита G6PD , серповидноклеточная анемия ) к малярии, которая, возможно, первоначально развилась около 7300 лет назад. среди африканцев к югу от Сахары была обнаружена [24] У африканцев к югу от Сахары более 90% генотипа Duffy-null. [28] В регионе пустыни Калахари различные возможные генетические адаптации (например, адипонектин , индекс массы тела , обмен веществ были обнаружены в Африке среди народа хомани ) . [24] У африканцев к югу от Сахары более 90% генотипа Duffy-null. [28] В Южной Африке генетическая адаптация (например, rs28647531 на хромосоме 4q22 ) и сильная предрасположенность к туберкулезу была обнаружена среди цветных . [24]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Осборн, Энн Х.; и др. (октябрь 2008 г.). «Влажный коридор через Сахару для миграции ранних современных людей из Африки 120 000 лет назад» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 105 (43): 16444–16447. Бибкод : 2008PNAS..10516444O . дои : 10.1073/pnas.0804472105 . ПМЦ 2575439 . ПМИД 18936490 . S2CID 10418009 .
- ^ Дрейк, Ник; Бриз, Пол (2016). «Изменение климата и современное заселение Сахары человеком из MIS 6-2» . Африка из МИС 6-2 . Палеобиология и палеоантропология позвоночных. Африка из МИС 6-2. стр. 103–122. дои : 10.1007/978-94-017-7520-5_6 . ISBN 978-94-017-7519-9 . S2CID 131383927 .
- ^ Эль-Шенави, Мохаммед И.; и др. (2018). «Спелеотемы свидетельствуют об озеленении Сахары и его последствиях для раннего расселения людей из стран Африки к югу от Сахары» . Четвертичные научные обзоры . 188 : 67–76. Бибкод : 2018QSRv..188...67E . doi : 10.1016/j.quascirev.2018.03.016 . S2CID 134694090 .
- ^ Шееле, Юдит (август 2016 г.). Перекресток регионов: Сахара . Оксфордские справочники в Интернете. дои : 10.1093/oxfordhb/9780199935369.013.18 . ISBN 978-0-19-993536-9 .
- ^ Виппель, Штеффен (2020). «Сахара как мост, а не барьер: эссе и рецензия на книгу о последних трансрегиональных перспективах» . Новая политическая литература . 65 (3): 449–472. дои : 10.1007/s42520-020-00318-y . S2CID 224855920 .
- ^ Бергстрем А., Стрингер С., Хайдиньяк М., Шерри Э.М., Скоглунд П. (февраль 2021 г.). «Происхождение современного человеческого происхождения». Природа . 590 (7845): 229–237. Бибкод : 2021Natur.590..229B . дои : 10.1038/s41586-021-03244-5 . PMID 33568824 . S2CID 231883210 .
- ^ Jump up to: а б с Чоудхури А., Сенгупта Д., Рамзи М., Шлебуш К. (апрель 2021 г.). «Миграция и примесь говорящих на языке банту на юге Африки» . Молекулярная генетика человека . 30 (R1): R56–R63. дои : 10.1093/hmg/ddaa274 . ПМЦ 8117461 . ПМИД 33367711 .
- ^ Jump up to: а б с Ван К., Гольдштейн С., Блисдейл М., Клист Б., Бостоен К., Баква-Луфу П. и др. (июнь 2020 г.). «Древние геномы раскрывают сложные закономерности перемещения, взаимодействия и замещения населения в странах Африки к югу от Сахары» . Достижения науки . 6 (24): eaaz0183. Бибкод : 2020SciA....6..183W . дои : 10.1126/sciadv.aaz0183 . ПМЦ 7292641 . ПМИД 32582847 .
- ^ Jump up to: а б с Ван К., Гольдштейн С., Блисдейл М., Клист Б., Бостоен К., Баква-Луфу П. и др. (июнь 2020 г.). «Древние геномы раскрывают сложные закономерности перемещения, взаимодействия и замещения населения в странах Африки к югу от Сахары» . Достижения науки . 6 (24): eaaz0183. Бибкод : 2020SciA....6..183W . дои : 10.1126/sciadv.aaz0183 . ПМЦ 7292641 . ПМИД 32582847 .
- ^ Jump up to: а б с д Липсон, Марк; и др. (23 февраля 2022 г.). «Таблица расширенных данных 1. Древние люди, проанализированные в этом исследовании: древняя ДНК и глубокая структура населения африканских собирателей к югу от Сахары» . Природа . 603 (7900): 290–296. Бибкод : 2022Natur.603..290L . дои : 10.1038/s41586-022-04430-9 . ISSN 0028-0836 . OCLC 9437356581 . ПМК 8907066 . ПМИД 35197631 . S2CID 247083477 .
- ^ Jump up to: а б с д и ж г час я дж Скоглунд П., Томпсон Дж.К., Прендергаст М.Е., Миттник А., Сирак К., Хайдиньяк М. и др. (сентябрь 2017 г.). «Реконструкция структуры доисторического населения Африки» . Клетка . 171 (1): 59–71.e21. дои : 10.1016/j.cell.2017.08.049 . ПМЦ 5679310 . ПМИД 28938123 .
- ^ Jump up to: а б с д и ж г Шлебуш К.М., Мальмстрем Х., Гюнтер Т., Сьёдин П., Коутиньо А., Эдлунд Х. и др. (ноябрь 2017 г.). «Древние геномы Южной Африки оценивают расхождение современного человека от 350 000 до 260 000 лет назад» . Наука . 358 (6363): 652–655. Бибкод : 2017Sci...358..652S . дои : 10.1126/science.aao6266 . ПМИД 28971970 . S2CID 206663925 .
- ^ Jump up to: а б с д и ж г Шлебуш К.М., Мальмстрем Х., Гюнтер Т., Сьёдин П., Коутиньо А., Эдлунд Х. и др. (3 ноября 2017 г.). «Дополнительные материалы к древним геномам Южной Африки оценивают дивергенцию современного человека от 350 000 до 260 000 лет назад» . Наука . 358 (6363): 652–655. Бибкод : 2017Sci...358..652S . дои : 10.1126/science.aao6266 . ПМИД 28971970 . S2CID 206663925 .
- ^ Коутиньо А., Мальмстрем Х., Эдлунд Х., Хеншилвуд К.С., ван Никерк К.Л., Ломбард М. и др. (апрель 2021 г.). «Человеческие волосы позднего каменного века из приюта Ваалкранс, флористический регион мыса Южной Африки, обнаруживают генетическое родство с группами Кхо» . Американский журнал физической антропологии . 174 (4). Am J Phys Anthropol: 701–713. дои : 10.1002/ajpa.24236 . HDL : 11250/2763572 . ПМИД 33539553 . S2CID 213563734 .
- ^ Рифкин, Риан Ф.; и др. (3 марта 2023 г.). «ДНК Rickettsia felis получена у ребенка, жившего на юге Африки 2000 лет назад» . Коммуникационная биология . 6 (1): 240. doi : 10.1038/s42003-023-04582-y . OCLC 9786799123 . ПМЦ 9984395 . ПМИД 36869137 . S2CID 257312840 .
- ^ Рифкин, Риан Ф.; и др. (3 марта 2023 г.). «Дополнительные примечания 1–7 к ДНК Rickettsia felis, полученной от ребенка, который жил на юге Африки 2000 лет назад» (PDF) . Коммуникационная биология . 6 (1): 240. doi : 10.1038/s42003-023-04582-y . OCLC 9786799123 . ПМЦ 9984395 . ПМИД 36869137 . S2CID 257312840 .
- ^ Jump up to: а б Найт А., Андерхилл П.А., Мортенсен Х.М., Животовский Л.А., Лин А.А., Хенн Б.М. и др. (март 2003 г.). «Расхождение африканской Y-хромосомы и мтДНК дает представление об истории щелкающих языков» . Современная биология . 13 (6): 464–473. дои : 10.1016/S0960-9822(03)00130-1 . ПМИД 12646128 . S2CID 52862939 .
- ^ Хаммер М.Ф., Карафет Т.М., Редд А.Дж., Джарджанази Х., Сантакьяра-Бенерекетти С., Судьялл Х., Зегура С.Л. (июль 2001 г.). «Иерархические закономерности глобального разнообразия Y-хромосом человека» . Молекулярная биология и эволюция . 18 (7): 1189–1203. doi : 10.1093/oxfordjournals.molbev.a003906 . ПМИД 11420360 .
- ^ Найду Т., Шлебуш К.М., Маккан Х., Патель П., Махабир Р., Эразмус Дж.К., Судьялл Х. (сентябрь 2010 г.). «Разработка метода расширения с единой базой для определения гаплогрупп Y-хромосомы в популяциях Африки к югу от Сахары» . Исследовательская генетика . 1 (1): 6. дои : 10.1186/2041-2223-1-6 . ПМЦ 2988483 . ПМИД 21092339 .
- ^ Jump up to: а б Са, Луиза; и др. (16 августа 2022 г.). «Филогеография митохондриальных линий к югу от Сахары за пределами Африки подчеркивает роль голоценовых изменений климата и атлантической работорговли» . Международный журнал молекулярных наук . 23 (16): 9219. doi : 10.3390/ijms23169219 . ISSN 1661-6596 . OCLC 9627558751 . ПМЦ 9408831 . ПМИД 36012483 . S2CID 251653686 .
- ^ Чен Ю.С., Олкерс А., Шурр Т.Г., Когельник А.М., Хуопонен К., Уоллес, округ Колумбия (апрель 2000 г.). «Вариации мтДНК южноафриканских кунгов и хве - и их генетические связи с другими африканскими популяциями» . Американский журнал генетики человека . 66 (4): 1362–1383. дои : 10.1086/302848 . ПМК 1288201 . ПМИД 10739760 .
- ^ Тишкофф С.А., Гондер М.К., Хенн Б.М., Мортенсен Х., Найт А., Жиньу С. и др. (октябрь 2007 г.). «История говорящих по щелчку популяций Африки, выведенная на основе генетических вариаций мтДНК и Y-хромосомы» . Молекулярная биология и эволюция . 24 (10): 2180–2195. дои : 10.1093/molbev/msm155 . ПМИД 17656633 .
- ^ Шлебуш К.М., Найду Т., Судьял Х. (ноябрь 2009 г.). «Мини-секвенирование SNaPshot для определения митохондриальных макрогаплогрупп, обнаруженных в Африке». Электрофорез . 30 (21): 3657–3664. дои : 10.1002/elps.200900197 . ПМИД 19810027 . S2CID 19515426 .
- ^ Jump up to: а б с д и Пфенниг, Аарон; и др. (29 марта 2023 г.). «Эволюционная генетика и примесь в африканских популяциях» . Геномная биология и эволюция . 15 (4): evad054. дои : 10.1093/gbe/evad054 . OCLC 9817135458 . ПМЦ 10118306 . ПМИД 36987563 . S2CID 257803764 .
- ^ Хенн Б.М., Жинью Ч.Р., Джобин М., Гранка Дж.М., Макферсон Дж.М., Кидд Дж.М. и др. (март 2011 г.). «Геномное разнообразие охотников-собирателей предполагает южноафриканское происхождение современных людей» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 108 (13). Национальная академия наук : 5154–5162. дои : 10.1073/pnas.1017511108 . ПМК 3069156 . ПМИД 21383195 .
- ^ Каплан, Мэтт (2011). «Изучение генов бросает вызов происхождению человека в Восточной Африке» . Научный американец . Издательская группа «Природа» . Проверено 22 июня 2012 г.
- ^ Jump up to: а б с д Пфайффер С (2020). «Болезнь как фактор африканских археологических данных» . Африканский археологический обзор . 37 (3): 487–490. дои : 10.1007/s10437-020-09405-7 . ПМЦ 7445818 . ПМИД 32863518 .
- ^ Jump up to: а б Вонкам, Амбруаз; Адейемо, Адебовале (8 марта 2023 г.). «Использование нашего общего африканского происхождения для понимания эволюции и здоровья человека» (PDF) . Клеточная геномика . 3 (3): 100278. doi : 10.1016/j.xgen.2023.100278 . ПМЦ 10025516 . ПМИД 36950382 . S2CID 257458855 .