Пептидогликангликозилтрансфераза
| пептидогликангликозилтрансфераза | |||
|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||
| Номер ЕС. | 2.4.1.129 | ||
| Номер CAS. | 79079-04-2 | ||
| Базы данных | |||
| ИнтЭнк | вид IntEnz | ||
| БРЕНДА | БРЕНДА запись | ||
| Экспаси | Просмотр NiceZyme | ||
| КЕГГ | КЕГГ запись | ||
| МетаЦик | метаболический путь | ||
| ПРЯМОЙ | профиль | ||
| PDB Структуры | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||
| Генная онтология | АмиГО / QuickGO | ||
| |||
Пептидогликангликозилтрансфераза ( EC 2.4.1.129 ) представляет собой фермент, в биосинтезе пептидогликана используемый . Он переносит дисахарид-пептид с донорного субстрата для синтеза гликановой цепи. [1]
Этот фермент принадлежит к семейству гликозилтрансфераз , в частности гексозилтрансфераз. Систематическое название этого класса ферментов — ундекапренилдифосфо-(N-ацетил-D-глюкозаминил-(1->4)-(N-ацетил-D-мурамоилпентапептид):ундекапренилдифосфо-(N-ацетил-D-глюкозаминил-( 1 ->4)-N-ацетил-D-мурамоилпентапептид) дисахаридтрансфераза . Другие широко используемые названия включают PG-II , бактопренилдифосфо-N-ацетилмурамоил-(N-ацетил-D-глюкозаминил)- , пентапептид:пептидогликан , N-ацетилмурамоил-. N-ацетил-D-глюкозаминилтрансфераза , пенициллинсвязывающий белок (3 или 1В) и пептидогликантрансгликозилаза .
Функция
[ редактировать ]Пептидогликангликозилтрансфераза соединяет субъединицы липида II для синтеза цепей пептидогликана. Транспептидазы сшивают углеводные цепи, образуя каркас клеточной стенки. [2]
Он катализирует химическую реакцию
- [GlcNAc-(1->4)-Mur 2 Ac(oyl-L-Ala-gamma-D-Glu-L-Lys-D-Ala-D-Ala)]n-дифосфоундекапренол + GlcNAc-(1->4 ) )-Mur 2 Ac(ойл-L-Ala-гамма-D-Glu-L-Lys-D-Ala-D-Ala)-дифосфоундекапренол
- ⇌
- [GlcNAc-(1->4)-Mur 2 Ac(ойл-L-Ala-гамма-D-Glu-L-Lys-D-Ala-D-Ala)]n + 1- дифосфоундекапренол + ундекапренилдифосфат
Двумя субстратами этого фермента являются
- [GlcNAc-(1->4)-Mur2Ac(оил-L-Ala-гамма-D-Glu-L-Lys-D-Ala-D-Ala)]n-дифосфоундекапренол,
- GlcNAc-(1->4)-Mur2Ac(оил-L-Ala-гамма-D-Glu-L-Lys-D-Ala-D-Ala)-дифосфоундекапренол,
его 2 продукта тогда как
- [GlcNAc-(1->4)-Mur2Ac(оил-L-Ala-гамма-D-Glu-L-Lys-D-Ala-D-Ala)]n+1-дифосфоундекапренол и
- ундекапренилдифосфат . [3]
Структурные исследования
[ редактировать ]По состоянию на конец 2007 года 3 структуры для этого класса ферментов были решены PDB с кодами доступа 2BG1 , 2UWX и 2UWY .
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Меслех М.Ф., Раджаратнам П., Конрад М., Чандрасекаран В., Лю СМ, Пандья Б.А. и др. (февраль 2016 г.). «Нацеливание на синтез пептидогликана бактериальной клеточной стенки путем ингибирования активности гликозилтрансферазы». Химическая биология и дизайн лекарств . 87 (2): 190–199. дои : 10.1111/cbdd.12662 . ПМИД 26358369 .
- ^ Юань Ю, Барретт Д., Чжан Ю., Кане Д., Слиз П., Уокер С. (март 2007 г.). «Кристаллическая структура пептидогликангликозилтрансферазы предлагает модель процессивного синтеза гликановой цепи» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 104 (13): 5348–5353. дои : 10.1073/pnas.0701160104 . ПМЦ 1817829 . ПМИД 17360321 .
- ^ «Информация о EC 2.4.1.129 - пептидогликангликозилтрансфераза - База данных ферментов BRENDA» . www.brenda-enzymes.org . Проверено 13 мая 2022 г.
