Джанет Торнтон
Дама Джанет Торнтон | |
|---|---|
 Джанет Торнтон | |
| Рожденный | Джанет Морин Маклафлин [8] 23 мая 1949 г. |
| Национальность | Британский |
| Образование | Средняя школа Бери [9] |
| Альма-матер |
|
| Известный | |
| Супруг | Алан Д. Торнтон |
| Дети | 2 [8] |
| Награды |
|
| Научная карьера | |
| Поля | |
| Учреждения | |
| Диссертация | Конформация динуклеотидов (1975) |
| Известные студенты |
|
| Веб-сайт | www |
Дама Джанет Морин Торнтон, DBE FRS FMedSci FRSC (родилась 23 мая 1949 г.) [8] — старший научный сотрудник и почетный директор Европейского института биоинформатики (EBI), входящего в состав Европейской лаборатории молекулярной биологии (EMBL). [12] [13] [14] Она является одним из ведущих в мире исследователей в области структурной биоинформатики , использующей вычислительные методы для понимания структуры и функции белков. [2] [15] [16] [17] Она занимала должность директора EBI с октября 2001 по июнь 2015 года и играла ключевую роль в ELIXIR . [11]
Образование
[ редактировать ]Торнтон посещала гимназию Бери до 1967 года, где была старостой . [9] по физике После окончания Ноттингемского университета Торнтон получил степень магистра биофизики в Королевском колледже Лондона и докторскую степень по биофизике в Национальном институте медицинских исследований в Милл-Хилле, Лондон, в 1973 году. [18]
Карьера и исследования
[ редактировать ]После получения докторской степени Торнтон работала в области молекулярной биофизики с Дэвидом Чилтоном Филлипсом в Оксфордском университете . [19] [20] В 1978 году она вернулась в Национальный институт медицинских исследований, а после этого поступила на стажировку в Биркбек-колледж , входящий в состав Лондонского университета . В 1990 году она была назначена профессором и директором отдела биомолекулярной структуры и моделирования на факультете биохимии и молекулярной биологии Университетского колледжа Лондона , а позже также была назначена на кафедру Бернала на кафедре кристаллографии в Биркбек-колледже . [ нужна ссылка ]
Торнтон был директором Европейского института биоинформатики (EBI) с 2001 по 2015 год в кампусе Wellcome Genome в Хинкстоне недалеко от Кембриджа . [21] Она была организатором совместной конференции « Интеллектуальные системы для молекулярной биологии» (ISMB) и Европейской конференции по вычислительной биологии (ECCB) в Глазго в 2004 году. [22]
Работа Торнтона носит весьма междисциплинарный характер и связана, среди прочего, со структурной биологией, биоинформатикой, биологической химией и хемоинформатикой. Она была пионером в проверке структуры для кристаллографии белков , разработав широко используемое программное обеспечение ProCheck. [23] Вместе с Кристиной Оренго она представила CATH. [24] Классификация структуры белков. [4] [6] [25] [26] [27] [28] [29] [30] [31] Ее группа разработала надежный инструмент классификации, сравнения и аннотации ферментов – EC-BLAST. [32] который вычисляет сходство между ферментами на основе химических реакций, фиксируя изменения связей, реакционные центры или структурное сходство между ними. [33] [32]
С 2008 по 2012 год она координировала четырехлетний подготовительный этап европейской инфраструктуры данных в области медико-биологических наук ELIXIR . [11] По состоянию на 2013 год она остается в совете директоров ELIXIR в качестве одного из . научных делегатов EMBL [34] Ее исследования финансировались Советом медицинских исследований , Исследовательским советом по биотехнологиям и биологическим наукам (BBSRC). [13] [35] Wellcome Trust и Европейский Союз .
Докторанты и постдокты
[ редактировать ]Торнтон руководил несколькими кандидатами наук. [36] и постдокторанты, включая Сару Тейхманн [6] и Дэвид Джонс . [5]
Награды и почести
[ редактировать ]Торнтон был избран членом Королевского общества (FRS) в 1999 году . [37] В 2000 году она стала членом Европейской организации молекулярной биологии (EMBO). [1] иностранный сотрудник Национальной академии наук США в 2003 году и член Академии медицинских наук (FMedSci) в 2014 году. Торнтон — сверхштатный научный сотрудник Черчилль-колледжа в Кембридже . [8] [38] В 2017 году она была избрана членом Королевского химического общества (FRSC). [39] Номинация Торнтона в Королевское общество гласит:
Джанет Торнтон известна своим вкладом в понимание трехмерной структуры белка: ее проницательные сравнительные исследования привели к разработке алгоритмов, которые используются для анализа и прогнозирования супервторичной и третичной структуры . В 1970-х годах в Оксфорде (совместно с М. Дж. Штернбергом ) она установила четкие и полезные правила для направленности единиц BaB и продемонстрировала действенные методы прогнозирования порядка цепей в B-листах . В Биркбеке она разработала эту работу, чтобы определить семейства конформаций в B-шпильках и aB-звеньях, где структуры ранее считались случайными. Она провела наиболее полный и полезный анализ третичных взаимодействий боковых цепей белков, что привело к созданию атласа, ценного для дизайна белков и лигандов. Атлас широко используется как в научных кругах, так и в фармацевтической промышленности. В Университетском колледже она превратила исследования конформации боковой цепи и стереохимии в процедуру PROCHECK для оценки качества экспериментально определенных белковых структур: она широко используется для проверки белковых структур. Она представила метод, известный как нарезка, который дает убедительные доказательства третичной структуры белковой последовательности, которая явно не гомологична какой-либо другой известной структуре. [40]
Ее цитата об избрании в Академию медицинских наук гласит:
Дама Джанет Торнтон — директор Европейского института биоинформатики и мировой лидер в области биоинформатики. Она внесла значительный вклад в медицинскую науку, расширив наше фундаментальное понимание структуры белков и того, как они способствуют болезням и старению. Разработанные ею инструменты и базы данных используются во всем мире для фундаментальных исследований, в научных кругах, а также в фармацевтических компаниях.В качестве директора EBI она отвечала за стратегические разработки, связанные с влиянием данных медико-биологических наук на медицинскую науку. Она активно решает задачу объединения биологических и медицинских данных в Великобритании и создания инструментов, которые облегчат использование этих данных в исследованиях и в клинике. [41]
Торнтон была назначена кавалером Ордена Британской Империи (CBE) в 2000 году и кавалером Ордена Британской Империи (DBE) в честь Дня рождения 2012 года за заслуги перед биоинформатикой. [42] В 2010 году газета Times назвала Торнтона 86-м номером в списке «Эврика-100» британских ученых. [43] она была удостоена награды «Наука избирательного права» . В 2011 году [3]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б Анон (2000). «Карманный справочник EMBO» (PDF) . Европейская организация молекулярной биологии. Архивировано из оригинала (PDF) 16 марта 2015 года.
- ^ Jump up to: а б Загорский, Н. (2005). «Профиль Джанет М. Торнтон» . Труды Национальной академии наук . 102 (35): 12296–12298. Бибкод : 2005PNAS..10212296Z . дои : 10.1073/pnas.0505819102 . ПМК 1194944 . ПМИД 16118281 .
- ^ Jump up to: а б «Честь и реликвия Сары Тейхманн» . 9 марта 2012 г.
- ^ Jump up to: а б Публикации Джанет Торнтон , индексируемые Google Scholar
- ^ Jump up to: а б Джонс, DT ; Тейлор, WR; Торнтон, Дж. М. (1992). «Новый подход к распознаванию складки белка». Природа . 358 (6381): 86–89. Бибкод : 1992Natur.358...86J . дои : 10.1038/358086a0 . ISSN 0028-0836 . ПМИД 1614539 . S2CID 4266346 .
- ^ Jump up to: а б с Маркс, В. (2014). «Авторский файл: Джанет Торнтон» . Природные методы . 11 (2): 115. doi : 10.1038/nmeth.2831 . ПМИД 24645189 . S2CID 1970327 .
- ^ Тейхманн, SA ; Райсон, Южная Каролина; Торнтон, Дж. М. ; Райли, М; Гоф, Дж .; Чотия, К. (2001). «Эволюция и структурная анатомия метаболических путей малых молекул в Escherichia coli». Журнал молекулярной биологии . 311 (4): 693–708. CiteSeerX 10.1.1.121.1628 . дои : 10.1006/jmbi.2001.4912 . ПМИД 11518524 .
- ^ Jump up to: а б с д Анон (2015). «Торнтон, дама Джанет (М.)» . Кто есть кто (онлайн- изд. Oxford University Press ). А&С Черный. дои : 10.1093/ww/9780199540884.013.U37638 . (Требуется подписка или членство в публичной библиотеке Великобритании .)
- ^ Jump up to: а б Томсон, Дэвид (27 сентября 2013 г.). «Ведущий учёный говорит ученикам гимназии Бери: «Следуйте за своей мечтой» » . burytimes.co.uk . Бери Таймс.
- ^ Перл, FM; Беннетт, CF; Брей, Дж. Э.; Харрисон, AP; Мартин, Н; Шеперд, А; Силлито, я; Торнтон, Дж; Оренго, Калифорния (2003). «База данных CATH: расширенный ресурс семейства белков для структурной и функциональной геномики» . Исследования нуклеиновых кислот . 31 (1): 452–5. дои : 10.1093/нар/gkg062 . ПМК 165509 . ПМИД 12520050 .
- ^ Jump up to: а б с Кроссвелл, ЖК; Торнтон, Дж. М. (2012). «ЭЛИКСИР: Распределенная инфраструктура для европейских биологических данных». Тенденции в биотехнологии . 30 (5): 241–242. дои : 10.1016/j.tibtech.2012.02.002 . ПМИД 22417641 .
- ^ «Профессор Дам Джанет Торнтон: директор Европейского института биоинформатики» . Архивировано из оригинала 9 июня 2013 года.
- ^ Jump up to: а б «Великие британские пионеры биологической науки - профессор Дама Джанет Торнтон» . Архивировано из оригинала 9 февраля 2015 года.
- ^ Джанет Торнтон Публикации из Europe PubMed Central
- ^ Дин, Кэролайн ; Осборн, Мэри ; Ошлак, Алисия ; Торнтон, Джанет (2012). «Женщины в науке» . Геномная биология . 13 (3): 148–201. дои : 10.1186/gb4005 . ПМЦ 3439960 . ПМИД 22405408 .
- ^ «Страница исследовательской группы Торнтона» . Архивировано из оригинала 18 апреля 2011 года.
- ^ Результаты поиска автора Thornton JM на PubMed .
- ^ Торнтон, Джанет (1975). Конформация динуклеотидов (кандидатская диссертация). Королевский колледж Лондона. OCLC 731231069 . ПроКвест 301309997 .
- ^ Торнтон, Дж. М. ; Бэйли, премьер-министр (1976). «Расчеты конформационной энергии для молекул динуклеотидов. Систематическое исследование конформации динуклеотидов с применением к диаденозинпирофосфату». Биополимеры . 15 (5): 955–975. дои : 10.1002/bip.1976.360150511 . ПМИД 177120 . S2CID 30211950 .
- ^ Перкинс, В.Дж.; Пайпер, Э.А.; Торнтон, Дж. (1976). «Компьютерные методы конформационных исследований биологических молекул». Компьютеры в биологии и медицине . 6 (1): 23–31. дои : 10.1016/0010-4825(76)90034-2 . ПМИД 1253578 .
- ^ «Джанет Торнтон уходит в отставку» . Европейский институт биоинформатики. 30 июня 2015 г. Архивировано из оригинала 3 июля 2015 г.
- ^ «ISMB/ECCB 2004» . www.iscb.org .
- ^ Ласковский, РА; Макартур, штат Вашингтон; Мосс, Д.С.; Торнтон, Дж. М. (1993). «PROCHECK: Программа для проверки стереохимического качества белковых структур». Журнал прикладной кристаллографии . 26 (2): 283–291. Бибкод : 1993JApCr..26..283L . дои : 10.1107/S0021889892009944 .
- ^ Оренго, Калифорния; Мичи, AD; Джонс, С.; Джонс, DT ; Суинделлс, МБ; Торнтон, Дж. М. (1997). «CATH – иерархическая классификация белковых доменных структур» . Структура . 5 (8): 1093–1109. дои : 10.1016/S0969-2126(97)00260-8 . ПМИД 9309224 .
- ^ Сибанда, БЛ; Бланделл, TL ; Торнтон, Дж. М. (1989). «Конформация бета-шпильок в белковых структурах. Систематическая классификация с применением к моделированию по гомологии, подбору электронной плотности и белковой инженерии». Журнал молекулярной биологии . 206 (4): 759–77. дои : 10.1016/0022-2836(89)90583-4 . ПМИД 2500530 .
- ^ Торнтон, Дж. М. ; Сингх, Дж; Кэмпбелл, С; Бланделл, ТЛ (1988). «Распознавание белок-белок посредством взаимодействий боковой цепи». Труды Биохимического общества . 16 (6): 927–30. дои : 10.1042/bst0160927 . ПМИД 3224756 .
- ^ Бланделл, TL ; Сибанда, БЛ; Штернберг, MJ ; Торнтон, Дж. М. (1987). «Основываясь на знаниях, предсказание белковых структур и создание новых молекул». Природа . 326 (6111): 347–52. Бибкод : 1987Natur.326..347B . дои : 10.1038/326347a0 . ПМИД 3550471 . S2CID 4330510 .
- ^ Публикации Джанет Торнтон , индексируемые библиографической базой данных Scopus . (требуется подписка)
- ^ Бланделл, Т ; Барлоу, Д; Боркакоти, Н; Торнтон, Дж (1983). «Искажения, вызванные растворителем, и кривизна альфа-спиралей». Природа . 306 (5940): 281–3. Бибкод : 1983Natur.306..281B . дои : 10.1038/306281a0 . ПМИД 6646210 . S2CID 4331613 .
- ^ Ривз, Джорджия; Эйлбек, К.; Магран, М.; О'Донован, К.; Монтекки-Палацци, Л.; Харрис, Массачусетс; Орчард, С.; Хименес, RC; Прлич, А.; Хаббард, TJP ; Хермякоб, Х.; Торнтон, Дж. М. (2008). «Онтология свойств белков: инструмент для унификации аннотаций свойств белков» . Биоинформатика . 24 (23): 2767–2772. doi : 10.1093/биоинформатика/btn528 . ПМК 2912506 . ПМИД 18936051 .
- ^ Рахман, SA; Куэста, СМ; Фернем, Н.; Холлидей, GL; Торнтон, Дж. М. (2014). «EC-BLAST: Инструмент для автоматического поиска и сравнения ферментативных реакций» . Природные методы . 11 (2): 171–4. дои : 10.1038/nmeth.2803 . ПМК 4122987 . ПМИД 24412978 .
- ^ Jump up to: а б Рахман, Сайед Асад; Куэста, Серхио Мартинес; Фернем, Николас; Холлидей, Джемма Л.; Торнтон, Джанет М. (1 февраля 2014 г.). «EC-BLAST: инструмент для автоматического поиска и сравнения ферментативных реакций» . Природные методы . 11 (2): 171–174. дои : 10.1038/nmeth.2803 . ISSN 1548-7091 . ПМК 4122987 . ПМИД 24412978 .
- ^ Рахман, Сайед Асад; Торранс, Джиллиан; Бальдаччи, Лоренцо; Мартинес Куэста, Серхио; Феннингер, Франц; Гопал, Нимиш; Чоудхари, Сакет; Мэй, Джон В.; Холлидей, Джемма Л. (1 июля 2016 г.). «Инструмент декодера реакций (RDT): извлечение особенностей химических реакций» . Биоинформатика . 32 (13): 2065–2066. doi : 10.1093/биоинформатика/btw096 . ISSN 1367-4811 . ПМК 4920114 . ПМИД 27153692 .
- ^ «Лидерство ELIXIR: Управление на этапе строительства ELIXIR» . Архивировано из оригинала 14 октября 2013 года.
- ^ «Гранты правительства Великобритании предоставлены Джанет Торнтон» . Исследовательские советы Великобритании . Архивировано из оригинала 10 марта 2015 года.
- ^ Анон (2014). «Публикации кандидатских диссертаций EMBL-EBI» . Архивировано из оригинала 4 марта 2014 года.
- ^ «За что профессору Торнтону была вручена награда ФРС» . Лондон: Королевское общество. Архивировано из оригинала 12 ноября 2007 года.
- ^ «Профессор Дам Джанет Торнтон, доктор философии, CBE, FRS, DBE, Черчилль-колледж, Кембридж» . Архивировано из оригинала 10 марта 2015 года.
- ^ «Наши почетные коллеги» . Королевское химическое общество . Проверено 27 февраля 2018 г.
- ^ «EC/1999/34: Торнтон, Джанет М» . Лондон: Королевское общество. Архивировано из оригинала 15 апреля 2013 года.
- ^ «Профессор Дам Джанет Торнтон, DBE, FRS FMedSci» . Академия медицинских наук. Архивировано из оригинала 10 марта 2015 года.
- ^ «№60173» . Лондонская газета (Приложение). 16 июня 2012 г. с. 6.
- ^ «Эврика 100: люди, которые имеют значение» . thetimes.co.uk . Лондон: Таймс.
- 1949 рождений
- Живые люди
- Члены Европейской организации молекулярной биологии
- Выпускники Королевского колледжа Лондона
- Дамы-кавалеры Ордена Британской Империи
- Женщины-члены Королевского общества
- Стипендиаты Черчилль-колледжа, Кембридж
- Члены Международного общества вычислительной биологии
- Члены Королевского химического общества
- Академики Биркбека, Лондонский университет
- Преподаватели Университетского колледжа Лондона
- Британские биоинформатики
- Выпускники Ноттингемского университета
- Иностранные сотрудники Национальной академии наук
- Факультет Национального института медицинских исследований
- Члены Академии медицинских наук (Великобритания)
- Члены Королевского общества
- Женщины-биоинформатики
- Люди, получившие образование в гимназии Бери (девочки)