Корепрессор
В генетике и молекулярной биологии корешессор - это молекула, которая экспрессию генов подавляет . [ 1 ] У прокариотов корепрессоры являются небольшими молекулами , тогда как у эукариот корепрессоры являются белками . Корепрессор напрямую не связывается с ДНК , но вместо этого косвенно регулирует экспрессию генов путем связывания с репрессорами .
Корепрессор подавляет (или подавляет) экспрессию генов путем связывания и активации фактора транскрипции репрессора . гена Репрессор, в свою очередь, связывается с последовательности оператора (сегмент ДНК , с которой фактор транскрипции связывается для регуляции экспрессии генов), тем самым блокируя транскрипцию этого гена.

Функция
[ редактировать ]Прокариоты
[ редактировать ]В прокариотах термин корепрессор используется для обозначения активирующего репрессорного белка лиганда . Например, E. coli репрессор триптофана (TRPR) способен связываться с ДНК и репрессировать транскрипцию оперона , TRP когда его триптофан Corepressor -триптофан связан с ним. TRPR в отсутствие триптофана известна как апорепрессор и неактивен в подавлении транскрипции генов. [ 2 ] TRP Operon кодирует ферменты, ответственные за синтез триптофана. Следовательно, TRPR предоставляет механизм отрицательной обратной связи , который регулирует биосинтез триптофана.
Короче говоря, триптофан действует в качестве корепрессора для своего собственного биосинтеза. [ 3 ]
Эукариоты
[ редактировать ]У эукариот корепрессор - это белок, который связывается с факторами транскрипции . [ 4 ] В отсутствие корепрессоров и в присутствии коактиваторов факторы транскрипции усиливают экспрессию генов. Коактиваторы и корепрессоры конкурируют за те же сайты связывания на факторах транскрипции. Второй механизм, посредством которого корепрессоры могут подавлять транскрипционную инициацию , когда связаны с комплексами транскрипции/ДНК, - это рекрутирование гистондеацетилаз , которые катализируют удаление ацетильных групп из остатков лизина . Это увеличивает положительный заряд гистонов , который усиливает электростатическое притяжение между положительно заряженными гистонами и отрицательно заряженной ДНК, что делает ДНК менее доступной для транскрипции. [ 5 ] [ 6 ]
У людей от нескольких дюжин до нескольких сотен корепрессоров известно, в зависимости от уровня уверенности, с которым может быть сделана характеристика белка в качестве корепрессоров. [ 7 ]
Примеры корепрессоров
[ редактировать ]Ncor
[ редактировать ]NCOR (ко-репрессор ядерного рецептора) напрямую связывается с D и E-доменами ядерных рецепторов и подавляет их транскрипционную активность. [ 8 ] [ 9 ] [ 10 ] класса Гистоновые деацетилазы рекрутируются с помощью NCOR через SIN3, а NCOR напрямую связывается с диацетилазами класса II класса . [ 8 ] [ 10 ] [ 11 ]
Посредник молчания рецептора ретиноида и щитовидной железы
[ редактировать ]SMRT (медиатор молчания ретиноевой кислоты и рецептора гормонов щитовидной железы), также известный как NCOR2 , является альтернативно сплайсированным SRC-1 (коактиватор-стероид-рецептор-1). [ 8 ] [ 9 ] На него отрицательно и положительно влияет MAPKKK (активированный митогеном протеинкиназу киназу киназу) и фосфорилирование казеинкиназы 2 соответственно. [ 8 ] SMRT имеет два основных механизма: во -первых, аналогично NCOR, SMRT также рекрутирует деацетилазы класса I через SIN3 и непосредственно связывается с диацетилазами гистона класса II . [ 8 ] Во -вторых, он связывает и секвестер компонентов общего транскрипционного механизма, таких как транскрипционный фактор II b . [ 8 ] [ 10 ]
Роль в биологических процессах
[ редактировать ]Известно, что Corepressors регулируют транскрипцию посредством различных состояний активации и инактивации. [ 12 ] [ 13 ]
NCOR и SMRT действуют как комплекс корепрессора для регулирования транскрипции, становясь активированным после того, как лиганд будет связан. [ 12 ] [ 13 ] [ 14 ] [ 15 ] Нокауты NCOR привели к смерти эмбриона, что указывает на его важность в развитии эритроцитарной, тимуческой и нервной системы. [ 15 ] [ 16 ]
Мутации в определенных корепрессорах могут привести к дерегуляции сигналов. [ 13 ] SMRT способствует развитию сердечных мышц, с нокаутами комплекса, что приводит к менее развитым мышцам и ненадлежащим развитию. [ 13 ]
Также было обнаружено, что NCOR является важной контрольной точкой в таких процессах, как воспаление и активация макрофагов . [ 15 ]
Последние данные также свидетельствуют о роли корепрессора RIP140 в метаболической регуляции энергетического гомеостаза. [ 14 ]
Клиническое значение
[ редактировать ]Болезни
[ редактировать ]Поскольку Corpressors участвуют и регулируют широкий спектр экспрессии генов, неудивительно, что активность аберрантных корепрессоров может вызвать заболевания. [ 17 ]
Острый миелоидный лейкоз (ОМЛ) - это летальный рак крови, характеризующийся неконтролируемым ростом миелоидных клеток. [ 18 ] Два гена гомологичных корепрессоров, BCOR (BCL6 -корепрессор) и BCORL1, повторяются у с ОМЛ . пациентов [ 19 ] [ 20 ] BCOR работает с несколькими факторами транскрипции и, как известно, играет жизненно важную регуляторную роль в эмбриональном развитии. [ 18 ] [ 19 ] Клинические результаты обнаружили соматические мутации BCOR у ~ 4% невыбранной группы пациентов с ОМЛ и ~ 17% у подмножества пациентов, у которых не хватает известных мутаций с ОМЛ . [ 18 ] [ 19 ] Точно так же BCORL1 является корепрессором, который регулирует клеточные процессы, [ 21 ] и было обнаружено, что он мутировал у ~ 6% протестированных пациентов с ОМЛ . [ 18 ] [ 20 ] Эти исследования указывают на сильную связь между мутациями корепрессора и AML . Дальнейшее исследование корепрессора может выявить потенциальные терапевтические цели для ОМЛ и других заболеваний.
Терапевтический потенциал
[ редактировать ]Corpressors представляют много потенциальных возможностей для лекарств, чтобы нацелиться на обширный диапазон заболеваний. [ 22 ]
Повышенная регуляция BCL6 наблюдается при раке, таких как диффузные большие B-клеточные лимфомы (DLBCLS) , [ 23 ] [ 24 ] [ 25 ] [ 26 ] колоректальный рак , [ 27 ] [ 28 ] и рак легких . [ 29 ] [ 30 ] BCL-6 COREPRORSOR , SMRT , NCOR и другие корепрессоры способны взаимодействовать и транскрипционно подавлять BCL6 . [ 23 ] [ 24 ] [ 25 ] [ 26 ] Маломолекулярные соединения, такие как синтетические пептиды , которые нацелены на взаимодействие BCL6 и корепрессора, [ 23 ] [ 24 ] а также другие ингибиторы взаимодействия белка белка, [ 26 ] было показано, что эффективно убивают раковые клетки.
Активированный рецептор печени X (LXR) образует комплекс с корепрессорами для подавления воспалительного ответа при ревматоидном артрите , что делает агонисты LXR , такие как GW3965 потенциальной терапевтической стратегией. [ 31 ] [ 32 ] Урсодеоксихолевая кислота (UDCA) , активируя малого гетеродимерного партнера корепрессора, взаимодействующего с белком лейциновой молнии (улыбки), ингибирует экспрессию IL-17, воспалительного цитокина и подавляет клетки Th17, оба влияют на ревматоидный артрит . [ 33 ] [ 34 ] Этот эффект зависит от дозы у людей, и, как полагают, UCDA является еще одним проспективным агентом терапии ревматоидным артритом . [ 33 ]
Смотрите также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Привальский, Мартин Л., изд. (2001). Транскрипционные корепрессоры: медиаторы репрессии эукариотических генов . Текущие темы в области микробиологии и иммунологии. Тол. 254. Берлин, Гейдельберг: Спрингер Берлин Хейдельберг. doi : 10.1007/978-3-662-10595-5 . ISBN 978-3-642-08709-7 Полем S2CID 8922796 .
- ^ Эванс П.Д., Джазья М., Дживс М., Хайд Эй (декабрь 1996 г.). «Исследования ЯМР Escherichia coli Trp Repressor.trprs Операторный комплекс». Евро. J. Biochem . 242 (3): 567–75. doi : 10.1111/j.1432-1033.1996.0567r.x . PMID 9022683 .
- ^ Foster JB, Slonczewski J (2010). Микробиология: развивающаяся наука (второе изд.). Нью -Йорк: WW Norton & Company. ISBN 978-0-393-93447-2 .
- ^ Дженстер Г. (август 1998 г.). «Коактиваторы и корепрессоры в качестве посредников функции ядерного рецептора: обновление». Мол Клетка. Эндокринол . 143 (1–2): 1–7. doi : 10.1016/s0303-7207 (98) 00145-2 . PMID 9806345 . S2CID 26244186 .
- ^ Лазар М.А. (2003). «Ядерные рецептор -корепрессоры» . Nucl Recept Signal . 1 : E001. doi : 10.1621/nrs.01001 . PMC 1402229 . PMID 16604174 .
- ^ Гудсон М., Джонас Б.А., Привальский М.А. (2005). «Corpressors: пользовательский пошив и изменения во время ждете» . Nucl Recept Signal . 3 (21 октября): E003. doi : 10.1621/nrs.03003 . PMC 1402215 . PMID 16604171 .
- ^ Schaefer U, Schmeier S, Bajic VB (январь 2011 г.). «TCOF-DB: база данных Dragon для сотрудников транскрипции человека и взаимодействующих белков транскрипции» . Нуклеиновые кислоты Res . 39 (проблема базы данных): D106–10. doi : 10.1093/nar/gkq945 . PMC 3013796 . PMID 20965969 .
- ^ Jump up to: а беременный в дюймовый и фон Боландер, Франклин Ф. (2004), «Гормонально регулируемые факторы транскрипции» , Молекулярная эндокринология , Elsevier, с. 387–443, doi : 10.1016/b978-012111232-5/50013-0 , ISBN 978-0-12-111232-5 Получено 2020-10-25
- ^ Jump up to: а беременный Чиннадурай, G (февраль 2002 г.). «CTBP, нетрадиционный транскрипционный корепрессор в развитии и онкогенезе» . Молекулярная клетка . 9 (2): 213–224. doi : 10.1016/s1097-2765 (02) 00443-4 . PMID 11864595 .
- ^ Jump up to: а беременный в Каммер, Гэри М. (2004), «Эстроген, передача сигнала и системная волчанка эритематозу: молекулярные механизмы» , принципы гендерной специфической медицины , Elsevier, стр. 1082–1092, DOI : 10.1016/B978-012440905-7/50375555. -3 , ISBN 978-0-12-440905-7 Получено 2020-10-25
- ^ Кадамб, Рама; Миттал, Шилпи; Бансал, Нидхи; Батра, Хариш; Салуджа, Даман (август 2013 г.). «SIN3: понимание его регуляторных функций транскрипции» . Европейский журнал клеточной биологии . 92 (8–9): 237–246. doi : 10.1016/j.ejcb.2013.09.001 . PMID 24189169 .
- ^ Jump up to: а беременный Rosenfeld, MG (2006-06-01). «Датчики и сигналы: коактиватор/корепрессор/эпигенетический код для интеграции зависимых от сигнальных программ транскрипционного ответа» . Гены и развитие . 20 (11): 1405–1428. doi : 10.1101/gad.1424806 . ISSN 0890-9369 . PMID 16751179 .
- ^ Jump up to: а беременный в дюймовый Батталья, Себастьяно; Магуайр, Орла; Кэмпбелл, Морей Дж. (2010). «Транскрипционное фактор ко-репрессоров в биологии рака: роли и нацеливание» . Международный журнал рака . 126 (11): 2511–9. doi : 10.1002/ijc.25181 . PMC 2847647 . PMID 20091860 .
- ^ Jump up to: а беременный Кристиан, Марк; Белый, Роджер; Паркер, Малкольм Г. (август 2006 г.). «Метаболическая регуляция ядерного рецептора корепрессора RIP140» . Тенденции в эндокринологии и метаболизме . 17 (6): 243–250. doi : 10.1016/j.tem.2006.06.008 . PMID 16815031 . S2CID 45870845 .
- ^ Jump up to: а беременный в Ogawa, S.; Lozach, J.; Джепсен, К.; Sawka-Verhelle, D.; Перисси, v.; Сасик, Р.; Роза, DW; Джонсон, RS; Розенфельд, мг; Glass, CK (2004-10-05). «Контрольная точка транскрипции ядерного рецептора, контролирующая активаторные белки 1-зависимые генные сети, необходимые для активации макрофагов» . Труды Национальной академии наук . 101 (40): 14461–14466. Bibcode : 2004pnas..10114461O . doi : 10.1073/pnas.0405786101 . ISSN 0027-8424 . PMC 521940 . PMID 15452344 .
- ^ Джепсен, Кристен; Германсон, Ола; Онами, Танди М; Глейберман, Анатоли с; Лунак, Виктория; McEvilly, Robert J; Курокава, Рики; Кумар, Вивек; Лю, Форрест; Сето, Эдвард; Хедрик, Стивен М. (сентябрь 2000 г.). «Комбинаторная роль ядерного рецептора в транскрипции и развитии» . Клетка . 102 (6): 753–763. doi : 10.1016/s0092-8674 (00) 00064-7 . PMID 11030619 . S2CID 15645977 .
- ^ Привальский, Мартин Л. (март 2004 г.). «Роль корепрессоров в регуляции транскрипции рецепторами ядерных гормонов» . Ежегодный обзор физиологии . 66 (1): 315–360. doi : 10.1146/annurev.physiol.66.032802.155556 . ISSN 0066-4278 . PMID 14977406 .
- ^ Jump up to: а беременный в дюймовый Tiacci, E.; Гроссманн, В.; Мартелли, депутат; Kohlmann, A.; Haferlach, T.; Falini, B. (2011-12-30). «Corepressors BCOR и BCORL1: два новых игрока в остром миелоидном лейкозе» . Haematologica . 97 (1): 3–5. doi : 10.3324/haematol.2011.057901 . ISSN 0390-6078 . PMC 3248923 . PMID 22210327 .
- ^ Jump up to: а беременный в Гроссманн, Вера; Tiacci, Enrico; Холмс, Энтони Б.; Колманн, Александр; Мартелли, Мария Паола; Керн, Вольфганг; Sphol-Rosseto, Ariele; Кляйн, Ханс-Ульрих; Дугас, Мартин; Шиндела, Соня; Трифонов, Владимир (2011-12-01). «Секвенирование всего экзома идентифицирует соматические мутации BCOR при острого миелоидного лейкоза с нормальным кариотипом» . Кровь . 118 (23): 6153–6163. doi : 10.1182/blood-2011-07-365320 . ISSN 0006-4971 . PMID 22012066 .
- ^ Jump up to: а беременный Ли, Мэн; Коллинз, Роксан; Цзяо, Ючен; Уиллетт, Питер; Биксби, Дейл; Эрба, Гарри; Фогельштейн, Берт; Кинцлер, Кеннет У.; Пападопулос, Николас; Малек, Сами Н. (2011-11-24). «Соматические мутации в гене транскрипционного корепрессора BCORL1 при острой мигогенной лейкозе взрослых» . Кровь . 118 (22): 5914–5917. doi : 10.1182/blood-2011-05-356204 . ISSN 0006-4971 . PMC 3228503 . PMID 21989985 .
- ^ Язычник, Джулия К.; Арнольд, Джереми; Ханчард, Ким Дж.; Кумар, Раман; Бруно, Тизиана; Джонс, Мэтью Дж.К.; Ричард, Дерек Дж.; Форрест, Алистер; Spurdle, Аманда; Вердин, Эрик; Crossley, Merlin (2007-03-22). «Новый корепрессор, BCOR-L1, подавляет транскрипцию через взаимодействие с CTBP» . Журнал биологической химии . 282 (20): 15248–15257. doi : 10.1074/jbc.m700246200 . ISSN 0021-9258 . PMID 17379597 .
- ^ Vaiopoulos, Aristeidis G.; Костакис, Иоаннис Д.; Athanasoula, Kalliopi Ch.; Papavassiliou, Athanasios G. (июнь 2012 г.). «Нацеливание фактора транскрипции корепрессоров в опухолевых клетках» . Клеточные и молекулярные науки о жизни . 69 (11): 1745–1753. doi : 10.1007/s00018-012-0986-5 . ISSN 1420-682X . PMC 11114811 . PMID 22527719 . S2CID 16407925 .
- ^ Jump up to: а беременный в Cerchietti, Leandro C.; Гету, Александру Ф.; Чжу, Сяо; Да Силва, Густаво Ф.; Чжун, Шидзюн; Мэтьюз, Мэрилин; Бантинг, Карен Л.; Поло, Хосе М.; Фарес, Кристоф; Эрроусмит, Шерил Х.; Ян, Шао Нин (апрель 2010 г.). «Ингибитор небольшой молекулы BCL6 убивает клетки DLBCL in vitro и in vivo» . Раковая клетка . 17 (4): 400–411. doi : 10.1016/j.ccr.2009.12.050 . PMC 2858395 . PMID 20385364 .
- ^ Jump up to: а беременный в Cerchietti, Leandro C.; Ян, Шао Нин; Шакнович, Рита; Хатци, Катерина; Поло, Хосе М.; Чедберн, Эми; Дауди, Стивен Ф.; Мелник, Ари (2009-04-09). «Пептомиметический ингибитор BCL6 с мощным эффектом антилимфомы in vitro и in vivo» . Кровь . 113 (15): 3397–3405. doi : 10.1182/blood-2008-07-168773 . ISSN 0006-4971 . PMC 2668844 . PMID 18927431 .
- ^ Jump up to: а беременный Парех, Самир; Приватор, Гилберт; Мельник, Ари (январь 2008 г.). «Терапевтическое нацеливание на онкоген BCL6 для диффузных больших B-клеточных лимфом» . Лейкемия и лимфома . 49 (5): 874–882. doi : 10.1080/10428190801895345 . ISSN 1042-8194 . PMC 2748726 . PMID 18452090 .
- ^ Jump up to: а беременный в Yasui, Takeshi; Yamamoto, Takeshi; Sakai, Nozomu; Asano, Kouhei; Takai, Takafumi; Yoshitomi, Yayoi; Davis, Melinda; Takagi, Terufu mi; Sakamoto, Kotaro; Sogabe, Satoshi; Kamada, Yusuke (September 2017). " Открытие нового ингибитора взаимодействия B-клеток 6 (BCL6)-коррепрессора с использованием структурной конструкции лекарственного средства » . Биоорганический и лекарственный химик Ry . 25 (17): 4876–4886. DOI : 10.1016/j.bmc.2017.07. 037 .
- ^ Сена, Паола; Мариани, Франческо; Бенинкаса, Марта; Де Леон, Маурицио Понз; Грегорио, Кармела; Манчини, Стефано; Кавани, Франческо; Smargiassi, Alberto; Палумбо, Карла; Ронкуччи, Лука (Janogy 2014). «Морфологический и количественный анализ экспрессии BCL6 в цветовом канцерогенезе человека» . Онкологические отчеты . 31 (1): 103–110. Doi : 10.3892/или.2013.2846 . HDL : 11380/101113 . ISSN 1021-335X . PMID 24220798 .
- ^ Солнце, Найхуи; Чжан, Лян; Чжан, Чонгуанг; Юань, Юань (декабрь 2020 г.). «MIR-144-3p ингибирует пролиферацию клеток клеток колоректального рака путем нацеливания на BCL6 посредством ингибирования передачи сигналов Wnt/β-катенина» . Клеточная и молекулярная биологическая буква . 25 (1): 19. DOI : 10.1186/S11658-020-00210-3 . ISSN 1425-8153 . PMC 7079415 . PMID 32206063 .
- ^ Деб, дхруба; Раджарам, Сатвик; Ларсен, Джилл Э.; Dospoy, Patrick D.; Марулло, Росселла; Ли, Лонг Шан; Авила, Кимберли; Сюэ, Фенгтиан; Cerchietti, Leandro; Минна, Джон Д.; Altschuler, Steven J. (2017-06-01). «Комбинированная терапия, нацеленная на BCL6 и Phospho-STAT3, побеждает внутриопухолевую неоднородность в подмножеством рака легких, не имеющих клетки» . РАНКА . 77 (11): 3070–3081. doi : 10.1158/0008-5472.can-15-3052 . ISSN 0008-5472 . PMC 5489259 . PMID 28377453 .
- ^ Солнце, Ченгао; Ли, Шудзюн; Ян, Куили; XI, ouryong; Ван, Лян; Чжан, Фэн; Ли, Деяя (февраль 2016 г.). «МикроРНК-187-3P смягчает немелкоклеточное рак легкого (NSCLC) посредством подавления BCL6» . Биохимическая и биофизическая исследовательская коммуникация . 471 (1): 82–88. doi : 10.1016/j.bbrc.2016.01.175 . PMID 26845350 .
- ^ Venteclef, N.; Jakobsson, T.; Эрлунд, а.; Damdimopoulos, A.; Mikkonen, L.; Эллис, Е.; Нильссон, Л.-М.; Parini, P.; Янн, О. Густафссон, J.-A.; Steffensen, KR (2010-02-15). «GPS2-зависимые пути корепрессора/SUMO регулируют противовоспалительные действия LRH-1 и LXR в острой фазе печени» . Гены и развитие . 24 (4): 381–395. doi : 10.1101/gad.545110 . ISSN 0890-9369 . PMC 2816737 . PMID 20159957 .
- ^ Юн, Чонг-Хён; Квон, Юн-джин; Ли, Санг-Вон; Парк, Yong-Beom; Ли, Су-Кон; Парк, Мин-чан (январь 2013 г.). «Активация рецепторов печени X подавляет воспалительные экспрессии генов и клиренс -корепрессор транскрипции в фибробластах ревматоидного артрита, таких как синовиоциты» . Журнал клинической иммунологии . 33 (1): 190–199. doi : 10.1007/s10875-012-9799-4 . ISSN 0271-9142 . PMID 22990668 . S2CID 15965750 .
- ^ Jump up to: а беременный Ли, Юн-Юнг; Квон, Чон-эн; Парк, Мин-Юнг; Юнг, Кёнг-ах; Ким, да-зум; Ким, Юн-Кюнг; Ли, Сын Хун; Чой, Чон Янг; Парк, Сун-Хван; Чо, Ми-Ла (август 2017 г.). «Урсодеоксихолевая кислота ослабляет экспериментальный аутоиммунный артрит, нацеливаясь на Th17 и вызывая улыбку PAMPK и транскрипционного корепрессора» . Иммунологические письма . 188 : 1–8. doi : 10.1016/j.imlet.2017.05.011 . PMID 28539269 .
- ^ Саркар, Суджата; Фокс, Дэвид А. (май 2010 г.). «Нацеливание на клетки IL-17 и Th17 при ревматоидном артрите» . Клиники ревматической болезни Северной Америки . 36 (2): 345–366. doi : 10.1016/j.rdc.2010.02.006 . PMID 20510238 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]- Ко-репрерыссор+белки в Национальной медицинской библиотеке Медицинской библиотеки США (Mesh)