Цикломальтодекстрин глюканотрансфераза
![]() | Эта статья включает в себя список общих ссылок , но в ней не хватает достаточно соответствующих встроенных цитат . ( Март 2020 ) |
Цикломальтодекстрин глюканотрансфераза | |||
---|---|---|---|
![]() CGTase Диаграмма ленты | |||
Идентификаторы | |||
ЕС №. | 2.4.1.19 | ||
CAS №. | 9030-09-5 | ||
Базы данных | |||
Intenz | Intenz View | ||
Бренда | Бренда вход | ||
Расширение | Вид Nicezyme | ||
Кегг | Кегг вход | ||
Метатический | Метаболический путь | ||
Напрямую | профиль | ||
PDB Структуры | RCSB PDB PDBE PDBSUM | ||
Джин Онтология | Друг / Quickgo | ||
|
При ферменте циклометринодекстрин глюканотрансфераза ( гликозилтрансфераза или cgtas также циклодекстриновая 1,4-альфа-D-глюкозидная связь. Это бактериальные ферменты, принадлежащие к одному и тому же семейству α-амилазы , специфически известной как семейство гликозилгидролазы 13. Этот специфический фермент способен катализировать более чем одну реакцию с наиболее важной из которых из них синтез не измельченных циклических декстринов, известных как циклодекс. Начиная с крахмала , амилозы и других полисахаридов .
CGTase является ферментом, общим для многих видов бактерий, в частности Bacillus рода (например , Circulans , B. macerans и B. Stearothermophilus ) и Brevibacillus brevis.
Этот фермент относится к семейству гликозилтрансфераз , в частности, гексозилтрансферазы. Систематическое название этого класса ферментов составляет 1,4-альфа-D-глюкан 4-альфа-D- (1,4-альфа-D-глюкано) -рансфераза (циклизация) . Другие названия в общем использовании включают амилазу Bacillus Macerans циклодекстрин глюканотрансфераза , альфа , -циклодекстрин глюканотрансфераза, альфа-циклодекстрин-гликозилтрансфераза бета -циклодекстрин глюканотрансфераза , бета-циклодексал-циклодексал , -циклодексал-циклодексфераза Фераза , циклодекстрин -гликозилтрансфераза , цикломальтодекстрин глюкотрансфераза , цикломальтодекстрин гликозилтрансфераза , кончизайму , альфа -1,4-глюкан 4-гликозилтрансфераза, циклизация , BMA , CGTase и нейтральный циклодекстрин гликозилтрансфераза .
Каталитическая активность
[ редактировать ]Все CGTases могут катализировать до четырех реакций: циклизация, связь, диспропорция и гидролиз. Все эти действия имеют один и тот же каталитический механизм, который является общим для всех гликозилгидролаз.
Циклизация - это процесс, посредством которого линейная полисахаридная цепь расщепляется, а два конца расщепленного фрагмента соединяются для получения круглого декстрина (циклодекстрин или CD): на основе количества остатков сахара этот круглый продукт изготовлен из трех основных Тип циклодекстринов можно различить, α-CD с шестью остатками, β-CD с семью остатками и γ-CD с восемью остатками.
Реакцию связи можно легко описать как обратный процесс циклизации: фермент расщепляет циклодекстрин, чтобы получить линейный декстрин, который впоследствии соединяется с линейным олигосахаридом.
Спропорция очень похожа на связь, но расщепленный декстрин не является циклодекстрином, а линейным олигосахаридом, который затем соединяется ко второму олигосахариду.
CGTase также обладает слабой гидролизующей активностью, которая состоит в том, чтобы расщеплять более длинные полисахаридные цепи на более короткие фрагменты.
Структурные исследования
[ редактировать ]В конце 2007 года для этого класса ферментов было решено 47 кодами , с PDB соглашения 1A47 , 1CDG , 1CGT , 1CGU , 1CGV , 1CGW , 1CGX , 1CGY , 1CIU , 1CXE , 1CXF , 1CXH , 1CXI , 1CXK , 1CX структур 1cyg , 1d3c , 1d7f , 1ded , 1dtu , 1eo5 , 1eo7 , 1i75 , 1kck , 1pez , 1tcm 1pj9 , 1kcl , 1ot1 , 1ot2 , , 1pam 1ukt, 1v3j, 1v3k, 1v3l, 1v3m, 2cx, 2, 2, 2, 2, 1v3k, 1v3l, 1v3m, 2cx, 1v3j, 1v3k, 1v3l, 1v3m, 2cx, 1v3j , 1v3k , 1v3l 1ukq, 1Uks , 2cx , 1v3m, 2cx, 1v3j, 1v3k, 1v3l, 1v3m, 2cx , 1V3m , 1v3j 2Cx , , 1v3k , 1v3l , 1V3m , , 1v3j, 1v3k , 1v3j , , 1v3l, 1uks , 1V3j , 1v3j, 1v3 1v3k, 1v3l , 3CGT , 4CGT , 5CGT , 6CGT , 7CGT , 8CGT и 9CGT .
Ссылки
[ редактировать ]- Depinto JA, Campbell LL (1968). «Очистка и свойства амилазы бациллусных макеран». Биохимия . 7 (1): 114–20. doi : 10.1021/bi00841a015 . PMID 5758537 .
- Френч Д., Левин М.Л., Норберг Е., Нордин П., Пазур Дж.Х., Дикий Г.М. (1954). «Исследования по декстринам Schardinger. VII. Специфичность со-подставки в реакциях связывания амилазы Macerans». J. Am. Химический Соц 76 (9): 2387–2390. doi : 10.1021/ja01638a027 .
- Hehre EJ (1951). «Ферментативный синтез полисахаридов: биологический тип полимеризации». Достижения в области фермеров и связанных с ними областей молекулярной биологии . Достижения в области фермеров - и связанных с ними областей молекулярной биологии. Тол. 11. С. 297–337. doi : 10.1002/9780470122563.CH6 . ISBN 9780470122563 Полем PMID 24540594 .
{{cite book}}
:|journal=
игнорируется ( помощь ) - Schwimmer S (1953). «Свидетельство о чистоте шардингера декстриногеназы». Архи Биохимия. Биофиз . 43 (1): 108–17. doi : 10.1016/0003-9861 (53) 90089-7 . PMID 13031665 .
- Biwer A, Antranikian G, Heinzle E (сентябрь 2002 г.). «Ферментативная продукция циклодекстринов». Прикладная микробиология и биотехнология . 59 (6): 609–17. doi : 10.1007/s00253-002-1057-x . PMID 12226716 .
- Van der Veen Ba, Uitdehaag JC, Penninga D, Van Alebeek GJ, Smith LM, Dijkstra BW, Dijkhuizen L (март 2000 г.). «Рациональная конструкция циклодекстриновой гликозилтрансферазы из штамма Bacillus Circulans 251 для увеличения продукции альфа-циклодекстрина». Журнал молекулярной биологии . 296 (4): 1027–38. doi : 10.1006/jmbi.2000.3528 . PMID 10686101 .