Jump to content

Спирохета

(Перенаправлено из спирочэтии )

Спирочэты
Treponema pallidum , спирочоте, который вызывает сифилис
Научная классификация Измените эту классификацию
Домен: Бактерии
Филум: Спирочэтота
Гаррити и Холт 2021 [ 3 ]
Сорт: Спирочэтия
Более чистый 2020 [ 1 ] : 471–563  [ 2 ]
Приказ
Синонимы
  • Sperochaetota:
    • «Протозобактериалы» Prevot 1958
    • "Sperochaetae" Cavalier-Smith 2002
    • "Sperochaetaeota" Oren et al. 2015
    • "Sperochaetes" Garrity and Holt 2001
    • "Sperochaetota" Whitman et al. 2018
  • Sperochaetia:
    • Sperochaetes Cavalier-Smith 2002
    • "Sperochaetia" Cavalier-Smith 2020
    • "Leptospiria" Cavalier-Smith 2020
Поперечное сечение ячейки спирочейта
Эндофлагелла компоненты. Легенда: Рис. 1: поперечное сечение типичной клетки спирохета, показывающая эндофлагеллу, расположенную в периплазме между внутренней цитоплазматической мембраной и внешней мембраной. Периплазма, состоящая из гелеподобной матрицы, обеспечивает полустабильную среду для обеспечения эндофлагеллы во время вращения. Осевая нить, указанная красным, состоит из пучков эндофлагеллы.
Рис. 2: Боковой вид спирохтевой ячейки, которая показывает две осевые нити в противоположных движениях. Одна осевая нить вращается по по часовой стрелке; Прилегающая осевая нить вращается в противозачатой ​​часовой стрелке. Вращение эндофлагеллы создает кручение и ведет вращение штопора клетки.
Рис. 3: Расширенный вид клеточных мембран, которые окружают эндофлагеллум. Как внутренняя, так и внешняя мембрана содержат фосфолипидный би-слой, с непольстными цепями жирных кислот в направлении головок полярного фосфора. Пептидогликан, клеточная стенка, обеспечивает структуру в бактериальных микроорганизмах. Осевые филаменты превосходят пептидогликан.

Спирочет ( / ˈ s p r ˌ k t / ) [ 4 ] или спирохет является членом Phylum Sperochaetota (также называется Sperochaetes [ 5 ] / k S p r ˈ t z / ) который содержит отличительные Diderm двойной мембран) грамотрицатель ( , бактерии Полем [ 6 ] Спирочэты носят химитетеротрофный характер, с длиной от 3 до 500 мкм и диаметром около 0,09 до не менее 3 мкм. [ 7 ]

Спирочэты отличаются от других бактериальных типов по расположению их жгутиков , называемой эндофлагеллой , или периплазматической жгутики , которые иногда называют осевыми нитями . [ 8 ] [ 9 ] Endoflagella прикрепляются на каждом конце (полюс) бактерии в периплазматическом пространстве (между внутренними и внешними мембранами), где они проецируют назад, чтобы расширить длину клетки. [ 10 ] Они вызывают скручивающее движение, которое позволяет спирохоте двигаться. При воспроизведении спирочет будет подвергаться бесполым поперечному бинарному делению . Большинство спирочэтов свободные и анаэробные , но есть многочисленные исключения. Бактерии спирочет разнообразны по своей патогенной способности и экологическим нишам, в которых они обитают, а также молекулярные характеристики, включая содержание гуанинового цитозина и размер генома. [ 11 ] [ 12 ]

Патогенность

[ редактировать ]

Многие организмы в филоме спирочатоты вызывают распространенные заболевания. Патогенные члены этого типа включают следующее:

Сальварсан , первый частично органический синтетический антимикробный препарат в истории болезни, был эффективен против спирочэтов и в основном использовался для лечения сифилиса . Кроме того, известно, что оральные спирочэты играют значительную роль в патогенезе человека заболевания пародонта . [ 17 ]

Таксономия и молекулярные подписи

[ редактировать ]

В настоящее время класс состоит из 14 обоснованных родов в 4 заказах и 5 семей. [ 18 ] [ 19 ] [ 20 ] Приказы брахизпирал , Brevinematales и Leptospirales содержат одно семейство, Brachyspiraceae , Brevinemataceae и Leptospiraceae , соответственно. Заказ Sperochaetales питает две семьи, Sperochaetaceae и Borreliaceae . Молекулярные маркеры в форме консервативных сигнатурных инделей (CSI) и CSP были обнаружены специфичными для каждого из порядков, за исключением Brevinimetales , которые обеспечивают надежные средства для разграничения этих клад друг от друга в разнообразном филоме. [ 19 ] Дополнительные CSI были обнаружены исключительно разделены каждой семьей в спирочалатах . Эти молекулярные маркеры согласуются с наблюдаемым ветвлением филогенетического дерева двух монофилетических клад в порядке спирочэталей . [ 19 ] Также было обнаружено, что дальнейшие дифференцированные таксономические группы в семействе Borreliaceae , которые дополнительно определяют эволюционные отношения, которые соответствуют физическим характеристикам, таким как патогенность (а именно Borrelia Emend. Borreliella Gen. Nov.). [ 21 ] Тем не менее, это исследование подвергалось критике, и другие исследования с использованием различных подходов не подтверждают предлагаемый раскол. [ 22 ] Новая система именования для Лайма и рецидивирующей лихорадки Borrelia не была принята научной литературой. [ 22 ]

CSI также был найден исключительно разделяемым всеми видами Sporochaetota. [ 19 ] Этот CSI представляет собой 3 -аминокислотную вставку в белке базального стержня базального тела , который является важной частью уникальной эндофлагеллярной структуры, разделяемой видами спирочатоты. [ 23 ] Учитывая, что CSI используется исключительно членами в этом филаме, было постулировано, что он может быть связан с характерными флагиных, наблюдаемыми среди видов Sporochaetota. [ 19 ] [ 23 ]

Исторически все семьи, принадлежащие к филому спирочатоты, были назначены в один заказ, Sperochaetales . [ 11 ] [ 12 ] Тем не менее, нынешний таксономический взгляд более знакомы с точными эволюционными отношениями. Распределение CSI свидетельствует о общем происхождении в кладе, для которой оно является специфическим. Таким образом, он функционирует как синапоморфная характеристика, так что распределения различных CSI обеспечивают средства для выявления различных порядков и семей в рамках типа и, таким образом, оправдать филогенетические подразделения. [ 19 ]

Филогения

[ редактировать ]
16S RRNA на основе LTP _08_2023 [ 24 ] [ 25 ] [ 26 ] 120 маркеры с одним копии на основе GTDB 08-RS214 [ 27 ] [ 28 ] [ 29 ]
Спирочэтия
Спирочэталес
"Exluspiraceae"

Exilispira

Thermospiraceae

Термоспира

"Leptospirae"
"Лепппирия"
"Euspirochaetae"
"Ecilumpiria"
"Экилампирал"
"Exluspiraceae"

Exilispira

Спирочэтия
"Entomospirales"
"Entomospiraceae"

" Entomospira "

DSM -17781
DSM -17781

Sperochaeta cellobiosiphila

Sperochaetales_e
DSM -19205

Тиоспирочаэта

Sperochaetaceae_b

Sperochaeta Видовая группа 2

Oceanispirochaeta

"Sphaerochaetales"
"Marispirochaetales"
"Marispirochaetaceae"

Marispirochaeta

"Sediminispirochaetales"
"Sediminispirochaetaceae"

Sediminispiquerya

Sperochaetales_a
Sperochaetaceae_a

Sperochaeta Thermophila

"Salinispirales"
"Salinispiraceae"

Спирочэта желтый

Salinispira

DSM -8902

Африканский дух

"Alkalispirochaetaceae"

Alkalispirochaeta

Таксономия

[ редактировать ]

Принятая в настоящее время таксономия основана на списке прокариотических имен в номенклатуре (LPSN) [ 30 ] и Национальный центр информации о биотехнологии (NCBI). [ 31 ]

Смотрите также

[ редактировать ]
  1. ^ Paster BJ (2010). «Класс I. Спирочэтия класс. Ноябрь». В Krieg NR, Staley JT, Brown DR, Hedlund BP, Paster BJ (ред.). Руководство по систематической бактериологии Берджи . Тол. 4 - Bacteroidetes, Sperochaetes, Tenericutes (Mollicutes), Acidobacteria, Fibrobacteres, Fusobacteria, Dictyoglomi, Gemmatimonadetes, Lentisphaerae, Verrrucomicrobia, Chmamydiae и Planctomycetes (2ndd.). Нью -Йорк, Нью -Йорк: Спрингер. doi : 10.1007/978-0-387-68572-4 . ISBN  978-0-387-95042-6 .
  2. ^ Орен А, Гаррити Г.М. (2020). «Список проверки № 195. Список новых имен и новых комбинаций ранее эффективно, но не обоснованно, опубликовано» . Int J Syst Evol Microbiol . 70 (9): 4844–4847. doi : 10.1099/ijsem.0.004366 . PMID   32993851 . S2CID   222147003 .
  3. ^ Орен А, Гаррити Г.М. (2021). «Действительная публикация названий сорока двух фил прокариот» . Int J Syst Evol Microbiol . 71 (10): 5056. doi : 10.1099/ijsem.0.005056 . PMID   34694987 . S2CID   239887308 .
  4. ^ "Sperochaete | Значение и определение для Великобритании английского | Lexico.com" . Словарей лексико | Английский . Архивировано из оригинала 27 января 2021 года.
  5. ^ Иллюстрированный медицинский словарь Дорланда . Elsevier .
  6. ^ Райан К.Дж., Рэй К.Г., ред. (2004). Шеррис Медицинская микробиология (4 -е изд.). МакГроу Хилл. ISBN  978-0-8385-8529-0 .
  7. ^ Margulis L , Ashen JB, Solé M, Guerrero R (август 1993). «Композитный, большие спирохеты из микробных матов: обзор структуры спирохета» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 90 (15): 6966–6970. Bibcode : 1993pnas ... 90.6966m . doi : 10.1073/pnas.90.15.6966 . PMC   47056 . PMID   8346204 .
  8. ^ Накамура S (апрель 2020 г.). «Спирохтевая жгутика и подвижность» . Биомолекулы . 10 (4): 550. doi : 10.3390/biom10040550 . PMC   7225975 . PMID   32260454 .
  9. ^ Кэрролл К.К., Хобден Дж. А., Миллер С. (2019). «Спирохеты и другие спиральные микроорганизмы» . Jawetz, Melnick, & Adelberg's Medical Microbiology . McGraw-Hill Education . Получено 9 мая 2021 года .
  10. ^ Madigan MT (2019). Брок биология микроорганизмов (пятнадцатая, глобальная изд.). Нью -Йорк, Нью -Йорк: Пирсон. п. 519. ISBN  9781292235103 .
  11. ^ Jump up to: а беременный Paster BJ (2011). «Phylum XV. Sperochaetes Garrity и Holt». В Brenner DJ, Krieg NR, Garrity GM, Staley JT (ред.). Руководство по систематической бактериологии Берджи . Нью -Йорк: Спрингер. п. 471.
  12. ^ Jump up to: а беременный Paster BJ (2011). «Семья I. sprochaetes uvlengrebel 1907, 581al.». В Brenner DJ, Krieg NR, Garrity GM, Staley JT (ред.). Руководство по систематической бактериологии Берджи . Нью -Йорк: Спрингер. С. 473–531.
  13. ^ McBride A, Athanazio D, Reis M, Ko A (2005). "Лептоспироз". Текущее мнение инфекционных заболеваний . 18 (5): 376–86. doi : 10.1097/01.qco.0000178824.05715.2c . PMID   16148523 . S2CID   220576544 .
  14. ^ Wolcott KA, Margos G, Fingle V, Becker NS (сентябрь 2021 г.). «Ассоциация хозяина Боррелия Бургдорфери Сенду Лато: обзор». Клеща и заболевания клещей . 12 (5): 101766. DOI : 10.1016/j.ttbdis.2021.101766 . PMID   34161868 .
  15. ^ Schwan TG (июнь 1996 г.). «Клеки и Borrelia: модельные системы для исследования взаимодействия патогено-артропод». Инфекционные агенты и болезнь . 5 (3): 167–181. PMID   8805079 .
  16. ^ Poller I, Boroquio Aguilar E, Beloqui Perez R. Полем Гепатол Гастролерум (в испанском). 27 (1): 21–3 doi : 10.1016/s0210-5705 (03) 70440-3 PMID   14718105 .
  17. ^ Yousefi L, Leylabadlo He, Pourlak T, Eslami H, Taghizadeh S, Ganbarov K, et al. (Июль 2020 г.). «Оральные спирохеты: патогенные механизмы при пародонтальном заболевании». Микробный патогенез . 144 : 104193. DOI : 10.1016/j.micpath.2020.104193 . PMID   32304795 . S2CID   215818931 .
  18. ^ Schoch CL, Ciufo S, Domrachev M, Hotton CL, Kannan S, Khovanskaya R, et al. «Терспирочаэтия» . Национальный центр биотехнологической информации (NCBI) База данных таксономии . Получено 25 октября 2016 года .
  19. ^ Jump up to: а беременный в дюймовый и фон Гупта Р.С., Махмуд С., Адеолу М. (2013). «Филогеномный и молекулярный подход, основанный на характеристике филома -спирочэта и его основных клад: предложение о таксономической пересмотре филома» . Передний микробиол . 4 (217): 217. doi : 10.3389/fmicb.2013.00217 . PMC   3726837 . PMID   23908650 .
  20. ^ Орен А., Гаррити Г.М. (2014). «Список новых имен и новых комбинаций ранее эффективно, но не обоснованно, опубликовано» (PDF) . Инт. J. Syst. Эвол. Микробиол . 64 (3): 693–696. doi : 10.1099/ijs.0.062521-0 .
  21. ^ Adeolu M, Gupta RS (2014). "Филогеномное и молекулярное маркерное предложение о разделении рода Borrelia на два рода: помиренный род Borrelia, содержащий только членов рецидивирующей ливерной Borrelia, и род Borreliella Gen. Nov. Содержит члены Болелией Болерелии (Borrelia (Borrelia (Borrelia Borrelia (Borrelia (Borrelia Lyme Borrelia и род Borreliella. Borrelia Burgdorferi Sensu Lato Complex) ". Антони Ван Леувенхук . 105 (6): 1049–1072. doi : 10.1007/s10482-014-0164-x . PMID   24744012 .
  22. ^ Jump up to: а беременный Winslow C, Coburn J (2019). «Недавние открытия и достижения в исследованиях по болезни Лайма Спирохет Borrelia Burgdorferi» . F1000Research . 8 : 763. DOI : 10.12688/f1000research.18379.1 . PMC   6545822 . PMID   31214329 .
  23. ^ Jump up to: а беременный MacNab RM (2003). «Как бактерии собирают жгутики». Annu Rev Microbiol . 57 : 77–100. doi : 10.1146/annurev.micro.57.030502.090832 . PMID   12730325 .
  24. ^ "LTP" . Получено 20 ноября 2023 года .
  25. ^ «Дерево LTP_ALL в формате Newick» . Получено 20 ноября 2023 года .
  26. ^ «LTP_08_2023 Notes» (PDF) . Получено 20 ноября 2023 года .
  27. ^ "GTDB Release 08-RS214" . База данных таксономии генома . Получено 10 мая 2023 года .
  28. ^ "BAC120_R214.sp_label" . База данных таксономии генома . Получено 10 мая 2023 года .
  29. ^ «История таксонов» . База данных таксономии генома . Получено 10 мая 2023 года .
  30. ^ Euzéby JP. «Спирочэты» . Список прокариотических имен с стоянием в номенклатуре (LPSN) . Получено 20 июля 2018 года .
  31. ^ Schoch CL, Ciufo S, Domrachev M, Hotton CL, Kannan S, Khovanskaya R, et al. «Спирочэты» . Национальный центр биотехнологической информации (NCBI) База данных таксономии . Получено 20 июля 2018 года .
[ редактировать ]
  • Спирохеты (UCMP) Введение в Музей палеонтологии Калифорнийского университета
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: feb8c21ab0e8b9647f2cac36b72973ed__1720685220
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/fe/ed/feb8c21ab0e8b9647f2cac36b72973ed.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
Spirochaete - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)