Спирохета
Спирочэты | |
---|---|
![]() | |
Treponema pallidum , спирочоте, который вызывает сифилис | |
Научная классификация ![]() | |
Домен: | Бактерии |
Филум: | Спирочэтота Гаррити и Холт 2021 [ 3 ] |
Сорт: | Спирочэтия Более чистый 2020 [ 1 ] : 471–563 [ 2 ] |
Приказ | |
| |
Синонимы | |
|


Рис. 2: Боковой вид спирохтевой ячейки, которая показывает две осевые нити в противоположных движениях. Одна осевая нить вращается по по часовой стрелке; Прилегающая осевая нить вращается в противозачатой часовой стрелке. Вращение эндофлагеллы создает кручение и ведет вращение штопора клетки.
Рис. 3: Расширенный вид клеточных мембран, которые окружают эндофлагеллум. Как внутренняя, так и внешняя мембрана содержат фосфолипидный би-слой, с непольстными цепями жирных кислот в направлении головок полярного фосфора. Пептидогликан, клеточная стенка, обеспечивает структуру в бактериальных микроорганизмах. Осевые филаменты превосходят пептидогликан.
Спирочет ( / ˈ s p aɪ r oʊ ˌ k iː t / ) [ 4 ] или спирохет является членом Phylum Sperochaetota (также называется Sperochaetes [ 5 ] / k S p aɪ r oʊ ˈ iː t iː z / ) который содержит отличительные Diderm двойной мембран) грамотрицатель ( , бактерии Полем [ 6 ] Спирочэты носят химитетеротрофный характер, с длиной от 3 до 500 мкм и диаметром около 0,09 до не менее 3 мкм. [ 7 ]
Спирочэты отличаются от других бактериальных типов по расположению их жгутиков , называемой эндофлагеллой , или периплазматической жгутики , которые иногда называют осевыми нитями . [ 8 ] [ 9 ] Endoflagella прикрепляются на каждом конце (полюс) бактерии в периплазматическом пространстве (между внутренними и внешними мембранами), где они проецируют назад, чтобы расширить длину клетки. [ 10 ] Они вызывают скручивающее движение, которое позволяет спирохоте двигаться. При воспроизведении спирочет будет подвергаться бесполым поперечному бинарному делению . Большинство спирочэтов свободные и анаэробные , но есть многочисленные исключения. Бактерии спирочет разнообразны по своей патогенной способности и экологическим нишам, в которых они обитают, а также молекулярные характеристики, включая содержание гуанинового цитозина и размер генома. [ 11 ] [ 12 ]
Патогенность
[ редактировать ]Многие организмы в филоме спирочатоты вызывают распространенные заболевания. Патогенные члены этого типа включают следующее:
- Виды Leptospira , который вызывает лептоспироз [ 13 ]
- Borrelia Burgdorferi , B. Mayonii , B. Bissetiae , B. Garini , B. Afzeli , B. Spielman , B. Lusitaneee , которые вызывают болезнь Лайма. [ 14 ]
- Borrelia recurrentis , которая вызывает рецидивирующую лихорадку [ 15 ]
- Treponema pallidum subspecies, которые вызывают трепонематозы, такие как Syphilis и Yaws .
- Brachyspira pilosicoli и Brachyspira aalborgi , которые вызывают кишечный спирочэтоз [ 16 ]
Сальварсан , первый частично органический синтетический антимикробный препарат в истории болезни, был эффективен против спирочэтов и в основном использовался для лечения сифилиса . Кроме того, известно, что оральные спирочэты играют значительную роль в патогенезе человека заболевания пародонта . [ 17 ]
Таксономия и молекулярные подписи
[ редактировать ]В настоящее время класс состоит из 14 обоснованных родов в 4 заказах и 5 семей. [ 18 ] [ 19 ] [ 20 ] Приказы брахизпирал , Brevinematales и Leptospirales содержат одно семейство, Brachyspiraceae , Brevinemataceae и Leptospiraceae , соответственно. Заказ Sperochaetales питает две семьи, Sperochaetaceae и Borreliaceae . Молекулярные маркеры в форме консервативных сигнатурных инделей (CSI) и CSP были обнаружены специфичными для каждого из порядков, за исключением Brevinimetales , которые обеспечивают надежные средства для разграничения этих клад друг от друга в разнообразном филоме. [ 19 ] Дополнительные CSI были обнаружены исключительно разделены каждой семьей в спирочалатах . Эти молекулярные маркеры согласуются с наблюдаемым ветвлением филогенетического дерева двух монофилетических клад в порядке спирочэталей . [ 19 ] Также было обнаружено, что дальнейшие дифференцированные таксономические группы в семействе Borreliaceae , которые дополнительно определяют эволюционные отношения, которые соответствуют физическим характеристикам, таким как патогенность (а именно Borrelia Emend. Borreliella Gen. Nov.). [ 21 ] Тем не менее, это исследование подвергалось критике, и другие исследования с использованием различных подходов не подтверждают предлагаемый раскол. [ 22 ] Новая система именования для Лайма и рецидивирующей лихорадки Borrelia не была принята научной литературой. [ 22 ]
CSI также был найден исключительно разделяемым всеми видами Sporochaetota. [ 19 ] Этот CSI представляет собой 3 -аминокислотную вставку в белке базального стержня базального тела , который является важной частью уникальной эндофлагеллярной структуры, разделяемой видами спирочатоты. [ 23 ] Учитывая, что CSI используется исключительно членами в этом филаме, было постулировано, что он может быть связан с характерными флагиных, наблюдаемыми среди видов Sporochaetota. [ 19 ] [ 23 ]
Исторически все семьи, принадлежащие к филому спирочатоты, были назначены в один заказ, Sperochaetales . [ 11 ] [ 12 ] Тем не менее, нынешний таксономический взгляд более знакомы с точными эволюционными отношениями. Распределение CSI свидетельствует о общем происхождении в кладе, для которой оно является специфическим. Таким образом, он функционирует как синапоморфная характеристика, так что распределения различных CSI обеспечивают средства для выявления различных порядков и семей в рамках типа и, таким образом, оправдать филогенетические подразделения. [ 19 ]
Филогения
[ редактировать ]16S RRNA на основе LTP _08_2023 [ 24 ] [ 25 ] [ 26 ] | 120 маркеры с одним копии на основе GTDB 08-RS214 [ 27 ] [ 28 ] [ 29 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|
Таксономия
[ редактировать ]Принятая в настоящее время таксономия основана на списке прокариотических имен в номенклатуре (LPSN) [ 30 ] и Национальный центр информации о биотехнологии (NCBI). [ 31 ]
- Phylum Sperochaetota Garrity и Holt 2021
- Класс Sperochaetia paster 2020
- Семья ? 1993
- Заказ Leptospirales Gupta et al. 2014
- Семейство Leptospiraceae Hovind-Hougen 1979
- Род Лепторемема Ховинд-Хаген 1983
- Класс Leptospira Noguchi 1917
- Race Turneriella Levett et al. 2005
- Семейство Leptospiraceae Hovind-Hougen 1979
- Закажите Brachyspirales Corrig. Gupta et al. 2014
- Семейная брахиспирасея Paster 2012
- Род Brachyspira Hovind-Hougen et al. 1982
- ? Род 2017
- Семейная брахиспирасея Paster 2012
- Заказ Brevinematales Gupta et al. 2014
- Семейство Brevinemataceae Paster 2012
- Brevinema defosse et al . 1995
- Семейство " Longinemaceae " Karnachuk et al. 2021
- Семья ? 2021
- Семейство " Thermospiraceae " Ben Ali Gam et al. 2023
- Race Thermospira Ben Ali Gam et al. 2023
- Семейство Brevinemataceae Paster 2012
- Порядок Exilispirales"
- , Родригес - Паллен Alimination R &
- Тип Exilumpira Imachi et al. 2008
- , Родригес - Паллен Alimination R &
- Pallen 1917 ["Entomospirales" Pallen Buachan ; Pallen, Rodriguez-R & Alistion 2022 Pallen , Rodriguez-R & Alistion & Alistion 2022 ; Паллен
- Семья " "
- Род? . 1967 Ex Бермуд и Ал 1988
- Семейство Borreliaceae Gupta et al. 2014
- Род Borrelia wullengrebel 1907 (рецидивирующая лихорадка Borrelia, связанная с рептильными боррелией и эхиднами Borrelia)
- Род Borreliella Adeolu & Gupta 2015 (болезнь Лайма Borrelia)
- Род? Cristispira Gross 1910
- Семейство Sphaerochaetaceae Hördt et al. 2020
- Race Bullifex Wylensek et al. 2021 [вкл. « Ca. Aphodenecus» Gilroy et al. 2021 ]
- Род " Ca. Ornithospirochaeta " Gilroy et al. 2021
- Класс Parasphaerochaeta Bidzhieva et al. 2020
- Род " Ca. Physcosoma " Gilroy et al. 2022
- Класс Pleomorphochaeta arro al. 2016
- Класс Sphaerochaeta Ritalahti et al. 2012
- ; Паллен , Родригес Alidsans -R & 2022 ; Pallen, Rodriguez-R & Alistion 2022 Pallen , Rodriguez-R & Alifans 2022 ; сказал Пеллен 2022 Паллен ;
- Род ?
- Семья ?
- Сорт? Clevelandin Bermudes et al. 1988
- Род? Diplocalyx Gharagozlou 1968 Ex Bermudes et al. 1988 Non Richard 1850 Non Presl 1845
- Сорт? Hollandina to et al. 1978 от Bermudes et al. 1988 Imary 1956
- Семья ? 1990
- Род Alkalispirochaeta Sravanthi et al. 2016
- Род " Entomospira " Grana-Miraglia et al. 2020 НЕ ЭНДЕРЛЕЙН 1917
- Тип Marispirochaeta Shivani et al. 2017
- Genus Oceanispirochaeta subhash & Lee 2017b
- Род Salinipira Ben Hania et al. 2015
- Класс Sediminispirochaeta Shivani et al. 2016
- Род Sperochaeta ehrenberg 1835 Em. Pikuta et al. 2009 не турчаниноу 1851
- Race Thiospirochaeta Al. 2020
- Семья " "
- Порядок " Treponematales " Song et al. 2021
- Семейство Breznakiellaceae Brune et al. 2022
- Род Rosekiella Song et al. 2022
- Класс Gracilinema Brune et al. 2022
- Класс Helmutkoenigia Brune et al. 2022
- Род Leadbettera Brune et al. 2022
- Класс Zuezera Brune et al. 2022
- Семейство " Rectinemataceae " Song et al. 2021
- Rectinema . Koelschbach et al 2017
- Семейная Treponemataceae Robinson 1948
- Класс " Ca. Avitreponema " Gilroy et al. 2021
- Род " Brucepastera " Song et al. 2022
- Класс " Ca. Gallitreponema " Gilroy et al. 2021
- Класс " Teretinema " Song et al. 2022
- Класс Treponema Schaudinn 1905 Em. Abt et al. 2013
- Семейство Breznakiellaceae Brune et al. 2022
- Класс Sperochaetia paster 2020
Смотрите также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Paster BJ (2010). «Класс I. Спирочэтия класс. Ноябрь». В Krieg NR, Staley JT, Brown DR, Hedlund BP, Paster BJ (ред.). Руководство по систематической бактериологии Берджи . Тол. 4 - Bacteroidetes, Sperochaetes, Tenericutes (Mollicutes), Acidobacteria, Fibrobacteres, Fusobacteria, Dictyoglomi, Gemmatimonadetes, Lentisphaerae, Verrrucomicrobia, Chmamydiae и Planctomycetes (2ndd.). Нью -Йорк, Нью -Йорк: Спрингер. doi : 10.1007/978-0-387-68572-4 . ISBN 978-0-387-95042-6 .
- ^ Орен А, Гаррити Г.М. (2020). «Список проверки № 195. Список новых имен и новых комбинаций ранее эффективно, но не обоснованно, опубликовано» . Int J Syst Evol Microbiol . 70 (9): 4844–4847. doi : 10.1099/ijsem.0.004366 . PMID 32993851 . S2CID 222147003 .
- ^ Орен А, Гаррити Г.М. (2021). «Действительная публикация названий сорока двух фил прокариот» . Int J Syst Evol Microbiol . 71 (10): 5056. doi : 10.1099/ijsem.0.005056 . PMID 34694987 . S2CID 239887308 .
- ^ "Sperochaete | Значение и определение для Великобритании английского | Lexico.com" . Словарей лексико | Английский . Архивировано из оригинала 27 января 2021 года.
- ^ Иллюстрированный медицинский словарь Дорланда . Elsevier .
- ^ Райан К.Дж., Рэй К.Г., ред. (2004). Шеррис Медицинская микробиология (4 -е изд.). МакГроу Хилл. ISBN 978-0-8385-8529-0 .
- ^ Margulis L , Ashen JB, Solé M, Guerrero R (август 1993). «Композитный, большие спирохеты из микробных матов: обзор структуры спирохета» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 90 (15): 6966–6970. Bibcode : 1993pnas ... 90.6966m . doi : 10.1073/pnas.90.15.6966 . PMC 47056 . PMID 8346204 .
- ^ Накамура S (апрель 2020 г.). «Спирохтевая жгутика и подвижность» . Биомолекулы . 10 (4): 550. doi : 10.3390/biom10040550 . PMC 7225975 . PMID 32260454 .
- ^ Кэрролл К.К., Хобден Дж. А., Миллер С. (2019). «Спирохеты и другие спиральные микроорганизмы» . Jawetz, Melnick, & Adelberg's Medical Microbiology . McGraw-Hill Education . Получено 9 мая 2021 года .
- ^ Madigan MT (2019). Брок биология микроорганизмов (пятнадцатая, глобальная изд.). Нью -Йорк, Нью -Йорк: Пирсон. п. 519. ISBN 9781292235103 .
- ^ Jump up to: а беременный Paster BJ (2011). «Phylum XV. Sperochaetes Garrity и Holt». В Brenner DJ, Krieg NR, Garrity GM, Staley JT (ред.). Руководство по систематической бактериологии Берджи . Нью -Йорк: Спрингер. п. 471.
- ^ Jump up to: а беременный Paster BJ (2011). «Семья I. sprochaetes uvlengrebel 1907, 581al.». В Brenner DJ, Krieg NR, Garrity GM, Staley JT (ред.). Руководство по систематической бактериологии Берджи . Нью -Йорк: Спрингер. С. 473–531.
- ^ McBride A, Athanazio D, Reis M, Ko A (2005). "Лептоспироз". Текущее мнение инфекционных заболеваний . 18 (5): 376–86. doi : 10.1097/01.qco.0000178824.05715.2c . PMID 16148523 . S2CID 220576544 .
- ^ Wolcott KA, Margos G, Fingle V, Becker NS (сентябрь 2021 г.). «Ассоциация хозяина Боррелия Бургдорфери Сенду Лато: обзор». Клеща и заболевания клещей . 12 (5): 101766. DOI : 10.1016/j.ttbdis.2021.101766 . PMID 34161868 .
- ^ Schwan TG (июнь 1996 г.). «Клеки и Borrelia: модельные системы для исследования взаимодействия патогено-артропод». Инфекционные агенты и болезнь . 5 (3): 167–181. PMID 8805079 .
- ^ Poller I, Boroquio Aguilar E, Beloqui Perez R. Полем Гепатол Гастролерум (в испанском). 27 (1): 21–3 doi : 10.1016/s0210-5705 (03) 70440-3 PMID 14718105 .
- ^ Yousefi L, Leylabadlo He, Pourlak T, Eslami H, Taghizadeh S, Ganbarov K, et al. (Июль 2020 г.). «Оральные спирохеты: патогенные механизмы при пародонтальном заболевании». Микробный патогенез . 144 : 104193. DOI : 10.1016/j.micpath.2020.104193 . PMID 32304795 . S2CID 215818931 .
- ^ Schoch CL, Ciufo S, Domrachev M, Hotton CL, Kannan S, Khovanskaya R, et al. «Терспирочаэтия» . Национальный центр биотехнологической информации (NCBI) База данных таксономии . Получено 25 октября 2016 года .
- ^ Jump up to: а беременный в дюймовый и фон Гупта Р.С., Махмуд С., Адеолу М. (2013). «Филогеномный и молекулярный подход, основанный на характеристике филома -спирочэта и его основных клад: предложение о таксономической пересмотре филома» . Передний микробиол . 4 (217): 217. doi : 10.3389/fmicb.2013.00217 . PMC 3726837 . PMID 23908650 .
- ^ Орен А., Гаррити Г.М. (2014). «Список новых имен и новых комбинаций ранее эффективно, но не обоснованно, опубликовано» (PDF) . Инт. J. Syst. Эвол. Микробиол . 64 (3): 693–696. doi : 10.1099/ijs.0.062521-0 .
- ^ Adeolu M, Gupta RS (2014). "Филогеномное и молекулярное маркерное предложение о разделении рода Borrelia на два рода: помиренный род Borrelia, содержащий только членов рецидивирующей ливерной Borrelia, и род Borreliella Gen. Nov. Содержит члены Болелией Болерелии (Borrelia (Borrelia (Borrelia Borrelia (Borrelia (Borrelia Lyme Borrelia и род Borreliella. Borrelia Burgdorferi Sensu Lato Complex) ". Антони Ван Леувенхук . 105 (6): 1049–1072. doi : 10.1007/s10482-014-0164-x . PMID 24744012 .
- ^ Jump up to: а беременный Winslow C, Coburn J (2019). «Недавние открытия и достижения в исследованиях по болезни Лайма Спирохет Borrelia Burgdorferi» . F1000Research . 8 : 763. DOI : 10.12688/f1000research.18379.1 . PMC 6545822 . PMID 31214329 .
- ^ Jump up to: а беременный MacNab RM (2003). «Как бактерии собирают жгутики». Annu Rev Microbiol . 57 : 77–100. doi : 10.1146/annurev.micro.57.030502.090832 . PMID 12730325 .
- ^ "LTP" . Получено 20 ноября 2023 года .
- ^ «Дерево LTP_ALL в формате Newick» . Получено 20 ноября 2023 года .
- ^ «LTP_08_2023 Notes» (PDF) . Получено 20 ноября 2023 года .
- ^ "GTDB Release 08-RS214" . База данных таксономии генома . Получено 10 мая 2023 года .
- ^ "BAC120_R214.sp_label" . База данных таксономии генома . Получено 10 мая 2023 года .
- ^ «История таксонов» . База данных таксономии генома . Получено 10 мая 2023 года .
- ^ Euzéby JP. «Спирочэты» . Список прокариотических имен с стоянием в номенклатуре (LPSN) . Получено 20 июля 2018 года .
- ^ Schoch CL, Ciufo S, Domrachev M, Hotton CL, Kannan S, Khovanskaya R, et al. «Спирочэты» . Национальный центр биотехнологической информации (NCBI) База данных таксономии . Получено 20 июля 2018 года .
Внешние ссылки
[ редактировать ]- Спирохеты (UCMP) Введение в Музей палеонтологии Калифорнийского университета