Потексвирус
Потексвирус | |
---|---|
![]() | |
Симптомы нарушения окраски, вызванные вирусом мозаики нарцисса (NMV), у нарциссов (A, B) и нормальных цветков (C) | |
Классификация вирусов ![]() | |
(без рейтинга): | Вирус |
Область : | Рибовирия |
Королевство: | Орторнавиры |
Тип: | Китриновирикота |
Сорт: | Алсувирицетес |
Заказ: | Тимовирал |
Семья: | Альфафлексивирусиды |
Род: | Потексвирус |
Потексвирусы — род патогенных вирусов отряда Tymovirales семейства Alphaflexiviridae . Растения служат естественными хозяевами. В этом роде 48 видов, три из которых отнесены к подроду. Заболевания, связанные с этим родом, включают: симптомы мозаики и кольцевых пятен. [ 1 ] [ 2 ] Название рода происходит от POT atovirus X ).
Таксономия
[ редактировать ]Потексвирус включает один подрод, включающий три вида, и 45 дополнительных видов, не отнесенных к подроду. К роду отнесены следующие 48 видов: [ 2 ]
- Подрод: Мандаривирус
Следующие виды не отнесены к подроду:
- Вирус лука X
- Вирус альстромерии X
- Вирус мозаики альтернантеры
- Бессимптомный вирус амброзии 1
- Вирус спаржи 3
- Вирус мозаики Бабако
- Вирус бамбуковой мозаики
- Кактусовый вирус X
- Колумбийский бессимптомный вирус маниоки
- Вирус общей мозаики маниоки
- Вирус маниоки X
- Вирус желтой мозаики клевера
- Вирус Книдиум X
- Вирус мозаики цимбидиума
- Вирус, ассоциированный с желтой пятнистостью бересклета
- Вирус желтой жилки бересклета
- Вирус мозаики лисохвоста
- Вирус хосты X
- Вирус кольцевой пятнистости гортензии
- Вирус легкой мозаики лагенариоза
- Вирус салата X
- Вирус лилии X
- Вирус мозаики мальвы
- Как вирус Х
- Вирус мозаики нарцисса
- Вирус Нерин X
- Вирус опунции X
- Вирус мозаики папайи
- Вирус мозаики огурца
- Вирус Файуса X
- Pitaya virus X
- Вирус мозаики Plantago asiatica
- Вирус подорожника X
- Вирус мозаики ростков картофеля
- Картофельный вирус X
- Вирус Шлюмбергеры X
- Вирус мозаики сенны
- Вирус легкого желтого края клубники
- Вирус красной мозаики Тамуса
- Вирус тюльпана X
- Вирус черепаховой травы X
- Ванильный вирус X
- Вирус мозаики белого клевера
- Вирус Ямса X
- Вирус зигокактуса X
Вирусология
[ редактировать ]Длина вириона может значительно варьировать (от 470 до 1000 нанометров и более) и составляет 12-13 нм в диаметре. Шаг спирали основной спирали 3,3-3,7 нм (8-9 копий белка оболочки на виток). Он без оболочки, гибкий и нитевидный. Сама шерсть состоит из 1000-1500 копий белка оболочки. [ 1 ]
Геном линейный, длиной 5,9-7 тысяч оснований, с кэпированным 5'-концом и полиаденилированным 3'-концом. Геном кодирует 5 белков. Слева направо эти белки: белок репликации вируса, который состоит из домена кэп-фермента, геликазоподобного домена, РНК-зависимой РНК-полимеразы , трех белков - тройного генного блока (TGB) 1, 2 и 3 - и белок оболочки. [ 1 ]
Род | Структура | Симметрия | Капсид | Геномное расположение | Геномная сегментация |
---|---|---|---|---|---|
Потексвирус | Нитчатый | Без конверта | Линейный | Однодольный |
РНК транслируется, образуя вирусную РНК-полимеразу. Это, в свою очередь, создает матрицу с отрицательной цепью, из которой генерируется серия субгеномных РНК. Эти субгеномные РНК затем транслируются в вирусные белки.
5'-конец имеет длину около 80 нуклеотидов и обычно начинается с последовательности GAAAA. [ 3 ]
В дополнение к своей РНК-полимеразной активности вирусная РНК-полимераза (молекулярная масса ~ 150 килодальтон ) также обладает метилтрансферазной и РНК-хеликазной активностью.
Белки TGB консервативны среди родов Allexivirus , Carlavirus , Foveavirus , Furovirus , Hordeivirus , Pecluvirus , Pomovirus и Potexvirus. Их функции являются предметом активных исследований.
TGB 1 (молекулярная масса 23 кДа) – многофункциональный белок. Он обладает РНК-хеликазной активностью и, по-видимому, участвует в движении от клетки к клетке.
Белки TGB 2 (молекулярная масса 11 кДа) и TGB 3 (молекулярная масса 10 кДа) связываются с эндоплазматической сетью .
Белок оболочки имеет молекулярную массу ~ 25 кДа.
Длина 3'-нетранслируемой области составляет ~100 нуклеотидов.
Жизненный цикл
[ редактировать ]Репликация вируса цитоплазматическая. Вход в клетку-хозяина достигается путем проникновения в клетку-хозяина. Репликация соответствует модели репликации вируса с положительной многоцепочечной РНК. Транскрипция вируса с положительной цепью РНК - это метод транскрипции. Трансляция происходит методом неплотного сканирования. Вирус покидает клетку-хозяина путем трехстороннего движения вируса, не направляемого канальцами. Вирус передается через переносчика (насекомые). Пути передачи – векторные и механические. [ 1 ]
Род | Сведения о хосте | Тканевой тропизм | Детали входа | Подробности выпуска | Сайт репликации | Монтажный участок | Передача инфекции |
---|---|---|---|---|---|---|---|
Потексвирус | Растения | Никто | Вирусное движение; механическая инокуляция | Вирусное движение | Цитоплазма | Цитоплазма | Насекомые |
Хозяева
[ редактировать ]Известные хозяева — различные цветковые растения .
Распределение
[ редактировать ]Эти вирусы, по-видимому, встречаются во всем мире.
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б с д «Вирусная зона» . ЭксПАСи . Проверено 15 июня 2015 г.
- ^ Jump up to: а б «Таксономия вирусов: выпуск 2020 г.» . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV). Март 2021 года . Проверено 15 мая 2021 г.
- ^ Коте, Ф.; Паре, К.; Мажо, Н.; Болдук, Миннесота; Леблан, Э.; Бержерон, Миннесота; Бернарди, МГ; Леклерк, Д. (2008). «Нуклеотидная последовательность и филогенетический анализ нового потексвируса: вируса мозаики мальвы». Инфекция, генетика и эволюция . 8 (1): 83–93. дои : 10.1016/j.meegid.2007.10.006 . ПМИД 18054524 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]
- «Род: Potexvirus - Alphaflexiviridae - РНК-вирусы с положительным смыслом» . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV) . Проверено 13 ноября 2020 г.
- Вирусная зона: Потексвирус