Цитозоль
Клеточная биология | |
---|---|
Диаграмма клеток животных | |
Цитозоль или , также известный как цитоплазматический матрикс основная плазма , [ 2 ] — одна из жидкостей, находящихся внутри клеток ( внутриклеточная жидкость (ВКФ)). [ 3 ] Он разделен на отсеки мембранами. Например, митохондриальный матрикс разделяет митохондрию на множество отсеков.
В эукариотической клетке цитозоль окружен клеточной мембраной и является частью цитоплазмы , которая также включает митохондрии, пластиды и другие органеллы (но не их внутренние жидкости и структуры); ядро клетки отдельное. Таким образом, цитозоль представляет собой жидкую матрицу вокруг органелл. У прокариот большая часть химических реакций метаболизма протекает в цитозоле, а некоторые — в мембранах или в периплазматическом пространстве . У эукариот, хотя многие метаболические пути все еще происходят в цитозоле, другие происходят внутри органелл.
Цитозоль представляет собой сложную смесь веществ, растворенных в воде. Хотя вода составляет большую часть цитозоля, ее структура и свойства внутри клеток еще недостаточно изучены. Концентрации ионов, таких как натрий и калий, в цитозоле отличаются от таковых во внеклеточной жидкости ; Эти различия в уровнях ионов важны для таких процессов, как осморегуляция , передача сигналов клетками и генерация потенциалов действия в возбудимых клетках, таких как эндокринные, нервные и мышечные клетки. Цитозоль также содержит большое количество макромолекул , которые могут изменять поведение молекул за счет скученности макромолекул .
Хотя когда-то считалось, что цитозоль представляет собой простой раствор молекул, он имеет несколько уровней организации. К ним относятся градиенты концентрации малых молекул, таких как кальций , большие комплексы ферментов , которые действуют вместе и принимают участие в метаболических путях , а также белковые комплексы, такие как протеасомы и карбоксисомы , которые окружают и разделяют части цитозоля.
Определение
[ редактировать ]Термин «цитозоль» был впервые введен в 1965 году Х.А. Ларди и первоначально относился к жидкости, полученной путем разделения клеток на части и осаждения всех нерастворимых компонентов ультрацентрифугированием . [ 4 ] [ 5 ] Такой растворимый клеточный экстракт не идентичен растворимой части клеточной цитоплазмы и обычно называется цитоплазматической фракцией. [ 6 ]
Термин «цитозоль» теперь используется для обозначения жидкой фазы цитоплазмы интактной клетки. [ 6 ] Это исключает любую часть цитоплазмы, содержащуюся внутри органелл. [ 7 ] Из-за возможности путаницы между использованием слова «цитозоль» для обозначения как экстрактов клеток, так и растворимой части цитоплазмы интактных клеток, фраза «водная цитоплазма» использовалась для описания жидкого содержимого цитоплазмы. живых клеток. [ 5 ]
До этого другие термины, в том числе гиалоплазма , [ 8 ] использовались для обозначения клеточной жидкости, не всегда как синонимы, так как ее природа была недостаточно изучена (см. протоплазма ). [ 6 ]
Свойства и состав
[ редактировать ]Доля объема клетки, занимающая цитозоль, варьируется: например, хотя этот компартмент образует основную часть клеточной структуры у бактерий , [ 9 ] В растительных клетках основным отсеком является большая центральная вакуоль . [ 10 ] Цитозоль состоит в основном из воды, растворенных ионов, малых молекул и крупных водорастворимых молекул (например, белков). Большинство этих небелковых молекул имеют молекулярную массу менее 300 Да . [ 11 ] Эта смесь малых молекул чрезвычайно сложна, поскольку разнообразие молекул, участвующих в обмене веществ (метаболитов ) , огромно. Например, в растениях может быть создано до 200 000 различных малых молекул, хотя не все они будут присутствовать у одного и того же вида или в одной клетке. [ 12 ] По оценкам количества метаболитов в отдельных клетках, таких как кишечная палочка и пекарские дрожжи, их количество составляет менее 1000. [ 13 ] [ 14 ]
Вода
[ редактировать ]Большую часть цитозоля составляет вода , составляющая около 70% общего объема типичной клетки. [ 15 ] рН . внутриклеточной жидкости составляет 7,4 [ 16 ] цитозоля человека в то время как pH колеблется в пределах 7,0–7,4 и обычно выше, если клетка растет. [ 17 ] Вязкость диффузия цитоплазмы примерно такая же, как у чистой воды, хотя малых молекул через эту жидкость происходит примерно в четыре раза медленнее, чем в чистой воде, главным образом из-за столкновений с большим количеством макромолекул в цитозоле. [ 18 ] Исследования артемии показали , как вода влияет на функции клеток; они увидели, что уменьшение количества воды в клетке на 20% подавляет метаболизм, при этом метаболизм постепенно снижается по мере высыхания клетки, а вся метаболическая активность прекращается, когда уровень воды достигает 70% ниже нормального. [ 5 ]
Хотя вода жизненно важна для жизни, структура этой воды в цитозоле недостаточно изучена, главным образом потому, что такие методы, как спектроскопия ядерного магнитного резонанса, дают информацию только об средней структуре воды и не могут измерить локальные изменения в микроскопическом масштабе. Даже структура чистой воды плохо изучена из-за способности воды образовывать такие структуры, как водные кластеры, посредством водородных связей . [ 19 ]
Классический взгляд на воду в клетках состоит в том, что около 5% этой воды прочно связано с растворенными веществами или макромолекулами в виде сольватной воды , тогда как большая часть имеет ту же структуру, что и чистая вода. [ 5 ] Эта сольватная вода не активна при осмосе и может иметь различные растворяющие свойства, так что некоторые растворенные молекулы исключаются, а другие становятся концентрированными. [ 20 ] [ 21 ] Однако другие утверждают, что эффекты высоких концентраций макромолекул в клетках распространяются на весь цитозоль и что вода в клетках ведет себя совсем не так, как вода в разбавленных растворах. [ 22 ] Эти идеи включают в себя предположение о том, что клетки содержат зоны с низкой и высокой плотностью воды, что может оказывать широкомасштабное воздействие на структуры и функции других частей клетки. [ 19 ] [ 23 ] Однако использование передовых методов ядерного магнитного резонанса для прямого измерения подвижности воды в живых клетках противоречит этой идее, поскольку предполагает, что 85% клеточной воды действует как чистая вода, а остальная часть менее подвижна и, вероятно, связана с макромолекулами. . [ 24 ]
Ионы
[ редактировать ]Концентрации других ионов в цитозоле сильно отличаются от таковых во внеклеточной жидкости , и цитозоль также содержит гораздо большее количество заряженных макромолекул, таких как белки и нуклеиновые кислоты, чем вне клеточной структуры.
Ион | Концентрация (миллимолярная) | |
---|---|---|
В цитозоле | В плазме | |
Калий | 139–150 [ 25 ] [ 26 ] | 4 |
Натрий | 12 | 145 |
Хлористый | 4 | 116 |
Бикарбонат | 12 | 29 |
Аминокислоты в белках | 138 | 9 |
Магний | 0.8 | 1.5 |
Кальций | <0,0002 | 1.8 |
В отличие от внеклеточной жидкости, цитозоль имеет высокую концентрацию ионов калия и низкую концентрацию ионов натрия . [ 27 ] Эта разница в концентрациях ионов имеет решающее значение для осморегуляции , поскольку, если бы уровни ионов внутри клетки были такими же, как и снаружи, вода постоянно поступала бы в результате осмоса , поскольку уровни макромолекул внутри клеток выше, чем их уровни снаружи. Вместо этого ионы натрия выводятся, а ионы калия поглощаются Na⁺/K⁺-АТФазой , ионы калия затем стекают по градиенту своей концентрации через ионные каналы отбора калия, эта потеря положительного заряда создает отрицательный мембранный потенциал . Чтобы сбалансировать эту разность потенциалов , отрицательные ионы хлорида также выходят из клетки через селективные хлоридные каналы. Потеря ионов натрия и хлорида компенсирует осмотический эффект более высокой концентрации органических молекул внутри клетки. [ 27 ]
Клетки могут справляться с еще более серьезными осмотическими изменениями, накапливая осмопротекторы, такие как бетаины или трегалоза . в цитозоле [ 27 ] Некоторые из этих молекул могут позволить клеткам выжить при полном высыхании и позволить организму войти в состояние анабиоза, называемое криптобиозом . [ 28 ] В этом состоянии цитозоль и осмопротекторы становятся стеклообразным твердым веществом, которое помогает стабилизировать белки и клеточные мембраны от разрушительного воздействия высыхания. [ 29 ]
Низкая концентрация кальция в цитозоле позволяет ионам кальция действовать как вторичный мессенджер при передаче сигналов кальция . Здесь сигнал, такой как гормон или потенциал действия, открывает кальциевый канал , и кальций попадает в цитозоль. [ 30 ] Это внезапное увеличение цитозольного кальция активирует другие сигнальные молекулы, такие как кальмодулин и протеинкиназа C. [ 31 ] Другие ионы, такие как хлорид и калий, также могут выполнять сигнальные функции в цитозоле, но они недостаточно изучены. [ 32 ]
Макромолекулы
[ редактировать ]Молекулы белка, которые не связываются с клеточными мембранами или цитоскелетом, растворяются в цитозоле. Количество белка в клетках чрезвычайно велико и приближается к 200 мг/мл, занимая около 20–30% объема цитозоля. [ 1 ] Однако точно измерить, сколько белка растворено в цитозоле интактных клеток, сложно, поскольку некоторые белки, по-видимому, слабо связаны с мембранами или органеллами в целых клетках и высвобождаются в раствор при лизисе клеток . [ 5 ] Действительно, в экспериментах, где плазматическую мембрану клеток осторожно разрушали с помощью сапонина , не повреждая при этом другие клеточные мембраны, высвобождалось лишь около четверти клеточного белка. Эти клетки также были способны синтезировать белки, если им давали АТФ и аминокислоты, а это означает, что многие ферменты в цитозоле связаны с цитоскелетом. [ 33 ] Однако идея о том, что большинство белков в клетках прочно связаны в сеть, называемую микротрабекулярной решеткой, сейчас считается маловероятной. [ 34 ]
клетки У прокариот цитозоль содержит геном внутри структуры, известной как нуклеоид . [ 35 ] Это неравномерная масса ДНК и связанных с ней белков, которые контролируют транскрипцию и репликацию бактериальных хромосом и плазмид . У эукариот геном хранится внутри ядра клетки , которое отделено от цитозоля ядерными порами более 10 нанометров . , которые блокируют свободную диффузию любой молекулы диаметром [ 36 ]
Эта высокая концентрация макромолекул в цитозоле вызывает эффект, называемый макромолекулярным краудингом , когда эффективная концентрация других макромолекул увеличивается, поскольку у них меньше объема для перемещения. Этот эффект краудинга может вызывать большие изменения как в скорости , так и в положении химическое равновесие реакций в цитозоле. [ 1 ] Это особенно важно из-за его способности изменять константы диссоциации , способствуя ассоциации макромолекул, например, когда несколько белков собираются вместе, образуя белковые комплексы , или когда ДНК-связывающие белки связываются со своими мишенями в геноме . [ 37 ]
Организация
[ редактировать ]Хотя компоненты цитозоля не разделены на области клеточными мембранами, эти компоненты не всегда смешиваются случайным образом, и несколько уровней организации могут локализовать определенные молекулы в определенных местах внутри цитозоля. [ 38 ]
Градиенты концентрации
[ редактировать ]Хотя небольшие молекулы быстро диффундируют в цитозоль, внутри этого компартмента все же могут возникать градиенты концентрации. Хорошо изученным примером являются «кальциевые искры», которые на короткое время возникают в области вокруг открытого кальциевого канала . [ 39 ] Они имеют диаметр около 2 микрометров и существуют всего несколько миллисекунд , хотя несколько искр могут сливаться, образуя более крупные градиенты, называемые «волнами кальция». [ 40 ] Градиенты концентрации других малых молекул, таких как кислород и аденозинтрифосфат, могут образовываться в клетках вокруг кластеров митохондрий , хотя они менее изучены. [ 41 ] [ 42 ]
Белковые комплексы
[ редактировать ]Белки могут объединяться с образованием белковых комплексов , которые часто содержат набор белков со схожими функциями, например ферменты, которые выполняют несколько этапов одного и того же метаболического пути. [ 43 ] Такая организация может обеспечить каналирование субстрата , то есть когда продукт одного фермента передается непосредственно следующему ферменту в пути, не высвобождаясь в раствор. [ 44 ] Каналирование может сделать этот путь более быстрым и эффективным, чем если бы ферменты были случайным образом распределены в цитозоле, а также может предотвратить высвобождение нестабильных промежуточных продуктов реакции. [ 45 ] Хотя в самых разных метаболических путях участвуют ферменты, тесно связанные друг с другом, другие могут включать более слабо связанные комплексы, которые очень трудно изучать вне клетки. [ 46 ] [ 47 ] Следовательно, значение этих комплексов для метаболизма в целом остается неясным.
Белковые отсеки
[ редактировать ]Некоторые белковые комплексы содержат большую центральную полость, изолированную от остального цитозоля. Одним из примеров такого закрытого отсека является протеасома . [ 48 ] Здесь набор субъединиц образует полый бочонок, содержащий протеазы , разрушающие цитозольные белки. Поскольку они были бы вредными, если бы свободно смешивались с остатком цитозоля, цилиндр покрыт набором регуляторных белков, которые распознают белки с помощью сигнала, направляющего их на деградацию ( убиквитиновая метка), и подают их в протеолитическую полость. [ 49 ]
Другим большим классом белковых компартментов являются бактериальные микрокомпартменты , состоящие из белковой оболочки, инкапсулирующей различные ферменты. [ 50 ] Эти отсеки обычно имеют диаметр около 100–200 нанометров и состоят из взаимосвязанных белков. [ 51 ] Хорошо изученным примером является карбоксисома , которая содержит ферменты, участвующие в фиксации углерода, такие как RuBisCO . [ 52 ]
Биомолекулярные конденсаты
[ редактировать ]Несвязанные с мембраной органеллы могут образовываться в виде биомолекулярных конденсатов , которые возникают в результате кластеризации, олигомеризации или полимеризации макромолекул , что приводит к коллоидному фазовому разделению цитоплазмы или ядра.
Цитоскелетное просеивание
[ редактировать ]Хотя цитоскелет не является частью цитозоля, наличие этой сети нитей ограничивает диффузию крупных частиц в клетке. Например, в нескольких исследованиях частицы-индикаторы размером более 25 нанометров (размером примерно с рибосому ) [ 53 ] были исключены из частей цитозоля по краям клетки и рядом с ядром. [ 54 ] [ 55 ] Эти «исключающие отсеки» могут содержать гораздо более плотную сеть актиновых волокон, чем остальная часть цитозоля. Эти микродомены могут влиять на распределение крупных структур, таких как рибосомы и органеллы, внутри цитозоля, исключая их из одних областей и концентрируя в других. [ 56 ]
Функция
[ редактировать ]Цитозоль является местом многих клеточных процессов. Примеры этих процессов включают передачу сигнала от клеточной мембраны к местам внутри клетки, таким как клеточное ядро , [ 57 ] или органеллы. [ 58 ] Этот отсек также является местом многих процессов цитокинеза после разрушения ядерной мембраны в митозе . [ 59 ] Другой важной функцией цитозоля является транспортировка метаболитов от места их образования туда, где они используются. Это относительно просто для водорастворимых молекул, таких как аминокислоты, которые могут быстро диффундировать через цитозоль. [ 18 ] Однако гидрофобные молекулы, такие как жирные кислоты или стерины , могут транспортироваться через цитозоль с помощью специфически связывающихся белков, которые перемещают эти молекулы между клеточными мембранами. [ 60 ] [ 61 ] Молекулы, попадающие в клетку путем эндоцитоза или на пути к секреции, также могут транспортироваться через цитозоль внутри везикул . [ 62 ] которые представляют собой небольшие сферы липидов, которые перемещаются по цитоскелету с помощью моторных белков . [ 63 ]
Цитозоль является местом большей части метаболизма у прокариот. [ 9 ] и значительная часть метаболизма эукариот. Например, у млекопитающих около половины белков клетки локализованы в цитозоле. [ 64 ] Наиболее полные данные имеются по дрожжам, метаболические реконструкции которых показывают, что большинство как метаболических процессов, так и метаболитов происходит в цитозоле. [ 65 ] Основными путями метаболизма, которые происходят в цитозоле у животных, являются биосинтез белка , пентозофосфатный путь , гликолиз и глюконеогенез . [ 66 ] Локализация путей может быть разной у других организмов, например, синтез жирных кислот происходит в хлоропластах . у растений [ 67 ] [ 68 ] и в апикопластах у apicomplexa . [ 69 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б с Эллис Р.Дж. (октябрь 2001 г.). «Макромолекулярная скученность: очевидна, но недооценена». Тенденции биохимии. Наука . 26 (10): 597–604. дои : 10.1016/S0968-0004(01)01938-7 . ПМИД 11590012 .
- ^ Каммак, Ричард; Этвуд, Тереза; Кэмпбелл, Питер; Пэриш, Ховард; Смит, Энтони; Велла, Фрэнк; Стерлинг, Джон (2006). Каммак, Ричард; Этвуд, Тереза; Кэмпбелл, Питер; Пэриш, Ховард; Смит, Энтони; Велла, Фрэнк; Стерлинг, Джон (ред.). «Цитоплазматический матрикс» . Оксфордский словарь биохимии и молекулярной биологии . Издательство Оксфордского университета. doi : 10.1093/acref/9780198529170.001.0001 . ISBN 9780198529170 .
- ^ Ляховицкий, Карлос (2015). «Подготовительный курс анатомии и физиологии человека» (pdf) . Открытые образовательные ресурсы . CUNY Academic Works: 69. Архивировано из оригинала 23 августа 2017 г. Проверено 22 июня 2021 г.
- ^ Лардри, HA 1969. О направлении окислительно-восстановительных реакций пиридиннуклеотидов в глюконеогенезе и липогенезе. В: Контроль энергетического метаболизма под редакцией Б. Чанса, Р. Эстабрука и Дж. Р. Уильямсона. Нью-Йорк: Академик, 1965, с. 245, [1] .
- ^ Jump up to: а б с д и Клегг Джеймс С. (1984). «Свойства и метаболизм водной цитоплазмы и ее границ». Являюсь. Дж. Физиол . 246 (2, часть 2): R133–51. дои : 10.1152/ajpregu.1984.246.2.R133 . ПМИД 6364846 . S2CID 30351411 .
- ^ Jump up to: а б с Каммак, Ричард; Тереза Этвуд; Эттвуд, Тереза К.; Кэмпбелл, Питер Скотт; Пэриш, Ховард И.; Смит, Тони; Велла, Фрэнк; Стерлинг, Джон (2006). Оксфордский словарь биохимии и молекулярной биологии . Оксфорд [Оксфордшир]: Издательство Оксфордского университета. ISBN 0-19-852917-1 . OCLC 225587597 .
- ^ Jump up to: а б Лодиш, Харви Ф. (1999). Молекулярно-клеточная биология . Нью-Йорк: Книги Scientific American. ISBN 0-7167-3136-3 . OCLC 174431482 .
- ^ Ханстейн, Дж. (1880). Дас Протоплазма . Гейдельберг. п. 24.
- ^ Jump up to: а б Хопперт М., Майер Ф. (1999). «Принципы макромолекулярной организации и функции клеток бактерий и архей». Клеточная биохимия. Биофиз . 31 (3): 247–84. дои : 10.1007/BF02738242 . ПМИД 10736750 . S2CID 21004307 .
- ^ Баушер К.Г., Тобин А.К. (апрель 2001 г.). «Разделение метаболизма в митохондриях и пластидах» . Дж. Эксп. Бот . 52 (356): 513–27. дои : 10.1093/jexbot/52.356.513 . ПМИД 11373301 .
- ^ Гудакр Р., Вайдьянатан С., Данн В.Б., Харриган Г.Г., Келл Д.Б. (май 2004 г.). «Метаболомика в цифрах: получение и понимание глобальных данных о метаболитах» (PDF) . Тенденции Биотехнологии . 22 (5): 245–52. дои : 10.1016/j.tibtech.2004.03.007 . ПМИД 15109811 . Архивировано из оригинала (PDF) 17 декабря 2008 г.
- ^ Векверт В (2003). «Метаболомика в системной биологии». Annu Rev Plant Biol . 54 : 669–89. doi : 10.1146/annurev.arplant.54.031902.135014 . ПМИД 14503007 . S2CID 1197884 .
- ^ Рид Дж.Л., Во Т.Д., Шиллинг Ч., Палссон Б.О. (2003). «Модель расширенного генома Escherichia coli K-12 (iJR904 GSM/GPR)» . Геном Биол . 4 (9): Р54. дои : 10.1186/gb-2003-4-9-r54 . ЧВК 193654 . ПМИД 12952533 .
- ^ Фёрстер Дж., Фамили I, Фу П., Палссон Б., Нильсен Дж. (февраль 2003 г.). «Геномная реконструкция метаболической сети Saccharomyces cerevisiae» . Геном Рез . 13 (2): 244–53. дои : 10.1101/гр.234503 . ПМК 420374 . ПМИД 12566402 .
- ^ Луби-Фелпс К. (2000). «Цитоархитектура и физические свойства цитоплазмы: объем, вязкость, диффузия, площадь внутриклеточной поверхности» (PDF) . Межд. Преподобный Цитол . Международный обзор цитологии. 192 : 189–221. дои : 10.1016/S0074-7696(08)60527-6 . ISBN 978-0-12-364596-8 . ПМИД 10553280 . Архивировано из оригинала (PDF) 19 июля 2011 г.
- ^ Роос А., Бор В.Ф. (апрель 1981 г.). «Внутриклеточный pH». Физиол. Преподобный . 61 (2): 296–434. дои : 10.1152/physrev.1981.61.2.296 . ПМИД 7012859 .
- ^ Яркий, ГР; Фишер, ГВ; Роговска, Дж; Тейлор, Д.Л. (1987). «Визуализирующая микроскопия соотношения флуоресценции: временные и пространственные измерения pH цитоплазмы» . Журнал клеточной биологии . 104 (4): 1019–1033. дои : 10.1083/jcb.104.4.1019 . ПМК 2114443 . ПМИД 3558476 .
- ^ Jump up to: а б Веркман А.С. (январь 2002 г.). «Диффузия растворенных веществ и макромолекул в водных средах клетки». Тенденции биохимии. Наука . 27 (1): 27–33. дои : 10.1016/S0968-0004(01)02003-5 . ПМИД 11796221 .
- ^ Jump up to: а б Виггинс ПМ (1 декабря 1990 г.). «Роль воды в некоторых биологических процессах» . Микробиол. Преподобный . 54 (4): 432–49. дои : 10.1128/MMBR.54.4.432-449.1990 . ПМЦ 372788 . ПМИД 2087221 .
- ^ Фултон AB (сентябрь 1982 г.). «Насколько густонаселена цитоплазма?». Клетка . 30 (2): 345–7. дои : 10.1016/0092-8674(82)90231-8 . ПМИД 6754085 . S2CID 6370250 .
- ^ Гарлид К.Д. (2000). «Состояние воды в биологических системах». Межд. Преподобный Цитол . Международный обзор цитологии. 192 : 281–302. дои : 10.1016/S0074-7696(08)60530-6 . ISBN 978-0-12-364596-8 . ПМИД 10553283 .
- ^ Чаплин М. (ноябрь 2006 г.). «Недооцениваем ли мы важность воды в клеточной биологии?». Нат. Преподобный мол. Клеточная Биол . 7 (11): 861–6. дои : 10.1038/nrm2021 . ПМИД 16955076 . S2CID 42919563 .
- ^ Виггинс ПМ (июнь 1996 г.). «Вода высокой и низкой плотности и покоящиеся, активные и трансформированные клетки». Клеточная Биол. Межд . 20 (6): 429–35. дои : 10.1006/cbir.1996.0054 . ПМИД 8963257 . S2CID 42866068 .
- ^ Перссон Э., Галле Б (апрель 2008 г.). «Динамика клеточной воды в различных временных масштабах» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 105 (17): 6266–71. Бибкод : 2008PNAS..105.6266P . дои : 10.1073/pnas.0709585105 . ПМЦ 2359779 . ПМИД 18436650 .
- ^ Тьер, С.О. (25 апреля 1986 г.). «Физиология калия». Американский медицинский журнал . 80 (4А): 3–7. дои : 10.1016/0002-9343(86)90334-7 . ПМИД 3706350 .
- ^ Лоте, Кристофер Дж. (2012). Принципы физиологии почек, 5-е издание . Спрингер. п. 12.
- ^ Jump up to: а б с Ланг Ф. (октябрь 2007 г.). «Механизмы и значение регуляции объема клеток». J Am Coll Nutr . 26 (5 доп.): 613S–623S. дои : 10.1080/07315724.2007.10719667 . ПМИД 17921474 . S2CID 1798009 .
- ^ Сусич Ф, Скопец С, Брэйди Дж, Сезаро А (август 2001 г.). «Обратимая дегидратация трегалозы и ангидробиоз: от состояния раствора к экзотическому кристаллу?». Углевод. Рез . 334 (3): 165–76. дои : 10.1016/S0008-6215(01)00189-6 . ПМИД 11513823 .
- ^ Кроу Дж. Х., Карпентер Дж. Ф., Кроу Л. М. (1998). «Роль витрификации в ангидробиозе». Анну. Преподобный физиол. 60 : 73–103. дои : 10.1146/annurev.phyol.60.1.73 . ПМИД 9558455 .
- ^ Берридж MJ (1 марта 1997 г.). «Элементарные и глобальные аспекты передачи сигналов кальция» . Дж. Физиол . 499 (Часть 2): 291–306. doi : 10.1113/jphysicalol.1997.sp021927 . ПМЦ 1159305 . ПМИД 9080360 .
- ^ Киккава У, Кисимото А, Нисидзука Ю (1989). «Семейство протеинкиназ C: гетерогенность и ее последствия». Анну. Преподобный Биохим. 58 : 31–44. дои : 10.1146/annurev.bi.58.070189.000335 . ПМИД 2549852 .
- ^ Орлов С.Н., Хамет П. (апрель 2006 г.). «Внутриклеточные одновалентные ионы как вторичные мессенджеры». Дж. Член. Биол . 210 (3): 161–72. дои : 10.1007/s00232-006-0857-9 . ПМИД 16909338 . S2CID 26068558 .
- ^ Хаддер А., Натансон Л., депутат парламента Германии (декабрь 2003 г.). «Организация цитоплазмы млекопитающих» . Мол. Клетка. Биол . 23 (24): 9318–26. дои : 10.1128/MCB.23.24.9318-9326.2003 . ПМК 309675 . ПМИД 14645541 .
- ^ Хойзер Дж (2002). «Что случилось с «концепцией микротрабекулярности»?». Биол Клетка . 94 (9): 561–96. дои : 10.1016/S0248-4900(02)00013-8 . ПМИД 12732437 . S2CID 45792524 .
- ^ Танбихлер М., Ван С., Шапиро Л. (2005). «Бактериальный нуклеоид: высокоорганизованная и динамичная структура» . J Cell Biochem . 96 (3): 506–21. дои : 10.1002/jcb.20519 . ПМИД 15988757 . S2CID 25355087 .
- ^ Питерс Р. (2006). «Введение в нуклеоцитоплазматический транспорт». Протоколы Ксенопуса . Методы молекулярной биологии. Том. 322. стр. 235–58. дои : 10.1007/978-1-59745-000-3_17 . ISBN 978-1-58829-362-6 . ПМИД 16739728 .
- ^ Чжоу Х.С., Ривас Дж., Минтон А.П. (2008). «Макромолекулярная скученность и удержание: биохимические, биофизические и потенциальные физиологические последствия» . Анну Рев Биофиз . 37 : 375–97. doi : 10.1146/annurev.biophys.37.032807.125817 . ПМЦ 2826134 . ПМИД 18573087 .
- ^ Норрис В., ден Блаувен Т., Кабин-Фламан А. (март 2007 г.). «Функциональная систематика бактериальных гиперструктур» . Микробиол. Мол. Биол. Преподобный . 71 (1): 230–53. дои : 10.1128/MMBR.00035-06 . ПМЦ 1847379 . ПМИД 17347523 .
- ^ Ван С.К., Вэй С., Чжао Г. (апрель 2004 г.). «Визуализация микродомена Ca2+ в мышечных клетках» . Цирк. Рез . 94 (8): 1011–22. дои : 10.1161/01.RES.0000125883.68447.A1 . ПМИД 15117829 .
- ^ Яффе Л.Ф. (ноябрь 1993 г.). «Классы и механизмы кальциевых волн». Клеточный кальций . 14 (10): 736–45. дои : 10.1016/0143-4160(93)90099-Р . ПМИД 8131190 .
- ^ Ой, Тай (2000). «Внутриклеточная компартментация органелл и градиенты низкомолекулярных видов». Int Rev Цитол . Международный обзор цитологии. 192 : 223–53. дои : 10.1016/S0074-7696(08)60528-8 . ISBN 978-0-12-364596-8 . ПМИД 10553281 .
- ^ Вайс Дж. Н., Корге П. (20 июля 2001 г.). «Цитоплазма: больше не хорошо перемешанный мешок» . Цирк. Рез . 89 (2): 108–10. дои : 10.1161/res.89.2.108 . ПМИД 11463714 .
- ^ Срере П.А. (1987). «Комплексы последовательных метаболических ферментов». Анну. Преподобный Биохим. 56 : 89–124. дои : 10.1146/annurev.bi.56.070187.000513 . ПМИД 2441660 .
- ^ Перхам Р.Н. (2000). «Качающиеся плечи и качающиеся домены в многофункциональных ферментах: каталитические машины для многостадийных реакций». Анну. Преподобный Биохим. 69 : 961–1004. doi : 10.1146/annurev.biochem.69.1.961 . ПМИД 10966480 .
- ^ Хуан Икс, Холден Х.М., Раушел Ф.М. (2001). «Канализирование субстратов и промежуточных продуктов в реакциях, катализируемых ферментами». Анну. Преподобный Биохим. 70 : 149–80. doi : 10.1146/annurev.biochem.70.1.149 . ПМИД 11395405 . S2CID 16722363 .
- ^ Моубрей Дж., Моисей В. (июнь 1976 г.). «Предварительная идентификация в Escherichia coli мультиферментного комплекса с гликолитической активностью». Евро. Дж. Биохим . 66 (1): 25–36. дои : 10.1111/j.1432-1033.1976.tb10421.x . ПМИД 133800 .
- ^ Шривастава Д.К., Бернхард С.А. (ноябрь 1986 г.). «Перенос метаболитов через фермент-ферментные комплексы». Наука . 234 (4780): 1081–6. Бибкод : 1986Sci...234.1081S . дои : 10.1126/science.3775377 . ПМИД 3775377 .
- ^ Гролл М., Клаузен Т. (декабрь 2003 г.). «Молекулярные измельчители: как протеасомы выполняют свою роль». Курс. Мнение. Структура. Биол . 13 (6): 665–73. дои : 10.1016/j.sbi.2003.10.005 . ПМИД 14675543 .
- ^ Нанди Д., Тахилиани П., Кумар А., Чанду Д. (март 2006 г.). «Система убиквитин-протеасома» (PDF) . Дж. Биоши . 31 (1): 137–55. дои : 10.1007/BF02705243 . ПМИД 16595883 . S2CID 21603835 . Архивировано (PDF) из оригинала 2 июля 2006 г.
- ^ Бобик, Т.А. (2007). «Бактериальные микрокомпарты» (PDF) . Микроб . 2 . Am Soc Microbiol: 25–31. Архивировано из оригинала (PDF) 2 августа 2008 г.
- ^ Йейтс Т.О., Керфельд К.А., Хайнхорст С., Кэннон Г.К., Шайвли Дж.М. (август 2008 г.). «Белковые органеллы бактерий: карбоксисомы и родственные микрокомпартменты». Нат. Преподобный Микробиол . 6 (9): 681–691. дои : 10.1038/nrmicro1913 . ПМИД 18679172 . S2CID 22666203 .
- ^ Бэджер М.Р., Прайс Г.Д. (февраль 2003 г.). «Механизмы концентрации CO 2 у цианобактерий: молекулярные компоненты, их разнообразие и эволюция» . Дж. Эксп. Бот . 54 (383): 609–22. дои : 10.1093/jxb/erg076 . ПМИД 12554704 .
- ^ Кейт Дж. Х. (ноябрь 2001 г.). «Построение рентгеновских кристаллографических карт электронной плотности рибосомы низкого разрешения» . Методы . 25 (3): 303–8. дои : 10.1006/meth.2001.1242 . ПМИД 11860284 .
- ^ Прованс Д.В., Макдауэлл А., Марко М., Луби-Фелпс К. (1 октября 1993 г.). «Цитоархитектура безразмерных компартментов в живых клетках» . Дж. Клеточная наука . 106 (2): 565–77. дои : 10.1242/jcs.106.2.565 . ПМИД 7980739 .
- ^ Луби-Фелпс К., Касл П.Е., Тейлор Д.Л., Ланни Ф. (июль 1987 г.). «Затрудненная диффузия инертных частиц-индикаторов в цитоплазме клеток 3Т3 мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 84 (14): 4910–3. Бибкод : 1987PNAS...84.4910L . дои : 10.1073/pnas.84.14.4910 . ПМК 305216 . ПМИД 3474634 .
- ^ Луби-Фелпс К. (июнь 1993 г.). «Влияние цитоархитектуры на транспорт и локализацию белковых синтетических механизмов». Дж. Селл. Биохим . 52 (2): 140–7. дои : 10.1002/jcb.240520205 . ПМИД 8366131 . S2CID 12063324 .
- ^ Холоденко Б.Н. (июнь 2003 г.). «Четырехмерная организация сигнальных каскадов протеинкиназ: роль диффузии, эндоцитоза и молекулярных моторов». Дж. Эксп. Биол . 206 (Часть 12): 2073–82. дои : 10.1242/jeb.00298 . ПМИД 12756289 . S2CID 18002214 .
- ^ Песарези П., Шнайдер А., Кляйне Т., Лейстер Д. (декабрь 2007 г.). «Межорганеллярная коммуникация». Курс. Мнение. Растительная биол . 10 (6): 600–6. дои : 10.1016/j.pbi.2007.07.007 . ПМИД 17719262 .
- ^ Вайни М., Мамай С.Л., О'Тул И.Т. (июнь 1995 г.). «Трехмерный ультраструктурный анализ митотического веретена Saccharomyces cerevisiae» . Дж. Клеточная Биол . 129 (6): 1601–15. дои : 10.1083/jcb.129.6.1601 . ПМК 2291174 . ПМИД 7790357 .
- ^ Вейзигер Р.А. (октябрь 2002 г.). «Цитозольные белки, связывающие жирные кислоты, катализируют два различных этапа внутриклеточного транспорта своих лигандов». Мол. Клетка. Биохим . 239 (1–2): 35–43. дои : 10.1023/А:1020550405578 . ПМИД 12479566 . S2CID 9608133 .
- ^ Максфилд Ф.Р., Мондал М. (июнь 2006 г.). «Транспорт стеринов и липидов в клетках млекопитающих». Биохим. Соц. Транс . 34 (Часть 3): 335–9. дои : 10.1042/BST0340335 . ПМИД 16709155 .
- ^ Пелхэм HR (август 1999 г.). «Лекция Круниана, 1999 г. Внутриклеточный мембранный трафик: сортировка белков» . Филос. Пер. Р. Сок. Лонд. Б Биол. Наука . 354 (1388): 1471–8. дои : 10.1098/rstb.1999.0491 . ПМЦ 1692657 . ПМИД 10515003 .
- ^ Камаль А., Гольдштейн Л.С. (февраль 2002 г.). «Принципы прикрепления груза к цитоплазматическим моторным белкам». Курс. Мнение. Клеточная Биол . 14 (1): 63–8. дои : 10.1016/S0955-0674(01)00295-2 . ПМИД 11792546 .
- ^ Фостер Л.Дж., де Хоог С.Л., Чжан Ю. (апрель 2006 г.). «Карта органелл млекопитающих с помощью профилирования белковой корреляции» . Клетка . 125 (1): 187–99. дои : 10.1016/j.cell.2006.03.022 . ПМИД 16615899 . S2CID 32197 .
- ^ Херргард, MJ; Суэйнстон, Н.; Добсон, П; Данн, ВБ; Арга, Кентукки; Арвас, М; Блютген, Н; Боргер, С; Костенобль, Р; и др. (октябрь 2008 г.). «Консенсусная реконструкция метаболической сети дрожжей, полученная на основе общественного подхода к системной биологии» . Природная биотехнология . 26 (10): 1155–60. дои : 10.1038/nbt1492 . ПМК 4018421 . ПМИД 18846089 .
- ^ Страйер, Люберт; Берг, Джереми Марк; Тимочко, Джон Л. (2002). Биохимия . Сан-Франциско: WH Freeman. ISBN 0-7167-4684-0 . OCLC 179705944 .
- ^ Олрогге Дж., Поллард М., Бао X (декабрь 2000 г.). «Синтез жирных кислот: от CO 2 к функциональной геномике». Биохим. Соц. Транс . 28 (6): 567–73. дои : 10.1042/BST0280567 . ПМИД 11171129 .
- ^ Ольрогге Дж.Б., Кун Д.Н., Штумпф ПК (март 1979 г.). «Субклеточная локализация ацильного белка-переносчика в протопластах листьев Spinacia oleracea» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 76 (3): 1194–8. Бибкод : 1979PNAS...76.1194O . дои : 10.1073/pnas.76.3.1194 . ПМЦ 383216 . ПМИД 286305 .
- ^ Goodman CD, McFadden GI (январь 2007 г.). «Биосинтез жирных кислот как мишень лекарств у апикомплексных паразитов». Цели Curr по борьбе с наркотиками . 8 (1): 15–30. дои : 10.2174/138945007779315579 . PMID 17266528 . S2CID 2565225 .
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Уитли, Денис Н.; Поллак, Джеральд Х.; Кэмерон, Иван Л. (2006). Вода и клетка . Берлин: Шпрингер. ISBN 1-4020-4926-9 . OCLC 71298997 .