Цикломальтодекстрин глюканотрансфераза
 | Эта статья включает список общих ссылок , но в ней отсутствуют достаточные соответствующие встроенные цитаты . ( Март 2020 г. ) |
| цикломальтодекстрин глюканотрансфераза | |||
|---|---|---|---|
 CGTase Ленточная диаграмма | |||
| Идентификаторы | |||
| Номер ЕС. | 2.4.1.19 | ||
| Номер CAS. | 9030-09-5 | ||
| Базы данных | |||
| ИнтЭнк | вид IntEnz | ||
| БРЕНДА | БРЕНДА запись | ||
| Экспаси | Просмотр NiceZyme | ||
| КЕГГ | КЕГГ запись | ||
| МетаЦик | метаболический путь | ||
| ПРЯМОЙ | профиль | ||
| PDB Структуры | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||
| Генная онтология | АмиГО / QuickGO | ||
| |||
В энзимологии цикломальтодекстрин глюканотрансфераза (также циклодекстрингликозилтрансфераза или CGTase сокращенно ) ( EC 2.4.1.19 ) представляет собой фермент , который катализирует химическую реакцию циклизации части молекулы 1,4-альфа-D -глюкана посредством образования 1,4-альфа-D-глюкозидная связь. Это бактериальные ферменты, принадлежащие к тому же семейству α-амилаз , конкретно известному как семейство гликозилгидролаз 13. Этот своеобразный фермент способен катализировать более чем одну реакцию, наиболее важной из которых является синтез невосстанавливающих циклических декстринов, известных как циклодекстрины. начиная с крахмала , амилозы и других полисахаридов .
CGTase является ферментом, общим для многих видов бактерий, в частности, для Bacillus рода (например, B. circulans , B. macerans и B. stearothermophilus ) и Brevibacillus brevis.
Этот фермент принадлежит к семейству гликозилтрансфераз , в частности гексозилтрансфераз. Систематическое название этого класса ферментов — 1,4-альфа-D-глюкан-4-альфа-D-(1,4-альфа-D-глюкано)-трансфераза (циклизирующая) . Другие общеупотребительные названия включают амилазу Bacillus macerans циклодекстрин глюканотрансферазу , альфа-циклодекстрин глюканотрансферазу , альфа-циклодекстрин гликозилтрансферазу , бета-циклодекстрин глюканотрансферазу , бета-циклодекстрин гликозилтрансферазу , гамма-циклодекстрин гликозилтрансферазу , циклодекстрин гликозилтрансферазу, тодекстрин глюкотрансфераза , цикломальтодекстрин , гликозилтрансфераза , кончизаиму , альфа -1,4-глюкан-4-гликозилтрансфераза, циклизирующая , BMA , CGTase и нейтральная циклодекстрингликозилтрансфераза .
Каталитическая активность
[ редактировать ]Все CGTases могут катализировать до четырех реакций: циклизацию, связывание, диспропорционирование и гидролиз. Все эти активности имеют один и тот же каталитический механизм, который является общим для всех гликозилгидролаз.
Циклизация — это процесс, при котором линейная полисахаридная цепь расщепляется и два конца расщепленного фрагмента соединяются с образованием кольцевого декстрина (циклодекстрина или ЦД): в зависимости от количества остатков сахара этот кольцевой продукт состоит из трех основных Можно выделить тип циклодекстринов: α-ЦД с шестью остатками, β-ЦД с семью остатками и γ-ЦД с восемью остатками.
Реакцию сочетания можно легко описать как процесс, обратный циклизации: фермент расщепляет циклодекстрин с образованием линейного декстрина, который впоследствии присоединяется к линейному олигосахариду.
Диспропорционирование очень похоже на сочетание, но расщепленный декстрин представляет собой не циклодекстрин, а линейный олигосахарид, который затем присоединяется ко второму олигосахариду.
ЦГТАза также обладает слабой гидролизующей активностью, заключающейся в расщеплении более длинных полисахаридных цепей на более короткие фрагменты.
Структурные исследования
[ редактировать ]По состоянию на конец 2007 года для этого класса ферментов было решено 47 кодами с PDB доступа 1A47 , 1CDG , 1CGT , 1CGU , 1CGV , 1CGW , 1CGX , 1CGY , 1CIU , 1CXE , 1CXF , 1CXH , 1CXI , 1CXK , структур , 1CYG , 1D3C , 1D7F , 1DED , 1DTU , 1EO5 , 1EO7 , 1I75 , 1KCK , 1KCL , 1OT1 , 1OT2 , 1PAM , 1PEZ , 1PJ9 , 1TCM , 1UKQ , 1UKS , 1UKT , 1V3 Дж , 1В3К , 1В3Л , 1В3М , 2CXG , 2DIJ , 3CGT , 4CGT , 5CGT , 6CGT , 7CGT , 8CGT и 9CGT .
Ссылки
[ редактировать ]- ДеПинто Дж.А., Кэмпбелл Л.Л. (1968). «Очистка и свойства амилазы Bacillus macerans». Биохимия . 7 (1): 114–20. дои : 10.1021/bi00841a015 . ПМИД 5758537 .
- Френч Д., Левин М.Л., Норберг Э., Нордин П., Пазур Дж.Х., Wild GM (1954). «Исследования декстринов Шардингера. VII. Косубстратная специфичность в реакциях сочетания амилазы Macerans». Дж. Ам. хим. Соц . 76 (9): 2387–2390. дои : 10.1021/ja01638a027 .
- Хере Э.Дж. (1951). «Ферментативный синтез полисахаридов: биологический тип полимеризации». Достижения энзимологии и смежных областей молекулярной биологии . Достижения в энзимологии и смежных областях молекулярной биологии. Том. 11. С. 297–337. дои : 10.1002/9780470122563.ch6 . ISBN 9780470122563 . ПМИД 24540594 .
{{cite book}}:|journal=игнорируется ( помогите ) - ШВИММЕР С (1953). «Доказательства чистоты декстриногеназы Шардингера». Арх. Биохим. Биофиз . 43 (1): 108–17. дои : 10.1016/0003-9861(53)90089-7 . ПМИД 13031665 .
- Бивер А., Антраникян Г., Хайнцле Э. (сентябрь 2002 г.). «Ферментативное производство циклодекстринов». Прикладная микробиология и биотехнология . 59 (6): 609–17. дои : 10.1007/s00253-002-1057-x . ПМИД 12226716 .
- ван дер Вин Б.А., Уитдехааг Дж.К., Пеннинга Д., ван Алебик Г.Дж., Смит Л.М., Дейкстра Б.В., Дейкхуизен Л. (март 2000 г.). «Рациональный дизайн циклодекстрингликозилтрансферазы из штамма 251 Bacillus circulans для увеличения производства альфа-циклодекстрина». Журнал молекулярной биологии . 296 (4): 1027–38. дои : 10.1006/jmbi.2000.3528 . ПМИД 10686101 .
