Jump to content

Коллагеназа

(Перенаправлено с Коллагенолиза )

Матриксная металлопептидаза 1 (интерстициальная коллагеназа)
Идентификаторы
Символ ММП1
ген NCBI 4312
HGNC 7155
МОЙ БОГ 120353
RefSeq НМ_002421
ЮниПрот P03956
Другие данные
Номер ЕС 3.4.24.7
Локус Хр. 11 q21-q22
Искать
StructuresSwiss-model
DomainsInterPro
Матриксная металлопептидаза 8 (коллагеназа нейтрофилов)
Идентификаторы
Символ ММП8
ген NCBI 4317
HGNC 7175
МОЙ БОГ 120355
RefSeq НМ_002424
ЮниПрот P22894
Другие данные
Номер ЕС Хромосома = 11 3.4.24.3 Хромосома = 11
Искать
StructuresSwiss-model
DomainsInterPro
Пептидаза М9
Идентификаторы
Символ Пептидаза М9
Пфам PF01752
Пфам Клан CL0126
ИнтерПро ИПР013510
МЕРОПС М9
Доступные белковые структуры:
Pfam  structures / ECOD  
PDBRCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsumstructure summary

Коллагеназы – это ферменты , разрушающие пептидные связи в коллагене . Они помогают разрушать внеклеточные структуры в патогенезе бактерий, таких как Clostridium . Их считают фактором вирулентности , способствующим распространению газовой гангрены . Обычно они нацелены на соединительную ткань мышечных клеток и других органов тела. [ 1 ]

Коллаген, ключевой компонент внеклеточного матрикса животных, вырабатывается путем расщепления проколлагена коллагеназой после того, как он секретируется из клетки. Это предотвращает образование крупных структур внутри самой клетки.

Коллагеназа не только вырабатывается некоторыми бактериями, но и может вырабатываться организмом как часть нормального иммунного ответа. Это производство индуцируется цитокинами , которые стимулируют такие клетки, как фибробласты и остеобласты , и могут вызвать косвенное повреждение тканей. [ нужна ссылка ]

Терапевтическое использование

[ редактировать ]

Коллагеназы одобрены для медицинского применения в следующих целях:

Семейство MEROPS M9

[ редактировать ]

Эта группа металлопептидаз составляет семейство пептидаз MEROPS M9, подсемейства M9A и M9B (микробная коллагеназа, клан MA(E)). Белковая складка пептидазы домена для членов этого семейства напоминает структуру термолизина, типичный пример для клана MA, и предсказанные активного центра остатки для членов этого семейства и термолизина встречаются в мотиве HEXXH. [ 3 ]

Микробные коллагеназы были идентифицированы у бактерий родов Vibrio и Clostridium . Коллагеназа используется во время бактериальной атаки для разрушения коллагенового барьера хозяина во время инвазии. Бактерии вибрионов иногда используются в больницах для удаления омертвевших тканей из ожогов и язв . Clostridium histolyticum возбудитель газовой гангрены; тем не менее, выделенная коллагеназа использовалась для лечения пролежней . коллагена Расщепление происходит по связям Xaa+Got у бактерий Vibrio и по связям Yaa+Gly у коллагеназ Clostridium . [ нужна ссылка ]

Анализ первичной структуры генного фермент продукта Clostridium perfringens показал, что продуцируется с участком из 86 остатков , которые содержат предполагаемую сигнальную последовательность . [ 4 ] Внутри этого участка находится PLGP, аминокислотная последовательность, типичная для субстратов коллагеназы . Таким образом, эта последовательность может быть вовлечена в самопроцессинг коллагеназы. [ 4 ]

Металлопротеазы являются наиболее разнообразными из семи основных типов протеаз : на сегодняшний день идентифицировано более 50 семейств. В этих ферментах двухвалентный катион, обычно цинк, активирует молекулу воды. металла Ион удерживается на месте аминокислотными лигандами, обычно тремя. Известными металлическими лигандами по крайней мере еще один остаток являются His, Glu, Asp или Lys, и для катализа необходим , который может играть электрофильную роль. Из известных металлопротеаз около половины содержат мотив HEXXH, который, как показали кристаллографические исследования, является частью сайта связывания металла. [ 3 ] HEXXH Мотив относительно распространен, но для металлопротеаз его можно более строго определить как «abXHEbbHbc», где «a» чаще всего представляет собой валин или треонин и образует часть субсайта S1' в термолизине и неприлизине, «b» представляет собой незаряженный остаток. и 'c' гидрофобный остаток . Пролин никогда не обнаруживается в этом сайте, возможно, потому, что он разрушает спиральную структуру, принятую этим мотивом в металлопротеазах. [ 3 ]

Другое использование

[ редактировать ]

Коллагеназы можно использовать для размягчения мяса аналогично широко используемым размягчителям папаину , бромелайну и фикаину . [ 5 ]

См. также

[ редактировать ]
В эту статью включен текст из общественного достояния Pfam и InterPro : IPR013510.
  1. ^ Джерард Дж. Тортора, Берделл Р. Функе, Кристин Л. Кейс (2007). Микробиология: введение . Пирсон Бенджамин Каммингс. ISBN  978-0-321-39603-7 .
  2. ^ Райли К.Н., Герман И.М. (2005). «Коллагеназа способствует клеточным реакциям на травмы и заживлению ран in vivo» . Джей Бернс Раны . 4 : е8. ПМК   1501117 . ПМИД   16921413 .
  3. ^ Jump up to: а б с Роулингс Н.Д., Барретт А.Дж. (1995). «Эволюционные семейства металлопептидаз». Протеолитические ферменты: аспарагиновая и металлопептидазы . Методы энзимологии. Том. 248. стр. 183–228. дои : 10.1016/0076-6879(95)48015-3 . ISBN  9780121821494 . ПМИД   7674922 .
  4. ^ Jump up to: а б Мацусита О, Ёшихара К, Катаяма С, Минами Дж, Окабе А (январь 1994 г.). «Очистка и характеристика 120-килодальтонной коллагеназы Clostridium perfringens и нуклеотидной последовательности соответствующего гена» . Дж. Бактериол . 176 (1): 149–56. дои : 10.1128/jb.176.1.149-156.1994 . ПМК   205026 . ПМИД   8282691 .
  5. ^ Чжао Г.И., Чжоу М.И., Чжао Х.Л., Чен XL, Се Б.Б., Чжан XY, Хэ Х.Л., Чжоу Б.С., Чжан Ю.З. (15 октября 2012 г.). «Влияние тендеризации холодоадаптированной коллагенолитической протеазы MCP-01 на говяжье мясо при низкой температуре и его механизм». Пищевая химия . 134 (4): 1738–1744. doi : 10.1016/j.foodchem.2012.03.118 . ISSN   0308-8146 . ПМИД   23442615 .
[ редактировать ]
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: abadd25f641442aed5b0dfaa20f01df5__1719133140
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/ab/f5/abadd25f641442aed5b0dfaa20f01df5.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
Collagenase - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)