Бокапарвовирус

Бокапарвовирус
Классификация вирусов
(не вмешательство):	Вирус
Область :	Моноднавирия
Королевство:	Shotokuvirae
Филум:	Cossaviricota
Сорт:	Пятый
Заказ:	Пиковиралс
Семья:	Parvoviridae
Подсемейство:	Parvovirinae
Род:	Бокапарвовирус
Разновидность
	Смотрите текст

Бокапарвовирус является родом вирусов в подсемействе Parvovirinae семейства вирусов Parvoviridae . ^{[ 1 ]}^{[ 2 ]} Люди, крупный рогатый скот и собаки служат натуральными хозяевами. В этом роде 28 видов. ^{[ 3 ]} Заболевания, связанные с этим родом, включают, у людей острые респираторные заболевания, а также у крупного рогатого скота, диареи и легких респираторных симптомов. ^{[ 4 ]}

История

Бокавирусы были впервые описаны у животных в начале 1960 -х годов.

Геном

Как и другие члены этого семейства, бокапарвовирусы имеют две открытые рамки считывания -ORF1 и 2. Уникальные среди парвовирусов, бокапарвовирусы содержат третью открытую раму считывания между неструктурными и структурными областями кодирования. ^{[ 5 ]} Этот ген кодирует высоко фосфорилированный Нтруктурный белок (NP1).

ORF1 кодирует неструктурный белок (NS1), который участвует в репликации вирусного генома. ORF2 кодирует два капсидных белка - VP1 и VP2.

Как и другие парвовирусы, уникальная область VP1 содержит мотив фосфолипазы А (2) с консервативным мотивом гистидиновой -аспарагиновой кислоты в каталитическом центре. ^{[ 6 ]}

Таксономия

Следующие 28 видов присваиваются роду: ^{[ 3 ]}

Детали вируса

У Parvoviridae виды в настоящее время обычно определяются как кластер вирусов, которые кодируют белки инициатора репликации (называемые NS1), которые имеют аминокислотные последовательности, которые по меньшей мере 85% идентичны тем, которые кодируются всеми другими членами вида. ^{[ 7 ]}

Морты также были идентифицированы как хозяева новых бокапарвовирусов. ^{[ 8 ]}

Вирусология

Бывшие бокавирусы используют эндоцитоз в везикулах с клатрином для попадания клеток; Они зависят от подкисления и, по -видимому, связаны с зависимостью актина и микротрубочек. ^{[ 9 ]}

Все бокапарвовирусы кодируют новый белок, называемый NP1, который не присутствует в парвовирусах из других родов. Было показано, что у собачьего минутного вируса NP1 необходим для раннего этапа репликации вируса, а также необходим для прочтения внутреннего сайта полиаденилирования, который необходим для экспрессии капсидных белков. ^{[ 10 ]}

Жизненный цикл

Вирусная репликация является ядерной. Вступление в клетку-хозяина достигается прикреплением к рецепторам хозяина, что опосредует клатрин-опосредованный эндоцитоз. Репликация следует за моделью прокатываемой волосы. Транскрипция с ДНК-образованием с некоторым альтернативным механизмом сплайсинга является методом транскрипции. Вирус выходит из клетки -хозяина с помощью экспорта ядерной пор. Люди, крупный рогатый скот и собаки служат естественным хозяином. Маршруты передачи являются устными и дыхательными. ^{[ 4 ]}

Род	Детали хоста	Ткань тропизм	Детали записи	Выпустить детали	Сайт репликации	Сайт сборки	Передача инфекции
Бокапарвовирус	Люди; коровы; собак	Никто	Клатрин-опосредованный эндоцитоз	Раннее высвобождение от жизнеспособного лизиса клеток и клеток	Ядро	Ядро	Аэрозоль

Клинический

Эти вирусы обычно заражают желудочно -кишечные и дыхательные путя. Некоторые могут пересекать плаценту и вызвать врожденную инфекцию плода.

Джаловый миночный вирус , сначала изолированный в 1967 году и связанный с заболеванием в 1970 году, вызывает респираторные заболевания с затруднением дыхания и энтеритом с тяжелой диареей, спонтанным абортом плодов и смертью новорожденных щенков.

Человеческие бокавирусы были сначала изолированы в 2005 году в Швеции . ^{[ 11 ]} Они могут быть в состоянии вызвать гепатит у иммунодепрессового хозяина. ^{[ 12 ]}

Бокапарвовирусы были изолированы от рака толстой кишки и легких человека. ^{[ 13 ]} Клиническая важность этого открытия - если какие -либо - остальные, которые можно увидеть.

Частота бокавируса у пациентов с раком выше, чем у здоровых контролей. ^{[ 14 ]}

Структура

Как и другие парвовирусы, бокапарвовирусы имеют икосаэдрическую и круглую структуру с симметрией t = 1. Капсид не развивается и состоит из 60 копий из шести типов капсидных белков (называемых VP1 до VP6), которые имеют общую С-концевую область. Структура вирусной частицы, состоящей только из белка VP2, определяли с помощью криогенной электронной микроскопии и реконструкции изображения. ^{[ 15 ]} Диаметр около 21-22 нм. Геномы линейные, длиной около 5,5 КБ ^{[ 4 ]}

Род	Структура	Симметрия	Капсид	Геномное расположение	Геномная сегментация
Бокапарвовирус	Икосаэдральный	T = 1	Не развитый	Линейный	Никто

Ссылки

^ Cotmoore, SF; Agbandje-McKenna, M; Canati, M; Чиорини, JA; EIS-Hunderger, A; Хьюз, J; Mietzsch, M; Modha, S; Оглиастро, м; Pénzes, JJ; Pintel, DJ; Qiu, j; Soderlund-Venermo, M; Tatterersall, P; Tijssen, P; и консорциум отчета ICTV (2019). "Профиль таксономии вируса ICTV: Parvoviridae " Журнал общей вирусологии 100 (3): 367–3 Doi : 10.1099/ jgv.0.0 6537627PMC 30672729PMID
^ «10 -й отчет ICTV (2018)» .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} «Таксономия вируса: выпуск 2020 года» . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV). Март 2021 г. Получено 10 мая 2021 года .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в «Вирусная зона» . Расширение . Получено 12 июня 2015 года .
^ Manteufel, Jill; Truyen, Uwe (2008). «Бокавирусы животных: краткий обзор». Интервенция . 51 (5): 328–334. doi : 10.1159/000173734 . PMID 19023216 . S2CID 1399470 .
^ Qu, xiao-wang; бокавируса А2 . уникальной подобная - Фосфолипаза » активность человека области
^ Котмор С.Ф., МакКенна М.А., Чиорини Дж.А., Сборник Д., Муха Д.В., Пинтел Д.Дж., Цю Дж., Венермо М.С., Таттерсолл П., Тиджссен П (19 июля 2013 г.). «Рационализация и расширение таксономии семьи Parvoviridae» (PDF) . Международный комитет по таксономии вирусов . ICTV . Получено 1 сентября 2020 года . ^{[ мертвая ссылка ]}
^ Оо, юаньня; Ли, Xiaoue; Ли, Лили; Се, Сяолу; Gen, Dong; Ты, Джамай; Лу, Шан; Дуан, Чжаоджун (2017). «Две новые спецификации Bocaparvirus идентифицированы в диких гималайских суроках» . Наука Чин наук о жизни . 60 (12): 1348–1356. doi : 10.1007/s11427-017-9231-4 . PMC 7089499 . PMID 29218438 .
^ Dudleenamjil, E; Лин, C.-Y; Dredge, D; Мюррей Б. К; Робисон Р. А; Джонсон, Ф. Б. (2010). «Корпус Парвовируса использует клатрин-опосредованный эндоцитоз для ввода клеток» . Журнал общей вирусологии . 91 (12): 3032–3041. doi : 10.1099/vir.0.024133-0 . PMID 20810750 .
^ Sukhu, L; Фасина, о; Бургер, L; Рай, а; Qiu, j; Pintel, D. J (2012). «Характеристика неинтруктурных белков вируса мельчайшего вируса бокавируса» . Журнал вирусологии . 87 (2): 1098–1104. doi : 10.1128/jvi.02627-12 . PMC 3554049 . PMID 23135724 .
^ Алландер, т; Тамми М. Т; Эрикссон, м; Бьеркнер, а; Tiveljung-Lindell, A; Андерссон Б. (2005). «Клонирование человеческого парвовируса путем молекулярного скрининга образцов дыхательных путей» . Труды Национальной академии наук . 102 (36): 12891–6. Bibcode : 2005pnas..10212891a . doi : 10.1073/pnas.0504666102 . PMC 1200281 . PMID 16118271 .
^ Kainulainen, L; Варис, м; Soderlund-Venermo, M; Алландер, т; Хедман, К; Ruuskanen, O (2008). «Гепатит и первичная инфекция бокавируса человека у ребенка с дефицитом Т-клеток» . Журнал клинической микробиологии . 46 (12): 4104–4105. doi : 10.1128/jcm.01288-08 . PMC 2593268 . PMID 18842946 .
^ Шильдген, Верена; Малекки, Моника; Тиллманн, Рамона-Лиза; Брокманн, Майкл; Шильдген, Оливер (2013). «Человеческий бокавирус связан с некоторыми раками легких и колоректального рака и сохраняется в солидных опухолях» . Plos один . 8 (6): E68020. BIBCODE : 2013PLOSO ... 868020S . doi : 10.1371/journal.pone.0068020 . PMC 3694905 . PMID 23826357 .
^ Ли, Яша; Донг, Янминг; Цзян, Джун; Ян, Юнбо; Лю, Кайю; Ли, Йи (2012). «Высокие пленки [sic] инфекции парвовируса человека у пациентов со злокачественными опухолями» . Онкологические письма . 3 (3): 635–640. doi : 10.3892/ol.2012.548 . PMC 3362544 . PMID 22740966 .
^ Гурда, Б. Л; Родитель, К. Н; Bladek, h; Sinkovits, R. S; Dimattia, M. A; Rence, c; Кастро, а; МакКенна, R; Олсон, н; Браун, К; Бейкер, Т. С; Agbandje-McKenna, M (2010). «Структура капсида человеческого бокавируса: понимание структурного репертуара Parvoviridae» . Журнал вирусологии . 84 (12): 5880–9. doi : 10.1128/jvi.02719-09 . PMC 2876641 . PMID 20375175 .

Внешние ссылки

Виральзон : Бокапарвовирус
[1] ICTV 2018 Bocaparvirus ]

[ICTV2019-1] Cotmoore, SF; Agbandje-McKenna, M; Canati, M; Чиорини, JA; EIS-Hunderger, A; Хьюз, J; Mietzsch, M; Modha, S; Оглиастро, м; Pénzes, JJ; Pintel, DJ; Qiu, j; Soderlund-Venermo, M; Tatterersall, P; Tijssen, P; и консорциум отчета ICTV (2019). "Профиль таксономии вируса ICTV: Parvoviridae " Журнал общей вирусологии 100 (3): 367–3 Doi : 10.1099/ jgv.0.0 6537627PMC 30672729PMID

[ICTV2018-2] «10 -й отчет ICTV (2018)» .

[ictv-3] Jump up to: ^а ^{беременный} «Таксономия вируса: выпуск 2020 года» . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV). Март 2021 г. Получено 10 мая 2021 года .

[ViralZone-4] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в «Вирусная зона» . Расширение . Получено 12 июня 2015 года .

[Manteufel2011-5] Manteufel, Jill; Truyen, Uwe (2008). «Бокавирусы животных: краткий обзор». Интервенция . 51 (5): 328–334. doi : 10.1159/000173734 . PMID 19023216 . S2CID 1399470 .

[Qu2008-6] Qu, xiao-wang; бокавируса А2 . уникальной подобная - Фосфолипаза » активность человека области

[7] Котмор С.Ф., МакКенна М.А., Чиорини Дж.А., Сборник Д., Муха Д.В., Пинтел Д.Дж., Цю Дж., Венермо М.С., Таттерсолл П., Тиджссен П (19 июля 2013 г.). «Рационализация и расширение таксономии семьи Parvoviridae» (PDF) . Международный комитет по таксономии вирусов . ICTV . Получено 1 сентября 2020 года . ^{[ мертвая ссылка ]}

[Ao2017-8] Оо, юаньня; Ли, Xiaoue; Ли, Лили; Се, Сяолу; Gen, Dong; Ты, Джамай; Лу, Шан; Дуан, Чжаоджун (2017). «Две новые спецификации Bocaparvirus идентифицированы в диких гималайских суроках» . Наука Чин наук о жизни . 60 (12): 1348–1356. doi : 10.1007/s11427-017-9231-4 . PMC 7089499 . PMID 29218438 .

[Dudleenamjil2010-9] Dudleenamjil, E; Лин, C.-Y; Dredge, D; Мюррей Б. К; Робисон Р. А; Джонсон, Ф. Б. (2010). «Корпус Парвовируса использует клатрин-опосредованный эндоцитоз для ввода клеток» . Журнал общей вирусологии . 91 (12): 3032–3041. doi : 10.1099/vir.0.024133-0 . PMID 20810750 .

[Sukhu2012-10] Sukhu, L; Фасина, о; Бургер, L; Рай, а; Qiu, j; Pintel, D. J (2012). «Характеристика неинтруктурных белков вируса мельчайшего вируса бокавируса» . Журнал вирусологии . 87 (2): 1098–1104. doi : 10.1128/jvi.02627-12 . PMC 3554049 . PMID 23135724 .

[Allander2005-11] Алландер, т; Тамми М. Т; Эрикссон, м; Бьеркнер, а; Tiveljung-Lindell, A; Андерссон Б. (2005). «Клонирование человеческого парвовируса путем молекулярного скрининга образцов дыхательных путей» . Труды Национальной академии наук . 102 (36): 12891–6. Bibcode : 2005pnas..10212891a . doi : 10.1073/pnas.0504666102 . PMC 1200281 . PMID 16118271 .

[Kainulainen2008-12] Kainulainen, L; Варис, м; Soderlund-Venermo, M; Алландер, т; Хедман, К; Ruuskanen, O (2008). «Гепатит и первичная инфекция бокавируса человека у ребенка с дефицитом Т-клеток» . Журнал клинической микробиологии . 46 (12): 4104–4105. doi : 10.1128/jcm.01288-08 . PMC 2593268 . PMID 18842946 .

[Schildgen2013-13] Шильдген, Верена; Малекки, Моника; Тиллманн, Рамона-Лиза; Брокманн, Майкл; Шильдген, Оливер (2013). «Человеческий бокавирус связан с некоторыми раками легких и колоректального рака и сохраняется в солидных опухолях» . Plos один . 8 (6): E68020. BIBCODE : 2013PLOSO ... 868020S . doi : 10.1371/journal.pone.0068020 . PMC 3694905 . PMID 23826357 .

[Li2012-14] Ли, Яша; Донг, Янминг; Цзян, Джун; Ян, Юнбо; Лю, Кайю; Ли, Йи (2012). «Высокие пленки [sic] инфекции парвовируса человека у пациентов со злокачественными опухолями» . Онкологические письма . 3 (3): 635–640. doi : 10.3892/ol.2012.548 . PMC 3362544 . PMID 22740966 .

[pmid20375175-15] Гурда, Б. Л; Родитель, К. Н; Bladek, h; Sinkovits, R. S; Dimattia, M. A; Rence, c; Кастро, а; МакКенна, R; Олсон, н; Браун, К; Бейкер, Т. С; Agbandje-McKenna, M (2010). «Структура капсида человеческого бокавируса: понимание структурного репертуара Parvoviridae» . Журнал вирусологии . 84 (12): 5880–9. doi : 10.1128/jvi.02719-09 . PMC 2876641 . PMID 20375175 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]