кринивирус

3'-концевой псевдоузел в SPCSV
3'-концевой псевдоузел в SPCSV
	Прогнозируемая вторичная структура 3'-концевого псевдоузла при SPCSV.
Идентификаторы
Рфам	RF01091
Другие данные
РНК Тип	СНГ-рег.
Домен(ы)	кринивирус
PDB Структуры	ПДБе

кринивирус
Классификация вирусов
(без рейтинга):	Вирус
Область :	Рибовирия
Королевство:	Орторнавиры
Тип:	Китриновирикота
Сорт:	Алсувирицетес
Заказ:	Мартелливиралес
Семья:	Клостеровирусиды
Род:	кринивирус
Разновидность
	Посмотреть текст

Кринивирусы , ранее принадлежавшие к группе вирусов инфекционной желтухи салата , представляют собой род вирусов семейства Closteroviridae . ^{[ 1 ]} Они представляют собой линейные одноцепочечные РНК-вирусы с положительным смыслом (и, следовательно, относятся к группе IV ). ^{[ 2 ]} В этом роде 14 видов. ^{[ 1 ]} К заболеваниям, связанным с этим родом, относятся: пожелтение и некроз, особенно поражающие флоэму. ^{[ 1 ]}^{[ 3 ]}

Примеры видов, полные геномы которых были секвенированы и которые в настоящее время отнесены к этому роду, включают вирус хлоротичного каскада сладкого картофеля (SPCSV) и вирус инфекционной желтизны салата (LIYV). ^{[ 4 ]}^{[ 5 ]}

Генетика

которых составляет 7500–19 500 нуклеотидов Вирусы этого рода имеют сегментированные двудольные геномы, общая длина . Их геномы также кодируют белки , не входящие в состав вирионных частиц, а также структурные белки. Универсальная база данных вирусов сообщает, что последовательности их генома вблизи их 3'-концов способны образовывать шпильку, а также полагают, что их 5'-концы могут иметь метилированные кэпы. ^{[ 5 ]} Каждая из молекул вирусной РНК содержит четыре шпильковые структуры и псевдоузел в 3'UTR . Псевдоузел необычен тем, что стебель-петля . внутри петли L1 он содержит небольшую структуру ^{[ 6 ]} у родственного рода Closterovirus эти вторичные структуры играют важную роль в репликации вирусной РНК. Было обнаружено, что ^{[ 7 ]}

Структура

Вирусы рода Crinivirus не имеют оболочки и имеют двудольную нитевидную геометрию. Диаметр около 10-13 нм, длина 700-900 нм. Геномы линейные и двудольные, длиной около 17,6 КБ. ^{[ 1 ]}^{[ 3 ]}

Род	Структура	Симметрия	Капсид	Геномное расположение	Геномная сегментация
кринивирус	Нитчатый		Без конверта	Линейный	Однодольный, двусторонний или трехсторонний.

Жизненный цикл

Репликация вируса цитоплазматическая. Вход в клетку-хозяина достигается путем проникновения в клетку-хозяина. Репликация соответствует модели репликации вируса с положительной многоцепочечной РНК. Транскрипция вируса с положительной цепью РНК - это метод транскрипции. Вирус покидает клетку-хозяина путем перемещения вируса по канальцам. Растения служат естественным хозяином. Вирус передается через переносчика (bemisia tabaci). Путь передачи механический. ^{[ 1 ]}^{[ 3 ]}

Род	Сведения о хосте	Тканевой тропизм	Детали входа	Подробности выпуска	Сайт репликации	Монтажный участок	Передача инфекции
кринивирус	Растения	Никто	Вирусное движение; механическая инокуляция	Вирусное движение	Цитоплазма	Цитоплазма	Механическая инокуляция: насекомые (белокрылка)

Таксономия

К роду отнесены следующие виды: ^{[ 8 ]}

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и «Отчет ICTV о Closteroviridae» .
^ Управление ICTVdB (2006). 00.017.0.02. Кринивирус. В: ICTVdB — Универсальная база данных вирусов, версия 4. Бюхен-Осмонд, К. (ред.), Колумбийский университет, Нью-Йорк, США.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с «Вирусная зона» . ЭксПАСи . Проверено 15 июня 2015 г.
^ Журнал вирусологии. сентябрь 2002 г.; 76(18): 9260–9270
^ Перейти обратно: ^а ^б Управление ICTVdB (2006)
^ Ливиератос И.С., Элиаско Э., Мюллер Г. и др. (июль 2004 г.). «Анализ РНК вируса желтой вены картофеля: доказательства трехчастного генома и консервативных 3'-концевых структур среди представителей рода Crinivirus» . Дж. Генерал Вирол . 85 (Часть 7): 2065–75. дои : 10.1099/vir.0.79910-0 . hdl : 1887/3629824 . ПМИД 15218192 .
^ Сатьянараяна Т., Гауда С., Айллон М.А., Альбиах-Марти М.Р., Доусон В.О. (август 2002 г.). «Мутационный анализ сигналов репликации в 3'-нетранслируемой области вируса цитрусовой тристезы» . Вирусология . 300 (1): 140–52. дои : 10.1006/виро.2002.1550 . ПМИД 12202214 .
^ «Таксономия вирусов: выпуск 2020 г.» . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV). Март 2021 года . Проверено 14 мая 2021 г.

Внешние ссылки

[ICTVReport-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и «Отчет ICTV о Closteroviridae» .

[2] Управление ICTVdB (2006). 00.017.0.02. Кринивирус. В: ICTVdB — Универсальная база данных вирусов, версия 4. Бюхен-Осмонд, К. (ред.), Колумбийский университет, Нью-Йорк, США.

[ViralZone-3] Перейти обратно: ^а ^б ^с «Вирусная зона» . ЭксПАСи . Проверено 15 июня 2015 г.

[4] Журнал вирусологии. сентябрь 2002 г.; 76(18): 9260–9270

[ICTVdB_Management_2006-5] Перейти обратно: ^а ^б Управление ICTVdB (2006)

[pmid15218192-6] Ливиератос И.С., Элиаско Э., Мюллер Г. и др. (июль 2004 г.). «Анализ РНК вируса желтой вены картофеля: доказательства трехчастного генома и консервативных 3'-концевых структур среди представителей рода Crinivirus» . Дж. Генерал Вирол . 85 (Часть 7): 2065–75. дои : 10.1099/vir.0.79910-0 . hdl : 1887/3629824 . ПМИД 15218192 .

[pmid12202214-7] Сатьянараяна Т., Гауда С., Айллон М.А., Альбиах-Марти М.Р., Доусон В.О. (август 2002 г.). «Мутационный анализ сигналов репликации в 3'-нетранслируемой области вируса цитрусовой тристезы» . Вирусология . 300 (1): 140–52. дои : 10.1006/виро.2002.1550 . ПМИД 12202214 .

[8] «Таксономия вирусов: выпуск 2020 г.» . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV). Март 2021 года . Проверено 14 мая 2021 г.

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]