Каспаза 6

CASP6
Доступные структуры
PDB	Поиск ортолога: PDBE RCSB
showСписок кодов идентификаторов PDB
	2WDP, 3K7E, 3NKF, 3NR2, 3OD5, 3P45, 3P4U, 3QNW, 3S70, 3S8E, 3V6L, 3V6M, 4EJF, 4FXO, 4HVA, 4IYR, 4N5D, 4N6G, 4N7J, 4N7M, 4NBK, 4NBL, 4NBN
Идентификаторы
Псевдонимы	CASP6 , MCH2, каспаза 6, CSP-6
Внешние идентификаторы	Омим : 601532 ; MGI : 1312921 ; Гомологен : 37455 ; GeneCards : CASP6 ; OMA : CASP6 - Ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 4 (human)
End	109,703,583 bp
showМестоположение гена ( мышь )
Chr.	Chromosome 3 (mouse)
End	129,707,752 bp
showРНК -паттерн экспрессии
	Top expressed in
	rectum; ; mucosa of transverse colon; ; oocyte; ; secondary oocyte; ; jejunal mucosa; ; duodenum; ; pancreatic ductal cell; ; mucosa of sigmoid colon; ; buccal mucosa cell; ; islet of Langerhans;
	Top expressed in
	gastric mucosa; ; epithelium of stomach; ; mucous cell of stomach; ; pyloric antrum; ; duodenum; ; jejunum; ; endocardial cushion; ; migratory enteric neural crest cell; ; yolk sac; ; parotid gland;
	More reference expression data
	; ;
	More reference expression data
showДжин Онтология
Molecular function	peptidase activity; cysteine-type endopeptidase activity; cysteine-type peptidase activity; endopeptidase activity; protein binding; hydrolase activity; identical protein binding; cysteine-type endopeptidase activity involved in execution phase of apoptosis; cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process;
Cellular component	cytosol; nucleoplasm; cytoplasm;
Biological process	epithelial cell differentiation; proteolysis; apoptotic process; regulation of apoptotic process; execution phase of apoptosis; cellular response to staurosporine;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	839
	12368
	ENSG00000138794
	Ensmusg00000000009997
	P55212
	O08738
	NM_001226 ; NM_032992
	NM_009811
	NP_001217 ; NP_116787
	NP_033941
	Викидид
Посмотреть/редактировать человека	Посмотреть/редактировать мышь

Каспаза-6 -это фермент , который у людей кодируется CASP6 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]} CASP6 Ортологи ^{[ 7 ]} были идентифицированы у многочисленных млекопитающих , для которых доступны полные данные генома. Уникальные ортологи также присутствуют у птиц , ящериц , лиссамбийцев и телеостов . Каспаза-6 имеет известные функции в апоптозе , ^{[ 8 ]} Ранний иммунный ответ ^{[ 9 ]}^{[ 10 ]} и нейродегенерация при болезни Хантингтона и Альцгеймера . ^{[ 11 ]}

Функция

который является членом цистеиновой семейства протеазы кислоты Этот ген кодирует белок , ( каспазы ). Последовательная активация каспаз играет центральную роль в фазе выполнения клеточного апоптоза . ^{[ 8 ]} Каспазы существуют в виде неактивных проферментов , которые подвергаются протеолитической обработке в консервативных аспартических остатках, чтобы получить две субъединицы, большие и малые, которые димеризуются с образованием активного фермента. Этот белок обрабатывается каспазами 7 , 8 и 10 , и, как полагают, функционирует как нижестоящий фермент в каскаде активации каспазы. Каспаза 6 также может подвергаться самопроцессы без других членов семейства каспаз. ^{[ 12 ]} Альтернативный сплайсинг этого гена приводит к двум вариантам транскрипта, которые кодируют разные изоформы. ^{[ 13 ]}

Каспаза-6 играет роль в раннем иммунном ответе посредством депрессии. Это уменьшает экспрессию иммунодепрессанта цитокина интерлейкина-10 ^{[ 9 ]} и расщепляет макрофаг, подавляющий IRAK-M . ^{[ 10 ]}

Что касается нейродегенерации , каспаза-6 расщепляет HTT в Хантингтоне и приложении при болезни Альцгеймера . В результате обоих случаев в агрегации белка фрагментов. ^{[ 11 ]}

Взаимодействия

Было показано, что каспаза 6 взаимодействует с каспазой 8 . ^{[ 14 ]}^{[ 15 ]}^{[ 16 ]}

Смотрите также

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000138794 - ENSEMBL , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000027997 - Ensembl , май 2017 г.
^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ Место Паллавичини А, Муруро CPP32, MCH2 и ICH-1 Biophy Biophhys Res Communic 225 (3) (3): 983–9. doi : 10.1006/до н.э. HDL : 11577/2461073 . PMID 8780721 .
^ Fernandes-Alnemri T, Litwack G, Alnemri ES (август 1995). «MCH2, новый член апоптотического семейства генов CED-3/ICE цистеина». Рак . 55 (13): 2737–42. PMID 7796396 .
^ «Ортомам филогенетический маркер: кодирующая последовательность CASP6» . Архивировано с оригинала 2016-03-03 . Получено 2009-12-20 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Коэн, Джеральд М. (1997-08-15). «Каспазы: палачи апоптоза» . Биохимический журнал . 326 (1): 1–16. doi : 10.1042/bj3260001 . ISSN 0264-6021 . PMC 1218630 . PMID 9337844 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Бартель, Александр; Гелер, Андре; Хопф, Верена; Брейтбах, Катрин (2017-07-07). «Каспаза-6 опосредует устойчивость к инфекции псевдомаллеи Burkholderia и влияет на экспрессию вредных цитокинов» . Plos один . 12 (7): E0180203. BIBCODE : 2017PLOSO..1280203B . doi : 10.1371/journal.pone.0180203 . ISSN 1932-6203 . PMC 5501493 . PMID 28686630 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Кобаяши, Хироши; Нолан, Анна; Навид, Бушра; Хошино, Йошихико; Сегал, Леопольдо Н.; Фудзита, Йоко; Рим, Уильям Н.; Вейден, Майкл Д. (2011-01-01). «Нейтрофилы активируют альвеолярные макрофаги путем продуцирования каспазы-6-опосредованного расщепления рецепторной киназы, ассоциированной с IL-1» . Журнал иммунологии . 186 (1): 403–410. doi : 10.4049/jimmunol.1001906 . ISSN 0022-1767 . PMC 3151149 . PMID 21098228 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Грэм, Рона К.; Ehrnhoefer, Dagmar E.; Хейден, Майкл Р. (2011-12-01). «Каспаза-6 и нейродегенерация» . Тенденции в нейронауках . 34 (12): 646–656. doi : 10.1016/j.tins.2011.09.001 . ISSN 0166-2236 . PMID 22018804 . S2CID 1603684 .
^ Wang XJ, Cao Q, Liu X, Wang KT, Mi W, Zhang Y, Li LF, Leblanc AC, Su XD (ноябрь 2010). «Кристаллические структуры человеческой каспазы 6 выявляют новый механизм внутримолекулярной самоактивации расщепления» . Embo Rep . 11 (11): 841–7. doi : 10.1038/inbors.2010.141 . PMC 2966951 . PMID 20890311 .
^ «Ген Entrez: CASP6 каспаза 6, связанная с апоптозом цистеин пептидазу» .
^ Cowling V, Downward J (октябрь 2002 г.). «Каспаза-6 является прямым активатором каспазы-8 в цитохромом C-индуцированном пути апоптоза: абсолютная потребность в удалении продомен каспазы-6» . Клеточная гибель отличается . 9 (10): 1046–56. doi : 10.1038/sj.cdd.4401065 . PMID 12232792 .
^ Guo Y, Srinivasula SM, Druilhe A, Fernandes-Alnemri T, Alnemri ES (апрель 2002 г.). «Каспаза-2 индуцирует апоптоз, высвобождая проапоптотические белки из митохондрий» . Дж. Биол. Химический 277 (16): 13430–7. doi : 10.1074/jbc.m108029200 . PMID 11832478 .
^ Сринивасула С.М., Ахмад М., Фернандес-Альнемри Т., Литвак Г., Алнемри Е.С. (декабрь 1996). «Молекулярное упорядочение FAS-апоптотического пути: протеаза Fas/Apo-1 MCH5 представляет собой протеазу, ингибируемую CRMA, которая активирует множественные протеазы цистеина CED-3/льда» . Прокурор Нат. Академический Наука США 93 (25): 14486–91. Bibcode : 1996pnas ... 9314486S . doi : 10.1073/pnas.93.25.14486 . PMC 26159 . PMID 8962078 .

Дальнейшее чтение

Фернандес-Альнемри Т., Литвак Г., Алнемри Э.С. (1995). «CPP32, новый апоптотический белок человека с гомологией с белком белка клеточной гибели клеток CED-3 и интерлейкина-1 млекопитающего и межклевина-межклевина-1» . Дж. Биол. Химический 269 (49): 30761–4. doi : 10.1016/s0021-9258 (18) 47344-9 . PMID 7983002 .
Такахаши А., Алнемри Э.С., Лазебник Я.А., Фернандес-Альнемри Т., Литвак Г., Моир Р.Д., Голдман Р.Д., Пуарье Г.Г., Кауфманн Ш, Эрншоу В.К. (1996). «Расщепление ламина A от Alpha MCH2, но не CPP32: множественные протеазы, связанные с бета-конвертирующим ферментом, с различными свойствами распознавания субстрата активны при апоптозе» . Прокурор Нат. Академический Наука США . 93 (16): 8395–400. Bibcode : 1996pnas ... 93.8395t . doi : 10.1073/pnas.93.16.8395 . PMC 38682 . PMID 8710882 .
Буллрих Ф., Фернандес-Альнемри Т., Литвак Г., Алнемри Э.С., Кроче С.М. (1997). «Хромосомное картирование протеаз гибели клеток CPP32, MCH2 и MCH3». Геномика . 36 (2): 362–5. doi : 10.1006/geno.1996.0476 . PMID 8812467 .
Srinivasula SM, Fernandes-Alnemri T, Zangrilli J, Robertson N, Armstrong RC, Wang L, Trapani JA, Tomaselli KJ, Littack G, Alnemri ES (1996). «CED-3/Interleukkin 1beta, преобразующий фермент, похожий на фермент гомолог MCH6 и фермент, расщепляющий ламин MCH2ALPHA, являются субстратами для апоптотического медиатора CPP32» . Дж. Биол. Химический 271 (43): 27099–106. doi : 10.1074/jbc.271.43.27099 . PMID 8900201 .
Сринивасула С.М., Ахмад М., Фернандес-Альнемри Т., Литвак Г., Алнемри Е.С. (1997). «Молекулярное упорядочение FAS-апоптотического пути: протеаза Fas/Apo-1 MCH5 представляет собой протеазу, ингибируемую CRMA, которая активирует множественные протеазы цистеина CED-3/льда» . Прокурор Нат. Академический Наука США . 93 (25): 14486–91. Bibcode : 1996pnas ... 9314486S . doi : 10.1073/pnas.93.25.14486 . PMC 26159 . PMID 8962078 .
Rao L, Perez D, White E (1997). «Протеолиз ламина облегчает ядерные события во время апоптоза» . J. Cell Biol . 135 (6 пт 1): 1441–55. doi : 10.1083/jcb.135.6.1441 . PMC 2133948 . PMID 8978814 .
Ким Т.В., Петтингелл В.Х., Юнг Юк, Ковач Д.М., Танзи Р.Е. (1998). «Альтернативное расщепление пресенлинов, связанных с болезнью Альцгеймера во время апоптоза с помощью семейства каспазы-3». Наука . 277 (5324): 373–6. Citeseerx 10.1.1.1025.8052 . doi : 10.1126/science.277.5324.373 . PMID 9219695 .
Сринивасула С.М., Ахмад М., Оттили С., Буллрих Ф., Бэнкс С., Ван Й., Фернандес-Альнемри Т., Кроче С.М., Литвак Г., Томаселли К.Дж., Армстронг Р.К., Алнемри Э.С. (1997). «Flame-1, новая FADD-подобная антиапоптотическая молекула, которая регулирует FAS/TNFR1-индуцированный апоптоз» . Дж. Биол. Химический 272 (30): 18542–5. doi : 10.1074/jbc.272.30.18542 . PMID 9228018 .
Caulín C, Salvesen GS, Oshima RG (1997). «Каспаза расщепление кератина 18 и реорганизация промежуточных филаментов во время апоптоза эпителиальных клеток» . J. Cell Biol . 138 (6): 1379–94. doi : 10.1083/jcb.138.6.1379 . PMC 2132555 . PMID 9298992 .
Хирата Х, Такахаши А., Кобаяши С., Йонехара С., Савай Х, Оказаки Т., Ямамото К., Сасада М. (1998). «Каспазы активируются в разветвленном каскаде протеазы и контролируют отдельные нижестоящие процессы при Fas-индуцированном апоптозе» . J. Exp. Медик 187 (4): 587–600. doi : 10.1084/jem.187.4.587 . PMC 2212161 . PMID 9463409 .
Харви К.Ф., Харви Н.Л., Майкл Дж. М., Парасивам Г., Уотерхаус Н., Алнемри Э.С., Уоттерс Д., Кумар С. (1998). «Опосредованное каспазой расщепление убиквитин-белковой лигазы NEDD4 во время апоптоза» . Дж. Биол. Химический 273 (22): 13524–30. doi : 10.1074/jbc.273.22.13524 . PMID 9593687 .
Utz PJ, Hottelet M, Le TM, Kim SJ, Geiger ME, Van Venrooij WJ, Anderson P (1999). «Компонент 72 кДа частицы распознавания сигнала расщепляется во время апоптоза» . Дж. Биол. Химический 273 (52): 35362–70. doi : 10.1074/jbc.273.52.35362 . PMID 9857079 .
Самима К., Свинген П.А., Баси Г.С., Котке Т., Меснер П.В., Стюарт Л., Дуррие Ф., Пуарье Г.Г., Алнемри Э.С., Чампукс Дж.Дж., Кауфманн Ш., Эрншоу В.К. (1999). «Опосредованное каспазой расщепление ДНК топоизомеразы I в нетрадиционных участках во время апоптоза» . Дж. Биол. Химический 274 (7): 4335–40. doi : 10.1074/jbc.274.7.4335 . PMID 9933635 .
Walter J, Schindzielorz A, Grünberg J, Haass C (1999). «Фосфорилирование пресенилина-2 регулирует его расщепление каспазами и замедляет прогрессирование апоптоза» . Прокурор Нат. Академический Наука США . 96 (4): 1391–6. Bibcode : 1999pnas ... 96.1391W . doi : 10.1073/pnas.96.4.1391 . PMC 15473 . PMID 9990034 .
из Craen M, Jongghe C, Brange I, Declercq W, от греков G, из ручьев W, Vandean I, Fiers W, из Broeckhen C, Hendriks L, Vaderks P (1999). «Идентификация или CASPASSES CLEVE PRESENNIIN-1 и презеннин-2. Пять мутаций презенниина-1 (PS1) не всегда делают чувствительность или PS1 к CASPASS» (PDF) . Фебс пусть . 445 (1): 149–54. doi : 10,1016/s0014-5793 (999) 0010108-8 . HDL : 10067/23804015162165141 . PMID 10069390 . S2CID 31218178 .
Xanthoudakis S, Roy S, Rasper D, Hennessey T, Aubin Y, Cassady R, Tawa P, Ruel R, Rosen A, Nicholson DW (1999). «HSP60 ускоряет созревание прокаспазы-3 протеазами активатора вверх по течению во время апоптоза» . Embo j . 18 (8): 2049–56. doi : 10.1093/emboj/18.8.2049 . PMC 1171289 . PMID 10205159 .

Внешние ссылки

Онлайн- база данных Merops для пептидаз и их ингибиторов: C14.005 Архивировал 2008-02-05 на машине Wayback
Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для Uniprot : P55212 (человеческая каспаза-6) в PDBE-KB .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000138794 - ENSEMBL , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000027997 - Ensembl , май 2017 г.

[3] «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[4] «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[pmid8780721-5] Место Паллавичини А, Муруро CPP32, MCH2 и ICH-1 Biophy Biophhys Res Communic 225 (3) (3): 983–9. doi : 10.1006/до н.э. HDL : 11577/2461073 . PMID 8780721 .

[pmid7796396-6] Fernandes-Alnemri T, Litwack G, Alnemri ES (август 1995). «MCH2, новый член апоптотического семейства генов CED-3/ICE цистеина». Рак . 55 (13): 2737–42. PMID 7796396 .

[OrthoMaM-7] «Ортомам филогенетический маркер: кодирующая последовательность CASP6» . Архивировано с оригинала 2016-03-03 . Получено 2009-12-20 .

[:0-8] Jump up to: ^а ^{беременный} Коэн, Джеральд М. (1997-08-15). «Каспазы: палачи апоптоза» . Биохимический журнал . 326 (1): 1–16. doi : 10.1042/bj3260001 . ISSN 0264-6021 . PMC 1218630 . PMID 9337844 .

[:1-9] Jump up to: ^а ^{беременный} Бартель, Александр; Гелер, Андре; Хопф, Верена; Брейтбах, Катрин (2017-07-07). «Каспаза-6 опосредует устойчивость к инфекции псевдомаллеи Burkholderia и влияет на экспрессию вредных цитокинов» . Plos один . 12 (7): E0180203. BIBCODE : 2017PLOSO..1280203B . doi : 10.1371/journal.pone.0180203 . ISSN 1932-6203 . PMC 5501493 . PMID 28686630 .

[:2-10] Jump up to: ^а ^{беременный} Кобаяши, Хироши; Нолан, Анна; Навид, Бушра; Хошино, Йошихико; Сегал, Леопольдо Н.; Фудзита, Йоко; Рим, Уильям Н.; Вейден, Майкл Д. (2011-01-01). «Нейтрофилы активируют альвеолярные макрофаги путем продуцирования каспазы-6-опосредованного расщепления рецепторной киназы, ассоциированной с IL-1» . Журнал иммунологии . 186 (1): 403–410. doi : 10.4049/jimmunol.1001906 . ISSN 0022-1767 . PMC 3151149 . PMID 21098228 .

[:3-11] Jump up to: ^а ^{беременный} Грэм, Рона К.; Ehrnhoefer, Dagmar E.; Хейден, Майкл Р. (2011-12-01). «Каспаза-6 и нейродегенерация» . Тенденции в нейронауках . 34 (12): 646–656. doi : 10.1016/j.tins.2011.09.001 . ISSN 0166-2236 . PMID 22018804 . S2CID 1603684 .

[pmid20890311-12] Wang XJ, Cao Q, Liu X, Wang KT, Mi W, Zhang Y, Li LF, Leblanc AC, Su XD (ноябрь 2010). «Кристаллические структуры человеческой каспазы 6 выявляют новый механизм внутримолекулярной самоактивации расщепления» . Embo Rep . 11 (11): 841–7. doi : 10.1038/inbors.2010.141 . PMC 2966951 . PMID 20890311 .

[13] «Ген Entrez: CASP6 каспаза 6, связанная с апоптозом цистеин пептидазу» .

[pmid12232792-14] Cowling V, Downward J (октябрь 2002 г.). «Каспаза-6 является прямым активатором каспазы-8 в цитохромом C-индуцированном пути апоптоза: абсолютная потребность в удалении продомен каспазы-6» . Клеточная гибель отличается . 9 (10): 1046–56. doi : 10.1038/sj.cdd.4401065 . PMID 12232792 .

[pmid11832478-15] Guo Y, Srinivasula SM, Druilhe A, Fernandes-Alnemri T, Alnemri ES (апрель 2002 г.). «Каспаза-2 индуцирует апоптоз, высвобождая проапоптотические белки из митохондрий» . Дж. Биол. Химический 277 (16): 13430–7. doi : 10.1074/jbc.m108029200 . PMID 11832478 .

[pmid8962078-16] Сринивасула С.М., Ахмад М., Фернандес-Альнемри Т., Литвак Г., Алнемри Е.С. (декабрь 1996). «Молекулярное упорядочение FAS-апоптотического пути: протеаза Fas/Apo-1 MCH5 представляет собой протеазу, ингибируемую CRMA, которая активирует множественные протеазы цистеина CED-3/льда» . Прокурор Нат. Академический Наука США 93 (25): 14486–91. Bibcode : 1996pnas ... 9314486S . doi : 10.1073/pnas.93.25.14486 . PMC 26159 . PMID 8962078 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]

[ 16 ]

v Т и Протеазы : протеазы цистеина ( EC 3.4.22 )
Caspase	Caspase 1 Caspase 2 Caspase 3 Caspase 4 Caspase 5 Caspase 6 Caspase 7 Caspase 8 Caspase 9 Caspase 10 Caspase 12 Caspase 13 Caspase 14
Fruit-derived	Papain Ficain Bromelain Actinidain
Calpain	CAPN1 CAPN2 CAPN3 CAPN5 CAPN6 CAPN7 CAPN8 CAPN9 CAPN10 CAPN11 CAPN12 CAPN13 CAPN14 CAPNS1 CAPNS2
Cathepsin	B C F H K L1/L2 O S W Z
Other	Clostripain Cancer procoagulant Separase Autophagin Cruzipain 3C-like protease Gingipain R Gingipain K

v Т и Ферменты
Activity	Active site Binding site Catalytic triad Oxyanion hole Enzyme promiscuity Diffusion-limited enzyme Cofactor Enzyme catalysis
Regulation	Allosteric regulation Cooperativity Enzyme inhibitor Enzyme activator
Classification	EC number Enzyme superfamily Enzyme family List of enzymes
Kinetics	Enzyme kinetics Eadie–Hofstee diagram Hanes–Woolf plot Lineweaver–Burk plot Michaelis–Menten kinetics
Types	EC1 Oxidoreductases (list) EC2 Transferases (list) EC3 Hydrolases (list) EC4 Lyases (list) EC5 Isomerases (list) EC6 Ligases (list) EC7 Translocases (list)