Академический

Академический
Доступные структуры
PDB	Поиск ортолога: PDBE RCSB
showСписок кодов идентификаторов PDB
	2UXW, 3B96
Идентификаторы
Псевдонимы	Acadvl , ацил-коадегидрогеназа, очень длинная цепь, Acad6, LCACD, VLCAD, ацил-коадегидрогеназа очень длинная цепь
Внешние идентификаторы	Омим : 609575 ; MGI : 895149 ; Гомологен : 5 ; Genecards : Acadvl ; OMA : Acadvl - ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 17 (human)
End	7,225,266 bp
showМестоположение гена ( мышь )
Chr.	Chromosome 11 (mouse)
End	69,906,237 bp
showРНК -паттерн экспрессии
	Top expressed in
	right adrenal cortex; ; apex of heart; ; left adrenal cortex; ; anterior pituitary; ; right lobe of liver; ; right hemisphere of cerebellum; ; left lobe of thyroid gland; ; right lobe of thyroid gland; ; left ventricle; ; mucosa of transverse colon;
	Top expressed in
	myocardium of ventricle; ; right ventricle; ; cardiac muscles; ; extraocular muscle; ; digastric muscle; ; soleus muscle; ; intercostal muscle; ; sternocleidomastoid muscle; ; masseter muscle; ; thoracic diaphragm;
	More reference expression data
	n/a
showДжин Онтология
Molecular function	oxidoreductase activity, acting on the CH-CH group of donors; acyl-CoA dehydrogenase activity; oxidoreductase activity; flavin adenine dinucleotide binding; long-chain-acyl-CoA dehydrogenase activity; fatty-acyl-CoA binding; very-long-chain-acyl-CoA dehydrogenase activity;
Cellular component	membrane; mitochondrial matrix; nucleolus; mitochondrion; mitochondrial inner membrane; mitochondrial nucleoid; nucleus; cytosol; mitochondrial membranes;
Biological process	epithelial cell differentiation; negative regulation of fatty acid biosynthetic process; lipid metabolism; negative regulation of fatty acid oxidation; energy derivation by oxidation of organic compounds; fatty acid metabolic process; regulation of cholesterol metabolic process; IRE1-mediated unfolded protein response; fatty acid beta-oxidation; temperature homeostasis; fatty acid catabolic process; response to cold; fatty acid beta-oxidation using acyl-CoA dehydrogenase;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	37
	11370
	ENSG00000072778
	Ensmusg00000018574
	P49748
	P50544
	NM_000018 ; NM_001033859 ; NM_001270447 ; NM_001270448
	NM_017366
	NP_000009 ; NP_001029031 ; NP_001257376 ; NP_001257377
	NP_059062
	Викидид
Посмотреть/редактировать человека	Посмотреть/редактировать мышь

Очень длинная цепочка, специфичная ацил-коа-дегидрогеназа, митохондриальная (VLCAD)-это фермент, который у людей кодируется AcadVL геном .

Мутации в AcadVL связаны с очень длинным цепным ацил-коферментом дегидрогеназы . Белок , кодируемый этим геном, нацелен на внутреннюю митохондриальную мембрану , где он катализирует первую стадию пути бета-окисления митохондриальных жирных кислот . Этот ацил-кофермент А. Дегидрогеназа специфична для жирных кислот с длинной цепью и очень длинной цепью . Дефицит в этом генном продукте снижает бета-окисление мирокардиальных жирных кислот и связан с кардиомиопатией . Альтернативный сплайсинг приводит к множеству вариантов транскрипта, кодирующих различные изоформы. ^{[ 5 ]}

Структура

Ген AcadVL содержит 20 экзонов , ^{[ 6 ]} и длиной около 5,4 кб. ^{[ 7 ]} VLCAD имеет интересную структуру генов у людей, в которой расположена в структуре головы с геном DLG4 на хромосоме 17 , и что транскрибированные области этих генов перекрываются. Было показано, что лечение DEHP приводит к повышению регуляции минимальным промотором. ^{[ 8 ]} В то время как DLG4 и VLCAD имеют общие регуляторные элементы, у каждого из них есть отдельные и различные тканевые специфические элементы, которые выполняют их функцию. У мышей эти два гена находятся в стороне, но они не перекрываются. ^{[ 7 ]}

Функция

Фермент VLCAD катализирует большую часть бета-окисления жирных кислот, образуя транс - двойную связь C2-C3 в жирных кислотах. VLCAD специфичен для очень длинных цепных жирных кислот, обычно C16- ацил-КоА и дольше. ^{[ 9 ]} У мышей, имеющих дефицит VLCAD, в печени практически нет гиперацетилирования белка; Это подразумевает, что белок VLCAD также необходим для ацетилирования белка в этой биологической системе. ^{[ 10 ]}

Клиническое значение

AcadVL связан с очень длинным цепью ацил-кофермента дегидрогеназы (VLCADD), который имеет много симптомов и обычно представляет собой один из трех фенотипов . Первый тяжелый, с началом раннего детства и высоким уровнем смертности; Наиболее распространенным симптомом является кардиомиопатия . Второе - это поздняя форма детства, с более мягкими симптомами, которые чаще всего присутствуют в виде гипокетотической гипогликемии. Последняя форма представляет собой во взрослом возрасте и представляет собой изолированное участие скелетных мышц, рабдомиолиз и миоглобинурию , что запускается упражнениями или голоданием. ^{[ 11 ]} Заболевание обычно диагностируется с помощью сначала выполняя тандемную масс -спектрометрию на образце крови пациента в течение периода стресса, а затем проведя молекулярное генетическое тестирование для наличия гена AcadVL. Дефицит лечится систематически, но определенные условия, такие как пост , раздражение миокарда, обезвоживание и диеты с высоким содержанием жира, избегаются в попытке предотвратить вторичные осложнения. ^{[ 12 ]}

Взаимодействия

Было показано, что AcadVL имеет 75 бинарных белковых взаимодействий, включая 73 совместного взаимодействия. AcadVL, по -видимому, взаимодействует с RPSA и GPHN . ^{[ 13 ]}

Смотрите также

Ацил -коадегидрогеназа

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000072778 - ENSEMBL , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000018574 - Ensembl , май 2017 г.
^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «Ацил-коадегидрогеназа, очень длинная цепь» .
^ Strauss AW, Powell CK, Hale DE, Anderson MM, Ahuja A, Brackett JC, Sims HF (ноябрь 1995). «Молекулярная основа митохондриального человеческого митохондриального дефицита ацил-коадегидрогеназы, вызывая кардиомиопатию и внезапную смерть в детстве» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 92 (23): 10496–500. Bibcode : 1995pnas ... 9210496S . doi : 10.1073/pnas.92.23.10496 . PMC 40638 . PMID 7479827 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Zhou C, Blumberg B (февраль 2003 г.). «Перекрывающаяся генная структура человеческого VLCAD и DLG4». Ген . 305 (2): 161–6. doi : 10.1016/s0378-1119 (02) 01235-0 . PMID 12609736 .
^ Zhang LF, Ding JH, Yang Bz, He GC, Roe C (декабрь 2003 г.). «Характеристика двунаправленной области промотора между человеческими генами, кодирующими VLCAD и PSD-95». Геномика . 82 (6): 660–8. doi : 10.1016/s0888-7543 (03) 00211-8 . PMID 14611808 .
^ Aoyama T, Souri M, Ushikubo S, Kamijo T, Yamaguchi S, Kelley Ri, Rhead WJ, Uetake K, Tanaka K, Hashimoto T (Jun 1995). «Очистка очень длинной цепь человека, ацил-кофермента, дегидрогеназа, и характеристика его дефицита у семи пациентов» . Журнал клинических исследований . 95 (6): 2465–73. doi : 10.1172/jci117947 . PMC 295925 . PMID 7769092 .
^ Pougenkina O, Ofman R, из Cruachen AG, Kuk W, Wonders RJ, Holden SM, The Board VC (JU 2014). «Ацетилирование протеза с протезами протекала обусловлена ацетил-КоА из окисления жирных кислот» . Молекулярная генетика человека . 23 (13): 3513–22. doi : 10,1093/hmg/ddu059 . PMID 24516071 .
^ Andresen BS, Olpin S, Poorthuis BJ, Scholte HR, Vianey-Saban C, Wanders R, Ijlst L, Morris A, Pourfarzam M, Bartlett K, Baumgartner ER, deKlerk JB, Schroeder LD, Corydon TJ, Lund H, Winter V, Bross P, Bolund L, Gregersen N (февраль 1999 г.). «Четкая корреляция генотипа с фенотипом заболевания в очень длинной цепей дефицит ацил-коадегидрогеназы» . Американский журнал человеческой генетики . 64 (2): 479–94. doi : 10.1086/302261 . PMC 1377757 . PMID 9973285 .
^ Лесли, ND; Валенсия, Калифорния; Штраус, AW; Чжан, К.; Адам, депутат; Ardinger, HH; Булавка, Ра; Уоллес, SE; Бин LJH; Стивенс, К.; Amemiya, A. (1993). «Очень длинноцепочечный ацил-кофермент дегидрогеназы». PMID 20301763 . {{cite journal}}: CITE Journal требует |journal= ( помощь )
^ «75 двоичных взаимодействий, найденных для поискового термина Acadvl» . База данных интактного молекулярного взаимодействия . Embl-Ebi . Получено 2018-08-24 .

Дальнейшее чтение

Costa CG, Dorland L, De Almeida IT, Jakobs C, Duran M, Poll-The Bt (июнь 1998 г.). «Влияние натощак, длинноцепочечной нагрузки триглицеридов и карнитина на уровни длинноцепочечной ацилкарнитины в плазме в митохондриальной очень длинной цепной дефиците ацил-коа-дегидрогеназы». Журнал наследственного метаболического заболевания . 21 (4): 391–9. doi : 10.1023/a: 1005354624735 . PMID 9700596 . S2CID 2198523 .

Внешние ссылки

Genereviews/ncbi/nih/uw inpitry на очень длинноцепочечном ацил-коферменте а ацил-кофермент а ацил-кофермент дегидрогеназы дефицит
Местоположение генома Human Acadvl и Acadvl страница генов в браузере UCSC Genome .

Эта статья включает в себя текст из Национальной медицины Соединенных Штатов , которая находится в общественном доступе .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000072778 - ENSEMBL , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000018574 - Ensembl , май 2017 г.

[3] «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[4] «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[entrez-5] «Ацил-коадегидрогеназа, очень длинная цепь» .

[6] Strauss AW, Powell CK, Hale DE, Anderson MM, Ahuja A, Brackett JC, Sims HF (ноябрь 1995). «Молекулярная основа митохондриального человеческого митохондриального дефицита ацил-коадегидрогеназы, вызывая кардиомиопатию и внезапную смерть в детстве» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 92 (23): 10496–500. Bibcode : 1995pnas ... 9210496S . doi : 10.1073/pnas.92.23.10496 . PMC 40638 . PMID 7479827 .

[Zhou_2003-7] Jump up to: ^а ^{беременный} Zhou C, Blumberg B (февраль 2003 г.). «Перекрывающаяся генная структура человеческого VLCAD и DLG4». Ген . 305 (2): 161–6. doi : 10.1016/s0378-1119 (02) 01235-0 . PMID 12609736 .

[8] Zhang LF, Ding JH, Yang Bz, He GC, Roe C (декабрь 2003 г.). «Характеристика двунаправленной области промотора между человеческими генами, кодирующими VLCAD и PSD-95». Геномика . 82 (6): 660–8. doi : 10.1016/s0888-7543 (03) 00211-8 . PMID 14611808 .

[9] Aoyama T, Souri M, Ushikubo S, Kamijo T, Yamaguchi S, Kelley Ri, Rhead WJ, Uetake K, Tanaka K, Hashimoto T (Jun 1995). «Очистка очень длинной цепь человека, ацил-кофермента, дегидрогеназа, и характеристика его дефицита у семи пациентов» . Журнал клинических исследований . 95 (6): 2465–73. doi : 10.1172/jci117947 . PMC 295925 . PMID 7769092 .

[10] Pougenkina O, Ofman R, из Cruachen AG, Kuk W, Wonders RJ, Holden SM, The Board VC (JU 2014). «Ацетилирование протеза с протезами протекала обусловлена ацетил-КоА из окисления жирных кислот» . Молекулярная генетика человека . 23 (13): 3513–22. doi : 10,1093/hmg/ddu059 . PMID 24516071 .

[11] Andresen BS, Olpin S, Poorthuis BJ, Scholte HR, Vianey-Saban C, Wanders R, Ijlst L, Morris A, Pourfarzam M, Bartlett K, Baumgartner ER, deKlerk JB, Schroeder LD, Corydon TJ, Lund H, Winter V, Bross P, Bolund L, Gregersen N (февраль 1999 г.). «Четкая корреляция генотипа с фенотипом заболевания в очень длинной цепей дефицит ацил-коадегидрогеназы» . Американский журнал человеческой генетики . 64 (2): 479–94. doi : 10.1086/302261 . PMC 1377757 . PMID 9973285 .

[12] Лесли, ND; Валенсия, Калифорния; Штраус, AW; Чжан, К.; Адам, депутат; Ardinger, HH; Булавка, Ра; Уоллес, SE; Бин LJH; Стивенс, К.; Amemiya, A. (1993). «Очень длинноцепочечный ацил-кофермент дегидрогеназы». PMID 20301763 . {{cite journal}}: CITE Journal требует |journal= ( помощь )

[13] «75 двоичных взаимодействий, найденных для поискового термина Acadvl» . База данных интактного молекулярного взаимодействия . Embl-Ebi . Получено 2018-08-24 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]