Spiraviridae

Альфаспиравирус
Классификация вирусов
(не вмешательство):	Вирус
Семья:	Spiraviridae
Род:	Альфаспиравирус
Разновидность
	Вирус вируса в форме аэропийра ;
Синонимы
	Название вируса ACV Abbr. ; HE681887 GenBank Incession ; NC_043427 Refseq Accession ;

Spiraviridae - это семейство неопределенных вирусов сидений , которые воспроизводят гипертермофильную архею класса самолета , в частности Aeropyrum . ^{[ 1 ]} Семейство содержит один род, Alphaspiravirus , который содержит один вид, вирус в форме аэропировой катушки . ^{[ 2 ]} Вирионы внутри ACV не развиты и в форме полых цилиндров, которые образуются с помощью покрытого волокна, которое состоит из двух переплетенных половинок круглой прядью ДНК капсида . Придаток выступает с каждого конца цилиндрического вириона. Вирусным геномом является ssDNA (+) и кодирует значительно больше генов, чем другие известные вирусы ssDNA. ACV также уникален тем, что, по -видимому, не имеет собственных ферментов, чтобы помочь репликации, вместо этого, вероятно, используя копии клетки хозяина . ACV не имеет никакого известного отношения к каким-либо другим вирусам, инфицирующим археи, но он имеет свою катушку, подобную катушке, с некоторыми другими архейными вирусами, что позволяет предположить, что такие вирусы могут быть древней линией, которая заражает только архей. ^{[ 1 ]}^{[ 3 ]}

Имя

Имена Alpaspira вируса и Spira viridae взяты из латинской спирины для «катушки». ^{[ 4 ]}

Структура

Вирионы ACV не развиты и в форме полых цилиндров приблизительно 230 ± 10 на 19 ± 1 нанометры (нм) в размере. Цилиндрическая форма образуется намотками нуклеопротеиновой нити в виде спиральной пружины. Эта спиральная структура сама образуется двумя переплетчивыми половинками круглой молекулы ssDNA в другой спиральной форме, которая покрыта капсидными белками. Каждый конец цилиндрического вириона имеет придаток около 20 ± 2 нм в длину, выступающий от вириона под углом 45 ° относительно оси вириона. ^{[ 1 ]} Примерно для 80% вирионов придатки выступают от того же лица вириона. ^{[ 3 ]} Вирион гибкий, способен сжиматься и жестко после обезвоживания. Вирионы имеют два основных белка с молекулярными массами около 23 и 18,5 килодальтов (KDA) и несколькими незначительными белками с молекулярными массами 5–13 кДа. ^{[ 1 ]} Приблизительно 40 дисков или поворотов спирали различаются для длины вириона. ^{[ 3 ]} Катушка, подобная морфологии ACV, характерна для некоторых архейных вирусов, не обнаруженных среди бактериальных и эукариотических вирусов. ^{[ 1 ]}

Геном

ACV содержит одну молекулу круглой, одноцепочечной ДНК ((+) ssDNA), которая длиной 24 893 нуклеотидов. GC -контент генома составляет 46,7%. Предполагается, что геном будет иметь 57 открытых кадров считывания (ORF), более 40 кодонов , такие ORF составляют 93,5% генома. Все, кроме одного ORF, имеет такую же направленность , что и прядь ДНК, что указывает на то, что геном является положительным смыслом . Количество прогнозируемых генов намного больше, чем другие известные вирусы ssDNA. которые кодируют предполагаемую трипсиноподобную К ним относятся гены , сериновую протеазу , тирозин -рекомбиназу , два тиоредоксиноподобных белка, белки, участвующие в метаболизме углеводов и ДНК -связывающие белки . ^{[ 1 ]}

Репликация

ACV не кодирует какие -либо идентифицируемые ДНК или РНК -полимеразы , и при этом он не кодирует какие -либо белки, гомологичные для известных белков Rep, используемых наиболее известными вирусами ssDNA в репликации. Таким образом, ACV, вероятно, будет воспроизвести способом, который зависит от повторения хозяина. После репликации вирионы покидают клетку -хозяина без клетки -хозяина, подвергающейся лизису или гибели клеток. ^{[ 1 ]}

Эволюция

ACV не имеет известных отношений с любыми другими вирусами. Тем не менее, некоторые другие архейные вирусы также имеют вирионы в форме спиральной формы, такие как ACV, что может указывать на такую морфологию, является древней формой, которая не представлена среди вирусов, которые заражают эукариоты и другие прокариоты. ^{[ 1 ]}

История

ACV был сначала выделен из образца Pernix Pernix ( A. pernix ), взятого из прибрежного горячего источника Ямагава, где температура может достигать 109 ° C, в Японии в 2010 году. Поскольку A. pernix был единственным организмом, присутствовавшим в культуре, культура Это было признано хозяином ACV. ACV не может быть воспроизведен в других штаммах A. pernix или в Aeropyrum camini оригинальная культура A. pernix . , поэтому для изучения использовалась ^{[ 3 ]} Семейство, род и виды были признаны ICTV в 2013 году. ^{[ 2 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и ^фон ^глин ^час Пранджшвили Д., Мочизуки Т., Крупович М (2020). «Профиль таксономии вируса ICTV: Spiraviridae» . J Gen Virol . 101 (3): 240–241. doi : 10.1099/jgv.0.001385 . PMC 7416610 . PMID 31961791 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} «Таксономия вируса: выпуск 2022 года» . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV) . Март 2023 г. Получено 19 августа 2023 года .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} Мочизуки Т., Крупович М., Пехау-Арнаде Г., Сако Ю., Фортерре П., Прангвишвили Д. (2012). «Архаальный вирус с исключительной архитектурой вириона и крупнейшим одноцепочечным геномом ДНК» . Proc Natl Acad Sci USA . 109 (33): 13386–91. Bibcode : 2012pnas..10913386M . doi : 10.1073/pnas.1203668109 . PMC 3421227 . PMID 22826255 .
^ «Предложение 2013.003a-gb.a.v3.spiraviridae.pdf pdf» (PDF) . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV) . Получено 19 августа 2023 года .

[taxprf-1] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и ^фон ^глин ^час Пранджшвили Д., Мочизуки Т., Крупович М (2020). «Профиль таксономии вируса ICTV: Spiraviridae» . J Gen Virol . 101 (3): 240–241. doi : 10.1099/jgv.0.001385 . PMC 7416610 . PMID 31961791 .

[ICTV-2] Jump up to: ^а ^{беременный} «Таксономия вируса: выпуск 2022 года» . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV) . Март 2023 г. Получено 19 августа 2023 года .

[Mochizuki12-3] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} Мочизуки Т., Крупович М., Пехау-Арнаде Г., Сако Ю., Фортерре П., Прангвишвили Д. (2012). «Архаальный вирус с исключительной архитектурой вириона и крупнейшим одноцепочечным геномом ДНК» . Proc Natl Acad Sci USA . 109 (33): 13386–91. Bibcode : 2012pnas..10913386M . doi : 10.1073/pnas.1203668109 . PMC 3421227 . PMID 22826255 .

[coil-4] «Предложение 2013.003a-gb.a.v3.spiraviridae.pdf pdf» (PDF) . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV) . Получено 19 августа 2023 года .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]