Дезоксинуклеозидкиназа
| дезоксинуклеозидкиназа | |||
|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||
| Номер ЕС. | 2.7.1.145 | ||
| Номер CAS. | 52227-81-3 | ||
| Базы данных | |||
| ИнтЭнк | вид IntEnz | ||
| БРЕНДА | БРЕНДА запись | ||
| Экспаси | Просмотр NiceZyme | ||
| КЕГГ | КЕГГ запись | ||
| МетаЦик | метаболический путь | ||
| ПРЯМОЙ | профиль | ||
| PDB Структуры | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||
| Генная онтология | АмиГО / QuickGO | ||
| |||
Дезоксинуклеозидкиназы обычно группируют в два семейства на основе структурной гомологии:
Семья ТК1. Это семейство получило свое название от человеческого фермента тимидинкиназы 1 . Субстратная специфичность среди природных субстратов ограничена тимидином (и в меньшей степени дезоксиуридином). Члены семейства TK1 широко распространены и встречаются как у эукариот, так и у прокариот.
Семья, не похожая на TK1. В это семейство входят дезоксицитидинкиназа (цитозольная), а также два митохондриальных фермента: дезоксигуанозинкиназа и тимидинкиназа 2 у человека. Базовая специфичность, как правило, шире, чем у семейства ТК-1. Члены семейства, не относящиеся к TK1, широко распространены и встречаются как у эукариот, так и у прокариот. К этому семейству также принадлежит тимидинкиназа вируса герпеса, хотя это не очевидно из гомологии последовательностей (она все же структурно родственна).
Катализируемая реакция
[ редактировать ]В энзимологии дезоксинуклеозидкиназа , ( КФ 2.7.1.145 ) — фермент катализирующий реакцию химическую .
- АТФ + 2'-дезоксинуклеозид АДФ + 2’-дезоксинуклеозид 5’-фосфат
Таким образом, двумя субстратами этого фермента являются АТФ и 2'-дезоксинуклеозид , тогда как двумя его продуктами являются АДФ и 2'-дезоксинуклеозид-5'-фосфат .
Этот фермент принадлежит к семейству трансфераз , в частности тех, которые переносят фосфорсодержащие группы ( фосфотрансферазы ) со спиртовой группой в качестве акцептора. Систематическое название этого класса ферментов — АТФ:дезоксинуклеозид-5'-фосфотрансфераза . Другие широко используемые названия включают мультиспецифическую дезоксинуклеозидкиназу , ms-dNK , мультисубстратную дезоксирибонуклеозидкиназу , многофункциональную дезоксинуклеозидкиназу , дезоксинуклеозидкиназу D. melanogaster и Dm-dNK .
Структурные исследования
[ редактировать ]По состоянию на конец 2007 года 5 структур для этого класса ферментов было решено PDB с кодами доступа 1OE0 , 1OT3 , 1ZM7 , 1ZMX и 2JCS .
Ссылки
[ редактировать ]- Мунк-Петерсен Б., Пискур Дж., Зондергаард Л. (1998). «Четыре активности дезоксинуклеозидкиназы Drosophila melanogaster содержатся в одном мономерном ферменте, новой многофункциональной дезоксинуклеозидкиназы» . Ж. Биол. Хим . 273 (7): 3926–31. дои : 10.1074/jbc.273.7.3926 . ПМИД 9461577 .
- Мунк-Петерсен Б, Кнехт В, Ленц С, Зондергаард Л, Пискур Дж (2000). «Функциональная экспрессия мультисубстратной дезоксирибонуклеозидкиназы Drosophila melanogaster и ее C-концевых делеционных мутантов» . Ж. Биол. Хим . 275 (9): 6673–9. дои : 10.1074/jbc.275.9.6673 . ПМИД 10692477 .
