ОпенЭпи
 | Эта статья нуждается в дополнительных цитатах для проверки . ( сентябрь 2009 г. ) |
 ОпенЭпи 2.3 | |
| Разработчик(и) | А.Г. Дин, К.М. Салливан, М.М. Соу |
|---|---|
| Стабильная версия | 3.03 / 22 сентября 2014 г |
| Операционная система | Кросс-платформенный |
| Платформа | HTML , JavaScript |
| Тип | Веб-приложение , Статистический анализ |
| Лицензия | МОЯ лицензия |
| Веб-сайт | www |
OpenEpi — это бесплатная , сетевая, независимая от операционной системы серия программ с открытым исходным кодом для использования в эпидемиологии , биостатистике , общественном здравоохранении и медицине , предоставляющая ряд эпидемиологических и статистических инструментов для обобщения данных. [1] [2] [3] [4] [5] [6] [7] [8] [9] [10] [11] OpenEpi был разработан на JavaScript и HTML и может работать в современных веб-браузерах . Программу можно запустить с веб-сайта OpenEpi или загрузить и запустить без подключения к Интернету. Исходный код и документация доступны для скачивания и бесплатно доступны для использования другими исследователями. OpenEpi был рассмотрен как средствами массовой информации, так и в исследовательских журналах. [12] [13] [14] [15] [16]
Разработчики OpenEpi имели большой опыт разработки и тестирования Epi Info — программы, разработанной Центрами по контролю и профилактике заболеваний (CDC) и широко используемой во всем мире для ввода и анализа данных. OpenEpi был разработан для выполнения анализа, найденного в DOS- версии модулей Epi Info StatCalc и EpiTable, для улучшения типов анализа, предоставляемых этими модулями, а также для предоставления ряда инструментов и вычислений, которые в настоящее время недоступны в Epi Info. Это первый шаг на пути к набору эпидемиологических программных инструментов, полностью основанному на Интернете. OpenEpi можно считать важным дополнением к Epi Info и другим программам, таким как SAS , PSPP , SPSS , Stata , SYSTAT , Minitab , Epidata и R (см. язык программирования R ). Еще одна функционально похожая программа для Windows — Winpepi . См. также список статистических пакетов и сравнение статистических пакетов . И OpenEpi, и Epi Info были разработаны с целью предоставления инструментов для регионов мира с низкими и умеренными ресурсами. Первоначальная разработка OpenEpi поддерживалась грантом Фонд Билла и Мелинды Гейтс при Университете Эмори . [17]
Типы
[ редактировать ]Типы вычислений, выполняемые OpenEpi в настоящее время, включают:
- Различные доверительные интервалы для долей, показателей, стандартизированного коэффициента смертности , среднего значения , медианы , процентилей
- 2x2 грубые и стратифицированные таблицы для данных подсчета и скорости
- Соответствующий случай-контроль анализ
- Проверка тенденции с помощью данных подсчета
- Независимый t-критерий и односторонний дисперсионный анализ
- Анализ диагностических и скрининговых тестов с использованием кривых рабочих характеристик приемника (ROC).
- Размер выборки для определения пропорций, перекрестных исследований, несопоставимых методов «случай-контроль» , когорты , рандомизированных контролируемых исследований и сравнения двух средних значений.
- Расчеты мощности для пропорций (несовпадающие исследования «случай-контроль» , перекрестные , когортные, рандомизированные контролируемые исследования ) и для сравнения двух средних значений
- Генератор случайных чисел
Для эпидемиологов и других исследователей в области здравоохранения OpenEpi выполняет ряд расчетов на основе таблиц, которых нет в большинстве эпидемиологических и статистических пакетов. Например, для одной таблицы 2x2, помимо результатов, представленных в других программах, OpenEpi предоставляет оценки для:
- Этиологическая или предотвращенная доля в популяции и в группе риска с доверительными интервалами, основанными на данных о риске, шансах или частоте
- перекрестного произведения и отношения шансов MLE Оценка
- Точные значения p в середине p и доверительные пределы для отношения шансов
- Расчеты коэффициентов и разностей ставок с использованием доверительных интервалов и статистических тестов.
Для стратифицированных таблиц 2x2 с данными подсчета OpenEpi предоставляет:
- Мантеля-Хензеля (МХ) и прецизионные оценки отношения риска и отношения шансов
- Скорректированная разница рисков, основанная на точности
- Тесты на взаимодействие для отношения риска , отношения шансов и разницы рисков
- Четыре различных метода доверительного предела для отношения шансов.
Как и в случае с Epi Info, при стратифицированном анализе предоставляются как грубые, так и скорректированные оценки, чтобы оценить искажающие факторы можно было . Используя данные о скоростях, OpenEpi предоставляет скорректированные соотношения скоростей и различия в скоростях, а также тестирует взаимодействие . Наконец, с помощью данных подсчета OpenEpi также выполняет проверку тренда как для необработанных данных, так и для стратифицированных данных.
OpenEpi не только используется для анализа данных исследователями в области здравоохранения, но и в качестве учебного пособия для преподавания эпидемиологии студентам в: Университете Эмори , Массачусетском университете , Мичиганском университете , Университете Миннесоты , Колледже Морхаус , Колумбийском университете , Университете Висконсин , Государственный университет Сан-Хосе , Университет медицины и стоматологии Нью-Джерси , Вашингтонский университет и другие. Сюда входят курсы очного и дистанционного обучения. Поскольку OpenEpi прост в использовании, не требует опыта программирования и может быть запущен в Интернете, студенты могут использовать программу и сосредоточиться на интерпретации результатов. Пользователи могут запускать программу на английском, французском, испанском, португальском или итальянском языках.
Комментарии и предложения по улучшениям приветствуются, разработчики отвечают на запросы пользователей. Разработчики поощряют других разрабатывать модули, которые можно было бы добавить в OpenEpi, и размещать на веб-сайте инструменты разработчика. Планируемая будущая разработка включает усовершенствование существующих модулей, разработку новых модулей, перевод на другие языки, а также добавление возможности вырезания и вставки данных и/или чтения файлов данных.
См. также
[ редактировать ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Салливан К.М., Дин А., Со М.М. (2009). «OpenEpi — веб-эпидемиологический и статистический калькулятор общественного здравоохранения» . Отчеты общественного здравоохранения . 124 (3): 471–474. дои : 10.1177/003335490912400320 . ПМЦ 2663701 . ПМИД 19445426 .
- ^ Салливан К.; Абрамсон Дж. (июль 2008 г.). «Обновление бесплатного эпидемиологического программного обеспечения». Эпидемиологический монитор . 29 (7): 3–4.
- ^ Салливан, К. (весна – лето 2008 г.). «В центре внимания факультета». Эпи Авангард .
- ^ Салливан, К.М. (декабрь 2007 г.). «OpenEpi теперь доступен на английском, французском, итальянском и испанском языках». Эпидемиологический монитор . 28 (14).
- ^ Салливан К.М., Дин А., Со М.М. (май 2007 г.). «OpenEpi Версия 2». Эпидемиологический монитор . 28 (5): 1, 9–10.
- ^ Салливан, К.М. (апрель 2007 г.). «Обзор бесплатного аналитического программного обеспечения для эпидемиологов». Эпидемиологический монитор . 28 (4).
- ^ Салливан, К.М. (весна 2007 г.). «OpenEpi — веб-калькулятор». Эпи Авангард .
- ^ Салливан К., Дин А., Со М.М. (июнь 2006 г.). «OpenEpi: обновление». Эпидемиологический монитор . 27 (6): 4.
- ^ Салливан К.М., Дин А.Г., Мир Р. (апрель 2004 г.). «OpenEpi: новое сотрудничество в области эпидемиологических вычислений». Эпидемиологический монитор . 25 (4): 3, 7, 9.
- ^ Салливан К.М., Дин А.Г., Мир Р. (11–14 июня 2003 г.). OpenEpi: новая совместная работа в области эпидемиологических вычислений . 36-е ежегодное собрание Общества эпидемиологических исследований. Атланта, Джорджия , США.
- ^ Дин А.Г., Салливан К.М., Мир Р. (1–4 октября 2003 г.). Инициатива Open Epi: программное обеспечение веб-браузера с открытым исходным кодом для общественного здравоохранения . Ежегодное научное собрание Международной эпидемиологической ассоциации. Толедо, Испания : Европейская эпидемиологическая федерация.
- ^ «ОпенЭпи онлайн» . 24 сентября 2007 г.
- ^ Отличные бесплатные инструменты для обучения статистике | Образование ИТ | ZDNet.com
- ^ Анточ, Дж. (2008). «Среда статистических вычислений». Обзор компьютерных наук . 2 (2): 113–122. дои : 10.1016/j.cosrev.2008.05.002 .
- ^ Абрамсон Дж.Х., Абрамсон З.Х. (2008). Методы исследования в общественной медицине: опросы, эпидемиологические исследования, оценка программ, клинические испытания (6-е изд.). Джон Уайли и сыновья.
- ^ Сингх, С. (2009). «Обзор бесплатных программ для ввода и анализа эпиданных» . Индийский журнал общественной медицины . 34 (34): 76–7. дои : 10.4103/0970-0218.45384 . ПМЦ 2763648 . ПМИД 19876466 .
- ^ «Архивная копия» (PDF) . Архивировано из оригинала (PDF) 20 сентября 2009 г. Проверено 22 сентября 2009 г.
{{cite web}}: CS1 maint: архивная копия в заголовке ( ссылка )
