Пикобирнавирус
| Пикобирнавирус | |
|---|---|
| |
| Электронная микрофотография частиц пикобирнавируса человека | |
Классификация вирусов 
| |
| (без рейтинга): | Вирус |
| Область : | Рибовирия |
| Королевство: | Орторнавиры |
| Тип: | Писувирикота |
| Сорт: | Дуплопивирицеты |
| Заказ: | дурнавиралес |
| Семья: | Пикобирнавирусиды |
| Род: | Пикобирнавирус |
Пикобирнавирусы — род вирусов с двухцепочечной РНК . Это единственный род семейства Picobirnaviridae . [ 1 ] Хотя считалось, что хозяевами служат амниоты , особенно млекопитающие, недавно было высказано предположение, что эти вирусы могут инфицировать бактерии и, возможно, некоторых других беспозвоночных. Если они заражают бактерии, то это бактериофаги . [ 2 ] [ 3 ] В этом роде три вида. Сопутствующие симптомы включают гастроэнтерит у животных и людей, хотя связь с заболеванием неясна. [ 4 ] [ 5 ]
Этимология
[ редактировать ]Пикобирнавирус — это маленький ( pico , по-испански « маленький» ), двусегментированный ( bi , по латыни « два ») вирус с двухцепочечной РНК. Первоначально пикобирнавирусы считались бирна-подобными вирусами, и название произошло от бирнавируса (двусегментированная РНК), но вирионы намного меньше (диаметр 35 нм против 65 нм). [ 6 ] Пикобирнавирусы были впервые обнаружены у людей и черноногих карликовых рисовых крыс в 1988 году. [ 7 ]
Структура
[ редактировать ]Вирусы этого рода не имеют оболочки, имеют икосаэдрическую геометрию и симметрию T = 3. Диаметр составляет около 35–40 нм. [ 5 ] [ 4 ]
Геном
[ редактировать ]
Геном . двудольный и состоит из двухцепочечной РНК линейный , Он включает сегмент 1 длиной 2,2–2,7 килобаз (кб) и сегмент 2 длиной 1,2–1,9 КБ. Геном кодирует три-четыре белка. [ 4 ] Ген капсидного белка кодируется второй открытой рамкой считывания большего геномного сегмента 1. [ 4 ]
Пикобирнавирусы делятся на две геногруппы на основании последовательности сегмента 2 . РНК -зависимая РНК-полимераза (RdRp) кодируется сегментом 2 . Вирусы группы были выделены от человека и других млекопитающих, а также птиц и чешуйчатых . [ 8 ]
Жизненный цикл
[ редактировать ]
Пикобирнавирусы поражают ткани кишечника. Вход в клетку-хозяина достигается путем проникновения в клетку-хозяина. Попав в клетку-хозяина, репликация вируса происходит цитоплазматически. Репликация соответствует модели репликации вируса с двухцепочечной РНК. Транскрипция вируса двухцепочечной РНК - это метод транскрипции. Вирусы выходят из клетки путем почкования. Млекопитающие служат естественным хозяином. Пути передачи – фекально-оральный. [ 5 ] [ 4 ]
Таксономия
[ редактировать ]Первоначально считалось, что пикобирнавирусы принадлежат к семейству Birnaviridae , но позже было подтверждено, что они различаются по хозяину, размеру вириона, капсиду, РНК-зависимой РНК-полимеразе, размеру генома и организации. [ 9 ] Семейство Picobirnaviridae теперь четко классифицируется и состоит из одного рода Picobirnavirus , который включает три вида: [ 10 ]
- Бэйхайский пикобирнавирус
- Пикобирнавирус лошадей
- Пикобирнавирус человека
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Дельмас, Б; Аттуи, Х; Гош, С; Малик, Ю.С.; Мундт, Э; Вахариа, В.Н.; Отчет Ictv, Консорциум (февраль 2019 г.). «Профиль таксономии вируса ICTV: Picobirnaviridae» . Журнал общей вирусологии . 100 (2): 133–134. дои : 10.1099/jgv.0.001186 . hdl : 11603/12290 . ПМИД 30484763 .
- ^ Кришнамурти, Сиддхарт Р.; Ван, Дэвид (1 марта 2018 г.). «Обширная консервация прокариотических участков связывания рибосом у известных и новых пикобирнавирусов». Вирусология . 516 : 108–114. дои : 10.1016/j.virol.2018.01.006 . ISSN 0042-6822 . ПМИД 29346073 .
- ^ Иди, Клод Кве; Гогому, Стивен Мбига; Консейсан-Нето, Надя; Беллер, Лин; Дебютт, Уорд; Ванхулле, Эмиэль; Мэйс, Пит; Ван Ранст, Марк; Маттейнссенс, Йелле (январь 2018 г.). «Камерунские летучие мыши являются носителями различных вирусов, включая ротавирус H, бастровирусы и пикобирнавирусы, использующие альтернативный генетический код» . Эволюция вирусов . 4 (1): вей008. дои : 10.1093/ve/vey008 . ISSN 2057-1577 . ПМК 5888411 . ПМИД 29644096 .
- ^ Jump up to: а б с д и «Вирусная зона» . ЭксПАСи . Проверено 15 июня 2015 г.
- ^ Jump up to: а б с «Отчет ICTV: Пикобирнавирусы» .
- ^ Малик, Яшпал С.; Гош, Сувик (январь 2020 г.). «Этимология: Пикобирнавирус» . Новые инфекционные заболевания . 26 (1): 89. дои : 10.3201/eid2601.et2601 . ПМК 6924892 .
- ^ Перейра, ХГ; Флюетт, TH; КАНДЕИАС, ЯН; Барт, О.М. (1988). «Вирус с двусегментированным геномом двухцепочечной РНК в кишечнике мыши (Oryzomys nigripes)» . Джей Ген Вирол . 69 (11): 2749–2754. дои : 10.1099/0022-1317-69-11-2749 . ПМИД 3053986 .
- ^ Смитс, СЛ; ван Леувен, М; Шапендонк, CM; Шюрх, AC; Бодевес, Р; Хаагманс, БЛ; Остерхаус, AD (2012). «Пикобирнавирусы в дыхательных путях человека» . Новые инфекционные заболевания . 18 (9): 1539–40. дои : 10.3201/eid1809.120507 . ПМЦ 3437736 . ПМИД 22932227 .
- ^ Малик, Ю.С.; Кумар, Н; Шарма, К; Дхама, К; Шаббир, МЗ; Ганеш, Б; Кобаяши, Н; Баньяи, К. (2014). «Эпидемиология, филогения и эволюция новых кишечных пикобирнавирусов животного происхождения и их связь с человеческими штаммами» . Биомед Рес. Межд . 2014 : 1–13. дои : 10.1155/2014/780752 . ПМК 4124650 . ПМИД 25136620 .
- ^ «Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV)» . talk.ictvonline.org . Проверено 8 октября 2020 г.
Внешние ссылки
[ редактировать ]- Малик, Ю.С. (2014). «Эпидемиология, филогения и эволюция новых кишечных пикобирнавирусов животного происхождения и их связь с человеческими штаммами» . Биомед Рес Инт . 2014 : 1–13. дои : 10.1155/2014/780752 . ПМК 4124650 . ПМИД 25136620 .
- Чандра, Р. (1997). «Пикобирнавирус, новая группа неописанных вирусов млекопитающих и птиц: миниобзор». Акта вирусологика . 41 (1): 59–62. ПМИД 9199719 .
- Розен, Б; Фанг, З.Ы.; Гласс, Род-Айленд; Монро, СС (2000). «Клонирование геномных сегментов пикобирнавируса человека и разработка метода обнаружения RT-PCR» . Вирусология . 277 (2): 316–29. дои : 10.1006/виро.2000.0594 . ПМИД 11080479 .
- Таксономическое предложение пикобирнавирусов на ICTV
- Вирусная зона : Пикобирнавирус.
- Отчет ICTV: Пикобирнавирусы