Дигидропиримидиндегидрогеназа (НАДФ+)
(Перенаправлено с DPYD )
| дигидропиримидиндегидрогеназа (НАДФ+) | |||
|---|---|---|---|
 Димер дигидропримидиндегидрогеназы, Sus scrofa | |||
| Идентификаторы | |||
| Номер ЕС. | 1.3.1.2 | ||
| Номер CAS. | 9029-01-0 | ||
| Альт. имена | Дигидротиминдегидрогеназа | ||
| Базы данных | |||
| ИнтЭнк | вид IntEnz | ||
| БРЕНДА | БРЕНДА запись | ||
| Экспаси | Просмотр NiceZyme | ||
| КЕГГ | КЕГГ запись | ||
| МетаЦик | метаболический путь | ||
| ПРЯМОЙ | профиль | ||
| PDB Структуры | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||
| Генная онтология | АмиГО / QuickGO | ||
| |||
В энзимологии дигидропиримидиндегидрогеназа (НАДФ+) ( КФ 1.3.1.2 ) представляет собой фермент химическую , катализирующий реакцию .
- 5,6-дигидроурацил + НАДФ + урацил + НАДФН + Н +
Таким образом, двумя субстратами этого фермента являются 5,6-дигидроурацил и НАДФ. + , тогда как его тремя продуктами являются урацил , НАДФН и H + .
У человека этот фермент кодируется DPYD геном . [ 1 ] [ 2 ] Это начальный и лимитирующий этап катаболизма пиримидинов. [ нужна ссылка ] Он катализирует восстановление урацила и тимина . [ 3 ] Он также участвует в расщеплении химиотерапевтических препаратов 5-фторурацила и тегафура . [ 4 ] Он также участвует в метаболизме бета-аланина и биосинтезе пантотената и коа .
Терминология
[ редактировать ]Систематическое название этого класса ферментов — 5,6-дигидроурацил:НАДФ+5-оксидоредуктаза .
Другие широко используемые имена включают:
- дигидротиминдегидрогеназа
- дигидроурацилдегидрогеназа (НАДФ+)
- 4,5-дигидротимин: оксидоредуктаза
- ДПД
- ДХПДХ
- дегидрогеназа, дигидроурацил (никотинамидадениндинуклеотид , фосфат)
- DHU дегидрогеназа
- гидропиримидиндегидрогеназа
- дигидропиримидиндегидрогеназа (НАДФ+)
Структурные исследования
[ редактировать ]По состоянию на конец 2007 года 5 структур для этого класса ферментов было решено PDB с кодами доступа 1GT8 , 1GTE , 1GTH , 1H7W и 1H7X .
Функция
[ редактировать ]Белок представляет собой пиримидиновый катаболический фермент и начальный и лимитирующий фактор на пути урацила и тимидина катаболизма . Генетический дефицит этого фермента приводит к ошибке метаболизма пиримидина, связанной с тимин-урацилурией, и повышенному риску токсичности у онкологических больных, получающих химиотерапию 5-фторурацилом . [ 2 ]
Интерактивная карта маршрутов
[ редактировать ]Нажмите на гены, белки и метаболиты ниже, чтобы перейти к соответствующим статьям. [ § 1 ]
активность Фторурацил (5-ФУ) Редактировать
- ^ Интерактивную карту маршрутов можно редактировать на WikiPathways: «Фторпиримидинактивность_WP1601» .
См. также
[ редактировать ]- Дефицит дигидропиримидиндегидрогеназы , генетическое заболевание.
- Фармакогеномика рака
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Такай С., Фернандес-Сальгеро П., Кимура С., Гонсалес Ф.Дж., Ямада К. (декабрь 1994 г.). «Присвоение гена дигидропиримидиндегидрогеназы человека (DPYD) хромосомной области 1p22 путем флуоресцентной гибридизации in situ» . Геномика . 24 (3): 613–4. дои : 10.1006/geno.1994.1680 . ПМИД 7713523 .
- ^ Jump up to: а б «Ген Энтрез: дигидропиримидиндегидрогеназа DPYD» .
- ^ Чунг Т, На Дж, Ким ЙИ, Чанг ДЮ, Ким ЙИ, Ким Х, Мун ХЭ, Кан К.В., Ли Д.С., Чунг Дж.К., Ким СС, Сух-Ким Х, Пэк Ш., Юн Х (2016). «Дигидропиримидиндегидрогеназа является прогностическим маркером гена цитозиндезаминазы, опосредованного мезенхимальными стволовыми клетками, и терапии пролекарством 5-фторцитозина для лечения рецидивирующих глиом» . Тераностика . 6 (10): 1477–90. дои : 10.7150/thno.14158 . ПМЦ 4955049 . ПМИД 27446484 .
- ^ Кодл К.Е., Торн К.Ф., Кляйн Т.Е., Свен Дж.Дж., Маклеод Х.Л., Диасио Р.Б., Шваб М. (декабрь 2013 г.). «Руководство Консорциума по внедрению клинической фармакогенетики по генотипу дигидропиримидиндегидрогеназы и дозированию фторпиримидина» . Клиническая фармакология и терапия . 94 (6): 640–5. дои : 10.1038/clpt.2013.172 . ПМЦ 3831181 . ПМИД 23988873 .
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Хофф П.М., Ройс М., Медьеси Д., Брито Р., Паздур Р. (декабрь 1999 г.). «Оральные фторпоиримидины». Семинары по онкологии . 26 (6): 640–6. ПМИД 10606257 .
- Шнайдер Х.Б., Беккер Х. (май 2003 г.). «Влияние дигидропиримидиндегидрогеназы на лечение 5-фторурацилом у онкологических больных». Европейский журнал медицинских исследований . 8 (5): 226–8. ПМИД 12844478 .
- Омура К. (июнь 2003 г.). «Клинические последствия активности дигидропиримидиндегидрогеназы (ДПД) при химиотерапии на основе 5-ФУ: мутации в гене ДПД и фторпиримидины, ингибирующие ДПД». Международный журнал клинической онкологии . 8 (3): 132–8. дои : 10.1007/s10147-003-0330-z . ПМИД 12851836 . S2CID 22593228 .
- Ли В., Локхарт А.С., Ким Р.Б., Ротенберг М.Л. (февраль 2005 г.). «Фармакогеномика рака: мощные инструменты химиотерапии рака и разработки лекарств». Онколог . 10 (2): 104–11. doi : 10.1634/теонколог.10-2-104 . ПМИД 15709212 .
- Лу Ж., Чжан Р., Диасио Р.Б. (август 1992 г.). «Очистка и характеристика дигидропиримидиндегидрогеназы из печени человека» . Журнал биологической химии . 267 (24): 17102–9. дои : 10.1016/S0021-9258(18)41899-6 . ПМИД 1512248 .
- Портер DJ, Chestnut WG, Меррилл Б.М., Спектор Т (март 1992 г.). «Механизм инактивации дигидропиримидиндегидрогеназы 5-этинилурацилом» . Журнал биологической химии . 267 (8): 5236–42. дои : 10.1016/S0021-9258(18)42757-3 . ПМИД 1544906 .
- Дюпюи А., Скехель Дж. М., Уокер Дж. Э. (март 1991 г.). «Гомолог ядерно-кодируемой субъединицы железо-серного белка бычьего митохондриального комплекса I кодируется в геномах хлоропластов». Биохимия . 30 (11): 2954–60. дои : 10.1021/bi00225a032 . ПМИД 1901022 .
- Эггинка Г., Энгель Х., Вриенд Г., Терпстра П., Витолт Б. (март 1990 г.). «Рубредоксинредуктаза Pseudomonas oleovorans. Структурная связь с другими флавопротеиноксидоредуктазами на основе одного отпечатка пальца НАД и двух отпечатков пальцев ФАД». Журнал молекулярной биологии . 212 (1): 135–42. дои : 10.1016/0022-2836(90)90310-I . ПМИД 2319593 .
- Тухман М., Ремелинг Р.В., Грушески В.А., Сотерн Р.Б., О'Ди Р.Ф. (1989). «Активность дигидропиримидиндегидрогеназы в мононуклеарных клетках крови человека». Фермент . 42 (1): 15–24. дои : 10.1159/000469002 . ПМИД 2528450 .
- Диасио Р.Б., Биверс Т.Л., Карпентер Дж.Т. (январь 1988 г.). «Семейный дефицит дигидропиримидиндегидрогеназы. Биохимическая основа семейной пиримидинемии и тяжелой токсичности, вызванной 5-фторурацилом» . Журнал клинических исследований . 81 (1): 47–51. дои : 10.1172/JCI113308 . ПМЦ 442471 . ПМИД 3335642 .
- Йокота Х, Фернандес-Сальгеро П, Фуруя Х, Лин К, МакБрайд О.В., Подшун Б, Шнакерц К.Д., Гонсалес Ф.Дж. (сентябрь 1994 г.). «Клонирование кДНК и картирование хромосом дигидропиримидиндегидрогеназы человека, фермента, связанного с токсичностью 5-фторурацила и врожденной тиминурацилурией» . Журнал биологической химии . 269 (37): 23192–6. дои : 10.1016/S0021-9258(17)31638-1 . ПМИД 8083224 .
- Лу З, Чжан Р., Диасио Р.Б. (ноябрь 1993 г.). «Активность дигидропиримидиндегидрогеназы в мононуклеарных клетках периферической крови и печени человека: популяционные характеристики, недавно выявленные пациенты с дефицитом и клиническое значение химиотерапии 5-фторурацилом». Исследования рака . 53 (22): 5433–8. ПМИД 8221682 .
- Врекен П., Ван Куиленбург А.Б., Мейнсма Р., Смит Г.П., Баккер Х.Д., Де Абреу Р.А., ван Геннип А.Х. (1997). «Точечная мутация в инвариантном донорском сайте сплайсинга приводит к пропуску экзонов у двух неродственных голландских пациентов с дефицитом дигидропиримидиндегидрогеназы». Журнал наследственных метаболических заболеваний . 19 (5): 645–54. дои : 10.1007/BF01799841 . ПМИД 8892022 . S2CID 10835574 .
- Джонсон М.Р., Ван К., Тиллманнс С., Альбин Н., Диасио Р.Б. (май 1997 г.). «Структурная организация гена дигидропиримидиндегидрогеназы человека». Исследования рака . 57 (9): 1660–3. ПМИД 9135003 .
- Фернандес-Сальгеро ПМ, Сапоне А, Вэй Икс, Холт-младший, Джонс С., Айдл-младший, Гонсалес Ф.Дж. (апрель 1997 г.). «Отсутствие корреляции между фенотипом и генотипом полиморфно экспрессируемой дигидропиримидиндегидрогеназы в семье пакистанского происхождения». Фармакогенетика . 7 (2): 161–3. дои : 10.1097/00008571-199704000-00012 . ПМИД 9170156 .
- Врекен П., Ван Куиленбург А.Б., Мейнсма Р., ван Геннип А.Х. (июль 1997 г.). «Идентификация новых точечных мутаций в гене дигидропиримидиндегидрогеназы» (PDF) . Журнал наследственных метаболических заболеваний . 20 (3): 335–8. дои : 10.1023/А:1005357307122 . ПМИД 9266349 . S2CID 3060557 .
- Врекен П., Ван Куиленбург А.Б., Мейнсма Р., ван Геннип А.Х. (декабрь 1997 г.). «Дефицит дигидропиримидиндегидрогеназы (ДПД): идентификация и экспрессия миссенс-мутаций C29R, R886H и R235W» . Генетика человека . 101 (3): 333–8. дои : 10.1007/s004390050637 . ПМИД 9439663 . S2CID 24362516 .
- Огура К., Нисияма Т., Такубо Х., Като А., Окуда Х., Аракава К., Фукусима М., Нагаяма С., Кавагути Ю., Ватабе Т. (январь 1998 г.). «Суицидальная инактивация дигидропиримидиндегидрогеназы человека (Е)-5-(2-бромвинил)урацилом, полученным из противовирусного препарата соривудин». Письма о раке . 122 (1–2): 107–13. дои : 10.1016/S0304-3835(97)00377-7 . ПМИД 9464498 .
- ФРИЦСОН П. (1960). «Свойства и анализ дигидроурацилдегидрогеназы печени крыс» . Ж. Биол. Хим . 235 (3): 719–25. дои : 10.1016/S0021-9258(19)67929-9 . ПМИД 13825299 .
- Шиотани Т., Вебер Г. (1981). «Очистка и свойства дигидротиминдегидрогеназы печени крыс» . Ж. Биол. Хим . 256 (1): 219–24. дои : 10.1016/S0021-9258(19)70122-7 . ПМИД 7451435 .
галерея PDB |
|---|
