Jump to content

Мобильные генетические элементы

ДНК-транспозоны, ретротранспозоны LTR, SINE и LINE составляют большую часть генома человека.

Мобильные генетические элементы ( МГЭ ), иногда называемые эгоистичными генетическими элементами , [ 1 ] представляют собой тип генетического материала , который может перемещаться внутри генома или передаваться от одного вида или репликона к другому. МГЭ обнаружены во всех организмах. Считается, что у человека примерно 50% генома составляют MGE. [ 2 ] МГЭ играют особую роль в эволюции. События дупликации генов также могут происходить посредством механизма MGE. MGE также могут вызывать мутации в кодирующих участках белка, что изменяет функции белка. Эти механизмы также могут перестраивать гены в геноме хозяина, создавая вариации. Эти механизмы могут повысить физическую форму за счет приобретения новых или дополнительных функций. Примером MGE в эволюционном контексте является то, что факторы вирулентности и гены устойчивости к антибиотикам MGE могут транспортироваться для совместного использования генетического кода с соседними бактериями. Однако MGE также могут снижать физическую форму, вводя аллели или мутации, вызывающие заболевания. [ 3 ] Совокупность МГЭ в организме называется мобиломом , который состоит из большого числа плазмид , транспозонов и вирусов . [ 4 ]

pBLU представляет собой векторную плазмиду длиной 5437 пар оснований. Этот вектор содержит точку начала репликации, сайт разрезания фермента рестрикции, ген lacZ и ген устойчивости к ампициллину.
  • Плазмиды : обычно это кольцевые внехромосомные молекулы ДНК , которые реплицируются и передаются независимо от хромосомной ДНК. Эти молекулы присутствуют у прокариот ( бактерий и архей ), а иногда и у эукариотических организмов, таких как дрожжи . Пригодность плазмиды определяется ее подвижностью. Первым фактором приспособленности плазмиды является ее способность реплицировать ДНК. Второй фактор приспособленности — это способность плазмиды к горизонтальному переносу. Плазмиды в течение своего цикла переносят гены от одного организма к другому посредством процесса, называемого конъюгацией . Плазмиды обычно содержат набор генов подвижности, необходимых для конъюгации. Некоторые плазмиды используют мембраносвязанное образование спаривающихся пар (MPF). Плазмида, содержащая собственные гены MPF, считается самопередающейся или конъюгативной. [ 5 ] Плазмиды можно разделить на мобилизуемые и немобилизуемые классы. Плазмиды, которые используют MFP других генетических элементов в клетке, являются мобилизуемыми. Плазмиды, которые не мобилизуются, но распространяются путем трансдукции или трансформации, называются немобилизуемыми. [ 5 ] Плазмиды часто могут вводить гены, которые делают бактерии устойчивыми к антибиотикам . [ 6 ] [ 5 ]
  • Векторы клонирования : это типы гибридных плазмид с бактериофагами , используемые для переноса и репликации ДНК. Фрагменты ДНК могут быть вставлены с помощью рекомбинантной ДНК методов . Жизнеспособный вектор должен быть способен реплицироваться вместе с фрагментами ДНК, которые он несет. Эти векторы могут содержать нужные гены для внедрения в геном организма. Примерами являются космиды и фагмиды . [ 7 ]
Примеры мобильных генетических элементов в клетке (слева) и способы их приобретения (справа)
Транспозиция целевой последовательности в сайт рекомбинации ДНК с помощью транспозазы. Репликация мобильной последовательности начинается, когда транспозаза разрезает отдельные цепи на противоположных сторонах дцДНК. Репликация завершается в транспозонном комплексе и вырезается до целевой последовательности для рекомбинации.
  • ДНК-транспозоны : это транспозоны, которые перемещаются непосредственно из одного положения в другое в геноме, используя транспозазу , чтобы разрезать и прикрепляться к другому локусу . [ 9 ] Эти генетические элементы расщепляются транспозазой в четырех одноцепочечных участках ДНК. Чтобы достичь максимальной стабильности промежуточного транспозона, происходит расщепление одной цепи целевой ДНК. Одновременно донорскую цепь лигируют с целевой цепью после расщепления, оставляя одиночный выступ на обоих концах целевой последовательности. Эти сайты обычно содержат выступ из 5–9 пар оснований, который может создать сплоченный конец. [ 10 ] Затем транспозаза удерживает последовательность в перекрестном образовании и связывает донорскую цепь с целевой цепью. Структура, образованная дуплексом ДНК и транспозазы в репликативных транспозонах, известна как промежуточный продукт Шапиро. [ 11 ] Выступающий выступ из 5–9 пар оснований остается по обе стороны от целевой последовательности, что позволяет ей присоединяться к целевой последовательности в любой ориентации. Последовательность этих выступов может определять ориентацию соединения. [ 10 ] Прежде чем может произойти сайт-специфическая рекомбинация, концы олигонуклеотидов должны быть заполнены. Лигирование этих концов образует репликационную вилку на каждом конце мобильного элемента. Смещение одноцепочечной цепи вызывает синтез несвязанной 3'-гидроксильной группы с образованием длинных одноцепочечных участков, прилегающих к 5'-концу. Следовательно, противоположная цепь секвенируется прерывисто по мере того, как обе репликационные вилки приближаются к центру мобильного элемента. В результате образуются два рекомбинантных дуплекса, содержащие полуконсервативный мобильный элемент, фланкированный предыдущим выступающим элементом из 5–9 пар оснований. Между двумя мобильными элементами происходит сайт-специфическая реципрокная рекомбинация, чему способствуют белки. Эта взаимная репликация перекрывается во времени и происходит между дублированными сегментами элемента репликации до завершения репликации. [ 10 ] В результате молекула-мишень содержит вставленный элемент, фланкированный последовательностями из 5-9 пар оснований. Транспозиция этих элементов дублирует элемент транспозиции, оставляя элемент транспозиции в исходном месте и новый транспозон в сайте реципрокной репликации. При этом общее количество пар оснований в геномах организмов увеличивается. Частота транспозиций увеличивается с течением времени и по мере старения организмов.
Механизм ретротранспозона, который использует обратную транскриптазу для преобразования транспозона мРНК обратно в ДНК для интеграции.
  • Ретротранспозоны : это транспозоны, которые перемещаются по геному и транскрибируются в РНК , а затем в ДНК с помощью обратной транскриптазы . Многие ретротранспозоны также демонстрируют репликативную транспозицию . Ретротранспозоны присутствуют исключительно у эукариот . [ 12 ] Ретротранспозоны состоят из двух основных типов: длинных концевых повторов (LTR) и транспозонов, не относящихся к LTR. Транспозоны, не относящиеся к LTR, можно дополнительно разделить на длинные вкрапленные ядерные элементы (LINE) и короткие вкрапленные ядерные элементы (SINE). [ 13 ] Эти ретротранспозоны регулируются семейством коротких некодирующих РНК, называемых PIWI [P-элементом, индуцирующим слабые семенники]-взаимодействующими РНК (piRNA). [ 14 ] piRNA — это недавно открытый класс нкРНК, длина которых составляет ~24–32 нуклеотида. Первоначально piRNA были описаны как siRNA, ассоциированные с повторами (rasiRNA), поскольку они происходят из повторяющихся элементов, таких как мобильные последовательности генома. Однако позже выяснилось, что они действовали через PIWI-белок. Помимо роли в подавлении геномных транспозонов, недавно сообщалось о различных ролях piRNA, таких как регуляция 3'-UTR генов, кодирующих белок, через РНКи, трансгенерационное эпигенетическое наследование для передачи памяти о прошлой активности транспозонов и РНК-кодирование. индуцированное эпигенетическое молчание. [ 14 ]
  • Интегроны : это генные кассеты , которые обычно несут гены устойчивости к антибиотикам бактериальных плазмид и транспозонов. [ 15 ]
  • Интроны : групп I и Интроны II представляют собой нуклеотидные последовательности с каталитической активностью, которые являются частью транскриптов хозяина и действуют как рибозимы, которые могут вторгаться в гены, кодирующие тРНК , рРНК и белки . Они присутствуют во всех клеточных организмах и вирусах. [ 16 ]
  • Интронеры: последовательности, подобные транспозонам, которые могут прыгать в геноме, оставляя новые интроны там, где они были. Они были указаны как возможный механизм получения интронов в эволюции эукариот, где они присутствуют по крайней мере у 5% всех видов, особенно у водных таксонов, возможно, из-за горизонтального переноса генов , который чаще происходит у этих животных. [ 17 ] [ 18 ] Впервые они были описаны в 2009 году у одноклеточных зеленых водорослей micromonas . [ 19 ]
  • Вирусные агенты : в основном это инфекционные бесклеточные агенты, которые реплицируются в клетках-хозяевах. Во время инфекционного цикла они могут переносить гены от одного хозяина к другому. Они также могут переносить гены от одного организма к другому в случае, если вирусный агент заражает более двух разных видов. Традиционно их считают отдельными объектами, но правда в том, что многие исследователи, изучающие их характеристики и эволюцию, называют их мобильными генетическими элементами. Это основано на том факте, что вирусные агенты представляют собой простые частицы или молекулы, которые реплицируются и передаются между различными хозяевами, как и остальные невирусные мобильные генетические элементы. Согласно этой точке зрения, вирусы и другие вирусные агенты не следует считать живыми существами , их лучше рассматривать как мобильные генетические элементы. Вирусные агенты эволюционно связаны с различными мобильными генетическими элементами. [ 20 ] Считается, что эти вирусные агенты возникли из секретируемых или выделяемых плазмид других организмов. Транспозоны также дают представление о том, как эти элементы могли возникнуть изначально. Эта теория известна как гипотеза бродяжничества, предложенная Барбарой МакКлинток в 1950 году. [ 21 ] [ 1 ] [ 22 ] [ 4 ] [ 23 ]
    • Вирусы : это вирусные агенты, состоящие из молекул генетического материала (ДНК или РНК) и способные образовывать сложные частицы, называемые вирионами , чтобы легко перемещаться между хозяевами. Вирусы присутствуют во всех живых существах. Вирусные частицы производятся репликативным механизмом хозяина для горизонтального переноса. [ 20 ] [ 21 ] [ 24 ]
    • Сателлитные нуклеиновые кислоты : это молекулы ДНК или РНК, которые инкапсулированы в качестве «зайца» в вирионы определенных вирусов-помощников и возможность репликации которых зависит от них. Хотя их иногда считают генетическими элементами вирусов-помощников, они не всегда обнаруживаются в их вирусах-помощниках. [ 20 ] [ 21 ] [ 25 ]
    • Вироиды : это вирусные агенты, состоящие из небольших кольцевых молекул РНК, которые заражают и размножаются в растениях . Эти мобильные генетические элементы не имеют защитной белковой оболочки. В частности, эти мобильные генетические элементы обнаружены у покрытосеменных растений . [ 20 ] [ 21 ] [ 26 ]
    • Эндогенный вирусный элемент : это вирусные нуклеиновые кислоты, интегрированные в геном клетки. Они могут перемещаться и размножаться несколько раз в клетке-хозяине, не вызывая заболеваний или мутаций. Их считают автономными формами транспозонов. Примерами являются провирусы и эндогенные ретровирусы . [ 27 ]

Примеры исследований

[ редактировать ]

Системы CRISPR-Cas у бактерий и архей представляют собой адаптивные иммунные системы для защиты от смертельных последствий МГЭ. Используя сравнительный геномный и филогенетический анализ, исследователи обнаружили, что варианты CRISPR-Cas связаны с разными типами MGE, такими как мобильные элементы. В транспозонах, связанных с CRISPR , CRISPR-Cas контролирует распространение мобильных элементов. [ 28 ]

МГЭ, такие как плазмиды, посредством горизонтальной передачи обычно полезны для организма. Способность передавать плазмиды (совместное использование) важна с эволюционной точки зрения. Таззиман и Бонхеффер обнаружили, что фиксация (получение) перенесенных плазмид в новом организме так же важна, как и способность их переносить. [ 29 ] Полезные редкие и переносимые плазмиды имеют более высокую вероятность фиксации, тогда как вредные переносимые генетические элементы имеют более низкую вероятность фиксации, поскольку они смертельны для организмов-хозяев.

Один тип MGE, а именно интегративные конъюгативные элементы (ICE), играет центральную роль в горизонтальном переносе генов, формируя геномы прокариот, обеспечивая быстрое приобретение новых адаптивных признаков. [ 30 ] [ 31 ]

В качестве репрезентативного примера ICEs, ICE Bs1 хорошо охарактеризован своей ролью в SOS-ответе Bacillus subtilis на глобальное повреждение ДНК. [ 32 ] к радиации и высыханию , а также его потенциальная связь с устойчивостью спор Bacillus pumilus SAFR-032 [ 33 ] изолированы от помещений чистых помещений космического корабля. [ 34 ] [ 35 ] [ 36 ]

Транспозиция мобильными элементами является мутагенной. Таким образом, организмы научились подавлять события транспозиции, а неспособность подавить эти события вызывает рак в соматических клетках. Чекко и др. обнаружили, что в раннем возрасте транскрипция ретротранспозируемых элементов у мышей минимальна, но в пожилом возрасте уровень транскрипции увеличивается. [ 37 ] Этот возрастной уровень экспрессии мобильных элементов снижается с помощью диеты с ограничением калорий. Репликация мобильных элементов часто приводит к добавлению в геном повторяющихся последовательностей. Эти последовательности часто некодируют, но могут мешать кодирующим последовательностям ДНК. Хотя транспозоны обладают мутагенетической природой, они увеличивают геном организма, в который они переносятся. Необходимо провести дополнительные исследования того, как эти элементы могут служить инструментом быстрой адаптации, используемым организмами для создания изменчивости. Многие транспозиционные элементы находятся в состоянии покоя или требуют активации. Следует также отметить, что текущие значения для кодирующих последовательностей ДНК были бы выше, если бы в качестве кодирующих последовательностей рассматривались элементы транспозиции, которые кодируют свой собственный транспозиционный аппарат.

Некоторые другие исследованные примеры включают Mavericks, [ 38 ] [ 39 ] [ 40 ] Звездолеты [ 41 ] [ 40 ] и Космические захватчики (или СПИНЫ) [ 42 ] [ 43 ]

Последствия мобильных генетических элементов могут изменить паттерны транскрипции, что часто приводит к генетическим нарушениям, таким как иммунные нарушения, рак молочной железы, рассеянный склероз и боковой амиотрофический склероз. У людей стресс может привести к транзакционной активации MGE, таких как эндогенные ретровирусы , и эта активация связана с нейродегенерацией . [ 44 ]

Другие примечания

[ редактировать ]

Совокупность всех мобильных генетических элементов в геноме можно назвать мобиломом .

Барбара МакКлинток была удостоена 1983 года Нобелевской премии по физиологии и медицине «за открытие мобильных генетических элементов» ( transposable elements ). [ 45 ]

Мобильные генетические элементы играют решающую роль в распространении факторов вирулентности, таких как экзотоксины и экзоферменты , среди бактерий. Были предложены стратегии борьбы с некоторыми бактериальными инфекциями путем воздействия на эти специфические факторы вирулентности и мобильные генетические элементы. [ 46 ]

См. также

[ редактировать ]
  1. ^ Перейти обратно: а б Морейра Д., Лопес-Гарсиа П. (апрель 2009 г.). «Десять причин исключить вирусы из древа жизни». Обзоры природы. Микробиология . 7 (4): 306–311. дои : 10.1038/nrmicro2108 . ПМИД   19270719 . S2CID   3907750 .
  2. ^ Му Х, Ахмад С, Хур С (2016). Эндогенные ретроэлементы и сенсоры врожденного иммунитета хозяина . Достижения иммунологии. Том. 132. стр. 47–69. дои : 10.1016/bs.ai.2016.07.001 . ISBN  9780128047972 . ПМК   5135014 . ПМИД   27769507 .
  3. ^ Сингх П.К., Бурк Дж., Крейг Н.Л., Дубнау Дж.Т., Фешотт С., Флаш Д.А. и др. (18 ноября 2014 г.). «Мобильные генетические элементы и эволюция генома 2014» . Мобильная ДНК . 5:26 . дои : 10.1186/1759-8753-5-26 . ПМЦ   4363357 . ПМИД   30117500 .
  4. ^ Перейти обратно: а б Кунин Е.В., Вольф Ю.И. (декабрь 2008 г.). «Геномика бактерий и архей: новый динамический взгляд на мир прокариот» . Исследования нуклеиновых кислот . 36 (21): 6688–6719. дои : 10.1093/нар/gkn668 . ПМЦ   2588523 . ПМИД   18948295 .
  5. ^ Перейти обратно: а б с Смилли С., Гарсильян-Барсия, депутат парламента, Франсия М.В., Роча Е.П., де ла Крус Ф. (сентябрь 2010 г.). «Мобильность плазмид» . Обзоры микробиологии и молекулярной биологии . 74 (3): 434–452. дои : 10.1128/MMBR.00020-10 . ПМЦ   2937521 . ПМИД   20805406 .
  6. ^ Саммерс Д. (1996). «Глава 1 – Функции и организация плазмид» . Биология плазмид (первое изд.). Уайли-Блэквелл. стр. 21–22. ISBN  978-0632034369 .
  7. ^ Глик Б.Р., Пастернак Дж.Дж. (2005). Принципы молекулярной биотехнологии и применение рекомбинантной ДНК (3-е изд.). АСМ Пресс. ISBN  9781555816124 .
  8. ^ Макаловский В., Готеа В., Панде А., Макаловска I (2019). «Мобильные элементы: классификация, идентификация и их использование как инструмент сравнительной геномики». В Анисимовой М (ред.). Эволюционная геномика . Методы молекулярной биологии. Том. 1910. Нью-Йорк, штат Нью-Йорк: Humana. стр. 185–186. дои : 10.1007/978-1-4939-9074-0_6 . ISBN  978-1-4939-9074-0 . ПМИД   31278665 . S2CID   195814061 .
  9. ^ Муньос-Лопес М., Гарсия-Перес Х.Л. (апрель 2010 г.). «ДНК-транспозоны: природа и применение в геномике» . Современная геномика . 11 (2): 115–128. дои : 10.2174/138920210790886871 . ПМЦ   2874221 . ПМИД   20885819 .
  10. ^ Перейти обратно: а б с Шапиро Дж. А. (апрель 1979 г.). «Молекулярная модель транспозиции и репликации бактериофага Мю и других мобильных элементов» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 76 (4): 1933–1937. Бибкод : 1979ПНАС...76.1933С . дои : 10.1073/pnas.76.4.1933 . ПМЦ   383507 . ПМИД   287033 .
  11. ^ Бушман Ф (2002). Латеральный перенос ДНК: механизмы и последствия . Колд-Спринг-Харбор, Нью-Йорк: Лабораторное издательство Колд-Спринг-Харбор. ISBN  0-87969-603-6 . OCLC   47283049 .
  12. ^ Ричардсон С.Р., Дусе А.Дж., Копера ХК, Молдован Ж.Б., Гарсиа-Перес Х.Л., Моран Дж.В. (апрель 2015 г.). «Влияние ретротранспозонов LINE-1 и SINE на геномы млекопитающих» . Микробиологический спектр . 3 (2): 1165–1208. doi : 10.1128/microbiolspec.mdna3-0061-2014 . ISBN  9781555819200 . ПМЦ   4498412 . ПМИД   26104698 .
  13. ^ Макаловский В., Готеа В., Панде А., Макаловска I (2019). «Мобильные элементы: классификация, идентификация и их использование как инструмент сравнительной геномики». В Анисимовой М (ред.). Эволюционная геномика . Методы молекулярной биологии. Том. 1910. Нью-Йорк, штат Нью-Йорк: Humana. стр. 177–207. дои : 10.1007/978-1-4939-9074-0_6 . ISBN  978-1-4939-9074-0 . ПМИД   31278665 . S2CID   195814061 .
  14. ^ Перейти обратно: а б Монга I, Банерджи I (ноябрь 2019 г.). «Вычислительная идентификация piRNA с использованием признаков, основанных на последовательности, структуре, термодинамических и физико-химических свойствах РНК» . Современная геномика . 20 (7): 508–518. дои : 10.2174/1389202920666191129112705 . ПМЦ   7327968 . PMID   32655289 .
  15. ^ Ковалевская Н.П. (2002). «Мобильные генные кассеты и интеграны». Молекулярная биология . 36 (2): 196–201. дои : 10.1023/А:1015361704475 . S2CID   2078235 .
  16. ^ Хауснер Г., Хафез М., Эджелл Д.Р. (март 2014 г.). «Интроны бактериальной группы I: мобильные РНК-катализаторы» . Мобильная ДНК . 5 (1): 8. дои : 10.1186/1759-8753-5-8 . ПМЦ   3984707 . ПМИД   24612670 .
  17. ^ Гозашти Л., Рой С.В., Торнлоу Б., Крамер А., Арес М., Корбетт-Детиг Р. (ноябрь 2022 г.). «Мобильные элементы способствуют увеличению количества интронов у различных эукариот» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 119 (48): e2209766119. Бибкод : 2022PNAS..11909766G . дои : 10.1073/pnas.2209766119 . ПМЦ   9860276 . ПМИД   36417430 .
  18. ^ Бюлер Дж. (30 марта 2023 г.). «Как ДНК-паразит мог фрагментировать наши гены» . Журнал Кванта . Проверено 31 марта 2023 г.
  19. ^ Уорден А.З., Ли Дж.Х., Мок Т., Рузе П., Симмонс М.П., ​​Аэртс А.Л. и др. (апрель 2009 г.). «Зеленая эволюция и динамические адаптации, выявленные геномами морских пикоэукариот Micromonas» . Наука . 324 (5924): 268–272. Бибкод : 2009Sci...324..268W . дои : 10.1126/science.1167222 . ПМИД   19359590 . S2CID   206516961 .
  20. ^ Перейти обратно: а б с д Кун Дж.Х., Доля В.В., Крупович М., Адриансенс Э.М., Ди Серио Ф., Дутиль Б.Е. и др. (2020). Расширять, дополнять и дополнять Международный кодекс классификации и номенклатуры вирусов (ICVCN; «Кодекс») и Устав, чтобы четко определить сферу компетенции ICTV (Отчет). дои : 10.13140/RG.2.2.26202.26565 .
  21. ^ Перейти обратно: а б с д Кунин Е.В., Доля В.В., Крупович М., Кун Дж.Х. (декабрь 2021 г.). «Вирусы, определяемые положением виросферы в пространстве репликатора» . Обзоры микробиологии и молекулярной биологии . 85 (4): e0019320. дои : 10.1128/MMBR.00193-20 . ПМЦ   8483706 . ПМИД   34468181 .
  22. ^ Кунин Е.В., Доля В.В. (июнь 2014 г.). «Вирусный мир как эволюционная сеть вирусов и бескапсульных эгоистичных элементов» . Обзоры микробиологии и молекулярной биологии . 78 (2): 278–303. дои : 10.1128/MMBR.00049-13 . ПМК   4054253 . ПМИД   24847023 .
  23. ^ Рэнкин DJ, Rocha EP, Brown SP (январь 2011 г.). «Какие черты передаются мобильным генетическим элементам и почему?» . Наследственность . 106 (1): 1–10. дои : 10.1038/hdy.2010.24 . ПМК   3183850 . ПМИД   20332804 .
  24. ^ Кроуфорд Д. (2011). Вирусы: очень краткое введение . Нью-Йорк: Издательство Оксфордского университета. п. 4 . ISBN  978-0199574858 .
  25. ^ Бриддон Р.В., Габриал С., Лин Н.С., Палукайтис П., Шольтхоф КБ, Веттен Х.Дж. «3 – Сателлиты и другие вирусозависимые нуклеиновые кислоты – Субвирусные агенты – Субвирусные агенты (2011)» . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV) . Архивировано из оригинала 13 января 2019 года.
  26. ^ Ди Серио Ф., Оуэнс Р.А., Ли С.Ф., Матушек Дж., Паллас В., Рэндлс Дж.В. и др. (ноябрь 2020 г.). «Вироиды» . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV). Архивировано из оригинала 2 декабря 2020 года.
  27. ^ Фешотт С., Гилберт С. (март 2012 г.). «Эндогенные вирусы: понимание вирусной эволюции и влияние на биологию хозяина» (PDF) . Обзоры природы. Генетика . 13 (4): 283–296. дои : 10.1038/nrg3199 . ПМИД   22421730 . S2CID   205485232 .
  28. ^ Петерс Ю.Э., Макарова К.С., Шмаков С., Кунин Е.В. (август 2017 г.). «Привлечение систем CRISPR-Cas с помощью Tn7-подобных транспозонов» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 114 (35): Е7358–Е7366. Бибкод : 2017PNAS..114E7358P . дои : 10.1073/pnas.1709035114 . ПМЦ   5584455 . ПМИД   28811374 .
  29. ^ Таззиман С.Дж., Бонхеффер С. (декабрь 2013 г.). «Вероятность фиксации мобильных генетических элементов, таких как плазмиды» . Теоретическая популяционная биология . 90 : 49–55. дои : 10.1016/j.tpb.2013.09.012 . ПМИД   24080312 .
  30. ^ Гульельмини Дж., Кинтайс Л., Гарсильян-Барсиа, член парламента, де ла Крус Ф., Роча Е.П. (август 2011 г.). «Репертуар ICE у прокариот подчеркивает единство, разнообразие и повсеместность конъюгации» . ПЛОС Генетика . 7 (8): e1002222. дои : 10.1371/journal.pgen.1002222 . ПМК   3158045 . ПМИД   21876676 .
  31. ^ Возняк Р.А., Вальдор М.К. (август 2010 г.). «Интегративные и конъюгативные элементы: мозаичные мобильные генетические элементы, обеспечивающие динамический боковой поток генов». Обзоры природы. Микробиология . 8 (8): 552–563. дои : 10.1038/nrmicro2382 . ПМИД   20601965 . S2CID   21460836 .
  32. ^ Аухтунг Дж. М., Ли К. А., Гаррисон К. Л., Гроссман А. Д. (июнь 2007 г.). «Идентификация и характеристика репрессора иммунитета (ImmR), который контролирует мобильный генетический элемент ICEBs1 Bacillus subtilis» . Молекулярная микробиология . 64 (6): 1515–1528. дои : 10.1111/j.1365-2958.2007.05748.x . ПМЦ   3320793 . ПМИД   17511812 .
  33. ^ Тирумалай М.Р., Fox GE (сентябрь 2013 г.). «Элемент, подобный ICEBs1, может быть связан с чрезвычайной устойчивостью спор Bacillus pumilus SAFR-032 к радиации и высыханию». Экстремофилы . 17 (5): 767–774. дои : 10.1007/s00792-013-0559-z . ПМИД   23812891 . S2CID   8675124 .
  34. ^ Линк Л., Сойер Дж., Венкатешваран К., Николсон В. (февраль 2004 г.). «Чрезвычайная устойчивость спор к УФ-излучению изолятов Bacillus pumilus, полученных на сверхчистом объекте сборки космических кораблей». Микробная экология . 47 (2): 159–163. Бибкод : 2004MicEc..47..159L . дои : 10.1007/s00248-003-1029-4 . ПМИД   14502417 . S2CID   13416635 .
  35. ^ Ньюкомб Д.А., Шуергер А.С., Бенардини Дж.Н., Дикинсон Д., Таннер Р., Венкатешваран К. (декабрь 2005 г.). «Выживание микроорганизмов, связанных с космическим кораблем, в условиях искусственного марсианского УФ-облучения» . Прикладная и экологическая микробиология . 71 (12): 8147–8156. Бибкод : 2005ApEnM..71.8147N . дои : 10.1128/АЕМ.71.12.8147-8156.2005 . ПМЦ   1317311 . ПМИД   16332797 .
  36. ^ Кемпф М.Дж., Чен Ф., Керн Р., Венкатешваран К. (июнь 2005 г.). «Периодическое выделение устойчивых к перекиси водорода спор Bacillus pumilus на сборочном предприятии космического корабля». Астробиология . 5 (3): 391–405. Бибкод : 2005AsBio...5..391K . дои : 10.1089/ast.2005.5.391 . ПМИД   15941382 .
  37. ^ Де Чекко М., Крисчионе С.В., Петерсон А.Л., Неретти Н., Седиви Дж.М., Крейлинг Дж.А. (декабрь 2013 г.). «Мобильные элементы становятся активными и мобильными в геномах стареющих соматических тканей млекопитающих» . Старение . 5 (12): 867–883. дои : 10.18632/aging.100621 . ПМЦ   3883704 . ПМИД   24323947 .
  38. ^ Барреат Дж.Г., Кацуракис А. (май 2021 г.). Баттистуцци Ф.У. (ред.). «Филогеномика вирусоподобных мобильных генетических элементов позвоночных животных» . Молекулярная биология и эволюция . 38 (5): 1731–1743. дои : 10.1093/molbev/msa291 . ПМЦ   8097293 . ПМИД   33481003 .
  39. ^ Виден С.А., Бес И.С., Корешова А., Плиота П., Крогулл Д., Бурга А. (июнь 2023 г.). «Вирусоподобные транспозоны преодолевают видовой барьер и способствуют развитию генетической несовместимости». Наука . 380 (6652): eade0705. дои : 10.1126/science.ade0705 . ПМИД   37384706 . S2CID   250645873 .
  40. ^ Перейти обратно: а б Болахе С (03 августа 2023 г.). «Эгоистичная вирусоподобная ДНК может переносить гены между видами» . Журнал Кванта . Проверено 6 августа 2023 г.
  41. ^ Глюк-Талер Э., Ралстон Т., Конкель З., Окампос К.Г., Ганешан В.Д., Дорранс А.Е. и др. (май 2022 г.). Ларракуэнте А. (ред.). «Гигантские элементы звездолета мобилизуют вспомогательные гены в геномах грибов» . Молекулярная биология и эволюция . 39 (5). дои : 10.1093/molbev/msac109 . ПМЦ   9156397 . ПМИД   35588244 .
  42. ^ Пейс Дж.К., Гилберт С., Кларк М.С., Фешотт С. (ноябрь 2008 г.). «Повторный горизонтальный перенос ДНК-транспозона у млекопитающих и других четвероногих» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 105 (44): 17023–17028. дои : 10.1073/pnas.0806548105 . ПМЦ   2579371 . ПМИД   18936483 .
  43. ^ «ДНК космического захватчика проникла в геномы млекопитающих» . Наука . 03.11.2008. Архивировано из оригинала 4 мая 2021 года . Проверено 6 августа 2023 г.
  44. ^ Энтони Дж.М., ван Марл Г., Опи В., Баттерфилд Д.А., Маллет Ф., Йонг В.В. и др. (октябрь 2004 г.). «Человеческий эндогенный ретровирусный гликопротеин, опосредованный индукцией окислительно-восстановительных реагентов, вызывает гибель олигодендроцитов и демиелинизацию». Природная неврология . 7 (10): 1088–1095. дои : 10.1038/nn1319 . ПМИД   15452578 . S2CID   9882712 .
  45. ^ «Нобелевская премия по физиологии и медицине 1983 года» . nobelprize.org . Проверено 14 июля 2010 г.
  46. ^ Кин EC (декабрь 2012 г.). «Парадигмы патогенеза: воздействие на мобильные генетические элементы болезней» . Границы клеточной и инфекционной микробиологии . 2 : 161. дои : 10.3389/fcimb.2012.00161 . ПМЦ   3522046 . ПМИД   23248780 .

Библиография

[ редактировать ]
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: 7535f917ce39ec6270b4f224472ca1ba__1712421600
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/75/ba/7535f917ce39ec6270b4f224472ca1ba.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
Mobile genetic elements - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)