Jump to content

Идеовирус

Идеовирус
Классификация вирусов Изменить эту классификацию
(без рейтинга): Вирус
Область : Рибовирия
Королевство: Орторнавиры
Тип: Китриновирикота
Сорт: Алсувирицетес
Заказ: Мартелливиралес
Семья: Майовирусиды
Род: Идеовирус

Идеовирус — это род оцРНК-вирусов с положительным смыслом , который содержит два вида: вирус кустистой карликовости малины (RBDV) и идеовирус бирючины . [ 1 ] [ 2 ] RBDV имеет две зависящие от хозяина клады : одна для малины ; другой для виноградной лозы . [ 3 ] Инфекции представляют собой значительное бремя для сельского хозяйства, приводящее к снижению урожайности и качества сельскохозяйственных культур. [ 4 ] RBDV имеет синергическую связь с вирусом крапчатости листьев малины , при этом совместная инфекция значительно увеличивает концентрацию вирионов в инфицированных растениях. [ 5 ] Вирус передается через опыление пыльцевыми зернами, инфицированными RBDV, которые сначала заражают рыльце пестика, а затем вызывают системную инфекцию. [ 6 ]

Вирусология

[ редактировать ]

RBDV не покрыт изометрической белковой оболочкой диаметром около 33 нанометров. [ 7 ] Внутри белковой оболочки находится вирусный геном, который состоит из двух частей и содержит цепи РНК , называемые РНК-1 и РНК-2. РНК-1 имеет 5449 нуклеотидов длину и содержит одну открытую рамку считывания (ORF), которая кодирует комбинированный белок, имеющий домены метилтрансферазы , геликазы и РНК-зависимой РНК-полимеразы . [ 1 ] [ 8 ] [ 9 ] РНК-2 имеет длину 2231 нуклеотид и содержит две ORF: одну на 5'-конце, а другую на 3'-конце. [ 9 ] [ 10 ] Первая ORF кодирует белок перемещения от клетки к клетке, а вторая ORF экспрессируется как субгеномная цепь РНК . [ 7 ] [ 10 ] Эта цепь, РНК-3, имеет длину 946 нуклеотидов и кодирует белок оболочки. [ 11 ] Было показано, что инфекция не возникает, если РНК-3 либо отсутствует, либо достаточно повреждена. [ 7 ]

Род Структура Симметрия Капсид Геномное расположение Геномная сегментация
Идеовирус Икосаэдрический, Изометрический Без конверта Линейный двусторонний

Жизненный цикл

[ редактировать ]

Репликация вируса цитоплазматическая. Вход в клетку-хозяина достигается путем проникновения в клетку-хозяина. Репликация соответствует модели репликации вируса с положительной многоцепочечной РНК. Транскрипция вируса с положительной цепью РНК - это метод транскрипции. Вирус покидает клетку-хозяина путем перемещения вируса по канальцам. Растения служат естественным хозяином. Пути передачи связаны с пыльцой. [ 12 ]

Род Сведения о хосте Тканевой тропизм Детали входа Подробности выпуска Сайт репликации Монтажный участок Передача инфекции
Идеовирус Растения Никто Цитоплазма Цитоплазма Связанный с пыльцой

Диагностика

[ редактировать ]

одностадийная полимеразная цепная реакция с обратной транскрипцией . Для обнаружения RBDV была разработана [ 5 ] [ 13 ] Вирусы обогащаются антителами в микролунках ПЦР с последующим лизисом вирусных частиц, затем обратной транскрипцией вирусной РНК. [ 13 ] Включив в весь процесс обратную транскриптазу и ДНК-полимеразу , процедуру можно провести в один этап. [ 13 ] Эти тесты достаточно чувствительны, чтобы идентифицировать конкретный штамм вируса. [ 5 ]

RBDV можно уничтожить на зараженных растениях с помощью процедуры, при которой сначала применяют термотерапию , а затем криотерапию к зараженным побегам . [ 14 ] [ 15 ] Применение тепла к зараженным растениям приводит к увеличению вакуолей в инфицированных клетках, которые позже погибают во время криотерапии. [ 15 ] Добавление Fe- этилендиаминтетрауксусной кислоты или Fe-этилендиаминди(о)гидроксифенилуксусной кислоты после криотерапии стимулирует отрастание и предотвращает хлороза в побегах растений. развитие [ 14 ] Используя этот метод, около 80% побегов выдерживают первоначальную тепловую терапию, а 33% выдерживают криотерапию и успешно отрастают. [ 14 ]

  1. ^ Jump up to: а б Зиглер, А; Нацуаки, Т; Мэйо, Массачусетс; Джолли, Калифорния; Мурант, А.Ф. (1992). «Нуклеотидная последовательность РНК-1 вируса кустистой карликовости малины» . Журнал общей вирусологии . 73 (12): 3213–8. дои : 10.1099/0022-1317-73-12-3213 . ПМИД   1469359 .
  2. ^ «Таксономия вирусов: выпуск 2020 г.» . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV) . Проверено 5 июля 2021 г.
  3. ^ Валасевич Н; Кухарчик, Н; Кварнхеден, А (2011). «Молекулярная характеристика изолятов вируса кустистой карликовости малины из Швеции и Беларуси». Архив вирусологии . 156 (3): 369–74. дои : 10.1007/s00705-010-0912-9 . ПМИД   21253783 . S2CID   43135450 .
  4. ^ Маловицкий, С.М.; Мартин, Р; Цянь, MC (2008). «Сравнение сахара, кислот и летучих веществ в трансгенной малине, устойчивой к вирусу кустистой карликовой малины, и дикой малине 'кроткий' (rubus idaeus L.)». Журнал сельскохозяйственной и пищевой химии . 56 (15): 6648–55. дои : 10.1021/jf800253e . ПМИД   18598047 .
  5. ^ Jump up to: а б с Кито-Авила, DF; Мартин, Р.Р. (2012). «ОТ-ПЦР в реальном времени для обнаружения вируса кустистой карликовости малины, вируса крапчатости листьев малины и характеристики синергического взаимодействия при смешанных инфекциях». Журнал вирусологических методов . 179 (1): 38–44. дои : 10.1016/j.jviromet.2011.09.016 . ПМИД   21968094 .
  6. ^ Исогай, М; Ёсида, Т; Накановатари, К; Ёсикава, Н. (2014). «Проникновение пыльцевых трубок с накопленным вирусом кустистой карликовости малины в рыльца способствует первичному заражению материнской ткани и горизонтальной передаче» . Вирусология . 452–453: 247–53. дои : 10.1016/j.virol.2014.02.001 . ПМИД   24606702 .
  7. ^ Jump up to: а б с Макфарлейн, ЮАР; МакГэвин, WJ (2009). «Активация генома белком оболочки вируса кустистой карликовости малины» . Журнал общей вирусологии . 90 (Часть 3): 747–53. дои : 10.1099/vir.0.007195-0 . ПМИД   19218221 .
  8. ^ Зиглер, А; Мэйо, Массачусетс; Мурант, А.Ф. (1993). «Предлагаемая классификация идеовируса кустистой карликовости малины с двусторонним геномом и вирусами с трехчастным геномом семейства Bromoviridae» . Архив вирусологии . 131 (3–4): 483–8. дои : 10.1007/bf01378649 . ПМИД   8347087 . S2CID   31922799 .
  9. ^ Jump up to: а б Кито-Авила, DF; Ибарра, Массачусетс; Альварес, Р; Перальта, Эль; Мартин, Р.Р. (2014). «Изолят вируса кустистой карликовости малины из эквадорского Rubus glaucus содержит дополнительную РНК, которая представляет собой перегруппировку РНК-2». Архив вирусологии . 159 (9): 2519–21. дои : 10.1007/s00705-014-2069-4 . ПМИД   24719196 . S2CID   18080015 .
  10. ^ Jump up to: а б Нацуаки, Т; Мэйо, Массачусетс; Джолли, Калифорния; Мурант, А.Ф. (1991). «Нуклеотидная последовательность РНК-2 вируса кустистой карликовости малины: бицистронный компонент двудольного генома» . Журнал общей вирусологии . 72 (9): 2183–9. дои : 10.1099/0022-1317-72-9-2183 . ПМИД   1895055 .
  11. ^ Мэйо, Массачусетс; Джолли, Калифорния; Мюрант, А.Ф.; Рашке, Дж. Х. (1991). «Нуклеотидная последовательность РНК-3 вируса кустистой карликовости малины» . Журнал общей вирусологии . 72 (2): 469–72. дои : 10.1099/0022-1317-72-2-469 . ПМИД   1993886 .
  12. ^ «Вирусная зона» . ЭксПАСи . Проверено 15 июня 2015 г.
  13. ^ Jump up to: а б с Кокко, HI; Кивинева, М; Каренлампи, Т.О. (1996). «Одноэтапная ОТ-ПЦР с иммунозахватом в обнаружении вируса кустистой карликовости малины» . БиоТехники . 20 (5): 842–6. дои : 10.2144/96205st03 . ПМИД   8723929 .
  14. ^ Jump up to: а б с Ван, Кью; Валконен, JP (2009). «Улучшенное восстановление обработанных криотерапией кончиков побегов после термотерапии выращенных in vitro побегов малины (Rubus idaeus L.)». Крио письма . 30 (3): 170–82. ПМИД   19750241 .
  15. ^ Jump up to: а б Ван, Кью; Куэльяр, В.Дж.; Раямяки, МЛ; Хирата, Ю; Валконен, JP (2008). «Комбинированная термотерапия и криотерапия для эффективного уничтожения вируса: взаимосвязь распределения вируса, субклеточные изменения, выживаемость клеток и деградация вирусной РНК в кончиках побегов» . Молекулярная патология растений . 9 (2): 237–50. дои : 10.1111/j.1364-3703.2007.00456.x . ПМК   6640318 . ПМИД   18705855 .
[ редактировать ]
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: d1fc82189ebf7ce35a9ed919007126be__1691900880
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/d1/be/d1fc82189ebf7ce35a9ed919007126be.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
Idaeovirus - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)