Potyviridae

Potyviridae
	Геном вируса плюмы рода Potyvirus с помощью просвечивающей электронной микрофотографии и модели вирионов
Классификация вирусов
(не вмешательство):	Вирус
Область :	Рибовирия
Королевство:	Orthornavirae
Филум:	Pisuviricota
Сорт:	Girlviricetes
Заказ:	Пататавиралес
Семья:	Potyviridae
Роды
	Смотрите текст

Potyviridae -это семейство вирусов РНК с положительной цепью , которое охватывает более 30% известных вирусов растений , ^{[ 1 ]}^{[ 2 ]} Многие из которых имеют большое значение для сельского хозяйства. Семейство имеет 12 родов и 235 видов, три из которых не назначены родом. ^{[ 3 ]}^{[ 4 ]}^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Структура

Геномная карта типичного члена рода Potyvirus .

Вирионы Potyvirid-это неразвитые, изгибные нитевидные, стержневые частицы. Диаметр составляет около 11–20 нм, с длиной 650–950 нм. ^{[ 4 ]}^{[ 5 ]}

Геном

Геномы линейные и обычно не сегментированные, около 8–12 КБ в длину, ^{[ 4 ]}^{[ 5 ]} состоящий из РНК с положительным смыслом, которая окружена белковым пальто, состоящим из одного вирусного кодируемого белка, называемого капсидом . Все индуцируют образование тел включения вируса , называемые цилиндрическими включениями («вертушка») в своих хозяевах. Они состоят из одного белка (около 70 кДа ), сделанного у их хозяев из одного вирусного генома. ^{[ Цитация необходима ]}

Вирусы элементов кодируют большие полипептиды, которые расщепляются в зрелые белки . В 5' -3 'порядок эти белки

P1 ( сериновая протеаза ): 83 кДа
HC (протеаза): 51 кДа
P3: 34 K.
6K1: 5 кДа
CL ( Helicase ): 71 кДа
6K2: 6 K.
VPG (5 'связывающий белок): 20 кДа
Nia-pro (протеаза): 27 кДа
NIB ( РНК -зависимая РНК -полимераза ): 57 кДа
Капсидный белок: 34 кДа

Может быть некоторое различия в количестве белков в зависимости от родов и видов. ^{[ 7 ]} Например, у некоторых родов не хватает P1, у некоторых вирусов рода iPomovirus не хватает HC и имеет тандем P1. Довольно интересные потивирусные ORF сладкого картофеля (Pispo), алкилирование B (ALKB) и инозин -трифосфат пирофосфатаза (известная как ITPase или HAM1), являются белковыми доменами, идентифицированными у атипичных членов. ^{[ 7 ]}^{[ 8 ]}

Жизненный цикл

Репликация и движение вируса соевой мозаики (SMV)

Вирусная репликация является цитоплазматической. Вход в ячейку -хозяина достигается проникновением. Репликация следует за моделью репликации вируса РНК с положительной цепью. Транскрипция вируса РНК с положительной цепью является методом транскрипции. Перевод происходит по -1 рибосомным кадром. Вирус выходит из клетки-хозяина путем вирусного движения, направленного на канальцы. ^{[ 4 ]}^{[ 5 ]} Растения служат естественным хозяином. Вирус передается через вектор (часто насекомое или клеща). Маршруты передачи являются векторными и механическими. ^{[ 4 ]}^{[ 5 ]}

Передача инфекции

Потивирус является крупнейшим родом в семействе с 183 известными видами. ^{[ 9 ]} Эти вирусы имеют длину 720–850 нм и передаются тли . Они также могут быть легко переданы механическими средствами. Эти вирусы разделили общее происхождение 6600 лет назад ^{[ 10 ]} и передаются более чем 200 видами тли. ^{[ Цитация необходима ]}

Виды в роде Macluravirus имеют длину 650–675 нм и также передаются тли. Вирусы растений в роде iPomovirus передаются белокульями , и они имеют длину 750–950 нм. Тритимовирус и вирусы римовируса имеют длину 680–750 нм и передаются клещами eriophydid . (Римовирусы тесно связаны с потивирусами и в конечном итоге могут быть объединены с потивирусами. ^{[ 11 ]}) Геном ByMovirus состоит из двух частиц вместо одной (275 и 550 нм), и эти вирусы передаются грибком читрида , полимикса Graminis . ^{[ Цитация необходима ]}

Таксономия

Филогенетическое дерево семейства *potyviridae*

Признаны следующие роды: ^{[ 6 ]}

Следующие виды не назначены родом: ^{[ 6 ]}

Ссылки

^ Riechmann, JL; Lain, S; Гарсия, JA (1992). «Основные моменты и перспективы Potyvirus molecularbiology» . J Gen Virol . 73 : 1–16. doi : 10.1099/0022-1317-73-1-1 . PMID 1730931 .
^ Berger PH, et al. (2005) В отношении таксономии вируса: восьмой доклад Международного комитета по таксономии вирусов, ред. Факет С.М., Майо М.А., Манилофф Дж., Дессельбергер У, Болл Л.А. (Elsevier Academic, Сан -Диего), стр. 819–841.
^ Wylie, SJ; Адамс, м; Chall, c; Крест, J; Лопес-Моя, JJ; Ошима, К; Правин, с; Рабенште, F; Стенгер, D; Ван, а; Сербинг, FM; Консорциум отчета ICTV (март 2017 г.). Отчет ICTTV: Potyviridae . Язычники общей победы 98 (3): 352–354. doi : 10.1099/jgv . PMC 5797945 . PMID 28366187 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и "Potyviridae" . ICTV Online (10th) отчет .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и «Вирусная зона» . Расширение . Получено 15 июня 2015 года .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в «Таксономия вируса: выпуск 2020 года» . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV). Март 2021 г. Получено 21 мая 2021 года .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Пасин, Фабио; Дарус, Хосе-Антонио; Tzanetakis, ioannis e (2022). «Расширение протеома в эволюционном радиации Potyviridae» . Обзоры микробиологии FEMS . 46 (4): FUAC011. doi : 10.1093/femsre/fuac011 . ISSN 1574-6976 . PMC 9249622 . PMID 35195244 .
^ Юэ, Цзянинг; Вэй, Яо; Солнце, Женки; Чен, Яхан; Вэй, Сюэфенг; Ван, Хайджуан; Пасин, Фабио; Чжао, Мингмин (октябрь 2022 г.). «Алкб РНК -деметилазы гомологи и N6 -метиладенозин участвуют в инфекции потивируса» . Патология молекулярного растения . 23 (10): 1555–1564. doi : 10.1111/mpp.13239 . ISSN 1364-3703 . PMC 9452765 . PMID 35700092 .
^ Описание вирусов растений: семейство Potyviridae
^ Nigam D, Latourrette K, Souza Pfn, Garcia-Ruiz H (2019). Front Plant Sci 10: 1439
^ Описание вирусов растений: семейный Potyviridae фигура

Внешние ссылки

[1] Riechmann, JL; Lain, S; Гарсия, JA (1992). «Основные моменты и перспективы Potyvirus molecularbiology» . J Gen Virol . 73 : 1–16. doi : 10.1099/0022-1317-73-1-1 . PMID 1730931 .

[2] Berger PH, et al. (2005) В отношении таксономии вируса: восьмой доклад Международного комитета по таксономии вирусов, ред. Факет С.М., Майо М.А., Манилофф Дж., Дессельбергер У, Болл Л.А. (Elsevier Academic, Сан -Диего), стр. 819–841.

[ICTVProfile-3] Wylie, SJ; Адамс, м; Chall, c; Крест, J; Лопес-Моя, JJ; Ошима, К; Правин, с; Рабенште, F; Стенгер, D; Ван, а; Сербинг, FM; Консорциум отчета ICTV (март 2017 г.). Отчет ICTTV: Potyviridae . Язычники общей победы 98 (3): 352–354. doi : 10.1099/jgv . PMC 5797945 . PMID 28366187 .

[ICTVReport-4] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и "Potyviridae" . ICTV Online (10th) отчет .

[ViralZone-5] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и «Вирусная зона» . Расширение . Получено 15 июня 2015 года .

[ictv-6] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в «Таксономия вируса: выпуск 2020 года» . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV). Март 2021 г. Получено 21 мая 2021 года .

[:0-7] Jump up to: ^а ^{беременный} Пасин, Фабио; Дарус, Хосе-Антонио; Tzanetakis, ioannis e (2022). «Расширение протеома в эволюционном радиации Potyviridae» . Обзоры микробиологии FEMS . 46 (4): FUAC011. doi : 10.1093/femsre/fuac011 . ISSN 1574-6976 . PMC 9249622 . PMID 35195244 .

[8] Юэ, Цзянинг; Вэй, Яо; Солнце, Женки; Чен, Яхан; Вэй, Сюэфенг; Ван, Хайджуан; Пасин, Фабио; Чжао, Мингмин (октябрь 2022 г.). «Алкб РНК -деметилазы гомологи и N6 -метиладенозин участвуют в инфекции потивируса» . Патология молекулярного растения . 23 (10): 1555–1564. doi : 10.1111/mpp.13239 . ISSN 1364-3703 . PMC 9452765 . PMID 35700092 .

[9] Описание вирусов растений: семейство Potyviridae

[Nigam2019-10] Nigam D, Latourrette K, Souza Pfn, Garcia-Ruiz H (2019). Front Plant Sci 10: 1439

[11] Описание вирусов растений: семейный Potyviridae фигура

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]