Сенекавирус

Сенекавирус
Классификация вирусов
(без рейтинга):	Вирус
Область :	Рибовирия
Королевство:	Орторнавиры
Тип:	Писувирикота
Сорт:	Пизонивирицеты
Заказ:	Пикорнавирусы
Семья:	Пикорнавирусиды
Род:	Сенекавирус
Синонимы
	Вирус долины Сенека ; Вирус долины Сенека-001 ;

Сенекавирус — род вирусов порядка Picornavirales , семейства Picornaviridae . Естественными хозяевами служат свинья и, возможно, корова. В этом роде имеется только один вид: Senecavirus A. ^{[ 1 ]}^{[ 2 ]} Сенекавирус — репликационно-компетентный онколитический пикорнавирус . Он обладает селективным тропизмом к онкологическим заболеваниям с нейроэндокринными особенностями, включая мелкоклеточный рак легких (МРЛ) и несколько солидных опухолей у детей, включая ретинобластому, нейробластому и медуллобластому. ^{[ 3 ]} I фазы Клинические испытания сенекавируса у взрослых с нейроэндокринными опухолями показали, что сенекавирус, очевидно, безопасно вводить в дозах до 1E11 vp/кг. ^{[ 4 ]} Он обладает потенциальной противоопухолевой активностью. ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Структура

Вирусы сенекавируса не имеют оболочки, имеют икосаэдрическую, сферическую и круглую геометрию, с симметрией T = псевдо3. Диаметр около 30 нм. Геномы линейные и несегментированные, длиной около 7,3 КБ. ^{[ 1 ]}

Род	Структура	Симметрия	Капсид	Геномное расположение	Геномная сегментация
Сенекавирус	икосаэдрический	Псевдо Т=3	Без конверта	Линейный	Однодольный

Жизненный цикл

Репликация вируса цитоплазматическая. Проникновение в клетку-хозяина достигается путем прикрепления вируса к рецепторам хозяина, что опосредует эндоцитоз. Репликация соответствует модели репликации вируса с положительной многоцепочечной РНК. Транскрипция вируса с положительной цепью РНК - это метод транскрипции. Вирус покидает клетку-хозяина путем лизиса и виропоринов. Естественным хозяином служат свинья и, возможно, корова. ^{[ 1 ]}

Рецептор вируса долины Сенека был идентифицирован как рецептор токсина сибирской язвы 1 . ^{[ 7 ]}

Род	Подробности о хосте	Тканевой тропизм	Детали входа	Подробности выпуска	Сайт репликации	Монтажный участок	Передача инфекции
Сенекавирус	Свиньи, Корова	Онколитический	Эндоцитоз клеточных рецепторов	Лизис	Цитоплазма	Цитоплазма	Неизвестный

Открытие и происхождение

Полная последовательность генома сенекавируса была завершена в 2008 году. ^{[ 8 ]}

Инфекционный клон сенекавируса был зарегистрирован в 2012 году. ^{[ 9 ]}

Было предложено, что сенекавирус атакует раковые стволовые клетки. ^{[ 10 ]}

Против сенекавируса были получены диагностические моноклональные антитела. ^{[ 11 ]}

Хотя последовательность генома, кодирующего белок SVV, наиболее похожа на последовательность представителей рода Cardiovirus , сайт входа некодирующей РНК во внутреннюю рибосому (IRES) наиболее похож на последовательность генома представителей рода Pestivirus , включая вирус классической чумы свиней и Hepacivirus. род , включая вирус гепатита С. ^{[ 12 ]}

РНК SVV IRES имеет сходство по последовательности, структуре и функциям с IRES вируса гепатита С. Субдомен IIa IRES SVV и HCV имеет схожую структуру и лигандсвязывающую функцию, что видно из его кристаллической структуры. ^{[ 13 ]} Эта область субдомена IIa классифицируется как чувствительный к лиганду переключатель РНК, который принимает четко определенные безлигандные и связанные конформации без разрушения или образования каких-либо пар оснований в своей вторичной структуре при взаимном преобразовании между двумя состояниями. ^{[ 14 ]} Этот переключатель РНК из SVV IRES был включен в треугольные наноструктуры РНК. ^{[ 15 ]}

Клинические испытания

Первоначальный изолят разрабатывается как противораковое терапевтическое средство виртуальной компанией Neotropix, Inc. под названием NTX-010.

Фаза I

Исследование безопасности сенекавируса у пациентов с солидными опухолями с нейроэндокринными особенностями. ^{[ 16 ]} Это исследование было опубликовано в 2011 году, и его данные показывают, что вирус хорошо переносился 30 пациентами и наблюдались некоторые признаки противоопухолевой активности. Эти данные послужили основанием для дальнейшего изучения вируса в ходе исследования II фазы мелкоклеточного рака легких . ^{[ 4 ]}

Фаза II

распространенной стадии Сенекавирус после химиотерапии при лечении больных мелкоклеточным раком легкого ^{[ 17 ]}
Сенекавирус и циклофосфамид у молодых пациентов с нейробластомой , рабдомиосаркомой или редкими опухолями с нейроэндокринными особенностями ^{[ 18 ]}

Репликация вируса

Сенекавирус использует в качестве рецептора белок рецептора токсина сибирской язвы 1 (ANTXR1). ^{[ 19 ]} Опубликована структура сенекавируса с этим рецептором в высоком разрешении. ^{[ 20 ]}

См. также

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с «Вирусная зона» . ЭксПАСи . Проверено 15 июня 2015 г.
^ «Таксономия вирусов: выпуск 2020 г.» . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV). Март 2021 года . Проверено 20 мая 2021 г.
^ Редди П.С., Берроуз К.Д., Хейлз Л.М., Ганеш С., Джонс Б.Х., Идамаканти Н., Хэй С., Ли С.С., Скеле К.Л., Васко А.Дж., Ян Дж., Уоткинс Д.Н., Рудин С.М., Халленбек П.Л. (2007). «Вирус долины Сенека, системно доставляемый онколитический пикорнавирус и лечение нейроэндокринного рака» . Журнал JNCI Национального института рака . 99 (21): 1623–1633. дои : 10.1093/jnci/djm198 . ПМК 5261858 . ПМИД 17971529 .
^ Jump up to: ^а ^б Рудин СМ, Пуарье Дж.Т., Сензер Н.Н., Стивенсон Дж., Леш Д., Берроуз К.Д., Редди П.С., Ханн К.Л., Халленбек П.Л. (15 февраля 2011 г.). «Фаза I клинического исследования вируса долины Сенека (SVV-001), репликационно-компетентного пикорнавируса, при запущенных солидных опухолях с нейроэндокринными особенностями» . Клинические исследования рака . 17 (4): 888–95. дои : 10.1158/1078-0432.CCR-10-1706 . ПМЦ 5317273 . ПМИД 21304001 .
^ Национального института рака Определение вируса долины Сенека-001 . Национальный институт рака . Проверено 9 октября 2008 г.
^ Мортон К.Л., Хоутон П.Дж., Колб Е.А. и др. (август 2010 г.). «Первоначальное тестирование компетентного к репликации вируса долины Сенека (NTX-010) в рамках программы педиатрических доклинических испытаний» . Детский рак крови . 55 (2): 295–303. дои : 10.1002/pbc.22535 . ПМК 3003870 . ПМИД 20582972 .
^ Майлз Л.А., Бурга Л.Н., Гарднер Э.Э., Бостина М., Пуарье Дж.Т., Рудин С.М. (2017) Рецептор 1 токсина сибирской язвы является клеточным рецептором вируса долины Сенека. Джей Клин Инвест
^ Хейлз Л.М., Ноулз Н.Дж., Редди П.С., Сюй Л., Хэй С., Халленбек П.Л. (2008). «Полный анализ последовательности генома вируса долины Сенека-001, нового онколитического пикорнавируса» . Журнал общей вирусологии . 89 (5): 1265–1275. дои : 10.1099/vir.0.83570-0 . ПМИД 18420805 .
^ Пуарье Дж.Т., Редди П.С., Идамаканти Н., Ли С.С., Стамп К.Л., Берроуз К.Д., Халленбек П.Л., Рудин К.М. (2012). «Характеристика полноразмерного инфекционного клона кДНК и репортерного производного GFP онколитического пикорнавируса SVV-001» . Журнал общей вирусологии . 93 (Часть 12): 2606–2613. дои : 10.1099/vir.0.046011-0 . ПМИД 22971818 .
^ Фридман Г.К., Кэссиди К.А., Байерле Э.А., Маркерт Дж.М., Гиллеспи Дж.Ю. (2012). «Нацеливание на стволовые клетки детского рака с помощью онколитической виротерапии» . Педиатрические исследования . 71 (4–2): 500–510. дои : 10.1038/пр.2011.58 . ПМК 3607376 . ПМИД 22430386 .
^ Ян М., Ван Брюгген Р., Сюй В. (2011). «Получение и диагностическое применение моноклональных антител против вируса долины Сенека» . Журнал ветеринарных диагностических исследований . 24 (1): 42–50. дои : 10.1177/1040638711426323 . ПМИД 22362934 .
^ Уиллкокс М.М., Локер Н., Гомвалк З., Ройалл Э., Бахшеш М., Белшам Г.Дж., Идамаканти Н., Берроуз К.Д., Редди П.С., Халленбек П.Л., Робертс Л.О. (2011). «Структурные особенности элемента внутреннего сайта входа в рибосому (IRES) вируса долины Сенека: пикорнавирус с пестивирусоподобным IRES» . Журнал вирусологии . 85 (9): 4452–4461. дои : 10.1128/JVI.01107-10 . ПМК 3126232 . ПМИД 21325406 .
^ Бурнеке М., Дибров С., Гу Дж., Уайлс Д., Герман Т. (11 ноября 2014 г.). «Функциональная консервация, несмотря на структурное расхождение в лиганд-чувствительных переключателях РНК» . Proc Natl Acad Sci США . 111 (45): 15952–7. Бибкод : 2014PNAS..11115952B . дои : 10.1073/pnas.1414678111 . ПМЦ 4234586 . ПМИД 25349403 .
^ Бернеке М., Герман Т. (август 2015 г.). «Механические переключатели РНК, реагирующие на лиганды» . Биология РНК . 12 (8): 780–786. дои : 10.1080/15476286.2015.1054592 . ПМЦ 4615790 . ПМИД 26158858 .
^ Бернеке М., Дибров С., Герман Т. (23 февраля 2016 г.). «Проектирование самособирающихся нанотреугольников РНК с учетом кристаллической структуры» . Angew Chem Int Ed Engl . 55 (12): 4097–100. дои : 10.1002/anie.201600233 . ПМЦ 4824544 . ПМИД 26914842 .
^ «Исследование безопасности вируса долины Сенека у пациентов с солидными опухолями с нейроэндокринными особенностями» . ClinicalTrials.gov . 23 февраля 2010 г.
^ «Вирус долины Сенека-001 после химиотерапии при лечении пациентов с мелкоклеточным раком легких распространенной стадии» . www.clinicaltrials.gov .
^ «Вирус долины Сенека-001 и циклофосфамид в лечении молодых пациентов с рецидивирующей или рефрактерной нейробластомой, рабдомиосаркомой или редкими опухолями с нейроэндокринными особенностями» . www.clinicaltrials.gov .
^ Майлз Л.А., Бурга Л.Н., Гарднер Э.Э., Бостина М., Пуарье Дж.Т., Рудин К.М. (1 августа 2017 г.). «Рецептор 1 сибирской язвы является клеточным рецептором вируса долины Сенека» . Журнал клинических исследований . 127 (8): 2957–2967. дои : 10.1172/JCI93472 . ПМК 5531414 . ПМИД 28650343 .
^ Джаявардена Н., Бурга Л.Н., Исингвуд Р.А., Такидзава Ю., Вольф М., Бостина М. (13 ноября 2018 г.). «Структурная основа распознавания рецептора 1 сибирской язвы вирусом долины Сенека» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 115 (46): E10934–E10940. Бибкод : 2018PNAS..11510934J . дои : 10.1073/pnas.1810664115 . ПМК 6243253 . ПМИД 30381454 .

Внешние ссылки

Структура вируса долины Сенека-001 — на Virus Particle ExplorerR (VIPERdb)
Вирусная зона : Сенекавирус
ICTV

[ViralZone-1] Jump up to: ^а ^б ^с «Вирусная зона» . ЭксПАСи . Проверено 15 июня 2015 г.

[ICTV-2] «Таксономия вирусов: выпуск 2020 г.» . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV). Март 2021 года . Проверено 20 мая 2021 г.

[3] Редди П.С., Берроуз К.Д., Хейлз Л.М., Ганеш С., Джонс Б.Х., Идамаканти Н., Хэй С., Ли С.С., Скеле К.Л., Васко А.Дж., Ян Дж., Уоткинс Д.Н., Рудин С.М., Халленбек П.Л. (2007). «Вирус долины Сенека, системно доставляемый онколитический пикорнавирус и лечение нейроэндокринного рака» . Журнал JNCI Национального института рака . 99 (21): 1623–1633. дои : 10.1093/jnci/djm198 . ПМК 5261858 . ПМИД 17971529 .

[RudinPoirier2011-4] Jump up to: ^а ^б Рудин СМ, Пуарье Дж.Т., Сензер Н.Н., Стивенсон Дж., Леш Д., Берроуз К.Д., Редди П.С., Ханн К.Л., Халленбек П.Л. (15 февраля 2011 г.). «Фаза I клинического исследования вируса долины Сенека (SVV-001), репликационно-компетентного пикорнавируса, при запущенных солидных опухолях с нейроэндокринными особенностями» . Клинические исследования рака . 17 (4): 888–95. дои : 10.1158/1078-0432.CCR-10-1706 . ПМЦ 5317273 . ПМИД 21304001 .

[5] Национального института рака Определение вируса долины Сенека-001 . Национальный институт рака . Проверено 9 октября 2008 г.

[pmid20582972-6] Мортон К.Л., Хоутон П.Дж., Колб Е.А. и др. (август 2010 г.). «Первоначальное тестирование компетентного к репликации вируса долины Сенека (NTX-010) в рамках программы педиатрических доклинических испытаний» . Детский рак крови . 55 (2): 295–303. дои : 10.1002/pbc.22535 . ПМК 3003870 . ПМИД 20582972 .

[Miles2017-7] Майлз Л.А., Бурга Л.Н., Гарднер Э.Э., Бостина М., Пуарье Дж.Т., Рудин С.М. (2017) Рецептор 1 токсина сибирской язвы является клеточным рецептором вируса долины Сенека. Джей Клин Инвест

[8] Хейлз Л.М., Ноулз Н.Дж., Редди П.С., Сюй Л., Хэй С., Халленбек П.Л. (2008). «Полный анализ последовательности генома вируса долины Сенека-001, нового онколитического пикорнавируса» . Журнал общей вирусологии . 89 (5): 1265–1275. дои : 10.1099/vir.0.83570-0 . ПМИД 18420805 .

[9] Пуарье Дж.Т., Редди П.С., Идамаканти Н., Ли С.С., Стамп К.Л., Берроуз К.Д., Халленбек П.Л., Рудин К.М. (2012). «Характеристика полноразмерного инфекционного клона кДНК и репортерного производного GFP онколитического пикорнавируса SVV-001» . Журнал общей вирусологии . 93 (Часть 12): 2606–2613. дои : 10.1099/vir.0.046011-0 . ПМИД 22971818 .

[10] Фридман Г.К., Кэссиди К.А., Байерле Э.А., Маркерт Дж.М., Гиллеспи Дж.Ю. (2012). «Нацеливание на стволовые клетки детского рака с помощью онколитической виротерапии» . Педиатрические исследования . 71 (4–2): 500–510. дои : 10.1038/пр.2011.58 . ПМК 3607376 . ПМИД 22430386 .

[11] Ян М., Ван Брюгген Р., Сюй В. (2011). «Получение и диагностическое применение моноклональных антител против вируса долины Сенека» . Журнал ветеринарных диагностических исследований . 24 (1): 42–50. дои : 10.1177/1040638711426323 . ПМИД 22362934 .

[12] Уиллкокс М.М., Локер Н., Гомвалк З., Ройалл Э., Бахшеш М., Белшам Г.Дж., Идамаканти Н., Берроуз К.Д., Редди П.С., Халленбек П.Л., Робертс Л.О. (2011). «Структурные особенности элемента внутреннего сайта входа в рибосому (IRES) вируса долины Сенека: пикорнавирус с пестивирусоподобным IRES» . Журнал вирусологии . 85 (9): 4452–4461. дои : 10.1128/JVI.01107-10 . ПМК 3126232 . ПМИД 21325406 .

[13] Бурнеке М., Дибров С., Гу Дж., Уайлс Д., Герман Т. (11 ноября 2014 г.). «Функциональная консервация, несмотря на структурное расхождение в лиганд-чувствительных переключателях РНК» . Proc Natl Acad Sci США . 111 (45): 15952–7. Бибкод : 2014PNAS..11115952B . дои : 10.1073/pnas.1414678111 . ПМЦ 4234586 . ПМИД 25349403 .

[14] Бернеке М., Герман Т. (август 2015 г.). «Механические переключатели РНК, реагирующие на лиганды» . Биология РНК . 12 (8): 780–786. дои : 10.1080/15476286.2015.1054592 . ПМЦ 4615790 . ПМИД 26158858 .

[15] Бернеке М., Дибров С., Герман Т. (23 февраля 2016 г.). «Проектирование самособирающихся нанотреугольников РНК с учетом кристаллической структуры» . Angew Chem Int Ed Engl . 55 (12): 4097–100. дои : 10.1002/anie.201600233 . ПМЦ 4824544 . ПМИД 26914842 .

[16] «Исследование безопасности вируса долины Сенека у пациентов с солидными опухолями с нейроэндокринными особенностями» . ClinicalTrials.gov . 23 февраля 2010 г.

[17] «Вирус долины Сенека-001 после химиотерапии при лечении пациентов с мелкоклеточным раком легких распространенной стадии» . www.clinicaltrials.gov .

[18] «Вирус долины Сенека-001 и циклофосфамид в лечении молодых пациентов с рецидивирующей или рефрактерной нейробластомой, рабдомиосаркомой или редкими опухолями с нейроэндокринными особенностями» . www.clinicaltrials.gov .

[19] Майлз Л.А., Бурга Л.Н., Гарднер Э.Э., Бостина М., Пуарье Дж.Т., Рудин К.М. (1 августа 2017 г.). «Рецептор 1 сибирской язвы является клеточным рецептором вируса долины Сенека» . Журнал клинических исследований . 127 (8): 2957–2967. дои : 10.1172/JCI93472 . ПМК 5531414 . ПМИД 28650343 .

[20] Джаявардена Н., Бурга Л.Н., Исингвуд Р.А., Такидзава Ю., Вольф М., Бостина М. (13 ноября 2018 г.). «Структурная основа распознавания рецептора 1 сибирской язвы вирусом долины Сенека» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 115 (46): E10934–E10940. Бибкод : 2018PNAS..11510934J . дои : 10.1073/pnas.1810664115 . ПМК 6243253 . ПМИД 30381454 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]

[ 16 ]

[ 17 ]

[ 18 ]

[ 19 ]

[ 20 ]